Centro de Cincias Biolgicas e da Sade Departamento de Fisiologia
Apostila
A qumica dos aminocidos e peptdeos
Professor: Paulo de Tarso Gonalves Leopoldo
So Cristvo, 2008 2 I - Tema Central: Aminocidos e Peptdeos.
II - Durao: 2 horas/aulas
III - Estratgia: Aula Expositiva
IV - Objetivos:
4.1. Geral
O aluno dever identificar as propriedades qumicas dos aminocidos, objetivando a compreenso do estudo dos peptdeos e das protenas.
4.2. Especficos
Ao final desta aula o aluno ser capaz de:
4.2.1 - Conceituar aminocidos e descrever a sua estrutura geral. 4.2.2 - Nomear e representar os aminocidos usando as abreviaturas de uma letra e de trs letras. 4.2.3. - Descrever a estereoqumica dos aminocidos. 4.2.4 - Classificar os aminocidos segundo a polaridade de sua cadeia lateral. 4.2.5 - Classificar aminocidos de acordo com as suas necessidades na alimentao. 4.2.6 - Conceituar aminocidos especiais, exemplificando-os e diferenciando-os dos aminocidos padres. 4.2.7 - Conceituar peptdeos, descrever a sua formao e citar exemplos de ocorrncia biolgica.
V - Contedo Programtico:
5.1. - Introduo. 5.2. - Estrutura geral e nomenclatura dos aminocidos. 5.3. - Estereoqumica dos aminocidos. 5.4. - Classificao dos aminocidos. 5.4.1. - Baseada na polaridade da cadeia lateral. 5.4.2. - Baseada nas suas necessidades na alimentao. 5.5. - Aminocidos especiais. 5.6. - Peptdeos 5.7.1 - Peptdeos de importncia biolgica 3 Captulo 1
A qumica dos aminocidos e peptdeos
1. Introduo:
Os aminocidos apresentam diversas funes biolgicas (figura 1) tais como: - So as unidades estruturais das protenas e peptdeos; - So componentes estruturais dos glicerofosfolipdios, uma das classes de lipdios das membranas biolgicas, como o aminocido serina, grupo polar da fosfatidilserina; - Precursores na sntese de molculas. Os aminocidos so precursores de vrias molculas complexas contendo nitrognio. Exemplos incluem as bases nitrogenadas componentes dos nucleotdeos e cidos nuclicos, o heme (grupo orgnico contendo ferro) e clorofila (pigmento de importncia crtica na fotossntese). - Fonte de grupos metila (-CH 3 ) em reaes de metilao. S- Adenosilmetionina, um derivado da metionina, transfere grupos metilas em reaes de metilao. - So componentes de coenzimas. O aminocido |-alanina que encontrada na coenzima A. - Intermedirios metablicos. Vrios aminocidos atuam como intermedirios metablicos como arginina, citrulina e ornitina componentes do ciclo da uria. A sntese da uria, uma molcula formada no fgado, o principal mecanismo de excreo do excesso de nitrognio proveniente do catabolismo dos aminocidos. - Mensageiros qumicos. Vrios aminocidos ou seus derivados atuam como mensageiros qumicos entre as clulas. Por exemplo, glicina, glutamato, arginina, cido -aminobutrico (GABA, um derivado do glutamato) e triptofano so neurotransmissores, substncias liberadas de uma clula nervosa e que influenciam outras clulas vizinhas (nervosas ou musculares). A tiroxina (um derivado da tirosina produzida pela glndula tireide) e cido indolactico (um derivado do triptofano e encontrado nas plantas) so exemplos de hormnios.
Figura 1. Funes biolgicas dos aminocidos. 4 Todos os 20 aminocidos encontrados nas protenas so o-aminocidos. Eles so formados por um grupo amino, um grupo carboxila, um tomo de hidrognio e um grupo R, radical ou cadeia lateral, ligados a um tomo de carbono. Os aminocidos diferem entre si apenas na natureza do grupo qumico das suas cadeias laterais (figura 2a). Os aminocidos em pH 7,0 so encontrados na forma ionizada, isto , o grupo carboxila com carga negativa e o grupo amino com carga positiva. Essa forma apresenta tanto um grupo cido ( + NH 3 ), como um grupo bsico (COO - ), sendo denominada on dipolar, zwitterion ou on hbrido (figura 1b). Formas que apresentam grupos cidos e bsicos nas suas estruturas so chamadas de anflitos.
