Techniques de Laboratoire : la Palynologie 1re partie

Notes des cours de Emilie Gauthier et Herv Richard

I. La reconstitution de lenvironnement vgtal De quand datent les paysages qui nous sont familiers ? Comment peut-on connatre, suivre, tudier lhistoire et lvolution du couvert vgtal ?

I.1. Les mthodes historiques - Les sources crites sont trs rares avant la priode mdivale, elles manquent de crdibilit et dexactitude sur le point prcis de la vgtation (exemple de la confusion entre sapin, pica et pin dans la Vie des Pres du Jura). - La toponymie et la microtoponymie : beaucoup de toponymes sont mdivaux (cerneux, chenevire), dautres sont impossibles dater avec prcision, dautres enfin peuvent avoir plusieurs interprtations (exp : les toponymes proches de bouleau (boulaie) signifient-ils qu cet endroit existait une fort domine par des bouleaux o quau milieu dune prairie subsistait un magnifique bouleau ?). - Les structures archologiques : cadastres anciens, traces dhabitats, de fosss, talus, haies, murgers

I.2. Les sciences naturelles - La vgtation potentielle (vgtation devant existe un endroit en fonction des contraintes du milieu : sol, climat) - La dendrologie (tude des cernes de croissance des arbres) - Lanthracologie et xylologie (tude des charbons de bois et des restes de bois) - Les macro-restes vgtaux et palosemences - La palynologie

I.3. Rappel sur la notion dcosystme Il est important, pour comprendre ces disciplines paloenvironnementales et les renseignements quelles peuvent apporter, de percevoir toute la complexit du fonctionnent les cosystmes actuels.

I.3.a. Dfinition dun cosystme partir dun exemple Exemple : une chnaie de la valle de lYonne. Dans cette fort se trouve un ensemble Climat dtres vivants (plantes et animaux) qui constituent la biocnose (ensemble de la faune et de la flore). Lvolution de cette Sol Biocnose (faune + flore) biocnose dpend des paramtres climatiques (tempratures, prcipitations, ensoleil-

lement) et daphiques (qualit et volution des sols) constituant lenvironnement physique de cette biocnose. Un cosystme lie une biocnose son environnement physique : le tout fonctionne en quilibre.

I.3.b. Le milieu physique - Le climat peut sanalyser plusieurs chelles spatiales : - le climat rgional (exp : climat breton, climat de la plaine dAlsace) - le climat local ou msoclimat (appel tort microclimat) : climat dune valle, dun versant, dune fort - le microclimat : les abords dune source, le creux dun rocher, etc. Ces diffrentes chelles peuvent semboter les unes dans les autres. Exp : la chnaie de lYonne est soumise des conditions climatiques prcises : temprature moyenne annuelle, tempratures moyennes du mois le plus froid et du mois le plus chaud, prcipitations annuelles, rpartition de ces prcipitations sur lanne, ensoleillement au coeur de cette chnaie existent des zones plus abrites, au pied dune falaise par exemple, des sources, des rochers qui sont autant dcosystmes. Ces paramtres climatiques globaux ou plus locaux sont dterminants sur la composition de la flore et la faune. De nombreuses espces sont trs exigeantes en termes de prcipitations, de 2

tempratures, densoleillement (exemple pour la vgtation : le sapin (Abies alba) prfre les zones recevant au moins 1000 mm. deau par an et descend donc difficilement en-dessous dune certaine altitude ; le noyer (Juglans regia) ne supporte pas les geles de printemps ce qui limite son dveloppement en altitude ; le mlze (Larix decidua) a besoin dau moins 2600 h. de soleil par an quil trouve le plus souvent au-dessus dune certaine altitude en montagne).

Le sol Il faut distinguer le support gologique (roche-mre, bed-rock) du sol proprement dit. Les formations gologiques constituant ce support sont classes en fonction de leur ge et de leurs proprits physico-chimiques. Ces proprits ont une influence directe sur la flore. Certaines plantes sont calcicoles (par exemple le charme, Carpinus betulus) parce quelles prfrent les sols calcaires, dautres sont calcifuges (chtaignier, Castanea sativa ; digitale pourpre, Digitalis purpurea) prfrant les sols siliceux, plus acides. Le sol volue trs lentement sous laction du climat et de la vgtation. On dsigne par le terme humus les couches contenant de la matire organique provenant de la dcomposition avance des vgtaux (notamment des feuilles). La dcomposition plus ou moins rapide de ces litires permet de distinguer trois types dhumus : mor (dcomposition lente, sols noirs), moder (intermdiaire), mull (dcomposition trs rapide).

