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27/08/2014

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Qumica dos Aminocidos
e Peptdeos
Prof. Dr. Edson dos Anjos
Informaes Gerais
As protenas so as macromolculas mais abundantes nas clulas
vivas eexibemumagrandediversidadedefunes biolgicas;
Asprotenassoformadas por subunidades monomricas simples;
Todas as protenas so construdas como mesmo conjunto de 20
aminocidos;
Levaavrias combinaes eseqncias diversas;
Possibilita que os organismos sintetizem diferentes produtos:
enzimas, hormnios, protenasentreoutros.
eri trci tos querati na
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Caractersticas Estruturais
Todos os aminocidos presentes nas protenas so -aminocidos.
Aminocidos
Forma geomtri ca
Estrutura
Geral , exceo
da Gl i ci na R=H
pH fi si ol gi co ~7.4
Estrutura
tetradri ca
Cadeia
Lateral
Carbono-
Grupo
Amino
Grupo
Carboxlico
Aminocidos
Lisina
Designao dos C
adicionais no grupo
R.
R= heterocclicos
utiliza-se o sistema
de numerao
Grupo R
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Caractersticas
Estruturais
Os 20 aminocidos das
protenas: aminocidos
primrios.
Aminocidos
Lisina
Designados por
abreviaes de 3 letras
Aminocido Nomes abreviados
Grupos R alifticos no-
polares

Glicina Gly G
Alanina Ala A
Prolina Pro P
Valina Val V
Leucina Leu L
Isoleucina Ile I
Metionina Met M
Grupos R aromticos
Fenilalanina Phe F
Tirosina Tyr Y
Triptofano Trp W
Grupos R no-
carregados, mas polares

Serina Ser S
Treonina Thr T
Cistena Cys C
Asparagina Asn N
Glutamina Gln Q
Grupos R carregados
positivamente

