El documento describe las propiedades y clasificación de los aminoácidos. Existen 20 aminoácidos que se diferencian por su orden y cadena lateral. Algunos tienen funciones catalíticas, de defensa, estructurales o de transporte. Los aminoácidos se clasifican en polares, no polares, aromáticos y azufrados dependiendo de su cadena lateral. La cisteína forma puentes disulfuro que estabilizan las proteínas. El pH afecta la carga neta de los aminoácidos.
El documento describe las propiedades y clasificación de los aminoácidos. Existen 20 aminoácidos que se diferencian por su orden y cadena lateral. Algunos tienen funciones catalíticas, de defensa, estructurales o de transporte. Los aminoácidos se clasifican en polares, no polares, aromáticos y azufrados dependiendo de su cadena lateral. La cisteína forma puentes disulfuro que estabilizan las proteínas. El pH afecta la carga neta de los aminoácidos.
El documento describe las propiedades y clasificación de los aminoácidos. Existen 20 aminoácidos que se diferencian por su orden y cadena lateral. Algunos tienen funciones catalíticas, de defensa, estructurales o de transporte. Los aminoácidos se clasifican en polares, no polares, aromáticos y azufrados dependiendo de su cadena lateral. La cisteína forma puentes disulfuro que estabilizan las proteínas. El pH afecta la carga neta de los aminoácidos.
Tienen funciones catalticas en forma de enzimas, de defensa como anticuerpos, estructurales como el
colgeno, de transporte como la hemoglobina, de almacenamiento como la ferritina, hormonas de origen
peptdico como la insulina glucagn, receptores para hormonas, y las hormonas que mantienen la estructura del ADN dentro del ncleo.
Todas las protenas contienen los mismos 20 aminocidos, lo que cambia es el orden de estos. Todos los aminocidos tienen un grupo carboxilo, un grupo amino y una cadena lateral o grupo R funcional, que es el que nos va a decir si es polar, no polar, y muchas cosas ms. Pueden haber varios ismeros como la isomera L y la isomera D. nuestros aminocidos siempre van a estar en el carbono alfa, por lo tanto nuestros carbonos siempre van ser tipo alfa aminocidos.
Lo primero que hace el organismo al ingerir protenas y romper esas cadenas proteicas, lo primero es absorber los aminocidos esenciales, ya que la capacidad de absorcin de estos aminocidos es mayor que la de otros. La arginina es un aminocido que podemos sintetizar en la vida adulta en el rin, pero en la vida infantil es un aminocido netamente esencial.
Todos nuestros aminocidos son de configuracin L, los aminocidos de configuracin D nos sirve para identificar aquellas protenas que son extraas y comenzar a luchar contra ellas.
Los aminocidos los podemos clasificar en aminocidos polares y aminocidos no polares a pH 7, la glicina al ser muy pequea, tiene un comportamiento polar y no polar al mismo tiempo. Pero se asumir como aminocido no polar, adems es el nico aminocido que no tiene isomera D y L.
Hay aminocidos ramificados que tienen un papel fundamental en la regulacin del metabolismo proteico. Cuando hago degradacin de protenas, estos aminocidos como la valina, tiende a aumentarse porque se degrada muy lentamente y este aumento tiene un efecto inhibitorio sobre la degradacin proteica, entonces es un mecanismo de proteccin para cuando se hace un ayuno prolongado no se vayan a degradar todas las protenas, ya que si degradamos el 30% de nuestras protenas puede estar en riesgo nuestra vida por ende debemos tener un control para esa degradacin.
La metionina y la cisterna son aminocidos azufrados, en el caso de la metionina, es un S que esta metido en medio de la cadena lateral, luego no tiene mucha capacidad reactiva.
Los aminocidos polares se pueden clasificar en 3 grupos:
La cistena que es un aminocido azufrado, este contiene un grupito sulfhidrilo, este grupo fcilmente pierde su hidrogeno fcilmente, entonces se puede asociar con otra cistena formando una molcula que es conocida como cistina que es un aminocido derivado de la misma cistena unida a otra cistena por medio de un puente disulfuro, que tiene un papel claro en la estabilizacin de las protenas, estos puentes disulfuro pueden ser intercatenarios o intracatenarios, por ejemplo las protenas pueden estar formadas por una cadena polipeptdica o por varias cadenas polipeptdicas, la insulina esta formada por una sola cadena polipeptdica, y a medida que madura esa cadena se divide; la insulina esta estabilizada por 2 puentes disulfuro que le permite mantener esa configuracin que se quiere mantener en una protena. A veces estos puentes estn entre dos cadenas estabilizando estructuras cuaternarias de las protenas. En algunos ptes se presentan problemas a nivel renal para absorber cistena, entonces los niveles en la orina de la cistena tienden a aumentar, tanto que puede variar el pH de la orina y volverlo alcalino, y esta cistena pueden perder el hidrogeno del grupo sulfhidrilo y crear puentes disulfuro entre las diferentes molculas de cistena y formar la cistina, que a su vez forman cristales. Estos cristales son esos cristales grandes y agudos que tienen forma de aguja que cuando se deposita mucho en los tejidos van a lesionar el mismo tejido y por lo tanto el pte puede sufrir de una insuficiencia renal por esta enfermedad que se llama cistinuria o en el mejor de los casos presentar urolitiasis que son los mismo clculos renales de cistina.
La prolina es un aminocido que la cadena lateral forma un anillo que hace que la prolina sea una aminocido rgido que ya no se llama grupo amino, sino que se llama un grupo imino a diferencia de los otros aminocidos, por lo tanto la prolina es considerada como un iminocido y no un aminocido. Esta rigidez de la prolina Va a tener consecuencias fuertes en la configuracin de la protena y e la forma de la protena. La prolina tiende a estar en protenas como el colgeno.
Aminocidos polares cargados positivamente:
Lisina Arginina Histidina.
La histidina tiene un pK de la cadena lateral cercano a 6, pero cuando hace parte de las protenas esas cadenas laterales tienden a modificar su pH al cual se ionizan, y a la histidina se le aumenta ese pK a 7 (pK plasmtico), y este pK de la histidina tiene propiedades buffer muy importante.
Aminocidos polares cargados negativamente:
cido apartico Acido glutmico
Las cargas de las cadenas laterales tienen una importancia clara ya que las enzimas en su gran mayora son protenas, y estas tienen la capacidad de aumentar la velocidad de reaccin porque se una al sustrato en un sitio activo, que es una parte de la estructura de la protena que es capaz de aceptar el sustrato. Esta interaccin se da a travs de los aminocidos que se exponen en el sitio activo, es decir, si el sustrato es polar, los aminocidos que estn en este sitio activo tbn deben ser polares, y si el sustrato es positivo, los aminocidos en el sitio activo deben ser cargados negativamente y si el sustrato es no polar, el sitio activo debe tener aminocidos no polares. Esa capacidad de los aminocidos de ionizarse, es decir, de ser polares o no polares a determinado pH, tiene mucha importancia tanto para la configuracin de la protena como para su funcin.
Aminocidos aromticos:
Fenilalanina Tiroxina Triptfano
Tienen muchos dobles enlaces, sus anillos les da la cap de absorber luz ultravioleta, mas o menos a 280 nm se encuentra el pico de absorcin de estos aminocidos, si se quiere observar que cantidad de protenas hay en una muestra, simplemente se analiza con el espectrofotmetro.
Aminocidos azufrados:
Metionina Cistena
El S de la metionina no es muy reactivo en comparacin con el de la cistena, que forma fcilmente puentes disulfuro con otras cisternas, que pueden estar asociadas a otras protenas, lo cual va a estabilizar una protena.
Aminocidos no proteicos:
Ornitina y Citrulina: es un aminocido que es un punto medio en el metabolismo de las protenas liberamos mucho amoniaco, el cual se convierte en urea para eliminarlo a travs del ciclo de la urea. En este ciclo se encuentra la ornitina y la citrulina. Tiroxina: a partir de este se hace sntesis de de las hormonas tiroideas. GABA (Acido Gama Amino Butrico): Hace parte de algunos neurotransmisores.
El pH puede hacer variar la estructura de cualquier aminocido, la glicina por ejemplo en un pH muy acido, el grupo amino de la glicina no pierde su H, no pierde su carga; el pK para el grupo amino esta alrededor de 9 y el grupo carboxilo tampoco ha perdido su H ni se ha ionizado y su pK esta alrededor de 2 en todos los aminocidos. Pero al agregarle OH el H del grupo carboxilo se desprende para reaccionar con el OH y producir agua y cuando nos acerquemos 2.34 que es el pk del grupo carboxilo, se va a dividir las cargas entre los aminocidos la mitad si y la otra no. Si se pasa de 2.34, el grupo amino va a perder un H y comienza a cambiar, entre mas se acerque a 9.6 que es el pk del grupo amino va estar sin carga, entonces, se va a dividir las cargas entre los aminocidos la mitad si y la otra no.
La carga neta del aminocido depende del pH de la sln en el que se encuentre, va a tener una carga neta positiva, una carga neutra o una carga negativa. Cada aminocido tiene su comportamiento tpico, porque cada aminocido va a tener un pk propio para cada uno de sus grupos amino y carboxilo. En la condicin en la carga neta del aminocido es neutra (1 carga negativa y una carga positiva) se va a conocer como zweterion (carga neta =0). En esta condicin de zweterion, el aminocido tiende a precipitarse. En ese momento en que se precipita el aminocido y esta en zweterion, se puede conocer el punto o pH isoelctrico del aminocido (PI). Este PI se calcula sacando el promedio del Pk1 (pk del grupo carboxilo) y el pk2 (pk del grupo amino).
OJO: tanto para aminocido como para protenas, si el pH esta por encima del PI, va a tener una carga negativa. Si el pH va a estar por debajo del PI, va a tener una carga positiva.
El acido glutmico tiene en su cadena lateral un grupo carboxilo, la cual es ionizable. Siguiendo con procedimiento de la glicina, se comienza a agregarle OH en pH cero, y vemos que lo primero que se ioniza es el grupo carboxilo (pierde un H y gana una carga negativa), cuando llegamos ando a 2.19 (pk1), se va a dividir las cargas entre los aminocidos la mitad si y la otra no. Al pasarse de 2.19 comienza a ionizarse de derecha a izquierda, por consiguiente se ioniza la cadena lateral, que cuando llega a 4.25 que es el pk de la cadena lateral (pkr), se va a dividir las cargas entre los aminocidos la mitad si y la otra no. Y al seguirle agregando OH y siguiendo de izquierda a derecha, pierde la carga el grupo amino (H) y al acercarnos a 9.67 (pk2), se va a dividir las cargas entre los aminocidos la mitad si y la otra no.
El zweterion como ya sabemos esta en el PI, este se halla tomando los pk que rodean al zweterion, en este caso es el pk1 y el pkr entonces 2.19 (pk1) + 4.25 (pkr) = 6.44 / 2 = 3.22 PI del acido glutmico. El PI no tiene capacidad buffer, solo el pk. El PI es el pH en que el aminocido es menos soluble.
El comportamiento de las protenas va a depender mucho del pH en que la coloquemos, ya que este pH afecta la carga de los aminocidos que se encuentran en el sitio activo, y si afecta estas cargas, va a afectar su capacidad de reaccin o interaccin con el sustrato. Como ya sabemos las enzimas son protenas, por lo tanto las enzimas se ven afectadas por el pH del medio, por lo tanto cada enzima tiene un pH ptimo para poder cumplir su funcin. Ningn pk de los grupos amino o carboxilo de los aminocidos es similar al del pH plasmtico excepto el de la cadena lateral que se acerca, por lo tanto nos interesa solo los pk de las cadenas laterales de estos aminocidos, ya que estas hacen parte de las protenas y lo nico que le queda libre al aminocido es su cadena lateral. El pk de un aminocido se ve afectado tbn por las interacciones que tenga con otros aminocidos, si se pone un aminocido con carga positiva, junto a uno con carga negativa, estos tienden a asociarse y por lo tanto el pH en el que un aminocido se ioniza va a ser diferente al estar asociado con otro, entonces el pk de un aminocido libre es diferente cuando esta haciendo parte de una protena por las interacciones que hay entre estas cadenas laterales.
Los aminocidos estn asociados por enlaces peptdicos, estos enlaces son enlaces de condensacin donde se pierde una molcula de agua e interacciona un grupo carboxilo de un aminocido con el grupo amino de otro aminocido. El enlace C-N que hay en ese enlace peptdico es mas corto que cualquier otro enlace C-N que haya en la naturaleza, eso hace que por su cercana haya una resonancia entre ambos tomos, de tal forma que el doble enlace del C-O se vuelva un enlace sencillo y el C-N establecen un enlace doble, y en otro momento se encuentra un doble enlace entre el C-O y entre el C-N uno sencillo. Esto forma una estabilidad haciendo saltar este doble enlace salte entre el C-O y el C-N. Entonces se va a encontrar este enlace peptdico a veces como un enlace sencillo y otras veces como un enlace doble, por lo tanto se va a llamar enlace sencillo con caractersticas de enlace doble. Por lo tanto adquiere la caracterstica del doble enlace de rigidez planar (no hay rotacin). Pero al lado del enlace peptdico hay dos enlaces que si tienen rotacin que son los enlaces Pi y los Fi, el enlace Pi se establece entre el C alfa y el grupo amino que es un enlace sencillo, y el C alfa y el grupo carboxilo tbn establece un enlace sencillo llamado enlace Fi (pueden rotar mas o menos 180). En las protenas el enlace peptdico va a girar completo. Las cadenas laterales determinan el grado y el sentido de la rotacin de los enlaces Pi y Fi de los aminocidos.
Si el enlace peptdico es un enlace rgido planar con caractersticas de doble enlace, se encontrara isomeras cis y trans, todos los enlaces peptdicos son de configuracin trans, ya que las cadenas laterales no deben estar superpuestas, y los enlaces Pi y Fi se acomodaran segn la necesidad espacial de la configuracin.
La sntesis de los enlaces peptdicos de los aminocidos se lleva a cabo en los ribosomas por medio de accin enzimtica durante la traduccin del RNAm en este mismo. Se van pegando los aminocidos por medio de los enlaces peptdicos, las cadenas laterales van tomando su posicin y la protena que se va formando va buscando su acomodo, haciendo que si dos cadenas laterales hidrofbicas se va a buscar que estas dos cadenas queden hacia la misma regin. Y as se va a acomodando gracias a la rotacin de los enlaces Pi y Fi determinados por las cadenas laterales. Lo importante de una cadena polipeptdica es que independientemente de la cantidad de aminocidos que le pegue, siempre va a tener un extremo amino y un extremo carboxilo.
Como ya sabemos una protena entonces siempre va a tener un extremo carboxilo libre (c), y un extremo amino libre (n). Esto nos sirve para identificar la posicin de algunos dominios de la protena, por ejemplo la orientacin de la protena, si una protena va dirigida a la membrana celular, entonces tenemos un pptido seal que indica hacia donde va la protena y sabemos que este pptido se encuentra en el extremo amino terminal. Entonces nos podemos ubicar si los pptidos de seal se encuentran en los extremos n o en los c, a cual regin de la protena se esta refiriendo.
Los grupos amino-carboxilo, que hacen parte de los enlaces peptdicos, ya no tienen peso para la carga de la protena, ya que cuando se metieron en el enlace peptdico, ya no pueden perder hidrgenos, por lo tanto ya no se pueden ionizar, entonces estos grupos ya no hacen aporte al carga neta de la protena, solo los grupos n y c aportan a la carga neta de la protena junto a las cadenas laterales.
Las cadenas polipeptdicas, las podemos clasificar en protenas y en polipptidos. Protena en teora ser aquella cadena polipeptdica que tiene ms de 50 aminocidos y un polipptido ser el que tiene menos de 50 aminocidos, aunque hay excepciones como la insulina que no alcanza a tener los 50 aminocidos y aun as se considera una protena ya que tiene configuracin tridimensional, tiene una estructura terciaria.
Para determinar la carga de un polipptido se debe tener en cuenta las cadenas laterales de los aminocidos que conforma la protena en cuestin, el problema es cuando son demasiados los aminocidos que conforman esta protena, para poder hallar la carga, nos tenemos que ir a realizar ejercicios experimentales como una electroforesis de doble enfoque o bidimensional. Pero cuando son pequeos, es fcil ya que solo como ya se dijo se tiene en cuenta los pk de las cadenas laterales y de los extremos n y c. Como pasa con los aminocidos, el comportamiento de las protenas depende del pH de la solucin en la cual se encuentran. Y tbn en su PI o zweterion se precipita, por encima del PI la carga neta de la protena va a ser negativa, y por debajo del PI esta carga va a ser positiva.
Las protenas tienen una vida media, y tbn pueden sufrir modificaciones durante el desarrollo de su funcin. Por ejemplo pueden recibir molculas de glucosa o CH y se vana a glucocilar, pueden sufrir oxidar o reducir algunos de sus componentes, y esto lo que ocasiona es que se altere y pierda su actividad, y a nosotros no nos sirve una protena que no tenga actividad, entonces necesitamos dest5ruir estas protenas que no nos sirve, por lo tanto vana a existir unas enzimas que destruirn los enlaces peptdicos, las cuales se llamaran proteasas o peptidasas. Como tengo dos extremos, podemos encontrar carboxipeptidasas (rompen a partir del extremo carboxlico) y aminopeptidasas (rompen a partir del extremo amino). Pero tbn hay enzimas que rompen estos enlaces desde el interior de la cadena, por lo tanto estas se llamaran endopeptidasas. No solo a nivel celular se encuentran estas enzimas, tbn estn a nivel gstrico para el metabolismo de las protenas, la cuales son segregadas por el pncreas.
Las endopeptidasas tienen especificidad por secuencia de aminocidos, reconociendo un sitio especfico. Tenemos varias como la tripsina, la quimiotripsina, las trombinas, carboxipeptidasas, las termolisinas, etc.
El determinar el orden de los aminocidos, ha sido muy importante a nivel mdico. Una alteracin en su secuencia, puede conllevar consecuencias muy graves en la funcin de las protenas. La manera actual de conocer la secuencia de aminocidos de una protena, es por medio de la electroforesis capilar, la cual por medio de un capilar donde se va a encontrar la protena, conectado con una computadora, va a dar la secuencia de esta protena.
La estructura primaria de una protena se conoce como la cadena sencilla de un polipptido, la secundaria es esta cadena envuelta, para defensa en contra de las proteasas. En esta estructura se busca que la protena establezca la mayor cantidad de enlaces y tenga la menor energa acumulada.
La estructura terciaria es la manera en la cual se va a envolver la estructura secundaria en el espacio, y la cuaternaria es cuando se tienen muchas cadenas polipeptdicas que se asocian para formar una protena.
En la estructura secundaria, gracias a los enlaces Pi y los enlaces Fi, la protena puede formar hlices alfa (pueden girar a la derecha o a la izquierda) y laminas beta (pueden ser paralelas o antiparalelas). Una cadena polipeptdica de muchos aminocidos, pueden tener varias estructuras secundarias, estas estructuras secundarias entre si por medio de los giros beta que son muy ricos en aminocidos como la prolina y la glicina.
La alfa hlice es un juego de aminocidos que se enrolla alrededor de un eje imaginario, dependiendo del sentido en que se enrolle, girara a la derecha o a la izquierda. Esta estructura se estabiliza colocando sus cadenas laterales hacia fuera, y en la parte interna estableciendo puentes de hidrgeno, estos se establecen por medio del H suelto del grupo amino de un aminocido, y un O suelto de un grupo carboxilo. Entonces el primer aminocido de agarra del 4 aminocido, el 4 va a estar con el 1 y con el 8, el 5 va a estar con el 2 y con el 9, y as. Estos puentes son los que mantienen estables la cadena polipeptdica. Estos puentes de H son fciles de romper, pero tienen la caracterstica de ser cooperativos, se ayudan el uno al otro.
Las laminas Beta, son secuencias de aminocidos que se ubican en forma de una lmina, pueden ser laminas beta paralelas o antiparalelas. Las antiparalelas son las secuencias que llevan sentido contrario, es decir, una secuencia va de grupo amino a grupo carboxilo, y la otra va de grupo carboxilo a grupo amino. Tbn se estabilizan por puentes de H, la diferencia es que entre las alfa hlices los puentes de H era intracatenarios, y en la lamina beta son intercatenarios, el las antiparalelas los Puentes de H son mas fuertes que en las paralelas, ya que los enlaces de H son mas rectos que en las paralelas.
Las alfa Hlices son ricas en glutamina, metionina, alanina, leusina, lisina y fenilalanina. Las laminas Beta son ricas en triptfano, isoleucina, valina y tirosina (son mas ricas en aminocidos ramificados). Los giros Beta son ricos en prolina (cuando hay varias unidades de prolina, esta tiende a formar una curva) y en glicina (al ser muy pequea se le facilita estar en esta estructura). Hay otra estructura de unin que es el bucle un poco mas largo que el giro Beta pero en si tiene la misma funcin.
Los motivos o dominios de las protenas deben cumplir varias condiciones para cumplir su funcin. La primara es que deben ser muy concentrados, es decir, la secuencia de aminocidos en ese sitio activo debe ser muy similar entre la familia de las protenas. La segunda condicin es que debe ser estructuralmente muy parecido, por ejemplo en una protena por error mutagnico o de traduccin, se cambio el Ac Glutmico por Ac Asprtico, la funcin de la protena no se pierde, ya que las propiedades de la protenas permite que el motivo funcional se acople al sustrato si es una enzima o al ligando si es un receptor. Tambin debe tener flexibilidad ese motivo en el caso de las enzimas ya que este se debe adaptar al sustrato.
La diferencia entre un dominio estructural y un dominio funcional, es que el dominio estructural es propio de una familia proteica, mientras el funcional se puede separar de la protena y solo puede cumplir la funcin. Estos motivos estn formados por diversas estructuras secundarias y se debe resaltar que en la estructura primaria, un aminocido este muy distante de otro, pero cuando la protena se pliega, puede ser que estos aminocidos queden muy cerca y tengan una funcin clave dentro de la actividad de la protena, si es cataltica en el caso de la enzima o el reconocimiento del ligando en el caso de un receptor.
Las estructuras secundarias, terciarias y cuaternarias se estabilizan por medio de fuerzas no covalentes y fuerzas covalentes. Entre las fuerzas no covalentes encontramos las fuerzas electrostticas, fuerzas dipolo- dipolo, carga-carga, dipolo-carga, fuerzas de vander walls, puentes de H (son fciles de romper por medio de cambios de pH, T o aumento de electrolitos en la sln) si se rompe las fuerzas no covalentes, se va a alterar la estructura secundaria, y si altero las secundarias, se afectaran la terciaria y por ende la cuaternaria (SE LLAMA DENATURALIZACIN DE LA PROTENA) pero si se vuelve a poner a pH, T y la concentracin adecuadas, la protena vuelve a se renaturaliza ganando su estructura secundaria, terciaria, y cuaternaria.
Si rompo las fuerzas covalentes en las que se encuentran los puentes disulfuro y los enlaces peptdicos, puede que la desnaturalizacin sea irreversible, ya que crear los enlaces peptdicos requiere de mucha energa.
La estructura secundaria tiene que plegarse, tomar una configuracin en el medio. Entonces se va formando a la estructura terciaria que solo hace referencia a una sola cadena polipeptdica. Puede estar formada por varias estructuras secundarias. Es importante que est correctamente plegada, ya que la funcin va de la mano de la configuracin, y esta configuracin va de la mano de la secuencia de aminocidos. Si a la protena le adhiero una molcula diferente a su componente, esto le alterara su configuracin, y en algunos casos la har mas funcional y en otros har que pierda totalmente su funcin.
La estructura cuaternaria es en s la unin de varias estructuras terciarias, cada cadena polipeptdica debe estar codificada por un gen distinto, y en el caso de la gliceraldehido 3 fosfato deshidrogenasa, que es una enzima de la gluclisis, tiene 4 cadenas polipeptdicas, que cada una esta codificada por un gen distinto. Esta enzima es conocida como tetrmero, ya que tiene 4 cadenas polipeptdicas asociadas, si tuviese dos seria un dmero. Las estructuras terciarias se asocian por medio de fuerzas no covalentes y fuerzas covalentes. Estas estructuras cuaternarias se van a organizar en el espacio como agregados simtricos (se muestran como cristales y los microtbulos de forma simtrica), o asimtricos (formados por diferentes subunidades y no mantienen una estructura definida como los ribosomas).
En las protenas todo lo que es polar se expone y lo que no se esconde en su interior. Si se cambia el medio de la protena, se pasa de un medio polar a uno apolar, se cambia la estructura de la protena escondiendo ahora lo polar y exponiendo lo apolar. Todas las protenas a excepcin de las purinas, tiene la misma conformacin (polar hacia fuera y lo no polar hacia adentro).
En algunas protenas como la hemoglobina (grupos hem que son anillos pirrlicos), hay porciones no proteicas que se adhieren a la protena por medio de enlaces covalentes, es decir, se mantienen unidos a la protena desde que se sintetiza hasta que se degrada se conoce como grupo prosttico. Sin estos grupos la protena no podra llegar a cumplir su funcin. Hay dos teoras de cmo se pliegan las protenas para llegar a tener la mayor cantidad de enlaces con la menor cantidad de energa acumulada posible. La primera consiste en que se pliegan de manera aleatoria donde se pliega y se despliega, hasta encontrar la estructura ideal. La otra teora habla sobre la cooperatividad, donde la protena se va plegando tan pronto se va sintetizando formando la estructura secundaria que mejor convenga con los aminocidos presentes, buscando siempre la mayor cantidad de enlaces con la menor energa. Cuando ya se tienen varias estructuras secundarias, se va plegando de la mejor manera en que estas estructuras secundarias se puedan acoplar, ahorrando tiempo. Hay una estado intermedio llamado globo de fusin llegando a tener una mayor o una menor entropa. El estado nativo es el estado funcional o configuracin funcional de la protena.
Cuando una protena esta desnaturalizada es muy susceptible a la accin de la degradacin. Entonces un sistema para protegerla de ello, es hacer que se pliegue rpidamente, y si no logramos plegarla o el plegamiento es incorrecto, la protena se degrada. Tenemos un sistema que permite que este plegamiento se mas rpido y correcto, por medio de un grupo de protenas llamadas chaperonas y chaperoninas, permitiendo protegerlas. Las protenas se meten entre estas chaperonas que tienen forma de barril y por medio de acciones que requiere de ATP, tapamos este barril con las chaperoninas. Ya dentro la protena se pliega rpidamente y se va a encontrar protegida de la accin de las proteasas. Estas protenas tbn se conocen como protenas de choque trmico ya que se descubrieron en las bacterias, cuando estas eran sometidas a cambios temperaturas extremos, entonces comenzaban a sintetizar protenas que respondan a estos cambios de T, se ubican en el retculo endoplasmtico. Cuando hay problemas en la sntesis de estas protenas, la cantidad de protenas sintetizadas va a ser menor, ya que las protenas van a ser degradadas a medida que van siendo sintetizadas en el mismo retculo endoplasmtico.
En las purinas y las protenas de membranas que son protenas que permiten el paso a travs de sus paredes, las cuales son ricas en fosfolpidos. Entonces en esta protena que se encuentra en la pared celular, la porcin no polar es la que se expone, ya que se encuentra en contacto con los fosfolpidos. Y en el interior de estas protenas que es por donde debe pasar los sustratos, debe ser polar, as que la parte polar de la protena esta expuesta internamente.
Una vez sintetizadas las protenas sufren modificaciones, que le permiten ser ms funcionales, ms estables, aumentar su vida media, regular su funcin, etc., una de ellas es la acetilacin que es pegarle grupos acetilo al extremo amino, lo que permite que la protena sea mas estable. Otra es hidroxilarlas como la hidroxlisina y la hidroxiprolina que son importantes en las actividades del colgeno. Otra es la glicocilacin que es clave porque tiene varias actividades como direccionar la protena ya sea que se dirija a un sitio u a otro, ya sea membrana celular o mitocondrial, dependiendo el tipo de CH que se vayan a adherir a la protena. Muchas aumentan la polaridad de las protenas, como las apoprotenas que son una familia que tiene un papel clave en el metabolismo de los lpidos, estas se glicosilan, reteniendo CH, cosa que aumentan el transporte de los lpidos del plasma. Esta glicocilacin se puede dar por medio de los aminocidos que en su cadena lateral tengan residuos OH y esto permite establecer un enlace entre un CH como la glucosa y este OH libre de la cadena lateral (se llaman enlaces O-Glucosilico, ya que queda un O en medio del OH y el carbohidrato). Tbn se puede dar con aminocidos que tengan un grupo amino o un N en su cadena lateral, como es el caso de la glutamina o la asparagina. Entonces ese tipo de enlace lo llamamos N-Glucosilico.
Las modificaciones tbn tiene como funcin el reconocimiento celular, los grupos sanguneos estn determinado por la presencia o la ausencia de CH dentro de la membrana celular. Algunos tendrn N Acetil Glucosalina y otros glucosalina sencilla, entonces unos sern A, otros sern B y el que no tenga ninguno de los dos, ser O.