I.3.c. Le milieu vivant * phytocnose (ensemble des plantes) La monospcificit recherche aujourdhui par les forestiers na jamais t une ralit ( quelques rares exceptions) dans lhistoire des forts. Les essences forestires principales des forts dEurope de louest sont : - en plaine : les chnes (principalement pdoncul et sessile,rouvre) et le htre (le pin martime dans les Landes) ; - en moyenne montagne et montagne : lpica, le sapin, le htre, le pin sylvestre, le mlze ; ces essences principales sassocient des essences secondaires : charme, tilleuls, rables, ormes, chtaignier, frnes, merisier, alisiers, sorbiers, aulne, saules (le pluriel ou le singulier utilis dans cette numration est importante, il souligne si ces genres sont reprsents par une ou plusieurs espces) ... En milieu mditerranen se rencontrent des forts de chne pubescent, chne vert, chne lige, de pin dAlep et de trs nombreux arbustes.

A cette strate arborescente sassocient des lianes (clmatite, lierre), mais aussi du gui, des lichens, des mousses Les arbustes principaux sont : le noisetier, le houx, la viorne, le cornouiller, buis, genvrier La strate infrieure des forts est constitue dune multitude de plantes herbaces, de fougres, de ronces, mousses, champignons * La zoocnose (voir cours spcialis pour les dtails) Grands mammifres (cerf, sanglier, chevreuil) ; petits mammifres (rongeurs : livre, mulot ; insectivores : hrisson, taupe ; carnivores : renard, blaireau) ; les oiseaux ; les reptiles et batraciens ; les insectes

I.3.d. Des chelles diffrentes Un cosystme peut tre considr des chelles trs diverses. La fort de chne de lYonne fait partie dun cosystme plus vaste, celui des chnaies du Bassin parisien, qui fait lui-mme partie des forts de feuillus dEurope tempre, qui la limite extrme du raisonnement font partie de la biosphre. Inversement, lintrieur de cette fort, une valle plus humide, un plateau plus sec, une petite source, une vieille souche darbre constituent dautres cosystmes. Toute la difficult, lorsque lon veut reconstituer lhistoire de la vgtation partir de donnes fossiles, est de savoir quelle chelle se situent les donnes recueillies. Linterprtation de comptages de charbons de bois ou de pollen est donc trs complexe, et cela devient encore plus difficile interprter partir du moment o lhomme intervient sur la dynamique naturelle du couvert vgtal.

I.4. Agrosystme

I.4.a. Dfinition Lintervention de lhomme, et plus particulirement larrive de lagriculture, rompt lquilibre des cosystmes. Climat Agriculture On passe dun cosystme un agrosystme, mais ce nouvel quilibre est difficile Sol Biocnose (Faune + flore) prserver. des La grande premiers

difficult

agriculteurs sera maintenir cet quilibre. Les dfrichements se font par le feu et le btail, et jusqu lge du Fer il ny a pas (ou peu) dengrais (naturels) pour compenser lpuisement des sols. Les semis se font entre les souches brles et, annes aprs annes, les plantes messicoles prolifrent ; il faut donc changer de place et le cycle recommence.

I.4.b. Les rapports de lhomme avec la vgtation Lhomme au cours du temps, sest trouv confront trois types de forts : la fort vierge, la fort naturelle, la fort cultive/pature. Linfluence quil a exerce sur le milieu forestier varie en fonction des poques et des moyens techniques dont il dispose. Linfluence peut tre directe ou indirecte (couper un arbre ou une fort/pluie acide-transformation

des sols) lgre ou profonde (impact nolithique/impact mdival) rversible ou irrversible (nolithique/mdivale).

