Professional Documents
Culture Documents
TEZ DE DOCTORAT
Caracterizarea molecular a proteinelor
implicate n distrofii musculare
Rezumat
Conductor tiinific
Prof. Dr. Ion BRAD
Doctorand
Gisela Florina GAINA
BUCURETI
2008
Pagina 1
Rezumat
Teza de doctorat
Departamentului
a fost
de
elaborat
Biochimie
n cadrul
Biologie
Biologie
Molecular
(BCUM
BM),
Pagina 2
Rezumat
CUPRINS
PARTEA I-A:
NOIUNI INTRODUCTIVE. .5
Pagina 3
Rezumat
Pagina 4
Rezumat
Pagina 5
Rezumat
Reactivi i aparatur..........................................................................................200
Protocol de lucru................................................................................................ 201
6.2.1.3. Determinarea spectrofotometric a puritii i concentraiei ADN genomic.
.............................................................................................................................. 202
6.2.1.4. Tehnica HR- MCA (High Resolution-Melting Curve Analysis).................202
Principiul metodei.............................................................................................. 202
6.2.1.5. Amplificarea PCR a fragmentelor de interes.............................................206
Principiul metodei.............................................................................................. 206
Reactivi i aparatur..........................................................................................207
Protocol de lucru................................................................................................ 208
Prepararea mixului PCR.....................................................................................212
6.2.1.6. Analiza temperaturii de hibridizare a ampliconilor cu ajutorul LightScanner
.............................................................................................................................. 213
Protocol de lucru LightScanner..........................................................................214
Analiza datelor obtinute cu ajutorul softului LightScanner Software..................214
6.2.2. Tehnica de secveniere....................................................................................215
6.2.2.1. Probele biologice......................................................................................215
6.2.2.2. Reactivi i aparatur.................................................................................215
6.2.2.3. Mod de lucru............................................................................................. 216
6.3. REZULTATE SI DISCUTII...........................................................................................219
6.4. CONCLUZII............................................................................................................. 236
CAPITOLUL 7: CONCLUZII GENERALE.............................................................237
7.1. Evidenierea prin imunofluorescenta a proteinelor musculare implicate in diferite
tipuri de distrofii musculare.......................................................................................... 237
7.2. Evidenierea prin western blot a proteinelor musculare implicate in diferite tipuri de
distrofii musculare........................................................................................................ 239
7.3. Analiza duplicaiilor si deleiilor de la nivelul genei distrofinei prin tehnica MLPA. .240
7.4. Gena Distrofinei Determinarea Mutaiilor Punctiforme........................................241
BIBLIOGRAFIE.............................................................................................. 242
LISTA TABELELOR PREZENTATE N TEZ.........................................................258
LISTA FIGURILOR PREZENTATE N TEZ..........................................................261
LISTA LUCRRILOR PUBLICATE I COMUNICATE..............................................266
Pagina 6
Rezumat
INTRODUCERE
Pagina
Rezumat
devine o cerin obligatorie pentru diagnosticul de laborator ( Becker E i van Ommen G:J,
1998).
matrixul
extracelular (2-laminina,
Pagina
Rezumat
conjunctiv din jurul fibrei. Mutaiile care apar n una din componetele acestui complex
determin deficiena primar a proteinei pe care o codific gena respectiv,
deficien care este adesea acompaniat i de modificri secundare a altor proteine
ce aparin complexului glicoptroteinelor asociate distrofinei.
Unele din proteinele complexului DGC au o localizare extracelular (distroglican), apte sunt proteine membranare (-distroglican, sarcospan i -, -,
-,-,si -sarcoglican), patru sunt proteine citoplasmatice (-actinin-2 i sintrophin 1,
1, i 2) i dou sunt izoforme ale proteinelor subsarcolemale (-dystrobrevin-1,
-2).
Aceste proteine mpreun cu distrofina formeaz membrana citoscheletic a
membranei fibrei musculare, au rol structural dar i posibil rol n transmiterea
semnalului celular ntre elementele contractile ale fibrei i matrixul extracelular
(Ervasti and Campbell, 1993).