Hay otras que pierden su funcin al glicosilarse, se altera su estructura y por ende si se altera su configuracin, se altera la configuracin, y si se altera su configuracin, se altera su funcin. En la diabetes por ejemplo, las protenas propias de la mielina que sirven de grapa para atrapar las dos membranas de las clulas de Shwan que permiten la mielinizacin son exageradamente glicosiladas, y se pierde la mielinizacin. La glicosilacin de los anticuerpos hace que la respuesta inmune disminuya, la glicosilacin de las protenas de la coagulacin hace que la respuesta a hemorragias sea menor. La entrada de glucosa al eritrocito es libre, solo depende de la concentracin de glucosa circulando, y dentro del eritrocito, esta glucosa glicosila la hemoglobina, y esta glicolisacin es irreversible. Entonces en una muestra yo puedo medir la cantidad de hemoglobina glucosilada, y de esta manera voy a saber de manera indirecta cuanta glicemia tiene el paciente. Como no se sabe el tiempo que el eritrocito lleva circulando, se supone que dentro el tiempo de vida media de un eritrocito (120 das) cuales son los niveles un paciente normal debe tener la hemoglobina glicosilada entre 5 y 7% (dependiendo de la tcnica puede variar de 6 a 8%). Mientras un paciente diabtico que no control su glicemia durante los ltimos 3 meses, se puede encontrar una glicemia de 10, 12 ,15 y 20%. Si un paciente que muestra un nivel de hemoglobina glicosilada de 15%, lo que esta diciendo es que maneja niveles de glicemia dos veces mayor que lo normal.
Tambin se pueden aadir Ac. Grasos a las protenas. Si hacemos esto hacemos que la protena sea menos polar. Si hacemos esto logramos ponerla dentro de la membrana celular. Se puede fosforilar, que es una accin covalente que se usa mas que todo en las enzimas para hacerlas mas activas o menos activas, por ejemplo si fosforilamos la glicgeno sintasa, que es una enzima que se encarga de depositar la glucosa y convertirla en glucgeno en el hgado y el msculo como reserva de glucosa, esta se vuelve inactiva, pero si le quito el fosfato por medio de enzimas, se activa. Lo mismo le pasa a la protein quinasa a y b.
Otra modificacin de las protenas es que pueden ser clivadas, es decir, quitarles un segmento o porcin de su estructura. Un ejemplo serian los cimgenos, que son enzimas que para activarse se quita o cliva una porcin de esta. Un ejemplo tpico de cimgenos son las proteasas que se encuentran en el pncreas, como la quimiotripsina que se produce como quimiotripsinogeno, la tripsina como tripsinogeno, y se activan cuando se cortan una porcin de ellas, cosa que sucede en el intestino. Esto sucede para evitar la degradacin de las protenas pancreticas.
Todas las protenas tienen una vida media tpica, la cual depende de varios factores: Funcin: aquellas protenas que tienen una funcin muy delicada muy sensibles como la expresin gnica, son protenas que tienen una vida media muy corta como la RNA polimerasa, los factores de trascripcin, tiene vida media de segundos (15-20), esto garantiza que la cantidad de protena que haya en un momento dado dependa de los factores que estimulan su sntesis y no de factores externos. En cambio las protenas que no tienen una funcin tan delicada como son las funciones estructurales como el colgeno tienen una vida media mucho mas larga (1000 das en promedio). Estructura: las protenas se vuelven sensibles a la degradacin cuando su estructura se altera, por ejemplo la misma glicolisacin, puede ser una manera de marcar una protena para su posterior degradacin. Un pptido muy pequeo incluido en nuestro sistema llamado ubiquitina, que marca a las protenas para su degradacin, tiende a pegarse a los residuos no polares. Entonces al alterar la estructura de la protena, la porcin no polar comienza a ser expuesta y la ubiquitina reconoce estas porciones no polares y se pega irreversiblemente. Clasificacin de las protenas:
Se pueden clasificar de diversas formas, como por ejemplo segn su estructura se pueden clasificar en fibrosas (que tienen una forma alargada como el colgeno y la queratina, generalmente son estructurales), y hay otras en forma de globo llamadas protenas globulares (albmina, hemoglobina, pepsina, tripsina las globulinas.
De acuerdo a como se conforman, se pueden clasificar en: Simples: conformadas solo por aminocidos como las albminas, globulinas, glutelinas, prolaminas, protaminas e histnas y cada una de ellas se pueden diferenciar por su solubilidad, en el caso de la albumina es soluble en agua, pero coagulable en el calor; en el caso de las globulinas son solubles en sales diluidas pero si esta saturada, las estas se precipitan, las glutelinas son solubles en soluciones alcalinas y acidas diluidas; las prolaminas solubles en alcohol entre 70 y 80%; las protaminas en agua, cidos diluidos en amoniaco; y las histnas en agua, cidos diluidos, pero se precipitan en amoniaco, que es una forma que usamos para desnudar el ADN, que esta envuelto en protenas como las histnas, entonces al hacerlas precipitar, desnudo el DNA. Compuestas: que no solo estn compuestas por aminocidos sino tbn por grupos prostticos como las lipoprotenas que son protenas que estn muy asociadas al metabolismo de los lpidos, y tiene como grupo prosttico lpidos, como la VLDL que su porcin proteica es la APO B 100. las glicoprotenas como la inmunoglobulina g, las fosfoprotenas como la caseina, las hemoprotenas como la hemoglobina, las flavoprotenas que son un grupo de protenas que contienen flavina, que es un vtamero (forma activa de una vitamina), que tiene mucho que ver con el transporte de equivalentes reductores, entonces se puede encontrar en forma de nucletido (flavin adenosin dinucletido (FAD), que es el grupo prosttico de muchas enzimas) y las metaloprotenas como la ferritina, la alcohol deshidrogenada que contiene zinc, las calmodulinas que contienen calcio, la nitrogenasas que tienen molibdeno, la ceroplasminas que es rica en Cu o la plastocianina.
La solubilidad de las protenas depende del pH de la sln donde se encuentre. Al punto isoelctrico, las protenas tienen la misma cantidad de cargas negativas que positivas, como son molculas de cargas diferentes, estas tienden a formar agregados desplazando el agua ue puede estar en medio de ellas, entonces sacan el agua, se pegan y se van al fondo en su punto isoelctrico. Entonces esta es la razn por la cual las protenas en su punto isoelctrico se precipitan. Pero ya sea por debajo o por encima de ese punto isoelctrico las protenas se vuelven solubles, ya que por debajo como ya se haba mencionado la mayora de las cargas van a ser positivas, lo mismo por encima, la mayora de las cargas van a ser negativas, por ende estas cargas se van a repeler y se va a solubilizar las protenas en la sln. Pero si se agraga a la sln electrolitos, se puede alterar las cargas en la sln, y por ende se puede llegar a un estado zweterion donde las cargas son iguales a 0, pero no es el PI, ya que el PI es el pH donde la carga neta es cero.
Para poder obtener una protena se utilizan diferentes tcnicas como la electroforesis, dilisis, cromatografa de intercambio inico, la HPLC (cromatografa de alta velocidad)
PROTEINAS
Son fundamentales para nosotros como seres vivos, cumplen funciones como: -Catalticas -Defensa Anticuerpos (inmunoglobulinas) -Estructural (colgeno) -Contraccin (actina y miosina) -Transporte (hemoglobina, albmina) -Almacenamiento (ferritina) -Hormonas (insulina, glucagn) -Receptores (receptores de adrenalina o glucagon) -sostenimiento de material gentico dentro del ncleo (histonas, DNA polimerasas duplicacin-, RNA polimerasas expresin-)
Todas las protenas estn formadas por 20 aminocidos proteicos comunes, lo que cambia es el orden en que estn cada uno de estos dentro de la protena
Todos lo aa tienen una estructura general compuesta por grupo carboxilo (COO-), grupo amino (NH3) y grupo R o grupo funcional, este determina las propiedades del aa, si es polar o no polar, si puede hacer puentes disulfuro, a que pH tiene capacidad buffer ese aa.
Teniendo en cuenta el grupo carboxilo, el amino y la cadena lateral, el carbono va a ser un carbono asimtrico o carbono quiral, entonces se puede tener isomera de estos aa, siguiendo la idea de fisher, isomera D o isomera L. Todos nuestros aminocidos van a ser de tipo aa ya que el grupo amino y el carboxilo van a estar pegados al Carbono.
De cuerdo a la capacidad de sintetizarlos o no, podemos clasificar los aa en dos grupos:
Los esenciales no los podemos sintetizar por lo que se necesitara mucha energa. La proporcin de aa esenciales que tenga una protena, va a determinar su valor nutricional.
Si consumimos albmina de huevo, o casena (protenas ricas en aa esenciales) lo primero que nuestro organismo hace despus de la digestin, es absorber aa esenciales, la capacidad de absorcin de los aa esenciales es mayor que la capacidad de absorcin de los aa no esenciales, la afinidad del transportador de aa esenciales es mucho mayor que la de los aa no esenciales. Y cuando hacemos degradacin proteica, por ejemplo en condiciones de ayuno, cuando tenemos 5, 6 o 7 horas de ayuno y empezamos a degradar protenas para obtener fuentes de energa, nuestro metabolismo utiliza primero los aa no esenciales y despus los esenciales.
La Arginina la podemos sintetizar, tenemos cierta capacidad de sntesis a nivel del rin, pero esta capacidad de sntesis no es suficiente para aportar la Arginina necesaria, entonces en los nios la Arginina se vuelve un aa esencial neto, necesitan fuente exgena de Arginina, en los adultos las necesidades de Arginina disminuye.
La Histidina es un aa esencial, pero la deficiencia no causa patologa a corto plazo, por eso se considera un aa semiesencial
Los aa no esenciales fcilmente se sintetizan, a partir de sustratos que obtenemos del catabolismo de otras molculas como la glucosa, de productos intermediarios del ciclo de kreps, a travs de unos procesos de trans-aminacin
NOMENCLATURA
Un aminocido cualquiera, se haba dicho q tiene un grupo carboxilo, un grupo amino, una cadena lateral y podra tener las dos isomeras D o L si la comparamos con el gliceraldehido, siempre hablando de carbono. La alanina podra tener la isomera L o la isomera D, todos nuestros aminocidos son de isomera L, no tenemos aminocidos de configuracin D en las protenas, estos aminocidos de configuracin D sirven para identificar protenas q no son propias del organismo como por Ej. Una protena de membrana de una clula de un donante, una protena de reconocimiento de un virus, una protena propia de una bacteria, se reconoce como extraa y se empieza a luchar contra ella, de resto todas van a ser L aminocidos.
De acuerdo a como se comporta esa cadena lateral a ph 7 (neutro) nosotros podemos clasificar los aa en dos grupos grandes: aa no polares y aa polares
NO POLARES Glicina Alanina Valina Leucina Metionina isoleucina
En algunos textos se puede encontrar q la glicina la clasifican como polar, pero la estructura de la glicina es muy pequea entonces tiene un comportamiento polar y uno no polar. Pero se asume como aa no polar. Es el nico aa donde la cadena lateral es un hidrogeno, luego no tiene ismero D ni ismero L, ya que no tiene carbono asimtrico, es el nico aa q no tiene isomera D-L.
GLICINA
La valina, leucina e isoleucina se conocen todos como aa ramificados y tienen un papel fundamental en la regulacin del metabolismos proteico. Cuando yo hago degradacin de protenas, la valina tiende a aumentarse porque se degrada con mucha lentitud y este aumento en los niveles de valina tienen un efecto inhibitorio sobre la degradacin proteica, es un mecanismo q los humanos tienen de proteccin para q cuando se hace un ayuno prolongado no vaya a degradar todas sus protenas, sino q haya un control sobre la degradacin proteica, si degradamos mas del 30% de las protenas podemos estar en riesgo de perder la vida. Eso los hace aa esenciales y fundamentalmente la valina.
VALINA
La metionina es uno de los aa azufrados junto con la cisteina pero el azufre q tiene la metionina es un azufre q esta metido dentro de la cadena lateral luego no tiene mucha capacidad reactiva. METIONINA
Los aa polares los podemos clasificar en tres grupitos: ACUERDENSE QUE HABLAMOS DE Ph 7 (neutro)
AA POLARES NO CARGADOS AA POLARES CARGADOS + AA POLARES CARGADOS - Serina Glicina Ac. Aspartico Treonina Arginina Ac. glutmico Cisteina Histidina Prolina Asparagina Glutamina
AA POLARES NO CARGADOS:
CISTEINA
La cisteina es el segundo aa q tiene azufre, ese grupo q tenemos ah fcilmente pierde ese hidrogeno y entonces se puede asociar con otra cisteina formando una molcula q se conoce como cistina, q es un aa derivado de la cisteina, ese puente de disulfuro tiene un papel clave en la estabilizacin de las protenas, esos puentes pueden ser intercatenarios o intracatenarios,
CISTINA
Las protenas pueden estar formadas por una sola cadena polipeptdica o por varias cadenas polipeptdicas en el caso de la insulina es una sola cadena polipeptdica pero durante su maduracin esta cadena polipeptdica se divide. La insulina esta estabilizada por dos puentes disulfuro, le da agarre a esa protena, permite mantener la configuracin q es lo q se kiere mantener en una protena y a veces los puentes disulfuro estn dentro de dos cadenas estabilizando estructuras cuaternarias de las protenas.
En algunos pacientes se presentan problemas a nivel renal para reabsorber cisteina entonces los niveles de cisteina en orina se tienden a aumentar variando el pH en la orina (ph ligeramente alcalino), el grupo del SH pierde el hidrogeno y pueden formar puentes de disulfuro dentro de la misma orina, produciendo cistina y esos cristales de cistina, son cristales grandes bastantes agudos, en forma de aguja, q cuando se depositan mucho en los tx van a hacer lesiones en los txs y el paciente puede sufrir una insuficiencia renal por tener esa enf. Q se llama cistinuria o en el menor de los casos presentar urolitiasis, en clculos renales de cistina tendramos q jugar con el pH urinario para tratar de mejorar ese estado.
La prolina es otro aa especial se observa q cualquier otro aa tiene un montn de enlaces q pueden girar, tienen rotacin, en la prolina la cadena lateral forma un anillo.
PROLINA
No tiene un grupo amino sino q le dicen grupo imino, por eso consideran la prolina un iminoacido y no un aminoacido. Ese anillo hace q la prolina sea un aa rgido y esa rigidez de la prolina va a tener consecuencias fuertes en la configuracin de la protena, en la forma de la protena, tiende a estar metida en protenas q no tengan capacidad de flexibilidad,q no necesiten ser muy flexibles por Ej. En el colgeno podemos encontrar prolina.
AA POLARES CARGADOS POSITIVAMENTE:
HISTIDINA
La histidina tiene un PK para la cadena lateral cercano a 6, pero cuando hace parte de la protenas esas cadenas laterales tienden a modificar su pH al cual se ioniza y entonces la histidina se le aumenta un poquito ese PK alrededor de 7, a este PK las sustancias tienen capacidad buffer, entonces a ese PK de 7 q es mas o menos el PK plasmtico la histidina tiene una capacidad buffer q es muy importante, la hemoglobina es una protena rica en histidina, por eso la hemoglobina tiene propiedades buffer importantes para nuestro organismo.
AA POLARES CARGADOS NEGATIVAMENTE:
Ac. Arpartico y el acido glutmico
Estas cargas de las cadenas laterales tienen una importancia clave, las enzimas en el 99% de los casos son protenas, y la enzima tiene la capacidad de aumentar la velocidad en una reaccin porq se une al sustrato en un sitio activo, una parte de la estructura de la protena q es capaz de aceptar el sustrato, la interaccin entre el sitio activo y el sustrato se da a travs de los aa q se exponen en el sitio activo, si el sustrato es un sustrato polar los aa q estn en el sitio activo debern ser polares, si el sustrato es + en el sitio activo debern haber aminocidos cargados . si el sustrato no es polar el sitio activo tendr q tener aa no polares, esa posicin de los aa en la cadena y esa capacidad de ionizarse y no ionizarse, de ser polares o no ser polares para determinado pH tiene mucha importancia tanto para la configuracin de la protena como para su funcin, su actividad.
Miremos algunos aa especiales:
AA AROMTICOS: fenilalamina, tirosina, triptofano tienen muchos dobles enlaces en sus anillos, que les da capacidad de absorber luz ultravioleta.
FENILALANINA TIROSINA
TRIPTOFANO
Se puede cuantificar la cantidad de estos aa si someto la muestra mas o menos a 280 nm q es donde se encuentra el sitio de mxima absorcin de estos aa, si se kiere saber si hay protenas o no hay protenas en una muestra, se mira la absorbancia de luz ultravioleta y va a encontrar un pico mximo, si encuentra ese pico es muy probable q tenga protenas. Si se kiere saber cuanta protena hay, se hace la comparacin de cuanto absorbe esa sustancia a 280nm frente a un patrn, donde se sepa la concentracin y se hace la relacin y fcilmente se puede saber cuantas protenas tiene. Es un proceso q se usa con mucha frecuencia en los laboratorios de investigacin, cuando se kiere extraer una protena por Ej. De una clula lo q se debe hacer es macerar la clula y dejar libre las protenas (muchas veces durante el proceso se contamina la muestra entrndole bacterias y esas bacterias se encargan de degradar las protenas) y luego se mira el espectro de absorcin de luz ultravioleta y voy a determinar si hay o no hay protenas.
Hay algunos aa q no son proteicos pero q son muy importantes en nuestro metabolismo como el aa Ornitina es un aa q no hace parte de protenas pero si es un producto intermedio en el metabolismo de las protenas.
Cuando nosotros hacemos degradacin de protenas liberamos grandes cantidades de amoniaco, ese amoniaco es un neurotoxico violento, luego tenemos q hacer q ese amoniaco desaparezca de nuestro organismo, entonces para eliminarlo lo convertimos en urea, a travs de un ciclo q se conoce como ciclo de la urea, y parte de ese ciclo o dentro de los componentes de ese ciclo encontramos a ese aa hornitina y a la hna de el q se llama citrulina, son dos aa no proteicos.
La tiroxina () q tampoco hace parte de protenas pero q tambien es muy importante porq a travs de ese aa nosotros hacemos sntesis de las hormonas tiroideas la T3 y T4, y hay otros como el acido gamaaminobutirico (GABA) q hace parte de algunos neurotransmisores. No todos lo aa no tienen q ser componentes de protenas.
Una propiedad importante de los aa es su comportamiento a diferentes pH, el pH puede hacer variar la estructura de un aa, miremos la glicina q es el aa mas sencillo, si se pone en un pH muy acido cercano a cero, a ese pH el grupo amino no pierde su hidrogeno, no pierde la carga no se desprotona, el PK para el grupo amino esta en 9, y el grupo carboxilo no ha perdido su hidrogeno, tampoco se ha ionizado, el PK para el grupo carboxilo esta alrededor de 2 para todos los aa, si yo lo coloco en un ph cercano a cero, el grupo amino va a tener su carga + y el carboxilo no ha perdido su hidrogeno, pero si se le aumenta la concentracin de OH, cada vez q le echamos una base ese hidrogeno se desprende para reaccionar con el OH q se le agrega y producir agua.
La carga neta de un aa depende del pH de la solucin en q lo encontremos, dependiendo del pH de esa solucin el aa puede tener una carga+, una carga neutra o no tener carga o una carga -.
Cada aa tiene su comportamiento tpico, porq cada aa tiene un PK para el grupo carboxilo y un PK para el grupo amino propio, entonces cada uno va a tener un comportamiento distinto, a esta condicin en la cual la carga neta del aa es cero, hay una carga- y hay una carga+ la voy a conocer como zwiterion. A esa carga neta igual a cero la solubilidad del aminoacido es mnima entonces el tiende a precipitarse a irse al fondo del recipiente en q lo tengamos, si en ese momento se sabe a q pH se encuentra el aa cuando la carga neta es igual a cero podemos decir q se sabe cual es el punto isoelectrico o el ph isoelectrico o PI. (pH al cual la carga neta del aa = 0) Se calcula: si es un aa, se suma PK1 PK2 y se divide entre dos, saco un promedio de ellos y ese es el punto isoelectrico del aa. Esto se aplica para todos los aa y para las protenas.
Si el pH esta por encima del punto isoelectrico, el aa o la protena va a tener una carga- por Ej. La albmina, la albmina tiene un punto isoelectrico alrededor de 4.8, luego nuestro pH plasmtico esta alrededor de 7.4, eso significa q la albmina en nuestro ph plasmtico tiene una carga- y al contrario, si el pH esta por debajo del punto isoelectrico la protena o el aa tendr una carga + Otro Ej. el ac. Glutmico tiene como todos los aa, grupo carboxilo, grupo amino, carbono alfa y la cadena lateral, pero en la cadena lateral tiene un grupo carboxilo tambin, entonces tiene una cadena lateral q es ionizable, se necesita hacer lo mismo q se le hace a la glicina, se pone a pH cero se le hecha OH y lo primero q se ioniza es el grupo carboxilo, el PK 1 siempre hace referencia al grupo carboxilo, entonces el grupo carboxilo pierde un hidrogeno y gana una carga- (2.19), lo segundo q se ioniza es la cadena lateral (4.25), el PK R siempre hace referencia al PK de la cadena lateral siempre y cuando sea ionizable,(siete aa tienen cadena lateral ionizable) cuando me acerco a pH 4.25 la cadena lateral se ioniza y empieza a adquirir carga- . Y se le sigue echando OH y empieza a perder carga el grupo amino, pierde un hidrogeno, y pasa de RNH 3 + a RNH 2 . A un pH de 9.6 PK 2 (PK 2 siempre hace referencia al grupo amino) Para calcular el pH isoelectrico se cogen los dos aminocidos que rodean al zwiterion en el proceso de ionizacion y se le saca un promedio. En este caso PK 1 Y PK R .
En el PI no hay capacidad buffer, los PK si tienen capacidad buffer. El punto isoelectrico no, es importante recordar q el PI es el momento en q el aa es menos soluble.
La funcionalidad de una protena esta muy asociada al pH de la solucin en q se coloque, porq ese pH va a afectar la carga de los aa q estn en el sitio activo y si afecta la carga de los aa en el sitio activo voy a afectar su capacidad de reaccionar de interaccionar con el sustrato, entonces afecta la funcin.
El PK para los aa esta alrededor de 2 para el grupo carboxilo, para el grupo amino esta alrededor de 9, hay algunos q tienen un PK mas alto por Ej. la prolina, casi ninguno tiene un PK cercano al pH plasmatico, es importante las cadenas laterales en los aa cuando estn haciendo parte de la protena, porq cuando hacen parte de la protena, lo unico q le keda libre al aa, es su cadena lateral. En gral el PK de un aa o de la cadena lateral de un aa se va a afectar too por las interacciones q tenga, si se coloca un aa con carga+ junto a un aa con carga- ellos tienden a asociarse y cuando se trata de ionizar esos aa, esa asociacin hace q la fuerza sea diferente, luego al pH al cual se ionizan los dos va a ser diferente a como si yo lo tuviera suelto, entonces el PK de las cadenas laterales de los aa sueltos o libres es diferente al PK de los aa cuando estn haciendo parte de una protena por las interacciones q pueden haber entre esas cadenas laterales.
Los aa se asocian entre si por enlaces peptidicos, un enlace peptdico es un enlace de condensacin donde se pierde una molcula de agua, interacciona el grupo carboxilo de un aa con el grupo amino de otro aa, y as se forma el enlace peptdico, caractersticas especiales:
El enlace carbono-nitrgeno q hay en ese enlace peptdico es mas corto q cualquier otro en lace carbono-nitrgeno q se encuentre en la naturaleza, es un 10% mas corto este enlace, eso implica q los dos tomo estn muy cerca, y eso hace q hay una resonancia entre estos, de tal forma q a veces ese doble enlace se convierte en un enlace sencillo y el carbono y el nitrgeno establecen un doble enlace y en otro momento se puede encontrar no el doble enlace entre carbono y nitrgeno sino entre carbono y el oxigeno, se estabilizan por resonancia, haciendo saltar el doble enlace, por as decirlo, entre el carbono y el oxigeno y entre el carbono y el nitrgeno, van a ver momentos en q se va encontrar el enlace peptdico como un enlace sencillo y va a ver otro momento en q lo va a encontrar como un enlace doble, por eso se conoce el enlace peptdico como un enlace sencillo con caractersticas de doble enlace.
Esas caractersticas de doble enlace, recuerde q lo fundamental de ellos es la rigidez, los componentes del enlace peptdico siempre va a estar en un mismo plano.
Adems de ser un enlace sencillo con caractersticas de doble enlace tambin es un enlace planar, entonces va a ser planar, rgido, con caractersticas de doble enlace pero es un enlace sencillo; al lado de esos enlaces peptdicos vamos a encontrar dos enlaces q si tienen rotacin, q es el enlace fi y el enlace pi, el enlace pi se establece entre el carbono alfa y el grupo amino, y el carbono alfa y el grupo carboxilo forman el enlace fi, estos dos enlaces si tienen rotacin libre, pueden rotar 180mas o men os.
Las cadenas laterales o grupos R son los q determinan cuanto es el grado de rotacin y el sentido, son los q dicen si gira en el mismo sentido o en sentido contrario, si se deca q el enlace peptdico era un enlace rgido, planar con caracterstica de doble enlace, se podra encontrar isomera Cis e isomera Trans, todos los enlaces peptdicos son de configuracin trans, porq necesitamos q las cadenas laterales no estn superpuestas. La sntesis del enlace peptdico, es una sntesis enzimatica q se lleva en los ribosomas durante la traduccin, mientras se lee el RNA mensajero, se empiezan a pegar aminocidos de acuerdo a las tripletas, empieza RNA de transferencia a traer aminocidos, en el mismo componente, en el ribosoma, se va a tener la maquinaria q forma los enlaces peptdicos, las cadenas laterales empiezan a colocarse en posicin y se empieza la protena a buscar el acomodo; si se tienen dos cadenas laterales q son hidrofobicas, se hace q las dos cadenas laterales keden hacia la misma regin, entonces los enlaces pi y pi van a girar de tal forma q keden cerca esas dos cadenas, si hay una positiva y una negativa pasa igual, va haber rotacin d esos enlaces si y pi, y se van a acomodar para q esos aminocidos q tienen carga distinta estn cerca, si los dos son hidrofilicos igual.
Entonces las cadenas laterales van a determinar cuanto va a girar el enlace pi y el si, la otra cosa importante de la cadena polipeptidica es q independiente de cuantos aa se le peguen, siempre va a tener un extremo amino y un extremo carboxilo, por eso en las protenas uno habla del extremo n-Terminal de la protena y extremo c-Terminal de la protena, para identificar la posicin de algunos componentes de la protena, por Ej. Si kiere hablar de la orientacin de la protena, la protena se sintetiza y debe ser dirigida hacia membrana celular por Ej., tenemos un pptido seal q determina hacia donde va la protena, y se sabe q ese pptido seal esta en el extremo amino Terminal, entonces me puedo ubicar si esta en el extremo amino Terminal o en el extremo carboxilo Terminal a cual regin de la protena se estn refiriendo. Por otro lado los grupos amino-carboxilo q hacen parte de los enlaces pepetidicos, ya no tienen peso para la carga de la protena, porq cuando se metieron en el enlace peptdico, ya no pueden perder hidrogeno, q era el q determinaba si tenia una carga negativa o si tenia una carga positiva, ya no se puede ionizar, luego los grupos carboxilos y los grupos aminos q estn metidos, q estn inmersos en los enlaces peptdicos no hacen aporte a la carga, ya no interesan para el aporte a la carga, los q aportan a la carga son el grupo amino Terminal y el carboxilo Terminal y lgico las cadenas laterales tambin tienen q ver con la carga. Cuando se tiene una cadena polipeptidica se tienen dos trminos para referirse a la cadena polipeptidica, puede decir q es una protena o un polipptidoen teora
Una protena es aquella q tiene mas de 50 aa. Un polipptido ser aquel q tiene menos de 50 aa.
Pero solo en teora, la insulina no alcanza a tener 50 aa y se considera una protena porq tiene configuracin tridimensional, tiene estructura terciaria. Para determinar la carga de un polipptido, si tiene muy pocos aa es sencillo porq es solo tener en cuenta las cadenas laterales, el problema es cuando se tiene una protena muy grande de 2500 aa, para ponerse a buscar a un pH determinado cual de las cadenas laterales esta ionizada, tonces cuando se kiere encontrar el PI de una protena, se tiene q ir a procesos experimentales, a hacer una electroforesis de doble enfoque o una electroforesis de doble dimensin, donde se corre la protena por carga y se corre tambin por pH, cuando la protena a su PI no se mueve ni para el polo positivo ni para el polo negativo, se keda quieto, entonces es una forma de determinar el PI, pero cuando se tiene un pptido q es peqo se puede determinar de manera terica, ac. Glutmico, glicina, alanina y lisina, hay q recordar q la glicina no tiene cadena lateral, la alanina tiene una cadena lateral q no es ionizable, pero la lisina y el Ac. Glutmico si tiene una cadena lateral q es ionizable.
El comportamiento de las protenas igual q el de los aa depende del pH de la S/n en q lo coloqmos, igual q los aa la protena se va a precipitar, por encima de ese PI la protena tiene carga neta negativa, por debajo de ese PI la carga neta es positiva.
