Estudos de Expresso Gnica e Possibilidades de Aplicao no Melhoramento Gentico de Pessegueiro
[Prunus persica (L.) Batsch] Documentos 370 Estudos de Expresso Gnica e Possibilidades de Aplicao no Melhoramento Gentico de Pessegueiro [Prunus persica (L.) Batsch] Embrapa Clima Temperado Pelotas, RS 2013 ISSN 1516-8840 Dezembro, 2013 Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuria Embrapa Clima Temperado Ministrio da Agricultura, Pecuria e Abastecimento Miriam Valli Bttow Sandro Bonow Exemplares desta publicao podem ser adquiridos na: Embrapa Clima Temperado BR 392 Km 78 Caixa Postal 403, CEP 96010-971- Pelotas, RS Fone: (53) 3275-8100 Home page: www.cpact.embrapa.br E-mail: cpact.sac@embrapa.br Comit Local de Publicaes Presidente: Ariano Martins de Magalhes Jnior Secretria - Executiva: Brbara Cosenza Membros: Mrcia Vizzotto, Ana Paula Schneid Afonso, Giovani Theisen, Luis Antnio Suita de Castro, Flvio Luiz Carpena Carvalho. Suplentes: Isabel Helena Vernetti Azambuja e Beatriz Marti Emygdio. Superviso editorial: Antnio Luiz Oliveira Heberl Reviso de texto: Ana Luiza B. Viegas Normalizao bibliogrfca: Fbio Lima Cordeiro Editorao eletrnica: Renata Abreu Serpa Autor(a) foto da capa: Miriam Valli Bttow 1 edio (2013) Todos os direitos reservados A reproduo no autorizada desta publicao, no todo ou em parte, constitui violao dos direitos autorais (Lei N 9.610). Dados Internacionais de Catalogao na Publicao (CIP) Embrapa Clima Temperado Valli Bttow, Miriam Estudos de expresso gnica e possibilidades de aplicao no melhoramento gentico de pessegueiro [Prunus persica (L.) Batsch] / Miriam Valli Bttow e Sandro Bonow Pelotas: Embrapa Clima Temperado, 2013. 27p. (Embrapa Clima Temperado. Documentos, 1516-8840, 370) 1. Biologia Molecular. 2. Expresso Gnica. 3. Melhoramento gentico vegetal. 4. Pssego. I. Bonow, Sandro. II. Ttulo. III. Srie.
CDD 572.865 Embrapa 2013 Autores Miriam Valli Bttow Biloga, D.Sc. em Gentica e Biologia Molecular, pesquisadora da Fepagro Serra do Nordeste, Caxias do sul, RS, miriam-buttow@fepagro. rs.gov.br Sandro Bonow Engenheiro-agrnomo, D.Sc em Agronomia, pesquisador da Embrapa Clima Temperado, Pelotas, RS, sandro.bonow@embrapa.br Apresentao O pessegueiro uma das espcies frutferas de maior relevncia em regies de clima temperado. O Estado do Rio Grande do Sul possui uma tradio de mais de 50 anos de pesquisa em melhoramento gentico de pssego, visando sempre cultivares mais adaptadas s condies edafoclimticas e aos interesses dos consumidores. Nas ltimas dcadas, o desenvolvimento de inmeras tcnicas de biologia molecular tem ajudado a enfrentar alguns dos maiores desafos desta cultura, como por exemplo maior qualidade de fruto, propriedades nutricionais e funcionais e durabilidade ps-colheita. Em locais com invernos amenos, no entanto, a produtividade pode ser ameaada devido necessidade que esta cultura tem de acumular horas de frio antes da forao. Este documento revisa alguns aspectos bsicos da biologia molecular e mostra como as pesquisas mais recentes nesta rea podem ser importantes para o avano no melhoramento gentico de diversas espcies, especialmente o pessegueiro. Clenio Nailto Pillon Chefe-Geral Embrapa Clima Temperado Sumrio Introduo....................................................................................9 Conceitos bsicos de biologia molecular.........................................11 Os cidos nucleicos.................................................................11 Da sequncia de DNA sntese proteica......................................13 Estudos de expresso gnica em plantas........................................14 RT-qPCR: uma abordagem para estudos de expresso