Studiul proteinelor musculare este important att pentru sporirea nelegerii
corelaiilor genotip- fenotip ct i n stabilirea exact a unui diagnostic pentru aceste
maladii n care este implicat un numr mare de gene. Analiza expresiei proteinelor
deficiente reprezint un instrument valoros n stabilirea situaiilor n care este
necesar analiza genetic a genelor care codific aceste proteine i n final
diagnosticarea corect a bolii neuromusculare ( Vainzof si col.,2003b; Zatz si col.,2003).
Prin
aceste
studii
se
propune
realizarea
unui
model
pentru
Pagina
Rezumat
MUSCULARE
IMPLICATE
DISTROFIILE
de
distrofii
musculare
prin
imunohistochimie
cu
Concluzii
preliminare
privind
importana
utilizrii
tehnicii
de
Pagina 10
Rezumat
nivelul genelor care le codific apar mutaii care determin aparaia diferitelor tipuri
de distrofii musculare..
Absena distrofinei sau a unei proteine din complexul proteinelor asociate
distrofinei determin reducerea secundar i a altor proteine. Pentru evitarea unor
rezultate incorecte, la fiecare pacient luat n studiu au fost analizate toate proteinele
mai sus menionate pentru a se identifica n mod corect deficiena proteic primar
precum i reducerile secundare care apar n alte proteine.
Deoarece distrofina este o protein foarte mare, evaluarea expresiei
fenotipice trebuie realizat utiliznd mai muli anticorpi cu specificitate pentru mai
multe domenii ale proteinei. Utilizarea simultan a celor trei anticorpi duce la
ndeprtarea rezultatelor fals negative care apar n cazurile particulare cu mutaii inframe. Cei 3 anticorpi utilizai sunt direcionai mpotriva a trei din cele patru domenii
structurale ale acestei proteine: Dys1-pentru domeniul central al distrofinei, Dys 2 pentru captul C - terminal al distrofinei, i Dys 3 - pentru captul N - terminal al
distrofinei
Interpretarea seciunilor marcate imunohistochimic s-a facut n comparaie cu
seciunile martor provenite de la pacieni cu afectare neurologic i la care muchiul
nu este afectat.
Studiul de fa s-a realizat pe un lot de 40 de pacieni cu diagnostic clinic de
distrofie muscular progresiv de diferite tipuri sau la care diagnosticul nu a putut fi
precizat prin metoda imunohistochimic i s-a dorit o precizare de diagnostic.
Pacienii luai n studiu au provenit de la Laboratorul de Neurotiine din cadul
Spitalului Clinic Colentina care au fost selectai n perioada septembrie 2005-iulie
2008. Alturi de cei 40 de pacieni, au fost introdui n studiu i alte 10 cazuri care au
reprezentat lotul martor.
Biopsia muscular s-a realizat la Clinica de Chirurgie a Spitalului Colentina,
de fiecare dat folosindu-se tehnica biopsiei musculare deschise, sub anestezie
local cu xilin 2%.
Pentru studiul proteinelor sarcolemale s-au folosit crioseciuni deoarece pn
n prezent exist puini anticorpi care reacioneaz pe seciuni mparafinate. Ca
Pagina 11
Rezumat
Pagina 12
Rezumat
Pagina 13
Rezumat
complet absent (-) comparativ cu esutul normal la care expresia este observat dea lungul ntregii membrane musculare.
Totodat s-a observat c la toi pacienii cu distrofie muscular Becker care
prezint o deleie a exonului 48 din gena distrofinei sunt caracterizai n mod
surprinzator de un nivel redus al expresie nNOS n ciuda faptului c la aceti pacieni
distrofina este prezent, semnalul avnd o intensitate asemntoare sau uor
redus comparativ cu seciunile martor.
S-a observat o deficien a nNOS i n distrofiile musculare de tip forma
centurilor n special cnd este implicat complexul sarcoglicanilor sugerndu-se faptul
c deficienele fluxului sangvin pot contribui n patogenia altor forme de distrofii
musculare.
