B 1377556477 Clase2.EvaluacionesdelosReproductores

Curso On-Line Seleccin de Reproductores en Ganado Bovino de Leche
Mdulo II: Evaluaciones de los Reproductores

Diana Cunliffe S.
Ing. Zootecnista Consultora en Produccin Lechera con nfasis en Administracin Ganadera y Seleccin de Reproductores en Ganado Bovino Lechero
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CLASE 2.
2.1 Evaluaciones de los reproductores 2.2 Pruebas tradicionales 2.2.1 Prueba de progenie 2.2.1.1 Base gentica. 2.2.2 Promedio de los padres. 2.3 Pruebas genmicas 2.3.1 Snips 2.3.2 Chips utilizados
Curso On-Line Seleccin de Reproductores en Ganado Bovino de Leche Mdulo II: Evaluaciones de los Reproductores - Prof.: Diana Cunliffe
Componentes de la produccin de un animal Genes(G)
Medio Ambiente (E) Px Manejo (M)
Record
Retos en la transferencia de tecnologa Pases desarrollados Pases en desarrollo

100 aos de registros Fenotipos Pedigris Pruebas de progenie por 50 aos
Animales de clima temperado
Sin registros Sin pedigr

Sistemas de produccin marginales, tropicales. Sin Sistema de evaluacin para evaluar germoplasma.
Pocos recursos econmicos.

2.1 Como evaluamos a los reproductores?

Hemos dicho que el progreso gentico en un hato se lograr mayormente a partir del semen. La eleccin del semen a utilizar ser fundamental para el futuro de su hato. En general el gasto en semen es aproximadamente 2% del gasto anual en un hato. El semen puede ser 0.5 a 7 % del costo de criar una novilla pero va a determinar su vida productiva, su adaptabilidad y su rentabilidad dentro del hato. Tengamos en cuenta que en una poblacin hay correlacin negativa entre algunas caractersticas y por ello no es fcil seleccionar al mismo tiempo estas caractersticas, como ubre y produccin de leche. Como produccin de leche y % de solidos.
El Reto
Tenemos que escoger reproductores que no exhiben la mayora de las caractersticas que buscamos mejorar en nuestras vacas, produccin de leche, grasa y protena, ubre anteriores, ancho de ubre post, ligamento medio, etc. Por ello se realizan las pruebas de progenie que nos permiten evaluar a un toro en funcin al desempeo de sus hijas. As a travs del control lechero evaluamos sus caractersticas productivas y los rasgos de salud y a travs de las asociaciones de raza evaluamos las caractersticas de tipo. Lnea de tiempo, nace el toro, se colecta a los 12-15 meses, nacen sus hijas a los 23-24 meses, a los 2 aos paren y luego de 10 meses tenemos una primera lactancia. La primera cosecha de hijas. Esto nos da aprox 5 aos para obtener la prueba de progenie.
2.2.1. Las pruebas de progenie

Las pruebas de progenie se basan en modelos estadsticos que buscan determinar el valor gentico real de un reproductor, para ello necesita un nmero suficiente de hijas y necesita eliminar todos los efectos de manejo que enmascaran el valor gentico transmitido a la hijas. Para ello se seleccionan vacas en diferentes climas y situaciones de manejo y se les compara con las compaeras de rebao para eliminar los efectos de manejo, poca de parto, tratamiento preferencia, etc.
Modelo Animal
Mas exacto que el modelo anterior, (Contemporary Comparison Method) G + ambiente +Manejo = Produccion. En uso desde 1989. Que es?...Evala simultaneamente vacas y toros usando todos sus ancestros. Es decir que todos los animales conocidos en un pedigree son usados. Esto incrementa tremendamente la exactitud ya que antes solo se usaba padre y abuelo materno y se ignoraba todas las hembras. Se evaluan animales pedigree y no registrados que tengan padres debidamente identificados en el DHI. Un modelo es un concepto matematico usado para describir la parte genetica y los factores ambientales que influencian un record de produccin. Describe una lactacion corregida para largo de lactacion asi como edad y epoca de parto, incluyendo los sgtes efectos:
Efectos de Correccin en el Modelo Animal

