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2. Biomolculas composio qumica, estructura e reactividade

AULA 7 BIOQUMICA

C I DOS NUC L EI C OS ( A DN E A R N)
ORGANIZAO ESTRUTURAL, FUNO, REPLICAO, TRANSCRIO E TRADUO

O ADN e ARN, so a base da hereditariedade

O ADN (ou DNA) cido desoxiribonucleico tem a funo fundamental para a manuteno da organizao biolgica que a de conter e guardar toda a informao necessria para a produo de todos os enzimas de cada clula. O RNA serve de utenslo para transformar a informao do DNA e em cadeias polipeptidicas

Enzimas (catalizadores) Evolutivamente, suposto o RNA ter surgido antes do DNA e das protenas. O RNA tem capacidades catalticas (ribozimas)

Metabolismo
Conjunto das reaces qumicas dos seres vivos

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cidos nucleicos so formados por cadeias de nucletidos

Nucletido Monmero de ADN e ARN
Fosfato * nuclesidos fosfatados ADN Base pentose
Nuclesido

cido desoxiribonucleico Desoxiribose ARN

2 tipos de pentose 4(+1) tipos de bases Desoxiribonucletidos: dAMP, dTMP, dCMP e dGMP Ribonuclesidos: AMP, UMP, CMP, GMP

cido ribonucleico Ribose

cidos nucleicos so formados por cadeias de nucletidos

Devido presena do grupo hidroxilo no C2 o RNA mais reactivo, mas mais instvel, podendo sofrer hidrlise em condies alcalinas. Esta a principal justificao porque o DNA e no o RNA serve de armazenamento de informao.

ADN cido desoxiribonucleico Desoxiribose ARN

cido ribonucleico Ribose

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cidos nucleicos so compostos por 4 tipos de bases

Fosfato

Nucletido
Base

acar

Bases nuclesido Adenina adenosina Timina timina Guanina guanosina Citosina citidina Uracilo uracilo

Desoxiribonucletidos: dAMP, dTMP, dCMP e dGMP

Por exemplo, monofosfato de desoxiadenosina,
adenosina

Ribonuclesidos: AMP, UMP, CMP, GMP Por exemplo, monofosfato de adenosina S no RNA S no DNA

Os ribonucletidos trifosfatados e difosfatados so essencias no metabolismo

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cidos nucleicos so formados por cadeias de nucletidos

Ligao fosfodister A estrutura tridimensional deas cadeias estabilizada por pontes de hidrognio entre bases complementares Pontes de hidrognio Ligao fosfodister

Leitura das sequncias de bases de 5 para 3

O ADN formado por duas cadeias complementares invertidas ou antiparalelas

O n de purinas sempre igual ao de pirimidinas no ADN Complementaridade das bases

5 3

3 5

Cadeia molde e cadeia complementar

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cidos nucleicos
Cadeia dupla (ADN) Cadeia simples (ARN)
Tambm h pontes de H no ARN

A estrutura do DNA dupla hlice

B-DNA

Sulco menor 10 nt por volta Sulco maior

Caso especfico de alternancia purina pirimidina Voltada esquerda. 12 nt/volta. Estrutura em zig-Zag

Existe em estado desidratado, mais compacta (11 -12 nt/volta) no tem funo biolgica

+ comum

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Informao contida no DNA

Heterocromatina sequncias no codificantes , espalhadas que se repetem muitas vezes -que podem ser longas repeties (LINE long interspersed repeated sequences) ou curtas (SINE short interspersed repeated sequences). So semelhantes a elementos mveis dos procaritas, os transposes. Funes estruturais (telmeros e centrmeros) Eucromatina sequncias de DNA que codificam a sequncia de aminocidos de protenas, e tambm dos RNAs. os genes Os procariotas s contm eucromatina, e por vezes podem ter genes sobrepostos. Quanto mais complexos os organismos, maior a componente no codificante
5 3 3 5

Cadeia molde Cadeia complementar

Organizao estrutural do DNA nos eucaritas a cromatina

Cada clula humana tem 1,5 m de DNA, que tem de estar muito bem empacotado O DNA encontra-se associado a caties de baixo peso molecular, metais, di e poliaminas e protenas. As principais protenas so as histonas. O nvel mais simples de organizao estrutural o nucleossoma, composto por um ncleo octamero de histonas, onde se enrola a hlice do DNA. O octamero est associado ao DNA e histona H1

