Aminocidos, pptidos y protenas

Bioqumica

TEMA 4

AMINOCIDOS, PPTIDOS Y PROTENAS

1. Estructura y clasificacin de los aminocidos.
2. Propiedades cido-base de los aminocidos y pptidos
3. El enlace peptdico
4. Pptidos: hidrlisis y secuenciacin
5. Clasificacin y funcin biolgica de las protenas
6. Niveles estructurales de las protenas

1. Estructura y clasificacin de los aminocidos.

Como su nombre indica los aminocidos son compuestos que poseen un grupo
amino (-NH2) y un grupo cido (carboxlico -COOH) en su estructura. Los
aminocidos son los precursores de los pptidos y las protenas, y en ellos el grupo
amino y el grupo carboxilo, se encuentran unidos al mismo tomo de carbono,
conocido como carbono- (-aminocidos). La estructura general de los aminocidos (a excepcin de la prolina, que es cclica) se muestra en la Figura 1.

Figura 1.
Estructura qumica de un aminocido. Estructura qumica
en el plano y estructura espacial. Enantimeros del aminocido
alanina.

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Como se puede apreciar, el carbono- (a excepcin de la glicina) es un carbono

quiral y como tal presenta dos enantimeros (L- y D-). Los 20 -aminocidos
presentes en las protenas son de la serie L- y en su representacin de Fischer
poseen el grupo amino hacia la izquierda. La diferencia entre los aminocidos viene
dada por el resto -R, o cadena lateral, unida al carbono-. Atendiendo a la
naturaleza del grupo -R los aa s pueden clasificarse en:

Neutros o apolares
Polares sin carga
Polares con carga negativa
Polares con carga positiva

La Figura 2 recoge las estructuras de los 20 L--aminocidos a pH fisiolgico.

Neutros o Apolares. Son 8 los aminocidos que se clasifican como poseedores de
cadenas laterales no polares. La alanina, valina, leucina e isoleucina, poseen
cadenas laterales de hidrocarburos alifticos. La metionina posee una cadena
lateral de ter tilico (C-S-C). La prolina es el nico aminocido cclico, pues el
grupo -R se cierra sobre el N del grupo -amino (realmente es un amina
secundaria). Por su parte, la fenilalanina y el triptfano contienen grupos
aromticos.
Polares sin carga. Siete son los -aminocidos cuyo resto -R es polar pero sin
carga. La glicina posee la cadena ms simple, un tomo de hidrgeno. La serina y
la treonina son portadores de un grupo hidroxilo (-OH). La asparragina y la
glutamina, poseen cadenas laterales portadoras de un grupo amida, y por hidrlisis
dan lugar, respectivamente, a aspartato y glutamato, dos aminocidos con carga
negativa. La tirosina posee un grupo fenlico y la cistena debe su polaridad a la
presencia de un grupo tilico (-SH).
Polares con carga negativa. Existen dos -aminocidos cuyo resto polar posee
carga negativa a pH fisiolgico, debida a la presencia de un grupo carboxilo (COOH) , el cido glutmico y el cido asprtico.
Polares con carga positiva. Tres son los -aminocidos que poseen restos -R
cargados positivamente a pH fisiolgico. La lisina posee una cadena lateral de
butilamonio, la arginina presenta un grupo -R de guanidina y la histidina es
portadora de un grupo -R de imidazolio.

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Figura 2.
Estructura qumica de los L-aminocidos.

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Esta clasificacin se ha realizado en base al grupo -R, pero es importante indicar

que a pH fisiolgico (pH 7,3), el grupo -amino se encuentra cargado positivamente
y el grupo -carboxilo lo est negativamente, por esta razn en la Figura 2 estos
grupos aparecen siempre cargados.
Dentro del conjunto de los aminocidos naturales, existen unos que pueden ser
sintetizados por las clulas humanas a partir de otras sustancias, pero tambin hay
aminocidos que debemos tomarlos en la dieta, ya que nuestras clulas no pueden
sintetizarlos o, cuando menos, no en cantidad suficiente para satisfacer la demanda
del organismo; se conocen con el nombre de aminocidos esenciales y son valina,
leucina, isoleucina, treonina, metionina, fenilalanina, triptfano y lisina.