gnica............16 Oportunidades de pesquisa com expresso gnica em pessegueiro....17 Consideraes finais....................................................................19 Referncias.................................................................................19 Estudos de Expresso Gnica e Possibilidades de Aplicao no Melhoramento Gentico de Pessegueiro [Prunus persica (L.) Batsch] Introduo Miriam Valli Bttow Sandro Bonow O ramo da Biologia conhecido como biologia molecular possui especial foco na estrutura e funo dos cidos nucleicos DNA e RNA e seus produtos de expresso, as protenas. Nas ltimas dcadas, o advento das tecnologias de sequenciamento e o mapeamento completo do genoma de muitas espcies de plantas cultivadas, tornou o estudo dos genomas uma tarefa muito mais interessante e fortemente aplicvel para o melhoramento. A pesquisa em expresso gnica, por sua vez, dedicada ao estudo de como, quando e quanto os genes, contidos no DNA, so expressos ao longo do desenvolvimento e em resposta a estresses biticos e/ ou abiticos. De modo geral, cada clula vegetal contm os mesmos genes. A diferena entre as clulas da folha em relao s presentes nas fores, por exemplo, o nvel de expresso destes genes. Simplifcadamente, a informao que est contida nos genes (DNA) da planta transcrita em RNA. O RNA, ento, traduzido em protenas. Variaes das quantidades de transcritos (informao contida no RNA) e do contedo de protenas faz com que as clulas sejam, em ltima anlise, diferentes. Da mesma forma, cultivares de uma mesma espcie possuem diferenas na expresso de seus genes, sendo que a identifcao de 10 Estudos de Expresso Gnica e Possibilidades de Aplicao no Melhoramento Gentico de Pessegueiro [Prunus persica (L.) Batsch] genes de interesse diferencialmente expressos entre cultivares pode ser um caminho efciente na seleo precoce de gentipos promissores para o melhoramento (LEIDA et al., 2012b). Nos estudos de expresso gnica, uma das tcnicas que se destacam atualmente a tcnica RT- qPCR (do Ingls quantitative reverse-transcriptase polymerase chain reaction). Esta tcnica permite a identifcao da presena de RNAs especfcos de um gene, alm da sua quantifcao, possibilitando estudos de expresso diferencial, ou seja, quais genes apresentam alterao na expresso quando a planta est em determinada condio ou ambiente (BUSTIN et al., 2005). As espcies frutferas de clima temperado, como o pessegueiro, tm um perodo de dormncia que permite que as plantas suportem temperaturas muito frias. O preparo das plantas para as condies desfavorveis compreende o acmulo de reservas, a perda de rgos sensveis (como as folhas) e o desenvolvimento de estruturas que protegem os meristemas. Portanto, no perodo de dormncia acontecem vrios eventos que iniciam pela induo e terminam na superao da dormncia. A regularidade de baixas temperaturas durante o perodo hibernal fundamental para a induo e adequada superao da dormncia. O suprimento inadequado em frio para espcies de clima temperado determina a ocorrncia de problemas relacionados brotao, afetando o potencial produtivo destas espcies. Dentre as principais estratgias utilizadas para minimizao dos problemas decorrentes do insufciente acmulo de frio, destaca- se a seleo e uso de cultivares de menor requerimento em frio (HAWERROTH et al., 2010). Erez (2000) enfatiza que o aspecto mais crtico no cultivo de espcies frutferas de clima temperado em zonas com baixo acmulo de frio hibernal a superao da dormncia de forma natural. Por outro lado, tanto a induo como a superao da dormncia podem ter problemas. No primeiro caso, por ela acontecer tarde demais, podendo resultar em danos a rgos que no estavam