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Organizao estrutural do DNA nos eucariotas a cromatina

A partir do enrolamento de conjuntos de nucleossomas, obtm-se fibras cada vez mais compactadas.
S durante a diviso celular (mitose) que o DNA superenrolado na estrutura de cromossoma

Estrutra to compactada, que ter dificil actividade transcricional

Estruturas da cromatina

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Papel das SINEs e LINEs na estrutura do cromossoma

Telmeros LINEs Extremidades das cadeias de DNA que tm de estar protegidas, seno poderia haver ligao de vrios loop cromossomas em cadeia

centrmero SINEs Estrutura essencial para a correcta segregao dos cromossomas durante a mitose

A cada duplicao da clula, perde-se uma repetio no telmero. Funo de controlo de excesso de multiplicao, relacionado com o envelhecimento e cancro. As telomerases conseguem repor as repeties nos telmeros clulas estaminais.

Organizao Gentica nos procariotas e eucariotas

O tamanho de DNA define-se em pares de base (bp). Os genes so muitas vezes definidos em kb (1000bp), os genomas em Mb
~150 bp

E. coli H. sapiens gene 0 (ATG)

-35 -10 TATA box

4,6 Mb 3300 Mb

promotor

Segmento que codifica a ordem de aminocidos de uma protena, ou a sequncia de nucletidos de RNAs

Regio promotora onde se ligam protenas que influenciam (activam/inibem) a transcrio, factores ou reguladores transcricionais Regio operadora onde se liga a RNA polimerase, tb chamada TATA box ( -10, -35 nos procariotas)

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Organizao Gentica nos procariotas e eucariotas

Regio promotora onde se ligam protenas que influenciam (activam/inibem) a transcrio, factores ou reguladores transcricionais Regio operadora onde se liga a RNA polimerase -10, -35 nos procariotas)
Unidade monocistrnica transcrio

eucariotas

mRNA Pr-mRNA

Unidade policistrnica (opero)

mRNA

mRNA
Intres no codificantes Exes - codificantes
Enzimas envolvidos na mesma via metablica

Replicao, Reparao e recombinao do DNA

SENDO A BASE DA HEREDITARIEDADE, O DNA TEM DE SER CORRECTAMENTE COPIADO, TEM DE SER MANTIDO E REPARADO DURANTE O PERIODO DE VIDA DA CLULA.

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Replicao do DNA
Na replicao do DNA participam vrias enzimas: DNA polimerases que sintetizam uma nova cadeia de DNA, alinhando d-nucleotidos com de acordo com a sequncia complementar da cadeia molde pr-existente Helicases que desenrolam a dupla hlice e separam as cadeias de DNA, expondo bases para emparelhamento SSB single strain DNA binding proteins que ligam as cadeias simples expostas, estabilizando-as. Exonucleases que removem ribonucletidos Ligases que reestabelecem ligaes fosfodister entre nt adjacentes Topoisomerases que desfazem o super enrolamento da cadeia dupla Primase uma RNA polimerase que sintetiza pequenos fragmentos de RNA que emparelham na cadeia de DNA e que servem de iniciadores DNA polimerase (primers)

Replicao do DNA
Garfo de replicao Num primeiro passo, as helicases abrem a dupla cadeia de DNA, o que leva formao de uma estrutura especializada em Y chamada garfo de replicao, onde ocorre a adio de nucletidos levada a cabo pela DNA polimerase. medida que a DNA polimerase avana, com a sntese de novas cadeias, necessrio que a helicase v progredindo tambm, o que leva toro da cadeia dupla, e requer a actividade da topoisomerase para remover zonas super enroladas.

