00 Rappel Microbio Medicale

Rappel de Microbiologie mdicale
Dr Sandrine Lemaire Unit de Pharmacologie cellulaire et molculaire

11/11/2012 FARM2115 -- 2012-2013 1
Principales espces bactriennes

Bactries Gram + : - Cocci : Staphylococcus (S. aureus, S. epidermidis, ) Streptococcus (S. pneumoniae, S. pyogenes, ) Enterococcus (E. faecalis, E. faecium) - Bacilles: Bacillus (B. anthracis, B. cereus) Clostridium (C. difficile, C. tetani, ) Bactries Gram - : - Cocci : Neisseria (N. meningitidis, N. gonorrhoeae) - Bacilles: Enterobactries (E. coli, Salmonella, Shigella, Yersinia, ), Pseudomonas Legionella, H. influenzae,
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FARM2115 -- 2012-2013

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A. Staphylococcus aureus
A1. Proprits microbiologiques
Cocci Gram positif Facteurs de virulence: Toxines (hmolysines, leukocidines, ) Fibronectin Binding proteins (invasion des cellules et des tissus lss)
Rsistance la chaleur, hautes conc. en sels, variation de pH,
A2. Habitat
Ubiquitaire Rservoir: hommes, animaux - Portage cutan et/ou nasal (20-30 % des individus) - Source de contamination (pour lindividu lui-mme, ainsi que pour les autres)
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From http://www.medecinesciences.org/
A. Staphylococcus aureus
A3. Infections
Personnes risque : patients immunodprims, sjour prolong lhpital, plaies, oprations chirurgicales, corps tranger (cathter, prothses, ) Infections: Infections de la peau et des tissus mous (furoncle, abcs, infection des plaies, cellulite, impetigo, ) Infections profondes, viscrales (endocardite, ostomylite, arthrite, pneumonies de surinfection, abcs profonds, ) Bactrimies, septicmies Maladies causes par des toxines (syndrome du choc toxique, syndrome de Ritter, infections alimentaires, ) Pathogne majeur des infections nosocomiales & communautaires
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Methicillin-Resistant S. aureus (MRSA)

1950 1960 1970 1980 1990 2000 2010
Apparition des MRSA MRSA associes aux infections nosocomiales
MRSA dans la communaut:

Abcs, infections svres de la peau, Infections des poumons
MRSA chez les animaux
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The era of antibiotic resistance
MRSA
Tetracyclines Aminoglycosides Rifampicin Macrolides
Fluoroquinolones Glycopeptides (Vancomycin)
Daptomycin
+ Selection of isolates less susceptible to novel antimicrobials (linezolid, quinupristindalfopristin, )

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Year : 2009
From: http://ecdc.europa.eu/en/activities/surveillance/EARS-Net/database
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2005: campagnes nationales vous tes en de bonnes mains afin de promouvoir lhygine des mains dans les institutions de soins
From: http://ecdc.europa.eu/en/activities/surveillance/EARSNet/database
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B. Streptococcus pneumoniae (pneumocoque)

B1. Proprits microbiologiques
Diplocoques Gram positif Facteurs de virulence: - Capsule polysaccharidique (rsistance la phagocytose; les souches avirulentes sont dpourvues de capsule) - Pas de toxines
B2. Habitat
Commensal des voies respiratoires suprieures Rservoir humain (transmission de personne personne)
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B. Streptococcus pneumoniae (pneumocoque)

B3. Infections
Personnes risques: enfants (< 2 ans), personnes ges Infections: - 75 % des pneumonies bactriennes communautaires (CAP) - Surinfection de bronchopathies chroniques - Pleursies - Septicmies - Mningites - Otites, sinusites, mastodites - (Arthrites, endocardites, pritonites)
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B. Streptococcus pneumoniae (pneumocoque) B4. Rsistance

tude belge rcente, souches de pneumonie communautaire
Lismond et al; IJAA 2012

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C. Clostridium difficile
C1. Proprits microbiologiques
Bacille Gram + Anarobie Spores (sol, milieux hospitaliers, foyers pour pers. ges) Facteurs de virulence principaux : toxine A (entrotoxine) & toxine B (cytotoxine)
C2. Infections Agent tiologique de la colite pseudomembraneuse

et des diarrhes aprs antibiothrapie
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Colite pseudomembraneuse
Perturbation de la flore gastro-intestinale (antibiothrapie) Colonization par C. difficile (endogne vs. exogne) Production des toxines A & B Lsion de la muqueuse intestinale (altration par la prsence de fausses membranes fibrineuses et dun infiltrat inflammatoire)
Symptmes principaux: diarrhe aqueuse ou mucopurulente (rarement hmorragique), douleurs abdominales, fivre, La manifestation la plus grave demeure le mgacolon toxique, qui peut donner lieu une perforation intestinale Pathologie parfois mortelle (chez les personnes ges)
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C. Clostridium difficile
C3. Diagnostic
Isolement de la bactrie dans les selles Recherche de toxines
C4. Traitement
Mtronidazole Vancomycine
C5. Prophylaxie
Isolement des patients hospitaliss Dcontamination de la chambre
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D. Enterobactries
D1. Proprits microbiologiques
Bacilles Gram Prolifration abondante dans le sol, leau, tube digestif (hommes & animaux)
D2. Infections Infections urinaires (E. coli, Klebsiella, Serratia, )