2. Propiedades cido-base de los aminocidos y los pptidos

El pH del medio en el que se encuentre el aminocido es esencial para determinar
sus propiedades cido-base, aspecto importante pues de ello dependen las
propiedades qumicas y la funcionalidad biolgica de los pptidos y protenas que
forman.
Las propiedades cido-base de un aminocido vienen determinadas por los grupos
protonables que posea. Un aminocido puede actuar bien como cido o como base
(sustancias anfteras), pudiendo tener hasta tres grupos con carcter cido-base:
el -amino, el -carboxilo y, en algunos casos, el resto -R. Lo importante es que
estos grupos poseen un carcter cido-base dbil, lo que hace que, dependiendo
del pH, el correspondiente equilibrio pueda desplazarse en un sentido o en otro
(hacia la forma protonada o hacia la desprotonada, Figura 3).

Figura 3
Ionizacin de un L-aminocido.
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La expresin que regula la proporcin entre las formas protonada y desprotonada

es:

pH pK a log

DP
P

Donde P es la forma protonada y DP es la forma desprotonada. Veamos como

afecta el pH a la valina. La val posee slo dos grupos protonables, el -amino y el
-carboxilo. A pH fisiolgico la valina presentara la siguiente estructura:

COO

NH3

CH
CH

CH3

CH3

Tomemos los grupos por separado y veamos como les afecta el pH. El grupo amino presentara dos formas, una protonada (P) y cargada positivamente (-NH 3+),
y otra desprotonada (DP) y sin carga (-NH2), segn el siguiente equilibrio:
NH 3 NH 2 H

donde el pK a log K a 8

si el pH aumenta, el equilibrio se desplaza hacia la derecha (dominando la forma

con carga 0) y si disminuye lo har hacia la izquierda (dominando la forma con
carga +1).
Con el grupo -carboxilo ocurrira algo similar:
COOH COO H

donde el pK a log K a 2

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En funcin del pH, la proporcin de forma protonada (carga 0) o forma

desprotonada (carga -1) variar, respetando siempre la constante de ionizacin del
grupo en cuestin si la temperatura se mantiene constante.
Supongamos que estamos ahora a pH 1; en estas condiciones de elevada
concentracin de protones en el medio ambos equilibrios estaran desplazados en
un 100 % hacia las formas protonadas. Si aumentamos el pH los equilibrios
comenzaran a desplazarse hacia la derecha hasta llegar a un pH muy bsico,
momento en el que las formas dominantes (al 100 %) seran las desprotonadas.
Pero, qu ocurre a pHs intermedios?. Para ello debemos tener en cuenta la K a
para cada equilibrio, o mejor dicho su pK a (que sera el -logK a). El grupo -amino de
la valina tiene un pK de 8, y esto quiere decir que a pH 8 el 50 % de los grupos
amino estarn protonados (si tenemos 100 molculas de valina, 50 tendrn el grupo
amino protonado y 50 lo tendrn desprotonado, al menos tericamente, segn se
desprende de la constante de ionizacin). Por su parte el grupo -carboxilo de la
valina, que tiene un pK de 2, estar protonado al 50 % cuando el pH del medio sea
2.
En general se asumen las siguientes consideraciones, para determinar el porcentaje
de protonacin de un grupo ionizable en un aminocido:

Si el pH < pK-1 el grupo esta al 100 % protonado

Si el pH > pK+1 el grupo est al 100 % desprotonado
Si el pH = pK el grupo est al 50 % protonado

Tomemos ahora un aminocido con tres grupos ionizables, el cido glutmico:

(-amino) NH3

CH

COO - (-carboxilo)

CH2
CH2
COO (-carboxilo)

que posee el grupo -amino, el -carboxilo y el -carboxilo. Los tres grupos

ionizables darn lugar a tres equilibrios cido-base distintos, cada uno con su

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correspondiente pKa (2, 4 y 8 respectivamente). Para ver como afecta el pH a la

carga de cada grupo vamos a realizar la siguiente tabla, en la que ordenamos (de
menor a mayor pK) los grupos protonables y sus correspondientes valores de carga
en funcin del pH:

GRUPO

10

-carboxilo
(pK=2)

-0,5

-1

-1

-1

-1

-1

-1

-1

-1

-carboxilo
(pK=4)

-0,5

-1

-1

-1

-1

-1

-1

-amino
(pK=8)