A replicao do DNA semiconservativa, bidireccional e semidescontnua

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A replicao do DNA semiconservativa

Semiconservativa Cada uma das cadeias pr-existentes fica emparelhada com uma nova cadeia qual serviu de molde

2 cadeias duplas formadas pela cadeia molde antiga, e a outra que foi sintetizada

A replicao do DNA Bidirecional

Quando ocorre a abertura do DNA em locais especficos, designados por origem de replicao, forma-se dois garfos de replicao que iro progredindo em direces opostas, com a sntese, em ambos os stios das duas cadeias de DNA. Replicao de DNA bacteriano (uma origem de replicao)

Nos eucaritas, ocorrem vrias origens de replicao num cromossoma, e quando os garfos se encontram, s necessrio unir as duas novas cadeias

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A replicao do DNA semidescontnua

A DNA polimerase s consegue sintetizar novas cadeias de DNA no sentido 5 3, no entanto o DNA formado por duas cadeias antiparalelas, assim, na progresso do garfo de replicao, uma das cadeias tem de ser sintetizada ao contrrio, de 3 5. Isto conseguido atravs de sntese de desconstnua, de pequenos fragmentos 53, que vo sendo unidos por ligases. So os fragmentos Okazaki. A sntese da cadeia principal mais rpida (leading strand), e da complementar mais lenta (lagging strand).

Fragmentos okazaki Procariota Eucariota 1 a 2 kb 100 a 200 bp

Replicao de DNA em E. coli

Iniciao com formao do complexo aberto Extenso da leading strand por aco da DNA polimerase III, e da lagging strand por acco conjunta da DNA polimerase III, do primossoma e SSB
Ligao da DnaA origem de replicao oriC

Complexo da helicase DnaB com a primase DnaG, primossoma

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Replicao de DNA em E. coli

Unio dos fragmentos okazaki, ocorre com remoo do primer de RNA e sntese de cadeia de DNA a substitui-lo, pela DNApolimerase I

A replicao termina quando os dois garfos se encontram, e a as duas novas cadeias duplas separam-se por aco da DNA topoisomerase iV

Replicao de DNA em eucariotas

idntica replicao nos procariotas, mas mais lento devido ao elevado empacotamento do DNA, que dificulta a abertura da hlice. Os cromossomas eucarioticos so lineares, no so circulares. Assim, a replicao termina quando os garfos atingem o fim da cadeia. Contudo, o fim da cadeia no permite o priming final na lagging strand, o que leva ao encurtamento sucessivo das cadeias na regio dos telmeros. A telomerase consegue resintetizar as regies em falta

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Manuteno, Reparao e Recombinao do DNA

A manuteno correcta da informao gentica essencial para o funcionamento da clula e das clulas filhas. Requer mecanismos rigorosos de cpia, e tambm de reparao de DNA de forma a corrigir erros acidentais que ocorrem continuamente na sequencia de DNA Os erros podem ser introduzidos durante a cpia, ou por aco de diversos agentes ambientais mutagnicos. Quando no so reparados, os erros podem ser propagados e so chamados mutaes. As mutaes so a base da evoluo, e por vezes vm de erros cometidos pelos prprios sistemas de reparao.

Proof-reading da DNA polimerase

As DNA polimerases tm 3 caractersticas fundamentais: 1. No efectuam a separao das duas cadeias da dupla hlice de DNA 2. No iniciam a nova cadeia, apenas estendem uma nova cadeia a partir de um fragmento pr-existente (primer de DNA ou RNA) 3. Catalisam a adio de nucletidos extremidade 3OH livre da nova cadeia em crescimento

As DNA polimerases tm ainda uma outra actividade de exonuclease , que permite remover por catlise hidroltica, os ltimos resduos adicionados. Assim se houver erros de emparelhamento introduzidos, os nt so removidos e a DNA polimerase volta a sintetizar nova cadeia correctamente efeito de proof reading

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Manuteno, Reparao e Recombinao do DNA

As alteraes mais comuns que ocorrem so: substituio de pares de bases Transio (um par purina-pirmimidina trocado por outro par purina-pirimidina, ex GC AT) Transverso (um par purina-pirimidina trocado por um pirimidinapurina, ex GC CG/TA) Adio de pares de bases Ocorrem devido ao Eliminao de pares de bases deslizamento da polimerase

Manuteno, Reparao e Recombinao do DNA

Alterao por mudana de configurao de bases Tautomerizao de bases (forma ceto ou enol) Desaminao de bases Criao de locais apurnicos (ou menos frequente, apirimidinicos) Alquilao de bases ou grupos fosfatos
Base Agente original desaminante Efeito da alterao

Base original

Agente alquilante

Efeito da alterao

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Outras modificaes no DNA efeito da radiao UV