preparados. J na superao da dormncia, existe o risco de que esta ocorra demasiado cedo e as gemas (e ou fores) sejam danifcadas por geadas. Os programas de melhoramento em pessegueiro tm 11 Estudos de Expresso Gnica e Possibilidades de Aplicao no Melhoramento Gentico de Pessegueiro [Prunus persica (L.) Batsch] trabalhado intensamente no sentido de desenvolver cultivares com menor necessidade em frio e, portanto, melhor adaptadas a estas condies (HAWERROTH et al., 2010). Entender os processos relacionados com a transcrio e expresso de genes pode abrir novos caminhos para a pesquisa de plantas em clima temperado, aumentando a precocidade e efcincia da escolha de gentipos e selees em programas de melhoramento gentico. Portanto, o objetivo deste trabalho foi reunir aspectos bsicos da biologia molecular, importantes para a compreenso da tcnica de RT- qPCR e seu potencial para estudar os principais alvos da pesquisa e melhoramento em pessegueiro. Conceitos bsicos de biologia molecular Os cidos nucleicos Entre as caractersticas dos organismos vivos, a capacidade de autorreplicao fundamental. A maneira como este processo ocorre, h muito tempo vem sendo objeto de estudo de inmeros pesquisadores. Desde a descoberta do DNA por Friederich Miescher, em 1869, levou muito tempo at que suas funes primordiais de conterem e transmitirem a informao gentica fossem comprovadas por Herschey, em 1953. Ainda em 1953, a estrutura em dupla-hlice foi proposta por Watson e Crick e lanou as bases de como essa molcula poderia ser duplicada. No mesmo laboratrio onde Miescher descobriu o DNA, outra substncia muito semelhante, hoje conhecida como RNA, foi descrita por Hoppe-Seyler (ZAHA et al., 2013). O DNA (cido desoxirribonucleico) e o RNA (cido ribonucleico) constituem os cidos nucleicos, macromolculas de extrema importncia biolgica em todos os organismos vivos. As clulas recebem instrues sobre quais protenas sintetizar e em que quantidade, a partir destas molculas, responsveis por estocar e transmitir a informao gentica na clula. Essa informao decifrada atravs do cdigo gentico, cuja traduo resulta na sntese 12 Estudos de Expresso Gnica e Possibilidades de Aplicao no Melhoramento Gentico de Pessegueiro [Prunus persica (L.) Batsch] proteica. Portanto, conter a informao gentica signifca no somente armazenar e transmitir ao longo das geraes, mas expressar, ou seja, servir de molde para a sntese de RNAs e alguns desses serem traduzidos nas protenas correspondentes (TURNER et al., 2004; ZAHA et al., 2013). Em contraste com o DNA, diferentes tipos de RNA esto presentes na clula e desempenham funes especfcas. Os RNAs so classifcados de acordo com a sua localizao e sua funo na clula: O mRNA (RNA mensageiro) transfere a informao gentica do DNA aos ribossomos, stio da sntese de protenas; o rRNA (RNA ribossomal) o componente majoritrio dos ribossomos e o tRNA (RNA transportador) carrega os resduos de aminocidos at os ribossomos para a sntese de protenas (TURNER et al., 2004). No incio dos anos 1950, Francis Crick sugeriu que haveria um fuxo unidirecional de informao gentica do DNA atravs do RNA para uma protena, ou seja, o DNA faz um RNA que faz uma protena. Esta sentena fcou conhecida como dogma central da biologia molecular. Atualmente se reconhece que a ampla confana no dogma central correta, embora existam vrias modifcaes no esquema bsico. A via primria permanece do DNA para o RNA para a protena. Tanto nas clulas procariticas quanto nas eucariticas, o DNA transcrito para uma molcula de mRNA e, ento, a mensagem traduzida em uma sequncia de protena conforme o cdigo gentico. Entretanto, existem algumas excees a este esquema bsico. Diversas