Ncleo

Estructura y Funcin Celular.

Robert Brown:
1773-1858
En 1831, mientras realizaba un
estudio microscpico de la epidermis
de orqudeas, not la existencia de
un punto opaco en el interior de las
clulas.
Esto se haba observado antes por
otras personas, pero Brown fue el
primero en reconocerlo como parte
componente de la clula vegetal.
A esta estructura la llam ncleo.
1844-1895
Friedrich Miescher:
Aisl una sustancia cida rica en
fosfatos a partir de clulas blancas
de la sangre (1871). La llam
nuclena.
Despus (1872) aisl de las cabezas
de los espermatozoides de salmn
una sustancia que llam protamina
con un componente cido y otro
bsico
La palabra cido nucleico deriva de
la nuclena usada por Miescher.
Contenido del ncleo
Protenas
RNA
DNA
DNA
RNA
Composicin de los cidos nucleicos
Bases nitrogenadas
Composicin de los cidos nucleicos
Cadenas polinucleotdicas
Composicin de los cidos nucleicos
C N O H
Enlaces
Composicin de los cidos nucleicos
Bases nitrogenadas
por qu uracilo en RNA y timina en DNA?
ATP
GTP
CTP
UTP
deshidroxilacin
dATP
dGTP
dCTP
dUTP
metilacin
durante la sntesis de nucletidos:
dATP
dGTP
dCTP
dTTP
para qu metilar U y convertirlo en T antes de formar el DNA?
Composicin de los cidos nucleicos
Bases nitrogenadas
Metilacin: proteccin del DNA frente a nucleasas
metilacin de dATP y dCTP
hidrofobicidad
emparejamiento con todas las bases
otorga una conformacin precisa en la doble hlice
que obliga a emparejar con A.
Composicin de los cidos nucleicos
proteccin
especificidad de unin
Bases nitrogenadas
desaminacin
Si U en DNA: mutaciones C > U inadvertidas
se distingue metil-U de U y se corrige
Composicin de los cidos nucleicos
reconocimiento normal/mutado
Resumen
DNA
RNA
Funcin del DNA
Cul es la
funcin del DNA?
Funcin del DNA
Friedrich Grifith demuestra la tranformacin bacteriana 1928
Avery, OT; MacLeod, CM and McCarty, M (1944). Studies on the chemical nature of the substance inducing
transformation of Pneumococcal types. J. Exp. Med. 79, 137-158.
Avery, MacLeod y McCarty demuestran que el material
transformante es el DNA
1944
Funcin del DNA
Martha Chase y Alfred Hershey demuestran que
el DNA es el material gentico
1952
Hershey, AD. Chase, M (1952). Independent functions of viral protein and nucleic acid in growth of bacteriophage. J.
Gen. Physiol. 36(1): 39-56.
1908-1997 1928-2003
Funcin del DNA
Resumen
Friedrich Grifith demuestra la tranformacin bacteriana 1928
Avery, MacLeod y McCarty demuestran que el material
transformante es el DNA
1944
Martha Chase y Alfred Hershey demuestran que
el DNA es el material gentico
1952
1905-2002
REGLAS DE CHARGAFF PARA DNA DOBLE HLICE (1950)
Estructura del DNA
1.- A=T A/T= 1
2.- G=C G/C= 1
3.- (A+G)=(C+T) (A+G)/(C+T)=1
4.- (A+G)/(C+T) vara para cada organismo
Estructura del DNA
1953
1920-1958 1916-2004
Estructura del DNA
dor sal es de azucar -
fosfato exteriores
bases enfrentadas al
interior.
api l adas en pl anos
paralelos
5
3 5
3
Estructura del DNA
Estructura del DNA
Aceptor de enlace de hidrgeno A
Donador de enlace de hidrgeno D
Hidrgeno no polar H
Grupo metilo M
Estructura del DNA
Cada vuelta de hlice: 3,4 nm
Cada vuelta de hlice: 10
pares de bases
Estructura del DNA
humedad baja 65-75%
RNA/DNA
RNA/RNA
molculas pequeas
y repeticiones G/C
Estructura del DNA
Flexibilidad: puentes de H
transversales y no longitudinales
Empaquetamiento
Resumen
REGLAS DE CHARGAFF PARA DNA DOBLE HLICE (1950)
1953
Factores que alteran la estructura
Temperatura: al aumentarla experimentalmente se induce la
desnaturalizacin de una solucin de DNA.
ruptura de los enlaces de hidrgeno
repulsin de las hebras por las cargas
(-) de las dorsales de azcar-fosfato
hay un cambio en la absorcin de
luz UV
cerca de la T de desnaturalizacin
El DNA de dobl e hebra se
comporta como monohebra en
cuanto a la absorcin de UV.
