Álvaro Ribas

 Nome Oficial: YAP1

 Resumo: Gene que se liga ao SH3 formando

o produto proto-oncogene YES.

 Importante no desenvolvimento do Câncer

Hepatocelular
 Câncer de Mama
 Cancer Gastrico
 Em presença de cancer a aumento de
proteinas associadas com YAP
 O gene é conservado em Yap1 chimpanzé,
cachorro, vaca, rato, galinha e peixe zebra.
 Base montada com dados do NCBI
 Contém :
 Proteínas expressas pelo gene
 Proteínas que interagem para formar

complexos
 Nome do complexo
 Fontes
 Publicações
 GDS2861.soft
 Base: Gene Expression Omnibus (GEO)
 Titulo: X-Box binding protein overexpression

effect on breast cancer cell line

 Descrição: Analise MCF7 do câncer de mama.
 Tipo: gene expression array-based
 Quantidade: 22283 colunas
 Contém:
 Id ref: identificador do experimento
 Identifier: Proteína analisada

 #GSM212605 = Value for GSM212605: MCF7/c p.1; src: Breast Cancer Cell Line
 #GSM212606 = Value for GSM212606: MCF7/c p.2; src: Breast Cancer Cell Line
 #GSM212607 = Value for GSM212607: MCF7/c p.6; src: Breast Cancer Cell Line
 #GSM212608 = Value for GSM212608: MCF7/XBP1 p.2; src: Breast Cancer Cell
Line
 #GSM212609 = Value for GSM212609: MCF7/XBP1 p.3; src: Breast Cancer Cell
Line
 #GSM212610 = Value for GSM212610: MCF7/XBP1 p.6; src: Breast Cancer Cell
Line
 Base: Gene Expression Omnibus
 Título: YAP overexpression effect on MCF10A

mammary epithelial cell line

 Descrição: Análise das células epiteliais

mamárias MCF10A superexpressas a

transcrição do coactivador YAP
 Tipo: gene expression array-based
 Quantidade: 54681 colunas
 :Contém:
 Id ref: identificador do experimento
 Identifier: Proteína analisada

 #GSM257525 = Value for GSM257525: vector control cells,

biological rep1; src: vector control cells, biological rep1
 #GSM257526 = Value for GSM257526: YAP-
overexpressing cells, biological rep1; src: YAP-
overexpressing cells, biological rep1
 #GSM257527 = Value for GSM257527: vector control cells,
biological rep2; src: vector control cells, biological rep2
 #GSM257528 = Value for GSM257528: YAP-
overexpressing cells, biological rep2; src: YAP-
overexpressing cells, biological rep2
 Base: Gene Expression Omnibus
 Título: Genes regulated by YAP in normal

breast cell line and breast cancer cell lines

 Descrição: Uso de microarray para analisar

os genes regulados por YAP em células

normais da mama luminal e linhas de células
cancerígenas da mama.
 Tipo: gene expression array-based
 Quantidade:
 A partir daqui todos as bases possuem os
atributos a seguir:
 #ID = Affymetrix Probe Set ID
 #GB_ACC = GenBank Accession Number
 #SPOT_ID = identifies controls
 #Species Scientific Name = The genus and
species of the organism
 #Annotation Date = The date that the
annotations for this probe array were last
updated
 #Sequence Type =
 #Sequence Source = The database from which
the sequence used to design this probe set was
taken.
 #Target Description =
 #Representative Public ID = The accession
number of a representative sequence.
 #Gene Title = Title of Gene represented by

the probe set.

 #Gene Symbol = A gene symbol, when one is

available (from UniGene).

 #ENTREZ_GENE_ID = Entrez Gene Database

UID
 #RefSeq Transcript ID = References to

multiple sequences in RefSeq.

 #Gene Ontology Biological Process = Gene
Ontology Consortium Biological Process
derived from LocusLink.
 #Gene Ontology Cellular Component = Gene

Ontology Consortium Cellular Component

derived from LocusLink.
 #Gene Ontology Molecular Function = Gene

Ontology Consortium Molecular Function

derived from LocusLink.
 Base: Gene Expression Omnibus
 Título: Perfis de expressão gênica do YAP tipo
selvagem ou células mutantes overexpressing
MCF10A
 Descrição: Compara a mudança de expressão
gênica em expressão de proteínas associadas
YAP do tipo selvagem ou mutantes, a fim de
estabelecer a importância da ligação TEAD e
domínios WW na função de indução de genes de
YAP
 Tipo: gene expression array-based
 Quantidade:
 Base: Gene Expression Omnibus
 Título: Expression data from biopsies of

Nasopharyngeal carcinoma (NPC) and non-

malignant controls
 Descrição: Dados do perfil de expressão a

partir de biópsias de carcinoma de

nasofaringe (NPC).
 Tipo: gene expression array-based
 Quantidade: 22283 colunas
 Base: Gene Expression Omnibus
 Título: Identification of YAP target genes in

MCF10A cells
 Descrição: We used microarrays to detail the

global program of gene expression to identify

YAP target genes.
 Tipo: gene expression array-based
 Quantidade: 54675 colunas
 Temos as proteínas Expressas pelo gene;
 Proteínas expressas em determinados tipos

de cânceres;
 Ligações do tipo GO entre essas proteínas;
 Criar a árvore GO entre os componentes
(Feature);
 Entender como usar SNPs no cluster.
 Tentar prever novas interações com base nos
dados.