+1

+1

+1

+1

+1

+1

+1

0,5

carga total

+1

0,5

-0,5

-1

-1

-1

-1,5

-2

-2

1) a pH= 1, el pH es inferior en una unidad al pK del grupo -COOH, el cul

estar protonado al 100 %, luego su carga ser 0; y lo mismo le ocurrir al
grupo -COOH, protonado al 100 % y con carga 0. Por su parte, el grupo amino tambin estar protonado, aunque en este caso la carga del grupo es
+1.
2) a pH= 2, se produce coincidencia del pH con el pK del -COOH, por lo que
estar al 50 % protonado. Luego la carga ser -0,5 ; este pH es an dos
unidades inferior al pK del grupo -COOH, que seguir protonado (0), como
tambin le ocurrira al grupo -amino (+1). La carga total del glutmico sera
0,5.
3) a pH= 3, se ha superado en una unidad el pK a del -COOH, luego estar
desprotonado al 100 % y su carga ser -1 para valores superiores de pH. Los
otros dos grupos siguen estando protonados al 100 % (0 y +1,
respectivamente). Y la carga total ser cero.
4) a pH= 4, el pH coincide con el pKa del grupo -COOH y estar protonado
en un 50% (carga -0,5). El -COOH seguir desprotonado (0) y el -amino
protonado (+1). La carga total ser ahora -0,5.

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5) a pH=5 el grupo -COOH estar al 100 % desprotonado y el resto de

grupos seguir igual, hasta llegar a pH= 8, donde el -amino estar
desprotonado al 50 % (0,5) , grupo que se desprotonar al 100 % a partir de
un pH= 9.
Como se puede apreciar en la tabla, la carga total del aminocido depende del pH
de la disolucin en que se encuentre.
En la siguiente tabla pueden localizarse los aminocidos que, al igual que el cido
glutmico, poseen grupos R protonables.

Existe un pH al cual la carga neta del aminocido es cero (si lo colocamos en un

campo elctrico no se desplazar hacia ninguno de los polos). El pH al cul un
aminocido posee carga neta cero recibe el nombre de punto isoelctrico (pI), que
es la media aritmtica de los valores de pK 1 y pK2 que delimitan la forma con carga
cero.

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3. El enlace peptdico
Los aminocidos se encuentran unidos en los pptidos y las protenas mediante un
enlace amida (-CO-NH-):

Este enlace se forma por reaccin entre el grupo -COOH de un aminocido y el amino del siguiente (con prdida de una molcula de agua) y recibe el nombre de
enlace peptdico.

Figura 4.
Estructura espacial del enlace peptdico. (a) Ilustracin del
carcter parcialmente doble del enlace peptdico. (b)
Configuracin del plano que conforman el enlace peptdico y
los carbonos extremos.

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Entre los aos 1930-1940, Pauling y Corey, mediante el estudio de Rayos X de

cristales de aminocidos, dipptidos y triptidos, dilucidaron la estructura
tridimensional del enlace peptdico (Figura 4). As, descubrieron que la unin C-N
del enlace peptdico era ms corta que en la mayor parte de los dems enlaces C-N
y llegaron a la conclusin de que el enlace deba tener algn carcter de doble
enlace, por la aparicin de dos formas resonantes:

Luego dedujeron que los 4 tomos que rodeaban al enlace peptdico C-N (O, C,
C, H) estaban situados en el mismo plano, de tal manera que el oxgeno del grupo
carbonilo y el hidrgeno del N-H estaran en posicin trans. Esta ordenacin es
rgida, y es el resultado de la estabilizacin por resonancia de las formas
anteriormente citadas.

Partiendo de estos dos hechos, puede describirse el armazn de una cadena

polipeptdica como constituido por una serie de planos, con posibilidad de giro en
los C. De esta forma podemos escribir la estructura de un pptido como una
sucesin de planos en la que los grupos -R se van alternando (Figura 5).

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Figura 5.
Estructura espacial de un pptido. Secuencia ordenada de
los planos de enlace peptdico en el espacio. Los grupos R se
alternan por encima y debajo del plano general de la molcula.