II. Le pollen II.1. Rappel sur le rle biologique du pollen

De Mai Juin, il peut y avoir jusqu 500 1000 grains de pollen par m3 dair. Le pollen provient des tamines des plantes fleur. Les grains de pollen se dposent sur le pistil afin que les quils puissent lovule Une fleur

spermatozodes contiennent fconder (figure).

naccepte pas les grains

de pollen des autres espces, ni, en gnral, les siens propres. Les grains de pollen vivent entre 2 jours et une semaine. Les grains qui nont pas atteint leur but se dposent sur le sol o ils disparaissent, ils perdent leur contenu biologique ; seule la paroi pollinique, si les conditions le permettent, peut se conserver. La dure de vie dun grain de pollen varie en fonction des conditions dhumidit, du taux de dshydratation du cytoplasme, des rayonnements UV, du taux et de la virulance des micro-organismes prsents dans le milieu de dpt. Cette dure de vie varie entre un jour chez les gramines et une centaine de jours chez les rosaces (la dure moyenne se situant autour dune semaine).

II.2. Les diffrents types de pollen La reconnaissance des grains de pollen est fonde sur quatre critres : La forme : sphre plus ou moins aplatie, isol ou en ttrade.

La taille : entre 2.5 et 200 m, la plupart se situant entre 30 et 40 m.

Les apertures : zones plus fragiles permettant la sortie du tube pollinique ; rondes lorsquil sagit de pores ou allonges lorsquil sagit de sillons. Le nombre dapertures varie selon les espces. Un vocabulaire spcifique permet de dcrire le nombre et la rpartition de ces apertures. Par exemple, un grain de pollen qui a trois sillons est dit tricolp (1), avec trois pores il est tripor (2), avec trois sillons et trois pores (3), il est tricolpor.

- La structure de la paroi : lisse, verruque (7-8), strie (6-9), rticule (5)

7. Centaure Tilleul 6. Rosaceae 4. Pollen de Pin Reine-des-Prs petits grains de pollen) 9. Erable

5. Pollen de trfle 8. Plantain

Une collection de rfrence, des cls de dtermination et des ouvrages de photos de pollen sont utiliss pour la dtermination pollinique.

II.3. Les relations entre la pluie pollinique et la vgtation Pour comprendre les pluies polliniques passes, il est ncessaire de connatre la pluie pollinique actuelle. Cette connaissance permet de rsoudre certains problmes dinterprtation (comment la vgtation est enregistre selon les milieux, quelle distance parcourt le pollen, quelles sont les plantes qui pollinisent beaucoup et celles qui pollinisent peu, etc).

II.3.a. Les capteurs artificiels placs en hauteur Ces capteurs dont laspiration est rgle sur celle de la respiration humaine moyenne (2 litre/mn) sont essentiellement utiliss dans le cadre dtudes sur lallergologie : on peut mettre en parallle les crises dallergie et la pollinisation des taxons au cours de lanne. Le pollen analys est frais, il a conserv son contenu biologique.

II.3.b. Les capteurs placs au niveau du sol La collecte dchantillons se fait sur une transect (figure) de surface (sur une ligne droite traversant diffrents types de vgtation). Il existe deux types de prlvements :

- les trappes artificielles : un bocal contenant un produit retenant le pollen (efficacit mdiocre). - les chantillons bryophytiques : lanalyse de touffes de mousse a de nombreux avantages, elles sont gnralement prsentes dans tous les types de milieu et leur environnement un peu acide et souvent humide assure une bonne et abondante conservation des grains de pollen. Ces mousses ne craignent pas le desschement et peuvent tre trait selon les mthodes classiques de la palynologie. Un chantillon de mousse peut rsumer une dizaine dannes de pluie pollinique.

Exemple de transect traversant diffrents types de vgtation, les points rouges correspondent aux prlvements de touffes de mousse.

II.3.c. Les apports de ltude de la pluie pollinique actuelle Ltude de la pluie pollinique actuelle permet de comprendre la rpartition de la pluie pollinique sur une rgion (exemple du diagramme pollinique de Heim (1970), daprs un transect de surface). Elle permet galement dvaluer la distance parcourue par ces grains de pollen et la reprsentation moyenne des vgtaux. - 60 % des grains de pollen proviennent de la vgtation locale (situ entre 0 20 m du point de prlvement) ; - 30 % provient dun apport du voisinage (20 m 500 m) - 10 % vient de lapport rgional (500 m 10 km) - 1 % enfin constitue lapport lointain (+ de 10 km)

Des tudes rcentes (voir F. Mazier notamment, programme Pollandcal) essaient de proposer des reconstitutions quantitatives des paysages anciens se fondant sur des tudes trs complexes de la pluie pollinique partir danalogues actuels.