Infections gastro-intestinales (Salmonella, Yersinia, Shigella, certaines souches dE. coli)
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Escherichia coli
Espce bactrienne le plus souvent implique en pathologie infectieuse Infections : Infections urinaires (80 % des infections acquises en communaut; 40-50 % des infections nosocomiales) Diarrhes infectieuses:
E. coli entrotoxinognes (toxines ST et LT; diarrhe du voyageur) E. coli entropathognes (diarrhe infantiles) E. coli entrohmorragiques (diarrhes sanglantes; ex. E. coli 0157:H7) E. coli entroinvasifs (invasion de cellules intestinales; diarrhes infantiles ou dadultes)
Septicmies, abcs abdominaux, infections respiratoires, mningites no-natales

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Escherichia coli
- Rsistance aux antibiotiques: Production de
pnicillinases (+++) Production de lactamases spectre tendu (BLSE; rsistance aux pnicillines et cphalosporines) Acquisition de plasmides portant des dterminants de rsistance dautres classes dantibiotiques modification de la cible
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Escherichia coli
- Rsistance aux antibiotiques:
Augmentation du nombre dinfections impliquant des souches dE. coli rsistantes aux antibiotiques (ex: fluoroquinolones)
From: http://ecdc.europa.eu/en/activities/surveillance/EARS-Net/database
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E. Pseudomonas aeruginosa
E1. Proprits microbiologiques
Bacilles Gram Pathogne ubiquitaire (sol, eau, milieu hospitalier [lavabos, appareils respiratoires, ]) Facteurs de virulence: flagelle (mobilit), pili (colonisation),
E2. Infections P. aeruginosa

Pathogne opportuniste ; infections chez les patients immunodprims (cancer, mucoviscidose, brls) Frquemment impliqu dans les infections nosocomiales (pneumonie chronique, septicmie, )
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Infections P. aeruginosa
Facteur prdisposant Mucoviscidose Brlures Traumatisme Oprations chirurgicales Neutropnie Enfants prmaturs et nouveaux-ns Type dinfection Pneumonie chronique Surinfection, septicmie Ostomylite Pneumonie, mningite Septicmie, pneumonie Septicmie, mningite, entrite
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E3. Rsistance
Rsistance frquente aux antibiotiques (ex. beta-lactames par scrtion de beta-lactamases) Capacit rsister de nombreux dsinfectants, savons liquides pour les mains,
Adaptation lenvironnement hospitalier
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Carbapnmes (2009)
P-B, 3 %; Belgique, 9 %; France, 18 %; Italie, 30 %; Grce, 44 %

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Dr Sandrine Lemaire Unit de Pharmacologie cellulaire et molculaire

Principales espces bactriennes

Principales espces bactriennes

Rsistance la chaleur, hautes conc. en sels, variation de pH,

Methicillin-Resistant S. aureus (MRSA)

Apparition des MRSA MRSA associes aux infections nosocomiales

MRSA dans la communaut:

MRSA chez les animaux

The era of antibiotic resistance

Fluoroquinolones Glycopeptides (Vancomycin)

+ Selection of isolates less susceptible to novel antimicrobials (linezolid, quinupristindalfopristin, )

Methicillin-Resistant S. aureus (MRSA)

Methicillin-Resistant S. aureus (MRSA)

Principales espces bactriennes

B. Streptococcus pneumoniae (pneumocoque)

B. Streptococcus pneumoniae (pneumocoque)

B. Streptococcus pneumoniae (pneumocoque) B4. Rsistance

Lismond et al; IJAA 2012

Principales espces bactriennes

C2. Infections Agent tiologique de la colite pseudomembraneuse

Principales espces bactriennes

D2. Infections Infections urinaires (E. coli, Klebsiella, Serratia, )

Septicmies, abcs abdominaux, infections respiratoires, mningites no-natales

Principales espces bactriennes

E2. Infections P. aeruginosa

Adaptation lenvironnement hospitalier

P-B, 3 %; Belgique, 9 %; France, 18 %; Italie, 30 %; Grce, 44 %

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