classes de vrus contm um genoma que consiste em uma molcula de RNA. Em retrovrus, por exemplo no HIV, a molcula uniflamentar de RNA convertida em DNA de dupla hlice. Este processo conhecido como transcrio reversa, e a enzima responsvel - codifcada no genoma viral, chamada de transcriptase reversa. O uso de transcriptases reversas (RT) derivadas de vrus em inmeras tcnicas de laboratrio revolucionou a biologia molecular (TURNER et al., 2004). A sntese de DNA e RNA ocorre por processos semelhantes, 13 Estudos de Expresso Gnica e Possibilidades de Aplicao no Melhoramento Gentico de Pessegueiro [Prunus persica (L.) Batsch] entretanto, a funo biolgica de cada um desses processos bastante diferente. Uma sequncia particular de DNA, codifcadora de uma informao ou protena, corresponde a um gene. J o conjunto de genes de um organismo, o genoma, possui sempre a mesma funo bsica, que de servir como repositrio replicativo da informao codifcada pelo DNA que o constitui. Enquanto a sntese de DNA deve ser precisa e uniforme, a transcrio espelha o estado fsiolgico da clula e, portanto, extremamente varivel para atender s suas necessidades. Assim, a sequncia de mRNA alterada aps ser transcrita do DNA, em um processo de edio do RNA, de modo que a sequncia do DNA no integralmente usada para codifcar o produto proteico (TURNER et al., 2004). Diversos avanos signifcativos tm sido obtidos atravs do isolamento, anlise e sntese de sequncias de DNA e de genes, e da introduo desses DNAs recombinantes em clulas vivas para o estudo da sua funo e dos mecanismos que controlam sua expresso. Atualmente, os esforos esto voltados para o entendimento das relaes entre cidos nucleicos e protenas que resultam em, virtualmente, todos os eventos genticos na clula (TURNER et al., 2004; WANG et al., 2010; ARS et al., 2012). Da sequncia de DNA sntese proteica Os cidos nucleicos possuem papel fundamental no armazenamento e transmisso da informao gentica. O processo da cpia de regies especfcas de DNA (os genes) numa molcula de mRNA e a passagem da informao contida na sequncia de nucleotdeos desse mRNA para uma sequncia de aminocidos, resulta na expresso dos genes contidos em determinado organismo, ou expresso gnica. As molculas de RNA so sintetizadas por um processo de transcrio, similar replicao do DNA. A transcrio deve ser iniciada e terminada em pontos especfcos da sequncia do DNA, e a clula controla quando determinadas sequncias devem ser transcritas e quanto RNA deve ser sintetizado. Nesse processo, uma das duas 14 Estudos de Expresso Gnica e Possibilidades de Aplicao no Melhoramento Gentico de Pessegueiro [Prunus persica (L.) Batsch] ftas do DNA atua como modelo para que o pareamento de bases complementares possa acontecer. O mRNA, ento transcrito, dirige a sntese da molcula proteica. Em uma determinada clula e em determinado momento, alguns genes so utilizados para transcrever RNA em grandes quantidades, enquanto outros podem ser pouco ou no so transcritos. A partir de um gene ativo, grandes quantidades de mRNAs podem ser sintetizados em cada clula. Alm disso, cada molcula de mRNA pode ser traduzida em milhares de cpias de uma cadeia polipeptdica, isto , a informao contida numa pequena regio do DNA pode dirigir a sntese de milhares de cpias de uma protena especfca (ZAHA et al., 2013). Portanto, a transcrio representa a diversidade e a complexidade da expresso dos genes contidos em um determinado genoma. Este conjunto de transcritos de uma clula ou conjunto de clulas, incluindo mRNAs que codifcam protenas, e RNAs pequenos no codifcantes, como RNA ribossomal e RNA transportador, formam o transcriptoma (TURNER et al., 2004). As