Figura 2: a) Estrutura geral dos aminocidos. Esta estrutura comum a todos os o-aminocidos das protenas, exceto um. (a prolina, um aminocido cclico, a exceo). O grupo R, ou cadeia lateral ligada ao carbono o diferente em cada um dos aminocidos b) zwitterion ou on hbrido, forma ionizada do aminocido em pH 7,0 ou ambiente aquoso.
Os aminocidos mais comumente encontrados em protenas so os aminocidos primrios ou padres. Esses aminocidos compreendem um total de 20 unidades. Duas convenes que acarretam na prtica uma certa confuso, so utilizadas para identificar os carbonos de um aminocido. Os carbonos adicionais em um grupo R so designados por |, , o, c, etc., e so assim nomeados a partir do carbono o (figura3). Para a maioria das outras molculas orgnicas, os tomos de carbono so simplesmente numerados a partir de uma extremidade, com maior prioridade para os carbonos com substituintes contendo tomos com os nmeros atmicos mais elevados. Por esta ltima conveno, o grupo carboxila de um aminocido seria C-1 e o carbono o seria C-2. Em alguns casos, tais como nos aminocidos com grupos R heterocclicos, o sistema que utiliza letras gregas ambguo e, por esse motivo, utiliza-se a conveno numrica.
Figura 3. Numerao orgnica dos carbonos dos aminiocidos que utilizam tantos numerais quanto letras gregas. O carbono de todos os aminocidos o carbono 2. O quadro 1 lista os 20 aminocidos padres, acompanhados das abreviaturas de uma e de trs letras. Essas abreviaturas so utilizadas para descrever de forma prtica a seqncia de aminocidos de protenas. A regra seguida na abreviatura de trs letras da maioria dos aminocidos consiste em escrever as trs primeiras letras iniciais do seu nome em ingls. A abreviatura de uma letra usada em textos cientficos quando se quer comparar as seqncias de aminocidos de diversas protenas. Essa abreviatura feita, para a maior parte dos aminocidos, usando a primeira letra do nome do aminocido correspondente. Alguns tm smbolos que no tm nenhuma relao com os seus nomes, como por exemplo, o triptofano e a lisina, que so representados por W e K, respectivamente. Como j existem dois aminocidos representados pelas letras L, leucina e T, treonina, convencionou-se representar a lisina com a letra K e o triptofano com a letra W. b) a) C H H 3 + N COO - R C H H 2 N COOH R 5 Quadro 1: Nome e Abreviatura dos Aminocidos Aminocido Abreviatura de trs letras Abreviatura de uma letra Alanina Ala A Arginina Arg R Asparagina Asn N cido asprtico Asp D cido glutmico Glu E Cistena Cys C Glicina Gly G Glutamina Gln Q Histidina His H Isoleucina Ile I Leucina Leu L Lisina Lys K Metionina Met M Fenilalanina Phe F Prolina Pro P Serina Ser S Tirosina Tyr Y Treonina Thr T Triptofano Trp W Valina Val V
2. Nomenclatura dos aminocidos
Os aminocidos so denominados com nomes comuns de acordo com trs critrios, a saber: 1) a fonte a partir da qual eles foram pela primeira vez obtidos na forma pura, como por exemplo, a tirosina, (tyros, do grego, que significa queijo) nomeada assim por ter sido obtida do queijo. A asparagina, por que foi obtida do aspargo; 2) uma caracterstica qumica do aminocido, como por exemplo a fenilalanina, denominada assim por apresentar um grupo fenil ligado ao aminocido alanina e 3) uma propriedade do aminocido, como por exemplo a glicina, que recebe esse nome, por ter o sabor doce, lembrando os glicdios (acares). A maioria dos aminocidos tem seus nomes terminados com o sufixo ina, como: prolina, glicina, alanina asparagina, etc. Outros tm nomes terminados em ano, como o triptofano e em ico, como o cido asprtico e o cido glutmico. O cido asprtico e o cido glutmico em suas formas ionizadas, em apresentam carga lqida negativa, so nomeados aspartato e glutamato, respectivamente, uma vez que a terminao ato usada para designar os cidos carregados negativamente.