Aceste studii sugereaz importana introducerii studiului nNOS att la pacienii
cu distrofinopatii n special la pacienii cu distrofie muscular Becker care prezint
deleii n poriunea mijlocie a domeniului central al distrofinei.
Evidenierea
expresiei
caveolinei-3
la
pacieni
cu
distrofii
musculare
progresive
Caveolina-3 este exprimat n muchiul scheletic i cardiac i este localizat
la nivelul sarcolemei fibrelor musculare, unde formeaz un complex cu distrofina i
proteinele asociate acesteia prin legarea la domeniul intracelular al -distroglicanilor
(Song i col., 1996). Totui caveolina-3 n cele mai multe cazuri pare s nu fie direct
asociat cu complexul proteinelor asociate distrofinei ( Crosbie i col., 1998).
Dintre pacienii lotului de studiu pentru determinarea expresiei caveoline-3 au
fost selectai 10 pacieni la care celelalte proteine musculare aveau o expresie
normal i pentru care clinicienii au stabilit ca diagnostic distrofie muscular
progresiv. Acest diagnostic este dat atunci cnd pacientul prezint un tablou tipic
pentru distrofie muscular, are CK serice n concentraie mare (mai mare de 500U/
I), EMG indic un tablou electric modificat i nu se cunoate cu exactitate cauza
apariiei bolii.
n urma analizei expresiei caveolinei-3 s-a constatat c unul dintre cele 10
cazuri luate n studiu a prezentat o expresie modificat.
Pagina 14
Rezumat
Pagina 15
Rezumat
Pagina 16
Rezumat
MUSCULARE
IMPLICATE
DISTROFIILE
Pagina 17
Rezumat
Pagina 18
Rezumat
Pagina 19
Rezumat
Analizele
Western
blotting
se
coreleaz
bine
cu
analizele
de
studiu;
Cele mai comune mutaii care au loc n gena distrofinei sunt deleiile care
reprezint aproximativ 65 % din totalul mutaiilor i duplicaiile cu o frecven
cuprins ntre 5% i 15%. ( Abbs i col., 1992). Deleiile i mai rar duplicaiile pot avea
loc de-a lungul ntregi gene dar s-a demonstrat c exist doua zone fierbini n gena
Tez de doctorat Drd Gisela Gin, 2008
Pagina 20
Rezumat
distrofinei numite zone hotspot n care frecvena mutaiilor este foarte ridicat. Una
dintre acestea este zone este situat n regiunea central a genei iar cealalt spre
capatul 5 al genei.
Procentele rmase sunt reprezentate de mutaii punctiforme ce apar datorit
mutaiilor frame-shift sau mutaiilor de tip nonsense.
Tehnica MLPA (multiplex ligation-dependent probe amplification) introdus
de ctre Schouten i col. n anul 2002, permite detectarea sistematic a
modificrilor cantitative i calitative de la nivelul exonilor genei distrofinei - mutaii de
tipul deleiilor i duplicaiilor. Cu ajutorul acestei tehnici se pot identitifica cu un bun
randament deleiile i duplicaiile genice responsabile de apariia DMD/BMD.
Au fost analizate prin aceast tehnic un numar de 40 de pacieni la care s-a
stabilit prin metodele prezentate anterior: imunofluorescen i western blotting c
proteina implicat n procesul distrofic este distrofina. Dintre aceti 40 de pacieni, 9
sunt de sex feminin ntre care dou gemene n vrst de 9 ani iar restul 11 sunt
baiei cu vrste cuprinse ntre 3-15 ani
Probele biologice au constat n 3 ml sange recoltat pe EDTA din care n
continuare s-a efectuat extracia de ADN.
Datele obinute n urma aplicrii protocolului de MLPA la probele luate n
studiu au fost corelate cu cele obinute prin imunofluorescen i western blotting
pentru stabilirea unor corelaii ntre rezultatele obinute prin imunofluorescen i
western blotting.
