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ARN historia 1. 2. 3.

1965 Robert Holley descubre el ARNt la molcula faltante de Crick 1968 Francis Crick y Leslie Orgel propusieron al ARN como la primera molcula informativa 1986 Thomas Cech y Sidney Altman descubrieron el ARN catalitico (self-splicing) primera evidencia slida de primera molcula informativa 1993 el laboratorio de Harry Noller evidencio la participacin del ARNr en la sntesis de protenas ARN tipos ARNm-> mol mas grandes.2% ARNt-> mol pequeas.16% ARNr->diversas clases de arn r --- mas predomina.82% procariote.subunidades 30 s y 50s de sediemntacion Eucarionte mas pesada 60s y 40s (mayor) Difernecia de los mensajeros en los procariontes cuando se sintettitza se genera una hebra de rnra que puee tener varias unidades geneticas (cistron) en el procarionte es policistronico . Eucariote son monocistronicos un solo segemento que codifica a una proteina ,gen que tiene unidades regulatorias cola poli-a en prima 3 en 5 prima adicion de metil guanina. Rnat_> tiene forma d etrebol en el extremo 3 prima se coloca el aminoacido..> se denomina brazo adaptador el brazo D contiene dihidrourina. 3 prima va mantener Region constante ccaai es donde se coloca el aminoacido ,en procariotes ya aparece en eucariotes aparece desdepues que se sintetiza con trna . .. se coloca aminoaciado es un trabajo enzimatico grupo de enzimas va a producir catalisis va a provacar la union ccaaminoaciodes.. se realiza por la aminoazil.. Trna si El Brazo TC tallo de 5 bp apareadas que contiene la secuencia TC donde es una pseudouridina. Catalisis se va a relaizar por aminoacil-trna sintetasas ---esta liugando un aa al trna tenemos 20 aa por tanto tenemos 20 trna como minim. Se separan dos grupos de enzimas. Tipos de tRNA-sintetasas Existen dos tipos de Aminoacil tRNA sintetasas clasificadas en la forma inicial de la unin del aminoacido a la adenina del CCA terminal del tRNA: CLASE I. Aminoacila inicialmente el 2 OH de la adenina, luego por una transesterificacion esta unin se traslada al 3 OH. Comprende las sintetasas para los tRNA de los aminoacidos: Leu,Ile,Val,Cys,Met,Glu,Gln,Arg,Tyr,Trp. CLASE II. Aminoacila el 3 OH de la adenina. Comprende las sintetasas para los tRNA de los aminoacidos: His,Pro,Ser,Thr,Asp,Asn,Lys,Gly,Ala,Phe

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22. La aminoacil tRNA sintetasa une una adenosina monofosfato AMP, al grupo COOH para crear un aminoacil adenilato intermediario. 23. Luego el apropiado tRNA desplaza el AMP. 24. 25. La aminoacil tRNA sintetasa puede realizar el proceso de relectura o proofreading valiendose de los determinantes de identidad del tRNA 26. Transcripcin 27. La informacin gentica almacenada en el DNA es transcrita a una copia de RNA complementario a una de las hebras del DNA 28. La hebra de ADN que ha servido como molde se denomina hebra antisentido y la otra hebra de ADN es denominada hebra codante o con sentido y la secuencia es identica a la del RNA sintetizado ( Excepto en las posicion de T que son cambiadas por U) 29. El transcripto puede ser : 30. RNA mensajero o mRNA; 31. RNA ribosomal o rRNA; 32. RNA de transferencia o tRNA 33. La trancripcion s einicia en el promotor. Todo gen tiene su promotor. Promotor tiene secuencias concesosmas conocido caja tataat.5-8 pares de bases del sitio de inicio .se encuentra en la posicion menos 10, factores de transcripcion deben unirse al promotor estos son como parte del adn polimeras echeriche coli..sub unidad sigma (parte del arn plomerasa) que es un factor de iniciacion reconocera ESTA secuencia de inicio. Punto clave del inicio de la transcripcion. Esto es lo que conlleva a la union de la arn polimerasa ..formado por 2 subnidades alfa y beta rodean a alamolecula de arna , es importante que factor sigma se una para que la enzima se active-> se activa la encima se abre la hebra de dna . 34. La subunidad sigma de la RNA polimerasa es un Factor de iniciacin que es especifico para la transcripcion de diferentes grupos de genes en E. coli 35. Factor sigma mantiene estable la unin de la RNA polimerasa 36. al promotor en el DNA 37. Factor sigma activa el proceso , Primeros nucleotidos que se colocan son la A G , cuando se unen los nucleotidos el factor sigma es liberadola sintesis se inicia en ese momento y solo una de las hebras se transcribe 38. la direccion del enrollamiento va proceder en sentido positiva hacia donde va y sentido negativo en contra. 39. Terminacion de la transcripcin 2 formas 40. Terminacin de la transcripcin Rho independiente 41. contiene una secuencia que induce a la formacin de una horquilla en el transcrito de RNA de 10 a 15 nucletidos antes del final, seguida por un