Las protenas tienen una vida media o un punto en el cual se deben destruir, las protenas pueden sufrir modificaciones durante su funcin, por Ej. pueden recibir molculas de glucosa o de carbohidratos si se van a glicosilar, pueden producir oxidacin algunos de sus componentes, entonces eso lo q hace es q la protena se altere y protenas alteradas son protenas q no tienen actividad, no sirven protenas alteradas. Esas protenas q se han daado a travs del tiempo o q tienen una funcin clave por Ej. esas q tienen q ver con la expresin gnica, se destruyen muy rpidamente entonces necesitamos romper esos enlaces peptdicos, los enlaces peptdicos se van a romper a travs de unas enzimas q se llaman proteasas o peptidasas, como se tienen dos extremos se encuentran carboxipeptidasas y aminopeptidasas y hay enzimas q rompen enlaces peptdico en el interior de la cadena peptidica y esas se llaman endopeptidasas, existen muchas endopeptidasas cuando se hace digestin de protenas tambin se necesita q esa protena se rompa en pedacitos, tenemos proteasas en el sistema digestivo, el pncreas produce una serie de proteasas q se encargan de esa digestin; esas endopeptidasas tienen especificidad por secuencia de aa, reconocen una secuencia, un sitio especifico de esos aa, por Ej. Rompen entre lisina y Arginina o rompen entre ac. Glutmico y prolina, van a encontrar secuencias q reconocen y las van a romper, hay varias, como: la tripsina, la trombina, las carboxipeptidasas, las termodipsinas, de ellas se valen mucho en los estudios de laboratorio.
Una alteracin en la secuencia de las protenas tiene consecuencias muy graves en la estructura y en la funcin de las protenas en muchos casos, se pueden encontrar dos cosas en cuanto a la alteracin de la secuencia de las protenas, se puede encontrar q en una protena cambio el ac. Glutmico por el ac. Aspartico pero los dos tienen carga-, es muy posible q ese cambio en los aa no tenga consecuencia sobre la actividad de la protena porq son muy similares pero por Ej. en la anemia de las clulas falciformes se cambia un solo aa en una de las cadenas de la hemoglobina, la cadena beta de la hemoglobina en la posicin 6 u 8 hay un ac. Glutmico, en la clula falciforme se cambia ese aa por valina y ese solo cambio de ese aa, hace q cambie la estructura completamente y empiece la hemoglobina a formar grumos a pegarse entre ella y a perder la capacidad de transportar oxigeno y adicional a eso altera la flexibilidad del eritrocito, y adquiere una forma de medialuna, por solo cambiarse un aa en una de las cadenas, la cadena beta, es mas comn en las personas de raza negra.
A partir de eso se empez a mirar q tan importante era la secuencia de las protenas, apareci el seor edman q encontr un reactivo, el FENILISOCIANATO, que tiene la propiedad de pegarse a los extremos aminos y ciclarlo, ese aa es muy fcil de desprender con slns acidas, y el aa se identifica por el espectro de absorcin, ese reactivo de edman permite secuenciar protenas, el problema es q a medida q se va agregando el reactivo de edman empiezan a aparecer una serie de contaminantes q hace q el reactivo no se pegue al extremo amino sino q se pegue a cualquier grupo amino q encuentre por ah. Ya se sabe cual es la secuencia de los aa y eso se define como una estructura primaria de la protena, pero resulta q esa estructura primaria tiene q empezar a tomar forma. Si se deja la protena expuesta como una lnea larga de aa, fcilmente las proteasas pueden identificar donde hay lisina, arginina o prolina y cortar. El punto q busca la protena es mayor cantidad de enlaces menor energa acumulada, empieza a tomar configuracin, cuando se habla de configuracin se refiere a la forma q toma la protena.
Se habla de cuatro niveles estructurales: Estructura primaria q es la secuencia de aa q cambia de una protena a la otra pero siempre van a ser los mismos 20 aa. Estructura secundaria q es como se enrollan esa estructura primaria, cual es la forma q toman en el espacio. Estructura terciaria es como se envuelven esas estructuras secundarias. Estructura cuaternaria es cuando se tienen muchas cadenas polipeptdicas q se asocian para formar una sola protena
Las estructuras secundarias q se pueden encontrar son las alfa-hlices con giro a la der o giro a la izq o las laminas beta q pueden ser paralelas o antiparalelas, una cadena polipeptdica puede tener varias estructuras secundarias por Ej. los primeros 30 aa pueden formar un alfa hlice, del 35 al 50 pueden formar una lamina beta, del 55 al 80 pueden formar otra alfa-hlice, esto significa q una cadena no solo puede formar una estructura secundaria, una alfa hlice se conecta con otra alfa-hlice o con una lamina beta por medio de una estructura q se conoce como giro beta, son muy ricos en aa como la prolina y la glicina.
Alfa hlice: es un juego de aa q se enrolla alrededor de un eje imaginario, q pueden tener giro a la der o hacia a la izq, las alfas hlice tienden a enrollarse alrededor de un eje y colocar los grupos, las cadenas laterales hacia fuera, y en el medio esta el eje imaginario
LA ESTRUCTURA DE LA ALFA HELICE se estabilizan por puentes de hidrogeno, el primer aa se agarra del cuarto aa por un puente de hidrogeno y el cuarto va a estar agarrado del primero y del octavo aa, cada cuatro aa se establece un puente de hidrogeno, entonces el primero va a estar con el cuarto, el cuarto va a estar con el primero y con el octavo, el quinto va a estar con el segundo y con el noveno, cada uno va a tener dos puentes de hidrogeno q lo estabilicen, esos puentes de hidrogeno mantienen estables la cadena polipeptidica, los puentes de hidrogeno son muy dbiles y se pueden romper pero tienen la propiedad de ser cooperativos, el uno ayuda al otro, se estabilizan todos y juntos dan una fuerza bastante grande, es decir, si se coloca una cadena polipeptidica a un ph distinto, se tiende a romper los puentes de hidrogeno, si se somete al calor se tienden a romper los puentes de hidrogeno.
La alfa queratina es una protena q es rica en alfa hlice, se cojen dos alfa hlices, se enrollan, con giro a la derecha y luego esas dos cadenas se asocian y forman un protofilamento, y ese protofilamento forma la fibra de la alfa queratina, las alfas queratina son fciles de estabilizar por puente disulfuro, esa alfa queratina es la q se encuentra en el cabello, si se kiere cambiar la forma del cabello de rizado a liso o de liso a rizado, lo q se hace es reducir para romper los puentes de hidrogeno y luego vuelven a oxidar dejando grupos sulfidrilos libres, (pero eso va contra la premisa q se tiene de las protenas, se deca q una protena es estable cuando establece la mayor cantidad de enlaces y tiene la menor energa acumulada), luego la protena vuelve y se renaturaliza, vuelve a su estado.
El colgeno son tres cadenas alfa hlice, con giro a la izq, tienen en su estructura prolina, son ricas en prolina y en medio de esas alfas hlices queda un espacio muy pequeo, en el cual solo puede entrar la glicina, entonces el colgeno es una protena rica en prolina y en glicina y tiene algunos aa q son modificaciones, tiene prolina, hidroxiprolina, tiene lisina y tiene hidroxilisina, el paso de prolina a hidroxiprolina o de lisina a hidroxilisina depende de vitaminas, cuando se tiene deficiencia vitamnicas, tenemos problemas en esta conversin, la cual se lleva a cabo por una enzima q se llama prolinahidroxilasa o lisinahidroxilasa, eso depende de la vitamina C.
Lamina beta: son secuencia de aa, q como su nombre lo dice se ubican en forma de una lmina, de una placa, se parece como a un techo, como una teja:
LAMINA BETA Puede ser lamina beta paralela o antiparalela, las antiparalelas son las q llevan sentido contrario. Tambin se estabilizan por puentes de hidrogeno, la diferencia es q en las alfa hlice los puentes eran intracatenarios, estaban en la misma cadena de la alfa hlice, mientras q en la lamina beta son intercatenarios, entre dos laminas beta, otro detalle importante en la antiparalela si se miran con la paralela, es que son rectos, hace q los puentes de hidrogeno sean un poco mas fuerte, en la antiparalela, en cambio en la paralela los puentes son curvos y los hace un poco mas dbiles.
Las alfa hlices son muy ricas en glutamina, metionina, alanina, leucina, lisina, fenilalanina, ac. Glutmico. Las laminas beta son muy ricas en triptofano, isoleucina, valina y tirosina, en gral las laminas betas son mas ricos en aa ramificados (valina, isoleucina y leucina) q las alfa hlice. Los giros beta q unen una estructura secundaria con otra estructura secundaria, son muy ricas en prolina y en glicina, la glicina como es tan pequea, fcilmente se mete en el giro y la prolina esta muy presente, porq cuando hay varias seguidas, la cadena tiende hacer una curva.
Las enzimas hacen un dominio en el sitio activo q parece un bolsillo, de tal forma q el sustrato se pueda ubicar en el bolsillo, muchas veces apenas entra el sustrato al bolsillo se cierra y es lo q permite cumplir la funcin, si se cogiera ese dominio y se separa de la protena en un tubo este mantendra la funcin, es decir q un dominio funcional es aquel q yo puedo separar de la protena y mantiene su funcin de manera aislada, hay dominios q no son funcionales sino conformacionales y esos son como la huella digital de una familia de protenas, son dominios altamente conservados dentro de un grupo de protenas, por Ej. Los receptores en serpentina tienen un dominio conformacional q atraviesa la membrana celular 7 veces, entonces es un dominio q identifican los receptores en serpentina.
En los aos 60 y 70s se crea que todas las enzimas eran de naturaleza proteica, pero cuando se empezaron a estudiar los cidos nuclicos encontraron un tipo de RNA con actividad enzimtica: la transcripcin completa del DNA produce unas partes codificantes y no codificantes, las codificantes son exones y las no codificantes intrones luego se deben retirar los intrones y asociar exones en un proceso que se llama explasis y lo realizan los RNA con actividad cataltica, ahora sabemos que no todas las enzimas son protenas que hay una porcin mnima que es de naturaleza proteica el 99% de las enzimas son protenas, tenemos que recordar que la actividad de una enzima, por ser protena est muy asociada a su configuracin y esa configuracin va de la mano con la estructura primaria que depende mucho del medio. Durante una reaccin enzimtica vamos a encontrar algunos componentes que necesitamos reconocer o identificar: sustrato: molcula sobre la cual va a tener su actividad la enzima; asociado a muchas enzimas, no a todas, encontramos unas molculas que ayudan con la actividad cataltica de la enzima y las vamos a conocer como coenzima que pueden ser de naturaleza orgnica o inorgnica, las de naturaleza inorgnica son generalmente metales (Mg, Ca) las de naturaleza orgnica son bsicamente vitaminas: riboflavina, niacina, acido pantotenico ej. De coenzima orgnica: NAD (niacin adenosin dinucletido) interviene principalmente en reacciones de oxido reduccin la podemos encontrar en dos formas fosforilada y no fosforilada, la fosforilada interviene ms en reacciones anablicas, es decir en procesos de sntesis y la no fosforilada interviene en reacciones catablicas. A veces estas coenzimas estn asociadas de manera covalente a la protena (ya sabemos que son grupo prosttico) la porcin proteica de la enzima la vamos a llamar apoenzima y la no proteica (grupo prosttico) coenzima, la asociacin de la apoenzima y la coenzima forma la holoenzima, la holoenzima es la forma activa de la enzima. Las enzimas se clasifican en seis grupos: Oxidorreductasas, transferasas, hidrolasas, liasas, isomerasas y ligasas; esta clasificacin surgi porque en un principio se llamaban las enzimas segn el sustrato sobre el que actuaban y se el aada la terminacin asa pero hay muchas enzimas que trabajan sobre el mismo sustrato y por esto se crearon o definieron los grupos de enzimas. 1. Oxidorreductasas: intervienen en reacciones de oxido-reduccin tambin vamos a encontrar dentro de este grupo una serie de enzimas que se identifican con otro nombre: deshidrogenasas, oxidasas, reductasas, catalasas, oxigenasas o hidrolasas; eso dependiendo de de que accin tenga la enzima, deshidrogenasas cuando quitan hidrgenos, las oxidasas cuando usan como ultimo aceptor de electrones el oxigeno, pero el oxigeno no est metido dentro del producto, las reductasas cuando hay una reduccin, peroxidasas cuando se usa el potencial oxidativo del perxido de hidrogeno, catalasas son una clase especial de enzimas que trabajan sobre el perxido de hidrogeno, las oxigenasas utilizan el oxigeno como aceptor de electrones pero a diferencia de las oxidasas en las oxigenasas el oxigeno si hace parte del producto final, el grupo uno tambin tiene subgrupos, dependiendo sobre el grupo funcional o tipo de molcula que trabaje la oxidorreductasa: 1.1. sobre OH. 1.2. sobre grupo aldehdo 1.3. CH-CH 1.4 CH-NH2 1.5 CH-NH 1.6 NADH o NADPH. 2. Transferasas: transfieren grupos funcionales, dentro de este grupo podemos encontrar las transaldolasas: transfieren grupos aldehdos; transcetolasas: transfieren grupos cetona; acetil transferasas: transfieren grupos acetilos; aciltransferasas: transfieren cidos grasos; quinasas: transfieren grupos fosfato; fosfomutasas: cambian la posicin de un fosfato en una misma molcula. Subgrupos de acuerdo a al grupo que transfieran: 2.1 grupos monocarbonados 2.2 grupo aldehdo o ceto 2.3 aciltransferasas: cidos grasos 2.4 glucositransferasas 2.5 alquil transferasas 2.6 grupos nitrogenados 2.7 grupos fosfato 2.8 grupos sulfatos 3. Hidrolasas: rompen enlaces C-N; C-O; C-S o enlaces oxigeno fosfato y utilizan como aceptor de ese grupo que se est liberando cuando rompo el enlace al agua, dentro de este grupo vamos a encontrar las esterasas ej.: colesterolesterasas; glucosidasas: rompen enlaces glucosidicos como el que hay en el DNA; peptidasas; tiolasas; fosforilasas; lipasas; desaminasas; ribonucleasas. Dependiendo del enlace que se rompa vamos a tener subgrupos 3.1 enlace ester 3.2 enlace glucosidico 3.3 enlace ter 3.4 enlace peptidico 3.5 enlace C-N 3.6 enlace C-C.se pueden encontrar hasta 48 subgrupos. 4. Liasas: eliminan o agregan agua, CO2 o amoniaco y durante este proceso pueden crear o romper dobles enlaces, dentro de este grupo encontramos descarboxilasas, aldolasas, hidratasas, deshidratasas, sintasas y liasas. no confundir las sintasas con las sintetasas las sintasas sintetizan una nueva molcula pero durante la sntesis no se consume energa; no pertenecen a un solo grupo. Los subgrupos son: 4.1 enlaces C-C 4.2C-O 4.3 C-S 5. Isomerasas: interconvierten ismeros: ismero D a L, ismero cis a trans encontramos las racemasas, las isomerasas, epimerasas, y las mutasas. Subgrupos: 5.1 racemasas o epmerasas 5.2 cis trans isomerasas 5.3 transferasas... 5.99 otras isomerasas. 6. Ligasas: unen dos molculas para sintetizar una nueva, a este grupo pertenecen las sintetasas y las carboxilasas en las sintetasas siempre hay consumo de fosfatos de alta energa; subrupos: 6.1 forman enlaces C-O 6.2 forman enlaces C-N 6.3 forman enlaces C-C 6.4 forman enlaces esteres fosfricos. Hay tres formas diferentes para nombrar las enzimas; nombre sistmico por ejemplo: hexosafosfotransferasa que tambin tiene un nmero sistmico: EC 2.7.1.1 donde 2 es el grupo 7.1 el subgrupo y 1 la enzima. Y el nombre comn es hexoquinasa.
Propiedades de las enzimas:
1. Aumentan la velocidad de la reaccin (lo ms importante) y en un orden grande. 2. Son esteroespecificas: reconocen ismeros, la gran mayora son esteroespecificas, pueden diferenciar la D-fenilalanina de la L-fenilalanina, pueden diferenciar la glucosa de la galactosa (la galactosa y la glucosa se diferencian en la posicin de un OH en el carbono 2, es decir son epmeros) pero hay enzimas que son capaces de identificar ismeros con una habilidad asombrosa, pero hay otras enzimas que no tienen esa estereoespecificidad ej.: tenemos enzimas que son capaces de actuar sobre molculas muy parecidas. La hexoquinasa no tiene estereoespecificidad puede actuar sobre cualquier hexosa. 3. Las enzimas no se modifican durante la reaccin: la enzima interviene en la reaccin y al final de la reaccin est lista para volver a intervenir en otra reaccin, las enzimas pueden sufrir modificaciones pero son modificaciones temporales durante el proceso de la reaccin, al final de la reaccin siempre queda la enzima libre y otra vez dispuesta a empezar a actuar. 4. No altera el equilibrio de la reaccin si yo agrego enzima a una reaccin la reaccin ocurre ms rpido pero el equilibrio se mantiene. La estereoespecificidad est muy determinada por la configuracin de la enzima (recordar dominios funcionales) Definicin de trminos: Sitio activo: sitio o regin donde se lleva a cabo la funcin de la enzima; sitio de unin al sustrato: es el sitio donde se une el sustrato, puede hacer parte del sitio activo pero no necesariamente el sitio de unin al sustrato tiene que estar dentro del sito activo, puede estar en la vecindad del sitio activo; cuando est en la vecindad del sito activo la unin del sustrato a la enzima produce cambio conformacional en la enzima y el sitio activo se desplaza hasta donde est el sustrato y cumple su funcin; sitio alostrico: es un sitio diferente al sitio de unin al sustrato, diferente al sitio activo donde se va a unir un regulador que lo vamos a llamar regulador alostrico. Una enzima puede (y generalmente lo hace) tener muchos sitios activos aunque algunas tienen solo uno. La estereoespecificidad depende de la configuracin de la protena y de la configuracin del sitio activo: generalmente los sitios activos son ricos en aminocidos no polares para hacer que el agua se desplace, se salga del sitio y no haga parte de la reaccin a no ser que sea una enzima que utilice el agua como sustrato, los sitios activos son ricos en aminocidos como la histidina, la cistena que asociarse al sustrato. La unin del sustrato a la enzima siempre se hace por fuerzas dbiles nunca la enzima se une al sustrato por enlaces fuertes (covalentes) porque la enzima tiene que quedar libre. Los aminocidos que forman el sitio de unin al sustrato en la estructura primaria pueden estar muy alejados pero una vez se forma la configuracin de la protena los aminocidos pueden volverse muy activos, no modifican la reaccin el producto va a ser el mismo en presencia o no de la enzima. Los mecanismos con que se hace la catlisis pueden ser diversos. La reaccin depende de la posibilidad que tengan los sustratos de encontrarse entre s con la suficiente energa para producir la reaccin; yo puedo acelerar la catlisis de varias formas a travs de las enzimas: Catlisis covalente: las coenzimas se asocian covalentemente al sustrato y lo mantienen muy cerca al sitio activo, por ejemplo: las transaminasas transfieren grupos aminos entre aminocidos y un cetocido para eso va a usar fosfato de piridoxal (PLP) toma el grupo amino lo pega y forma la base de shiff cuando se pega al nitrgeno hace muy lbil al aminocido y hace que la transaminasa pueda romper el enlace, se libera el cetocido y queda el grupo amino pegado al PLP y este PLP queda convertido en fosfato de piridoxiamina. Lo anterior se da porque la coenzima se asocia al sustrato de forma covalente y lo vuelve inestable facilitando la ruptura de los enlaces para dar el producto. Catlisis acido-bsica: depende de aminocidos que son electroflicos o netroflicos es decir que tengan carga negativa o positiva, la habilidad de ellos de tomar o donar protones nuevamente desestabiliza al sustrato y facilita su degradacin ejemplo: quimiotripsina. A veces no hay necesidad de aadir o quitar molculas al sustrato sino que la simple unin del sustrato a la enzima cambia la configuracin del sustrato y lo vuelve ms inestable y ese sustrato inestable es mucho ms lbil este tipo de catlisis se llama: catlisis de tensin. Catlisis de aproximacin: es quiz la forma ms importante de catlisis que tienen las enzimas y consiste en aumentar la concentracin del sustrato alrededor del sitio activo se ha visto que una enzima es capaz de aumentar entre 1000 y 100000 veces la concentracin del sustrato alrededor del sitio activo si se compara con el resto del volumen de la solucin en la cual se encuentra. Se concentra mucho el sustrato alrededor del sitio activo y si aumento la concentracin alrededor del sitio activo la posibilidad de que ocurra la catlisis es mucho mayor. Las enzimas pueden usar cualquiera de esos mecanismos, algunas enzimas como la quimiotripsina utiliza dos: la catlisis acido-bsica y la catlisis covalente, la mayora de las enzimas utiliza la catlisis por aproximacin. Siempre en una reaccin enzimtica hay una diferencia entre el sustrato y el producto y siempre que quiera convertir un sustrato en un producto voy a pasar por el estado de transicin en el cual el sustrato se vuelve muy lbil. La diferencia entre el producto y el sustrato delta de G o energa libre estndar de Gibbs y hay un estado de transicin yo necesito que el sustrato lo alcance para que se convierta en el producto. La energa que yo consumo para que el sustrato alcance el estado de transicin se conoce como energa de activacin tengo que darle energa a las molculas para que alcancen el estado de transicin. Si Ud. quiere que una cosa reaccione con otra o le pone calor o un catalizador, pero siempre se debe pasar por el estado de transicin.
PARTE DOS
Siempre que queremos convertir un sustrato de un producto tendramos que pasarlo a un estado de transicin y que ese estado de transicin era un momento o una condicin del sustrato en la cual el se volva muy inestable y terminaba convirtindose en el producto con el fin de encontrar su estabilidad.
Vemos que para que el sustrato se convierta en el producto debe llegar al estado de transicin, el cual es mucho ms energtico que el sustrato y que el producto, la energa que se le da al sustrato para llegar al estado de transicin vuelve y se recupera cuando este sustrato o este estado de transicin cambia hacia el producto y vuelvo a tener la misma energa con la que empez, entonces ac no hay cambio de energa. Ese estado de transicin puede tomar 2 sentidos: puede devolverse hacia el sustrato nuevamente con una velocidad representada por la constante K y este estado de transicin se convertira en producto tambin pero esta conversin es irreversible y esa velocidad con la que se convierte ese estado de transicin en producto lo vamos a representar con una V que va a depender de la concentracin del sustrato, para que el estado de transicin vuelva a ser sustrato o producto depende de la constante K y de la V, si la constante K es mayor que la V pues va a tender a convertirse en sustrato y si la V es mayor que la constante K pues el estado de transicin pasa a convertirse en Producto. A pesar de necesitarse tanta energa para llegar a ese estado de transicin la gran parte de esa energia que utilizamos la recuperamos cuando hacemos la conversin a producto, entre el sustrato y el producto hay una diferencia de energia, el producto tiene menos energia que el sustrato entonces es una reaccin exergnica (libera energia).Esta es una reaccin no catalizada porque no estamos usando enzimas ah. La barrera para llevar a cabo ese proceso es la energia de activacin, se necesita que los sustratos alcancen esa energia de activacin para llegar al estado de transicin. Para aumentar la velocidad las enzimas disminuyen esa energia de activacin. Si la energia de activacin disminuye o tengo mas sustrato es ms fcil alcanzar el estado de transicin para llegar al producto. Ese estado de transicin que se alcanza con la enzima tiene varios estados intermedios, hay entonces varias enzimas que hacen varios estados intermedios para llevar a cabo una reaccin. Cada uno de esos estados tendrn su nivel de energia necesario.
S + E me va a formar el complejo E-S, este complejo E-S es el que me facilita alcanzar el estado de transicin. El complejo E-S se va a romper y me va a dar como resultado el producto + la E (las enzimas no sufren modificaciones cuando hablamos de una reaccin), la E no altera el equilibrio de la reaccin pero si aumenta la velocidad de la reaccin disminuyendo la energia de activacin. La diferencia de energia entre los reactantes y los productos se mantiene se use o no catalizador, las enzimas solo cambian la forma de energia (por ejemplo energia qumica a mecnica) pero la diferencia de energia se mantiene.
En el dibujo anterior tenemos la mezcla enzima sustrato, el sustrato se ensambla a la enzima, y este complejo E-S luego se va a transformar en E-P y la enzima vuelve a ser reciclada. La cantidad de E S va a depender de con que velocidad se asocien la enzima y el sustrato para formar el complejo y con que velocidad este complejo E-S se transforma en enzima + producto. Hay varias cosas que afectan la velocidad de una reaccin (la concentracin del sustrato, la concentracin de la enzima, la afinidad de la enzima por el sustrato). En el estado en que la enzima se pega con el sustrato se alcanza el estado de transicin. A veces puedo tener la suficiente cantidad de sustrato pero los sustratos no se enlazan, entonces en este caso las enzimas ayudan a que los sustratos se encuentren y entonces eso puede reducir la energia e activacin, ahora la enzima los orienta y facilita la reaccin. Otro mecanismo que se puede aplicar aqu es la orientacin de los sustratos, tienen que tener una orientacin particular para llevar a cabo la reaccin, las enzimas facilitan darle esa orientacin a los sustratos y entonces ms fcilmente alcanzan el estado de transicin y por tanto pueden dar el producto. Cmo se une el sustrato a la enzima? Hay 2 modelos.
Modelo de llave cerradura: la enzima reconoce al sustrato como una cerradura reconoce a la llave (encajan perfectamente), y unas vez hayan encajado se lleva a cabo la reaccin. Este modelo explicaba la especificidad de las enzimas pero tena un inconveniente: algunas enzimas no tenan tanta especificidad entonces no se acoplan a este modelo. Entonces surgi un segundo modelo llamado modelo de Ajuste Inducido.
Ajuste Inducido: el sitio de reconocimiento del sustrato que puede estar alrededor del sitio activo o dentro del sitio activo, una vez el sustrato se ha unido a la enzima la enzima sufre un cambio conformacional para acoplarse al sustrato y el sustrato tambin sufre una modificacin en razn a la unin a la enzima y esa modificacin que sufre el sustrato alrededor de la enzima es la que llamamos estado de transicin. Una vez se ha alcanzado esa asociacin de sustrato enzima y hemos alcanzado el estado de transicin fcil vamos a alcanzar a formar el producto + E y nos queda la enzima lista para volver a trabajar. El segundo modelo es el ms aceptado porque explica la especificidad de la enzima y la flexibilidad de aquellas enzimas que no son tan estereoespecficas.
Qu caractersticas tiene el sitio activo? Es tridimensional, es como una hendidura dentro de la protena, generalmente son ricos en aminocidos no-polares porque buscamos desplazar el agua del sitio activo, constituyen un 5% o 10 % del total de masa de la enzima, el otro 90% sirve para darle estabilidad a la enzima. La actividad de una enzima depende de la configuracin, si se altera la configuracin de la enzima tambin se altera la configuracin de su sitio activo y por ende no va a haber actividad enzimtica.
Qu reglas controlan la velocidad de la reaccin? Por ejemplo tenemos una determinada concentracin de enzima, y le empezamos a agregar sustrato poco a poco y vamos a tener en esa primera etapa que la enzima y el sustrato se unen y se forma el complejo E-S y este complejo E-S se va a convertir en un producto mas la E. La velocidad de la reaccin al comienzo va a depender de la concentracin de un solo sustrato, no va a depender de la enzima porque ya sabemos que tenemos una concentracin constante de enzima, entonces vamos a agregarle sustrato y la velocidad de la reaccin depende de la concentracin del sustrato. Esta primera fase de la reaccin en la cual la velocidad de la reaccin depende de la concentracin del sustrato nos define el orden de la reaccin. Reaccin de primer orden: Cuando la velocidad de la reaccin depende de la concentracin de un solo sustrato. Ej: A + Enzima se convierte en el complejo AE y finalmente en el Producto Z, la velocidad de la reaccin depende de la concentracin de A.
Reacciones de segundo orden: Si tuvisemos 2 sustratos la velocidad de la reaccin dependera de los 2.
Reacciones de orden cero: son aquellas que no dependen de la concentracin de ningn sustrato.
Ejemplo: Tenemos altas concentraciones de un sustrato y la enzima tiene una concentracin constante A, La enzima y el sustrato se asocian y forman el complejo E-S y empieza a surgir el producto. La enzima desaparece como enzima libre, surge como complejo E-S. Hay una fase en este periodo en el que la concentracin E-S se mantiene constante, es decir no va a modificarse y vamos a alcanzar un equilibrio. La velocidad con la que se produce el complejo E-S es la misma con que se destruye el complejo ES. En estos momentos la enzima se ha saturado (es decir que todos los sitios activos de la enzima estn acoplados, estn unidos al sustrato), La velocidad con la que se produce el complejo E-S depende de la constante de velocidad K1, depende de la concentracin de la enzima y de la concentracin del sustrato. La velocidad con la que se destruye el complejo E-S va a depender de 2 constantes de velocidad porque puede tener 2 destinos: E-S se puede convertir en enzima + producto (K 2); entonces, cunto E-S termina convirtindose en producto depende de k 2 y de la concentracin E-S. Pero la otra posibilidad del complejo E-S es que se regrese, entonces va a depender de K -1 que es la constante de velocidad de la reaccin inversa, entonces depende de K 1, entonces k 1 x [ enzima sustrato ]. En conclusin, la cantidad de complejo E-S que se destruye es = a aquel que se va para producto + aquel que se devuelve para el complejo E-S, o en otras palabras, la velocidad con la que se sintetiza E-S es igual a la velocidad con la que se degrada.