Formao de dmeros pirimidinas de bases consecutivas

Mecanismo de reparao Fotoliases

Sistemas de reparao de DNA 1. reparao por exciso de bases

reparao por exciso de bases
A base alterada reconhecida e removida pela DNA glucosilase, que quebra a ligao glisosdica entre a base e a pentose. A AP endonuclease reconhece um nucleotido apurinico/pirimidinico e quebra as ligaes fosfo diester, removendo o nt. A DNA polimerase I consegue refazer a cadeia

A DNA ligase une a nova cadeia antiga

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Sistemas de reparao de DNA 2.Reparao por exciso de nucletidos (excision-repair)

O dano no DNA localizado

A exonuclease excisa um fragmento de nt

A DNA polimerase re-sintetiza novo DNA

A DNA ligase une a nova cadeia de DNA

Sistemas de reparao de DNA 3. Recombinao homloga

A reparao por recombinao feita por troca da poro lesada com a cadeia homloga do outro cromossoma A recombinao homloga permite a troca de cadeias duplas de DNA por outras a partir de uma regio que homloga

Processo comum na meiose

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Transcrio e processamento de RNA

O RNA A MOLCULA INTERMEDIRIA ENTRE A MENSAGEM CONTIDA NO GENOMA E PROTENA A PARTIR DELA PRODUZIDA A TRANSFERNCIA DA INFORMAO GENTICA DO DNA PROTENA DESIGNA-SE POR EXPRESSO GNICA

Classes de RNA
1. RNA mensageiro
O mRNA contm a informao necessria sntese de protena, pois a sua sequncia de bases determina a sequncia de aminocidos. Nos eucariotas o RNA resultante da transcrio chamado RNA heterogneo nuclear (hnRNA) ou pr-mRNA, e apresenta regies codificantes (exes) e no codificantes (intres). O pr-mRNA modificado ou processado para retirar os intres e ficar mRNA

2. RNA de transferncia
tRNA , so molculas especiais de RNA, que ligam especificamente um aminocido e que actuam como molcula adaptadora durante a sntese proteca.

3. RNA ribossomal
rRNA, so os RNAs mais abundantes (80-90% ) e so componentes estruturais dos ribossomas. Procariotas tm 3 rRNAs -16S, 23S e 5S, Nos eucariotas h 4 rRNAs: 18S, 28S, 5.8S e 5S que so sintetizados no nuclolo. Os 3/4 rRNAs so sintetizados num nicotranscrito, que processado dando origem aos diferentes rRNAs.

4. Pequeno RNA nuclear (s eucariotas)

Pequenas molculas de RNA essenciais aos mecanismos de processamento de RNA

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Transcrio sntese de RNA a partir de DNA catalizada pela RNA polimerase

Os procariotas possuem um nico tipo de RNA polimerase que formada por vrias subunidades . O centro cataltico que efectua a sntese de cadeia de RNA constituido pelas subunidades ( ), para inciar a transcrio necessrio o Centro cataltico factor (sigma). RNA pol Existem vrios factores sigmas diferentes.

Factor Sigma Os eucariotas contm 3 tipos diferentes de RNA polimerases: RNA polimerase I transcreve rRNA RNA polimerase II transcreve genes que codificam protenas em hnRNA RNA polimerase III trasncreve outros RNAs funcionais, tais como os tRNAs E ainda, nos cloroplastos e mitocondrias, contm uma RNA polimerase semelhante RNA polimerase bacteriana (teoria endossmica).

Mecanismo de transcrio nos procariotas

A transcrio d-se por trs passos: iniciao, elongao e terminao
A RNA polimerase alonga a cadeia de RNA adicionando ribonucletidos (NTPs NMPs +ppi) ao terminal 3OH Para que ocorra a transcrio necessrio fazer a ruptura de pontes de H na cadeia de DNA e a cadeia dupla tem que ser desenrolada, de modo a que a cadeia molde fique exposta formando uma bolha de transcrio. medida que a RNA polimerase progride, a bolha avana e a cadeia de RNA aumenta. A sntese de RNA tb feita de 5 3. A sntese de RNA processiva se o transcrito for liberto, no continua, s pode recomear.
Libertao do factor sigma

elongao

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Mecanismo de transcrio nos procariotas

A transcrio d-se por trs passos: iniciao, elongao e terminao A terminao da transcrio d-se quando a RNA polimerase encontra regies ditas terminador, que so autocomplementares e que formam uma estrutura hibridada que leva paragem da RNA polimerase e libertao do transcrito. Alternativamente, existe um mecanismo dependente do terminador Rho, que uma helicase que reconhece sequncia atenuadoras e que leva interrupo da sntese do transcripto. um mecanismo de regulao transcricional comum em operes, em que s a parte inicial do opero ser mais transcrita.