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tramo de poliA en la cadena molde que facilita la disociacin de los elementos de la transcripcin. En la terminacin dependiente de r no se presenta el tramo de poliA, aunque s se forma una horquilla en la que la RNA polimerasa hace una pausa y si se encuentra la protena r presente se detiene la transcripcin. Transcripcin en eucariotes RNA polimerasa I transcribe la mayoria de los genes de rRNA RNA polimerasa II transcribe todos los genes que codifican proteinas y algunos RNA pequeos nucleares RNA polimerasa III transcribe los genes de tRNA y genes de 5S rRNA y RNA pequeos nucleares TF2B-ELEMENTO DE RECONOCIMIENTO DEL complejo de transripcion FACTOR PROMOTOR.. ACTUA DE MANERA SIMILAR AL FACTOR SIGMA, COMPLEJO PARA ACTIVARSE REQUIERE DE UNA FOSFORILACION.. Cola poli A proceso post-trancripcionales Se adicina metil 7 guanina pero ya no tiene el grupo fosfato en 5 molecula rara que no puede ser reconocida por la exonucleasa. TRADUCCION FASES: Activacion de aa ,iniciacin, elongacin,terminacin y liberacin, plegamiento de protena y procesos post trasduccionales. El inicio de la traduccion involucra el apareamiento del mRNA y el rRNA Shine-Delgarno (SD) es una secuencia que se presenta en muchos transcriptos de procariotes que consta de 3-9 bases del mRNA los que se complementan con el 3terminal del 16S rRNA En transcriptos mRNA de eucariotes la secuencia que facilita la union inicial del mRNA a la subunidad pequea ribosomal es la secuencia Kozak ACCATGG o (GCC)RCCATGG La subunidad menor inicia la busqueda del sitio de iniciacion: En Procariotes IF1 previene el enlace prematuro del aatRNA al sitio A IF2 facilita la unin del formilmetionina a la posicin P de la subunidad menor ribosomal IF3 previene el enlace prematuro de la subunidad mayor Posicion A unica posicion donde se une codan cona nticodon primaro. PARA EL CODON STOP NO EXISTE AMINOACIDO NI TRNA LO QUE HAY ES EL FACTOR R -> SEPARA EL COMPLEJO. Y AH TERMINA TRANSCRIPCION Antibiticos , TETRACICLINA BLOQUEA SITIO A--clorofrnicol bloquea el sitio P cicloheximidina bloquea peptil trnasferasa En Eucariotes los procesos de transcripcion y traduccin ocurren en diversos compartimientos Se transcribe solo regiones reguladoras de 3 a 5

65. El Codigo es un triplete. Un codon son 3 nucleotidos consecutivos de mRNA especifico para 1 aminoacido. 66. Presenta un codon de inicio y otro de termino. ATG para Met como codon de inicio. TAA, TAG, y TGA como codones stop de la traduccion del polipeptido. 67. El cdigo es degenerado. Muchos aminocidos tiene mas de un codon a excepcin de Met y Trp. 68. Degeneracion de la tercera base y Y la hipotesis del bamboleo 69. El apareamiento codon-anticodon es crucial en la lectura del codigo genetico el apareamiento de bases es antiparalelo 70. La hipotesis de Crick esta referida a la tercera posicion del codon, o primera posicion del anticodon (posicion de bamboleo) 71. En la tercera posicion del codon pueden ocurrir apareamientos no canonicos, ocurre el bamboleo o alternacion del nucleotido sin alterar la secuencia del polipeptido 72. Ventaja del bamboleo: disociacin del tRNA del mRNA mas rapida 73. El codigo esta escrito en el sentido 5 a 3 del mRNA 74. El codigo no se sobrelapa cada nucleotido es leido una sola vez, de manera continua en un MARCO DE LECTURA (ORF) 75. El codigo esta escrito en el sentido 5 a 3 del mRNA 76. El codigo no se sobrelapa cada nucleotido es leido una sola vez, de manera continua en un MARCO DE LECTURA (ORF) 77. Marco de lectura ORF 78. Esta determinado por el codon de inicio AUG 79. siempre el triplete siguiente es ledo como un codon hasta el stop 80. Inicio de un marco de lectura in procariotes and eucariotes 81. Puede ocurrir en codones internos AUG en mRNA procariote 82. En eucariotes solo puede ocurrir en el primer codon AUG 83. El operon lac en E. coli se transcribe como un mRNA policistronico 84. con multiple codones AUG 85. TIPOS DE MUTACIONES GNICAS 86. En la protena 87. Mutaciones conservativas 88. Mutacin silenciosa:Tripletes que codifican para el mismo aminocido: AAG(arg)CGG(arg) 89. Mutacin con sentido o neutra:Tripletes que codifican para aminocidos equivalentes distintos. AAA(lys)AGA(arg). Ambos son aminocidos bsicos 90. Mutaciones no conservativas 91. Mutacin cambio de sentido: aparece un nuevo triplete que codifica para un aminocido de