6 3. Estereoqumica dos aminocidos
3.1 Molculas assimtricas e ismeros pticos
Vivemos num mundo em que todas as coisas passam a ser conhecidas por suas formas. Na Qumica no diferente isto pode ser constatado pelo fato das molculas no serem estruturas amorfas, mas ao contrrio, possuem formas definidas. O conhecimento da estrutura tridimensional de uma molcula de importncia fundamental, porque ela determina a sua funo. A estereoqumica a parte da Qumica que estuda o arranjo espacial dos tomos nas molculas. Um carbono que faz ligao com quatro grupos qumicos diferentes denominado carbono assimtrico ou carbono quiral, enquanto o carbono simtrico faz ligao com pelo menos dois grupos qumico iguais. A maioria dos aminocidos tem carbono assimtrico, sendo a glicina a nica exceo, por apresentar um tomo de hidrognio na cadeia lateral (figura 4).
Figura 4. Estruturas dos aminocidos glicina e alanina.
Uma das conseqncias para molculas que apresentam em suas estruturas carbono assimtrico, que elas podem apresentar ismeros pticos, ou esteroismeros. Os esteroismeros so definidos como sendo imagens especulares no superpostas (figura 5). Os estereismeros apresentam as mesmas propriedades qumicas e quase todas as propriedades fsicas, diferindo apenas na maneira como desviam a luz planopolarizada no polarmetro. O ismero ptico que desvia a luz para a direita dextrorrotatrio e o que a desvia para a esquerda levorrotatrio. Neste ponto conveniente lembrar que as letras maisculas D e L antes do nome dos nomes dos aminocidos no se referem ao desvio da luz planopolarizada, mas, configurao absoluta dessas molculas. Para se referir ao desvio da luz planopolarizada so utilizados os smbolos (+), para dextrorrotatrio e (-) para levorrotatrio, escritos aps as letras D e L, seguido do nome do aminocido. Por exemplo, aminocido L (-) serina, apresenta configurao absoluta L e levorrotatrio, enquanto L (+) serina, apresenta configurao absoluta L e dextrorrotatrio.
Glicina Alanina C COOH H H 2 N CH 3 C COOH H H 2 N H (molcula simtrica) (molcula assimtrica) 7
Figura 5 - Ismeros pticos. Os ismeros pticos so imagens especulares no superpostas.
A importncia das molculas serem estruturas assimtricas explicada por duas razes principais: 1. A enorme diversidade de formas percebidas na natureza somente poderia ser possvel com molculas assimtricas. Se as biomolculas fossem simtricas, teramos um mundo pobre em formas, previsvel e montono, enfim, sem a riqueza da diversidade observada na biosfera. 2. As molculas que entram na composio da matria viva, na sua grande maioria, no esto isoladas no ambiente celular, mas interagindo entre si, e essa interao ocorre com o encaixe de uma molcula na outra atravs da complementaridade das suas formas. A forma da molcula determinada por sua estrutura assimtrica. Para John Kendrew, famoso bioqumico ingls, as caractersticas mais notveis das molculas so a sua complexidade e a sua assimetria. A estrutura molecular parece ser quase que totalmente destituda de regularidade, regularidade essa que seria esperada se as molculas fossem estruturas simtricas. Louis Pasteur, bilogo francs escreveu: A vida, como ela se manifesta a ns , uma funo de assimetrias do universo. (...) O Universo assimtrico, pois se todos os corpos em movimento, que constituem o sistema solar, fossem colocados diante de um espelho, sua imagem no poderia ser superposta real. (...) O magnetismo terrestre (...) a oposio entre eletricidade positiva e negativa, so apenas resultantes de aes assimtricas. Posso imaginar que todas as espcies vivas representem, primordialmente, em sua estrutura e em sua formas externas, funes da assimetria csmica.
3.2 Configurao absoluta dos aminocidos
A configurao absoluta a estrutura tridimensional das molculas feitas a partir da configurao dos ismeros D- e L- do gliceraldedo, que so usados como referncia na determinao de configurao das molculas orgnicas. Para se determinar a configurao dos aminocidos, preciso desenhar a sua estrutura utilizando a projeo em perspectiva (figura 6), em que se posiciona o grupo carboxila na parte superior da molcula, na mesma posio do grupo aldedo do gliceraldedo. Se o grupo amino (NH 2 ) estiver para o lado direito, coincidindo com a mesma posio da hidroxila no D- gliceraldedo, diz-se que a configurao do aminocido D, se o grupo amino estiver para a esquerda, coincidindo com a mesma posio da hidroxila no L-gliceraldedo a configurao ser L (figura 6).