Regulao da transcrio gnica em procariotas

~150 bp

promotor 0 (ATG)
-35 -10 operador

gene

Os factores transcricionais podem ser activadores que ajudam a ligao da RNA polimerase ao operador. Podem ser repressores, que se ligam perto da operador e impedem a formao do complexo da RNApolimerase ao operador.

Sequncias reconhecidas por protenas chamadas factores transcricionais

Podem existir multiplos reguladores para o mesmo gene ou opero, com funes disitntas (activadores e repressores) o caso do opero lac que duplamente regulado quer pelos nveis de lactose (inibidor LacI ) e pelos nveis de glucose e AMPc (activador CAP).

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Regulao coordenada de genes do metabolismo da lactose em E. coli o opero lac

Lactose Locais de ligao dos factores de transcrio CAP e LacI Intracelular
Galactose permease

+1
5 3 CAP Prom LacI O Z Y A 3 5 Lactose -galactosidase

Regio reguladora da transcrio (100 bp)

Genes Funcionais lacZ: Beta-galactosidase lacY: Galactose permease lacA: Transacetilase Alolactose -galactosidase

Galactose

Glicose

Regulao Negativa do Opero lac

Protena CAP RNAp

5 3

XX
CAP P O Z Y A

3 5

Repressor lac activo

Lactose indisponvel Glicose disponvel (baixo cAMP) Regulao Negativa

Transcrio basal de mRNA espordica

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Regulao Negativa do Opero lac

Repressor lac activo

Lactose/alolactose Mediador Qumico

Repressor lac inactivo

Protena CAP

X
5 3 CAP

X
P RNAp O Z Y A Represso Catablica 3 5

Baixa transcrio de mRNA

Lactose disponvel Glicose disponvel (baixo cAMP)

Regulao Positiva do Opero lac

Protena CAP inativa
cAMP Repressor lac activo Lactose/ IPTG

Protena CAP activa

Repressor lac inactivo

X
5 3 CAP P RNAp O Z Y A 3 5

Alta transcrio de mRNA Regulao Positiva

Lactose disponvel Glicose indisponvel (alto cAMP)

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Viso geral da regulao do opero lac

cAMP Protena CAP Glucose cAMP Repressor lac local CAP Glucose cAMP
Operador

Repressor lac ligado

Lactose

RNA polimerase

mRNA

Lactose

X
Repressor lac

Transcrio basal

mRNA

Efeitos combinados da glucose e da lactose na regulao do operon lac para haver expresso somente quando seja necessrio produzir glucose a partir de lactose

Transcrio nos Eucariotas

Os eucariotas tm um desafio enorme que regular a expresso gnica de no apenas 2 a 6 mil genes, mas por exemplo 30 000 genes. Assim, o controlo gentico requer uma quantidade enorme de fontes de informao e de factores, de forma a obter nveis de expresso adequados de cada protena, em diferentes tecidos ou orgos.
Actuam a grande Enhancers e distncia. No conse- silenciadores guem s por si induzir a expresso, mas conseguem aument-la ou diminu-la Factores indutiveis Factores a montante Factores gerais Toda a maquinaria que compe a RNA pol

A ligao dos factores indutiveis, eles prprios tb regulados, essencial para haver nveis de expresso acima do basal.

Estes 3 elementos so essencias para a ligao da RNA polimerase, mas no obrigatrio que existam os 3

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Transcrio nos Eucariotas

Iniciao ligao ao promotor
A transcrio pela RNA polimerase II (a dos mRNAs) tambm um mecanismo de 3 passos, iniciao, elongao e terminao, s que mais complexo que nos procariotas A passagem para a elongao requer o clearance ou limpeza do promotor

Fosforilao

Processamento do hnRNA ou pr-mRNA

Capping do terminal 5 (adio de 1 guanosina metilada) Exporte do ncleo e associao ao ribossoma

Adio de uma cadeia poli-A Remoo dos intres pelo splicessoma (pequenas ribonucleoprotenas nucleares snRNP)

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Processamento do hnRNA ou pr-mRNA

Existem casos de poliadenilao e de splicing alternativos

Exemplo da calcitonina (uma hormona produzida pela tiride)

O mesmo pr-mRNA em neurnios processado na presena de outros factores que fazem um splicing alternativo, eliminado o exo 2, e usam outro local de poliadenilao. Assim forma-se o pptido relacionado com o gene da calcitonina (CGRP) que um neurotransmissor.