propriedades biolgicas de cada tipo de clula so amplamente determinadas pelas protenas expressas dentro dela. Este conjunto de protenas expressas importante para a arquitetura celular, para as atividades enzimticas, as interaes com o ambiente, e diversas outras propriedades fsiolgicas. No entanto, em determinado momento da vida da clula, apenas uma frao dos RNAs e protenas codifcadas em seu genoma expressa. Em momentos diferentes, o perfl dos produtos expressos pode diferir marcantemente, tanto em tipos de protenas como em que nveis so expressas. A maioria da regulao gnica tida como ocorrendo atravs da transcrio gnica. O mecanismo bsico pelo qual a expresso gnica regulada depende dos sinais moleculares de fora ou de dentro da clula, os quais levam ligao de protenas reguladoras a stios especfcos do DNA, e a ligao destas protenas modula a taxa de transcrio (GRIFFITHS et al., 2008). Estudos de expresso gnica em plantas As plantas possuem a habilidade de alterar consideravelmente seus 15 Estudos de Expresso Gnica e Possibilidades de Aplicao no Melhoramento Gentico de Pessegueiro [Prunus persica (L.) Batsch] padres de expresso gentica em resposta a alteraes ambientais como temperatura, disponibilidade de gua e ataque por patgenos (NICOT et al., 2005; WINFIELD et al., 2010). O ambiente percebido pelas plantas atravs de um sinal particular, o qual pode ser ou no especfco de algum tipo de estresse. Essa pista na transcrio de um sinal dentro da planta a leva a amplas mudanas no metabolismo celular, envolvendo mudanas na expresso de centenas de genes. Algumas vezes, estas alteraes transcricionais so adaptaes bem sucedidas que levam tolerncia, enquanto que em outras situaes, a planta acaba falhando em se adaptar e tida como suscetvel determinada condio. Um perfl de expresso pode, portanto, defnir respostas sensveis e tolerantes (HAZEN et al., 2003). A anlise do transcriptoma auxiliou a melhor compreenso das respostas das plantas a diferentes tipos de estresse e, atravs destes estudos, numerosos genes de resposta a estresse foram descobertos. A sobreposio de genes induzidos sob vrias condies sugere que existam interseces entre as vias de sinalizao (NICOT et al., 2005). O tempo tambm outro fator crtico na regulao da transcrio. Alguns genes tm sua expresso aumentada em determinado perodo e depois continuam no mesmo nvel, enquanto que outros so ligados e desligados. Em plantas de aveia estressadas por sal, foram descritos quatro estdios de mudana de expresso: resposta instantnea, resposta precoce, recuperao precoce e compensao do estresse. Neste caso, acessos suscetveis obtiveram respostas similares aos acessos tolerantes, porm responderam de forma mais lenta. Portanto, aparentemente, a regulao rpida da transcrio foi responsvel pela tolerncia a sal nos gentipos estudados (KAWASAKI et al., 2001). Ainda, a descoberta de que existem mudanas de expresso gnica durante a aclimatao no frio levou ao conhecimento detalhado de uma das mais bem compreendidas rotas metablicas de respostas a estresses abiticos (HAZEN et al., 2003; WINFIELD et al., 2010). Da mesma forma, outros tipos de estresse podem ser explorados na busca por uma correlao entre a expresso gnica e os mecanismos de 16 Estudos de Expresso Gnica e Possibilidades de Aplicao no Melhoramento Gentico de Pessegueiro [Prunus persica (L.) Batsch] tolerncia e suscetibilidade em diferentes espcies e gentipos. As mudanas no transcriptoma so, em grande parte, tecido- especfcas. Esta uma condio esperada, j que muitos tipos de estresse so tambm tecido-especfcos. Razes, por exemplo, percebem fontes de estresse provenientes do solo, enquanto que temperaturas extremas so