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Figura 6. Determinao da configurao absoluta dos aminocidos em relao ao D e L gliceraldedo. Nessas frmulas em perpectiva, os carbonos so alinhados verticalmente, com o tomo quiral no centro. Os carbonos nessas molculas so numerados iniciando-se pelo grupo aldedo (do gliceraldedo) ou a carboxila de uma extremidade (do aminocido alanina). De 1 a 3 de cima para baixo, conforme mostrado. Quando apresentado desta forma, o grupo R do aminocido (neste caso, o grupo metila da alanina) est sempre abaixo do carbono o. Os L-aminocidos so aqueles que apresentam o o-aminogrupo esquerda e os D-aminocidos os que o tem direita.
A maioria dos aminocidos encontrados em protenas apresenta configurao absoluta L, e isto, pode ser, em parte, explicado pela propriedade estereospecfica das enzimas, denominada estereoespecificidade, que as capacitam a reconhecer molculas de acordo com as suas formas, podendo elas distinguirem entre duas molculas bastante semelhantes como os D- e L- aminocidos. As enzimas so as unidades funcionais do metabolismo, catalisando reaes de sntese ou de quebra de molculas na clula. Ento, como a estrutura do stio ativo das enzimas formada por aminocidos assimtricos, ela tem uma informao que faz com que elas somente sintetizem os aminocidos com configurao L. Uma outra explicao para a configurao absoluta dos aminocidos ser da srie L, que, se a formao das estruturas proticas ocorresse com misturas de D e L aminocidos, haveria uma quebra da sua estrutura regular. Um dos princpios gerais observados na organizao das biomolculas de que as suas subunidades apresentam a mesma orientao espacial e de serem complexas e organizadas, portanto, desordem no plano molecular no compatvel com a vida. Os aminocidos com configurao absoluta D no so encontrados em protenas, mas so comuns em certos peptdeos bacterianos, tomando parte da parede celular. Os D-aminocidos so produzidos a partir de modificao enzimtica sofrida pelos L- aminocidos. Os D-aminocidos na parede celular bacteriana conferem a essa estrutura uma resistncia aumentada ao das enzimas hidrolticas, porque esses aminocidos no so substratos das peptidases, enzimas que clivam peptdeos.
4. Classificao dos aminocidos quanto polaridade da cadeia lateral (R)
Os aminocidos so classificados de acordo com a polaridade da sua cadeia lateral em apolares (ou hidrofbicos), polar neutro (ou hidroflico), polar com carga negativa (ou cidos) e polares com carga positiva. A polaridade a capacidade de um grupo qumico se solubilizar em gua por interagir com ela por pontes de hidrognio ou por formao de uma camada de solvatao ou hidratao. Como os aminocidos apolares s apresentam hidrocarboneto em sua cadeia lateral, no so solveis em gua. Os aminocidos polares, por apresentar grupos OH, SH, NH e C=O, so solveis em gua. Os aminocidos polares solubilizam-se na gua, atravs da formao de pontes de hidrognio Os aminocidos bsicos apresentam cargas positivas lquida no pH 7,0, enquanto os aminocidos cidos apresentam carga negativa lquida no pH 7,0, C CHO OH H C CHO H HO C COOH H H 2 N C COOH CH 3 H CH 2 OH NH 2 CH 2 OH CH 3 D-Gliceraldedo D-alanina L-Gliceraldedo L-alanina 9 permitindo a esses aminocidos formarem uma camada de hidratao, quando adicionados gua, portanto, so hidroflicos.
4.1 Aminocidos apolares ou hidrofbicos. Os grupos R nesta classe de aminocidos so apolares ou hidrofbicos (figura 7). So formados em sua maioria por grupos hidrocarbonetos ou por tomos com valores prximos de eletronegatividade. As volumosas cadeias laterais de alanina, valina, leucina e isoleucina, com suas formas caractersticas, so importantes na estabilizao da estrutura das protenas pela promoo de interaes hidrofbicas em seu interior, como tambm em alguns casos causam impedimento estrico, ou seja, impedimento esse devido a proximidade desses grupos qumicos grandes numa cadeia polipeptdica. Valina, leucina e isoleucina so aminocidos de cadeia lateral ramificada.
Figura 7. Aminocidos apolares ou hidrofbicos apresentam em sua cadeia lateral (R) hidrocarbonetos ou tomos com baixo valor de eletronegatividade.