Ahora vamos a buscar el estado estacionario, es decir aquel en el que la [E-S] es constante, debemos llegar al estado estacionario que es el que nos va a permitir hacer la relacin de la velocidad con los diferentes factores que la pueden afectar. Entonces yo necesito saber en el estado estacionario que la [E-S] se va a mantener constante, entonces veamos con que velocidad se sintetiza y con que velocidad se destruye. La sntesis solo depende de la reaccin que se de en este sentido, k 1 es la constante de velocidad para esta reaccin, entonces k1que es la constante de velocidad va a depender de la [S] y de la [ E ]. Entonces si se multiplica K 1 por la [S] y la [E ] me da la cantidad del complejo E-S que se ha formado, la velocidad con que se ha formado ese complejo E.S. Pero ese complejo E-S tambin se puede destruir, entonces el complejo E- S puede convertirse en producto y va a depender de la constante de velocidad K 2, k 2 x [E-S] me determina con que velocidad el complejo E-S se convierte en producto. La otra probabilidad es que el complejo E-S se regrese, y para que el complejo E-S se regrese depende de la constante de velocidad K -1. K -1 x [E-S] me dice con que velocidad se regresa la reaccin. Si yo sumo la cantidad de enzima sustrato que se transforma en producto ms la cantidad de E-S que se regresa, voy a tener la velocidad con la que se destruye el complejo E-S. Supuestamente en condiciones en el estado estacionario, la velocidad con que se sintetiza debe ser = a la velocidad con que se degrade.
En este ejemplo es la misma historia que en los anteriores, a medida que se aumenta la cantidad del sustrato se alcanza la velocidad mxima, en el estado estacionario se alcanza la velocidad mxima (la cantidad de enzima y de sustrato es suficiente para que se forme producto de manera constante). Cuando la cantidad de enzima o la [ S ] es muy alta la velocidad de la reaccin se vuelve constante entonces en ese momento hemos alcanzado la velocidad mxima.
? En el estado estacionario hay 2 posibilidades: que se vuelva producto o que se regrese; lo que determina que una reaccin lleve a un sentido o el otro son las barreras energticas. ? El estado estacionario no es el mismo estado de transicin es aquel momento de la reaccin en la que la [ ] del complejo E-S no vara. En el estado estacionario la velocidad con la que se produce el complejo E-S es = a la velocidad con que se destruye el complejo E-S. El producto depende de K 1 x [ S ] x [ E ] y la forma como se destruye depende de la [ E-S] + K -1 x [E-S] , esto es lo que llamamos estado estacionario (la velocidad de produccin es = a la velocidad de degradacin y la [ complejo E-S] es constante).
La [ ] de le enzima total = a la enzima libre + la [complejo E S]. Ecuacin de ? : KM = Velocidad mxima / 2 o concentracin del S a la cual se alcanza la mitad de la velocidad mxima. El KM tambin es una relacin de afinidad de la enzima, cuanto ms pequeo es el KM, mas afn es la E por el S. En la parte inicial de una reaccin, la velocidad de sta depende de la [ ] del sustrato, es una reaccin de primer orden, pero al final del proceso en la fase estacionaria, la velocidad de la reaccin no depende de la [ ] del S.
Ejemplo del man: El alcohol en nuestro organismo se transforma en acetaldehdo y el acetaldehdo en acetato, el responsable de que las personas se pongan coloradas al tomar es el acetaldehdo. Hay personas que tienen la afinidad por el acetaldehidodeshidrogenasa (convierte acetaldehdo en acetato) muy alta entonces las concentraciones de acetaldehdo son elevadas y los vemos rojos como un pizco. Hay otras personas que por el contrario el acetaldehdo tiene un KM bajo, entonces muy poco acetaldehdo va a formar acetato y no presenta ese fenmeno.
# De recambio: tiempo que gasta una enzima despus de asociarse al sustrato para volver a agarrar otro sustrato. Acurdense que la E al principio se asocia al S y luego el complejo E-S se desprende para producir E libre, esa E libre tiene que volver a agarrar otro sustrato entonces el # de recambio es cuanto tiempo se gasta le E despus de asociarse a ese S para desprenderse y volver a agarrar otro sustrato. Cuanto ms alto es el # de recambio, ms eficiente es la reaccin, entonces una enzima que hace recambio de 100 molculas es ms eficiente que una que hace recambio de 10 molculas(huyyyyque pilln ese Flanders). Entonces debemos tener en cuenta 2 variables: el KM y el # de recambio, lo ideal es que una enzima tenga un # de recambio alto y un KM muy bajo y eso significara que la enzima es muy eficiente y muy afn. Tambin podemos encontrar enzimas con un KM bajo y un # de recambio bajo, en este caso la E sera muy afn pero muy poco eficiente. Si el caso es al contrario, la E con un KM alto y con un # de recambio alto tampoco sirve porque la E sera muy eficiente pero muy poco afn.
Factores que afectan la velocidad de una reaccin enzimtica:
1. La concentracin del sustrato es un factor que modifica la velocidad de una reaccin antes de alcanzar el estado estacionario (porque cuando se alcanza el estado estacionario se satura la enzima y puedo echarle chochomil molculas de sustrato y la velocidad no va a aumentar), entonces hasta cierto momento la concentracin del sustrato me va a modificar la velocidad de la reaccin.
2. La concentracin de la Coenzima, las coenzimas son las que se comportan como un segundo sustrato entonces tambin puedo modificar la velocidad de una reaccin disminuyendo la concentracin del sustrato. Este es uno de los mecanismos que utilizamos para regular nuestro metabolismo energtico.
Ejemplo de Rod Flanders: Usted puede producir muchas molculas de Acetil Coa degradando glucosa o degradando cidos grasos pero si usted no tiene oxgeno no puede obtener coenzimas en estado oxidado, porque a pesar de tener mucho sustrato para la enzima la reaccin no se da porque la coenzima no est en condiciones adecuadas.
3. Concentracin de la enzima: En el organismo hay 2 tipos de E: unas llamadas constitutivas las cuales mantienen su [ ] constante independiente de los estmulos, no se modifican, pero hay otras E que s responden a estmulos y son llamadas E inducibles las cuales ante un estmulo determinado lo que hacen es actuar sobre el gen para que aumenten las sntesis de la protena.
Ejemplo segn Tod Flanders: La cidograsosintasa es una E inducible, en nuestro organismo la sntesis de cidos grasos depende de la cantidad de Acetil Coa que yo le regale y ste Acetil Coa depende de la cantidad de glucosa que usted consuma. El Acetil Coa se convierte en malumil y luego ese malumil se convierte en el cido graso y ese cido graso lo voy a almacenar en forma de triacilglicerol y se va al tejido adiposo. Se depende para este proceso de la cantidad de glucosa. La [ ] de glucosa le dispara a un paciente normal la secrecin de insulina, la insulina activa factores de transcripcin y esos factores de transcripcin inducen la cidograsosintasa entonces si usted tiene ms enzima y le est regalando sustrato a la enzima lo que est aumentando son los niveles de triacilglicerol, el consumo de glucosa elevados induce la sntesis de triacilglicerol, entonces la cidograsosintasa sera una E inducible porque se puede aumentar la actuacin de la enzima ante un estmulo.
4. Ph: Tiene que haber un pH ptimo para que la enzima acte eficazmente porque por debajo o por encima de ese pH ptimo la velocidad de la reaccin disminuye y se puede desnaturalizar. Las E tienen diferentes pH ptimos.
5. Temperatura: la misma mierda, las enzimas tienen una temperatura ptima, a temperaturas ms bajas la actividad se hace ms lenta porque disminuye la posibilidad de posicin entre las partculas, y a temperaturas elevadas la velocidad tambin es lenta porque se desnaturaliza la E.
Nosotros debemos regular la actividad enzimtica, un mecanismo que tenemos es modificar la [ ] de la E (enzimas constitutivas e inducibles), pero no se puede jugar con el pH y la temperatura, entonces aparecen los inhibidores que son molculas en algunos casos muy parecidas al sustrato que logran disminuir la velocidad de una reaccin. Hay 2 tipos de inhibicin:
Inhibicin Competitiva: es una inhibicin competitiva en la cual el inhibidor se parece mucho al sustrato entonces la E puede reconocer al inhibidor y confundirlo con el sustrato. El inhibidor se une al sustrato y forma un complejo E I. Mientras este el complejo E I la enzima no puede unir al sustrato luego la velocidad de la reaccin disminuye, pero esta unin es reversible y puede volver a dejar la enzima libre y el inhibidor libre. La constante de velocidad con que se asocia o se disocia el inhibidor a la enzima la vamos a llamar K F. Como esta es una inhibicin competitiva porque hay competencia entre el inhibidor y el sustrato si usted coge un tubito con E S y le echa inhibidor la velocidad disminuye. Si se le empieza a agregar ahora ms cantidad de sustrato va a haber mayor probabilidad que la enzima reconozca al sustrato y entonces si se d la reaccin, entonces estas inhibiciones competitivas se pueden salvar aumentando la [ ] del sustrato. Eso significa que cuando hay inhibidor el KM de la E aumenta, y se va a necesitar ms sustrato para alcanzar la mitad de la velocidad mxima pero la velocidad mxima de la reaccin no se modifica. En conclusin la inhibicin competitiva disminuye el KM, no afecta la velocidad mxima y aumenta el sustrato.
Otro tipo de inhibicin reversible es la No-Competitiva en la cual el inhibidor se une a un sitio diferente al sitio activo formando el complejo E-S-I. Ya no necesariamente el inhibidor se tiene que parecer al sustrato. La unin de ese inhibidor al sitio de inhibicin hace que la estructura de la enzima se modifique y disminuya la velocidad de la reaccin. El KM de la reaccin no se modifica porque el sitio de unin es diferente al sitio activo y as usted le hecha chochomil molculas de sustrato la velocidad mxima disminuye. Esa modificacin depende de la [ ] del inhibidor y de la constante del inhibidor.
PARTE TRES
Otros tipos de inhibicin. Acompetitiva: el inhibidor se une solo al complejo ES, no se une a la enz libre. La cantidad de complejo ES inhibidor depende de la concertacin del inhibidor y la cte del inhibidor. Se afecta Km y V max en la misma proporcin. En la grafica la pendiente no se modifica por esto.
Inhibiciones irreversibles
Es la suicida. El inhibidor se asocia al sitio act, es parecido al sust, el inhibidor es modificado por la enz y se pega de forma covalente a la enz. Es decir no se desprende. La enz queda inhibida mientras la prot tenga vida. Este tipo de inhibicin es muy usada en farmacologa. La penicilina es un inhibidor irreversible de algunas enz que se encargan de la sntesis de la pared celular en las bacterias. El cianuro es un inhibidor irreversible de las enz que tienen dentro de sus est iones como el Zn y Cu, en la cadena respiratoria hay unas enz que se encargan de hacer la transferencia de los electrones a travs de la cadena respiratoria y que luego se acopla a la fosforilacin oxidativa, el cianuro se pega al complejo 3 y evita el traspaso de los electrones hacia el O2 y lo bloquea. El paratin es un insecticida q se usa en la agricultura, tambin es un tipo de inhibidor irreversible.
Regulacin alostrica
Hay rutas metb q tienen los mismos sust. Cuando se consumen carbohidratos y se quiere obtener energa de ellos, haciendo la ruta metb de la glucolisis para degradar la glucosa, esta ruta tiene reacciones reversibles e irreversibles que llevan a la obtencin de energa, o a la creacin de ac grasos. En condiciones de ayuno se empieza a tener deficiencia de carbohidratos por lo que el organismo busca otras rutas metablicas para obtener glucosa para las clulas que usan ppalmente este sustrato como el eritrocito y las neuronas. En la gluconeognesis a partir de a.a. se hace lo contrario a la glucolisis se llega a fructosa 1,6 difosfato y tiene q convertirse a fructosa 6P, esta conversin la hace la fructosa 1,6 difosfatasa, luego tiene que pasar a glucosa 6P con ayuda de la glucosa 6 fosfatasa, si no hubiera regulacin en estas enzimas luego de llegar a glucosa 6P se devolvera por la glucolisis para obtener energa y se convertira en un ciclo que es llamado vano o ciclo intil, donde se sint una molcula para volverla a degradar por esto se debe regular la fosfofructoquinasa 1, la fructosa 1,6 difosfatasa y la glucosa 6 fosfatasa para que no se den estas 2 rutas al tiempo, inhibiendo una cuando la otra esta activa, para que si estoy en glucolisis no sintetice glucosa y si estoy en gluconeognesis no degrade glucosa. Esta es una de las razones por las que debe existir la regulacin alostrica. Otra razn es que estas rutas son esenciales para sintetizar sustratos, y se consume energa, y como el organismo es econmico energticamente (zapatoqueo), evita el consumo de energa cuando no es necesario. Muchas de las molculas que se van a sintetizar tienen un efecto grande como los NT y su concentracin siempre debe ser kte.
Enz alostricas: son las que tiene un sitio diferente al sitio act al que se va a pegar una molcula, esas molculas que se pegan a las prot. Se conocen como ligando y pueden ser hormona, o en el caso de las enz puede ser un regulador, pero los que tiene efecto sobre la regulacin son llamados efectores o moduladores, por tanto a las enz alostricas en el sitio alostrico se les pega un efector o moduladores. Los moduladores pueden ser + o -, es decir pueden estimular o inhibir la act de la enz, esta regulacin es sinrgica, si tengo dos moduladores + la act de la enz es mayor que si hay uno solo. Las enz alostricas puede ser monomricas (tener una sola subunidad) o pueden ser oligomricas (varias subunid) cada subunidad alostrica est formada por varias cadenas y son llamadas protmeros.
Efectos sobre las enz alostricas
Efecto homotropico: si se une un ligando a la enz, ese ligando va a tener efecto sobre la act de la enz para con el mismo. Cuando hay concentraciones elevadas de glucosa en algunos tipos de cel la hexoquinasa es estimulada. Es decir la glucosa estimula la hexoquinasa para que reconozca a la misma glucosa.
Efecto heterotrpico: un ligando se pega a la enz y modifica la act de la enz por otro ligando. La fosfofructoquinasa es estimulada o modulada de forma alostrica por el ATP. Altas concentraciones de ATP inhiben a la fosfofructoquinasa, y disminuyen la afinidad de la fosfofructoquinasa por la fructosa 6P. Es un efecto heterotrpico negativo, en tanto que el AMP tiene un efecto heterotrpico positivo, si se aumentan los niveles de AMP se unen alostricamente con la fosfofructoquinasa para aumentar la afinidad de la enz por la fructosa 6P. La fosforibosilpirofosfato es la ms importante para la sntesis de las bases nitrogenadas usa ribosa y ATP, al sitio cataltico deben unirse ribosa y ATP, para que la enz produzca fosforibosilpirofosfato, al final de esta ruta metablica se produce GMP y AMP. Para este caso el ATP y el GTP son moduladores negativos y se pegan a un sitio alostrico a la fosforibosilpirofosfato sintetasa, el fosfato inorgnico es un modulador +, se asocia a la enz en un sitio alostrico y activa la enz. Una enz puede tener ms de un sitio alostrico. Si se compara la cintica de estas reacciones alostricas con las no alostricas se ve que no siguen la cintica de Michaelis-Menten, las alostricas muestran una curva sigmoidea entre el sustrato y Vmax, que es parecida a la curva de asociacin del O2 y la hemoglobina, y tiene un fenmeno similar al que ocurre entre O2 y la hemoglobina, la hemoglobina tiene 4 subunid y cada una tiene un grupo hemo y cada grupo hemo es capaz de unir O2, cuando el O2 se pega a una de las subunid hay cambio conformacional y favorece que una nueva molec de O2 se pegue a otra subunid y esta facilita que una 3 se pegue y as con otras, este fenmeno es conocido como cooperatividad, esto es lo que sucede en las enz alostricas, por esta cooperatividad es que se dice que no siguen la cintica de Michaelis-Menten
Caractersticas de cooperatividad
Esta cooperatividad dice que hay regiones que a pesar de cambiar las concentraciones de sustrato de manera marcada, la V de la reaccin no aumenta mucho, y es en el principio de la reaccin, a diferencia de las enz que manejan la cintica de Michaelis-Menten que al principio de la grafica se comporta como una reaccin de 1 orden. En la parte central hay una regin en la que pequeas modificaciones en la concentracin del sust, cambian la V de la reaccin. Tambin se encuentra el estado estacionario en el que a pesar de que se agregue sustrato la V de reaccin no cambia. Las caractersticas anteriores hacen referencia a la cooperatividad. Todas las molculas que presentan cooperatividad tienen una curva sigmoidea.
Modelos de cooperatividad
Secuencial y concertado. Las enz alostricas se supone que siempre van a tener 2 estadios, un estado R que es relajado ms activo, y otro T que es tenso de menor actividad.
Concertado: la conformacin de la enz, la de la Diapo tiene 2 protmeros, la unin del sustrato al primer protmero modifica la configuracin de la enz afectando los 2 protmeros, haciendo que se aumente la afinidad del 2 por el sustrato, solo se necesita que se pegue uno para que toda la enz se modifique, pasa del tenso al relajado.
Secuencial: se da cuando hay varios sustratos, el sustrato 1 modifica el primer protmero hace que se modifique el 2 protmero aumentando la afinidad por el sustrato, y el cambio en el 2 protmero, altera el 3 protmero y facilita la unin del sustrato 3 a este protmero, y as con los otros protmeros. Por esto es que es secuencial.
Los 2 modelos explican el comportamiento sigmoidea de las curvas simtricas, el concertado se refiere ms a las enz que usan un solo sust mientras q el secuencial ser refiere a la enz que usa ms de un sustrato, sin embargo no significa que una enz de un solo sustrato no pueda seguir el modelo secuencial. Hay enz con muchos protmeros y cada protmero cataliza la misma reaccin, una enz formada por 4 protmeros y los 4 son capaces de convertir citrato en fumarato ah se puede presentar el modelo secuencial.
En la regulacin alostrica se pueden encontrar enz que modifican el Km y la Vmax, y enz que modifican el Km sin modificar la Vmax, la cintica alostrica es parecida a la inhibicin No competitiva pero no cumple las mismas reglas porque en la inhibicin no competitiva no hay cooperatividad.
Hay varios mecanismos regulatorios en la act enz, cuando agrego una molcula a la enz la puede hacer cambiar del estado tenso al relajado y viceversa, en el caso de la glucgeno fosforilasa, que convierte el glucgeno en glucosa 6P, esta enz puede estar en 2 estados R y T, el paso de T a R en este tipo de enz es act por el AMP, en tanto que el citrato y el atp hacen lo contrario convierten el T en R. El hecho de que una enz tenga este tipo de regulacin no quiere decir que no tenga mecanismos adicionales, que tengan 2 subunid las enz una reguladora y una cataltica, una porcin de la subunid reguladora tiene una secuencia que se parece mucho al sustrato y le permite a la subunid reguladora meterse al sitio activo para inhibirla, pero ante ciertos estmulos se puede cambiar la configuracin de la porcin reguladora, para este caso el AMP cclico se pega a la subunid reguladora, le cambia la est y lo desprende de la porcin cataltica, y el sitio act queda libre y puede desempear su fx. La proteinquinasa A es una enz que tiene un papel importante en la sealizacin intracel, en llevar el mensaje de la hormona adentro de la cell, el modelo del estado R y T se le puede aplicar a la glucgeno fosforilasa, cuando se ayuna se aumentan los niveles de adrenalina y glucagn, esta ltima se une al receptor y a travs de una cascada de sealizacin, el glucagn aumenta las concentraciones del AMP cclico, en la membrana esta el receptor del glucagn que es de tipo serpentina, y la hormona se une al receptor, y el complejo hormona receptor act la prot G y esta act la adenilatociclasa que convierte el ATP en AMP, y el AMP activa la proteinquinasa A y esta a su vez pasa la forma inactiva de la prot a la forma activa, y la proteinquinasa fosforila la glucogenofosforilasa, y la va a activar. Ah hay 2 mecanismos regulatorios sobre la proteinquinasa A, uno el paso del estado T al R, y dos liberar las porciones reguladoras de la porcin cataltica y de esa forma activar a la enz.
Las enz dependientes de Ca tienen un dominio regulador y un domino cataltico, y cuando no tienen asociada la calmodulina son inactivas, La calmodulina en presencia de Ca cambia su est y se pega a la porcin reguladora inactivndola, y esa inactivacin hace que la enz que es dependiente de Ca pase a condicin act, la calmodulina es la que despega la porcin reguladora. La regulacin alostrica puede funcionar como un mecanismo De FEED BACK, en estos mecanismos hay unas reacciones enzimticas donde las vas se pueden o no disociar y los productos finales de la ruta inhiben las reacciones iniciales de esa ruta, generalmente esas reacciones iniciales son limitantes de un proceso metablico. Una ruta puede tener 25 reacciones y lo que busca el metabolismo es seleccionar de esas reacciones la que sea ms fcil de regular, y la ms fcil de regular es la catalizada por una enz que tenga una V baja y un Km elevado. En el caso de la glucolisis hay alrededor de 18 reacciones, pero solo 3 son las reacciones que tienen capacidad regulatoria, una es el paso de glucosa a glucosa 6P, que es regulado por la hexoquinasa que tiene un Km elevado para la glucosa, una V baja y es una reaccin irreversible (las reacciones irreversibles son las energticamente desfavorables). En esta reaccin es importante saber que tiene un Km alto, una V baja y que es IRREVERSIBLE. La fosfofructoquinasa tiene un Km bajo por la fructosa 6P luego tiene una V baja, esta enz tiene ms baja V que la de la reaccin catalizada por la hexoquinasa a tal punto que la V de la glucolisis est determinada por esta enz, a mas baja V ms fcil de regular la enz. La piruvatoquinasa que convierte el fosfoenol piruvato en piruvato. No siempre las rutas metablicas tiene varias reacciones regulatorias, hay rutas metablicas que con una reaccin regulatoria es suficiente, en el caso de la sint de ac graso la acetil coenzima A carboxilasa es la que regula la sntesis. Para la sint de CT la hidroximetilglutalilenzima A reductasa, estas son las enz que en estas rutas metablicas presentan menor V de reaccin y son IRREVERSIBLES.
Ejemplo de regulacin por feed back
Conversin de aspartato en isoleucina y metionina, la sint de a.a. siempre implica consumo de energa, que no necesariamente debe estar explicito en la reaccin, no necesariamente saco la energa del ATP, sino de sustratos de otras rutas. La isoleucina tiene regulacin por retroalimentacin sobre la primera enz que es una quinasa, igual con la conversin de treonina en alfa cetoglutarato, que tiene regulacin por retroalimentacin en varias enz. Al igual en la sntesis de nucletidos purnicos el producto final de esa reaccin regula las reacciones iniciales. Las reacciones regulatorias siempre estn al ppio de una ruta metb son las primeras, para el caso de la glucolisis la primera es la hexoquinasa.
Regulacin cruzada
Le efecto regulatorio se da cuando lo que le sucede a una ruta tiene efecto sobre otra ruta diferente. Cuando se hace sntesis de nucletidos para poder pasar de inosisn monofosfato a xantinmonofosfato se necesita ATP, y el paso de inosin monofosfato a adeninsuccinato depende de GTP. Cuando los niveles de ATP se aumentan regulan la inosinmonofosfato deshidrogenasa estimulandola para que se aumente el GTP, y el aumento de los niveles de GTP estimulan la adenilsuccinato sintetasa para la sntesis de de adenilsuccinato. La sntesis de ac graso parte de acetil CoA, luego se convierte en manolilCoA por medio de la acetil CoA carboxilasa y este por un complejo llamado acidograsosintasa se convierte en ac graso, y estos se depositan como TG. La ruta de degradacin de ac grasos, inicia cuando se desprenden los ac grasos y quedan libres, por la gatlipasa luego entran a la mitocondria por medio de la acilcarnitina transferasa o la misma carnitina palmitoil transferasa, dentro de la mitoc el ac graso sufre beta-oxidacin y produce acetil CoA para prod energa. Cuando hay altos niveles de ac grasos, los ac grasos libres inhiben la acilcarnitina transferasa, esto garantiza que si se est haciendo sntesis de ac grasos no halla degradacin. Y el aumento en los niveles de ac grasos libres inhiben la acetil CoA carboxilasa. En este ejemplo hay regulacin por retroalimentacin (ac graso inhibe la acetil CoA carboxilasa) y cruzada (inhibe la beta-oxidacin)
Modificacin covalente
En la regulacin por modificacin covalente se fosforila la enzima, esto hace que se de un cambio conformacional que la inactiva o activa. Una molcula se una al receptor y act la adenilatociclasa q aumentaba los niveles de AMPciclico, y este act la proteinquinasa A y esta fosoforila la enz que pasndola de la forma menos activa a la ms activa. Ej. La glucgeno fosforilasa, cuando se fosforila se vuelve ms activa. Pero la fosforilacin tambin puede inactivar las enz. El glucgeno que se deposita en el hgado y en los msculos, por medio de la glucgeno sintasa transforma glucosa en glucgeno, en condiciones de ayuno el glucgeno se convierte en glucosa, la enz ppal es la glucgeno fosforilasa. Suponiendo q me roban se me aumento la adrenalina y activo la proteinquinasa que fosforilo la glucgeno fosforilasa y la glucgeno sintasa, lo que sucede es que cuando se activo la glucgeno fosforilasa se degrado glucgeno y se convirti en glucosa pero cuando fosforilo la glucgeno sintasa bloqueo la ruta. Cuando me alejo del peligro baja la adrenalina y se inactiva la proteinquinasa A y se activa la fosfatasa que quita fosfatos a la glucgeno sintasa activndola e inactivando la glucgeno fosforilasa. La modificacin covalente es de tipo reversible. Las reacciones enz son reversibles a excepcin del regulador suicida.
Complejos multienzimaticos
Las enz cuando estn en forma de complejo multienz dan 2 ventajas sobre las que estn libres, porque son ms fciles de regular, como son prot que estn pegadas unas con otras, si se modifica una sola enz lo ms seguro es que tambin se modifiquen las otras, la otra ventaja es que reduce la velocidad de la reacciones, el prod de la primera enz pasa a la sig y le sirve como sustrato, si las enz estuvieran sueltas el sustrato andara por la cel buscando la enz de la sig reaccin, pero como estn asociadas en un complejo el paso del sust a la sig enz se da en menor tiempo y si tienen una ayuda adicional como una prot transportadora que es como una coenzima para el graso de los ac grasos a esta coenzima se le tiene pegar el ac pantotenico, siempre va a estar pegada a la prot transportadora el sustrato de las reacciones, se lo lleva a la primera enz que lo convierte en un producto la transportador sigue pegada a el producto para pasrselo a la sig enz llevando la secuencia de la reaccin, eso hace la V de sntesis de la reaccin de ac grasos teniendo ese complejo sea mucho mayor. Las bact no tienen el complejo multienz, si se compara la velocidad en la sint de ac palmtico en una bact vs un humano, la bact gasta 4 veces ms tiempo sint el mismo ac graso, y tiene explicacin evolutiva, ya que a la bact le interesa poco tener ac grasos acumulados porque los usa, en tanto que los humanos los sint y acumula.
Activacin por protelisis
En este mecanismo las enz pierden una porcin para volverse activas. Los cimgenos que estn en el pncreas, los cimgenos son la forma inactiva de las protenas, est el quimiotripsinogeno, tripsinogeno y proelastasa, se tienen en forma inactiva en el pncreas para que no degraden protenas del pncreas, que es lo que sucede en la pancreatitis. El tripsinogeno se libera al intestino y all una enteropeptidasa de ph alcalino, lo transforma en tripsina, y esta enz se encarga de activar el resto de cimgenos, toma el quimiotripsinogeno y le quita un pedazo para convertirlo en quimiotripsina, toma la proelastasa le quita un fragmento y lo convierte en elastasa, coge la procarboxipeptidasa y la convierte en carboxipeptidasa. Lo que sucede cuando se le quita un fragmento a la prot se favorece una nueva configuracin, en el caso del quimiiotripsinogeno, tiene una porcin no polar que evita que forme de manera adecuada, lo que hace la tripsina es quitar la porcin no polar permitiendo q el sitio activo se acople y pueda desempear su fx. Otro eje es la cascada de la coagulacin, los diferente Fac. De la coagulacin se comportan como enz, activo los cimgenos que una vez activos van a otra prot para activarla quitndole alguna porcin.
La mayora de las reacciones tienen 2 o ms sust, son muy pocas las que trabajan con un sust. Toda la cintica se tiene que aplicar a cada sust por aparte, y entra a jugar el reactivo lmite. Las reacciones con mltiples sustratos pueden ser secuenciales o no, las secuenciales pueden haber reacciones al azar y ordenadas. -al azar: no importa el sust que se pegue a la enz porque siempre se va a formar un producto. Ej. . Las ligasas y las sintetasas, como la acetil coenzima A carboxilasa tiene 2 sust la acetil CoA y el bicarbonato, independiente de quien se pegue primero la enz acta y sintetiza la monolil CoA. -ordenadas: es necesario conocer el orden en que se pegan los sust, luego la enz debe pegarse a uno de los sust, y luego ese complejo enz sust 1 debe aceptar el 2 sust para poder dar el prod. Ej. Las reacciones de oxido reduccin, el paso de gliceraldehido 3 P a fosfoglicerato, siempre se debe pegar el NAD y luego el gliceraldehido 3P, si pegara primero el gliceraldehido 3P la est de la enz cambia y no recibe el 2 sust.