III. Lanalyse pollinique Lanalyse pollinique repose sur deux qualits du grain de pollen : la spcificit et la rsistance de lenveloppe pollinique. - La spcificit : chaque espce produit un grain de pollen morphologiquement diffrent des autres espces. Lobservation dun grain de pollen permet donc de dterminer la plante qui la produit. - La sporopollnine : cest le constituant essentiel de la paroi pollinique, lexine. Cette sporopollnine se rapproche de la chitine qui constitue la carapace des insectes. La paroi pollinique est donc trs rsistante, surtout en milieu anarobie.

III.1. Les limites de la mthode La quantit de pollen mise par chaque espce, les moyens de dispersion et les distances parcourues jouent un rle essentiel dans la composition et la reprsentation de la pluie pollinique retrouve dans un chantillon.

III.1.a. La production pollinique Cette production varie selon les espces. Quelques exemples : - un chaton de noisetier produit 3 000 000 de grains/jour - une inflorescence doseille : 400 000 000 de grains/jour - une tamine de mas : 3000 grains de pollen (les crales sont parmi les plus faibles producteurs).

III.1.b. La dispersion pollinique Chaque espce produit donc une quantit de pollen diffrente ; les moyens de dispersion varient galement. - Dispersion par le vent : anmogamie (la plupart des arbres et quelques herbaces comme les Poaces ou les Cyperaces). Pour compenser ce mode de pollinisation alatoire, les espces anmogames produisent une grande quantit de pollen.

- Dispersion par les insectes : entomogamie (quelques arbres et la plupart des herbaces). Les plantes produisent alors beaucoup moins de pollen. - Dispersion par leau : hydrogamie (la plupart des plantes aquatiques). La distance parcourue par les grains de pollen va donc de quelques centimtres plusieurs centaines de kilomtres (dans le cas du pin par exemple).

III.2. Trois hypothses Ltude du contenu pollinique dune carotte sdimentaire devrait permettre de se faire une ide sur lvolution diachronique de la vgtation environnant un site : ceci repose sur trois hypothses (daprs Reille, 1990).

III.2.a. La pluie pollinique reprsente fidlement la vgtation Lanalyse et linterprtation des pluies polliniques passes ncessitent une parfaite connaissance de la pluie pollinique actuelle et de ces relations avec la vgtation (voir II.3).

III.2.b. Le dpt et la conservation ne modifient en rien limage de la pluie pollinique Les grains de pollen et les spores sont rsistants mais sensibles loxydation. Il ne se conserve donc pas de manire identique dans tous les sdiments. Seuls les sdiments organiques (tourbires, lacs, lagunes ctires, palochenaux..) constituent des bons milieux de conservation. Dune manire gnrale on peut considrer que les sdiments de couleur fonce (noir, marron) gris bleu contiennent du pollen. Ds quune couleur jaune ou ocre apparat, ou des marbrures de cette mme couleur, les sdiments sont gnralement striles ou trs pauvres en pollen. La prsence de rsidus vgtaux ou de micro-charbons nassure pas la prsence de pollen.

- Quels problmes peut-on rencontrer sur les sites archologiques terrestres ou en grotte ? - Les sdiments secs, sableux, ars comme ceux quon peut trouver dans une grotte sont peu propices une bonne conservation. Il a galement trs souvent des problmes de percolation de grains de pollen rcents dans des niveaux plus anciens. - Dans ce mme type de sdiments et dune manire gnrale dans presque tous les sdiments archologiques, on constate souvent des problmes de conservation diffrentielle. Certains grains rsistent mieux que dautres aux diffrents effets corrosifs. Les grains de pollen de la 10

famille des composes notamment, et plus particulirement les Anthemideae (type pquerette) et les Cichorieae (type pissenlit) sont particulirement rsistants et peuvent apparatre en concentration importante.

