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INGENIERA BIOTECNOLGICA
PRCTICA 1
Determinacin de actividad enzimtica y efecto de la
concentracin de enzima, pH, temperatura y fuerza
Inica en la actividad enzimtica (alfa-amilasa).
La Prctica 1 incluye 6 mdulos de iniciacin de tcnicas analticas y manejo
de equipo (1.1 a 1.6) necesarias para el curso y las tres ltimas estn
enfocadas tema central relativa actividad enzimtica, parte fundamental del
desarrollo del curso.
Contenido
1.1 Capacitacin para el uso de micropipetas y equipo de laboratorio. ...... 2
1.2. Capacitacin para el uso de espectrofotmetros y centrfugas. ............ 7
1.3. Preparacin de reactivos requeridos en el laboratorio de
bioconversiones. ................................................................................................. 13
1.4 Determinacin de crecimiento celular por turbidimetra (D.O.), peso
seco, protena y cuenta directa en cmara de Neubauer. ........................ 14
1.5 Determinacin de azcares reductores y azcares totales. ................... 17
1.6 Determinacin de la concentracin de protena de las enzimas
elegidas. ................................................................................................................. 20
1.7 Medicin de la actividad cataltica de enzimas y/o de extractos crudos
enzimticos: Amilasas. ...................................................................................... 23
1.8 Efecto de la concentracin de enzima y fuerza inica en la actividad de
la enzima elegida. ................................................................................................ 25
1.9 Efecto de la temperatura y pH en la actividad enzimtica. ...................... 27
INGENIERA BIOTECNOLGICA
1.1 Capacitacin para el uso de micropipetas y equipo de laboratorio.
USO DE MICROPIPETAS AUTOMTICAS
En las prcticas de Bioqumica los volmenes de las soluciones que se
necesitan medir son del orden de microlitros (L). Para tomar estas cantidades
con exactitud y reproducibilidad se emplean micropipetas, ya sean de volumen
fijo o variable. Los errores de medida que se pueden cometer dependen
principalmente del usuario y no de la micropipeta en s, a menos que esta no
est bien calibrada. Para que las medidas sean correctas se debe de tener en
cuenta las siguientes consideraciones:
La pipeta debe de mantenerse siempre en posicin vertical durante todo el
proceso de pipeteo, nunca inclinada. Tambin, cuando la pipeta no se utilice se
debe dejar siempre en posicin vertical en el soporte de pipetas. Nunca la deje
horizontalmente encima de la mesa y menos una vez que tenga lquido
succionado.
Cada pipeta sirve para medir un determinado volumen. Las de volumen fijo
miden solamente un volumen determinado. En las de volumen variable, se
puede seleccionar un volumen dentro de un intervalo de valores determinado.
En stas, no se deben ajustar volmenes superiores o inferiores a los que se
recomiendan para cada pipeta.
Los modelos que toman volmenes inferiores a 200 L usan puntas amarillas
(o blancas), y las micropipetas que toman volmenes superiores a 200 L
hasta 1 mL usan puntas azules (en algunos casos son blancas). Las pipetas
que manejan volmenes mayores de 1 o de 0.5 y 10 L, pueden usar otro tipo
de puntas especficas.
La pipeta se agarra como si se tomara una empuadura. La parte superior
debe de reposar sobre su dedo ndice (Fig. 1).
Todas las pipetas tienen dos topes:
1) Primer tope para tomar el volumen calibrado.
2) Segundo tope para expulsar de forma ms eficiente el volumen tomado y
se usa solo cuando se est expulsando el contenido. .
INGENIERA BIOTECNOLGICA
Posicin Inicial
1 2
Primer Tope
Segundo Tope
Fig. 1 Manera de asir una pipeta automtica y tomar una muestra (presin
del mbolo).
Tanto la presin como la liberacin del mbolo de la pipeta se debe de realizar
lentamente y con suavidad. Si se realiza bruscamente, se pueden formar
burbujas dentro de la punta de la pipeta, que alteraran los volmenes; as
mismo se podra ensuciar la parte interna de la pipeta.
Tambin se pueden formar burbujas o tomar un menor volumen si la punta no
est bien ajustada a la pipeta.
Procedimientos
micropipeta
para
medir
correctamente
un
volumen
con
una
INGENIERA BIOTECNOLGICA
Figura 3
Figura 4
INGENIERA BIOTECNOLGICA
Figura 5
Figura 6
http://www.um.es/bbmbi/AyudasDocentes/Practicas/Quimica/Practica00/Micropi
petas.htm
TRABAJO PRCTICO
Cada equipo realizar lo siguiente:
1. Elegir la micropipeta adecuada para 20, 200 o 1000 L. Seleccionar el
volumen indicado en la tabla 1 y colocar la punta adecuada.
2. Tomarla muestra indicada como se indic anteriormente.
3.
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Ensayar varias veces este procedimiento con las diferentes micropipetas as
como cambiar los volmenes de acuerdo a las tablas 1 y 2:
Tabla 1. Volmenes de agua a seleccionar para el uso de micropipetas.
1000 L
600
200
100
200 L
150
100
50
20 L
16
12
8
4
1
200 L
150
100
20 L
20
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1.2. Capacitacin para el uso de espectrofotmetros y centrfugas.
Fotometra
La fotometra o "medida de la luz" es un mtodo ptico de anlisis dentro del cual
se encuentran la colorimetra y la espectrofotometra, que miden la cantidad
de luz absorbida por sustancias colorido o colorido e incoloras respectivamente.
La luz es una forma de energa electromagntica, igual que los ultravioletas, infrarrojos etc.
Que es irradiada a partir de una fuente energtica en lneas o rayos virtualmente rectos. Se
propaga en el vaco sin necesitar sustancia transportadora. Dentro de su trayectoria
rectilnea describe ciclos en forma de ondas regulares que vibran perpendicularmente a su
direccin de desplazamiento y cuya longitud de onda se sita entre 380 y 780 nanmetros.
Longitud de onda: Es la distancia entre dos picos sucesivos de una onda. La luz
que percibe el ojo humano es la luz visible y comprende desde 400 a 700 nm.
Longitudes de onda superiores a 700 nm no son visibles para el ojo y se llama
infrarroja; entre 100 y 400 nm es radiacin ultravioleta (UV).
Las medidas de absorcin de luz se basan en dos leyes, la ley de Lambert y la
ley de Beer.
Ley de Lambert. Cuando un rayo de luz monocromtica pasa a travs de un
medio absorbente, su intensidad disminuye exponencialmente a medida que la
longitud del medio absorbente aumenta.
I0
I = I0 10 -K.L
log
= KL
I
donde:
I = intensidad de luz transmitida
I0 = intensidad de luz incidente
K = coeficiente de extincin
L = espesor de capa
K es el coeficiente de extincin definen cuan fuertemente una substancia absorbe
la luz a una dada longitud de onda, por unidad de masa o por concentracin
molar.
Ley de Beer: Cuando un rayo de luz monocromtica pasa a travs de un medio
absorbente (Fig 1), su intensidad disminuye exponencialmente a medida que
aumenta la concentracin de la sustancia absorbente en el medio.
I0
I = I0 10 K.C
log
= K C
I
donde
C = concentracin de la sustancia absorbente
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Sol.Absorbente
concentracin C
Luz
Rayo incidente
monocromtica
Intensidad I0
Rayo emergente
Intensidad I
L
Espesor de la solucin
Figura 1. Diagrama del paso de luz monocromtica a travs de una solucin
-CL
I = I0 10
log
= cL
- cL
=10
I0
La expresin log
I
%T =
x 100
I0
I0
I0
A = D.O. = log
I
T y A quedan relacionados de la forma A = - log T = 2 - log %T
ESQUEMA GENERAL DE UN ESPECTROFTOMETRO
Espectrofotmetros: Los mtodos fotomtricos de anlisis utilizan los efectos de
la interaccin de las radiaciones electromagnticas con las molculas. Los
aparatos de medicin de la absorcin de la radiacin electromagntica se
denominan "espectrofotmetros" y estn constituidos de forma general de (Fig 2):
Una fuente de luz, un monocromador, que desdobla la luz en haces
monocromticos, de un colimador que tiene una rendija de ajuste variable,
pasando a travs del mismo slo luz de una determinada longitud de onda. La
utilizacin de la luz monocromtica o de un intervalo pequeo de longitudes de
onda es importante, ya que la ley de Lambert-Beer solo se cumple en estas
condiciones.
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La luz que sale del colimador se hace pasar por la solucin y luego incide sobre
el fototubo donde es detectada. La seal se enva a un registrador que
convierte la seal a un registro anlogo, digital o grfico.
En algunos colormetros este registro consta de dos escalas, una mide
absorbancias (A) y la otra transmitancias (T). La escala de A va desde 0 a ,
la de T va desde 0 a 100, en sentido contrario.
