Ensayo sobre la Sntesis de protenas

Curso propedutico de Maestra en Biotecnologa

Dr. Investigador Julin Mario Pea Castro Titular de la materia de Bioqumica.

Elaborado por Ofelia Ram rez Sakyamuni Ch. Russell

Septiembre 2013

Ensayo sobre Sntesis de Protenas

Los procesos Biolgicos, bioqumicos, genmicos y fsicos, en la historia de la humanidad, no solo se han estudiado desde diferentes enfoques o perspectivas cientficas y filosficas, han servido como modelos para el desarrollo de nuevas tecnologas, mquinas y herramientas, la necesidad de encontrar las razones, el por qu ocurren, y pensar en qu pasara si pueden ser modificadas o no existieran, ha generado una revolucin cientfico-intelectual en los ltimos 100 aos, creemos que a partir del modelo del ADN plateado por Watson y Crick o incluso desde el modelo Atmico de Lewis. Ya que este tema se desarrolla en un contexto de estudio bioqumico, planteamos lo siguiente: El cuerpo humano es la maquinaria ms evolucionada y compleja de todas las especies, sobre todo en el aspecto intelectual, entender los procesos que ocurren dentro del cuerpo y las interacciones que tiene con el medio ambiente, la alimentacin y factores genticos, se ha resumido en los ltimos aos al estudio de tres estructuras fundamentales de todos los seres vivos, pero con mayor importancia en la especie humana, principalmente en el rea Biomdica. El ADN, el ARN y las protenas, estas tres superestructuras moleculares, hipotticamente vistas desde la filosofa son el origen de la vida, y se relacionan directamente en un proceso complejo que conocemos como sntesis de protenas. Iniciamos con el ADN, desde el punto bioqumico, son secuencias de nucletidos, y cada nucletido, a su vez, est formado por un azcar (la desoxirribosa), una base nitrogenada que puede ser adenina (A), timina (T), citosina (C) o guanina (G) y un grupo fosfato que acta como enganche, esta se encuentra en una cadena de doble hlice, y cada cadena tienen una organizacin complementaria a la otra, entrelazadas por puentes de hidrogeno. En cada una de las cadenas, se encuentra almacenada toda la informacin codificada, en fragmentos delimitados a los que la ciencia ha llamado Genes, estos genes contienen informacin especfica que puede ser expresada fenotpicamente en los organismos. Iniciaremos la sntesis de protenas con el primer proceso, que consiste en la transcripcin de una cadena de ADN a un ARN, por la enzima ARN polimerasa, formando una cadena complementaria con una secuencia de ARN que se denomina mensajero, en el cual cambian dos elementos, una Ribosa y el uracilo que sustituye a la Timina (en la cadena de DNA).

Imagen tridimensional de la ARN-polimeraza traduciendo ADN a ARN. Este ARN mensajero (ARNm) sale de la membrana del ncleo celular hacia el citoplasma de la clula, donde ser reconocido por un RIBOSOMA (orgnulo o estructura citoplasmticas compuesta por subunidades que traducen y ensamblan la aminocidos mediante enlaces peptdicos) en este proceso se reconocen tres fases: Iniciacin: El ARNm se une a la subunidad menor de los ribosomas. A stos se asocia el aminoacil-ARNt, gracias a que el ARNt tiene en una de sus asas un triplete de nucletidos denominado anticodn, que se asocia al primer codn del ARNm segn la complementariedad de las bases. A este grupo de molculas se une la subunidad ribosmica mayor, formndose el complejo ribosomal o complejo activo1. Los aminocidos (componentes de las protenas) son unidos a los ARN de transferencia (ARNt) que los llevarn hasta el lugar de sntesis proteica, donde sern encadenados uno tras otro. La enzima aminoacil-ARNt-sintetasa se encarga de dicha unin, en un proceso que consume ATP (Estos aminocidos son captados en las paredes celulares, transportadas por torrentes de fluidos como el sanguneo, obtenidos de los alimentos o nutrientes que consuma el organismo).

Imagen tridimensional de un ribosoma y un ARNm, modelo hipottico de las regiones que los componen.

