UE 5 : AMLIORATION DES PLANTES ET DES ANIMAUX, PROTECTION DES CULTURES

MOTS-CLS :

Biodiversit ; classification, phylognie ; ressources gntiques ; nuisibilit ; bio-agresseurs; rsistance des plantes ; mcanismes de dfense ; modles ; seuils ; risques ; pesticides ; homologation et lgislation, co-toxicologie ; mthodes de luttes ; prophylaxie ; hrdit ; hritabilit ; valeur additive ; slection gntique ; varits ; porte-greffe ; races ; clones ; adaptations ; biologie florale ; gntique quantitative ; quantitative traits loci( QTL) ; slection assiste par marqueurs ; biotechnologies.

1.- OBJECTIFS DE LA FORMATION Donner les connaissances de base permettant de raisonner des stratgies d'amlioration des plantes et des animaux d'levage et de protection des plantes contre les organismes nuisibles ou comptiteurs. PR-REQUIS La biologie et l'cologie des organismes Fonctions physiologiques de la plante, notamment photosynthse. Physiologie du systme nerveux, notamment transmission et conduction de l'influx nerveux. Biologie et cologie. Gntique mendlienne, gntique quantitative, gntique molculaire. Chimie organique. Bases de la biochimie et de lenzymologie. Bases de la biologie molculaire. Les outils de rflexion et d'analyse Probabilits. Statistiques : analyse de variance. Informatique : constitution et gestion de base de donnes. ACQUISITION DE CONNAISSANCES La diversit spcifique et gntique des organismes concerns Position dans la classification des organismes nuisibles et utiles. Outils de caractrisation des espces et limites de ces outils. Outils de caractrisation de la diversit gntique, notamment des espces cultives et leves, et limites des outils d'investigation. Notions de ressource gntique.
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La protection des plantes : Biologie et cologie des principaux groupes de bio-agresseurs, valuation de leur nuisibilit, des dgts conomiques et de la ncessit des traitements. Mcanismes de dfense des plantes aux agents pathognes. Comprhension des facteurs explicatifs des fluctuations d'effectifs des populations et consquences en termes de modles de prvision des risques et d'outils d'aide la dcision. Industries de la protection des plantes, modes d'action et homologation des pesticides. Moyens d'application, contraintes et consquences lies aux traitements. Elaboration multi-critres des stratgies d'intervention. L'amlioration gntique des animaux et des plantes Bases scientifiques de gntique pour les vgtaux et les animaux. Objectifs d'amlioration des vgtaux et des animaux. Marquage molculaire et slection assiste par marqueurs. Biotechnologies. Stratgies et schmas de slection cratrice. Mthodologies d'amlioration. Slection conservatrice et organisation de la production de semences et de plants . ACQUISITION DE COMPTENCES Gestion des populations de bio-agresseurs, choix des critres d'amlioration gntique et choix des varits et des races, en s'appuyant sur des bases scientifiques. Apprhension des mthodes de diagnostic et de prise de dcision. Prise en compte de la complexit des interactions diffrentes chelles. Utilisation d'un modle pour raisonner dans le cadre d'une approche intgrative en comprenant l'intrt et les limites. Initiation l'analyse systmique des problmes complexes.

2 ORGANISATION GNRALE La formation comportera : - des enseignements sur la biodiversit tous les niveaux dorganisation du vivant, - des enseignements communs la protection des cultures et l'amlioration gntique abordant un certain nombre de sujets de faon intgrative , - des enseignements spcifiques de protection des cultures, - des enseignements spcifiques l'amlioration des plantes et des animaux.

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3 HORAIRES ET PROGRAMME DES ENSEIGNEMENTS HORAIRES : UE 5 : AMLIORATION DES PLANTES ET DES ANIMAUX, PROTECTION DES CULTURES Visites - Thme 1 : Diversit spcifique et gntique des organismes Cours TD-TP

- Diversit au niveau spcifique et supra-spcifique des organismes impliqus dans la protection des plantes. - Analyse de diversit. - Ressources gntiques.

3h

2h

- Thme 2 :

Protection des cultures

- Nuisibilit, dgts et importance conomique des bio-agresseurs. - Biologie Ecologie des bio-agresseurs. - Rsistance des plantes aux agents pathognes ; systme de reconnaissance, mcanismes de dfense - Dynamique des populations et pidmiologie. - Phytopharmacie. - Application des traitements. - Stratgies de protection.

23 h

4h

- Thme 3 :

Amlioration gntique des animaux d'levage et des plantes cultives

- Impact et objectifs de lamlioration gntique. Bases de gntique pour les animaux et vgtaux. Stratgie d'amlioration gntique des plantes. Stratgie d'amlioration gntique des animaux. Biotechnologie et amlioration des espces vivantes.