Tehnica MLPA a permis realizarea screeningului celor 79 exoni ai genei
distrofinei n dou recaii PCR. Este o metod simpl i rapid i care ofer rezultate
foarte exacte fiind identificai prin aceast metod un numr de 13 pacieni care au
prezentat mutaii la nivelul genei distrofinei. Majoritatea mutaiilor au fost de tipul
deleiilor la 12 pacieni i un singur pacient a prezentat duplicaii. n cazul probelor
analizate deleiile au implicat n general exonii 45-50.
Metoda permite identificare a deleiilor care au loc la nivelul unui singur exon.
n cadrul studiului nostru a fost identificat dou cazuri care au prezentat o deleie la
nivelul unui singur exon exonul 45 n cazul probei 22 si exonul 38 n cazul probei 9.
Pagina 21
Rezumat
n cazul probei 22 la care a fost identificat deleia exonului 45, prin analiza
de imunofluorescen s-a observat absena semnalului pentru distrofin. Analiza
western blot a confirmat absena semnalului. Cercetrile de specialitate au artat c
deleia exonului 45 determin sinteza unor cantiti mici de distrofina deleia acestui
exon fiind implicat n distrofia muscular Duchenne. Diagnosticul n cazul acestui
pacient a fost de distrofie muscular Duchenne.
Corelarea datelor obinute prin imunofluorescena i westen blotting cu cele
rezultate n urma reaciei de MLPA la aceti pacieni, a condus la stabilirea
diagnosticului de distrofie muscular Duchenne.
Corelaiile genotip-fenotip sunt dificil de realizat deoarece foarte muli pacieni
cu distrofie muscular Duchenne ct i distrofie muscular Becker prezint excepii
de la teoria cadrului de citire a lui Montoni.
Probele la care nu au fost identificate mutaii dup aplicarea protocolului
MLPA vor fi supuse unei noi testri moleculare pentru identificarea eventualelor
mutaii punctiforme.
CONCLUZII:
Pagina 22
Rezumat
moleculare.
CAPITOLUL
GENA
DISTROFINEI
DETERMINAREA
Gena distrofinei este cea mai mare gen descris la om fiind format din mai
mult de 2.5 milioane perechi de baze ceea ce corespunde la mai mult de 0.1 % din
ntregul genom i aproximativ 1.5% din ntregul cromozom X ( LM Kunkel i col.,1989).
DMD i DMB sunt afeciuni ereditare recesive X- linkate cauzate de mutaii la
nivelul genei distrofinei i caracterizate prin reducerea sau absena expresiei
distrofinei din sarcolema muchiului striat. 2035% dintre pacienii cu DMD i BMD
nu prezint deleii sau duplicaii la nivelul genei distrofinei ( R.G. Roberts i col.,1994).
Pagina 23
Rezumat
Pagina 24
Rezumat
exonilor luai n studiu, pentru stabilirea unui diagnostic n cazul acestor pacieni fiind
necesar investigarea i restului de exoni din gena distrofinei.
La 7 pacieni au fost identificate o mutaie punctiform la nivelul unui exon
(probele 3, 10, 14, 15, 16, 25), 4 pacieni au prezentat mutaii punctiforme la nivelul e
doi exoni (probele 9, 12, 17, 40) i un singur caz a prezentat mutaii punctiforme la
nivelul a trei exoni (proba 30).
Prin secveniere au fost analizat 14 probe selectate din acele probe la care
prin MCA nu au fost observate mutaii, dar diagnosticul clinic a fost de distrofie
muscular. A fost ales pentru secveniere si proba 14, una din gemenele analizate
prin tehnica MCA, deoarece ambele prezentau aceasi mutatie.
La dou probe (proba 12, proba 14) mutaia punctiform prezent a
determinat formarea codonului STOP formarea lor determinnd producere unei
proteine foarte afectate care este rapid degradat ( Matsuo M., 1996).
Este vorba despre probele 12 si 14 la care au avut loc modificarie: n cazul
probei 12 - c.1990C>T (CAG>TAG, Glutamine>STOP) i n cazul probei 14
c.1843C>T (CAA>TAA, Glutamine>STOP).