Reacciones en ping pong
La enz se asocia a un sust y produce un primer producto q se libera, lo caracterstico es que la enz queda modificada en ese primer paso por un C, N, P, y esa enz modificada es la q recibe al segundo sustrato al que se le pega el C, N, P que en la primera reaccin se le haba pegado a la enz y da un segundo producto, que al liberarse deja la enz como estaba antes de la primera reaccin. Ej. Las transaminasas de la oxido reduccin. Se tiene un a.a. al que se le debe quitar el grupo amino, cuando se est en ayunas y no hay carbohidratos el organismo busca otras fuentes de energa, lo primero que usa son los ac grasos a pesar de obtener energa de los ac grasos el organismo con eso no sobrevive, por las cel que tienen como fuente ppal la glucosa, que se puede sint desde los a.a., pero para esta sint se le debe quitar el grupo amino por medio de transaminacin, la coenzima fosfato de piridoxal y el a.a. forman un complejo y se forma la base intermedia de shiff, se libera un grupo cetocido que se lleva el grupo amino y queda la enz modificada y el fosfato de piridoxal es ahora piridoxamina, y la enz est lista para la segunda reaccin con el sust que es otro cetocido que luego se libera como a.a. dejando la enz tal como se tena al comienzo. Cuando hay deficiencia en los mecanismos regulatorios aparecen enf que por lo general son mortales, las deficiencias en el catabolismo de los a.a. prod enf con retardo mental, dao heptico severo y muerte temprana, fenilcitonuria tirosinemias. La deficiencia en la sint de glucgeno produce tambin enf mortales. Cuando hay problemas para degradar carbohidratos complejos como los glicosaminosglicanos hay enf como la mucopolisacaridosis.
Mecanismo de compartimentalizacin de las enz
Hay enz ubicadas en la memb cel pero q no estn el citosol, por q su fx se cumple en memb, las enz de la mitoc solo funcionan ah, esta compartimentalizacin en el caso de la mtoc q tiene gran responsabilidad en la prod de energa, todas las enz estn en este compartimiento porque permite que haya una fina regulacin en la prod de la energa, si la mitoc tiene mucha energa, las enz se tiene que inhibir, y al estar todas las enz de este proceso en la mitocondria facilita la regulacin.
Todo lo relacionado con el anabolismo (sint) est en el citosol independiente de lo que pueda pasar en la mitoc, la compartimentalizacin permite que se den procesos catablicos y anablicos al mismo tiempo y no deja entrar en ciclos vanos.
PARTE CUATRO
Las enzimas son una herramienta en el diagnostico clnico, debe tenerse en cuenta que enz se va a evaluar, el sitio en el que acta, donde se encuentra, de acuerdo a esto se clasifican las enz en: Enz plasmo especficas: son aquellas q cuya mayor concertacin o mayor actividad se da en el plasma. Entre esas: Las serin proteasas que hacen parte de la cascada de la coagulacin, factor X y XII. Lipoproteinlipasa (LPL) importante en el metabolismo de lpidos. Se produce en los tejidos, se libera al torrente sanguneo y se pega al endotelio y es all donde cumple su funcin.
Enz no plasmo especficas o secretadas: Se producen en un rgano y se liberan a un espacio determinado como las enz digestivas lipasa tripsina quimiotripsina que se producen a nivel del pncreas y se liberan al intestino. Lipasa, amilasa, PCA El antgeno especifico de prstata (PSA), secretado en la prstata y se libera al fluido seminal, esta se puede clasificar como un enz tejido-especifica; la fosfatasa acida prosttica, fosfatasa alcalina de origen seo, son muy pocas las enz de este tipo.
Enz celulares: son las que tienen funcin dentro de la clula, es imprtate ubicar la enz dentro de la clula, saber donde cumple su funcin. Ej. La fosfatasa alcalina y la gama glutamil transferasa, son enz que se ubican alrededor de la membrana celular, mientras que la GOT Y GPT LDH creatin quinasa son enz citoplasmticas. La isocitrato deshidrogenasa, la citrato sintasa, malato deshidrogenasa, son enz intramitocondriales.
Polimerasas, histonas acetilasas en el ncleo.
Es importante conocer la ubicacin de la enz en la clula, por ejemplo un pte con una obstruccin en las vas biliares (coleolitiasis), tiene la fosfatasa alcalina, gamma GT altos, pero los niveles de transaminasa no van a estar muy altos, o se le elevan un poco a nivel de membrana celular, se est alterando la memb cell pero no se rompe, el dao cell no es tan profuso. Pero si adems de estas enzimas se encuentran transaminasas lactato deshidrogenasa creatin quinasa, indica que la memb est rota y que empezaron a salir las enz del citoplasma, las concentraciones de las enz citosolicas pueden ser 50 o 100 veces mayores que a nivel plasmtico. Se puede imaginar que al romperse una parte del tejido los niveles plasmticos de las transaminasas pueden estar alrededor de 12 UI/L y puede llegar a 80 90 UI/L, con lo que indica que el dao fue tan profuso que rompi la memb cell, pero si adems de las transaminasas y la gamma GT, se encuentran enz mitocondriales libres hay una necrosis total. Una enz muy usada para evaluar esto es la GOT, porque tiene un componente citoplasmtico y uno mitocondrial, luego en el laboratorio se cuantifica GOT y GPT, y se hace una relacin entre estas 2 enz. Si la lesin es citoplasmtica los niveles de GOT y GPT son similares la relacin es cercana a 1, pero cuando los niveles de GOT estn aumentados y GPT se mantiene, la lesin es mitocondrial, y se altera la relacin GOT GPT. Entre esas: Transaminasas: GOT=glutamato oxaloacetato transaminasa, tambin conocida como aspartato amino transferasa GPT=glutamato piruvato transaminasa, tambin conocida con alanani amino transferasa Lactato deshidrogenasa (LDH) Fosfatasa alcalina (FA) Las enz nucleares se usan muy poco para ev las lesiones nucleares.
Isoenzimas
Son formas de la enz que tiene caractersticas fsicas y qumicas diferentes. Tienen una carga distinta, una afinidad por el sust diferente, PERO catalizan la misma reaccin. Todas las isoenz son codificadas por genes diferentes. Al evolucionar algunos tejidos hicieron metabolismo en un sentido mientras otros lo hicieron en otro sentido. Ej. La lactato deshidrogenasa cataliza la ultima reaccin de la glucolisis que va de lactato a piruvato, esta reaccin puede suceder por va aerbica, y el piruvato se convierte en acetil coenzima A y se mete en el ciclo de krebs para producir energa 36 ATP, o la hace por va anaerobia y el piruvato se convierte en lactato y hasta ah llego. La va anaerbica es menos energtica produce solo 2 ATP, el organismo toma el lactato y lo recicla convirtindolo en glucosa. Hay 5 isoenz de la lactato deshidrogenasa. La lactato deshidrogenasa muscular tiene mayor afinidad por el piruvato y lo convierte en lactato, el msculo tomo esta ruta porque a veces se le exige energa por va anaerobia. La lactato deshidrogenasa que se da en el hgado es ms afn por el lactato, porque el hgado se especializo en reciclar el lactato para convertirlo en glucosa. En la medida que se evoluciona se especializan unas en enzimas para hacer la reaccin en un sentido u otro. La lactato deshidrogenasa en el encfalo tiene mayor afinidad por el lactato, para luego convertirlo en piruvato y se va por va aerbica.
Las enz pueden estar formadas por diferentes protmeros, y cada protmero esta codificado por un gen distinto. Ej. La LDH esta formada por 4 protmeros que pueden ser de 2 tipos H que hace referencia a corazn en ingles y M que se refiere a msculo. La LDH 1 tiene las cuatro unidades son H, tambin es conocida como H4=LDH1 HHHH. De ah para abajo se le empieza a quitar una H y a ponerle una M, LDH2 HHHM, LDH3 HHMM, LDH4 HMMM, LDH5 MMMM. Lo mismo sucede con la CK. Puede tener 2 subunidades una M o una B. y como tal la CK es un dmero. Puede haber una MM, MB, BB, cada una codificada por un gen diferente.
Las isoenzimas son variadas en msculos y rganos. Ej. El encfalo expresa ms la LDH1 al igual que el corazn, y el msculo expresa ms la LDH5.
Cada forma de una enz es muy relativa al msculo u rgano en el que actu, incluso en la clula hay isoenzimas, ej. La carbamoil fosfato sintetasa, hay una isoenz q es mitocondrial y otra que es citoslica, ambas catalizan la misma reaccin, q es la sntesis del fosfato de carbamoilo, en la mitocondria este producto es usado en el ciclo de la urea, y en el citoplasma se usa en la sntesis de nucletidos, es la misma enz pero especializada en cosas diferentes.
La expresin de las isoenz puede variar con el cto o con enfermedades. Esto es un dato importante cuando se quiere usar las enzimas como un marcador clnico. Hay que determinar la edad del pte y relacionar esa edad con la actividad de las enz. Ejemplo tpico, la fosfatasa alcalina aumenta en la etapa de crecimiento tiene su pico max, y cuando se llega a la edad adulta vuelve a descender. Los vr normales en un adulto es 110 UI y en un adolescente puede estar entre 180 - 190, y no significa que el pte tenga alguna patologa.
Las enz pueden sufrir modificaciones luego de ser sintetizadas, pero las enz que son modificadas postraduccin, no son conocidas como isoenz propiamente sino como isoformas de la enz, las isoenz se pueden separar por electroforesis pero las isoformas no. La amilasa es activa luego de que se le pega un grupo amido 29.44 min
La sntesis del fosfato de carbamohilo, la nica diferencia es que en mitocondria el fosfato de carbamohilo se utiliza en el ciclo de la urea, mientras que en el citoplasma el fosfato de carbamohilo se utiliza en la sntesis de nucletidos, pero son isoenzimas, se especializaron en dos cosas diferentes, la expresin de las isoenzimas puede variar con el crecimiento o con la enfermedad entonces eso es un dato muy importante cuando uno quiere utilizar las enzimas como marcador clnico, determinar la edad del paciente y relacionar esa edad con la actividad de las enzimas, el ejemplo tpico es el de la Fosfatasa alcalina (FA), la fosfatada alcalina aumenta en la etapa de crecimiento y tiene su pico mximo, cuando uno llega a la edad adulta estos descienden, entonces si usted le evala los niveles de fosfatada alcalina a un adulto usted va a encontrar como mximo 110 unidades, pero si se lo evala a un adolescente seguramente lo podr encontrar en 180 y 190, y eso no significa que el paciente tenga una patologa.
Modificaciones post- traduccionales de las enzimas
Las modificaciones post- traduccionales originan isoformas de las enzimas Las enzimas tambin pueden sufrir modificaciones despus de ser sintetizadas, pero esas enzimas que sufren modificaciones luego de ser sintetizadas (o modificaciones postraduccionales) no se conocen como isoenzimas propiamente dichas si no como isoformas de la enzima (entonces es diferente la isoforma a la isoenzima), usted la isoenzima las puede separar por electroforesis y la isoforma no la puede separar por electroforesis entonces podemos encontrar varios ejemplos: Amilasa: es activa despus que nosotros le agregamos un grupito amida, es la nica forma de hacer activa la amilasa. Grupo amida Adenosina desaminasa: se activa cuando se oxida este grupito sulfidrilo CK3: MM Mus esqueltico < 5% Corazn 37% Pulmn 40% Tiroides 16% SH Glicosilacin: algunas enzimas se vuelven activas cuando se glicosilan por que se aumenta la polaridad, se vuelven ms polares, entonces es ms fcil su dilucin. Acido sialico: algunas cuando le pegamos acido sialico tienden a pegarse a la membrana, que es el sitio donde ella funciona. Entonces podemos tener varia probabilidades con esas enzimas.
Aqu tenemos el ejemplo de la LDH, entonces las cinco isoformas de la LDH y donde se van ubicando(diapositiva 71): la LDH -1 esta mas en el corazn y el rin, mientras que la LDH -5 esta mas en msculo y en el hgado, yo las puedo separar por electroforesis, aqu hay una de la cK entonces yo puedo por electroforesis separar las diferentes isoenzimas de la LDH o de la CK por que tienen diferente carga, tienen estructura diferente, la estructura primaria cambia y entonces es fcil separarlas: Diapositiva 72.
Aqu tenemos la Creatin Kinasa (ver diapositiva 73), que cataliza la reaccin de el paso de creatina a fosfocreatina, la fosfocreatina veremos ms adelante cuando hablemos de bioenergtica, es un compuesto altamente energtico con fosfato, y ac cuando se desprende libera mucha energa, es una enzima muy importante a nivel del msculo, es una reserva energtica muscular grande, es una reserva energtica en el encfalo tambin, sirve como amortiguador, como un sistema Buffer para mantener niveles ms o menos constantes de ATP, se expresa tambin en el hgado, se expresa tambin en el corazn, se expresa en muchos sitios.
Tenemos varias isoenzimas de la creatin kinasa, entonces miren aqu tenemos (ver diapositiva 74):
Vemos la ck1:BB, la ck2: MB, ck3: MM y donde se expresan miren la ckbb hace referencia a una subunidad cerebral en ingles, M al msculo, entonces esta es mayor miren, ms abundante en el cerebro que en la prstata, la ck2 es mucho ms abundante en corazn al igual que la ck3, lo que pasa es que esta ck2 es mas especifica de la actividad cardiaca que la ck3, niveles altos de ck2 ayudan al diagnostico del infarto, ahorita vamos a mirar un poco lo del infarto como un ejemplo para aplicar la enzimologa, y cuando uno hace referencia a la actividad de la ck2 frente a la ck3, uno puede hacer diferenciacin entre enfermedades musculares, por ejemplo en la distrofia de dushein la actividad de la ck2 es menos del 5% de la actividad de la ck total, entonces uno puede de esa forma ayudarse a los diagnsticos, y esta es la forma como nosotros la separamos a travs de electroforesis; de visualizar ms que de cuantificar, esta es la forma de visualizar (refirindose a la electroforesis), cuantificarla ya no tiene justificacin en electroforesis, ahora hay unos mtodos ms sencillos para cuantificarla; aqu lo que hicieron(ver diapositiva 74) fue una electroforesis y entonces me muestran la ckmm, la ckmb y la ckbb y luego le hacen una densitometra para mirar los picos y aqu lo podemos evaluar, es una forma, digamos que esta forma lo que permite ms que todo es evaluar la cantidad de la enzima ms que la actividad de la enzima.
Pero lo que a nosotros nos interesa fundamentalmente es que todo ese conjunto de enzimas nosotros lo vamos a evaluar es en muestras sanguneas, si ustedes le piden a un paciente que se haga una transaminasa se lo van a evaluar en el plasma, amilasa plasmtica, ck total plasmtico, todo va a estar en plasma entonces necesitamos saber detectar los valores de las enzimas plasmticas: (ver diapositiva 75) Liberacin desde las Clula, entonces si usted somete a los tejidos a lesiones, traumatismos, o los pone a algunas sustancias qumicas, a txicos, por ejemplo los venenos de serpiente que son tan txicos tisularmente, lo somete a hipoxia, el corazn es muy sensible a la hipoxia, el hgado tambin es muy sensible a la hipoxia, todo esto lo que provoca es una disminucin en la produccin de ATP, y la deficiencia de energa de forma prolongada, lo que lleva es a la muerte celular, entonces una vez se muere la clula la membrana se vuelve permeable porque no somos capaces de mantener la estructura de la membrana y se liberan las enzimas, entonces se aumentan los niveles enzimticos a nivel de plasma, lo otro que vamos a tener son los Cambios de Produccin enzimticos, ante cierta patologa los niveles de la enzima tienden a aumentar, por ejemplo en los procesos de cncer de huesos, en los osteocarcinomas se tiende a aumentar la fosfatada alcalina, en la hipertrofia prosttica por ejemplo se aumenta la fosfatada acida prosttica, o se aumenta el antgeno especifico de prstata, en la pancreatitis por ejemplo se aumenta la lipasa y la amilasa, entonces comienzan a aparecer en plasma enzimas que normalmente no deberan estar; y el otro aspecto que me va a afectar esos niveles plasmticos es
Que tan Rpido se Eliminan de Circulacin, la mayora de las enzima se eliminan a travs del sistema retculo endotelial, muy pocas se eliminan en orina, quizs en los pocos ejemplos que hay de las enzimas que se logran eliminar por orina encontramos la amilasa, en algn tiempo se usaba el medir los niveles de amilasa en orina como muestra para el diagnostico de pancreatitis, esa eliminacin en orina es muy difcil bsicamente por el tamao de las protenas, las enzimas son protenas de muy buen tamao, entonces a lo que lleva esto es a que las enzimas solo se puedan eliminar a travs del sistema retculo endotelial, las enzimas tienen una vida media de circulacin en le plasma (en el sitio donde normalmente no deben estar) muy variable, por ejemplo (ver diapositiva 76) uno puede tener enzimas con una vida media como esta ejemplo la ALAT, es la misma GTP tiene 50 horas en circulacin, mientras que la ASAT se elimina rpidamente, en solo 12 horas, fosfatada alcalina placentaria miren tiene 170 horas de vida media a nivel del plasma, entonces estos son otros datos que hay que tener muy pendientes cuando nosotros hacemos evaluaciones de niveles plasmticos; supongamos que queremos evaluar en un paciente el Antgeno especifica de prstata, y resulta que le paciente se someti a una maniobra antes de tomarse la muestra, le hicieron el tacto rectal para evaluar el tamao de la prstata, y de manera desprevenida se tomo el antgeno especifico de prstata el da siguiente en la maana, usted va a encontrar esos niveles de antgeno especifico de prstata por el techo, debido a la manipulacin que le hicieron a la prstata, pero si usted conoce la vida media de ese antgeno especifico de prstata, puede decirle a su paciente que espere tres das, cuatro das y se repite la prueba, si uno no conoce estos valores, si no tiene en cuenta esta vida media de las enzimas es posible caer en errores de interpretacin; entre otras cosas porque para ustedes esto se convierte en una ayuda diagnostica, mas no en la prueba reina del diagnostico, el diagnostico ustedes lo van a hacer bsicamente por el aspecto clnico, esto es simplemente una confirmacin de la sospecha clnica que ustedes tienen, no va a ser todo el diagnostico.
Miremos esto por ejemplo, la lactato deshidrogenasa (LDH) en un infarto agudo de miocardio (IAM) (diapositiva 77), como se aumenta, es de las mas taridas en aumentarse, pero es la que mas tiempo permanece aumentada; ustedes saben que muchas veces ocurren infartos y el paciente no siente ese infarto, no es tan fuerte como para producirle al paciente sintomatologa clara de infarto, y en algunos casos el paciente sufre un infarto y ustedes lo colocan en unos estados sedados y es posible que tengan infartos a repeticin, entonces de las pocas formas que ustedes tienen para comprobar si hay infartos a repeticin es a travs de las enzimas, adems de las ayudas que tienen con el electrocardiograma; el rea bajo la curva de la LDH les dice a ustedes que tamao tuvo la lesin, que tanta necrosis tisular tengo, ustedes pueden evaluar el tamao bajo la curva y saber que tan bueno o que tan malo va a ser el pronstico del paciente que se infarta. Lo mismo ocurre con el CK, pero miren que las ck son de las que se aumenta de manera temprana y desciende mas marcadamente, pero lo mismo, el rea bajo la curva les va a decir a ustedes que tan grande es el impacto, esto es lo que le dice a uno lo de la ck1 y la ck2, perdn es que la ckmb puede tener tres formas, entonces cuando hay diferencia entre la Mb1 y la Mb2 mayor de 1,5 habla uno de necrosis tisular, pero ustedes en la prctica poco utilizan esto, aqu se me col, pero ustedes utilizan mas la ck total Mb para hacer medicin del infarto, el rea bajo la curva de la ckmb les va a decir a ustedes que tan grave fue el infarto, y se pueden ayudar de varios marcadores para hacer evaluacin de infarto miren (ver diapositiva 79), ay hay algunos de los nuevos, pero uno puede evaluar la ck, la LDH, miren que es la que ms tiempo permanece aumentada la ckmb es de las que ms se aumenta pero de las que ms temprano disminuye y tal vez nos faltara la transaminasa GOT que es un buen marcador tambin que esta mas o menos ac enzima de la ck total pero que disminuyen rpidamente, estos marcadores la troponina y la mioglobina son unos marcadores relativamente nuevos, hablo de relativamente nuevos por que tienen 5 6 aos de ser usados, no los usan en todas las clnicas pero es un buen marcador del infarto, pero estamos enfocados en las enzimas como marcadores de la actividad, entonces si usted tiene un paciente que sus niveles de CKMB han estado ya en la fase de descenso, y de pronto el siguiente examen que usted le hizo, generalmente hacen un examen 24 horas despus del infarto, 78 horas despus del infarto, 4 das despus del infarto para mirar cmo van variando esas concentraciones, y de pronto saldrn con la sorpresa que esos niveles de ck van descendiendo y vuelven a hacer un pico lo que les est indicando a ustedes que el paciente est teniendo un nuevo infarto agudo de miocardio, esta es una ayuda muy importante para ustedes desde el punto de vista clnico. Esta es la misma (refirindose a la diapositiva 80).
Hay muchas enzimas que se utilizan para medir la actividad heptica, son las transaminasas, la Got y la Gtp, (diapositiva 81) la reaccin que hay arriba as en un color medio naranja es catalizada por la GOT, glutamato oxaloacetato transaminasas, de ah viene su nombre, o si lo miran desde este sentido ser aspartato amino transferasa o AST, es una enzima citoplasmtica, tiene una isoenzima mitocondrial, se aumenta cuando hay dao heptico, por ejemplo en una hepatitis, hay un incremento marcado en pacientes que tienen intoxicacin heptica con etanol por ejemplo, o cuando se aumenta la dosis de acetaminofen, es hepatotoxico entonces aumenta el GOT, y esta de abajo es la que cataliza el GTP, glutamato piruvato transaminasa, o tambin conocida como alanito amino transferasa ALT; las dos son buenos marcadores de lesin heptica pero no le van a decir a usted que tan grave fue la lesin heptica, no le van a decir que tan severa fue la lesin, le dicen que hay lesin pero no cuanto porcentaje del hgado se vio afectado, hay un marcador muy bueno de eso que es la 5 - nucleotidasa que es una enzima que est muy bien unida a la membrana celular por lo que solo se libera cuando hay una lesin severa de hgado, y esa 5 nucleotidasa si le puede decir a usted que tan fuerte fue la lesin heptica; y estos dos (diapositiva 82) fosfatada alcalina (FA) que el la cataliza esta reaccin rompiendo un enlace Ester fosfato, y esta que es la gama glutamil transferasa que es una reaccin que cataliza la transferencia de un aminocido al gama glutamato que es el constituyente del glutation, entonces por eso se llama gama glutamil transferasa, son enzimas que evalan mucho la lesin heptica pero como estn pegadas a membrana celular se aumentan muy fcilmente, incluso la fosfatada alcalina est pegada en casi todos los tejidos, sin embargo miren que cuando ustedes tienen un paciente con una obstruccin de vas biliares colelitiasis, estas dos enzimas le ayudan a usted mucho en el diagnostico, el paciente va a tener aumentada la fosfatada alcalina, pero la fosfatada alcalina puede estar aumentada por una fractura por ejemplo, si usted la complementa con la Gama glutamil transferasa y las dos salen elevadas, es indicio de que la lesin es heptica, y son muy buenos marcadores de obstruccin biliar, hay tendran ustedes que evaluar otras cosas como es la evaluacin de la bilirrubina, los niveles de bilirrubina en este paciente debern estar elevados para hacer el diagnostico certero, adicional a esto esta Gama glutamil transferasa se utiliza mucho en el diagnostico de intoxicacin por etanol, los niveles de bebidas alcohlicas aumentan los niveles de Gama glutamil transferasa, los pacientes alcohlicos tienden a tener la Gama glutamil transferasa alta y los niveles de transaminasas elevados.
Hay otros usos, pero ms que pruebas que a ustedes les sirvan de diagnostico, son utilidades que les podemos dar a las enzimas para disear pruebas, el Elisa es un buen ejemplo de la utilidad de las enzimas en el laboratorio; entonces miren que aqu tenemos dos formas de Elisa (diapositiva 83), el indirecto y el de sanduwish, en este caso suponemos que vamos a buscar anticuerpos en un paciente, vamos a buscarle anticuerpos contra cualquier bicho, entonces miren que lo que pegamos al vasito son antgenos, por ejemplo una protena viral, y queremos evaluar si el paciente tiene anticuerpos contra ese virus, sometemos este posito que tiene la protena a una muestra de suero, si el suero tiene anticuerpos se ir a pegar a esos antgenos a esas protenas y luego simplemente le agregamos un segundo anticuerpo que reconozca este, que no lo vamos a marcar con una enzima, entonces se pega el segundo anticuerpo marcado con una enzima y luego lavamos el exceso de anticuerpos y todo lo que no est pegado lo eliminamos y le echamos el sustrato a la enzima que generalmente produce un cambio de color, el cambio de color se produce dependiendo de la concentracin o de la cantidad de enzima que yo tenga ac, y esa cantidad de enzima que yo tenga ac es una relacin a la cantidad de anticuerpos que hay en la muestra, eso es un Elisa, y lo puedo demostrar con la diferencia de color por espectrofotometra mirando la absorbancia (es un laboratorio que vamos a ver ms adelante); en este Elisa de sndwich bsicamente tengo el anticuerpo, busco la protena, entonces la protena se pega al anticuerpo y entonces hay un segundo anticuerpo marcado tambin por enzima, dirigido tambin a la misma protena, entonces este segundo anticuerpo se pega a la protena, y luego lo mismo, lo lavo para eliminar excesos, todo aquello que no est pegado se tiene que eliminar y al final le echo el sustrato, produzco el cambio de color y obtengo la relacin de cuantos antgenos o cuanta protena haba en la muestra, esa prueba se utiliza en el laboratorio para el diagnostico de muchas enfermedades, casi todas las enfermedades virales se estn diagnosticando de esa forma, HIV, Hepatitis B, Hepatitis A.
Entonces miren que las enzimas para ustedes van a ser una herramienta clave en su vida profesional.
Siempre que queremos convertir un sustrato de un producto tendramos que pasarlo a un estado de transicin y que ese estado de transicin era un momento o una condicin del sustrato en la cual el se volva muy inestable y terminaba convirtindose en el producto con el fin de encontrar su estabilidad.
Vemos que para que el sustrato se convierta en el producto debe llegar al estado de transicin, el cual es mucho ms energtico que el sustrato y que el producto, la energa que se le da al sustrato para llegar al estado de transicin vuelve y se recupera cuando este sustrato o este estado de transicin cambia hacia el producto y vuelvo a tener la misma energa con la que empez, entonces ac no hay cambio de energa. Ese estado de transicin puede tomar 2 sentidos: puede devolverse hacia el sustrato nuevamente con una velocidad representada por la constante K y este estado de transicin se convertira en producto tambin pero esta conversin es irreversible y esa velocidad con la que se convierte ese estado de transicin en producto lo vamos a representar con una V que va a depender de la concentracin del sustrato, para que el estado de transicin vuelva a ser sustrato o producto depende de la constante K y de la V, si la constante K es mayor que la V pues va a tender a convertirse en sustrato y si la V es mayor que la constante K pues el estado de transicin pasa a convertirse en Producto. A pesar de necesitarse tanta energa para llegar a ese estado de transicin la gran parte de esa energia que utilizamos la recuperamos cuando hacemos la conversin a producto, entre el sustrato y el producto hay una diferencia de energia, el producto tiene menos energia que el sustrato entonces es una reaccin exergnica (libera energia).Esta es una reaccin no catalizada porque no estamos usando enzimas ah. La barrera para llevar a cabo ese proceso es la energia de activacin, se necesita que los sustratos alcancen esa energia de activacin para llegar al estado de transicin.
Para aumentar la velocidad las enzimas disminuyen esa energia de activacin. Si la energia de activacin disminuye o tengo mas sustrato es ms fcil alcanzar el estado de transicin para llegar al producto. Ese estado de transicin que se alcanza con la enzima tiene varios estados intermedios, hay entonces varias enzimas que hacen varios estados intermedios para llevar a cabo una reaccin. Cada uno de esos estados tendrn su nivel de energia necesario.
S + E me va a formar el complejo E-S, este complejo E-S es el que me facilita alcanzar el estado de transicin. El complejo E-S se va a romper y me va a dar como resultado el producto + la E (las enzimas no sufren modificaciones cuando hablamos de una reaccin), la E no altera el equilibrio de la reaccin pero si aumenta la velocidad de la reaccin disminuyendo la energia de activacin. La diferencia de energia entre los reactantes y los productos se mantiene se use o no catalizador, las enzimas solo cambian la forma de energia (por ejemplo energia qumica a mecnica) pero la diferencia de energia se mantiene.