Colimador
Monocromador
Fototubo
Celda con
muestra
Registro
Fuente de luz
%T 0
A
100
0
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CAPACITACIN PARA EWL MANEJO DE ESPECTOFOTMETROS
Actividad en laboratorio:
Los maestros de laboratorio indicarn cmo operar y programar los equipos. El
alumno deber anotar en su bitcora cada paso y realizar un diagrama de flujo
de los pasos, as como las consideraciones que hay que tener en el manejo,
mantenimiento y limpieza del equipo.
Existen diferentes modelos de espectrofotmetros en los laboratorios de
docencia, de investigacin y una gran gama en el mercado. Para el laboratorio
se utilizarn dos o tres modelos, se debe aprender el manejo de cada uno.
Para la lectura de muestras se utiliza celdas o cubetas de cuarzo o
desechables de plstico, existen de diferentes volmenes de operacin 4, 2 y 1
mL.
Antes de usar, siempre regstrese en la libreta de control del equipo.
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CENTRFUGA BECKMAN J2-MC
Antes de usar, siempre regstrese en la libreta de control del equipo.
Rotores: JA-20 para 8 tubos de 45 mL
JA-14 para 6 tubos de 250 mL.
Asegrese de equilibrar los tubos de centrfuga con la muestra en una
balanza.
Se puede hacer con la misma sustancia o puede usar un contrapeso de agua.
Para abrir:
Cierre la centrfuga.
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CENTRFUGA HERMLE Z300
Antes de usar, siempre regstrese en la libreta u hoja de control del equipo.
Cuenta con tres Rotores para:
24 tubos Eppendorf de
12 tubos Falcon de
6 Tubos Falcon de
1.5 mL
15 mL
50 mL
el
botn
de
para aflojar,
para apretar.
apertura.
El equipo solo se abre cuando el LED (foco o luz verde) est encendido, seal
que el rotor se ha detenido y que es posible abrir.
Precaucin al abrir, la tapa no tiene un tope, por lo que se requiere apoyarla
lentamente.
Para programar:
Mantener oprimido el botn preset
Para operar:
Cierre la centrfuga.
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1.3. Preparacin de reactivos requeridos en el
bioconversiones.
laboratorio de
Reactivo de Bradford
Disolver 100 mg de azul brillante de Coomassie G-250 en 50 mL de etanol al
95%. A esta solucin se le aaden 100 mL de cido fosfrico al 85% (w/v). La
solucin resultante se diluye a un volumen final de 1L. Las concentraciones
finales en el reactivo son 0.01% (w/v) de azul brillante de Coomassie G-250,
4.7% (w/v) de etanol y 8.5% (w/v) de cido fosfrico.
Una vez terminado el reactivo se debe verificar el color, debe ser caf. Si tiene
un tono azulado no es adecuada y se desecha, debiendo preparar
nuevamente. Filtrar el reactivo cuando sea necesario.
Reactivo del cido 3,5-dinitrosaliclico (DNS)
1. Disolver 30.0 g de tartrato de sodio y potasio en agua destilada hasta
obtener un volumen final de mximo 50 mL.
2. Agregar 1.6 g de NAOH previamente disueltos en 10 mL de agua destilada.
3. Agregar 1.0 g de DNS previamente disuelto en 20 mL de agua destilada.
4. Aforar a 100 mL con agua destilada.
5. Guardar en obscuridad y en frasco mbar.
Dejar reposar 15 min, en caso de uso inmediato. ES IMPORTANTE tener
cuidado con los volmenes que se manejan, por que el volumen final no debe
ser mayor a 100 mL. Para esto, se aconseja ir disolviendo el tartrato de sodio
agregando agua hasta lograr el volumen final de 50 mL (no agregar 50 mL de
agua a la sal por que dar un volumen mayor) .
Solucin de Almidn 1% (p/v)
Suspender 1g de almidn en 100 mL de regulador de fosfatos, 0.1M, pH 7.0, el
cual deber estar tibio o caliente. Posteriormente desnaturalizar calentando en
bao de agua a 60 C durante 15 min, para pre-gelatinizar el almidn.
Solucin de alfa-amilasa
La concentracin de enzima ser indicada por el profesor y ser en mg de protena o
enzima por mL de regulador de fosfatos, 0.1 M, pH 7.0.
Solucin de antrona
Disolver 0.2 g de antrona en 5 ml de etanol y aforar a 100 ml con H2SO4 al
75%.
Para preparar el cido al 75%, se debe realizar en la campana de extraccin,
en un bao de hielo, colocar el matraz o pobreta que contienen el agua en el
bao e ir agregando lentamente por las paredes el cido. Usar material de
seguridad, lentes y guantes.
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1.4 Determinacin de biomasa microbiana por turbidimetra o Densidad
ptica (D.O.), peso seco y cuenta directa en cmara de Neubauer.
La determinacin biomasa microbiana puede realizarse por varios mtodos
tanto directos como indirectos, tres de estos son:
1. Densidad ptica (D.O.) o turbidimetra
2. Peso seco
4. Cuenta en cmara de Neubauer
PARTE EXPERIMENTAL
1) Densidad ptica
A partir de muestras obtenidas de una cintica de crecimiento, es decir del
medio de cultivo a travs del tiempo, (o a partir de diluciones de un cultivo
concentrado), obtener la densidad ptica de las muestras leyendo a 600 nm.
Las lecturas no deben ser mayores a 1 de absorbancia, es ese caso es
necesario realizar diluciones, para obtener el intervalo de lectura menor a 1. El
blanco es el medio de cultivo fresco utilizado; as mismo, ste se debe usar
para las diluciones en muestras que den lecturas mayores a 1.
Se entregar un cultivo microbiano, el cual se leer la DO a 600 nm y a partir
de la lectura se establecern 5 diluciones para leer. Con las lecturas graficar la
densidad ptica vs. dilucin.
La DO se puede graficar vs concentracin de protena extracelular, peso seco,
numero de clulas, protena celular, etc. Haciendo posible correlacionarlas
2) Peso seco
a) Etiquetar charolas de aluminio y ponerlas a peso constante a 60C por 24
horas en una estufa, enfriar en desecador y pesar.
b) Tomar una alcuota de 10 a 15 mL de la suspensin celular (de cada dilucin
hecha para DO) y colocarlo en un tubo de centrfuga.
c) Centrifugar las muestras a una velocidad de 6000 rpm durante 5 min.
Recuerde equilibrar los tubos antes de centrifugar.
d) Eliminar el sobrenadante y resupender la pastilla celular en un poco de agua
destilada y pasarla a una charola a peso constante y previamente pesada.
e) Dejar las charolas en una estufa a 60C por 24 h o hasta que la pastilla este
completamente seca, enfriar en desecador y pesar cada charola.
f) El peso seco se obtiene de la diferencia entre el peso final y el inicial de cada
charola.
g) Graficar peso seco vs DO y vs no de de clulas/mL.
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3) Cuenta directa en Cmara de Neubauer
La cmara de Neubauer es una cmara adaptada para ser utilizada en un
microscopio de campo claro o de contraste de fases. Se trata de un
portaobjetos con una depresin en el centro, con el fondo marcado con una
una cuadrcula (Fig 1). Es un cuadrado de 3 x 3 mm, subdividido en 9 reas de
1mm2 cada una. La depresin central del cubreobjetos est hundida 0.1 mm
respecto a la superficie, de forma que cuando se cubre con un cubreobjetos
ste dista de la superficie marcada 0.1 milmetro, y el volumen comprendido
entre la superficie de cada rea y el cubreobjetos es de 0.1 mm3 (0.1
microlitros).
Las diferencia entre las reas 1,3,7 y 9; 4,2,6,8 y la 5 son las subdivisiones, lo
que permite en ese orden contar clulas de mayor a menor tamao, contando
bacterias y levaduras en el rea 5, que cuenta con 25 subdivisiones y se
observa en 40 o 100X
Se deben contar el nmero de clulas de cuatro o cinco cuadros de un rea, la
concentracin en la suspensin celular ser:
Cl/mL = N X 104 X F
(ecuacin 1)
Donde:
N: La media de las clulas contadas (suma de clulas contadas por
subdivisin/Nmero de subdivisiones contadas)
25: es el nmero de cuadrados en cada grilla.