Prod = M + C +P + A + E
M = Factor de manejo del hato: se agrupan los animales segun el hato donde han producido el record, el ao y mes de parto (cada 2 meses), numero de lactacion (1ra y mas) y status de registro. Ajustan por efectos no geneticos. C = Interaccion toro-hato : para ajustar por un tratamiento preferencial a las hijas de un toro en un rebano. P = Efectos ambientales permanentes: 3 tetas, enfermedad o lesion que ha afectado permanentemente su produccion. Este efecto representa casi el 50% de la varianza entre vacas. A = Breeding Value (BV) : todos los ancestros, hembras y machos son incluidos al calcular BV de toros y vacas, parte genetica, transmite la mitad. E = parte no explicada por los otros trminos. De esta manera usando complicados calculos estadsticos los datos de las vacas son ajustados y resumidos usando todas las hijas de un toro para publicarse como las Evaluaciones del toro.
Una evaluacion genetica puede ser expresada como PTA (habilidad transmisora predicha) o BV (breeding value). PTA indica la diferencia en performance que podemos esperar de un animal comparado con sus compaeras. BV , es el merito genetico del animal y vale el doble que PTA.
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Recomendaciones para la Seleccin

Una prueba individual carece de sentido por si sola: pero es muy importante para: 1. El ranking de un toro con otro. 2. Diferencias entre toros.
Caractersticas no productivas deben ser factor secundario de seleccion.

Use toros jvenes como grupo. . % de uso? Si usa un programa de apareamiento gentico, ponga un minimo de PTA que aceptaria. Busque siempre las mejores compras disponibles. Usar grupos de toros de IA probados (7-10 por hato por ao). Seleccionar algunos toros en el 10% sup que puedan pagar. http://www.hoards.com/sites/default/files/April%2025,%202013%20Bull%20Li st.pdf Usar toros con alta confiabilidad (REL). Ponga mayor nfasis en caracteristicas de alta heredabilidad y alto valor economico.
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2.2.2 Base Gentica

Es el punto de referencia para expresar el merito gentico. Un grupo de animales se selecciona en una fecha especfica y sus promedios se definen como CERO.
Ej. Actualmente la base gentica es el promedio de las vacas nacidas en el 2010.
Estas bases se actualizan cada cierto tiempo : 5 aos en uSA, 1 ao Canada. Usada por Interbull y recomendada como la mejor opcin. www.aipl.arsusda.gov
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Promedios usados como base en el 2010 para calcular PTA AIPL USDA 2010
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Rasgos Promedio de la vaca base
Abril 2013
Significa Trait para las vacas de base
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Cambio en PTA. Agosto 2010 (Progreso gentico)
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Seleccin de ganado lechero tradicional

Lenta Las pruebas de progenie para caractersticas de produccin toman 3 a 4 aos desde la inseminacin. Un toro tendr por lo menos 5 aos cuando salga su primera evaluacin.
Costosa Una prueba de progenie cuesta entre $25,000 y $ 50,000 por toro. Solo 1 entre 8 a 10 toros se graduar. Por ello se invierte aproximadamente $ 200,000 por cada toro probado.
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2.2.2 Promedio de los padres

PA = VGpadre + VG madre.
PA = VG padre + VG abuelo materno + 1/8 VG bisabuelo materno
Entre 30 y 40% de confiabilidad.
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Lifecycle of bull
Parents Selected
Dam Inseminated
Embryo Transferred to Recipient
Bull Born Genomic Test Daughters Born (9 m later) Bull Receives Progeny Test (5 yrs)
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Semen collected (1yr)
Daughters have calves (2yr later)
Tradicionalmente
Pedigree
VERDADERO MERITO GENETICO
Desempeo
Progenie
DNA
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Genoma - ADN: ms exactitud en la prediccin

Pedigree
VERDADERO MERITO GENETICO
Desempeo
Progenie
DNA
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Pedigree tradicional
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Pedigree genmico
Azul = Dominante materno afecta Verde = No Afecta

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2.3 Qu es la genmica?
Es el estudio de la estructura, funcionamiento y heredabilidad del material gentico (GENOMA) de un organismo. El material gentico est contenido dentro del ADN, que consiste en pares de nucletidos. Son los bloques de construccin que forman el material gentico.
Genoma
ADN
Pares de nucletidos (SNP)
Los SNP son polimorfismo de un solo nucletido. Son una variacin gentica de la secuencia de nucletidos del ADN
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Marcadores genticos
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2.3.1 Los marcadores genticos, snp