En el dibujo anterior tenemos la mezcla enzima sustrato, el sustrato se ensambla a la enzima, y este complejo E-S luego se va a transformar en E-P y la enzima vuelve a ser reciclada. La cantidad de E S va a depender de con que velocidad se asocien la enzima y el sustrato para formar el complejo y con que velocidad este complejo E-S se transforma en enzima + producto. Hay varias cosas que afectan la velocidad de una reaccin (la concentracin del sustrato, la concentracin de la enzima, la afinidad de la enzima por el sustrato). En el estado en que la enzima se pega con el sustrato se alcanza el estado de transicin. A veces puedo tener la suficiente cantidad de sustrato pero los sustratos no se enlazan, entonces en este caso las enzimas ayudan a que los sustratos se encuentren y entonces eso puede reducir la energia e activacin, ahora la enzima los orienta y facilita la reaccin. Otro mecanismo que se puede aplicar aqu es la orientacin de los sustratos, tienen que tener una orientacin particular para llevar a cabo la reaccin, las enzimas facilitan darle esa orientacin a los sustratos y entonces ms fcilmente alcanzan el estado de transicin y por tanto pueden dar el producto. Cmo se une el sustrato a la enzima? Hay 2 modelos.
Modelo de llave cerradura: la enzima reconoce al sustrato como una cerradura reconoce a la llave (encajan perfectamente), y unas vez hayan encajado se lleva a cabo la reaccin. Este modelo explicaba la especificidad de las enzimas pero tena un inconveniente: algunas enzimas no tenan tanta especificidad entonces no se acoplan a este modelo. Entonces surgi un segundo modelo llamado modelo de Ajuste Inducido.
Ajuste Inducido: el sitio de reconocimiento del sustrato que puede estar alrededor del sitio activo o dentro del sitio activo, una vez el sustrato se ha unido a la enzima la enzima sufre un cambio conformacional para acoplarse al sustrato y el sustrato tambin sufre una modificacin en razn a la unin a la enzima y esa modificacin que sufre el sustrato alrededor de la enzima es la que llamamos estado de transicin. Una vez se ha alcanzado esa asociacin de sustrato enzima y hemos alcanzado el estado de transicin fcil vamos a alcanzar a formar el producto + E y nos queda la enzima lista para volver a trabajar. El segundo modelo es el mas aceptado porque explica la especificidad de la enzima y la flexibilidad de aquellas enzimas que no son tan estereoespecficas.
Qu caractersticas tiene el sitio activo? Es tridimensional, es como una hendidura dentro de la protena, generalmente son ricos en aminocidos no-polares porque buscamos desplazar el agua del sitio activo, constituyen un 5% o 10 % del total de masa de la enzima, el otro 90% sirve para darle estabilidad a la enzima. La actividad de una enzima depende de la configuracin, si se altera la configuracin de la enzima tambin se altera la configuracin de su sitio activo y por ende no va a haber actividad enzimtica.
Qu reglas controlan la velocidad de la reaccin? Por ejemplo tenemos una determinada concentracin de enzima, y le empezamos a agregar sustrato poco a poco y vamos a tener en esa primera etapa que la enzima y el sustrato se unen y se forma el complejo E-S y este complejo E-S se va a convertir en un producto mas la E. La velocidad de la reaccin al comienzo va a depender de la concentracin de un solo sustrato, no va a depender de la enzima porque ya sabemos que tenemos una concentracin constante de enzima, entonces vamos a agregarle sustrato y la velocidad de la reaccin depende de la concentracin del sustrato. Esta primera fase de la reaccin en la cual la velocidad de la reaccin depende de la concentracin del sustrato nos define el orden de la reaccin.
Reaccin de primer orden: Cuando la velocidad de la reaccin depende de la concentracin de un solo sustrato. Ej: A + Enzima se convierte en el complejo AE y finalmente en el Producto Z, la velocidad de la reaccin depende de la concentracin de A.
Reacciones de segundo orden: Si tuvisemos 2 sustratos la velocidad de la reaccin dependera de los 2.
Reacciones de orden cero: son aquellas que no dependen de la concentracin de ningn sustrato.
Ejemplo: Tenemos altas concentraciones de un sustrato y la enzima tiene una concentracin constante A, La enzima y el sustrato se asocian y forman el complejo E-S y empieza a surgir el producto. La enzima desaparece como enzima libre, surge como complejo E-S. Hay una fase en este periodo en el que la concentracin E-S se mantiene constante, es decir no va a modificarse y vamos a alcanzar un equilibrio. La velocidad con la que se produce el complejo E-S es la misma con que se destruye el complejo ES. En estos momentos la enzima se ha saturado (es decir que todos los sitios activos de la enzima estn acoplados, estn unidos al sustrato), La velocidad con la que se produce el complejo E-S depende de la constante de velocidad K1, depende de la concentracin de la enzima y de la concentracin del sustrato. La velocidad con la que se destruye el complejo E-S va a depender de 2 constantes de velocidad porque puede tener 2 destinos: E-S se puede convertir en enzima + producto (K 2); entonces, cunto E-S termina convirtindose en producto depende de k 2 y de la concentracin E-S. Pero la otra posibilidad del complejo E-S es que se regrese, entonces va a depender de K -1 que es la constante de velocidad de la reaccin inversa, entonces depende de K 1, entonces k 1 x [ enzima sustrato ]. En conclusin, la cantidad de complejo E-S que se destruye es = a aquel que se va para producto + aquel que se devuelve para el complejo E-S, o en otras palabras, la velocidad con la que se sintetiza E-S es igual a la velocidad con la que se degrada.
Ahora vamos a buscar el estado estacionario, es decir aquel en el que la [E-S] es constante, debemos llegar al estado estacionario que es el que nos va a permitir hacer la relacin de la velocidad con los diferentes factores que la pueden afectar. Entonces yo necesito saber en el estado estacionario que la [E-S] se va a mantener constante, entonces veamos con que velocidad se sintetiza y con que velocidad se destruye. La sntesis solo depende de la reaccin que se de en este sentido, k 1 es la constante de velocidad para esta reaccin, entonces k1que es la constante de velocidad va a depender de la [S] y de la [ E ]. Entonces si se multiplica K 1 por la [S] y la [E ] me da la cantidad del complejo E-S que se ha formado, la velocidad con que se ha formado ese complejo E.S. Pero ese complejo E-S tambin se puede destruir, entonces el complejo E-S puede convertirse en producto y va a depender de la constante de velocidad K 2, k 2 x [E-S] me determina con que velocidad el complejo E-S se convierte en producto. La otra probabilidad es que el complejo E-S se regrese, y para que el complejo E-S se regrese depende de la constante de velocidad K -1. K -1 x [E-S] me dice con que velocidad se regresa la reaccin. Si yo sumo la cantidad de enzima sustrato que se transforma en producto ms la cantidad de E-S que se regresa, voy a tener la velocidad con la que se destruye el complejo E-S. Supuestamente en condiciones en el estado estacionario, la velocidad con que se sintetiza debe ser = a la velocidad con que se degrade.
En este ejemplo es la misma historia que en los anteriores, a medida que se aumenta la cantidad del sustrato se alcanza la velocidad mxima, en el estado estacionario se alcanza la velocidad mxima (la cantidad de enzima y de sustrato es suficiente para que se forme producto de manera constante). Cuando la cantidad de enzima o la [ S ] es muy alta la velocidad de la reaccin se vuelve constante entonces en ese momento hemos alcanzado la velocidad mxima.
? En el estado estacionario hay 2 posibilidades: que se vuelva producto o que se regrese; lo que determina que una reaccin lleve a un sentido o el otro son las barreras energticas. ? El estado estacionario no es el mismo estado de transicin es aquel momento de la reaccin en la que la [ ] del complejo E-S no vara. En el estado estacionario la velocidad con la que se produce el complejo E-S es = a la velocidad con que se destruye el complejo E-S. El producto depende de K 1 x [ S ] x [ E ] y la forma como se destruye depende de la [ E-S] + K -1 x [E-S] , esto es lo que llamamos estado estacionario (la velocidad de produccin es = a la velocidad de degradacin y la [ complejo E-S] es constante).
La [ ] de le enzima total = a la enzima libre + la [complejo E S].
Ecuacin de ? : KM = Velocidad mxima / 2 o concentracin del S a la cual se alcanza la mitad de la velocidad mxima. El KM tambin es una relacin de afinidad de la enzima, cuanto ms pequeo es el KM, mas afn es la E por el S. En la parte inicial de una reaccin, la velocidad de sta depende de la [ ] del sustrato, es una reaccin de primer orden, pero al final del proceso en la fase estacionaria, la velocidad de la reaccin no depende de la [ ] del S.
Ejemplo del man: El alcohol en nuestro organismo se transforma en acetaldehdo y el acetaldehdo en acetato, el responsable de que las personas se pongan coloradas al tomar es el acetaldehdo. Hay personas que tienen la afinidad por el acetaldehidodeshidrogenasa (convierte acetaldehdo en acetato) muy alta entonces las concentraciones de acetaldehdo son elevadas y los vemos rojos como un pizco. Hay otras personas que por el contrario el acetaldehdo tiene un KM bajo, entonces muy poco acetaldehdo va a formar acetato y no presenta ese fenmeno.
# de recambio: tiempo que gasta una enzima despus de asociarse al sustrato para volver a agarrar otro sustrato. Acurdense que la E al principio se asocia al S y luego el complejo E-S se desprende para producir E libre, esa E libre tiene que volver a agarrar otro sustrato entonces el # de recambio es cuanto tiempo se gasta le E despus de asociarse a ese S para desprenderse y volver a agarrar otro sustrato. Cuanto ms alto es el # de recambio, ms eficiente es la reaccin, entonces una enzima que hace recambio de 100 molculas es ms eficiente que una que hace recambio de 10 molculas(huyyyyque pilln ese Flanders). Entonces debemos tener en cuenta 2 variables: el KM y el # de recambio, lo ideal es que una enzima tenga un # de recambio alto y un KM muy bajo y eso significara que la enzima es muy eficiente y muy afn. Tambin podemos encontrar enzimas con un KM bajo y un # de recambio bajo, en este caso la E sera muy afn pero muy poco eficiente. Si el caso es al contrario, la E con un KM alto y con un # de recambio alto tampoco sirve porque la E sera muy eficiente pero muy poco afn.
Factores que afectan la velocidad de una reaccin enzimtica:
1. La concentracin del sustrato es un factor que modifica la velocidad de una reaccin antes de alcanzar el estado estacionario (porque cuando se alcanza el estado estacionario se satura la enzima y puedo echarle chochomil molculas de sustrato y la velocidad no va a aumentar), entonces hasta cierto momento la concentracin del sustrato me va a modificar la velocidad de la reaccin.
2. La concentracin de la Coenzima, las coenzimas son las que se comportan como un segundo sustrato entonces tambin puedo modificar la velocidad de una reaccin disminuyendo la concentracin del sustrato. Este es uno de los mecanismos que utilizamos para regular nuestro metabolismo energtico.
Ejemplo de Rod Flanders: Usted puede producir muchas molculas de Acetil Coa degradando glucosa o degradando cidos grasos pero si usted no tiene oxgeno no puede obtener coenzimas en estado oxidado, porque a pesar de tener mucho sustrato para la enzima la reaccin no se da porque la coenzima no est en condiciones adecuadas.
3. Concentracin de la enzima: En el organismo hay 2 tipos de E: unas llamadas constitutivas las cuales mantienen su [ ] constante independiente de los estmulos, no se modifican, pero hay otras E que s responden a estmulos y son llamadas E inducibles las cuales ante un estmulo determinado lo que hacen es actuar sobre el gen para que aumenten las sntesis de la protena.
Ejemplo segn Tod Flanders: La cidograsosintasa es una E inducible, en nuestro organismo la sntesis de cidos grasos depende de la cantidad de Acetil Coa que yo le regale y ste Acetil Coa depende de la cantidad de glucosa que usted consuma. El Acetil Coa se convierte en malumil y luego ese malumil se convierte en el cido graso y ese cido graso lo voy a almacenar en forma de triacilglicerol y se va al tejido adiposo. Se depende para este proceso de la cantidad de glucosa. La [ ] de glucosa le dispara a un paciente normal la secrecin de insulina, la insulina activa factores de transcripcin y esos factores de transcripcin inducen la cidograsosintasa entonces si usted tiene ms enzima y le est regalando sustrato a la enzima lo que est aumentando son los niveles de triacilglicerol, el consumo de glucosa elevados induce la sntesis de triacilglicerol, entonces la cidograsosintasa sera una E inducible porque se puede aumentar la actuacin de la enzima ante un estmulo.
4. Ph: Tiene que haber un pH ptimo para que la enzima acte eficazmente porque por debajo o por encima de ese pH ptimo la velocidad de la reaccin disminuye y se puede desnaturalizar. Las E tienen diferentes pH ptimos.
5. Temperatura: la misma mierda, las enzimas tienen una temperatura ptima, a temperaturas ms bajas la actividad se hace ms lenta porque disminuye la posibilidad de posicin entre las partculas, y a temperaturas elevadas la velocidad tambin es lenta porque se desnaturaliza la E.
Nosotros debemos regular la actividad enzimtica, un mecanismo que tenemos es modificar la [ ] de la E (enzimas constitutivas e inducibles), pero no se puede jugar con el pH y la temperatura, entonces aparecen los inhibidores que son molculas en algunos casos muy parecidas al sustrato que logran disminuir la velocidad de una reaccin. Hay 2 tipos de inhibicin:
Inhibicin Competitiva: es una inhibicin competitiva en la cual el inhibidor se parece mucho al sustrato entonces la E puede reconocer al inhibidor y confundirlo con el sustrato. El inhibidor se une al sustrato y forma un complejo E I. Mientras este el complejo E I la enzima no puede unir al sustrato luego la velocidad de la reaccin disminuye, pero esta unin es reversible y puede volver a dejar la enzima libre y el inhibidor libre. La constante de velocidad con que se asocia o se disocia el inhibidor a la enzima la vamos a llamar K F. Como esta es una inhibicin competitiva porque hay competencia entre el inhibidor y el sustrato si usted coge un tubito con E S y le echa inhibidor la velocidad disminuye. Si se le empieza a agregar ahora ms cantidad de sustrato va a haber mayor probabilidad que la enzima reconozca al sustrato y entonces si se d la reaccin, entonces estas inhibiciones competitivas se pueden salvar aumentando la [ ] del sustrato. Eso significa que cuando hay inhibidor el KM de la E aumenta, y se va a necesitar ms sustrato para alcanzar la mitad de la velocidad mxima pero la velocidad mxima de la reaccin no se modifica. En conclusin la inhibicin competitiva disminuye el KM, no afecta la velocidad mxima y aumenta el sustrato.
Otro tipo de inhibicin reversible es la No-Competitiva en la cual el inhibidor se une a un sitio diferente al sitio activo formando el complejo E-S-I. Ya no necesariamente el inhibidor se tiene que parecer al sustrato. La unin de ese inhibidor al sitio de inhibicin hace que la estructura de la enzima se modifique y disminuya la velocidad de la reaccin. El KM de la reaccin no se modifica porque el sitio de unin es diferente al sitio activo y as usted le hecha chochomil molculas de sustrato la velocidad mxima disminuye. Esa modificacin depende de la [ ] del inhibidor y de la constante del inhibidor.
INHIBICIN
Inhibicin competitiva El inhibidor Se asocia al activo. Hay una competencia entre el inhibidor y el sustrato. El inhibidor es una molcula muy parecida al sustrato. Hay una constante de asociacin y de disociacin entre el inhibidor y la enzima.
La velocidad o la tendencia de la enzima a asociarse al inhibidor depende de 2 factores: 1) Constante de inhibicin. 2) Concentracion del inhibidor.
Si miramos una grafica de acuerdo a Michaelis y Menten: La velocidad mxima no cambia, usted le agrega ..sustrato y la enzima es capaz de alcanzar la misma velocidad mxima pero se necesita ms concentracin de sustrato para alcanzar la mitad de la velocidad mxima.
Se aumenta el km, pero la velocidad mxima no se modifica.
En la diapositiva: Velocidad mxima no cambia por lo tanto el cruce o intercepto del eje de las Y es el mismo. El Km si aumenta. Recibe el mismo tratamiento de la curva sobre el eje de las x. Como el Km aumenta entonces la pendiente tambin se modifica
Factor que est modificand : Pendiente Km Es una relacin entre la concentracin del inhibidor y la constante de disociacin del inhibidor.
Inhibicin no competitiva Donde el inhibidor se puede unir a: 1) Complejo enzima-sustrato 2) La enzima libre. Cualquiera de los dos lados.
La velocidad con la que el inhibidor se asocia a la enzima ya sea por complejo enzima sustrato o enzima libre depende de la constante del inhibidor y de la concentracin de l. (Igual que el inhibidor competitivo).
No se puede salvar agregando exceso de sustrato, lo nico que se logra es tener ms complejo enzima- sustrato que tambin se puede asociar con el inhibidor. Esto indica que: La velocidad mxima de la reaccin disminuye. El Km no se modifica.
Si miramos la curva de Michaelis y Menten: Una disminucin en la velocidad mxima. Km no se modifica. La concentracin de sustrato a la cual se alcanza la velocidad mxima no vara.
Si se observa la grfica de lawether: La velocidad mxima se modifica por un factor que est asociado con la concentracin del inhibidor y la constante de ese inhibidor. La curva se desplaza. El cruce sobre el eje de la Y cambia. El Km no se modifica. El corte sobre el eje de la X no se modifica. La pendiente se modifica. (por la disminucin de la velocidad mxima) aumenta la pendiente.
Algunas veces este tipo de inhibicin se llama Inhibicin mixta. (mathews).
Diferencias entre la competitiva y la no competitiva: En una se afecta la velocidad mxima pero no se afecta el Km. (no competitiva). En la competitiva es lo contrario, afecta el Km, pero no afecta la velocidad mxima.
Inhibicin acompetitiva El inhibidor se une solo al complejo enzima-sutrato no se une a la enzima libre. Para obtener enzima libre tengo que permitir que el complejo se rompa. La afinidad o cantidad de complejo enzima-sustrato inhibidor va a depender de la concentracin del inhibidor y de la constante del inhibidor. Se afecta tanto la velocidad mxima como el Km.
Representacin de Lawether: El Km se afecta por un factor que esta relacionado con la constante del inhibidor y la concentracin del inhibidor. La velocidad mxima tambin se afecta por el mismo factor. A medidia que agrego inhibidor el Km disminuye y la velocidad mxima disminuye. Se afectan en la misma proporcin. La pendiente se mantiene.
Cuando se le agrega el inhibidor el numero se vuelve negativo pero ms grande entonces el Km disminuye. Cuando le agrego el inhibidor el cruce sobre el eje de las Y se incrementa, la velocidad mxima tiene que tambin disminuir.
La expresin del Km (la formula matematica) es: La mitad de la concentracin del sustrato a la cual se alcanza la mitad de la velocidad mxima.
Usted disminuye la velocidad mxima y la concentracin del sustrato para alcanzar esa nueva velocidad mxima, se necesita para alcanzar esta nueva velocidad mxima, tambin va a disminuir. Disminuye el Km como la velocidad mxima en las mismas proporciones.
Inhibicin unin irreversible El inhibidor se asocia al sitio activo, es una molecula muy parecida al sustrato. Es modificado por la enzima (el inhibidor) y queda pegado de manera covalente a la enzima no se desprende. Enzima queda inhibida durante mucho tiempo, mientras este la protena.
Ejemplos: La penicilina es un inhibidor irreversible. Alguna enzima esta en la membrana celular El cianuro es un inhibidor irreversible que tiene dentro de su estructura ionines como por estilo del cobre. En la cadena oscilatoria, tienes unas enzimas que se encargan de hacer la transferencia de los electrones a travs de este flujo. Luego se acopla a la fosforilacion oxidativa, el cianuro se pega all, practicamente lo que tiene ms afinidad al el complejo 3 entonces evita el traspaso de los intrones hacia el sitio
Es separacin es un veneno, se usa mucho en la agricultura un inhibidor fuerte.
Necesidad de regulacin Tenemos una necesidad muy grande de regular la actividad enzimtica por varios factores: Quitar la que tiene ms peso
Es el hecho que tenemos rutas metablicas que tienen los mismos sustratos.
Cuando nosotros consumimos carbohidratos y queremos obtener energa de ellos comenzamos a hacer un jueguito metablico:
Glucosa mas glucosa 6 fostato llega a fructosa 6 fosfato debe pasar a convertir en fructosa 1,6 difosfato. Hay una enzima que se llama fosfofructoquinasol..
Glucolisis tratamos de enredarla micola. 1 Reaccin irreversible y la mayora de reaciones de aqu para abajo son reversible a excepcin delpiruvato piruvato. Piruvato acetil coa energa. O almacena acidos grasos a partir de acetil CoA.
Cuando no hay suficiente glucosa tenemos que recurrir a otros mecanismos ya que clulas son glucosa dependientes entonces tenemos que: El organismo hace otra ruta metabolica que se denomina gluconeogenesis y a partir de aminocidos se obtiene piruvato o productos del ciclo de krebs, hago lo contrario:
Piruvato se devuelve por la gluconeogenesis y produce fructosa 1,6 difosfato que se tiene que convertir en fructosa 6 fosfato y lo hace la fructosa 1,6 difofatasa. Tenemos glucosa 6 fosfatasa.
Mirando solo el pedazo de las 2 enzimas anteriores, si yo no tuviese un mecanismo regulatoria sobre estas 2 enzimas a mi nadie me garantiza que el proceso de degradar aminocidos (que es un proceso que consume energa), la sntesis de aminocidos consume energa, que es energticamente favorable que me lleva a sintetizar fructosa 6 fosfato si no pienso en regulacin esa fructosa 6 fosfato fcilmente podra devolverse, se convertira entonces es un ciclo al que llamamos intil donde sintetizo una molcula para volverla a liberar (no hago nada). Necesito regular estos procesos para que no se den estas 2 rutas al mismo tiempo. Tengo que regular la fructosa 1, 6 difosfatasa y regular fosfofructoquinasa 1. De tal forma que cuando una este activa, la otra se inhiba. Si yo estoy en la glicolisis no voy a sistetizar glucosa. Si estoy sistetizando glucosa no voy a hacer glicolisis.
La otra necesidad de hacer regulacin enzimtica es que muchas de las rutas implican el uso de muchas molculas esenciales o que para ser sintetizadas necesitan alto consumo de energa, necesitamos ser econmicos. El metabolismo tiene 2 propiedades: Economia. Sensibilidad.
Tengo que evitar el consumo de enrgia cuando no es necesario. La otra fucnion que tiene la regulacin enzimtica se realciona con que muchas de la molesculas que voy a sintetizar tienen un efecto muy grande, por ejemplo neurotransmisor.
MECANISMOS REGULATORIOS
Regulacion alostrica: Enzimas alostericas son aquellas que tienen un sitio diferente al sitio activo al cual se va a pegar la molecula. Aquellas molculas que se pegan a las protenas se conocen como ligandos. Ej. una hormona, puede ser un regulador tambin. Pero aquellos ligandos que tienen efectos sobre la regulacin los conocemos como Efectores o Moduladores. Entonces a las enzimas alostericas a los sitios alostericos se les pegan moduladores o efectores.
Moduladores: Positivos o negativos: se puede estimular la actividad de la enzima o se puede inhibir y esa regulacin es cinergica. Si tengo 2 reguladores positivos la actividad cinergica va a ser mayor que si hay un solo regulador.
Las enzimas alostericas pueden ser monomericas (una sola subunidad) o pueden ser oligomericas o oligomeros con varias subunidades. Esas subunidades estn formadas por diversas cadenas polipeptidicas. Atadas a esas subunidades se denominan Proton.
Se pueden tener dos efectos sobre las enzimas alostericas: efecto homotropico o efecto heterotropico: Homotropico: si se une un ligando a las enzima ese ligando va a tener efecto sobre la aafinidad de la enzima por el mismo por ej cunado hay concentraciones elevadas de glucosa en la celula. En algunos tipos de celula la hexocinasa es estimulada. Ej. La glucosa estimula la hexocinasa para que reconozca a la misma glucosa. Un efecto heterotropico ser lo contrario, un ligando pega la enzima y afecta o modifica la actividad de la enzima por otro ligando. Ej. Muchos. La fosfofructoquinasa que es regulada de manera alosterica por el ATP. Altas concentraciones de ATP inhiben a las fosfofructoquinasas y disminuye la afinidad de la fosfofructocinasa por la fructosa 6 fosfato. Hay una modulacin heterotropica negativa por lo hago inhibicin. Mientras que el AMp tienen un efecto heteropropico positivo sobre la fosfofructocinasa, es decir si se aumenta AMp se une alostericamente a la fosfofructocinasa y aumenta la actividad de la enzima por la fructosa 6 fosfato.
Ej. Enzima alosterica fosforibosilkilofosfato sintetasa, enzima de las. Utiliza 2 sustrato la ribosa y el ATP, al sitio cataltico se debe unir la ribosa y el ATP. Y de ellos la enzima produce fosforibosilkilofostato, al final produce GMp y AMp. Hay moduladores negativos el ATP y el GDP que se pegan aun sitio alosterico la fosforibosilkilofostato. El fosfato inorgnico es un modulador positivo se pega a una enzima en su sitio alosterico y la activa.
Una enzima puede tener mas de un sitio alosterico.
Si se compara la sinrgica de la grafica de reacciones alostricas, al lado de aquellas que no son alostricas, uno.la cinergica de michaelisy menten se observa una curva sigmoide cuando se hace relaciones de la concentracin del sustrato y la velocidad mxima. Hay una curva sigmoide que es muy parecida a la curva de asociacin del oxigeno a la hemoglobina. Ej. La hemoglobina tiene 4 subunidades, cada subunidad tiene un grupo Hemo. Cuando el oxigeno se pega a cada una de esas subunidades hay cambio conformacional y favorece que una molecula de oxigeno se pegue a otra subunidad y esa nueva que se pego facilita que una tercera se pegue.
COOPERATIVIDAD: se observa en la enzimas alostricas.
Hay un fenmeno en que no se rigen por la cinetica de Michaelis y Menten sino que tienen un nivel de cooperatividad: Esa cooperatividad implica que hay regiones en la cinetica que a pesar de cambiar la concentracin de sustrato de manera marcada, la velocidad de la reacion no aumenta mucho. Se cambia la concentracin de sustrato la velocidad no va a cambiar mucho. (Esto no se observa en la de Michaelis y Menten donde al comento hay un comportamiento de curva de reaccin de G2??? En la parte central hay una porcin en que la concentracin del sustrato hace una pequeas modificaciones y provoca grandes cambios en la velocidad de la reaccin y tenemos nuevamente el estado estacionario) Al estar agregando sustrato no se modifica la velocidad de reaccin.
En las no cooperativas se comparta como una reaccin de primer orden, depende solo de la concentracin del sustrato. Se agrega el inhibidor tenia un comportatmiento similar, simplemente la curva se hace mas baja, o se corre un poco hacia un lado pero en general el comportamiento es el mismo.
Al contrario, cuando se tiene una enzima alosterica, se da el comportamiento sigmoide, al comienzo a pesar de hacer cambios en la concentracin del sustrato, no hay cambios marcados en la velocidad de la reacion. En la parte central si hay cambios marcados. Esto es propio de la cooperatividad.
Hay dos modelos de cooperatividad: Secuencial
Concertado Enzimas alostricas van a estar en dos estadios: Relajado: mas activo Tenso: menos actividad
La conformacin de la enzima (aca hay una enzima con dos protones) una unin del sustrato al primer proton, modifica al segundo. Modificala configuracin de la enzima afectando los dos protones por lo que aumenta la actividad del segundo por el sustrato. Unos se pega y modifica toda la encima. Apenas entra una pasa de estado Tenso a estado relajado.
Secuencial: Se da cuando tengo varios sustratos, el sustrato 1 modifica la estructura del primer protmero y causa modificaciones en el segundo protmero que causa modificaciones en el tercer protmero y facilita unin del sustrato 3. Y luego al 4. Es secuencial.
Los dos modelos explican el comportamiento sigmoideo de las curvas: El concertado y el secuencial. Sin embargo una enzima que solo tenga un solo sustrato no significa que no se le pueda aplicar el modelo secuencial. Encontramos enzimas con muchos protmeros que catalizan? la misma reaccin (42:20). Una enzima conformada por 4 protmeros y los 4 protmeros se convierten en sustrato. (Modelo secuencial).
REGULACIN ENZIMATICA
En sistema alostrico funciona de esa manera. Esta la enzima hay un sitio de unin al sustrato, hay un sitio de unin a un activador y hay un sitio de unin al inhibidor. El activador se une a la enzima modifica la configuracin de la enzima y aumenta la afinidad por el sustrato. Modulador positivo. El inhibidor se asocia a la enzima, la enzima modifica su estructura y disminuye la actividad por el sustrato. Modulador negativo. Cuando la enzima tiene varios protmeros, la unin de un activador a uno de los protmeros modifica la estructura del primero y del segundo protmero que no est en contra o exento de la actividad secuencial o concertado. Es decir, este activador se pega al primer protmero, modifica la estructura del primer protmero, se pega al sustrato y tambin se modifica la estructura del segundo protmero para facilitar la entrada del segundo sustrato. Inhibidor, se modifica, se disminuye la afinidad y la disminucin de la actividad del primer protmero afecta la del segundo y produce un cambio.