104: factor para pasar el nmero de clulas en el cuadrado central (volumen =
0.1mm3 = 0,1L) a nmero de clulas por mL (1000mm3 = 1000L=1 mL)
F: factor de dilucin
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El conteo con la cmara se lleva a cabo de la siguiente forma:
a) Limpiar cuidadosamente con papel de arroz la cmara de Neubauer.
b) Colocar el cubreobjetos sobre los canales, tal como se indica en la figura
1.
c) Agitar la suspensin celular para tener una muestra homognea.
d) Con ayuda de una pipeta serolgica de 1 mL o con una pipeta
automtica de 100 L, tomar 0.1 mL de la suspensin y colocar la punta
de la pipeta en el borde del cubreobjetos; dejar que la solucin ingrese a
la cmara por capilaridad, sin que pase a los canales laterales. Si se
forman burbujas se debe repetir la operacin, lavando y secando la
cmara previamente.
e) Colocar la cmara Neubauer en la platina del microscopio y enfocar con
el objetivo 10x.
f) Localizar el cuadro central de la rejilla (ubicando la cuadrcula de 25
cuadros de 0.04 mm2), hacer un cambio de lente al objetivo de 40x y
contar el nmero de clulas de 4 o ms subdivisiones. Evitar contar dos
veces la misma clula u omitir alguna.
g) En caso de que el nmero de clulas sea muy elevado y se dificulte su
conteo, ser necesario diluir la suspensin en una proporcin conocida,
la que deber ser tenida en cuenta en la estimacin final.
h) Calcular el nmero de clulas con la ecuacin 1
Fugelsang, K.C. and Edwards, C.G. (2007). Wine Microbiology. Practical applications
and procedures., Edn. 2nd. (Springer, USA).
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1.5 Determinacin de azcares reductores y azcares totales.
1) Azcares reductores
Tubo
1. (Blanco)
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
Concentracin de
maltosa en la
muestra
(g/L)
0.0
0.2
0.4
0.6
0.8
1.0
1.2
1.4
1.6
1.8
2.0
Volumen de la
solucin de
maltosa de 2 g/L
(mL)
0.00
0.1
0.2
0.3
0.4
0.5
0.6
0.7
0.8
0.9
1.0
Volumen de
agua destilada
(mL)
1.00
0.9
0.8
0.7
0.6
0.5
0.4
0.3
0.2
0.1
0.0
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INGENIERA BIOTECNOLGICA
Elaborar la curva patrn en donde se grafique en el eje de las ordenas (ejey)
promedio de la absorbancia determinada a 540 nm y el en el eje de las
abscisas (ejex) el promedio de la concentracin de maltosa determinada en
g/L.
Determina la ecuacin de la lnea recta que relaciona a los dos parmetros:
y = mx + b
En donde y representa la absorbancia determinada a 540 nm.
x representa la concentracin de maltosa determinada en g/L.
La curva patrn ser correcta cuando se obtenga una r mayor o igual a 0.98,
con lecturas de absorbancia entre 0 y 1.
18
INGENIERA BIOTECNOLGICA
2) Azcares Totales por el mtodo de Antrona
Solucin de antrona: 0.2 g de antrona disuelta en 5 ml de etanol, y aforar a 100
Ml con H2SO4 al 75%. (ver prctica 1.3)
Tubo
1. (Blanco)
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
Concentracin de
sacarosa en la
muestra
(mg/L)
0.0
10
20
30
40
50
60
70
80
90
100
Volumen de la
solucin de sacarosa
100 m g/L
(mL)
Volumen de
agua destilada
(mL)
0.0
0.1
0.2
0.3
0.4
0.5
0.6
0.7
0.8
0.9
1.0
1.0
0.9
0.8
0.7
0.6
0.5
0.4
0.3
0.2
0.1
0.0
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1.6 Determinacin de protena.
Objetivo
Determinar la concentracin de protena de una solucin enzimtica con el
mtodo de Bradford.
Introduccin
La determinacin de la concentracin de protenas puede realizarse por varios
mtodos, entre ellos:
1. Leyendo la absorbancia a 280 nm, si se conoce el valor de su 280 [g-1L
cm-1], por ejemplo para la albmina de suero bovino (BSA) su 280 [g-1L cm-1]
es de 0.667.
*280: coeficiente de extincin a 280 nm (en la regin Ultravioleta del
espectro de luz)
Si no se conoce el coeficiente, se puede hace una curva tipo con la albmina de
suero bovino (BSA), como se indica en la tabla 3:
Tabla 3. Curva patrn de BSA para lectura en 280 nm.
Sol. de BSA
1000 g/mL
(mL)
Agua destilada
(mL)
Concentracin
de BSA
( g/mL)
0.0 0.10
1.0
1.0 0.90 0.80 0.70 0.60 0.50 0.40 0.30 0.20 0.10
0.0
100
0.2
200
300
400
500
600
700
800
900
1000
20
INGENIERA BIOTECNOLGICA
2. Mtodo de Bradford: El mtodo de Bradford involucra la unin del azul
brillante de Coomassie G-250 a la protena. Esta unin provoca un cambio en
el mximo de absorcin de 465 a 595 nm y este incremento a 595 nm es lo que
permite la cuantificacin. Dicha unin es independiente de la composicin de
aminocidos de las protenas. La concentracin de protena se determina por
medio de una curva tipo con Seroalbmina Bovina (BSA) y el reactivo de
Bradford.
Desarrollo experimental
Curva tipo: preparar diferentes concentraciones de BSA de 0 a 200 g/mL, a
partir de una solucin de 200 g/mL, (Tabla 4). Agregando en un tibo eppendorf
limpio las cantidad de solucions de BSA y agua como se indica en la tabla 4
para obtener un volumen final de .02 mL de muetra
Tabla 4. Curva Tipo de albmina de suero bovino (BSA), para determinacin de
protena por Bradford
(BSA) 200
0.0 0.025 0.05 0.075 0.10 0.125 0.15 0.175 0.20 0.225 0.25
g/mL (mL)
Agua destilada
0.25 0.225 0.20 0.175 0.15 0.125 0.10 0.075 0.05 0.025 0.0
(mL)
Concentracin
de BSA
0
20
40
60
80
100 120 140 160 180 200
(g/mL)
21
INGENIERA BIOTECNOLGICA
Informe
1. Establecer la curva patrn de protena con Bradford y otra por
espectrofotometra a 280 nm.
2. Calcular la concentracin de protena de la solucin de tripsina usando los
dos mtodos de determinacin de protena.
2. Discutir los resultados obtenidos.
Cuestionario
1.
2.
3.
4.
Referencia.
Bradford, M. M., 1976. A rapid and sensitive method for the quantitation of
microgram quantities of protein utilizing the principle of protein-dye binding.
Anal. Biochem. 72, 248-254.
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INGENIERA BIOTECNOLGICA
INSTITUTO POLITCNICO NACIONAL
UNIDAD PROFESIONAL INTERDISCIPLINARIA DE BIOTECNOLOGA
INGENIERA BIOTECNOLGICA
0.1 mL de la mezcla de reaccin (otra persona), transferirlo rpidamente a
un tubo conteniendo 0.1 mL de reactivo DNS (ste ser el testigo). Realizar:
un el Blanco sin agregar la enzima, es decir a los 0.1 mL de DNS, adiciones
0.1 mL de solucin de almidn.
4) Dejar que la reaccin se desarrolle a tres tiempos y por triplicado (9 tubos)
0.0 (testigo), 3.0 y 6.0 minutos exactamente. Transcurrido el tiempo
EXACTO transferir 0.1 mL de la mezcla de reaccin a uno de los tubo que ya
contiene 0.1 mL del reactivo DNS.
5) Tratar todos los tubos al mismo tiempo segn la tcnica de DNS: Poner en
bao de agua a ebullicin durante 5 min, exactamente. Cuidar de que no
entre agua a los tubos.
6) Transcurrido el tiempo sacra y poner en hielo o un bao de agua fra durante
10 min.
7) Posteriormente aadir 1.0 mL de agua destilada a dicha solucin.
8) Se homogeniza la solucin invirtiendo con la mano los tubos.
9) Se determina la absorbancia a 540 nm, ajustando a cero con el blanco,
determinando la absorbancia para cada tubo testigo y problema (tiempo 3 y
6 min). La absorbancia del tubo testigo se resta al tubo problema con la
finalidad de eliminar la absorbancia que no sea atribuible a la reaccin
enzimtica. .
10) Se utiliza la curva patrn de DNS realizada con maltosa para determinar la
concentracin de azucares reductores expresados como mg maltosa/ mL
de la muestra.
11) Expresar la actividad enzimtica en unidades de actividad de alfa
amilasa/mL. Considerar la siguiente definicin de una unidad de actividad
alfa amilasa: cantidad de enzima que libera 1 mg de maltosa a partir de
almidn despus de 1 min de reaccin con la enzima a 20C y pH 6.9
III. INFORME:
1. Elaborar la curva tipo Abs540nm vs concentracin de maltosa y determinar
la ecuacin de la regresin lineal.
2. Calcular la actividad enzimtica en unidades de actividad enzimtica (U)
y actividad especfica (Uesp).