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A Traduo do RNA em polipptido

Traduo
No processo de traduo os principais intervenientes so os trs tipos de RNA O ribossoma que o complexo cataltico de sntese da cadeia peptdica. formado essencialmente por molculas de rRNA, e tb por protenas, mas o rRNA que responsvel pela estrutura e actividade cataltica O mRNA, que contm a informao sobre a sequncia de aminocidos a unir. Os tRNA que servem de adaptadores/ tradutores entre a mensagem do mRNA e a que aminocidos ela se refere.

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Traduo - O cdigo gentico

Quando os organismos primordiais resolveram armazenar a informao relativa sntese de protenas nos cidos nucleicos deparam-se com um problema numrico: 4 nucletidos diferentes 20 aminocidos a soluo foi usarem conjuntos de 3 nucletidos para codificar os aminocidos.

4x4x4= 64 combinaes possveis

Assim o cdigo gentico um cdigo de tripletos, e universal, ou seja, todos os organismos usam o mesmo cdigo, o que permite facilmente extrair o mRNA de um organismo (p. ex. homem) e traduzi-lo noutro organismo diferente, p ex. bactria. A cada tripleto d-se o nome codo e os tRNA contm uma sequncia que emparelha no codo do mRNA, chamada anti-codo.

Aminoacil tRNA

Traduo - O cdigo gentico

Assim o cdigo gentico um cdigo de tripletos, e universal Dos 64 codes, 61 codes codificam os aminocidos e 3 actuam como terminadores da traduo (codes STOP) No existem 61 tRNAs diferentes, S que a extremidade 5 do anticodo (a ultima posio ou a 3 do codo) no faz uma ligao muito forte, e permite emparelhamentos menos especficos. A este efeito chama-se Wobble. E tal permite que o mesmo tRNA reconhea at 4 codes distinto

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A mensagem do gene protena

A sequncia de codes pode ser lido tanto no mRNA como na cadeia codificante, pois no esta e sim a sua complemntar que serve de molde para a transcrio Uma mesma sequncia de DNA/mRNA pode ser lida em 3 frames diferentes, chamadas reading frames

Estrutura e funo dos tRNA

Estrutura secundria Arranjo em folha de trevo

Cada tRNA liga um aminocido, e a insero deste aminocido feita por enzimas especficos, as aminoacil-tRNA sintetases Estes enzimas reconhecem especificamente o tRNA alvo, e o aminocido especfico desse tRNA A ligao do aminocido feita entre o grupo OH do terminal 3 do tRNA e o grupo carboxilo do aminocido A insero de um aminocido no tRNA um processo que requer ATP, (j que a enzima uma sintetase)

Estrutura tridimensional

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Ribossomas, sistemas de traduo

A sntese das protenas ocorre nos grandes complexos ribonucleoproteicos chamados ribossomas. 2/3 da composio so rRNA Os ribossomas so compostos por duas subunidades a grande, que catalisa a ligao peptidica A pequena onde encaixa o mRNA e onde se d a interaco codo-anticodo, ou seja mRNA-tRNA. Os ribossomas podem estar associados ao RE (eucariotas) ou no citoplasma (pro e eucariotas) e neste ultimo caso podem estar isolados ou agrupados nos polissomas, quando vrios ribossomas esto associados ao mesmo mRNA a traduzi-lo

Os ribossomas associados ao RE so responsveis pela sntese de proteans destinadas ao RE, outras estruturas celulares, ou secretadas

No RE e no Golgi, as protenas podem sofrer modifcaes por introduo de polisidos - glicosilao

No RE N-glicosilao no Golgi O-glicosilao A N-glicosilao est associada ao controlo do folding

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Traduo sntese de polipptidos

O ribossoma tem 3 locais de ligao aos tRNAs: Local A onde se ligam inicialmente os tRNA na forma aminoacil-tRNA Local B onde se liga um tRNA ligado a uma cadeia peptidica, i.e., peptidil-tRNA Local E o ltimo loca de ligao, de onde um tRNA vazio se solta, designado de Exit