Tenemos unas curvas en la cintica alostrica (observando la grafica): Con modulador negativo: Se reduce la velocidad mxima. Aumenta el Km.
Con modulador positivo Se disminuye el Km. La velocidad mxima no se modifica.
En la regulacin alostrica se pueden encontrar enzimas que: Modifican el Km y la velocidad mxima. Modifican el Km sin afectar la velocidad mxima.
La gran mayora de las enzimas funcionan afectando la actividad de la enzima por el sustrato pero no se afecta la velocidad mxima.
La regulacin alostrica es similar a la inhibicin no competitiva pero no cumplen estas mismas reglas ya que en la inhibicin no competitiva no hay cooperatividad. En las alostricas s.
Existen varios mecanismos regulatorios en la actividad enzimtica: Ej. La glucgeno fosforilasa es la que convierte el glucgeno en glucosa. Esta enzima se puede encontrar en dos estadios, el tenso y el relajado. El paso de tenso a relajado es activado por AMp. La vuelve ms activa. Mientras que el ATP Y EL. Hacen lo contrario.
Una enzima puede tener mecanismos regulatorios adicionales
Ej. Enzimas con 2 subunidades, una reguladora y una cataltica. Una porcin de la unidad reguladora tiene una secuencia, tiene un fragmento que le permite introducirse dentro del sitio activo de la enzima e inhibe. Hace bloqueo. Pero ante ciertos estmulos se puede cambiar la configuracin de la porcin reguladora de la enzima. En este caso el AMp cclico le cambia la estructura y lo desprende de la porcin cataltica. El sitio activo queda libre y puede terminar su funcin.
Ej. Proteincinasa es una enzima que es clave en la sealizacin intracelular, lleva mensajes al interior de la clula tiene modelo de porcin relajada, la porcin cataltica y una porcin reguladora tambin se puede aplicar en la glucgeno fosforilasa. La glucgeno fosforilasa adems de tener el estado p y el estado f, tiene este fenmeno.
Ante condiciones de ayuno se aumentan niveles de hormonas como la insulina y el glucagn. El glucagn tiene un efecto muy importante, se une al receptor y a travs de una cascada de sealizacin el glucagn aumenta la concentracin de AMp cclico, se pega el glucagn, el receptor (receptor en serpentina) membrana celular, la hormona se une al receptor, el complejo hormona receptor activa la protena G que activa la protena adenilato ciclasa que convierte el ATP en AMP que activa la proteincinasa A. Ella pasa a la forma activa de la enzima que fosforila a la glucgeno fosforilasa y la activa. Tenemos aqu dos mecanismos reguladores: 1) El paso de estado tenso al relajado 2) Liberar las porciones reguladoras de la actividad cataltica y activar a la encima.
Ej. La calmodulina. Las enzimas dependientes de calcio tiene un dominio regulador y un dominio cataltico, cuando no tienen asociada la calmodulina son inactivas. Las calmodulinas en presencia de calcio cambia su estructura se pega a la porcin reguladora inactivndola. La inactivacin de esa porcin hace que la enzima que sea dependiente de calcio pase a condicin activa. El regulador que est desprendiendo o inactivando la porcin reguladora es la calmodulina y no el AMp. . (calmodulina se puede disociar o no se puede disociar, el producto final de la ruta inhibe reacciones iniciales de esa ruta que son limitantes).
La regulacin alostrica puede funcionar como mecanismo de Feed Back. En estos, hay una reaccin intraenzimtica. Cuando se enfrenta a una ruta metablica, las rutas metablicas pueden tener muchas reacciones 20- 25 reacciones, el organismo selecciona la que sea ms fcil de regular o las 2 o 3 ms fciles de regular. Y esta es una reaccin que es catalizada por una enzima que tenga la velocidad baja y un km elevado.
Ej. La glicolisis tiene como 18 reacciones pero solo son 3 las que tienen actividad regulatoria. Una es el paso de la glucosa a glucosa 6 fosfato que es catalizada por la hexocinasa: Tiene un Km un tanto elevado. Es una reaccin irreversible.
Nuestro organismo busca reacciones que Sean irreversibles. Estas son las que energticamente son desfavorables, aquellas a las que necesito agregarles energa para que se puedan llevar a cabo. Tengan una velocidad baja.
Para regular la glicolisis utilizo: Glucosa 6 fosfato. Fosfofructoquinasa. Tiene un Km bajo pero requiere una velocidad baja. Ella determina la velocidad de la glicolisis. La primera y la tercera son regulatorias
Entre ms baja es su velocidad, ms capacidad regulatoria tienen. Otra de las reacciones es la piruvatoquinasa que se convierte en fosfonol piruvato.
No se siempre las vas metabolicas tienen varias regulaciones metabolicas, generalmente 1 reaccion regulatoria es suficiente:
*En el caso de la sntesis de los acidos grasos tenemos una sola enzima denominada acetilcoenzima (A) carboxilato. En la primera reaccin. *En el caso de la sntesis de colesterol tenemos la hidroxiacetilbutaril coenzima A reductasa. Es la tercera reaccin la que es la regulatoria.
El resto de regulaciones por retroalimentacin o feedback
La conversin de aspartato en isoleucina. La sntesis de aminocidos siempre implica consumo de energa y el consumo no necesariamente tiene que estar explicito dentro de la reaccin. Puede estar porque estoy gastando sustrato que de otra forma o en otra ruta me podra aporta muchsima energa. Isoleucina tiene regulacin por retroalimentacin sobre la primera enzima que es una quinasa. Convesion de treonina en cetoxidasa. Es una transaminasa. Sntesis de nucletidos purinicos. Los productos finales de la reaccin regulas las etapas iniciales de la misma.
Las reacciones regulatorias siempre estn al comienzo de una ruta metabolica, son la primeras en la va.
Regulacin Cruzada
Cuando hago sntesis de nucletidos para poder pasar de adenosinmonofosfato a dinosinmonofostato, esta reaccin es dependiente de ATP (no se bien como se llamas no entend) es una reaccin de oxidoreduccion. Y el paso de dinosinmonofostato a adenilsuccinato es dependiente de GTP.
Cuando los niveles de ATP se aumentan van a hacer regulacin sobre la dinosinmonofostato deshidrogenasa estimulndola. Y si GTP se aumenta, tiene un efecto estimulantes sobre el adenilato, sobre el adenilsuccinato deshidrogenasa estimulndola.
En el caso de la cruzada que tambin es una regulacin alostrica, lo que hago es que el producto tiene efectos regulatorios sobre otra ruta no sobre la misma.
Ej. La sintesis de cidos grasos, el acetil CoA se convierte en malonil CoA, y ese mayonil CoA forma un complejo que se llama acido graso simutal que es un complejo multienzimatico. Los cuales se convierten en acidos grasos. Estos acidos grasos despus se depositan en forma de triacilglicerol.
Otra ruta, los acidos grasos se desprenden de los triacilgliceroles, que libera acidos grasos libres, para que los acidos grasos puedan entrar a la mitocondria necesitan la enzima la acilcarnitina transferasa. Mete el acido graso dentro de la mitocondria donde sufre la B oxidacin y produce acetil CoA para producir energa.
Donde esta la regulacin cruzada? Cuando tengo niveles elevados de acidos grsos, los acidos grasos libres inhiben la acilcarnitina transferasa. Esto garantiza que al hacer sntesis de acidos grasos no haya degradacin de acidos grasos.
(En el caso de la regulacin por Feedback, aumentan niveles de acidos grasos libres que van a inhibir la primer enzima, en este caso la acetilcoenzima A Carboxilato y cruzada cuando inhibe una ruta diferente b oxilacion en este caso).
Modificacin covalente
Principalmente se hace un fosforilacion de la enzima. Le pegamos un fosfato que hace que su estructura conformacional cambie y la inactiva o la activa dependiendo de la enzima.
Esta modificacin covalente se puede realizar de la siguiente manera: Se le une a un receptor que activa la adenilato ciclasa, que aumenta los niveles de AMp cclico, el AMp de glucosa usando una enzima que se llama glucgeno sintasa, coge glucosa, la convierte en glucgeno. Cuando estamos en condiciones de ayuno el glucgeno se vuelve glucosa por la accin de la enzima glucgeno fosforilasa.
Supongamos que se aumentaron niveles de adrenalina, se activa proteinquinasa que fosforila proteinas: la glucgeno sintasa. glucgeno fosforilasa. La diferencia es que cuando fosfolira la glucgeno fosforilasa se degrado glucgeno y se conviertio en glucosa. Cuando fosforila la glucgeno sintasa, bloqueo la ruta.
Activo una ruta, bloqueo la otra por medio de modificaicon covalente. Es un tipo de regulacin reversible. Las regulaciones enzimticas son casi todas reversibles a excepcin del regulador (cianuro).
Cuando niveles de adrenalina baja se inactiva la proteinquinasa A y se activa la fosfatasa. Que le quita los fosfatos a ambas y activa glucgeno sintasa pero inhibe la glucgeno fosforilasa.
Complejos Multienzimticos
Las enzimas cuando estn en forma de complejos Multienzimticos, las enzimas cuando estn en esta forma sobre las que estn libres. La acido graso sintasa es un complejo enzimtico que esta confomado por 6 enzimas.
Tienen 2 ventajas: Son ms fciles de regular, como son protenas que estn pegadas. Al provocar una modificacin covalente. Ej. Al alterar la adenil reductasa, lo mas seguiro es que afecte las otras 5. Modifico una y puedo modificar el resto. Si tuviera que regularla cada una por aparte eso me representara mas gasto energtico. Reduce la velocidad de la reaccin. En el caso de la acido graso sintasa tenan que ocurrir 3 reacciones en cadena. El producto de una sirve de sustrato para la otra. lo primero que ocurre es la cetoacilsintasa que sintetisa la cetoacil que luego tiene que pasar a la accin de la aciltransferasa que hace que cambie de conformacin. Luego la aciltransferasa sufre el ciclo de la .reductasa. (aca el producto no nos sirve de sustrato para la sgte reaccin. Tendramos que ir por toda la clula buscando la enzima que me sirva para seguir con la otra reaccin. Al tenerlas juntas, el espacio que tienen que recorrer es mucho menor para poder encontrar la enzima que les corresponde y si aparte una ayuda adicional como una protena transportadora de acilos (que no en enzima) es como coenzima que se le pega una vitamina que es el acido pantotnico. La protena transportadora de acilos, siempre est pegada al sustrato, recoge el sustrato, se lo da a la primera enzima que lo convierte en su producto y lo pasa a la siguiente enzima. Esto hace que la velocidad de sntesis de cidos grasos sea ms grande que cuando no est en complejo multienzimtico.
Si comparo el tiempo que gasta en sintetizar acido palmtico en una bacteria vs la velocidad que se gasta en un humano. La bacteria gasta 4 veces ms de tiempo para sintetizar el acido graso. A la bacteria no le interesa tener acido grasos.
Activacin por protelisis
En esta activacin, lo que ocurre es que las enzimas pierden una porcin para volverse activas. Ej. Las vacuolas que transportan los (endo)(neuro)transmisores. (sea ctivan durante el desarrollo por cambio de pH. Enzimas producidas en el pncreas que se encargan de la digestin de protenas. Estas enzimas estn en forma de cimgenos.
Cimgenos: Formas inactivas de la enzima. Ej. Quimiotripsinogeno. Tripsinogeno, proelastasa. Estas formas estan inactivas, ya que si tuviramos proteasas activas es posible que comiencen a degradar las mismas protenas del pncreas y comencemos a tener patologas en el pncreas: pancreatitis.
El tripsinogeno se libera al intestino donde hay heteropeptidasa que tiene un pH ptimo ligeramente alcalino y convierte el tripsingeno en tripsina. La tripsina se encarga de activar el resto de cimgenos. Coge el quimiotripsinogeno, le quita un pedazo y lo convierte en quimiotripsina. As con los dems... En el tripsingeno hay una porcin polar que evita que el sitio activo se forme de una manera adecuada entonces la tripsina hace quita esa porcin polar y permite que sitio activo se acople perfectamente y pueda desempear su funcin. Las cascadas de coagulacin. Los diferentes factores de coagulacin se comportan como enzimas, si activo uno pasa de cimgeno a la forma activa de la enzima y ese activa otro de la misma forma quitndole una porcin para asi activar la cascada de coagulacin.
La mayora de las reacciones ocurren con ms de un sustrato, generalmente dos o ms sustratos. Tenemos que tener en cuenta el reactivo lmite que es el que determina con que velocidad se lleva a cabo la reaccin. Cuanto aporto de ese reactivo limite.
Puedo hacer entonces regulacin: Disminuyendo o aumentando la concentracin del sustrato. Aumentando o disminuyendo la cantidad de coenzima (que se comporta como segundo sustrato).
Las reacciones de mltiple sustrato pueden ser secuenciales o no secuenciales. Secuenciales: Al azar: No importa a cual se le pegue la enzima siempre va a dar el producto. Se pega al primero luego se pega al segundo, o se pega al segundo y luego al primero. Ej. Ligasas, sintetasas, acetil coenzima A carboxilato (clave en sitesis de acidos grasos). Ordenadas: es necesario saber orden con que se pegan los sustratos. Enzima debe pegarse al primero luego ir a segundo para poder dar el producto. Ej. Reacciones de oxido-reduccion. Primero se pege DNA y despus el gliceraldeido 3 fosfato. Necesito asociar en un orden establecido de lo contrario la enzima se modifica y no se obtiene el mismo resultado.
Reacciones en ping pong
Enzima se asocia a un sustrato y produce un. Y lo caracterstico es que la enzima se modifica en el primer paso. Esa enzima modificada es la que recibe el segundo sustrato y me da un segundo producto para tener una enzima como estaba en la primera reaccin. Enzima se modifica ya sea porque recibe una molecula, se le pega un carbono, un fosfato o un nitrgeno. Ej. Reacciones de transaminacion. Tenemos un aa que va a transaminar, la enzima pegada a una coenzima que se llama fosfato de piridoxal, tenemos los aa, se forma un complejo entre el fosfato de piridozal y el aa, se forma una base la intermedia de shift. Se da la reaccin se libera primer producto que es el cetoacido, queda enzima modificada, el fosfato de piridoxal ya no es piridoxal sino piridoxamina. Vienen segunda reaccin, llega segundo sustrato que es otro cetoacido que de devuelve y queda como aa y enzima queda igual que al comienzo.
Si estos mecanismos regulatorios no se dan, se producen problemas como dao heptico, retardo mental, muerte temprano. Deficiencias en sntesis de glucgeno tambin produce enfermedades mortales. Deficiencias para degradar carbohidratos complejos como los glucosaminoglicanos, enf. Glucofosfosacaridosis.
Compartimentalizacin de las enzimas
*Enzima que esta en las membranas y no en el citoplasma porque all es su funcin. *Enzima en la mitocondria y no en citoplasma. *En el caso de la mitocondria, relacionada con la produccin de la energa, tiene regulacin fina sobre la produccin de la misma. *Lo relacionado con sntesis, anabolismo con metabolismo se encuentra en el citoplasma independiente de lo que ocurra en mitocondria. Esto garantiza que se realicen procesos de manera independiente.
Las biomolculas son molculas esnciales para la vida dentro de ellas encontramos alas protenas, los lpidos, los carbohidratos y a las vitaminas a pesar de que son molculas pequeas. Las vitaminas son aminas que son esenciales para la vida, se dijo que eran aminas gracias al bioqumico polaco casimir funk que descubri una vitamina que era una amina y dedujo que todas las vitaminas eran aminas. Las vitaminas son esenciales en el metabolismo y necesarias para el crecimiento y buen funcionamiento del cuerpo. Solo las bacterias y los vegetales pueden sintetizar las vitaminas, por eso los seres humanos debemos ingerirlas en la dieta. La vitamina D, si puede ser sintetizada por las bacterias del organismo, la niacina no es considerada una vitamina porque se sintetiza a partir del triptfano que es un aminocido, pero de igual forma debe ser consumida en la dieta. De acuerdo a su solubilidad en agua y en otros compuestos apolares las vitaminas se pueden dividir en liposolubles e hidrosolubles. Las liposolubles se pueden disolver en compuestos apolares como las vitaminas A, K, D, E, y las hidrosolubles son aquellas que se disuelven en agua como la vitamina C, y todas las del complejo B. S requieren en cantidades pequeas. La vitamina c o acido ascrbico tambin conocida como antiescorbtica. La vitamina B1 o antiberiberica. La vitamina B2 o riboflavina. La vitamina B3 o niacina. La vitamina B5 o acido pantotenico La vitamina B6 o piridoxina. La vitamina B8 o biotina o vitamina H. La vitamina B9 o acido flico. La vitamina B12 o cobalamina.
La principal diferencia que existe entre las vitaminas liposolubles e hidrosolubles es que ante una hipervitaminosis, las vitaminas hidrosolubles van a superar el umbral renal y se van a eliminas a travs de la orina a diferencia de las liposolubles que tienden almacenarse en el tejido adiposo, generando mayores problemas al organismo. Los depsitos metablicos de estas vitaminas son muy labiles y esto hace que las personas que no consuman en su dieta vitaminas liposobles manifiesten rpidamente carencias. Las vitaminas hidrosolubles como son coenzimas, en estado vitamnico, es decir, que es la cantidad de vitamina que pueda requerir una persona en un momento dado lo podemos medir de manera indirecta cuando evaluamos la actividad enzimtica de algunas enzimas en las que ellas estn implicadas. Las vitaminas hidrosolubles participan en muchas reacciones bioqumicas y esto hace que cuando haya una carencia de vitaminas nos quede supremamente difcil decir a que vitamina corresponde a menos que se tenga muy claro el cuadro clnico. La mayora de vitaminas participan en el metabolismo energtico y esto hace que se afecten los tejidos de rpido crecimiento como por ejemplo la piel y esto lo podemos ver en que muchas de las carencias de estas vitaminas se manifiestan como dermatitis. Tambin debemos recordar que los alimentos se encuentran en forma reducida y la mayora de las reacciones bioqumicas se basan en tratar de oxidar esos alimentos como es el caso de los cidos grasos para poder realizar la digestin. Min 30.00 Las enzimas estn relacionadas con las coenzimas ya que estas corresponden a cofactores de tipo orgnico, al hablar de cofactores podemos decir que son orgnicos si nos referimos a una coenzima o inorgnicos si hablamos ion metlico como el hierro, el zinc, la funcin del cofctor es activar una enzima como tal. Una coenzima es un cosustrato que se une transitoriamente al sitio activo de la enzima, la apoenzima se une al cofctor o coenzima en el sitio activo de la enzima para formar la holoenzima que es la parte activa.
Aqu va el cuadro de las vitaminas y sus coenzimas pero yo no lo tengo.
A las vitaminas hidrosolubles las podemos resumir como coenzimas en las reacciones bioqumicas, y la vitamina c, cuya principal funcin es su accin antioxidante. La riboflavina en este caso seria el FAD, y el acido nictico esta relacionados con reacciones redox y en este caso seria el NAD.
Vitamina b1 o tiamina pirofosfato (tpp)
Es sensible a la luz ultravioleta, un pH alcalino puede daar esta vitamina, al igual que los procesos de pasteurizacin y esterilizacin (40%), participan en reacciones de descarboxilacion. Fuentes: cereales, la carne de cerdo, las levaduras. Esta vitamina no se almacena y tiene unos factores antitiamina llamados que pueden llegar a disminuir los niveles de tiamina al igual que estimulacin a nivel del nervio. La deficiencia de tiamina produce beriberi. Participa en todas las reacciones de deshidrogenacin, como la de la piruvato deshidrogenasa en el metabolismo de los carbohidratos, la alfa-cetoglutarato deshidrogenasa en el ciclo del acido ctrico, la cetoacidodeshidrogenasa en el metabolismo de la leucina, isoleucina y la valina y otra parte muy importante es la actividad de las transcetolasas en la va de las pentosas fosfato. La tiamina tambin sirve para aquellas personas que tiene problemas a nivel de los huesos y sobretodo a nivel neurolgico o neuropatas a nivel perifrico. No es clara la forma en que se da lugar a las carencias. La tiamina pirofosfato esta formada por un anillo de tiasol, que a su vez esta formado por un grupo carbanion que a la hora de la formacin del piruvato a travs de la piruvato deshidrogenasa, producir acumulacin de este y por lo tanto de acido lctico produciendo muchas reacciones para el organismo. Min 49.00 La tpp es la que se une al anillo de tiasol para formar el carbanion y poder activar a la piruvato deshidrogenasa. Tambin tenemos ala trascetolasa que es la que transfiere un grupo aldehdo desde una cetona hasta una aldosa. Los requerimientos varan segn la edad en nios se necesitan 0.5 mg, en adolescentes de1.2 a 1.8 mg, en mujeres es de 1.0 mg y en hombres de 1.5 mg. Cuando hay carencia de tiamina esta inhibido el metabolismo de los glcidos ya que hay acumulacin de piruvato, hay un defecto en la transmisin nerviosa ya que esta relacionado con neuropatas perifricas, tambin puede ocasionar perdida del apetito, nauseas, inestabilidad. Podemos encontrar varias patologas: el beriberi seco (neuropata perifrica); el beriberi hmedo (cuando se presenta edema), el sndrome de wernicke - korsakoff: en el cual hay signos oculares, ataxia, alteracin de la funcin mental, especialmente lo podemos encontrar en alcohlicos que son los que presentan carencia de todas las vita minas ya que presentan un dao en el hgado.
Vitamina b2 o riboflavina
Tiene un cofactor muy importante en las reacciones de oxidoreduccin que es la flavin-adenin-dinucletido o FAD, que se forma a partir de FMN y se da por fosforilacin dependiente de ATP. Es sensible a la luz, termoestable, sintetizadas por las plantas y los microorganismos, las podemos encontrar en levaduras, leche, huevo, hgado, corazn, verduras. Del 60 al 90% de riboflavina lo podemos en forma de FAD y de FMN (flavinmonosin nucletido). Acta en la cadena respiratoria, en la produccin de energa y en la reduccin de cidos grasos. Esta relacionada con la mitocondria, la respiracin celular y el metabolismo de cidos grasos. La riboflavina tiene dos coenzimas el FDA y el FMN, las enzimas relacionadas son todas las que tienen que ver con reacciones de oxido reduccin. El FAD y el FMN serian los dos vitameros de la riboflavina. La deficiencia de esta vitamina puede producir queilosis (boqueras, lesiones a nivel de las comisuras labiales), glositis (inflamacin y adormecimiento de la lengua), la dermatitis seborreica que se presenta en la nariz, las orejas, y en los surcos naso genianos. A nivel de ocular las lesiones se presentan a nivel de la cornea: vascularizacin, opacidad y ulceraciones de la cornea, fotofobia, congestin de la esclertica y pigmentacin anormal del iris. Requerimientos: en nios 0.5 mg, adolescentes 2.0 mg, adultos1.1 -1.8 mg por da, embarazadas y en la lactancia 2.3 mg por da.
Vitamina b3 o acido nicotnico:
El acido nicotnico no se considera una vitamina ya que se puede sintetizar a partir del aminocido triptfano, sus fuentes son la leche, los vegetales, carne, cereales(maz), levaduras, es estable ante la luz y el calor, su coenzima es el NAD y se absorbe o atrapa en forma de NAD+ (oxidado). Participa en reacciones de oxido reduccin. La deficiencia de esta vitamina produce una enfermedad llamada pelagra o la enfermedad de las tres D: diarrea, dermatitis y demencia.se pueden presentar requerimientos, de hasta 3g cuando hay gran deficiencia manifestados con ligeros cambios sensoriales y motores, y disminucin de la sensibilidad. Las personas que solo consumen una dieta amarilla pueden llagar a presentar falencias.
Vitamina b6 o piridoxina:
Presenta tres vitameros que son la piridoxina (PN), el piridoxal (PL), y la piridoxamina (PM), que pueden pasar a su forma por accin de una cinasaque son: piridoxina fosfato, pidoxal fosfato y piridoxamina fosfato que son esteres fosforilados, o por medio de una fosfatasa volver a la otra forma. Recibe el nombre de B6por que presenta 6 formas anteriormente mencionadas. El fosfato de piridoxal interviene en el metabolismo de los carbohidratos como es el caso de la glucgeno fosforilasa, y tambin ayuda en la formacin de la base de shiff. La base de shiff, es una reaccin en la que se unen el grupo proteico y el no proteico utilizada especialmente en el metabolismo de los aminocidos. La deficiencia tambin la esta relacionada con anormalidades en el metabolismo del triptfano y la metionina, tambin con canceres que tienen que ver con hormonas esteroideas como el de la glndula mamaria y el de prstata con respecto a este ultimo podemos encontrar que el antgeno prosttico esta disminuido y el tratamiento con vitamina E puede ayudar a mejorarlo.
Vitamina b 12 o cobalamina:
Tiene gran relacin con el factor intrnseco que debe unirse a la cobalmina. La protena cobalofibrina (protena que se encuentra en la saliva), esta protena se une a la vitamina B 12, donde acta tanto la lisina como el acido lctico para poderla liberar haciendo que se una con el factor intrnseco para que pueda ser absorbida, cuando una persona tiene una pancreatitis no se permite la unin al factor intrnseco y entonces la vitamina B12 no es absorbida de manera adecuada. Su funcin principal es transferir cobre, la cobalmina a travs de la metilmalonilcoA mutasa, puede transferir de n-metilmalonil CoA a sucinil CoA, podemos observar la transferencia del grupo metil. Las enzimas relacionadas con esta vitamina son la metilcobalamina al igual que la metilmalonil mutasa. La anemia megaloblastica esta relacionada con deficiencia de B12 y B10. Tenemos dos tipos de anemia una relacionada con la mal absorcin que puede estar relacionada con pancreatitis en la que no esta disponible el factor intrnseco, y una anemia perniciosa o megaloblastica que se consiste en un aumento de tamao de los glbulos rojos. Tambin esta relacionada con la hemocisteina que cuando hay deficiencia puede generar trastornos como los ateromas.
Acido flico o b10:
El acido flico es de vital importancia en los mecanismos de reparacin del ADN, tambin ha sido utilizado en tratamientos de fertilidad, que han sido exitosos y esto se debe a las coenzimas que posee, de igual forma interviene en la sntesis de pirimidinas. Es sintetizado por las plantas, es sensible al calor y a la luz, los medicamentos como los barbitricos lo pueden inhibir. El folato despus de varias reacciones de oxidacin puede llegar a formar tetrahidrofolato que es muy importante en algunas reacciones, tambin interviene en la sntesis de metionina. En muchas carencias estn relacionadas las vitaminas B10 y B12. Dentro de las coenzimas encontramos a la cianocobalamina esta unido a un cianuro, 5 adenosincobalamina a una base nitrogenada exactamente una purina, y si es metilcobalamina escara unido a un grupo metilo.
Al acido lipoco que dijimos que no era una vitamina.
Vitamina b5 o acido pantotenico
Est relacionado con la coenzima A que es su forma activa, esta relacionada con el ciclo del acido ctrico. La coenzima A posee unos grupos acilo que se destruyen o sintetizan cuando se consumen los alimentos que la contienen como las verduras y la carne. Se relaciona con la tiamina ya que ambas actan con la coenzima A. la trasferencia de grupos acilo tiene que ver con protenas que tiene que ver con el ADN, la sntesis de protenas, los fosfolpidos.
Vitamina b8, biotina o vitamina h.
La podemos encontrar en levaduras, el huevo, hgado. Sintetizada por la flora intestinal y puede estar como biotina o como biotitita, en las que hay transferencia de grupos carboxilo. En la reaccin de la piruvatocarboxilasa tenemos la biotina como cofactor para hacer la transferencia. De la biotina se requiere 1mg. No se ha reportado deficiencia de biotina ya que sus requerimientos son muy pocos.
El acido ascrbico con una dieta rica en frutas y vegetales lo podemos proporcionar. Los cereales pueden aportar la mayora de vitaminas hidrosolubles.
PARTE DOS
Son molculas orgnicas complejas, que son indispensables para algunas reacciones metablicas necesarias para el buen funcionamiento del organismo, se necesitan en pequeas cantidades, son proporcionadas en la dieta la dieta pero algunas de ellas pueden sintetizarse endgenamente como la vitamina D, son sintetizadas por los vegetales y las bacterias (vitamina K), y tambin las encontramos en algunos tejidos animales que ya han sintetizado la vitamina y nosotros la podemos consumir.
Vitaminas liposolubles:
Vitamina A o grupo de los retinoles. Vitamina D o grupo de los calciferoles Vitamina E o grupo de los tocoferoles. Vitamina K o grupo de los naptoquinonas.
Se le llama grupos porque no solo es una vitamina si no un complejo de molculas que poseen estas caractersticas en la que cada una va a tener una actividad especfica.