percebidas pela biomassa acima do solo. Alm disso, fsiologicamente, razes e ramos respondem seca de formas diferentes. As razes podem continuar o alongamento, enquanto que o crescimento dos ramos pode ser completamente inibido. A consequncia desta resposta diferencial que as razes podem buscar gua em solo mais profundo, enquanto que os ramos sem crescimento conservam o consumo de gua. Assim sendo, fca evidente que existem diferenas entre tecidos e rgos em resposta a estresse (HAZEN et al., 2003). Em muitas espcies arbreas perenes, a superao da dormncia responde ao acmulo sazonal de horas de frio e diversos estudos recentes usaram abordagens globais a fm de analisar os mecanismos moleculares deste processo. Os perfs de expresso durante a induo, manuteno e superao da dormncia foram realizados em espcies como Populus tremula, carvalho, framboesa, videira, pssego e damasco. Estes estudos descreveram um conjunto inicial de genes candidatos envolvidos na induo de dormncia por frio e luminosidade em espcies arbreas (JIMNEZ et al., 2010). Em pssego, alguns fatores de transcrio codifcados por uma famlia de genes conhecida como DORMANCY ASSOCIATED MADS-box (DAM) esto relacionados com esta rota metablica, porm outros elementos regulatrios ainda no foram identifcados. Alm disso, a regulao dos genes DAM ainda no conhecida a nvel molecular. A expresso de alguns genes desta famlia, relacionados com o cido abscsico e estresse por seca, esto tambm correlacionados com o processo da dormncia em cultivares de pssego (LEIDA et al., 2012a). O entendimento das respostas regulatrias das plantas aos diferentes 17 Estudos de Expresso Gnica e Possibilidades de Aplicao no Melhoramento Gentico de Pessegueiro [Prunus persica (L.) Batsch] tipos de condies ambientais tem aplicao direta no melhoramento gentico das plantas (HAZEN et al., 2003). Existe um grande potencial para melhorar a tolerncia ao estresse atravs tanto da engenharia gentica quanto do melhoramento convencional. Os estudos de perfs de transcrio podem aumentar o conhecimento de rotas metablicas de resposta a estresse e fornecer novos caminhos para a avaliao e seleo de gentipos. RT-qPCR: Uma abordagem para estudos de expresso gnica A quantifcao dos nveis de expresso gnica um passo fundamental em, virtualmente, todos os aspectos da biologia molecular. Alm disso, particularmente importante quando genes que so expressos especifcamente sob certas condies ambientais devem ser comparados. Entre as tcnicas comuns para avaliar nveis de expresso gnica destacam-se a hibridizao Northernblot e a PCR mediada por transcriptase reversa. Ambas as tcnicas so prticas para a anlise de pequenos conjuntos de genes e so complementadas pela anlise de microarranjos, a qual rotineiramente utilizada em perfs de expresso globais, em larga escala (HONG et al., 2008). Recentemente a RT-qPCR tem sido o mtodo de escolha para medir os nveis de expresso em mltiplas amostras, envolvendo um limitado nmero de genes (BUSTIN et al., 2010). A tcnica de RT-qPCR tornou-se extremamente til para a deteco e quantifcao dos nveis de transcrio do RNA mensageiro mRNA de determinado gene de interesse, devido sua alta sensibilidade, especifcidade e reprodutibilidade, pela facilidade de dispensar o ps-processamento do PCR e permitir uma comparao direta entre RNAs que diferem muito em abundncia. A base desta tcnica reside no processo de transcrio reversa (RT) seguida da reao em cadeia da polimerase (PCR) com a incorporao de molculas fuorescentes covalentemente ligadas ou no a nucleotdeos, as quais podem ser quantifcadas durante a cintica da reao (em tempo real). Os produtos formados so monitorados a cada ciclo de reao, o