U =
U esp =
24
INGENIERA BIOTECNOLGICA
INSTITUTO POLITCNICO NACIONAL
UNIDAD PROFESIONAL INTERDISCIPLINARIA DE BIOTECNOLOGA
INGENIERA BIOTECNOLGICA
e) Continuar la determinacin de DNS de acuerdo a lo indicado en la
prctica 1.5 y 1.7.
La reaccin se llevara cabo a pH (7.0), tiempo de reaccin y tempertaura
constante, siendo la nica variable la concentracin de enzima .
Tabla 6. Soluciones para determinar el efecto de concentracin de la
enzima en la actividad enzimtica .
3P1
3P2
3P3
3P4
3P5
0.25
0.5
1.0
2.0
3.0
0.95
0.95
0.95
0.95
0.95
0.95
0.05
0.05
0.05
0.05
0.05
0.05
Tubo
Testigo*
Soluciones de
Amilasa
(mg/mL)
Volumen de Sol.
Sustrato
(mL)
Vol. de sol. de enzima
en PO4 pH 7.0, 0.1M
(mL)
26
INGENIERA BIOTECNOLGICA
INSTITUTO POLITCNICO NACIONAL
UNIDAD PROFESIONAL INTERDISCIPLINARIA DE BIOTECNOLOGA
*Sol.
de
Enzima
en
regulador PO4
pH 7.0
(mL)
Testigo*
3P1
3P2
3P3
3P4
3P5
Uno
por
cada
temperatura
25
35
45
55
65
0.95
0.95
0.95
0.95
0.95
0.95
0.05
0.05
0.05
0.05
0.05
0.05
27
b)
c)
d)
e)
INGENIERA BIOTECNOLGICA
Posteriormente adicionar a cada tubo 0.05 mL de la solucin de amilasa
(excepto al testigo) con un intervalo entre cada tubo de 30 segundos
para poder detener la reaccin en el tiempo exacto a la reaccin
Incubar los tubos (un triplicado, un testigo y el blanco (sin enzima), por 5
min (tiempo de reaccin) en un bao a cada temperatura.
Pasado el intervalo de tiempo tomar 0.1 mL de la mezcla de reaccin y
adicionarlo a un tubo conteniendo 0.1 mL del reactivo DNS.
Continuar la determinacin de DNS de acuerdo a lo indicado en la
prctica 1.5 y 1.7.
Reactivos:
Almidn 1.0 % (p/v) en Reguladores a diferentes pH
Regulador de Acetatos pH 5.0
Regulador de Fosfatos pH 6.0, 7.0 y 7.5 0.1 M
Regulador de Boratos pH 8.0, 9.0 y 10.0
Preparar las soluciones de enzima con el regulador de pH indicado por el
profesor.
a) Preparar una serie de tubos Eppendorf, como se indica en la tabla 8,
adicionando, por triplicado para cada pH a ensayar, 0.95 mL de sustrato
(almidn al 1%).
b) Posteriormente adicionar a cada tubo 0.05 mL de la solucin de amilasa
(excepto al testigo) con un intervalo entre cada tubo de 30 segundos
para poder detener la reaccin en el tiempo exacto a la reaccin
c) Incubar los tubos (un triplicado, un testigo y el blanco (sin enzima), por 5
min (tiempo de reaccin).
d) Pasado el intervalo de tiempo tomar 0.1 mL de la mezcla de reaccin y
adicionarlo a un tubo conteniendo 0.1 mL del reactivo DNS.
e) Continuar la determinacin de DNS de acuerdo a lo indicado en la
prctica 1.5 y 1.7.
28
INGENIERA BIOTECNOLGICA
Tabla 8. Soluciones de enzima a diferentes pH para determinar el efecto
del pH en la actividad enzimtica.
Tubo
Testigo*
pH
3P1
3P2
3P3
3P4
3P5
3P6
3P7
5.0
6.0
7.0
7.5
8.0
9.0
10.0
Sol. de
almidn al 1.0
% (mL)
0.95
0.95
0.95
0.95
0.95
0.95
0.95
0.95
Enzima +
regulador al
pH indicado
(mL)
0.05
0.05
0.05
0.05
0.05
0.05
0.05
0.05
29
Asignaturas:
Acetatos 0.025M
(pH 5.0)(mL)
10
9
7
6
5
2
0
Concentracin final
de sacarosa (g/L)
0.0
3.0
9.0
12.0
15.0
24.0
30.0
Preparar 10 ml de cada concentracin por grupo, dividir las soluciones por equipos.
Procedimiento:
La prueba se realizar por triplicado con un blanco para toda la prueba y un testigo para
cada concentracin.
1. Colocar 0.95 mL de sustrato, para cada concentracin y de acuerdo a la tabla 2, en un
tubo eppendorfd, se deja equilibrar a temperatura ambiente por 5 min.
2. Agregar 0.05 mL de la enzima y agitar el tubo para homogenizar y dejar proceder la
reaccin durante 5 min.
Condiciones de la reaccin: regulador de acetatos 0.025M pH 5.0, temperatura de en C
(temperatura ambiente, determinar la temperatura del laboratorio al momento de realizar el
experimento).
3. Inmediatamente despus de terminada la reaccin (5 min), tomar un alcuota de 0.1 mL y
transferirla a un tubo que contiene 0.1 mL de DNS (para detener la hidrlisis enzimtica).
*testigo se adiciona la enzima al final del tiempo de la reaccin e inmediatamente el reactivo
de DNS
4. Los tubos se calientan a ebullicin en bao Mara durante 5 min. Se enfran en bao de
hielo, adiciona 1.0 mL de agua y se leen a 540 nm en un espectrofotmetro, contra un
blanco de reactivos (0.1 mL de regulador de acetatos 0.25 M pH 5.0 + 0.1 de DNS + 1 mL
de agua).
5. Tomar la lecturas de Abs (tabla 2) del mtodo de azucares reductores y determinar la
concentracin de producto, utilizando la curva tipo de glucosa (se har en laboratorio o se
proporcionar en funcin del tiempo).
6. Determinar la concentracin de protena de la solucin de invertasa por el Mtodo de
Bradford
Tabla 2. Efecto de la concentracin de la sacarosa en la velocidad de reaccin de la
invertasa.
Sacarosa
Sacarosa
Invertasa
Acetatos
Absorbancia
(g/L)
(g/L)
(0.6 mg/mL)
0.025M, pH
(540 nm)
(mL)
(mL)
5.0
(mL)
0.0
(blanco) 0.0
0
1.0
3.0
0.95
0.05
-9.0
0.95
0.05
-12.0
0.95
0.05
-15.0
0.95
0.05
-24.0
0.95
0.05
-30.0
0.95
0.05
--
Los valores de A540nm netos son: (A540nm Problema)- (A540nm Testigo) = A540nm Neto
La velocidad se determinar para cada concentracin de sustrato, sern reportadas
en mmoles o moles de producto formado / min; as mismo determinar la actividad
especfica de la enzima para concentracin de sustrato.
1
Km
1
1
V V max [ S ] V max
S
1
Km
S
V Vmax
Vmax
V Km
V
Vmax
S
INFORME:
1. Hacer la grfica de velocidad vs concentracin de sustrato.
2. Hacer las grficas de 1/vo vs 1/[So], [So]/vo vs [So] y vo vs vo/ [S] o y Calcule Km y
Vmax,
3. Determinar la constantes catalticas de la invertasa para estas condiciones de
reaccin
4. Discutir los resultados obtenidos por todos los equipos del grupo.
Referencia.
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PRCTICA 3
INMOVILIZACIN DE ENZIMAS.
OBJETIVOS
INGENIERA BIOTECNOLGICA
ser ms resistentes que los geles. En el primer caso, la enzima queda atrapada
en el interior de un gel, mientras que en el segundo caso la enzima se
encuentra ocluida dentro de las microcavidades de una fibra sinttica. El
atrapamiento requiere un control riguroso de las condiciones de polimerizacin,
as como la comprobacin de que la naturaleza qumica del proceso no altera
los grupos reactivos de la protena.
Inclusin en membranas: Dividida en dos tipos:
Microencapsulacin: En esta tcnica, las enzimas estn rodeadas de
membranas semipermeables que permiten el paso de molculas de sustrato y
producto, pero no de enzima. Estas membranas semipermeables pueden ser
permanentes (originadas por polimerizacin interfacial) o no permanentes
(generadas por surfactantes, tambin llamadas micelas reversas). Las
microcpsulas obtenidas son de forma esfrica, con tamaos comprendidos
entre 1 y 100 mm de dimetro. Mediante este mtodo se pueden encapsular
simultneamente una gran variedad de enzimas, clulas o biomolculas,
permitiendo que se lleven a cabo determinadas reacciones que suceden en
mltiples pasos
Reactores de membrana: Estos reactores emplean membranas permeables al
producto final, permeables o no al sustrato inicial y obviamente impermeables a
la enzima. Mediante una bomba se establece un flujo lquido de sustrato que
atraviesa el reactor.
