COMPRENDRE: Lois et modles

Chapitre 10 : reprsentation spatiale des molcules

- Le modle clat : les atomes sont reprsents par des boules de couleur dtermine, les liaisons sont reprsentes par des barres Exemple : modle clat de la cafine

Animation 1. reprsentation spatiale des molcules 2. module sous Word pour tracer des formules dveloppes semi-dveloppes et des reprsentations de Cram.

Table des matires

I) reprsentation spatiale des molcules

1) formule brute, semi-dveloppe et dveloppe, modle molculaire 2) formule topologique 3) reprsentation de Cram 1) dfinition de la stroisomrie 2) les stroisomres de conformation 3) les stroisomres de configuration 4) stroisomres de configuration dans le cas d'un carbone asymtrique, notion de chiralit. 5) la diastroisomrie, molcule deux carbones asymtriques 6) la diastroisomrie Z/E

II) la stroisomrie

III) organigramme sur la stroisomrie

Programme officiel
Introduction: les odeurs de menthe et de muguet sont trs diffrentes alors qu'elles peuvent tre produites par des molcules ayant la mme formule semi-dveloppe! Quel est ce mystre?

- formules dveloppes et semi-dveloppes : Lenchanement des atomes dans la molcule peut tre reprsent par une formule dveloppe ou semi-dveloppe. Dans une formule dveloppe, toutes les liaisons entre les diffrents atomes apparaissent. Dans une formule semidveloppe, les liaisons concernant les atomes dhydrogne ne sont pas reprsentes (pour gagner du temps et de la place!). Exemple : le propane de formule brute C3H8 pour formule dveloppe :

I) reprsentation spatiale des molcules

1) formule brute, semi-dveloppe et dveloppe, modle molculaire
Il existe plusieurs faons de reprsenter une molcule: - la formule brute: on crit cte cte les symboles des atomes qui la constituent, en prcisant en indice, droite du symbole le nombre datomes. Si ce nombre est gal 1 on ne l'crit pas. Exemple : la molcule deau de formule brute H2O : 2 atomes dhydrogne et 1 atome doxygne. - les modles molculaires: Animation : modles compacts et clats de centaines de molcules (minrale, organique, biochimique); un modle molculaire reprsente une molcule dans lespace. On en distingue 2 types : - Le modle compact : chaque atome est reprsent par une boule de couleur dtermine. Exemple : modle compact de leau de formule brute H2O Latome doxygne est de couleur rouge, les atomes dhydrogne sont de couleur blanche.

Formules semi-dveloppe : CH3 CH2 CH3

2) formule topologique
Intrt? La formule topologique permet de gagner du temps pour reprsenter une molcule. La chane carbone est reprsente par une ligne brise dont les sommets et les extrmits reprsentent les atomes de carbone. Une liaison simple est reprsente par un trait, une double par 2 traits ... Les symboles des atomes sont reprsents sauf ceux des atomes de carbone et des atomes d'hydrogne qui leur sont lis. Exemple: nom 3-chlorobut-1-ne formule semi-dveloppe formule topologique

Exemple: CH3-O-CH3 est isomre de constitution avec CH3CH2-OH (mme formule brute C2H6O, mais formule plane diffrente). Dans ce chapitre, nous nous intresserons au cas o 2 molcules ont mme formule brute et plane mais une reprsentation ___________ diffrente.

3) reprsentation de Cram
En 1874 les chimistes J. H. Van't off et J.A. Lebel mettent l'hypothse que l'atome de carbone es, dans de nombreuses molcules, au centre d'un ttradre. La reprsentation de Cram (1953) fait appel la perspective pour visualiser les molcules dans l'espace. Rgles de la reprsentation de Cram Les liaisons dans le plan dans la feuille sont symbolises par un trait. Les liaisons en avant du plan sont symbolises par un triangle noir. Les liaisons en arrire du plan sont symboliss par un triangle hachur (ou parfois par un trait en pointill). Exemple: nom

2,2-dimthylpropane

dimthylthanol

Remarque: dans le cas d'une structure ttradrique l'angle entre les liaisons est de 120.

II) la stroisomrie

Lorsque deux molcules ont mme formule brute mais une formule plane diffrente elles sont isomres de constitution.