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distinto tipo. La protena pierde su funcin si afecta su sitio catalitico Mutacin sin sentido: Aparece un triplete de terminacin o stop: CAG(gln)UAG(stop) Mutacin con cambio de marco de lectura inserciones y deleciones cambian el marco de lectura y la posicin del codon stop) Regulacin de la Expresin gnica En un organismo multicelular, las clulas se diferencian por el tipo de protenas que sintetizan a pesar de contener el mismo DNA Una clula puede cambiar la expresin de sus genes en respuesta a un estimulo externo La expresin de los genes puede ser regulada en muchos pasos en la va de DNA a RNA a protena. Regulacin de la actividad proteica Alosterismo Modificacin covalente Regulacion negativa siempre acompaada de un gen represor. Promotor es bloqueado por el represor Regulacion positiva :Promotor facilitado por el represor para unirse ala polimerasa. Operan lac tiene 3 proteinas importantes Operon esta siempre apagado -> por eso esta reprimido se activa cuando no hay glucosa en el medio. Se activa cuando encuentra lactosa. Control positivo: Protena activadora de catabolitos Glucosa es el principal suministro de carbono para E coli La glucosa causa represin de otros operones que catalizan el metabolismo para otras fuentes de carbono como operon lac En la ausencia de glucosa, los operones necesarios para el metabolismo de otras fuentes de carbono es inducida. Es mediada por cAMP y CAP Organizacin del operon trp de E coli El operon trp es regulado en parte por un aporepresor El operon trp es tambin regulado por atenuacin Trp regulado por un atenuador ,el atenuador , la posicion 1,4 esx importante para que se forme la union atenuadora. [trp] determina la [trp-trNA] La [trp] determina la traduccin ribosomal adicionando triptofano al peptido Leader o peptido seal Si el trp es adicionado : El ribosoma se desplaza hasta el codon stop El atenuador es una estructura secundaria que causa la terminacin de la transcripcin (OFF) Si el trp no es adicionado Se forma una diferente estructura en el RNA leader Permitiendo la transcripcin de los genes estructurales

26. La actividad del ribosoma determina la estructura secundaria del RNA lider de trp 27. Alta concentracin de triptfano, provoca la terminacin de la transcripcin 28. Baja concentracin de triptfano, mantiene la transcripcin 29. Muchos operones de biosintesis son regulados por atenuacin. 30. Operones de sintesis de aminoacidos: His, phe, leu, thr 31. En cada caso un corto RNA leader y un polipeptido preceden a los genes estructurales. El peptido leader es rico en el aminocido producto de la via de sintesis 32. Estados de los genes de eucariotes: 33. Inactivo: 34. Cromatina inaccesible o condensada 35. Cromatina accesible, pero con presencia de protenas represoras o falta de activadores de la iniciacin 36. Cromatina accesible, la transcripcin se ha iniciado pero la polimerasa no puede elongar el transcripto 37. Activo: 38. Cromatina accesible, transcripcin basal, requiere secuencia promotor TATA 39. Cromatina accesible, transcripcin activada, requiere enhancer o activador hebra arriba (posicin anterior a la posicin de inicio de la transcripcin: upstream de transcripcin. 40. Enhancers->(Enhancer segmento que colabora con el reconocimiento del promotor. ) 41. Causan el incremento de la expresin del gen 42. Actuan independiente de la posicin y la orientacin con respecto al gen 43. Pueden actuar: Incrementando el porcentaje de iniciacin en el promotor 44. Los enhancer se presentan en una variedad de posiciones respecto a los genes 45. Silenciadores ->Secuencias que causan la disminucin de la expresin del gen 46. Similar al enhancer pero con efecto opuesto sobre la expresin del gen 47. Represin del gen estructura de cromatina inactiva (heterocromatina)

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