MTODOS DE INMOVILIZACIN DE ENZIMAS POR UNIN QUMICA
Unin a soportes
Son los mtodos de inmovilizacin ms utilizados y de los que se dispone de
una mayor informacin. La eleccin del soporte y del tipo de enlace resultan
determinantes en el comportamiento posterior del biocatalizador. Se debe
procurar que la inmovilizacin incremente la afinidad por el sustrato, disminuya
la inhibicin, ample el intervalo de pH ptimo y reduzca las posibles
contaminaciones microbianas. Adems el soporte debe tener resistencia
mecnica adecuada a las condiciones de operacin del reactor y ser fcilmente
separable del medio lquido para que pueda ser reutilizado. Se han utilizado
una gran variedad de materiales como soportes para la inmovilizacin de
numerosas enzimas. Estos materiales difieren en tamao, densidad, porosidad
y forma, aunque generalmente nos los encontramos en forma de cilindro, hojas,
fibras y ms corrientemente en forma de esferas. Los soportes pueden
clasificarse en dos grandes grupos:
1. Soportes inorgnicos. Dentro de este grupo tenemos una gran variedad de
soportes, que pueden ser naturales (arcillas como la bentonita, piedra pmez,
slice, etc.) o materiales manufacturados (xidos de metales y vidrio de tamao
de poro controlado, vidrio no poroso, almina, cermicas, gel de slice, etc.)
INGENIERA BIOTECNOLGICA
INGENIERA BIOTECNOLGICA
MATERIAL Y EQUIPO.
Materiales:
Agitadores magnticos
Coladores de acero inoxidable
Cristalizador
Esptula
Matraces Erlenmeyer
Vasos de precipitados
Agitador magntico
Jeringa desechable de 20 mL
Equipos:
Balanza
Espectrofotmetro
Potencimetro
Vrtex
Soporte universal
Parrilla
Seccin experimental.
Inmovilizacin de enzimas por atrapamiento con alginato de sodio.
Soluciones (Preparar soluciones por grupo):
1) 5 mL de solucin de invertasa de levadura (X mg/mL) en amortiguador de
acetatos 0.025M pH 5.0
2) 15 mL de alginato de sodio al 2% (p/v) en amortiguador de acetatos 0.025M
pH 5.0
3) 100 mL Cloruro de calcio 1.0%
4) 20 mL Citrato de sodio 0.5 M o fosfato de sodio sodio monobsico 0.5 M
5) Sacarosa al 3% en amortiguador de acetatos 0.025M pH 5.0
Parte experimental
Se debe trabajar en condiciones limpias (no es necesario trabajar en
condiciones de esterilidad).
1. En un vaso de precipitado de 50 ml mezclar 5 mL de enzima concentrada
con 15 mL de sol. de alginato 2% que se encuentre a 40 C. Agita la mezcla
alginato-enzima para homogenizar y lograr una temperatura homognea, de
unos 40C.
2. Montar un sistema de inmovilizacin (Fig.1), que tenga con una jeringa con
aguja con punta roma (sujeta al soporte universal para mantener la altura, entre
la aguja y la sol de CaCl2, constante) y un vaso con solucin de CaCl2, 1%; a
temperatura ambiente; con agitacin constante y suave, por medio de una
barra magntica.
3. Llenar la jeringa (quitar la aguja y succionar la solucin alginato-enzima
tirando del mbolo y poner de nuevo la aguja), fijarla al sistema, a un
centmetro de distancia del CaCl2, e ir descendiendo, de forma constante, el
embolo para obtener gotas homogneas, las cuales se irn depositando en la
solucin e CaCl2. Contar el nmero de perlas de alginato formadas por cada
mL y sacar un promedio final.
4
INGENIERA BIOTECNOLGICA
INGENIERA BIOTECNOLGICA
INGENIERA BIOTECNOLGICA
pH 5.0 (mL)
(g/L)
0
1
3
4
5
8
10
10
9
7
6
5
2
0
0.0
3.0
9.0
12.0
15.0
24.0
30.0
INGENIERA BIOTECNOLGICA
INGENIERA BIOTECNOLGICA
PRCTICA 4
Estabilidad de una enzima inmovilizada y libre, determinacin de
Vmax y Km.
OBJETIVOS
1. Establecer el efecto de la inmovilizacin en la estabilidad de una enzima.
2. Determinar el efecto de la inmovilizacin en la constante de MichaelisMenten (Km) y la velocidad mxima (Vmax.) y su relacin con la
estabilidad.
INTRODUCCIN
La inmovilizacin puede altera significativamente el comportamiento de las
enzimas. En primer lugar se producen cambios en su estabilidad. En segundo
lugar, la enzima inmovilizada es un sistema heterogneo en el cual todos los
componentes que intervienen en el proceso cataltico (pH, sustratos, productos,
inhibidores, cofactores, activadores, etc.) se encuentran en interfase: en el medio
de reaccin y en la fase constituida por el soporte con la enzima. Como
consecuencia, la actividad enzimtica se ve afectada por efectos de tipo difusional,
estrico y del microentorno.
Efectos en la estabilidad
Generalmente se observa un incremento en la estabilidad de las enzimas despus
de su inmovilizacin, que se debe principalmente a las siguientes razones:
1. Una estabilizacin conformacional de la enzima debido a la existencia de
uniones multipuntuales enzima-soporte. La estructura terciaria de la enzima
adquiere mayor rigidez y se hace ms resistente a la desactivacin trmica o
qumica. Este tipo de estabilizacin se obtiene nicamente en aquellos mtodos
en los que intervienen enlaces de tipo covalente, como el reticulado o la unin a
soportes activados. La inmovilizacin covalente multipuntual se puede combinar
con la adicin de reactivos bifuncionales que den mayor rigidez a la estructura de
la enzima.
2. Una proteccin frente a las proteasas en el medio. Se ha visto que la unin de
proteasas a un soporte elimina su capacidad proteoltica, y evita su autolisis.
3. Se evita la agregacin intermolecular al mantener las molculas de enzima
retenidas en una determinada regin del espacio.
4. Existe una alteracin del microentorno del enzima debida a la interaccin de la
enzima con el soporte. Por ejemplo, si una enzima sensible al oxgeno (como las
nitrogenasas, hidrogenasas, etc.) se sita en la superficie de un soporte cargado,
la fuerza inica efectiva en el microentorno de la enzima ser muy alta y, como
consecuencia, la concentracin de oxgeno disuelto ser mucho menor en esa
1
INGENIERA BIOTECNOLGICA
zona que en el medio de reaccin. En otros casos el soporte tiene un efecto
tampn o buffer de tal manera que mantiene el pH ptimo de la enzima en su
microentorno, aunque en la disolucin se produzcan cambios importantes de pH.
Por otra parte, en aquellas reacciones catalizadas por enzimas inmovilizadas en
presencia de disolventes orgnicos, la hidrofilia del soporte o su capacidad para
retener agua, regula la actividad de la enzima. Cuanto mayor es la hidrofilia del
soporte, ms agua adsorbe y la enzima poseer la cantidad necesaria de agua en
su microentorno para mantener su conformacin activa.
Efectos en la actividad enzimtica
Tras una inmovilizacin, la actividad de la enzima puede disminuir e incluso
perderse por diversas razones. Si pierde totalmente la actividad enzimtica puede
ser debido a que:
1. La unin al soporte se produce de tal forma que el paso del sustrato al sitio
activo est impedido,
2. Los grupos reactivos del soporte reaccionan con algn aminocido que
forme parte del sitio activo o que sea esencial para la actividad cataltica de
la enzima,
3. La inmovilizacin puede originar un cambio conformacional que da lugar a
una forma inactiva, las condiciones experimentales del proceso causan la
desnaturalizacin de la enzima.
Si la prdida de actividad no es total despus de la inmovilizacin, los cambios
(disminucin o aumento de la actividad enzimtica) se debern principalmente a
efectos difusionales, electrostticos, estricos y/o del microentorno.
1) Efectos difusionales: Como consecuencia de la inmovilizacin, la difusin de los
sustratos hacia el centro activo de la enzima puede estar impedida por
resistencias de tipo externo e interno.
a) resistencias difusionales externas: si el soporte es insoluble en el medio
de reaccin, el sustrato deber atravesar la pelcula lquida estacionaria
(capa de Nernst o de disfusin) que rodea el soporte. En las proximidades
de un soporte no cargado, la concentracin de sustrato es menor que en el
resto de la disolucin, puesto que existe un gradiente de concentracin a
travs de la zona de difusin. Por tanto, los valores de km para las enzimas
inmovilizadas son siempre aparentes (km);
b) resistencias difusionales internas: debida a que los sustratos tienen que
atravesar el interior del gel, microcpsula, fibra o poro del soporte donde se
encuentra la enzima inmovilizada.