4.2 Aminocidos polares ou polares neutros. Os grupos R destes aminocidos so solveis em gua, ou hidroflicos. Isso se deve aos grupos funcionais de suas cadeias laterais que formam pontes de hidrognio com a gua. Esta classe de aminocidos inclui serina, treonina, cistena, prolina, asparagina, glutamina e glicina. A polaridade da serina e da treonina devida aos seus respectivos grupos hidroxila; a da cistena ao seu grupo sulfidrila e a polaridade da asparagina e da glutamina aos seus grupos amida. A prolina possui uma estrutura cclica distintiva e apenas moderadamente polar. O grupo amino secundrio (imino) dos resduos de Pro mantido numa conformao rgida que leva a uma reduo na flexibilidade estrutural de regies polipeptdicas contendo prolina. Asparagina e glutamina so amidas de dois outros aminocidos tambm encontrados em protenas, aspartato e glutamato, respectivamente, aos quais so facilmente hidrolisadas por cidos ou bases (Figura 8). Glicina o aminocido de estrutura mais simples. Embora seja formalmente apolar, sua cadeia lateral pequena (apresenta um tomo de hidrgnio) no contribui efetivamente para a existncia de interaes hidrofbicas (Figura 8).
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Figura 8. Aminocidos polares. Os aminocidos polares apresentam em sua cadeia lateral grupos qumicos que interagem com a gua por pontes de hidrognio.
4.3 Aminocidos polares bsicos (com carga lquida positiva) e cidos (com carga lquida negativa) no pH 7,0. Os aminocidos nos quais os grupos R tm uma carga positiva lquida em pH 7,0 so aminocidos bsicos, que so lisina, arginina e histidina. Lisina, que tem um segundo grupo amino protonado na posio c (ou carbono 6) da sua cadeia aliftica; arginina, que tem um grupo carregado positivamente, o grupo guanidino; histidina, que contm um grupo imidazol. Histidina o nico aminocido primrio que possui uma cadeia lateral com um pK a prximo da neutralidade. Em muitas reaes catalisadas por enzimas, um resduo de histidina facilita a reao ao servir como um doador ou aceptor de prtons (figura 9). Os aminocidos cidos apresentam grupos R com uma carga lquida negativa em pH 7,0 que so aspartato e glutamato; cada um deles possui na cadeia lateral um segundo grupo carboxila (figura 5C).
Figura 9. Aminocidos cidos e bsicos. Os aminocidos cidos glutamato e aspartato apresentam carga lquida negativa no pH 7,0, enquanto os aminocidos bsicos arginina, histidina e lisina apresentam carga lquida positiva.
11 4.4 Aminocidos aromticos Os aminocidos que apresentam em sua cadeia lateral um grupo fenil so denominados aminocidos aromticos, que so tirosina, triptofano e fenilalanina (figura 10). Os aminocidos fenilalanina, tirosina e triptofano com suas cadeias laterais aromticas so relativamente apolares (hidrofbicos). Todos eles podem participar de interaes hidrofbicas. O grupo hidroxila da tirosina pode formar pontes de hidrognio e por isso atua como um grupo funcional importante na atividade de algumas enzimas. A tirosina e o triptofano so significativamente mais polares do que a fenilalanina devido ao grupo hidroxila da tirosina e o nitrognio do anel indol do triptofano. Triptofano e tirosina promovem a absoro de luz na regio ultravioleta (200 a 300nm) do espectro. Este fato o responsvel pela forte e caracterstica absorbncia da luz pelas protenas no comprimento de onda de 280nm e uma propriedade muito explorada pelos pesquisadores na caracterizao de protenas.
Figura 10. Os aminocidos aromticos fenilalanina, tirosina e triptofano apresentam em sua cadeia lateral o grupo funcional fenil ou anel aromtico.
5. Classificao dos aminocidos quanto as suas necessidades nutricionais
De acordo com as necessidades nutricionais os aminocidos so classificados em essenciais e no essenciais. Os aminocidos essenciais no so sintetizados nas clulas e por isso devem ser obtidos da alimentao, j os aminocidos no essenciais so produzidos pelas clulas. O quadro 2 lista os aminocidos essenciais e no essenciais.