Totodat n cazul probei 9, mutaia determinat (c.11046+119 A>G) prezint o
patogenie necunoscut.
CONCLUZII
Pagina 25
Rezumat
Este o metod uoar care ntr-un timp foarte scurt permite identifcarea
modificarilor la nivelul fiecrui exon, oriennd cutarea mutaiei ntr-o anumit
regiune a genei, nemaifiind necesar secvenierea ntregii gene DYS.
Pagina 26
Rezumat
Pagina 27
Rezumat
Pagina 28
Rezumat
pacienilor
cu
distrofie
muscular
Becker,
deoarece
permite
dou
prin
intermediul
filaminei
C.
Complexul
sarcoglicanilor
Pagina 29
Rezumat
la
pacienii
cu
diferite
forme
de
distrofii
musculare.
7.3. Analiza duplicaiilor i deleiilor de la nivelul genei distrofinei prin
tehnica MLPA
A fost pus la punct pentru prima dat n Romnia un protocol de
Pagina 30
Rezumat
Pagina 31
Rezumat
BIBLIOGRAFIE
o Aartsma-Rus A, Janson AA, van Ommen GJ, van Deutekom JC..
Antisense-induced exon skipping for duplications in Duchenne muscular
dystrophy. BMC Med Genet 8:43. (2007).
o Anderson L.V.B. K. Davison, Multiplex Western Bloting System For The
Analysis Of Muscular Dystrophies Proteins. Am. J. Pathol., 154 (4),
1999,1017-1022. 1179, (1998).
o Anderson Lv, Davison K, Moss Ja, Richard I, Fardeau M, Tome Fm,
Hubner C, Lasa A, Colomer J & Beckmann Js . Characterization Of
Monoclonal Antibodies To Calpain 3 And Protein Expression In Muscle From
Patients With Limb-Girdle Muscular Dystrophy Type 2a. American Journal Of
Pathology, 153: 1169- 1174, 2000
o Anderson, L.V., Davison, K., Moss, J.A., Young, C., Cullen, M.J., Walsh,
J., Johnson, M.A., Bashir, R., Britton, S., Keers, S., Argov, Z., Mahjneh, I.,
Fougerousse, F., Beckmann, J.S., Bushby, K.M.. Dysferlin is a plasma
membrane protein and is expressed early in human development. Hum. Mol.
Genet. 8: 855861. (1999)
o Anderson, L.V., Harrison, R.M., Pogue, R., Vafiadaki, E., Pollitt, C.,
Davison, K., Moss, J.A., Keers, S., Pyle, A., Shaw, P.J., Mahjneh, I., Argov,
Z., Greenberg, C.R., Wrogemann, K., Bertorini, T., Goebel, H.H.,
Beckmann, J.S., Bashir, R., Bushby, K.M. Secondary reduction in calpain 3
expression in patients with limb girdle muscular dystrophy type2B and Miyoshi
myopathy (primary dysferlinopathies). Neuromusc. Disord. 10: 553559.
(2000).
o Bashir R, Britton S, Strachan T, et al. A gene related to Caenorhabditis
elegans spermatogenesis factor fer-1 is mutated in limb-girdle muscular
dystrophy type 2B. Nat Genet;20:3742.(1998).
o Bakker E., Van Ommen G.J.B.. Duchenne and Becker Muscular Dystrophy
(DMD and BMD). In Neuromuscular Disorders: Clinica land Molecular
Genetics, Ed by, A.E.H., Emery, John Wiley & Sons Ltd., 59 -85. (1998)
o Beggs AH, Koenig M, Boyce FM, Kunkel LM Detection of 98% of
DMD/BMD gene deletions by polymerase chain reaction. Hum Genet 86:45
48. (1990)
o Beggs AH. Dystrophinopathy, the expanding phenotype. Dystrophin
abnormalities in X-linked dilated cardiomyopathy [editorial; comment].