4. Secuenciacin de un pptido
La secuencia de un pptido tiene gran importancia porque entre otras cosas
condiciona los siguientes niveles estructurales. La insulina bovina fue la primera
protena que se secuenci completamente por Sanger en 1953, lo que le vali el
premio Nobel. La determinacin de la secuencia de la insulina fue el resultado del
trabajo de muchos cientficos durante 10 aos, desde entonces se han secuenciado
miles de protenas.
La secuencia de un pptido, si conocemos el gen del que proviene, puede
secuenciarse indirectamente, secuenciando dicho gen. Pero tambin puede hacerse
la secuenciacin qumica directa. Los pasos a seguir son:
-

Determinacin de la composicin del pptido por hidrlisis total y posterior

anlisis cromatgrfico.
Determinacin de los extremos C-terminal y N-terminal
Fragmentacin por hidrlisis selectiva
Secuenciacin: Degradacin de Edman

La determinacin de la composicin del pptido se realiza por hidrlisis total

presencia de HCl 6N, calentando a 100 C durante 10-24h, y en tubo al que se le
ha hecho el vaco. Tras el proceso se utiliza un sistema cromatogrfico que

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permita separar y determinar cuntos y cules son los aminocidos que forman la
cadena.
La determinacin de los extremos C-terminal y N-terminal. Hay mtodos que
permiten determinar el primer aminocido (Resto N- terminal) o el ltimo (Resto
C- terminal) de una cadena polipeptdica.
La determinacin del resto N-terminal, se puede realizar, entre otros mtodos,
mediante la Degradacin de Edman: en este proceso el pptido reacciona con
fenil isotiocianato que se une selectivamente al primer aminocido. A continuacin
se escinde con HF anhidro el aminocido marcado, separndolo del resto
selectivamente con un disolvente orgnico. Tras un tratamiento en medio cido el
compuesto resultante se determina cromatogrficamente (Figura 6).

Figura 6.
Determinacin de la secuencia de un pptido. Determinacin del
primer
aminocido
utilizando
2,4-dinitrofluorobenceno
(a)
o
fenilisotiocianato (b). Este segundo mtodo tambin se conoce como
degradacin de Edman .

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Por otro lado, la determinacin del resto C-terminal, se puede realizar con
Hidracina: este compuesto reacciona con todos los enlaces peptdicos del pptido,
provocando la hidrlisis de los mismos y dando lugar a aminoacil-hidracinas con
todos los aminocidos excepto con el ltimo (C-terminal), pudiendo separarse del
resto fcilmente y determinarse con posterioridad su naturaleza.

Fragmentacin por hidrlisis parcial es necesaria porque por lo general no pueden

secuenciarse pptidos con mas de 20 o 30 aminocidos. Se realiza con reactivos
selectivos (en la mayora de los casos proteasas) que hidrolizan determinados
enlaces peptdicos.
La tripsina hidroliza por la derecha de Arg , Lys
La quimotripsina hidroliza por la derecha de Phe, Trp, Tyr
La pepsina hidroliza por la izquierda de Phe, Trp, Tyr
La termolisina hidroliza por la izquierda de Val, Leu, Ile
El bromuro de ciangeno (BrCN) hidroliza por la derecha de la Met
La secuenciacin. Entre los distintos mtodos existentes, podemos citar la
degradacin de Edman, cuyo fundamento hemos visto en la determinacin del
extremo N-terminal. La aplicacin continuada de varios ciclos de la degradacin de

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Edman me permite la secuenciacin de todo el pptido, siempre que este no tenga