24 h

14 h

Horaire total de lUE 5 :

70 h

50 h

20 h

PROGRAMME

DE LUE 5 :

Thme 1 : DIVERSIT SPECIFIQUE ET GNTIQUE DES ORGANISMES COURS Diversit au niveau spcifique et supra-spcifique des organismes impliqus dans la protection et lamlioration des plantes et animaux domestiques : systmatique, classification, phylognie et diversit. Ressources gntiques. TRAVAUX DIRIGS Analyse de diversit.
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Thme 2 : PROTECTION DES CULTURES 2.1 Biologie Ecologie des bio-agresseurs COURS Biologie et cologie des arthropodes, des mauvaises herbes, des champignons, des bactries et des virus des plantes. La transmission des agents pathognes. 2.2 Rsistance des plantes aux agents pathognes COURS Systme de reconnaissance, mcanismes de dfense et de rsistance. 2.3 Dynamique des populations et pidmiologie COURS Dynamique des populations d'arthropodes et de mauvaises herbes. Bases de l'pidmiologie en pathologie vgtale. TRAVAUX DIRIGS TRAVAUX PRATIQUES Outils d'aide la dcision, prvision des risques, introduction l'utilisation de modles, seuils en pidmiologie. 2.4 Phytopharmacie COURS Stratgies des socits phytosanitaires, march des pesticides, mthodes de travail des socits. Homologation et lgislation. Modes d'action des principaux insecticides, acaricides et fongicides. 2.5 Application des traitements COURS Normes et contrles de l'utilisation des pesticides. TRAVAUX DIRIGS Application des traitements, types d'application et matriel. 2.6 Stratgies de protection COURS Mthodes prophylactiques et culturales, raisonnement de la lutte et lutte chimique raisonne. Lutte biologique. Lutte intgre.

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Thme 3 : AMLIORATION GNTIQUE DES ANIMAUX D'LEVAGE ET DES PLANTES CULTIVES 3.1 Impact et objectifs de l'amlioration gntique COURS 3.2 Bases de gntique pour les animaux et les vgtaux COURS Gntique des populations Gntique quantitative. Valeur additive, hritabilit. Gntique molculaire (lie l'amlioration des espces vivantes) et approches appliques des QTL. TRAVAUX DIRIGS Cartographie gntique. QTL. 3.3 Stratgie d'amlioration gntique des plantes COURS Mthodologies d'amlioration gntique : slection de lignes pures, slection de varits hybrides, hybridation inter spcifique, slection clonale et mthodes non conventionnelles damlioration. Approches spcifiques : adaptation gntique aux stress ; amlioration des porte-greffe, relation portegreffe/greffon et amlioration des varits greffons ; production de lignes, hybrides ou clones et inscription au Catalogue. TRAVAUX DIRIGS TRAVAUX PRATIQUES - VISITES Application des technologies lamlioration des espces : biologie florale et tude des mthodologies de slection des plantes cultives. Programmes d'amlioration gntique : visite du domaine exprimental de Melgueil (dcale en juin). 3.4 Stratgie d'amlioration gntique des animaux COURS Schmas de slection en bovins laitiers Les croisements TRAVAUX DIRIGS Utilisation du bilan gntique en levage bovin laitier 3.5 Biotechnologies et amlioration des espces vivantes

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CONFRENCE RALISE PAR UN INTERVENANT EXTERIEUR IMPLIQU LAMLIORATION GNTIQUE ET/OU SES APPLICATIONS BIOTECHNOLOGIQUES 4 CONTENUS DISCIPLINAIRES DES ENSEIGNEMENTS ET HORAIRES Cours

DANS

TD-TP Visites 2 h

Diversit des organismes Classification et diversit des organismes impliqus Ressources gntiques des micro-organismes

3 h

PROTECTION DES CULTURES Pathologie Vgtale Nuisibilit, dgts, importance conomique des maladies Biologie et cologie des agents pathognes et transmission Rsistance des plantes Epidmiologie, outils d'aide la dcision, prvision des risques, seuils Homologation, mode d'action des fongicides Malherbologie, cologie vgtale Classification et diversit des mauvaises herbes Nuisibilit, dgts, importance conomique des mauvaises herbes Biologie des mauvaises herbes Dynamique des populations de mauvaises herbes Mode d'action des herbicides Zoologie, cologie animale Classification et diversit Nuisibilit, dgts, importance conomique Biologie des arthropodes. Transmission des agents pathognes Dynamique des populations d'arthropodes Homologation, mode d'action des insecticides Risques dus l'utilisation des pesticides Stratgies de lutte Gnie des quipements Application des traitements Optimisation et diminution des risques dus aux traitements

23 h 9h

4 h 2h

4h

10 h

2h

N.B. : Les cours de protection des plantes trouveront des applications et un prolongement naturel dans de nombreux TD et TP de lUE 6 qui suit immdiatement lUE 5.
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GNTIQUE ET AMLIORATION DES PLANTES Analyse de diversit et ressources gntiques Impact de l'amlioration Gntique des populations Gntique molculaire Stratgies d'amlioration gntique des plantes Comparaison de plans de slection propres aux vgtaux Sorties d'illustration Confrence dbat GNTIQUE ET AMLIORATION DES ANIMAUX Gntique quantitative et ressources gntiques Stratgies d'amlioration gntique des animaux Comparaison de plans de slection propres aux animaux

15 h

12 h

9 h

2 h

Horaire total de lUE 5 :

70 h

50 h

20 h

5 RESPONSABLES DE LUE Franoise DOSBA Serge KREITER Coordinateurs tl. : 04.99.61.27.81 tl. : 04.99.61.23.49 ml : dosbaf@supagro.inra.fr ml : kreiter@supagro.inra.fr

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