Circulation.; 95: 23447. (1997).
o Bione S, Maestrini E, Rivella S, Mancini M, Regis S, Romeo G, Toniolo D:
Identification of a novel X-linked gene responsible for Emery-Dreifuss
muscular dystrophy. Nat Genet, 8:323-327, 1994
o Blake D.J. . Function And Genetics Of Dystrophin And Dystrophin - Related
Proteins In Muscle. Physiol Rev. 82, 291 329 (2002)
Tez de doctorat Drd Gisela Gin, 2008
Pagina 32
Rezumat
o Blake, D.J., Weir, A., Newey, S.E. and Davies, K.E. (2002). Function and
genetics of dystrophin and dystrophin-related proteins in muscle. Physiol.
Rev. 82:291329.
o Bonemann A., Anderson L.V.. Diagnostic protein expression in human
muscle biopsies. Brain Pathol., 10, 193 - 214. (2000)
o Bonne G, Di Barletta MR, Varnous S, Becane HM, Hammouda EH, Merlini
L, Muntoni F, Greenberg CR, Gary F, Urtizberea JA et al.: Mutations in the
gene encoding lamin A/C cause autosomal dominant Emery- Dreifuss
muscular dystrophy. Nat Genet, 21:285-288, (1999).
o Bnnemann, C.G. Limb-girdle muscular dystrophies: an overview. J.
Child. Neurol. 14: 3133. (1999).
o Bushby K.M.D.. The limb girdle muscular dystrophies multiple genes,
multiple mechanisms. Human Molecular Genetics, 8 (10): 1875 1882.
(1999)
o Campbell K.B.. Three muscular dystrophies loss of cytoskeleton extracellular
matrix linkage. Cell, 80, 675 - 679. (1995)
o Campbell, K.P. and Kahl, S.D. Association of dystrophin and an integral
membrane glycoprotein. Nature 338: 259262. (1989).
o Cao H, Hegele RA: Nuclear lamin A/C R482Q mutation in Canadian kindreds
with Dunnigan- type familial partial lipodystrophy. Hum Mol Genet 2000,
9:109-112.
o Carpenter, S, Karpati, G: Pathology of Skeletal Muscle. New York: Churchill
Livingstone; (2002).
o Chamberlain JS, Gibbs RA, Ranier JE, Nguyen PN, Caskey CT Deletion
screening of the Duchenne muscular dystrophy locus via multiplex DNA
amplification. Nucleic Acids Res 16:1114111156. (1988)
o Cohn, R.D. And Campbell, K.P Molecular Basis Of Muscular Dystrophies.
Muscle Nerve 23, 14561471 (2000)
o Crosbie RH, Lebakken CS, Holt KH, Venzke DP, Straub V, Lee JC, Grady
RM, Chamberlain JS, Sanes JR, Campbell KP. Membrane targeting and
stabilization of sarcospan is mediated by the sarcoglycan subcomplex. J Cell
Biol;145:153165. (1999).
o Crosbie RH, Lim LE, Moore SA, Hirano M, Hays AP, Maybaum SW, Collin
H, Dovico SA, Stolle CA, Fardeau M, Tome FM, Campbell KP. Molecular
and genetic characterization of sarcospan: insights into sarcoglycansarcospan interactions. Hum Mol Genet;9:20192027. (2000).
o Culligan K.G., Mackey A.J., Finn D.M., Maguire P.B., Ohlendieck K. Role of
dystrophin isoforms and associated proteins in muscular dystrophy, Int. J.
Med., 2, 639 648. (1998).
o Dalkilic I, Schienda J, Thompson TG, Kunkel LM. Loss of Filamin C (FLNc)
results in severe defects in myogenesis and myotube structure. Mol Cell
Biol;26:65226534. (2006).
o Davies, K.E., Smith, T.J., Bundey, S. et al. Mild and severe muscular
dystrophy associated with deletions in Xp21 of the human X chromosome. J.
Med. Genet., 25: 9-13. (1988)
Tez de doctorat Drd Gisela Gin, 2008
Pagina 33
Rezumat
Pagina 34
Rezumat
Pagina 35
Rezumat
Pagina 36