Grain de pollen de pissenlit (MEB) droite et grossissement de sa paroi, gauche, photo Renault-Miskovsky-Petzold, 1989

Exemple dune analyse pollinique posant problme : cette analyse a t ralise partir dun prlvement dans un trou de poteau de maison nolithique ; voici le spectre observ
Nombre de grains de pollen Pourcentages Taxons compt Pinus (pin) 1 0,43 Alnus (aulne) 2 0,86 Betula (bouleau) 4 1,72 Corylus (noisetier) 5 2,15 Tilia (tilleul) 2 0,86 Hedera (lierre) 1 0,43 AP (total pollen 15 6,43 d'arbre) NAP (total pollen 218 93,56 d'herbaces) Poaceae 15 6,44 (gramines) Cerealia 5 2,15 Composes 181 77,68 Cichorieae 180 77,25 Anthemideae 1 0,43 Chenopodiaceae 6 2,58 Brassicaceae 4 1,72 Fabaceae 1 0,43 Apiaceae 1 0,43 Plantes d'eau (Potamo et Typha) 5 2,15 Fougres 31 11,74 Monoltes 27 10,23 Triltes 4 1,51 Total pollen 264

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Dans cette analyse pollinique 264 grains de pollen et spores ont t compts ; ce nest pas norme mais statistiquement acceptable. Pourtant, on remarque quil y a trs peu de pollen darbres (AP), pas plus de 6.43 % ; les herbaces sont donc largement dominants. Nous somme donc apparemment dans un milieu trs ouvert, les nolithiques de cette rgion auraient dfrich avec succs des superficies plus que consquentes, un vritable paysage dopenfield aurait alors t cr. Mais si on regarde dun peu plus prs la composition du spectre herbace, on saperoit quil a plus de 77 % de Cichorieae. Nous serions donc dans un openfield couvert de pissenlits ?! En fait, les grains de pollen de Cichorieae, trs rsistants la corrosion, se sont mieux conservs que les autres types polliniques et se retrouvent alors surreprsents par rapport aux autres, moins rsistants. Cette analyse nest absolument pas utilisable, on ne peut en tirer aucune conclusion ( lexception de la prsence locale de certaines plantes), sinon quil y a un grave problme de conservation diffrentielle dans ces sdiments.

- Et dans les sites archologiques situs en milieux humides ? Les sites archologiques lacustres constituent a priori dexcellents milieux pour la conservation du matriel sporo-pollinique. Les analyses polliniques effectues par exemple sur le site de Chalain 3 offrent de trs bons rsultats (voir diagramme page suivante). Les niveaux archologiques sont cependant caractriss par laugmentation soudaine de certains taxons comme les crales, lail des ours et le lierre, et la diminution brutale des taux de pollen darbres. Ces problmes de fluctuations des taux polliniques sont dus des problmes de pollution de nature anthropique. Lhomme a apport des plantes sur le site, les grains de pollen de ces plantes sont venus polluer les niveaux archologiques. On sait par exemple grce la pluie pollinique actuelle que les crales pollinisent peu : les taux trs levs (parfois plus de 20 %) rencontrs dans les niveaux doccupation du site archologique ne sont alors pas dus la proximit des champs mais celle des zones de stockage et de aires de battage. Au moment de cette dernire opration, les grains de pollen sont librs de lpi et viennent sadditionner aux grains de pollen dautres plantes dj prsents naturellement dans les niveaux doccupation. Autre phnomne observ, les taux importants de pollen dail des ours : cette plante, comestible, a t apporte sur le site des fins alimentaires. Le fait que lon retrouve ses grains de pollen indique que la plante a t consomme lors de sa floraison. Enfin, linterprtation des taux anormalement levs de grains de pollen de lierre est difficile expliquer. La consommation de cette plante par lhomme est inconnue, et exceptionnelle par les animaux. Cette liane a pu tre ramene sur le site par exemple pour la fabrication des 12

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clayonnages, mais il faut alors supposer que la rcolte se faisait en priode de floraison et que les fleurs taient conserves jusque sur le site, ce qui parat curieux. En revanche, les grains de pollen ont pu tre inclus dans les sdiments archologiques parce quil se trouvait en abondance dans les mousses utilises pour le calfatage des maisons. La question reste ouverte. Cette analyse pollinique apporte donc des renseignements sur les pratiques alimentaires ou autres mais la surreprsentation de ces taxons dforme limage de lenvironnement vgtal du site. Il parait donc hasardeux de proposer une reconstitution du couvert vgtal pass partir des analyses polliniques effectues sur les niveaux doccupation dans un site archologique. Les problmes de percolation de pollen, de conservation diffrentielle, de pollution anthropique et aussi de sdimentation irrgulire bouleversent les donnes et constituent de srieux obstacles linterprtation des dynamiques vgtales. Dans lintrt du palynologue et de larchologue, il est ncessaire de prospecter autour des sites archologiques pour trouver des zones humides (lacs, mares, marais, palochenaux). La palynologie peut aussi se pratiquer en dehors de tout contexte archologique direct et apporter des renseignements sur les dynamiques agropastorales dans des zones ou le peuplement reste encore peu ou pas connu.