Un SNP es una diferencia en una de las bases (Adenina, Timina, Guanina y Citosina) contenida en una de las dos cadenas de ADN del cromosoma animal.
Los bovinos tienen 30 pares de cromosomas que a su vez contienen alrededor de 3 billones de estos pares de bases. Como es muy costoso identificar la secuencia de estos 3 billones de pares de bases El USDA, ha desarrollado un microchip que testea 50.000 de esos SNP, en un esfuerzo para condensar los 3 billones de pares de bases en una herramienta manejable. Ilumina BovineSNP50 BeadChip
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Caractersticas evaluadas
Produccin de leche.
Grasa en leche.
Proteina en leche. Resistancia a mastitis. Fertilidad.
Duracin de la vida productiva Dificultad al parto.

Probabilidad de que la cra est viva a los 2 das. 18 caractersticas de tipo como estatura.
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Que es confiabilidad?
Exactitud : correlacin entre la prediccin del Valor Gentico y el valor gentico verdadero del animal.
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Confiabilidad
La confiabilidad no debe usarse como determinante en la eleccin de un toro sino como condicionante de cuantas dosis comprar por toro. Actualmente los toros jvenes genmicos son una promesa real de mejora gentica, su prueba equivale a la que otorgan 10 hijas en produccin.el da de nacido.
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Confiabilidad en la prediccin Holstein
a VP=vida productiva, FP = facilidad parto and SB = nacidos muertos. b 2011 deregressed value 2007 genomic evaluation.
AIPL papers
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2.3.2 CHIPS UTILIZADOS

La biologa moderna trata de explicar como las variaciones en los marcadores de ADN se relacionan al fenotipo a travs de sistemas proticos, de transcripcin y reguladores. En el ganado lechero se encuentran disponibles los chips de alta densidad que relacionan los genotipos con miles de animales fenotipicados y almacenados en la base de datos del USDA para poder correlacionarlos.
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Pasos para preparar genotipos

Nominar al animal por genotipar Las asociaciones de raza organizan la toma de muestra (pedigr disponible) Recolectar sangre, pelo, semen, muestra nasal, o puncin en la oreja. Sangre no la major opcin en gemelos. Extraer DNA en el laboratorio.
Preparar DNA y aplicarlo al BeadChip Realizar amplificacin e hibridacin, proceso de 3 das.

Lectura e interpretacin.
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Cual es el impacto de la prueba genmica?

El pedigrnos da informacin equivalente a 7 hijas
Para protena en lb (h2=0.30), nos da informacin equivalente a 34 hijas adicionales.
Aipl papers
32
Cual es el impacto de la prueba genmica?

Para tasa de preez de las hijas (h2=0.04), SNP = 131 daughters
Aipl papers 33
Animales genotipados hasta abril 2013
Wiggans, 2013
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Aplicacin de la evaluacin genmica en USA

Dic. 2007 Abr. 2008 En. 2009 BovineSNP50 BeadChip disponible Primera evaluacin no official publicada Evaluacin Genomica oficial para Holstein y Jersey
Ag. 2009 Set. 2010 Dec. 2010
Official para Brown Swiss Evaluacin no oficial 3K chip Evaluacin del chip 3K oficial
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Marketed HO bulls
ANSC UMD(36)
Wiggans
2013
Resumen

La Genmica est revolucionando la crianza animal. La seleccin genomica es usada extensamente en la crianza de Ganado bovino lechero.
Los chips de alta calidad ayudan en la deteccin de errores de parentela y otros. Determina el valor del animal al nacimiento.
Incremente la exactitud en la seleccin.
Disminuye el intervalo entre generaciones. Aumenta la intensidad de seleccin.

Aumenta la tasa de ganancia gentica La colaboracin internacional ha sido muy importante.
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Comparacin de las evaluaciones de toros jvenes genmicos entre Diciembre 2012 y Abril AIPL abril 2013
38
Confiabilidad usando evaluaciones tradicionales y genmicas
Valores de Paul Van Raden, 2008
39
Confiabilidad usando evaluaciones tradicionales y genmicas
Valores de Paul Van Raden, 2008
40
Ganancia en confiabilidad
Van Raden, 2008