que permite uma deteco rpida e especfca dos produtos de amplifcao. Esta tcnica fornece uma acurada e sensvel quantifcao dos transcritos, mesmo em genes com nveis de 18 Estudos de Expresso Gnica e Possibilidades de Aplicao no Melhoramento Gentico de Pessegueiro [Prunus persica (L.) Batsch] expresso muito baixos e atualmente o mtodo que apresenta maior sensibilidade e especifcidade na anlise de transcritos (GACHON et al., 2004; HONG et al., 2008). Para quantifcar a expresso gnica acuradamente, muitas variaes experimentais devem ser levadas em conta: qualidade e quantidade do material inicial, presena de inibidores em diferentes materiais amostrais, desenho de primers (iniciadores), extrao de RNA e efcincia de retrotranscrio. A seleo de um gene mais estvel ou um conjunto de genes para serem usados como controle interno tambm um passo crtico para controlar a variabilidade entre amostras para estudos de expresso gnica quantitativa com a tcnica de RT-qPCR (TONG et al., 2009). Idealmente, o gene de referncia e o gene alvo devem ter intervalos similares de expresso nas amostras utilizadas (VANDESOMPELE et al., 2002). Desde ento, foram estudados genes de referncia para muitas culturas, como por exemplo arroz (JAIN et al., 2006), feijo (BORGES et al., 2012), ervilha (DIE et al., 2010), pssego (TONG et al., 2009), algodo (ARTICO et al., 2010), entre outras. Estes estudos mostraram que muitas vezes no possvel encontrar um gene de referncia que atinja todas as exigncias de normalizao, o que pode levar a erros signifcativos de interpretao dos resultados. Assim, atualmente recomendado utilizar de dois a trs genes de referncia em cada estudo. Os genes mais comuns utilizados como referncia so o 18S ribossomal, (18S rRNA), -actina (ACT) e o gliceraldedo-3-fosfato desidrogenase (GAPDH). Ainda assim, a seleo adequada de genes de referncia ir depender sempre da natureza e mbito do experimento a ser realizado (HUGGETT et al., 2005; NICOT et al., 2005; TONG et al., 2009). Oportunidades de pesquisa com expresso gnica em pessegueiro O pessegueiro (Prunus persica L. Batsch) a espcie mais bem caracterizada geneticamente dentro da famlia Rosaceae. De relevante 19 Estudos de Expresso Gnica e Possibilidades de Aplicao no Melhoramento Gentico de Pessegueiro [Prunus persica (L.) Batsch] importncia econmica, a terceira fruta de clima temperado em rea cultivada. Algumas caractersticas a tornam interessantes como uma espcie modelo entre as espcies frutferas arbreas, como por exemplo o sistema de cruzamento autocompatvel e um perodo juvenil relativamente curto (2 a 3 anos). Alm disso, uma espcie diploide com n=8 e um genoma pequeno, estimado em 0,61 pg de DNA por ncleo diploide e equivalente a cerca de 300 Mpb por genoma haploide (ARS et al., 2012). No Brasil, os programas de melhoramento gentico em pessegueiro tm trabalhado intensamente no sentido de desenvolver cultivares mais adaptadas s condies de inverno ameno, isto , com mais baixa necessidade de frio (BYRNE, 2010). A Embrapa Clima Temperado possui uma longa tradio no melhoramento de pssego, sendo que grande parte das variedades atualmente cultivadas so oriundas desta instituio (RASEIRA et al., 2008). Com o sequenciamento completo do genoma do pessegueiro em 2010 (ARS et al., 2012) e a disponibilidade de um enorme nmero de sequncias expressas (ESTs, do Ingls expressed sequence tags) em bancos de dados, foram impulsionadas vrias oportunidades de estudos relacionados ao genoma e ao transcriptoma em Prunus. Alguns trabalhos em Prunus tm buscado testar genes candidatos envolvidos em diferentes rotas metablicas de caractersticas de interesse agronmico via estudos de ESTs (TITTARELLI et al., 2009; VIZOSO et al., 2009), porm, outras alternativas, como por exemplo, via estudos de sequncias homlogas de espcies utilizadas como modelo deve ser considerada. Uma vez identifcados os genes candidatos, esses podem ser validados via estudos de expresso gnica. A grande maioria dos estudos de expresso gnica em pessegueiro busca genes associados qualidade de frutos e durabilidade durante o armazenamento e transporte. Em muitas situaes, o armazenamento refrigerado utilizado como uma alternativa para desacelerar o amadurecimento e aumentar a durabilidade do fruto. No entanto, 20 Estudos de Expresso Gnica e Possibilidades de Aplicao no Melhoramento Gentico de Pessegueiro [Prunus persica (L.) Batsch] este tipo de armazenamento pode ter efeitos negativos na qualidade de fruto, resultando em problemas como escurecimento e injria mecnica. Neste sentido, pesquisas recentes buscam encontrar genes ou grupos de genes diferencialmente expressos em resposta a fatores de ps-colheita (VIZOSO et al., 2009). Durante o armazenamento refrigerado, os genes dos frutos so expressos diferencialmente e associados com a aclimatao no frio (TITTARELLI et al., 2009). Outros trabalhos buscam em marcadores de sequncias expressas genes envolvidos na qualidade de fruto e estes genes so validados atravs de anlises de RT-qPCR (OGUNDIWIN et al., 2008). Entre as caractersticas estudadas via expresso gnica em Prunus, no so encontrados na literatura estudos substanciais envolvendo a tolerncia ao calor em pessegueiro (MARTNEZ-GMEZ et al., 2011). Isso explicado por esse estresse ser um problema, ao menos at o momento, apenas para alguns pases e regies do mundo, incluindo o Brasil. Existem, no entanto, estudos que buscam relacionar a necessidade de horas de frio para superao da dormncia com a expresso diferencial de genes. Um melhor conhecimento dos genes envolvidos na manuteno e superao da dormncia pode fornecer ferramentas genticas para o acesso precoce desta caracterstica em programas de melhoramento gentico. Estudos recentes sobre os aspectos moleculares da dormncia forneceram uma descrio inicial de genes candidatos envolvidos na manuteno e superao da dormncia de gemas em pessegueiro. Os resultados indicam que a anlise da expresso gnica pode contribuir para estimar a necessidade de horas de frio para superao da dormncia em novas cultivares (LEIDAet al., 2012b). Consideraes fnais O melhoramento gentico tem alcanado um grande sucesso nas ltimas dcadas, atravs do melhoramento de caractersticas agronmicas (produtividade, qualidade de fruto, resistncia a insetos e doenas) por cerca de um sculo. O advento da era genmica abriu novas oportunidades, ajudando no melhoramento de cultivares com 21 Estudos de Expresso Gnica e Possibilidades de Aplicao no Melhoramento Gentico de Pessegueiro [Prunus persica (L.) Batsch] tcnicas moleculares e engenharia gentica (ARS et al., 2012) O contexto atual de, por um lado, uma maior demanda por alimentos funcionais e com qualidade nutritiva superior, e, por outro, a percepo do aumento da temperatura global nos ltimos cem anos (ROOT, 2003), desafa a pesquisa em pessegueiro, em busca de gentipos superiores e bem adaptados a estas condies climticas. Estes eventos, mais do que difculdades, representam oportunidades para o desenvolvimento cientfco, to importante para a cadeia produtiva do pssego na regio e no Pas. Referncias ARTICO, S.; NARDELI, S. M.; BRILHANTE, O.; GROSSI-DE-SA, M. F.; ALVES-FERREIRA, M. Identifcation and evaluation of new reference genes in Gossypium hirsutum for accurate normalization of real-time quantitative RT-PCR data. 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