Lisina Lys K
Histidina His H
Arginina Arg R
Grupos R carregados
negativamente

Aspartato Asp D
Glutamato Glu E

Designados por
abreviaes por um
smbolo (armazenamento
digital).
Quiralidade
Todos os aminocidos primrios, exceto a glicina, possuemumgrupo R
diferentedosgruposamino, carboxilaeH.
Aminocidos
Todas as molculas quepossuemcentro quirais so opticamenteativas, ou
seja, desviamoplanodaluzplanopolarizada
Glicina Centro quiral
C quiral
C assimtrico
L-Alanina D-Alanina
Enantimeros
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Quiralidade (Configurao X Conformao)
Aminocidos
Lisina
Configurao: arranjo espacial de uma molcula orgnica que lhe
conferido pela:
- presenadeduplasligaesemtornodasquaisnohliberdadederotao
(cisetrans, ZouE);
- pela presena de centros quirais , ao redor dos quais os tomos esto
distribudosdeumamaneiraespecfica(estereoismeros).
Conformao: Refere-se ao arranjo espacial dos grupos substituintes
que so livres para assumir diferentes posies no espao sema quebra de
qualquer ligao, devido liberdade de rotao da mesma.
Y
X X
Y
X
Y X
Y
cis trans
Quiralidade
Estereoismeros: Ismeros configuracionais
Aminocidos
Enantimeros
L-Alanina D-Alanina
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Quiralidade
Aminocidos
Configurao absoluta:
nomenclatura especial
(sistema L,D)
L-Gliceraldedo D-Gliceraldedo
L-Alanina D-Alanina
Proposta
Fischer 1891
Acar de 3 C
Tambm pode
ser usado o
sistema R,S
R S
COO-
CH
3
H
N H
3
+
1
2
3
S
Nem sempre os
ami nocidos L so
l evorrotatri os
e D dextrorrotatrio
(poi s dependem do
resto da cadei a)
Leva em
considerao
apenas os 3 C
Aminocidos
Os D-aminocidos foram
encontrados em pequenos peptdeos
da parede celular de clulas
bacterianas.
As clulas podem sintetizar apenas
esses ismeros L pois os stios ativos das
enzimas so assimtricos
(estereoespecificidade).
Molculas Molculas proticas proticas
L-aminocidos
Antibiticos
Parede celular (bactrias)
D-aminocidos
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Classificao dos Aminocidos pelo grupo R (estruturas
predominante empH=7,0)
Aminocidos
Aminocidos
Lembrando que a Ser e Thr
contribuem com o
metabolismo (sinalizao);
e com o stio de ligao para
oligossacardeos nas
glicoprotenas.
Classificao dos Aminocidos pelo grupo R (estruturas
predominante empH=7,0)
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Aminocidos
Classificao dos Aminocidos pelo grupo R (estruturas
predominante empH=7,0)
Absorbncia em 280nm-
importante para caracterizao de
protenas
Estabilizadapor
ligao dissulfeto
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Acistena oxidada para formar umaminocido dimrico (duas
molculas idnticas) covalentemente ligado chamado de cistina.
Aminocidos
Ligao dissulfeto
Ligaes dissulfeto
exercem um papel
especial nas
estruturas de muitas
protenas pela
juno de cadeias
polipeptdicas.
Aminocidos
Classificao dos Aminocidos pelo grupo R (estruturas
predominante empH=7,0)
Hi sti na: possui um pKa
(6,0, grupo R) prxi mo
da neutral i dade, pode
estar carregada
posi ti vamente quanto
no carregada (pH 7,0).
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Aminocidos
Classificao dos Aminocidos pelo grupo R (estruturas
predominante empH=7,0)
Aminocidos incomuns (pH-=7,0)
Aminocidos
Todos so derivados dos
aminocidos comuns:
Como a demosina formada a
partir de 4 resduos de Lys.
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Aminocidos incomuns (pH-=7,0)
Aminocidos
Alguns dos aminocidos podem
sofrer modificaes estruturais
reversveis envolvidas na regulao
proteica;
A fosforilao o tipo de
regulao mais comum.
Aminocidos incomuns (pH-=7,0)
Aminocidos
A Ornitina e Citrulina no so encontradas em protenas;
So intermedirios na biossntese da arginina e no ciclo da ureia.
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Propriedades cidas e bsicas dos aminocido
Aminocidos
Forma
no-inica
Forma
zwitterinica
Quando um aminocido
dissolvido na gua
on
dipolar
zwitterion (do
alemo, on hbrido)
Forma que
Predomina em pH
neutro
Pode agir como um cido
(doador de prtons)
Pode agir como uma base
(receptor de prtons)
Anfteros ou Anflitos
(eletrlitos anfteros)
Propriedades cidas e bsicas dos aminocido
Aminocidos
cido diprtico
Um -aminocido
simples
monocarboxlico
Forma totalmente protonada
Carga
lquida: +1 0 -1
Forma Catinica Zwitterion (Neutra) Forma Aninica
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Propriedades cidas e bsicas dos aminocido
Aminocidos
Efeito do Ambiente Qumico no pKa
Propriedades cidas e bsicas dos aminocido
Aminocidos
Titulao de aminocidos
pI=
1
/
2
(pK
1
+pK
2
)
pK
1
e pK
2
correspondem ao pKa
pKa=- log [Ka
+
]
Ka=[H
+
].[A
-
]/[HA]
HA H
+
+A
-
pI
pH isoeltrico (aminocido
na forma neutra
pI
Equivalentes de H
+
Equivalentes de OH
-
Equivalentes de OH
-
adicionados
Equivalentes de H
+
adicionados
Equao de
Henderson-
Hasselbalch
Ponto isoeltrico
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Propriedades cidas e bsicas dos aminocido
Aminocidos
Titulao de aminocidos com o grupo R ionizvel
Equivalentes de OH
-
adicionados Equivalentes de OH
-
adicionados
Peptdeos
Ligao peptdica: ligao covalente entre duas molculas de aminocidos
Reao de Condensao
So formados pela juno de Aminocidos
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A ligao peptdica CN um pouco mais curta
que a ligao CN em uma amina simples (lig.
rgida).
Gerao de um pequeno dipolo eltrico
Peptdeos
Aligao peptdica plana
Peptdeos
Aligao peptdica plana
A grande maioria dos ligaes peptdicas esto na forma trans
(180
o
): evita colises estricas desfavorveis que acontecero na
conformao cis;
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Peptdeos
Oligopeptdeo: Unio de um pequeno n
o
. de
aminocidos
Polipeptdeos: unio de muitos aminocidos
2 aminocidos (dipeptdeo), 3 (tripeptdeo), 4 (tetrapeptdeo) e etc.
(PM < 10.000 u)
Extremidade
carboxiterminal
Extremidade
aminoterminal
Pentapeptdeo serilgliciltirosilalanileucina, ou Ser-Gly-Tyr-Ala-Leu (Sempre
Nomeados a partir do NH
3
+
terminal)
Peptdeos
Os peptdeos podem ser distinguidos pelos seus comportamentos de ionizao
Ala-Glu-Gly-Lys
Alanil-glutamil-glicil-lisina
Existe apenas um grupo -amino e -
carboxil livre nesse pentapeptdeo
(terminais)
Os demais esto realizando ligaes
peptdicas e no contribuem para o
carter cido-base
Os grupos R se ionizam e contribuem
(peptdeos tambmpossuemcurvas
de titulao e pI caractersticos)
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Peptdeos
Existem muitos: antibiticos provenientes de fontes naturais que so
peptdeos, assim como alguns venenos encontrados em cogumelos
amanitina
Amanita muscaria
Provoca danos hepatocel ul ares e a
fal nci a renal .
Peptdeos
Insulina: um pequeno peptdeo encontrado nos seres vivos
(hormnio responsvel pela reduo da taxa de glicose no sangue)
Massa relativa= 5,733 u, sendo 21 aminocidos na Cadeia A e 30 na Cadeia B
Produo Industrial
(tcnicas de biotecnologi a)
Bactrias Escherichia coli
modificao gentica (gene humano responsvel
pela produo da insulina)
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L-aspartil-L-fenilalanina metil ster
(Aspartame, doce)
L-aspartil-D-fenilalanina metil ster
(amargo)
Aspartame: um dipeptdeo comercial sinttico (adoante)
Peptdeos

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