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Comparacin de Abril 2013 evaluaciones genmicas and tradicionales para toros en AI con status de activo o extranjeros 585 toros Holstein activos
AIPL USDA
1Genomic
minus traditional.
42
Comparacin de Abril 2013 evaluaciones genomicas and tradicionales para toros en AI con status de activo o extranjeros 39 toros BS activos
1Genomic
minus traditional.
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TABLE 1. PTA promedio para toros evaluados en abril 2013. ----------------Leche/grasa Proteina SCS VP DPR ---------------- ---------- ------ ----- -----Breed Number PTAM PTAF% PTAF PTAP% PTAP PTASCS PTAPL PTADPR NM$ FM$ CM$ ------------------------------------------------------------------------------------------------------Active AI bulls: Ayrshire and Red.... 34 +840 +.07 +47 +.03 +33 2.84 +2.8 +0.9 +395 +361 +435 Brown Swiss......... 36 +322 +.01 +16 +.02 +14 2.94 +1.1 +0.3 +164 +145 +185 Guernsey............ 23 +233 +.06 +20 .00 +8 2.97 +0.8 -0.5 +131 +130 +135 Holstein............ 588 +788 +.03 +37 +.01 +26 2.86 +2.0 0.0 +345 +327 +364 Jersey.............. 122 +546 +.08 +40 +.03 +24 3.01 +1.9 +0.1 +277 +255 +309 Milking Shorthorn... 13 +444 +.06 +26 +.02 +16 3.02 +0.9 +0.2 +180 +171 +194 Red and White....... 66 -99 +.10 +22 +.04 +8 2.94 +1.8 +0.1 +199 +158 +246
Genomic tested young bulls being marketed: Ayrshire and Red.... 29 +635 +.05 +33 +.01 +22 2.88 +1.4 -0.1 +267 +249 +286 Brown Swiss......... 45 +719 +.01 +32 +.01 +26 2.85 +2.5 +0.3 +327 +301 +355 Guernsey............ 0 --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --Holstein............ 1227 +1086 +.05 +52 +.02 +39 2.78 +3.6 +0.3 +536 +497 +578 Jersey.............. 227 +907 +.07 +54 +.02 +36 2.95 +3.2 +0.1 +428 +396 +470 Milking Shorthorn... 0 --- --- --- --- --- --- --- --- --- --- --Red and White....... 85 +559 +.06 +35 +.04 +26 2.85 +2.4 0.0 +366 +322 +416
44
2.3.2 CHIPS UTILIZADOS
45
Gracias!!
46

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Mdulo II: Evaluaciones de los Reproductores

Componentes de la produccin de un animal Genes(G)

Medio Ambiente (E) Px Manejo (M)

Retos en la transferencia de tecnologa Pases desarrollados Pases en desarrollo

Sin registros Sin pedigr

Pocos recursos econmicos.

2.1 Como evaluamos a los reproductores?

2.2.1. Las pruebas de progenie

Efectos de Correccin en el Modelo Animal

Recomendaciones para la Seleccin

Caractersticas no productivas deben ser factor secundario de seleccion.

2.2.2 Base Gentica

Rasgos Promedio de la vaca base

Significa Trait para las vacas de base

Cambio en PTA. Agosto 2010 (Progreso gentico)

Seleccin de ganado lechero tradicional

2.2.2 Promedio de los padres

Entre 30 y 40% de confiabilidad.

Embryo Transferred to Recipient

Semen collected (1yr)

Daughters have calves (2yr later)

Genoma - ADN: ms exactitud en la prediccin

Azul = Dominante materno afecta Verde = No Afecta

Pares de nucletidos (SNP)

2.3.1 Los marcadores genticos, snp

Duracin de la vida productiva Dificultad al parto.

Confiabilidad en la prediccin Holstein

2.3.2 CHIPS UTILIZADOS

Pasos para preparar genotipos

Preparar DNA y aplicarlo al BeadChip Realizar amplificacin e hibridacin, proceso de 3 das.

Cual es el impacto de la prueba genmica?

Para protena en lb (h2=0.30), nos da informacin equivalente a 34 hijas adicionales.

Cual es el impacto de la prueba genmica?

Animales genotipados hasta abril 2013

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Ag. 2009 Set. 2010 Dec. 2010

Incremente la exactitud en la seleccin.

Disminuye el intervalo entre generaciones. Aumenta la intensidad de seleccin.

Confiabilidad usando evaluaciones tradicionales y genmicas

Valores de Paul Van Raden, 2008

Confiabilidad usando evaluaciones tradicionales y genmicas

Valores de Paul Van Raden, 2008

Van Raden, 2008

2.3.2 CHIPS UTILIZADOS

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