Os aminocidos derivados ou especiais so formados a partir de um dos 20 aminocidos padres ou primrios e so encontrados em certas protenas. Esses aminocidos resultam de modificaes qumicas sofridas por um dos aminocidos primrios aps a sntese da cadeia polipeptdica. Como esses aminocidos derivados no apresentam um cdon para que ocorra sua sntese nos ribossomos, essas modificaes qumicas so denominadas mudanas ps-translacionais ou ps-traduo. Cistina um aminocido derivado encontrado em muitas protenas da matriz extracelular ou que esteja voltada para esse compartimento aquoso, como por exemplo, algumas protenas das membranas biolgicas. Cistina formada a partir da oxidao de duas molculas de cistena (figura 11).
Figura 11. Formao de cistina a partir da oxidao de duas molculas de cistena. Duas cistenas so oxidadas no grupo sulfidrila (SH) formando uma ligao covalente denomida ponte dissulfeto (S-S) resultando na formao de cistina.
O aminocido -carboxiglutmico, cuja funo ligar o clcio, encontrado na protena da coagulao sangnea, a protombina. O aminocido 4-hidroxiprolina, derivado da prolina, e a 5-hidroxilisina, derivado da lisina, so encontrados no colgeno, protena fibrosa, que desempenha uma funo estrutural. 6-N-metilisina, encontrado na miosina, protena da contrao muscular (figura 12). Desmosina e isodesmosina so aminocidos derivados formados a partir da reao de quatro molculas de lisina. A elastina, uma protena de propriedade elstica, rica em desmosina e isodemosina. Esses aminocidos tm importncia fundamental na atividade biolgica dessa protena, pois so eles que conferem a ela elasticidade, uma vez que esses aminocidos interligam cadeias polipeptdicas (figura 12). 13
Figura 12. Estruturas qumicas dos aminocidos derivados ou especiais.
Aproximadamente 300 aminocidos adicionais foram encontrados nas clulas e tm uma grande variedade de funes, mas eles nunca aparecem em protenas. A ornitina e a citrulina (Figura 13) merecem uma nota especial, porque so intermedirias importantes na biossntese da arginina e no ciclo da uria, sendo portanto, metablitos, substncias que atuam numa via metablica.
Figura 13. Estruturas dos aminocidos metablicos (metablitos) ornitina e citrulina, envolvidos na sntese de arginina e no ciclo da uria .
7. Peptdeos
Os peptdeos so cadeias pequenas de aminocidos, que podem ser formados pela reao dos aminocidos, ou pela hidrlise de protenas. O grupo carboxila de um aminocido reage com o grupo amino de um outro aminocido, produzindo uma ligao covalente denominada ligao peptdica (figura 14). Uma unidade de aminocido na cadeia polipeptdica denominado resduo devido perda de uma hidroxila pelo grupo carboxila de um aminocido e a eliminao de um tomo de hidrognio pelo grupo amino.
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Figura 14. Formao de um peptdeo. O grupo carboxila (COOH) de um aminocido reage com um grupo amino (NH 2 ) de outro aminocido, com eliminao de H 2 O, produzindo uma ligao covalente denominada ligao peptdica.
A extremidade de uma cadeia polipeptdica que contm o grupo amino corresponde ao primeiro resduo de aminocido e a que contm o grupo carboxila corresponde ao ltimo resduo de aminocido. Os resduos de aminocidos na cadeia polipeptdica so nomeados por substituio do sufixo ina por il, como serina, que passa a ser denominada seril e glicina de glicil. Aminocidos como tirosina, so nomeados apenas por substituio da letra a por il, portanto, tirosinil. O ltimo aminocido de uma cadeia polipeptdica nomeado sem qualquer alterao no seu nome. O peptdeo Ser-Gly-Ala-Val-Phe-Met-Ala formado por 7 resduos de aminocidos, quais sejam: serina, glicina, valina, fenilalanina, metionina e alanina nomeado serilglicilalanilvalilfenilalanilmetionilalanina. Os peptdeos que apresentam at dez resduos de aminocidos, so nomeados empregando os prefixos di, tri, tetra, penta, hexa, hepta, octa, nona e deca ao nome peptdeo. Por exemplo: o peptdeo formado por dois aminocidos denominado dipeptdeo, por trs, tripeptdeo, por quatro, tetrapeptdeo, por cinco, pentapeptdeo, etc. Para os peptdeos que apresentam mais de dez resduos de aminocidos utilizamos os termos oligopeptdeos ou polipeptdeos. Os oligopeptdeos so cadeias pequenas de aminocidos. Esse termo se aplica a peptdeos com um nmero mximo de 20 resduos de aminocidos. Polipeptdio um termo empregado par se referir a peptdeos com mais de 20 resduos de aminocidos. Esse termo empregado tambm como sinnimo de protena ou de uma cadeia de protena. Alguns autores divergem na diferenciao de peptdeos de protenas. Segundo Lehninger, um polmero de aminocidos considerado uma protena quando apresentar uma cadeia com 100 unidades de aminocidos. Para Devlin uma protena deve conter uma cadeia com um nmero mnimo de 70 aminocidos e para Donald Voet, a partir de 40 aminocidos. Ento, para evitar dvidas ao se nomear peptdeo com mais de dez aminocidos conveniente cham-los simplesmente de peptdeos.