III.2.c. Lextraction, le comptage et la dtermination restituent fidlement limage de la pluie pollinique

Cette hypothse touche aux comptences du palynologue. Lextraction doit se faire suivant des rgles strictes et rigoureuses vitant la pollution des chantillons entre eux o par lintroduction de matriel sporo-pollinique venu des grains de pollen et des spores contenus dans lair par exemple. On estime que le comptage est acceptable au-del de 200 grains condition que ce comptage rvle aussi une grande diversit de type pollinique. Mais quil est toujours conseill daller largement au-del (500 grains), en particulier lorsquun ou plusieurs types polliniques se retrouvent en abondance (le comptage pourra alors approcher, voire dpasser, les 1000 grains par niveau). En microscopie optique, les dterminations aboutissent toujours au rang de la famille (Poaces), souvent au rang du genre (Quercus) dans lequel il est parfois possible de distinguer des types (Quercus type Ilex), et rarement jusquau rang de lespce (Plantago lanceolata), seul rang cologiquement significatif. Cette limite important conditionne - et limite parfois -

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linterprtation des donnes. Le palynologue raisonne alors en terme d assemblages polliniques . La Franche-Comt compte par exemple entre 250 et 300 espces de gramines diffrentes qui ont toutes des exigences cologiques prcises. Certaines dominent les prairies, dautres se dveloppent sous couvert forestier ; certaines affectionnent les sols trs secs alors que dautres peuvent crotre au contraire dans des zones trs humides Le palynologue est trs loin de distinguer tous ces types puisquil ne peut classer les grains de pollen de gramines quen deux grandes catgories : les gramines sauvages et les gramines cultives (qui constituent lessentiel des crales). Cest en fait un peu plus compliqu puisque la diffrence se faisant sur des critres morphologiques, et en particulier sur la taille du grain et du pore, certaines gramines sauvages sont trs proches des types cultivs ; dautre part, toujours partir dobservations prcises, il est possible de distinguer certains types (type Secale, le seigle par exemple), voire certaines espces caractristiques (Zea Mays, le mas).

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II. Du terrain au laboratoire

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Erable (Acer) Sapin (Abies)

Htre (Fagus) Orme (Ulmus)

Epicea (Picea)

Aulne (Alnus)

Tilleul (Tilia)

Chne (Quercus)

Pin (Pinus) Noisetier (Corylus)

Bouleau (Betula)

Frne (Fraxinus)

Monopor Exp. : gramine

Pripor Exp. : nielle

Monocolp Exp. : Spore

Stphanopor Exp. : aulne

Tricolp Exp. : rable

Stphanocolp Exp. : lavande

Tripor Exp. : noisetier

Tricolpor Exp. : chtaigner

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Bibliographie Erdtman G., 1943. An introduction to Pollen analysis. Chronica botanica, Whaltham Eds, 239p. Faegri K. & Iversen J., 1989. Textbook of pollen analysis. IV edition, John Wiley & Sons Eds, Chichester, 328 p. Moore P.D., Webb J.A.& Collinson M.E., 1991 (second edition). Pollen analysis. Blackwell Scientific Publications, Oxford, 216 p. Pons A., 1970. Le pollen. Paris : P.U.F., 126 p. (Que sais-je ?). Reille M. 1990. Leon de palynologie et d'analyse pollinique. Paris : CNRS, 206 p. Renault-Miskovsky J. et Petzold M., 1989. Spores et Pollen. Ed. La Duralie, 360 p. Richard H., 1999. La palynologie. In : La botanique, Paris Errance : 9-42. Richard H., 1985. Un exemple de pollution anthropique dans les analyses polliniques : les habitats littoraux du Grand Lac de Clairvaux (Jura). In : Palynologie archologique, ParisValbonne, CNRS : 279-297.

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