ms de 20 o 30 aminocidos.
No obstante los actales requerimientos de secuenciacin de gran cantidad de
pptidos en poco tiempo, han dado origen al desarrollo de nuevos mtodos de
secuenciacin de pptidos, desarrollados principalmente para afrontar proyectos
como el del proteoma humano. Entre estos mtodos podemos citar el MALDI MS y
el ESI MS, ambos basados en la espectrometra de masas.
La espectrometra de masas permite calcular la masa del compuesto analizado con
gran precisin. Esta tcnica se basa en que la desviacin que sufre una partcula
cargada al atravesar un campo magntico depende bsicamente de su carga y
masa. Si ionizamos las molculas, la mayora con carga +1, y las sometemos a un
barrido de campo magntico obtenemos un espectro de masas. Esta tcnica se
utilizaba con molculas en fase gaseosa lo que impeda su aplicacin a molculas
sensibles a la descomposicin por calor o por los tratamientos tradicionales
utilizados para pasar la muestra a fase gaseosa. En 1988 se desarrollaron dos
tcnicas que permiten evitar este problema.
La espectrometra de masas da mucha informacin sobre la masa molecular, la
presencia de cofactores, etc. Y adems puede utilizarse para secuenciar pequeas
cadenas de polipptidos, mediante una tcnica conocida como tanden MS, que
bsicamente consiste en dos epectrometros de masas en serie. La protena bajo
estudio se trata con proteasas para obtener una mezcla de pequeos pptidos. En
el primer espectrmetro la mezcla de pptidos se trata de forma que solo uno de los
pptidos es seleccionado para su posterior anlisis. El pptido seleccionado se
fragmenta en la cmara de colisin que se encuentra entre los dos espectrmetros
donde una pequea cantidad de gas noble (He o Ar) produce la fragmetacin del
pptido preferentemente por los enlaces peptdicos, como la cmara est en vaco
no hay agua los productos son radicales. Los fragmentos son medidos en el
segundo espectrmetro. En un especto tpico los picos mayoritarios corresponden a
radicales que difieren en la masa de un aminocido particular. As puede deducirse
la secuencia. La nica ambigedad tiene lugar entre la leucina y la isoleucina que
tienen la misma masa molecular. Este mtodo es rpido, requiere slo minsculas
cantidades de muestra que pueden ser extradas de una electroforesis
bidimensional. Las grandes compaas como Celera (particip en el proyecto
genoma humano) disponen de sistemas automatizados en que una gran cantidad de
protenas se separan por electroforesis bidimensional o HPLC, cada punto puede

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ser luego secuenciado por un espectrmetro en tandem. Este mtodo podra usarse
tambin para la secuenciacin de DNA, pero los mtodos tradicionales son tan
rpidos que no es rentable.
La figura muestra un tpico espectro realizado por espectrometra en tandem de un
pequeo pptido de 10 amincidos. La secuencia deducida de este pptido fue;
Phe-Pro-Gly-Gln-(Ile/Leu)-Asn-Ala-Asp-(Ile/Leu)-Arg.

5. Clasificacin y funcin biolgica de las protenas

Las protenas son cadenas polipptidicas que se diferencian de los oligopptidos en
el nmero de aminocidos que contienen, en su carcter funcional y sobre todo en
que son el resultado del proceso de traduccin gentica. La conformacin de una
protena hace referencia a la disposicin espacial de la misma, aspecto de vital
importancia, pues va a estar directamente relacionado con la funcin que
desempean. Segn la conformacin las protenas pueden clasificarse en fibrosas
y globulares. Las fibrosas poseen las cadenas polipeptdicas ordenadas de modo
paralelo a lo largo de un eje. Forman materiales fsicamente resistentes e insolubles
en agua, siendo elementos bsicamente estructurales como por ejemplo la queratina del pelo, la fibroina de la seda o el colgeno de los tendones. Por su
parte, las protenas globulares, estn constituidas por una o varias cadenas
polipeptdicas plegadas de modo que puedan adoptar una conformacin esfrica o
globular, desempeando diferentes funciones de tipo metablico (protenas
transportadoras, enzimas, anticuerpos,...). Algunas protenas incluso pueden
situarse entre estas dos conformaciones como sera el caso de la miosina de los
msculos o el fibringeno de la sangre.

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6. Niveles estructurales de las protenas

La conformacin que presenta una protena va a depender directamente de los
distintos niveles estructurales (hasta cuatro, esquema en Figura 7) que posee,
niveles que a continuacin se detallan.

Figura 7.
Esquema de los cuatro niveles de estructura de las protenas.

a) Estructura primaria: hace referencia a la posicin que ocupa cada aminocido

en la cadena polipeptdica, es decir nos da idea de la secuencia de la protena. La
importancia de este nivel radica en que la posicin que ocupa cada aminocido
dentro de la cadena va a condicionar enormemente el resto de los niveles
estructurales y en ltimo trmino la funcin que desempea la protena.

b) Estructura secundaria: hace referencia a la ordenacin regular y peridica de la

cadena polipeptdica en una direccin determinada. Bsicamente, podemos
encontrar dos tipos de estructura secundaria, la hlice- y la conformacin-.