3-thyl-2-methylpentane 2-mthylhexan-3-one 3-mthylbutan-1-ol reprsentation de Cram

1) dfinition de la stroisomrie
Deux molcules sont stroisomres lorsqu'elles ont la mme formule plane (semi dveloppes ou dveloppe mais pas la mme reprsentation spatiale. On distingue 2 types de stroisomres: - les stroisomres de conformation - les stroisomres de configuration

2) les stroisomres de conformation

Lorsqu'une molcule A peut avoir, par libre rotation autour d'une liaison simple plusieurs reprsentations spatiales, on dit qu'elle possde plusieurs stroisomres de conformation. On appelle conformation d'une molcule les diffrentes reprsentations spatiales qu'elle peut prendre par suite de libre rotation autour de ses simples liaisons. Exemple 1: la molcule A possde 2 stroisomres de conformation. On passe de la conformation 1 la conformation 2 par une rotation de 120 (par rapport la liaison simple C-CH3). conformation 1 conformation 2

Exemple 2 conformation 1

conformation 2

La molcule prsente 2 stroisomres de conformation. On passe de la conformation 1 la conformation 2 par rotation.

Stabilit des conformations

Exemple 1: l'thane peut prendre 2 conformations, les conformations dcales et les conformations clipses: Laquelle est la plus stable? La dcale! Pourquoi? Toutes les conformations ne sont pas quivalentes du point de vue nergtique. Les liaisons carbone hydrogne C-H sont composs de deux lectrons donc 2 charges ngatives. Au sein de la molcule elles se repoussent. La conformation

dans laquelle les simples liaisons sont les plus loigns est la plus stable nergtiquement. Par consquent la conformation dcale est la plus stable. La conformation la plus stable est celle pour laquelle: - les liaisons covalentes sont les plus loignes - les interactions striques dues aux gros substituants sont les plus faibles. Exemple 2:

appels des nantiomres. L'nantiomrie est la relation entre 2 stroisomres de configuration images l'un de l'autre par un miroir. 2 nantiomres possdent des proprits chimiques et physiques communes mais des proprits biochimiques diffrentes.

Exemple: 2 nantiomres formule semidveloppe

CH3-CHOH-CH3

Les 2 molcules sont nantiomres car : - images l'une de l'autre dans un miroir - non superposables mme par rotation La conformation chaise est plus stable que la conformation bateau car les liaisons covalentes y sont plus loignes.

3) les stroisomres de configuration

Deux stroisomres de configuration sont 2 molcules diffrentes ( la diffrence des stroisomres de conformation qui sont 2 reprsentations spatiales de la mme molcule)! Elles ne sont pas superposables. Elles ont mme formule plane mais une reprsentation spatiale diffrente. Exemple: reprsentation de Cram molcule A

Un objet est chiral s'il rponds au 2 conditions suivantes: 1) il n'est pas superposable son image dans un miroir 2) il n'a pas de plan de symtrie. Exemple: La main est chirale, elle n'est pas superposable son image et qu'elle n'a pas de plan de symtrie!

formule topologique

molcule B

Une molcule ne possdant qu'un seul atome de carbone asymtrique est toujours chirale. Rappel: pour qu'une molcule soit chirale il est ncessaire qu'elle ne possde pas de plan de symtrie ce qui est impossible quand elle ne possde qu'un seul atome de carbone asymtrique. Remarque: le concept de chiralit est macroscopique; il a t tendu aux molcules par Pasteur en 1948. Exemple

Les 2 molcules ne sont pas superposables mme par rotation: elles ne sont pas stroisomres de conformation. Elles possdent une formule plane identique mais une reprsentation spatiale diffrente. Elles ne peuvent pas tre la mme molcule!

4) stroisomres de configuration dans le cas d'un carbone asymtrique, notion de chiralit.

Un atome de carbone asymtrique, not C*, est un atome de carbone ttradrique li 4 atomes ou groupes d'atomes diffrents. Une molcule possdant un atome de carbone asymtrique peu exister sous 2 configurations diffrentes, image l'une de l'autre dans un miroir. Les 2 stroisomres de configuration correspondant sont

La molcule A possde un seul atome de carbone asymtrique. Elle n'a pas de plan de symtrie. Elle n'est pas superposable son image dans un miroir. Cette molcule est chirale. Un mlange contenant les deux nantiomres en proportions gales est appel un racmique. Exemple: un mlange quimolaire de l'acide amins Lalanine et de son nantiomre la D-alanine est appel un racmique.