La Elongacin se desarrolla en la estructura ribosomal que posee dos sitios de unin o centros. El centro peptidil o centro P, donde se sita el primer aminoacil-ARNt y el centro aceptor de nuevos aminoacil-ARNt o centro A. El carboxilo terminal (-COOH) del aminocido iniciado se une con el amino terminal (-NH2) del aminocido siguiente mediante enlace peptdico (es deshidratado). Esta unin es catalizada por la enzima peptidil transferasa 1. El centro P queda pues ocupado por un ARNt sin aminocido. El ARNt sin aminocido sale del ribosoma. Se produce la translocacin ribosomal. El dipeptil-ARNt queda ahora en el centro P. Todo ello es catalizado por los factores de elongacin (FE) y precisa GTP. Segn la terminacin del tercer codn, aparece el tercer aminoacil-ARNt y ocupa el centro A1. Luego se forma el tripptido en A y posteriormente el ribosoma realiza su segunda translocacin. Estos pasos se pueden repetir mltiples veces, hasta cientos de veces, segn el nmero de aminocidos que contenga el polipptido. La translocacin del ribosoma implica el desplazamiento del ribosoma a lo largo de ARNm en sentido 5'-> 3' 1. Cada anti codn que codifica para el ARNm, puede ser una combinacin de nucletidos diferente, cada tres nucletidos (tripletes) se transcriben en un aminocido especifico, hay 20 aminocidos conocidos, cada conjugacin determinara la estructura primaria de la protena, cuando ya estn unidos por enlaces peptdicos son llamados residuos, esta es la fase que comprende la elongacin.

En la fase de terminacin los codones UAA, UAG y UGA son seales de paro que no especifican ningn aminocido y se conocen como codones de terminacin; determinan el final de la sntesis proteica. No existe ningn ARNt cuyo anticodn sea complementario de dichos codones y, por lo tanto, la biosntesis del polipptido se interrumpe. Indican que la cadena polipeptdica ya ha terminado. Este proceso viene regulado por los factores de liberacin, de naturaleza proteica, que se sitan en el sitio A y hacen que la peptidil transferasa separe, por hidrlisis, la cadena polipeptdica del ARNt 2.

Imagen de un Ribosoma realizando la transcripcin del RNAm, con los sitios activos para la formacin de enlaces peptdicos de los aminocidos, se muestran los codones y anti-codones complementarios.

Un ARNm, si es lo suficientemente largo, puede ser ledo o traducido, por varios ribosomas a la vez, uno detrs de otro. Al microscopio electrnico, se observa como un rosario de ribosomas, que se denomina polirribosoma o polisoma. Una vez finalizada la sntesis de una protena, el ARN mensajero queda libre y puede ser ledo de nuevo. De hecho, es muy frecuente que antes de que finalice una protena ya est comenzando otra, con lo cual, una misma molcula de ARN mensajero, est siendo utilizada por varios ribosomas simultneamente hasta que este sea degradado. Posteriormente las protenas son liberadas al citoplasma, donde se plegaran y conformaran sus estructuras secundarias, en algunos casos requerir de otras protenas llamadas CHAPERONAS, las cuales mediante interacciones hidrofbicas reversibles, darn estabilidad y controlaran las funciones para que sea plegable o desplegable la protena.

Recapitulando, las protenas tienen funciones especficas en el metabolismo celular, son reguladoras de procesos como la asimilacin de nutrientes, catalizadores enzimticos, degradacin, oxido-reduccin, transporte, adems de conformar el sistema inmune de anticuerpos (reconocimiento de agentes invasores), conforman la estructural de los tejidos, son homeostticas, y su fusin especifica dependern de factores como su estructura tridimensional, la organizacin y predominancia de sus aminocidos, as como su estabilidad de enrollamiento y estabilidad molecular. Las mutaciones que pueden ocurrir son de origen desde el ADN, que codifique errneamente, actualmente se hacen estudios comparativos y filogenticos mediante secuenciaciones de miles de protenas, para determinar sus funciones especficas, en que procesos intervienen y que otras aplicaciones se pueden descubrir o modificar.

El modelo de la nanotecnologa est basado en el funcionamiento tanto del ribosoma como de las protenas, desde la reconstruccin de tejidos, la modificacin de funciones especficas en la clula o en tejidos celulares de organismos eucariontes, y en otros casos, se investigan la capacidad de algunos procariontes a resistencia de algunos antibiticos o agentes, tambin en la botnica se estn realizando grandes descubrimientos sobre el uso de protenas para cultivos y conservacin de especies.

Modelo de la sntesis de protenas en un organismo procarionte.

Bibliografa y referencias
1. - Devlin, T. M. 2004. Bioqumica, 4 edicin. Revert, Barcelona. ISBN 84291-7208-4 2. - David L. Nelson, Michael M. Cox, Lehninger. Principios de Bioqumica, 4 edicin. http://proteinas.org.es/ http://3dciencia.com/

Elaborado por Ofelia Ramrez Sakyamuni Ch. Russell