Iniciao da traduo
A traduo inicia-se com a ligao da subunidade pequena do ribossoma associada ao tRNA iniciador (com o aminocido metionina) ao mRNA Nos eucariotas este processo facilitado pela intervenso de Factores de Iniciao. O posicionamento correcto do codo ATG do mRNA conseguido graas aos factores ligados ao 5-CAP nos eucariotas. Nos procariotas o posicionamento correcto depende do reconhecimento pelo ribossoma de uma sequncia a montante do ATG designada ShineDalgarno

Aps a sada dos factores de iniciao, a subunidade grande do ribossoma liga-se, e a traduo inicia-se

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Elongao da traduo quando ocorre a sntese da cadeia peptdica

Primeiro, um novo aa-tRNA liga-se no local A

Ocorre a sada do apo-tRNA que estava no local E Com a intervenso de factores de elongao, ocorre o desvio da subunidade pequena em relao grande, os tRNAs saltam uma posio e d-se a formao de uma ligao peptdica, e o recm chegado tRNA torna-se um peptidil-tRNA A sada dos factores de elongao possibilita o desvio da subunidade pequena ao longo do mRNA, o que esvazia a posio A para receber um novo tRNA

Terminao da traduo

A traduo termina quando surge na posio A um codo terminador, ao qual se liga um factor de terminao. No possvel nova ligao peptdica, logo o pptido libertado com o desvio da subunidade grande. Por fim, o ribossoma dissocia-se do mRNA, e liberta tambm o apo-tRNA e o factor de terminao

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Bibliografia
Captulo 40, 41, 42, 43

Questes
1. Diga quais as protenas associadas ao DNA em clulas eucariotas e qual a estrutura bsica da cromatina durante a interfase. 2. Indique as diferenas fundamentais na organizao dos genes entre os procariotas e eucariotas. 3. Diga se verdadeiro ou falso. Justifique se for falso. a) Para a replicao do DNA so necessrias vrias enzimas, incluindo a DNA polimerase,a topoisomerase, a helicase e a primase b) A DNA polimerase consegue abrir a cadeia dupla c) O garfo de replicao tem a forma de X d) Para a sntese da cadeia lagging strand, existe uma DNA polimerase diferente que sintetisa de 3 para 5 e) Existe uma nica origem de replicao nos cromossomas procariticos e eucariticos f) As mutaes introduzidas pela DNA polimerase durante a replicao podem ser reparadas pela primase

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Questes
4. Como os cromossomas eucariticos so lineares impossvel replicar a cadeia lagging at ao final. Diga sucintamente qual a principal consequncia deste fenmeno? Qual a sua funo? Que enzima est envolvida na correo deste efeito? 5. Indique um mecanismo de reparao de mutaes. 6. Qual a molcula que funciona na transferncia de informao do ncleo para o citoplasma? 7. Qual o complexo enzimtico envolvido na sntese de RNA a partir de DNA e como se chama o processo? 8. Diga se verdadeiro ou falso, e justifique se falso. a) Existe uma RNA polimerase em eucaritas e 3 RNA polimerases diferentes em procaritas b) A RNA polimerase II responsvel pela transcrio dos genes que codificam protenas c) Em procariotas sempre necessrio a presena de factores de transcrio para a ligao da RNA polimerase e iniciao da transcrio.

Questes
9. D sucintamente um exemplo de uma forma de regulao da transcrio de um gene. 10. Em quantos passos se divide o processo de transcrio nos procariotas.?E nos eucariotas? 11. O transcrito primrio do gene da ovalbumina tem 7700 nucletidos, mas o mRNA maturo que traduzido no ribossoma contm 1872 nucletidos. Porque que os pr-mRNA eucariotas ficam mais pequenos durante o processamento de RNA, e qual a maquinaria envolvida neste processamento? 12. Indique os diferentes passos em que consiste o processamento de RNA nuclear em eucariotas. 13. Refira resumidamente a composio e funo de um ribossoma e o que entende por polirribossomas. 14. Indique algumas caractersticas do cdigo gentico. 15. Descreva as molculas intervenientes na traduo e qual a sua funo. 16. Um ribossoma formado por quantas subunidades? Indique a principal actividade de cada uma.

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