2) Efectos electrostticos entre el sustrato y el soporte, de tal manera que, si
tienen la misma carga existe una repulsin mutua, mientras que si las cargas son
opuestas hay atraccin. Cuando el sustrato y el soporte tienen cargas opuestas, el
valor de km aparente puede verse reducido hasta varias veces por debajo del
obtenido en disolucin.
INGENIERA BIOTECNOLGICA
3) Impedimentos estricos o de tamao de sustrato. En un principio, cualquier
enzima puede ser inmovilizada sin que haya una prdida apreciable de su
actividad. Este hecho suele ser vlido en el caso de que el sustrato sea de bajo
peso molecular, pero si se trata de sustratos con pesos moleculares elevados, la
actividad de la enzima inmovilizada disminuye drsticamente. Por ejemplo,
muchas hidrolasas unidas covalentemente a soportes slidos, a pesar de que son
muy activas frente a sustratos pequeos, muestran una actividad muy baja hacia
protenas, polisacridos y cidos nucleicos. Este efecto estrico se puede evitar
mediante una inmovilizacin covalente a travs de un brazo espaciador enzimasoporte ms largo
4) Efectos en el microentorno: La enzima inmovilizada se encuentra en un entorno
diferente al habitual, especialmente cuando el soporte tiene grupos cargados
elctricamente. El efecto observado suele ser un desplazamiento en el valor del
pH ptimo de la catlisis enzimtica y, muchas veces, un ensanchamiento en el
intervalo de pH en el cual la enzima puede actuar. Por ejemplo, una enzima unida
a un soporte cargado negativamente tendr en su microentorno una concentracin
mayor de iones hidrgeno que en el medio de reaccin. Como resultado, la
enzima inmovilizada ser ms activa a un pH ms alcalino. La enzima sera ms
activa a pH ms cidos si estuviera unida a un soporte cargado positivamente.
MATERIALES
Materiales:
o Esptulas de acero inoxidable.
o Matraces Erlenmeyer.
o Flotadores
o Gradillas para microtubos
o Termmetro
o Tubos eppendorf 1.5 mL
Equipos:
o Espectrofotmetro.
o Refrigerador comercial.
o Vrtex.
o Parrillas con agitacin
o Pipetas de 100, 200 y 1000 L
PARTE EXPERIMENTAL:
Se realizar en las siguientes 3 o 4 sesiones, posteriores a la prctica 3, en al cual
se inmoviliz y se conserv la enzima libre y las perlas de alginato con la enzima
inmovilizada.
Determinacin de Actividad enzimtica y constantes cinticas:
Sustrato: sacarosa, 30.0 g/L en buffer de acetatos 0.05M pH 5.0, para preparar las
diferentes concentraciones de sustrato.
Enzima: invertasa 0.8 mg/mL en regulador de acetatos 0.025M pH 5.0, e inmovilizada
(nmero de perlas necesarias para igualar la concentracin de invertasa libre)
INGENIERA BIOTECNOLGICA
Diluciones de sustrato:
Tabla 1. Preparacin de las soluciones de sacarosa a diferentes concentraciones
9
7
6
5
2
0
3.0
9.0
12.0
15.0
24.0
30.0
INGENIERA BIOTECNOLGICA
ANLISIS DE RESULTADOS
a) Calcular la actividad enzimtica de la enzima libre y de la enzima
inmovilizada en el da 2 y 10.
b) Determinar los parmetros cinticos de la enzima inmovilizada y la enzima
libre dos y diez das despus de la inmovilizacin.
c) Determinar la actividad enzimtica de la enzima inmovilizada contra la libre
dos y diez das despus de la inmovilizacin
d) Comparar los parmetros cinticos y actividad enzimtica de la enzima
inmovilizada contra la libre el primer da (practica 3), a las 48 horas y a los
10 das.
Calor hmedo
Calor seco
Filtracin
Compuestos qumicos
Radiacin
-Agitador y Vortex
-Placa de agitacin magntica
-Contador de Colonias
C) Mtodo
a) Verificar que la autoclave elctrica contenga agua hasta el nivel marcado por
el tubo de vidrio que se encuentra a su costado (nivel de agua).
b) El biorreactor con todo y su contenido se introduce a la autoclave. Verificar que
la salida de aire del biorreactor est abierta, de lo contrario se corre el riesgo
de que el biorreactor o alguna de sus partes se rompan durante el proceso
de esterilizacin.
c) Cerrar la puerta de la autoclave
d) Encender la autoclave para provocar la generacin de vapor.
e) verificar que la salida de aire de la autoclave se encuentre totalmente abierta,
de esta forma, el aire contenido en la autoclave ser excluido por el vapor
que se genera.
f) Una vez que el vapor generado se escapa de forma importante por la vlvula
de salida de la autoclave, es posible cerrar sta.
g) Esperar que la presin dentro de la autoclave sea de 1.5Kg/cm 2 (indicado por
el medidor de presin)y que a la vez la temperatura sea de 121C (indicado
por el medidor de temperatura).
h) Una vez alcanzadas las condiciones de esterilizacin (1.5 kg/cm 2 y 121 C)
mantenerlas durante 15 minutos, por medio del apagado y encendido de la
autoclave.
i) Posterior al proceso de esterilizacin, esperar a que la presin y la temperatura
de la autoclave disminuyan.
j) Una vez que el medidor de presin indique una presin de 0.1Kg/cm 2 abrir
lentamente la vlvula de salida y dejar escapar el vapor que an no se ha
condensado. Evitar que la presin caiga por debajo de cero (Bajo vaco), ya
que ello provoca riesgos de contaminacin del material ya esterilizado.
k) Abrir la puerta de la autoclave y con la ayuda de guantes de asbesto sacar el
biorreactor esterilizado. Dejar enfriar el biorreactor hasta temperatura
ambiente antes de utilizarlo.
4.- DESARROLLO EXPERIMENTAL
a) Preparacin del medio de cultivo (clado nutritivo 2L) para el biorreactor.
b) Preparar 14 cajas de Petri conteniendo Agar nutritivo slido
c) Verter en la jarra del biorreactor el medio de cultivo.
d) Esterilizar el biorreactor en la autoclave durante 15 min. A 120C, de acuerdo
al mtodo de esterilizacin por calor hmedo descrito en el apartado de
Materiales equipo y mtodos.
e) Una vez esterilizado el biorreactor, dejar enfriar.
f) Aspticamente tomar una muestra de 1 mL del medio de cultivo esterilizado
y realizar diluciones hasta un factor de 10-3, Sembrar por extensin en placa
10
ANEXO
Medio de Cultivo para Levaduras
Glucosa
Extracto de levadura
KH2PO4
(NH4)2SO4
.
MgSO4 7H2O
pH
g/L
50
1
5
2
0.4
Ajustar a 5
Glucosa
Extracto de levadura
Agar agar
g/L
20
10
20
11
INGENIERA BIOTECNOLGICA
PRCTICA 6
PRODUCCIN DE UNA ENZIMA EN UN BIORREACTOR DE
LABORATORIO CON CLULAS LIBRES
MARCO TERICO
Medios de Cultivo
Los medios de cultivo son una mezcla de nutrientes que en concentraciones
adecuadas y en condiciones fsicas ptimas, permiten el crecimiento de los
microorganismos. Estos medios son esenciales en las fermentaciones por lo
que un control en su fabricacin, preparacin, conservacin y uso, asegura la
exactitud, confiabilidad y reproducibilidad de los resultados obtenidos.
INGENIERA BIOTECNOLGICA
Calor seco
Filtracin
Compuestos qumicos
Radiacin
2
INGENIERA BIOTECNOLGICA
Procedimiento
a) Preparar de 2.5 L de medio de cultivo para levadura, composicin por
litro de medio: Sacarosa, 30 g; Extracto de Levadura, 5 g; KH2PO4, 5 g;
(NH4)2SO4, 2 g; MgSO4 . 7H2O, 0.4 g. Ajustar a pH 5
b) Preparar 14 cajas Petri con medio de cultivo slido para levaduras
adicionado al medio 15 g/L de agar.
c) Antes de esterilizar el medio tomar muestra de 1 mL del medio de
cultivo, para realizar cuenta en placa. Sembrar por duplicado en las
cajas con medio slido con las diluciones 100 (directo) a 10-2.