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En la Hlice- (Fig.8) la cadena polipeptdica adopta una conformacin

helicoidal. Las estructuras helicoidales se caracterizan por el numero de
aminocidos por vuelta (n) (3,6 restos en la Hlice-) y por su paso de
rosca (p), o distancia entre vueltas (5,4 para la Hlice-). Esta
conformacin se estabiliza por puentes de hidrgeno (R-C=O H-N-R)
intracatenarios (dentro de la hlice). Adems, los restos -R de los
aminocidos se disponen hacia fuera de la hlice evitando las interacciones
estricas (por grupos voluminosos) y estabilizando la conformacin. Por otro
lado, la hlice- se distorsiona o pierde la conformacin cuando en la
secuencia aparece una prolina, nico aminocido ciclado por su grupo amino.

Figura 8.
Esquema de la hlice-

En la conformacin- (Fig.9) la cadena adopta una ordenacin lineal en la

que los restos -R, de los aminocidos, se van alternando por encima y por
debajo (zig-zag) del plano del enlace peptdico. Esta conformacin se
estabiliza con puentes de hidrgeno entre varias cadenas de protenas con
conformacin-. El resultado de estas interacciones es la hoja plegada ,
que puede presentar un plegamiento paralelo, (en el que las cadenas
vecinas se desarrollan en la misma direccin), o bien un plegamiento
antiparalelo con cadenas vecinas en direcciones opuestas.

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Figura 9.
Esquema de la hoja plegada-En
antiparalela (a) y paralela (b)

conformacin

Aunque las dos conformaciones (hlice- y hoja plegada- son posibles dentro de
una misma protena (como veremos en la estructura terciaria), existen tambin
protenas que presentan slo una de las dos.
La -queratina es una protena que
aparece en todos los vertebrados
superiores y es el componente
principal del pelo, la lana, las uas o
los cuernos. El pelo est construido
por clulas muertas, cada una de las
cuales
contiene
macrofibrillas
empaquetadas que se orientan
paralelamente a la fibra del pelo.
stas estn formadas por microfifrillas,
que es una asociacin de protofibrillas
que continen dos cadenas de hliceque se retuercen en un arrollamiento
hacia la izquierda. Las -queratinas
Fig.10
poseen un alto contenido de Cys (R=
-queratina del pelo
-CH2-SH) de tal manera que las
interacciones entre las hebras se producen a travs de puentes disulfuro (-S-S-)
dando una gran resistencia e insolubilidad al conjunto. Aunque la insolubilidad de
las queratinas impide que la mayor parte de los animales la puedan digerir, la

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polilla, posee una concentracin elevada de mercaptanos, que rompen los puentes
disulfuro, en su tracto digestivo, y por lo tanto pueden digerir la lana.
Por su parte, la fibrona (Fig.11) de la seda es una agrupacin de -queratinas en
conformacin hoja plegada- antiparalela unidas por enlaces de hidrgeno
intracatenarios. La fibroina y otras -queratinas son muy ricas en aminocidos poco
voluminosos (gly y ala), lo que facilita que las hojas se apilen unas sobre otras, de
tal modo que se alternan zonas de contacto entre glicinas y zonas de contacto entre
alaninas, interaccionando mediante fuerzas dbiles de van der Waals. Este hecho
hace posible que la seda pueda extenderse en fibras fcilmente separables
(separando hojas) pero relativamente difciles de romper (implicara romper los
enlaces peptdicos).

Figura 11.
Hoja plegada- de la fibroina
de la seda.

Por otro lado, existe la posibilidad de transformar la -queratina en -queratina. As,

cuando el pelo o la lana se someten a la accin del vapor (calor + humedad) pueden
incluso duplicar su longitud. Lo que ocurre es que se rompen los puentes de
hidrgeno de la hlice- y las cadenas polipeptdicas adoptan una conformacin-;
no obstante los grupos -R de las -queratinas son muy voluminosos, lo que hace
que la conformacin- se desestabilice y al poco tiempo adopte de nuevo la
conformacin en -hlice con lo que el pelo o la lana recuperan su longitud original.
c) Estructura terciaria : hace referencia al modo en que se curvan o pliegan en el
espacio los segmentos de hlice- y/o conformacin-, que presenta una cadena