5) la diastroisomrie, molcule deux carbones asymtriques

Les diastroisomres sont des isomres de configuration qui ne sont pas des nantiomres. Ils ont mme formule dveloppe mais une reprsentation spatiale diffrente. 2 diastroisomres ne sont pas images l'un de l'autre dans un miroir, contrairement aux nantiomres. 2 diastroisomres ont des proprits physiques et chimiques diffrentes. Exemple: considrons l'espce chimique suivante possdant 2 carbones asymtriques: 1 et 2 ainsi que 3 et 4 sont nantiomres car image l'un de l'autre dans un miroir. 1 et 3, 2 et 4, 1 et 4 et 2 et 3 sont diastroisomres car ils ne sont pas images l'un de l'autre dans un miroir.

6) la diastroisomrie Z/E
Il n'y a pas de rotation possible autour d'une double liaison. Soit un compos de formule AHC=CHB avec A et B diffrent de H. Il existe 2 stroisomres de configuration appels Z et E qui ne sont pas image l'un de l'autre dans un miroir. Il s'agit donc de deux diastroisomres. - Dans le diastroisomre Z (zusammen qui veut dire ensemble en allemand) les deux atomes d'hydrogne se trouve 'ensemble' du mme cot de la double liaison. - Dans le diastroisomre E (entgegen qui veut dire oppos en allemand) les deux atomes d'hydrogne se trouve de part et d'autre de la double liaison.

Elles possdent 4 configurations possibles:

Exemple:

Dans le (E)-pent-2-ne les atomes d'hydrogne sont de part et d'autre de la double liaison. Pour le (Z)-pent-2-ne, les atomes d'hydrogne sont du mme cot de la double liaison. Ces deux composs sont des diastroisomres car ils ont mme formule semi-dveloppe ( CH3-CH=CH-CH3) mais une reprsentation spatiale diffrente et ils ne sont pas images l'un de l'autre dans un miroir.

III) organigramme sur la stroisomrie

A et B ont-ils la mme formule brute et dveloppe plane?

non

oui

A et B sont des isomres de constitution exemple: CH3-O-CH3 est isomre de constitution avec CH3-CH2-OH (mme formule brute mais formule plane diffrente) oui A et B sont des isomres de conformation (A et B sont des agencements spatiaux diffrents d'une mme molcule) exemple:

A et B sont des stroisomres

peut-on passer de A B par rotation autour d'une simple liaison?

non

A et B sont des stroisomres de configuration

A et B sont des diastroisomres (proprits chimiques et physiques diffrentes) exemple 1:

non

A est-il l'image de B dans un miroir?

oui

exemple 2:

A et B sont des nantiomres (mme proprits physiques et chimiques mais proprits biologique diffrentes exemple:

Programme officiel

Comprendre
Lois et modles
Comment exploite-t-on des phnomnes priodiques pour accder la mesure du temps ? En quoi le concept de temps joue-t-il un rle essentiel dans la relativit ? Quels paramtres influencent lvolution chimique ? Comment la structure des molcules permet-elle d'interprter leurs proprits ? Comment les ractions en chimie organique et celles par change de proton participent-elles de la transformation de la matire ? Comment seffectuent les transferts dnergie diffrentes chelles ? Comment se manifeste la ralit quantique, notamment pour la lumire ? Reprsentation spatiale Notions et contenus Chiralit : dfinition, approche historique. Reprsentation de Cram. Carbone asymtrique. Chiralit des acides amins. des molcules Comptences exigibles Reconnatre des espces chirales partir de leur reprsentation. Utiliser la reprsentation de Cram. Identifier les atomes de carbone asymtrique dune molcule donne.

nantiomrie, mlange racmique, diastroisomrie (Z/E, deux atomes de carbone asymtriques).

partir dun modle molculaire ou dune reprsentation, reconnatre si des molcules sont identiques, nantiomres ou diastroisomres.

Pratiquer une dmarche exprimentale pour mettre en vidence des proprits diffrentes de diastroisomres. Visualiser, partir dun modle molculaire ou dun logiciel de simulation, les diffrentes conformations d'une molcule.
Utiliser la reprsentation topologique des molcules organiques. Extraire et exploiter des informations sur : - les proprits biologiques de stroisomres, - les conformations de molcules biologiques, pour mettre en vidence limportance de la stroisomrie dans la nature.

Conformation : rotation autour dune liaison simple ; conformation la plus stable. Formule topologique des molcules organiques. Proprits biologiques et stroisomrie.