3
INGENIERA BIOTECNOLGICA
INGENIERA BIOTECNOLGICA
REPORTE DE RESULTADOS
a) Elaborar una tabla de resultados en donde se reporten los resultados
del conteo de microorganismos en cada una de las cajas Petri
sembradas con las diluciones del medio de cultivo, antes y despus del
proceso de esterilizacin. Comparar los resultados.
b) Calcular la concentracin de contaminantes (UFC/mL) en el medio de
cultivo sin esterilizar.
c) En caso de que exista contaminacin en el medio de cultivo ya
esterilizado, calcular la concentracin de contaminantes (UFC/mL).
d) Elaborar sus conclusiones sobre el papel que juega la esterilizacin en
las bioconversiones, as como de la eficacia del mtodo de
esterilizacin por calor hmedo en autoclave elctrica.
INGENIERA BIOTECNOLGICA
BIBLIOGRAFA
Bailey, J.E. and Ollas, D.F. Biochemical Engineering Fundamentals, 2nd
Edition, McGraw-Hill International Editions, 1986, New York, 984 p.
Deindoerfer, F. H. y Humphrey, A. E., 1959. Appl. Microbiol. 7 : 256-264
Doran, P.M. Bioprocess Engineering Principles, Academic Press, 1995, San
Diego, 439p.
Lydersen, B.K. , Delia, N.A. and Nleson, K.L. Bioprocess Engineering
Systems, equipment and facilities, John Wiley & Sons, 1994, New York,
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Quintero Ramrez, R. Ingeniera Bioqumica, teora y aplicaciones, Alambra
mexicana, 1981, Mxico, 332p.
Schgerl, K, Bioreactor engineering, volume 2; characteristics features of
bioreactors, John Wiley & Sons, 1981, Chichester, 393p.
MARCO TERICO
Las Enzimas como Metabolitos
Los metabolitos primarios producidos durante un proceso de fermentacin
representan productos finales de bajo peso molecular usados para la
produccin de macromolculas o son convertidos en coenzimas. As tambin,
los metabolitos primarios pueden ser productos intermediarios en vas
metablicas relacionadas con los productos finales. Los aminocidos,
vitaminas, los nucletidos y ciertas enzimas son considerados productos
primarios.
INGENIERA BIOTECNOLGICA
INGENIERA BIOTECNOLGICA
MATERIALES
- Vasos de precipitado de diferentes volmenes
- Barras magnticas para agitacin (mosca)
- Guantes de asbesto
- Agar nutritivo
- Medio de cultivo para levaduras
- Solucin del reactivo DNS
- Solucin de glucosa, 2 g/L
- Solucin del reactivo de Bradford
- Solucin de anthrona
- Solucin de sacarosa, 30 g/L
- Solucin buffer fosfatos 0.1 M a pH 6.9
- Solucin estril de cloruro de sodio, 0.09%
- Colorantes y soluciones para tincin de Gram
- Pipetas de 1 y 10 mL
- Portaobjetos
- Charolas de aluminio de 5 cm de dimetro
- Tiras de pH
EQUIPO
- Biorreactor de laboratorio New Brunswick Scientific modelo Bioflo II de jarra
de 5 L con su mdulo de control, partes y electrodos.
- Centrfuga para tubos falcn de 30 mL
- Balanza analtica
- Espectrofotmetro visible
- Incubadora orbital con control de agitacin y temperatura
- Autoclave elctrica de 50 L de volumen
- Campana de flujo laminar
- Microscopio ptico
- Agitador Vortex
- Bao de agua con control de temperatura
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MTODOLOGA
Inoculacin del Biorreactor.
Posteriormente de confirmar la pureza del inculo y la esterilidad del medio,
con ayuda del profesor se proceder a inocular, con 250 mL del inculo, el
biorreactor. Antes de inocular se verifica que el medio de cultivo del
biorreactor est libre de contaminantes. Despus de inocular el biorreactor se
toman muestras de 20 mL para cada tiempo en base al siguiente programa de
muestreo:
Tabla 1. Programa de Muestreo
Tiempo
Hora*
Horas
T0
8:00
0
T1
10:00
2
T2
12:00
4
T3
14:00
6
T4
16:00
8
T5
18:00
10
T6
20:00
12
T7
8:00
24
T8
10:00
26
T9
12:00
28
*Las horas no deben ser forzosamente exactas pero si apuntar la hora
exacta y el tiempo exacto de la muestra (Horas)
La muestra del tiempo cero (T0) se toma justo despus de inocular el
biorreactor. Si en los tiempos T7, T8 y T9, no hay cambios significativos en la
evolucin del crecimiento celular y en la produccin de invertasa, se procede
a detener la fermentacin.
* NOTA: El programa de muestreo anterior es una propuesta susceptible a
modificacin.
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Al final de la fermentacin:
a) Detener la fermentacin apagando la agitacin y el mdulo de control.
Cerrar el flujo de agua de enfriamiento.
b) Desmontar el biorreactor de su mdulo y esterilizarlo junto con su
contenido utilizando la autoclave elctrica, no olvidando dejar la salida
de aire del biorreactor abierta.
c) Despus de la esterilizacin, desmontar el biorreactor y sus partes y
efectuar su limpieza.
11
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REPORTE DE RESULTADOS
a) Elaborar una tabla de los datos obtenidos.
b) Elaborar una grfica de los resultados del crecimiento de la biomasa
(mg de biomasa seca/mL de caldo de cultivo), y de la densidad ptica a
600 nm contra tiempo (h).
c) Elaborar una grfica de los resultados de la produccin de invertasa
(mg de protena) contra tiempo (h).
d) Elaborar una grfica de los resultados del consumo de sustrato (mg de
sacarosa) contra tiempo (h).
e) Elaborar una grfica de los resultados de la actividad enzimtica
(U/mL) contra tiempo (h).
f) Elaborar una grfica del monitoreo de pH.
g) Elaborar una grfica del monitoreo de la temperatura.
h) Discutir sobre el comportamiento de las cinticas, explicando lo que
ocurri en cada fase de la fermentacin.
i) Calcular las constantes cinticas Vmax y Km mediante algn mtodo
sealado en la prctica No. 2, Determinacin de Vmax y Km de
enzimas.
j) Anexar la Hoja de control de la cintica de produccin de enzima con
clulas libres utilizada durante el desarrollo de la prctica.
k) Si se realizaron las cuatro fermentaciones diferentes marcadas en la
prctica No. 5, Adiestramiento en la operacin de un biorreactor de
laboratorio, comparar los resultados obtenidos entre ellas.
BIBLIOGRAFA
Bailey, J.E. and Ollas, D.F. Biochemical Engineering Fundamentals, 2 nd
Edition, McGraw-Hill International Editions, 1986, New York, 984 p.
12
INGENIERA BIOTECNOLGICA
13
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Muestra
Tiempo
T ( C)
(h)
pH
Pureza de
Cultivo (+,-)
Charola
(g)
Charola
con
Muestra PS
(g)
DO
(600 nm)
No de
Cel/mL
DNS (DO) se
sobrenadante
Bradford
(DO) de
Observaciones
sobrenadante
T0
T1
T2
T3
T4
T5
T6
T7
T8
T9
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INGENIERA BIOTECNOLGICA
PRCTICA 7
PRODUCCIN DE ENZIMA (INVERTASA) A PARTIR DE
Saccharomyces cerevisiae LIBRE E INMOVILIZADA EN UN
BIORREACTOR A NIVEL LABORATORIO.
OBJETIVOS:
El alumno determinar la actividad enzimtica de la invertasa producida por
Saccharomyces cerevisiae en estado libre e inmovilizado en esferas de
alginato de sodio, durante una fermentacin en un biorreactor a nivel
laboratorio.
Especficos:
- El alumno disear y construir un biorreactor nivel laboratorio para la
produccin de enzimas a partir de levadura en estado libre e
inmovilizado.
- El alumno inmovilizar clulas de S. cerevisiae en alginato de sodio.
- El alumno preparar el medio de cultivo para el crecimiento de la
levadura y la produccin de la enzima.
- El alumno llevar a cabo el seguimiento de la cintica de crecimiento de
la levadura en estado libre e inmovilizado.
- El alumno monitorear la produccin de protena en las clulas (en
estado libre e inmovilizado) durante el tiempo de proceso.
- El alumno determinar la actividad enzimtica y la actividad enzimtica
especifica de la invertasa producida por las clulas en estado libre e
inmovilizado.
MARCO TERICO
Inmovilizacin de clulas: La inmovilizacin celular se define como la
localizacin de clulas en una regin definida en el espacio con la preservacin
de las funciones celulares. Esta regin de inmovilizacin debe ser una fase
slida que permita el intercambio de sustratos y productos con el medio
exterior, no debe ser txica para las clulas y debo ser fcilmente manipulable.