Porcentaje de pares GC:
A mayor porcentaje GC en una molcula, mayor ser la T de
desnaturalizacin.
Se puede conocer el %GC de una molcula segn su Tm
Factores que alteran la estructura
Factores que alteran la estructura
Concentracin de iones:
los grupos P con carga (-) estn protegidos por iones con carga (+)
Agentes qumicos: Formamida y Urea interfieren con puentes de H.
Disminuyen la Tm.
pH:
pH cido: bases protonadas. Carga (+)
pH bsico: bases pierden protones. Carga (-)
Otras estructuras del DNA
DNA circular DNA bacteriano, plsmidos y...
Topoisomerasa I y II
Resumen
Temperatura
Concentracin de iones
Agentes qumicos
pH
Conformacin del RNA
RNA difiere del DNA en:
grupo reactivo
medio alcalino: ruptura del RNA
en mononucletidos
RNA:RNA; RNA:DNA
hebra sencilla o doble
lineal o circular
Conformacin del RNA
Estructura 3D define funcin
Ribozimas: splicing y self-splicing
Formacin de enlace peptdico
(rRNA)
Estructura gnica
Gen: Secuencia de DNA completa necesaria para la sntesis de
un producto gnico funcional (RNA o polipptido).
Estructura gnica
genes monocistrnicos genes policistrnicos
Estructura gnica
intrones: en genes eucariotas salvo levaduras
se eliminan durante el procesamiento del RNAm
protenas grandes presentan repeticiones de
exones que forman dominios
Estructura gnica
Unidades de transcripcin:
distinto de genes en procariotas
igual que genes en eucariotas
salto de exn
Sitios de poliadenilacin alternativos
Uso de promotores alternativos
Resumen
Gen:
genes policistrnicos
genes monocistrnicos
Unidades de transcripcin:
cmo se organizan las molculas
de DNA en una clula eucariota?
Empaquetamiento del DNA
Cromosoma:
Genoma humano:
24 cromosomas diferentes
Una molcula de DNA asociada a
protenas que la empaquetan
DNA interfase: cromatina
metafase: DNA condensado
en cromosomas
Empaquetamiento del DNA
Cromosomas homlogos
Humanos: 22 pares de cromosomas comunes a ambos sexos
1 par de cromosomas sexuales X Y
X X
cariotipo
Empaquetamiento del DNA
cromosoma: DNA y protenas
histonas y no histonas
cromatina
nivel de organizacin cromosmica ms bsico nucleosoma
nucleo interfsico
tratamiento de
desplegado
Empaquetamiento del DNA
Histonas: 4 tipos diferentes
Nucleosomas: separados por 80
nucletidos app. DNA linker
Formacin de nucleosomas: reduce la
longitud de la molcula de DNA a un tercio
Primer nivel de
empaquetamiento del DNA
Empaquetamiento del DNA
Segundo nivel de
empaquetamiento del DNA
Fibra de 30 nm
Modelos:
1.- Zig-zag
Empaquetamiento del DNA
2.- Irregularidades: Generadas por protenas de unin a DNA
Secuencias no plegables en nucleosomas
Mecanismos que actan juntos para conseguir la fibra de 30 nm
Empaquetamiento del DNA
Histona H1:
Colas de histonas nucleosmicas
Empaquetamiento del DNA
Los nucleosomas son estticos?
Qu pasa con la expresin gnica, la replicacin
del DNA y la reparacin?
Complejos de remodelacin de cromatina
Mquinas proteicas que usan ATP para cambiar la
estructura de los nucleosomas temporalmente
Empaquetamiento del DNA
Ejemplos de Complejos de remodelacin de cromatina
Empaquetamiento del DNA
Modificaciones de las colas de las histonas
Efecto en la fibra de 30 nm. Poco en el nucleosoma
Mayor efecto: atraccin de protenas al fragmento
modificado. Segn la modificacin estas protenas
plegarn ms o permitirn el acceso al DNA
Empaquetamiento del DNA
Regiones ms compactas son inaccesibles a enzimas
Empaquetamiento del DNA
Otras protenas no histonas conforman el andamio al
cual se unen los lazos de DNA de la fibra de 30 nm.
LECTURA FUERTEMENTE RECOMENDADA:
CAPTULO 4 ALBERTS
CAPTULO 4 DARNELL y
CAPTULO 10 DARNELL
CAPTULO 6 WATSON, J y
CAPTULO 7 WATSON, J