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polipeptdica de los protenas globulares. La conformacin espacial de las

protenas depende lgicamente de su estructura primaria, as las cadenas laterales
de los aminocidos en las protenas globulares se hallan distribuidas espacialmente
de acuerdo con sus polaridades, de tal forma que:
Los restos no polares aparecen, casi siempre, en el interior de la
protena, para no entrar en contacto con el disolvente acuoso que la
envuelve, creando un ambiente hidrofbico.
Los residuos polares con carga se hallan situados, normalmente en la
zona externa, interaccionando con el medio acuoso. A veces, se requiere
de estos centros en la parte interna de la protena y en estos casos
tambin ocurre que estn directamente implicados en alguna
funcionalidad de la protena, bien a nivel estructural o bien a nivel
cataltico.
Los grupos polares sin carga, aparecen distribuidos por la totalidad de la
cadena, si bien mayoritariamente, tambin aparecen en las partes
externas, en contacto con la disolucin acuosa.
Como consecuencia de esta distribucin de restos, las protenas globulares son
muy compactas, hay poco espacio en el interior, de modo que el agua difcilmente
accede a dicho espacio.
Algunas protenas, como le ocurre a la mioglobina (Fig.12) estn constituidas solo
por hlices-. La estructura terciaria de la mioglobina, se trata de una protena
globular que contiene una sola cadena polipeptdica, constituida por ocho
segmentos de hlice- . La mioglobina se halla, principalmente, en las clulas de
los msculos esquelticos y es especialmente abundante en los mamferos
buceadores, en los que no slo acta almacenando oxgeno, sino tambin
contribuyendo al aumento de la velocidad de difusin del oxgeno. La protena,
adems, contiene un componente no proteico, el grupo hemo que permite la
oxigenacin y desoxigenacin de forma reversible.

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Fig.12.
Estructura de la Mioglobina,
donde se aprecia el grupo
hemo (en rojo) y los 8
segmentos en hlice-

Otras protenas globulares, como la concanavalina A (Fig.13a) (lectina de soja)

mayoritariamente est formada por regiones extensas de hoja plegada-. Por otro
lado, tambin nos podemos encontrar con protenas que poseen cantidades
significativas de ambos tipos de estructura secundaria, como puede ser la
anhidrasa carbnica (Fig.13 b).

Fig.13.
Estructura de la concanavalina A (a) y la anhidrasa carbnica (b)

d) Estructura cuaternaria: Muchas protenas globulares son oligomricas, es decir

estn formadas por ms de una subunidad polipeptdica. La posicin espacial que
ocupa cada una de estas subunidades respecto a las otras queda determinada por

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la estructura cuaternaria. La estructura cuaternaria de la hemoglobina (Hb) estara

formada por cuatro subunidades (iguales dos a dos) cada una con su grupo hemo,
necesario para el transporte de oxgeno.

Fig.14
Estructura cuaternaria de la
hemoglobina

En la figura 7 se mostraban los cuatro niveles estructurales presentes en la

hemoglobina. As, se puede apreciar como la estructura primaria condiciona el resto
de niveles estructurales de la Hb. De hecho, existen varias mutaciones de las
molculas de Hb, en las que la secuencia de aminocidos difiere un poco de la
secuencia de la Hb normal (conocida como HbA). La mayora de estas mutaciones
son inofensivas, pero algunas causan graves enfermedades, como es el caso de la
Hb de las clulas falciformes (HbS).
La diferencia entre la HbA y la HbS (Fig.15a y
15b) radica slo en que en la secuencia una
molcula de ac. glutmico (polar con carga) es
sustituida por una Val (apolar). Este pequeo
cambio (1 de los 146 aas de las cadenas- )
tiene un profundo efecto sobre el resto de
niveles estructurales, pues la apolaridad de la
Fig.15a
Val (situada en un extremo exterior) interacciona
Glbulos rojos con HbA
de modo hidrofbico con partes apolares de las
subunidades a de otras HbS. Esto hace que las
molculas se agreguen y precipiten en las clulas. Como consecuencia, los

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Aminocidos, pptidos y protenas

Bioqumica

glbulos rojos (normalmente con forma de disco) adoptan una forma de media luna,
obstruyendo los capilares ms delgados, restringiendo el flujo sanguneo y
provocando entre otras complicaciones dolores severos y sudoracin.

Fig.15b
Glbulos rojos con HbS

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