La inmovilizacin en soportes naturales y sintticos ha mostrado por un
lado, estabilidad en las funciones celulares, por otro lado, permite alcanzar altas
concentraciones de microorganismos en volmenes reducidos y permite la
reutilizacin del biocatalizador y la implantacin de sistemas continuos da
produccin, facilitando las etapas de separacin.
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INGENIERA BIOTECNOLGICA
- Micro-encapsulacin.
La micro-encapsulacin se usa en el rea farmacutica o en el campo de
medicina para produccin de frmacos e inmovilizacin de enzimas. Una
microcpsula consiste en una semi-membrana permeable, esfrica, delgada y
fuerte que rodea un centro liquido, con un dimetro que varia de unas mieras a
1mm. La membrana sin/e como una barrera semipermeable permitiendo la
entrada ce sustrato y la salida de metabolitos, pero no permite el paso de clulas.
- Atrapamiento o inclusin.
De entre los mtodos de inmovilizacin de clulas, el mtodo de inclusin celular
ha mostrado ser el que permite un mejor control de la inmovilizacin y es el que
preserva mejor las funciones celulares. Este mtodo consiste en atrapar las
clulas en una red tridimensional rgida de hidrogel; los soportes de
inmovilizacin pueden ser sintticos (por ejemplo la poliacrilamida, el
poliuretano) o naturales, (por ejemplo el agar, la gelatina, el alginato y la
carragenina). Una de las caractersticas particulares del mtodo de inclusin
o atrapamiento celular est
relacionada
con
las
condiciones
de
gelificacin del soporte y la reversibilidad del proceso de gelificacin. La
gelificacin se realiza por cambios en la temperatura o por la presencia de
iones. Adems, la gelificacin es reversible, as, bajo ciertas condiciones
fsicas se cuenta con una suspensin celular que puede ser gelificada,
quedando las clulas atrapadas; posteriormente se puede volver a liberar las
clulas aumentando la temperatura o retirando los iones. Uno de ios materiales
ms empleados para realizar la inmovilizacin por inclusin celular es la Kcarragenina.
a) Kapa-carragenina.
La K-carragenina es un polisacrido no txico, de fcil adquisicin, aislado a partir
de algas marinas. Es ampliamente usado en las industrias cosmtica y alimentaria
como agente gelificante, espesante y estabilizante. Es un polmero, el cual esta
constituido por una estructura unitaria de sulfato de -D galactosa y 3,6-anhidro--Dgalactosa.
La K-carragenina gelifica al enfriarse o al contacto con una solucin de algn
agente inductor del gel, tales corno iones potasio o calcio.
Una ventaja al emplear K-carragenina es, que la inmovilizacin puede efectuarse
bajo condiciones muy suaves, sin el uso de qumicos que puedan inhibir la
actividad enzimtica de las clulas.
Invertasa: la invertasa (-D-fructofuranosidasa, -D-fructofuransido fructohidrolasa,
EC 3.2.1.26), cataliza la hidrlisis de restos terminales no reductores -Dfructofuranosdicos de fructofuransidos. Entre los sustratos sobre los que acta el ms
significado es, sin duda, la sacarosa, de ah que el enzima se designe con el nombre
de sacarasa. La denominacin trivial de invertasa, con la que tambin se conoce, hace
referencia al hecho de que los productos de la reaccin son conocidos desde antiguo
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Salida de aire
Alimentacin
Clulas
inmovilizadas
Aspersor de aire
Productos
B
Productos
Productos
Clulas
inmovilizadas
Alimentacin
Alimentacin
Probetas.
Termmetro
Autoclave
Bao Mara
Potencimetro.
Microscopio ptico
Centrfuga
Balanza analtica
Espectrofotmetro UV-VIS
Campana de flujo laminar
Tubos Falcn
Tubos Eppendorf estriles (150
aprox.)
Portaobjetos
Asa bacteriolgica
Lmpara de alcohol
Mechero de Bunsen
Micropipetas
Encendedor
Portaobjetos
Puntas para micropipetas
Tiras de medicin de pH
Charolas de aluminio secas
Soluciones para realizar tincin de
Gram
o Cristal Violeta
o Lugol
o Alcohol-cetona
o Safranina
Reactivo DNS
Reactivo de Bradford
Solucin de sacarosa al 30%
Agua destilada
Buffer pH 4
Buffer pH 7
5
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Aceite de inmersin
Solucin de anthrona
Alcohol al 70 %
Solucin de sacarosa
Pinzas
Charolas de aluminio
Bao de hielo
Sacarosa
Extracto de levadura
Vasos de precipitado de diferentes
volmenes
Barras magnticas para agitacin
(mosca)
Primera parte:
Cada equipo debe disear un reactor, considerando material que sea factible de
conseguir, que est en el laboratorio o bien matraces, frascos de vidrio, probetas,
tubera etc. El reactor diseado deber garantizar la esterilidad del cultivo, adems de
proveer un sistema de agitacin homogneo, ya sea por medio de inyeccin de aire o
con barras magnticas. El volumen total de operacin del reactor no deber ser mayor
a 1 L.
Prueba de del biorrecator diseado, funcionamiento y esterilidad:
Preparar medio de cultivo agar nutritivo (el volumen depender del tamao del reactor
diseado) y colocarlo en el reactor. Cerrar el reactor y someterlo a esterilizacin en
autoclave, a 125 C por 15 minutos. Posteriormente verificar que no se halla daado el
rector o sus partes durante el proceso y dejar funcionando durante 24 h. Al da
siguiente, comprobar por medio de turbidez y cuenta en placa que no haya crecimiento
en el reactor.
Segunda parte
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cerevisiae. De forma asptica, tomar con el asa una porcin de una colonia del cultivo
slido proporcionado e introducirla en el medio de cultivo estril del matraz. Incubar a
35C, con agitacin de 120 rpm y durante 14 a 16 horas (toda la noche). Verificar la
pureza del cultivo por tincin de gram
Inmovilizacin de clulas.
TODO el material donde se trabajar debe estar estril, y manipular en la
campana hasta que est montado en reactor. Prever tener todo el material estril,
pipetas, coladores, matraces, mangueras, etc.
Centrifigar 500 mL de medio a 5000 rpm, 15 min en tubos estriles y recuperar la
pastilla celular, (eliminar sobrenadante), posteriormente resuspender la biomasa
en 100 mL de solucin isotnica estril.
1. Contar el No de clulas por mL del inculo, por cuenta en cmara de
Neubauer.
2. Adicionar a un matraz de 500 0 1000 mL que contiene 400 mL de alginato
de calcio al 2.5% a 40-45 C, la biomasa contenida en los 100 ml del
inculo (biomasa resuspendida).
3. Agita con una barra magntica para homogenizar la suspensin.
4. La suspensin se bombea por medio de una bomba peristltica que
opera a 12 rpm y a travs de una aguja hacia una solucin de cloruro de
calcio al 1% (estril) en forma de gotas.
5. Las gotas al ponerse en contacto con la solucin de cloruro de calcio
solidifican instantneamente formndose as esferas de aproximadamente
3 mm de dimetro.
6. La solucin debe estar con agitacin mnima (60 rpm), para evitar que las
esferas se peguen entre ellas al momento de caer. Las esferas formadas
permanecen en la solucin de cloruro de calcio con agitacin durante
30 min.
7. Posteriormente son retiradas de forma estril (con un colador de
cocina metlico estril) e introducidas al biorreactor diseado. Todo ello
se realiza dentro de la campana de flujo laminar en condiciones de
esterilidad.
8. Tomar una muestra de esferas para determinar el volumen y peso de
la misma y establecer el nmero de clulas por esfera.
9. Tomar una muestra del cloruro de calcio para determinar las clulas
no inmovilizadas, por cuenta en cmara de Neubauer.
Una vez obtenidas la clulas inmovilizadas montar los dos reactores diseados, uno
para clulas libres (inocularlo al 10 %) y otro para inmovilizadas. Tener listo la cantidad
de medio de cultivo estril necesario para los reactores, tener preparado ms de lo
necesario para el caso de cualquier contingencia y los blancos.
INGENIERA BIOTECNOLGICA
*Cuenta en placa se realizar al inicio, tiempo cero, un tiempo intermedio y tiempo final,
por triplicado y tres diluciones, en medio para levaduras con 15 g/L de agar, inoculando
con 0.1 mL de la dilucin correspondiente (10 0 a 10-9 y extendiendo con varilla en L.
(Se requieren de 54 cajas por equipo, puntas estriles de 1000 y 100 L, para las
diluciones: 30 tubos eppendorf estriles, solucin isotnica estril)
En sobrenadante centrifugado a 5000 rpm 15 min determinar:
5.
6.
7.
8.
INGENIERA BIOTECNOLGICA
BIBLIOGRAFA
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