15 Quadro 3: Peptdeos de ocorrncia biolgica
Nmero de unidades de aminocidos Exemplos Funes 2 Carnosina Tamponamento do pH em clulas musculares Anserina Tamponamento do pH em clulas musculares
3 Fator liberador de tireotrofina Hormnio hipotalmico estimula a liberao de tireotrofina, hormnio da hipfise anterior Glutationa Agente antioxidante
9 Ocitocina
Hormnio da hipfise anterior, estimula as contraes uterinas Bradicinina Produzido no plasma ou estmago, um potente vasodilatador 10 Gramicidina S
Antibitico Amanitina Veneno de fungo
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Glucagon Secretado pelas clulas o do pncreas, tendo a funo de elevar os nveis de glicose no sangue 39 Corticotrofina Hormnio da hipfise anterior, estimula o crtex adrenal
O aspartame um dipeptdeo formado por fenilalanina e aspartato. O aspartame um adoante de baixa caloria, obtido por processos industrializados, bastante utilizado em dietas de emagrecimento. Metionina-encefalina e a leucina-encefalina pertencem a classe dos peptdeos opiceos, encontrados predominantemente nas clulas do tecido nervoso. Os pentapeptdeos leucina-encefalina e metionina-encefalina diferem entre si somente pelos resduos de aminocidos dos Cterminais. So pentapeptdeos que atenuam a dor e produzem sensaes agradveis. A substncia P e a bradicinina so nonapeptdeos liberados em processos inflamatrios estimulando a percepo de dor, dessa forma apresentando efeitos opostos aos peptdeos opiceos (figura 15).
a) Tyr-Gly-Gly-Phe-Met b) Tyr-Gly-Gly-Phe-Leu
Figura 15. Alguns peptdeos de ocorrncia biolgica. a) Metionina encefalina b) leucina encefalina
16 8 Referncias bibliogrficas:
01. CRICK, F. Vida, o mistrio da sua origem. 1 a edio, Editora Gradiva, 193p, 1988 02. HORTON, H.ROBERT, MORAN, LAURENCE. A., OCHS, RAYMOND. S., RAWN, J.DAVID,SCRIMGEOUR, K. GRAY. Fundamentos de Bioqumica, Editora Prentice-Hall do Brasil.
03. LEHNINGER, A. Princpios de Bioqumica. 4 a edio, Editora Sarvier, 1986.
04.. LEHNINGER, A. Princpios de Bioqumica. 3 a edio, Editora Sarvier, 1995.
1. O que so aminocidos? 2. Defina aminocidos padres ou primrios. 3. Explique o significado das letras D- e L- antes dos nomes de aminocidos seguidas dos sinais (+) e (-). 4. Como definida a configurao absoluta de uma molcula? 5. O que so ismeros pticos ou estereoismeros? 6 Qual a condio para que uma molcula apresente ismeros pticos? 7. Pode a glicina apresentar ismeros pticos e configurao absoluta L? 8. Por que todos os aminocidos encontrados em protenas tm configurao (L-)? 9. Em que estruturas so encontrados aminocidos com configurao D na natureza? Qual a funo biolgica desses aminocidos? 10. Como so classificados os aminocidos de acordo com sua polaridade? 11. O que so aminocidos essenciais e no-essenciais? Exemplifique-os. 12.O que so aminocidos especiais? 13. O que so aminocidos neurotransmissores? Exemplifique-os 14. O que so peptdeos? 15. Como podem ser formados os peptdeos e como eles so denominados? 16. Diferencie peptdeos de protenas? 17. Exemplifique alguns peptdeos de ocorrncia biolgica.