Estas vitaminas liposolubles son compuestos hidrfobos que son apolares y como nosotros tenemos grandes reservas de sustancia grasa fcilmente se van a cumular en este tipo de tejidos y por lo tanto se deben administrar con mucha precaucin. La administracin excesiva de esta vitamina puede generar toxicidad. Son molculas solubles en compuestos grasos, son termoestables, se absorben lentamente pero es la forma absorcin por la linfa, su principal rgano de almacenamiento es el hgado, pero hay otros sitios como el tejido adiposo, el pulmn, el rin en algunos casos. Se elimina por la bilis en una forma muy lenta y cada una de ellas va a tener una funcin fisiolgica especfica.
DIGESTION: si la ingerimos en cualquier alimento (zanahoria), van a llegar al intestino donde encontraremos las sales biliares que harn disociacin de estas vitaminas, luego se formaran mcelas , que pasaran al enterocito y en este se formaran las lipoprotenas llamadas quilomicrones que es la lipoprotena principal encargado de transportar todos los lpidos administrados de la dieta. Este quilomicrn saldr del enterocito, va a pasar por los capilares y va perdiendo cidos grasos, vitaminas etc., que van a ser distribuidos por los tejidos que si poseen reservorio van a almacenar este tipo de compuestos, luego ese quilomicrn permanente (mas pequeo), que a perdido parte de sus compuestos grasos va a entrar al hgado donde empieza la formacin de nuevas lipoprotenas que tienen la funcin de distribuir mas adecuadamente los cidos grasos y las vitaminas liposolubles. Las lipoprotenas LDL, VDL, HDL, son transformaciones de la lipoprotena inicial que es la VLDL, las vitaminas liposolubles tienen un metabolismo similar al de los cidos grasos.
Vitamina a o retinol:
La vitamina A tiene un precursor que se obtiene a travs de la dieta que son los carotenos. Los carotenos son de diferentes tipos alfa, beta y gama, los de mayor aporte nutricional son los betacarotenos porque son fciles de hidrolizar; estas molculas son precursores de compuestos derivados de terpenos e isoprenos. La vitamina A tiene un grupo isopreno y otros radicales, en la parte externa este grupo puede cambiar fcilmente y de acuerdo a como se cambie tendremos una forma diferente de esta vitamina, tenemos el retinol cuando tenemos la forma alcohlica de la vitamina, tenemos el retinal en la forma aldehdo y el acido retinoico si estamos frente a una forma acida. Todos estos compuestos van a tener una funcin diferente en el organismo. La vitamina A, en general con sus tres componentes son sensibles a la luz, al oxigeno y a los agentes oxidantes. En el intestino tenemos la desoxigenase de caroteno, que se encarga de romper las molculas de beta caroteno y a partir de esta obtener el retinol. Nutricionalmente a partir de 6 mg de beta carotenos obtenemos 1 mg de retinol. Estas sustancias retinoides tienen protenas receptoras que estn en el citoplasma o en la membrana nuclear para poder entrar a la clula y hacer su funcin. Hay receptores de superficie que son los que le permiten entrar al citoplasma como el TRB y el TRABP, que son protenas receptoras de retinol y receptores nucleares como el CAR y el CRX, receptores de retinal y acido retinoico, se necesita la comunicacin con estos receptores para que vayan hasta el ncleo e interfieran en los procesos de transduccin de las protenas para que aumenten o disminuyan la sntesis de alguna protena en particular, esta es la funcin que realizan en el organismo.
El 95% de la vitamina A esta almacenada en el hgado, pero tambin puede estar en el tejido adiposo, en el rin, en el pulmn en pequeas cantidades. Dentro de las funciones de esta vitamina tenemos que interfiere en la actividad que tiene la retina en el ojo, es esencial para el crecimiento y la diferenciacin de los tejidos epiteliales, interviene en el crecimiento de los huesos, en el proceso de reproduccin, en el desarrollo embrionario y tambin se ha visto asociada con el desarrollo de la funcin inmunolgica de algunos individuos.
El retinol es la molcula alcohlica que tiene la capacidad de transformarse en un retinil fosfato y esta sustancia es la precursora para la sntesis de glucoprotenas y de mucopolisacaridos. Las glucoprotenas hacen parte de la membrana celular e intervienen en el crecimiento y regulacin de la clula. Los mucopolisacaridos al igual que las glucoprotenas tienen que ver con la formacin de mocus para la proteccin de los diferentes tejidos (vaginal, respiratorio, conjuntivas etc.), en la deficiencia de la vitamina podemos ver afectados a todos estos tejidos que necesitan permanentemente la humedad, incluyendo a la piel, tambin se afecta la regulacin del crecimiento. El acido retinoico como su nombre lo indica es la forma acida de la vitamina, en la sangra esta el acido y se internaliza y requiere de receptores que son el TRB y el TRABP para poder ingresar al citosol, ya aqu se forma un complejo entre el acido y el receptor, y este complejo permite la entrada al ncleo de la protena, porque tiene tambin un receptor especifico en el ncleo como el CRX y el CAR que facilita su entrada, despus de estar en el ncleo se pega al ADN, normalmente a regiones reguladoras de los genes, libera una serie de protenas que llevan al bloqueo o inhibicin de la frecuencia reguladora, estimula la excrecin de otra protena que dependiendo la funcin del receptor va a bloquear o a aumentar la expresin de una protena para un gen, que casi siempre tiene relacin con la diferenciacin celular y con la funcin reproductiva, entonces va a atacar a vulos y a espermatozoides desde el momento de la diferenciacin. El retinal que es la forma aldehida tiene una relacin muy directa con la actividad de la retina, presenta una asociacin reversible con las protenas visuales que son: la oxina, y la rodoxina, actuan sobre los conos (permiten ver colores) y los bastones (ver en la oscuridad), en ambos hay tipos de oxinas particulares lgicamente pero el retinal exactamente el 11-cisretinal es el encargado de unirse con la oxina por un residuo de lisina para formar la rodoxina que la encargada de desencadenar el proceso visual. Esta formacin de la rodoxina ocurre en la penumbra. Cuando incide un rayo de luz ya sea en penumbra o en estado natural, esta rodoxina empieza un proceso de transformacin en el cual finalmente se libera la oxina y el compuesto ya metabolizado del 11 cisretinal, pasa por una laptorodoxina, por una metarodoxina en cuestin de segundos, y finalmente se librea la oxina pero el compuesto del retinal que obtenemos es un todo transretinal que es el encargado de abrir unos canales de calcio que son los encargados llevar el impulso nervioso al cerebro y recibir la informacin de la visin, este todo trasrretinol es reciclable se puede convertir nuevamente en el 11 cisretinal para seguir participando en el proceso de visualizacin . Tambin se puede dar que en un proceso igual al anterior se forme el todo trasrretinal que sale a la sangre y por accin de la retinol deshidrogenada por acciones de oxido reduccin se convierte en todo trasrretinol ( lo estamos alcoholizando), en el hgado por accin de una isomerasa se convierte el trasrretinol en cisrretinol, finalmente la misma retinol deshidrogenasa convierte el cisretinol en 11 cisretinal para estar disponible nuevamente para unirse con la oxina y formar la rodoxina y continuar con el ciclo. Estas molculas no se van a desgastar o alterar en el proceso sino que se pueden convertir y reutilizar.
Fuentes:
Betacarotenos: todos los alimentos como vegetales, verduras o frutas de color amarillo o anaranjado contienen fuentes altas de betacarotenos, como zanahoria, maz, durazno, tomate, inclusive los alimentos verdes como las legumbres, tambin tienen un nivel un nivel de betacarotenos aunque no tengan este color amarillo. En productos derivados de animales como la leche, la mantequilla, y la yema del huevo, aceite de hgado de peces que tambin son una buena fuente de esta vitamina. Requerimientos nutricionales en promedio por administracin 5000 (UI), unidades internacionales por da que equivalen a 1.5 mg por da, en el embarazo y la lactancia se requieren mayores dosis de esta vitamina. En sndromes de mal absorcin o en enfermedad heptica, no solo para la vitamina A sino para todas las vitaminas liposolubles, en los que no se pueden almacenar ni digerir adecuadamente estas vitaminas la administracin debe ser mayor.
Deficiencia de vitamina A: como esta vitamina acta en la produccin de mucopolisacaridos y de glucoprotenas si no hay vitamina A se puede presentar hiperqueratosis o resequedad en piel y mucosas, tambin llamada piel de gallina, como xeroftalmia y queratomalacia porque hay resequedad de la conjuntiva, inclusive hay unos momentos de la queratomalacia en los que hay calcificacin de la conjuntiva, formacin de un tejido queratinizado muy grueso. Relacionado con la actividad del retinal ser ceguera nocturna, no se puede apreciar el color verde inicialmente y luego o se pierde la capacidad de poder ver los colores o se produce la ceguera nocturna, susceptibilidad a infecciones si no hay proteccin adecuada del tracto respiratorio pues no tenemos ese mecanismo de defensa y seremos ms propensos a infecciones. Algunos lo asocian con anemia debido a que el acido retinoico (vitamina), aumenta la expresin de algunos genes tambin aumenta la expresin de la trasferna, cuando entra a la clula, al ncleo y trabaja sobre la expresin gentica, cuando hay deficiencia de la vitamina A habr deficiencia de la trasferna porque no se estar expresando la protena y as a la persona se le administren cantidades suficientes de hierro se va a presentar una anemia de tipo ferrfenico, que a diferencia de las otras anemias no mejora con la ingesta de hierro.
Toxicidad: cuando administramos dosis excesiva de estas vitaminas, superior a 15000 equivalentes de retinol, y generan dolor articular, crecimiento inadecuado de los huesos, puede generarse hepatomegalia, esplenomegalia, cada del cabello y dermatitis escamosa. Hiperqueratosis foliculares la que hay resequedad a nivel de codos y otras reas del cuerpo, que se caracteriza por piel de gallina. La anemia ferrfenica es una anemia de tipo microcitica hipocrmica donde los glbulos rojos son ms pequeos de lo normal y son bastante plidos, normalmente se controlara al administrar hierro, pero en este caso se controlara con la administracin de la vitamina. La xeroftalmia es una disminucin en la secrecin o la lubricacin del ojo que puede generar la formacin de grumos, tambin se puede presentar hiperqueratosis, la conjuntiva empieza a formar una capa de las protenas que se van queratinizadas, afectando la visin.
Vitamina d o complejo del calcitriol
El abastecimiento natural es sufriente, ya que el 90 % est dado por exposicin a la luz solar, por lo tanto no es necesario administrar suplementos de esta vitamina si tenemos una exposicin adecuada al sol. Podemos tener alimentos en los que obtengamos precursores de la vitamina D, pueden ser alimentos de origen animal donde el precursor es el 7 dehidrocolesterol o de origen vegetal donde el precursor es el ergosterol que no es un elemento fcil de digerir. Principalmente usamos el 7 dehidrocolesterol como suplemento de la dieta. La activacin de la 7 dehidrocolestero se da por accin directa de la luz sobre la piel, genera activacin del 7 DHC a una previtamina D, esta previtamina D requiere de un proceso de isomerizacion para que pueda ser el metabolito antiguo de esta vitamina D (vitamina D3), cuando pasa al hgado esta vitamina isomerizada se convierte en alfa 25 hidroxicolecalcitriol o alfa 25 hidroxicolecalciferol, y finalmente este es el metabolito que va a circular por la sangre, cuando llega al rin ocurre un fenmeno de Hidroxilacin y pasa a 1,25 hidroxicolecalciferol (HCC), que es la forma activa de la vitamina D, y es el que va a hacer todas las funciones fisiolgicas de la vitamina D.
La actividad de la vitamina D es similar a la de la vitamina A, ambas son consideradas ms hormonas que vitaminas por su forma de actuar. La vitamina D se pega a un receptor el cual permite que esta forma activa de la vitamina es decir la 1,25 atraviese la membrana y entre al citoplasma, habrn receptores en el membrana nuclear que permiten que esta vitamina llegue al ncleo vaya al ADN propiamente y genere la expresin algunas protenas, especialmente cuando hay un bloqueo, ya que la unin de la vitamina al ADN desplaza esos bloqueos permitiendo que la replicacin se d.
La vitamina D Interviene en el metabolismo o el mantenimiento de la homeostasis del calcio y del fsforo a nivel srico. El calcitriol o 1,25 despus de todo el proceso en el hgado y en el rin va a trabajar en dos puntos importantes: en el intestino y en el hueso. En el intestino va a aumentar la reabsorcin intestinal de calcio por medio de una protena que es la saltin D, que es la protena que est en el enterocito y se encarga de reabsorber todo el calcio que se encuentra en el tracto gastrointestinal y de esta manera el calcio y el fosfato irn al torrente sanguneo. A nivel del hueso por accin de la paratohormona u hormona paratiroidea, esta hormona en conjunto con el calcitriol hace que se pueda movilizar el calcio que est en el hueso hacia el torrente circulatorio y as mantener la disponibilidad de calcio y fosfato en el torrente sanguneo, ya que la actividad de muchas clulas es dependiente de canales de calcio, por lo tanto los niveles de calcio deben ser buenos para que haya un buen funcionamiento de las clulas que dependen de el. Entonces va a aumentar la sntesis de las protenas transportadoras del calcio desde el hueso hasta el torrente sanguneo. Otra forma de mantener esa homeostasis y controlarla es la reabsorcin tubular de calcio y as impedir que por el rin se pierdan o se excreten grandes cantidades de calcio. Estos son los mecanismos para mantener los niveles de calcio: Aumentar la reabsorcin de calcio de la dieta a travs del intestino. Sacar el calcio del hueso y llevarlo al torrente sanguneo Evitar la excrecin del calcio por el rin, aumentando la reabsorcin tubular. Ejemplos de cmo acta la hormona paratiroidea cuando hay niveles altos o bajos ya sea de vitamina D, o de calcio: Hay un bajo nivel de calcio srico: para que el calcio est disponible en el torrente sanguneo sin que lo est administrando hay que sacarlo del hueso, para esto tendramos a la vitamina D y a la hormona paratifoidea trabajando, se aumentara la reabsorcin de calcio por el intestino para coger el poco calcio que se est administrando, y el hueso sufrir las consecuencias porque todo el calcio lo obtendremos de el haciendo que se produzca una desmineralizacin del hueso. La vitamina D puede convertirse en la forma activa que es la 1, 25 HCC, o en la forma inactiva de la vitamina que es 24,25 HCC que no tiene actividad metablica, cuando deficiencia d calcio se necesita bastante vitamina D activa, por lo tanto hay que transformar a la vitamina D pasando por todo el proceso anterior, y actuara sobre el rin para que aumente la reabsorcin del calcio. Cuando tenemos niveles altos de calcio en el organismo: no se requiere de la actividad de la vitamina D, porque los niveles de calcio en el suero son altos, entonces la vitamina D pasa a su forma inactiva y servir de reserva para cuando sea necesaria y entra a jugar un papel importante la calcitonina, que es una protena que tiene la funcin de impedir el transporte o la eliminacin de calcio del hueso para llevarla al torrente sanguneo y aumenta la excrecin de calcio por la va renal para poder mantener esa homeostasis. Cuando hay niveles bajos de vitamina D y estamos en una situacin normal: la vitamina D no se est metabolizando y por lo tanto los niveles de calcio srico se ven disminuidos porque no habr reabsorcin del calcio intestinal y la hormona paratiroidea ser la encargada de que este calcio presente en los huesos vaya al torrente sanguneo, sin embargo no es suficiente ya que necesitan la activacin, y de hecho la hormona paratiroidea y la vitamina D trabajan en conjunto. Cuando tenemos exceso de vitamina D: cuando se vaya a sintetizar la vitamina se formara la mayora en parte inactiva, otra como parte activa que es la que va a trabajar a nivel del intestino llevando calcio al torrente sanguneo y a nivel del hueso ella es la encargada de la desmineralizacin del hueso, la paratohormona aqu casi no trabaja, tambin podemos ver que en un exceso de la vitamina habr mucho calcio en el torrente sanguneo y por lo tanto debemos aumentar la eliminacin o excrecin de calcio para mantener los niveles que es la forma de controlarlo, la calcitonina actuara en el rin para hacer que el calcio se elimine fcilmente. Hay otras clulas diferentes al intestino y diferentes al hueso que tienen receptores para vitamina D, una es la glndula paratiroidea que como ya vimos trabajan en conjunto, otros son los islotes pancreticos o clulas de langerhans, los queratinocitos en la piel y las clulas mieloides en la medula sea. Toda la lnea celular diferentes a linfocitos T y B, van teniendo recetores para la vitamina D. La vitamina D no solamente participara en el mantenimiento del equilibrio del calcio srico y el fosfato, tambin va a participar en la secrecin de insulina en los islotes pancreticos, en la sntesis y la excrecin de las hormonas tiroideas y paratiroideas, en la inhibicin de la sntesis de inmunoglobulinas y de los linfocitos y en la proliferacin y diferenciacin celular, inclusive puede estimular la formacin de la lnea mieloide a nivel sanguneo ya que entra la vitamina al ncleo y aumenta la expresin de algunas protenas y por lo tanto la expresin de un gen, esto hace que la clula la reconozca fcilmente o simplemente que active la produccin porque est trabajando a nivel del ADN. Tambin produce inhibicin de la sntesis de interleuquina que junto con los linfocitos T producen la sntesis de inmunoglobulinas.
Fuentes:
El 7 dehidrocolesterol lo vamos a encontrar en hgado, y vsceras peces, en la leche y la yema de huevo, en los vegetales encontramos el ergosterol pero realmente no lo aprovechamos ya que las grasas de origen vegetal tiene poca absorcin a nivel de nuestro intestino. Requerimientos: 7.5 microgramos por da que equivalen a unas 400 unidades internacionales por da (UI/da). La radiacin solar directa sobre la piel bsicamente es suficiente para generar la vitamina D que se necesita para el buen funcionamiento del organismo en el adulto. En los nios lgicamente la administracin debe ser muy cuidadosa, esta vitamina es proporcionada especialmente en la leche materna.
DEFICIENCIA: se debe mantener el equilibrio u homeostasis de calcio en el cuerpo entonces la hormona paratiroidea estar sacando calcio de los huesos porque ni siquiera por el intestino vamos a poder reabsorber esta cantidad de calcio, entonces se produce un debilitamiento de los huesos, en los nios se genera raquitismo por el debilitamiento de los huesos, es decir, la formacin del hueso es dbil, y en los adultos se produce la osteomalacia un debilitamiento en si del hueso, algo muy similar a la osteoporosis, solo que la osteoporosis est ms relacionada con fracturas, se presenta debilitamiento porque la hormona paratiroidea aumentara su actividad para compensar la deficiencia de calcio por la deficiencia de vitamina D. Cuando se administran corticosteroides a los pacientes esto tambin hace que los niveles de vitamina D disminuyan y pueden producir estas manifestaciones clnicas.
TOXICIDAD: la toxicidad de la vitamina se da cuando se administra en concentraciones mayores a 500 o 600 mg por kg da esto equivale ms o menos a unas 2000 UI/da, la diferencia entre los requerimientos normales y los excesos es muy grande, las manifestaciones clnicas que pueden presentar la calcificacin, sobre todo en los nios se puede presentar la calcinosis que es la calcificacin de los tejidos blandos como el hgado, rin pncreas, adems puede generar clculos renales en los pacientes debido al mismo aumento de calcio en la sangre, al aumento de la excrecin del calcio por va renal, inclusive se puede generar clculos de fosfato, ya que esta controlando los niveles tanto de calcio como de fosfato. Contradictoriamente tambin puede generar desmineralizacin sea, si hay mucha vitamina D fcilmente del hueso estar saliendo mucho calcio hacia el torrente sanguneo y la nica forma de controlarlos es excretando el calcio por orina. En pacientes con raquitismo podemos observar las alteraciones en la formacin sea o ms que todo el debilitamiento de los huesos. En adultos como ocurre un debilitamiento del tejido seo ya formado se presentan alteraciones seas, especialmente curvaturas a nivel de huesos largos por la gran flexibilidad que tienen por el debilitamiento de los huesos.
Vitamina e o tocoferol:
La vitamina A especialmente los betacarotenos tienen una gran actividad antioxidante junto con esta vitamina E y la vitamina C. La vitamina E y la vitamina K no han sido tan estudiadas como la vitamina A. Esta vitamina hace parte del grupo de los tocoferoles realmente son cuatro tocoferoles y cuatro tocotrienoles que hacen parte del grupo de las vitaminas, los tocoferoles son alfa, beta, gama, y delta, los tocotrienoles se diferencian de los tocoferoles porque presentan dobles enlaces es sus cadenas laterales. La funcin ms importante de la vitamina E es que tiene una gran actividad antioxidante. Protege a los lpidos tisulares de las molculas peroxidantes, es decir del ataque de los perxidos, los superoxidos y de los radicales libres. Los radicales libres como el oxigeno, el ion perxido, el ion superoxido, que hacen que las membranas celulares se rompan fcilmente generando una muerte celular ms temprana, entonces lo que est haciendo esta vitamina es evitar que estos iones perxidos acten sobre la membrana especialmente sobre la parte lipidica en los cidos poli insaturados de la membrana entonces lo que busca la vitamina es proteger la integridad de la membrana. Si los cidos grasos no se alteran estoy manteniendo la integridad e la estructura celular. Interviene en procesos de respiracin celular, esto se ha visto en experimentos pero no ha sido comprobado en seres humanos, interviene en el transporte de electrones en la mitocondria para facilitar la respiracin celular, facilita la sntesis de grupo hemo porque aumenta la sntesis de la alasintasa que es la precursora en la formacin del acido alfa amino levuliico, impide la oxidacin de la LDL, protena de baja densidad que es a la que se le atribuye en el torrente sanguneo la formacin de ateromas, cuando se oxida la LDL se precipita la LDL cae a la luz del vaso empieza a acumularse y a acumularse formando el ateroma. Si se impide la oxidacin de ella va a producir, disminucin de riesgo cardiaco, la encargada de realizar esta funcin es la alfatocoferol, la gamatocoferol est asociada con la inactivacin de mutageno electrofilicos liposolubles funcin que dentro de la celula la mayora los hace el glutatin, es una activacin o regulacin de los agentes sinobioticos de la clula, todos los agentes txicos que tengan una parte liposoluble pueden ser metabolizados por la accin oxidativa de la vitamina D. Los radicales libres son pequeas molculas producidas por todos los mecanismos metablicos que nosotros tenemos puede ser en la cadena respiratoria, a nivel mitocondrial, en el transporte de electrones a nivel microsomal, en las reacciones de oxidoreduccin que se presentan en todas las clulas, entonces todas las reacciones realizadas a nivel celular van a generar radicales libres iones perxido y superoxido que van a producir un dao a nivel celular, este dao se da a nivel de lpidos daando las membranas celulares, a nivel de protenas y a nivel del ADN, los dos mas importantes son a nivel de los lpidos y a nivel del ADN. Hay una formas de controlar la expresin de ciertos genes y la replicacin del ADN, cuando algunas bases nitrogenadas o algn nucletido esta metilado, y al metilarse no van a ser reconocidos por esas secuencias que van a ubicarse dentro del ADN para regular la replicacin, estos radicales pueden hacer en el ADN una desmetilacin de esta xitocina y pueden despejar reas que normalmente estaran inactivas para la transcripcin de los genes o para la replicacin del ADN, y al desmetilarlos o despejarlos va a hacer que esos genes sean activos haciendo que los genes puedan transcribirse, tambin pueden generar mutaciones en el ADN, que pueden generar la perdida en la expresin de las protenas o de los genes que produciendo daos o lesiones muy grandes a nivel de los cromosomas y tambin pueden generar rearreglos cromosmicos, los daos a nivel estructural de los cromosomas van a hacer que el funcionamiento del ADN se cambie esto va a hacer que se cambien o se pierdan algunas protenas que son codificadas por ese ADN. La vitamina E trata de controlar a los iones perxido y superoxido para que no sean tan reactivos y no vayan a daar la membrana celular.
Fuentes:
La vamos a encontrar en aceites especialmente los aceites de semillas, de trigo, nuez, aguacate, soya, girasol, en lcteos, huevos y en algunas carnes. Los requerimientos diarios son diferentes en hombres y mujeres y en los infantes los requerimientos diarios de vitamina E son de 5 UI por da, en los hombres de 10, y en las mujeres en estado de embarazo y lactancia es por lo menos de 22 unidades que corresponden ms o menos a 15 mg por da.
DEFICIENCIA: adems de su actividad oxidativa o de antioxidantes la vitamina E se ha relacionado con sistema nervioso central, si hay una buena actividad y si la vitamina est en buenas cantidades las membranas de las clulas neuronales van a mantener su integridad y van a ser ms estables, cuando hay deficiencia de la vitamina E van a presentarse alteraciones degenerativas, o neuropatas por ese mismo debilitamiento de la membrana, muerte temprana de los axones o de las clulas neuronales. La vitamina E es llamada la vitamina de la fertilidad, en animales de experimentacin la deficiencia de vitamina E, puede generar esterilidad incluso mal formaciones en el embrin. Esta deficiencia puede llegar a generar una distrofia muscular, debilidad, parlisis si las membranas musculares estn en constante oxidacin o atacadas por radicales libres ya que se estaran destruyendo las clulas. La anemia hemoltica tambin se ha visto involucrada porque la vitamina E est relacionada con el grupo hemo y la formacin del glbulo rojo, entonces en una deficiencia habr mala formacin de hemoglobina y en los recin nacidos una deficiencia puede generar una anemia de tipo hemoltico. TOXICIDAD: las cantidades que pueden generar toxicidad deben ser mayores a 1000 mg por da, debe ser muy alta la administracin de vitamina E, para que pueda generar toxicidad, no hay muchas alteraciones que se hayan visto, de pronto las hemorragias y esto puede ser porque la vitamina E trabaja con vitamina K, pero alteraciones tan graves como la de la vitamina A, o la de la vitamina D no se han encontrado. Si estamos hablando de sustancias antioxidante muchos le han atribuido la funcin de que la han utilizado para prevenir cncer inclusive el cncer pulmonar pero esto no se ha comprobad, muchas veces se hacen anlisis epidemiolgicos y no se ha observado que personas con algn tipo de cncer hayan presentado mejoras despus de la administracin de vitamina E, sin embargo no debemos desconocer que tiene una actividad antioxidante y que le brinda proteccin a la clula pero sobretodo al ADN, si no hubiera vitamina E, los radicales libres trabajaran a su gusto, si no existiera la vitamina C, ni vitamina E, ni betacarotenos, habran muchas mutaciones a nivel del ADN y esto podra generar cncer, pero de que sea reversible no se tienen datos. La vitamina E sinttica o farmacolgica tiene una mejor actividad que la vitamina E que nosotros sintetizamos en el cuerpo, ya que hay unos receptores que la mantiene o retienen por ms tiempo, la puede retener hasta 6 veces ms que lo que retienen a la vitamina sinttica.
Vitamina k o grupo de las naptoquinonas:
La vitamina k es otra vitamina muy importante, y tambin est formada por el grupo de las naptoquinonas, en general podemos decir que hay dos clases o dos fuentes de vitamina K naturales, La vitamina K1 que es la fitonanodiona o filoquinona que la podemos conocer as, es la proporcionada por la dieta y la vitamina K2 es la menaquinona tiene ms cadena lateral y es sintetizada por las bacterias en el tracto gastrointestinal y farmacolgicamente tenemos la menadiona que es en lo que se va a transformar esto al final y es como la forma activa de la vitamina K, esta vitamina tiene un papel fundamental en todo el mecanismo de la cascada de la coagulacin ya que la vitamina K es la encargada de la maduracin postraduccional, que quiere decir eso que despus de que la protena ha salido del ncleo y ha hecho toda la transformacin de la replicacin y a madurado el ARN mensajero y ya est la protena como tal, los factores de la coagulacin los vamos a encontrar en la sntesis como prefactores, es decir, como factores inactivos, lo que hace la vitamina K es activar esos factores o ayudar en la activacin de esos factores de la coagulacin, son bsicamente cuatro factores de la coagulacin en la que ella interviene, en el factor 2 o protombina que es en el que mas se ha estudiado su actividad, el factor 7 o proconvertina, el factor 9 o factor fishman , y el factor squash power o factor 10, en laq cascada estn todos en ese orden y unos activarn a los otros, esta activacin postraduccional se da por que ellos tienen en su estructura residuos de glutamato y para hacerse activos necesitan carboxilar eso residuos de glutamato y de esa manera hacer ms fcil la captacin de calcio por esa molcula. El glutamato, la vitamina K como interviene en ese proceso de carboxilacin del glutamato generando el grupo carboxilo a dnde viene el calcio a unirse fcilmente, y esa unin con el calcio permite a la protena por ejemplo en el caso de la pretrombina, si estaba como pretrombina al tener todo el mecanismo o esa carboxilacin con la protena K, al unirse el calcio esta pretrombina se va a pegar fcilmente a la membrana celular, en esta membrana celular es que estn las protenas que rompen e hidrolizan a esa pretrombina y la dejan convertida en trombina, esta trombina va y activa al siguiente factor de la cascada de coagulacin, desencadenando la cascada de la coagulacin. La cascada bsicamente tiene dos vas una va intrnseca y una va extrnseca, en la va extrnseca estn unos de los factores dependientes de calcio, la trombina, el factor 7 todos los que son dependientes de calcio, y en la intrnseca esta el factor 9. Ac tenemos un ejemplo viene la protrombina se convierte en trombina por esa carboxilacin y permite que el factor 5 actu, que el fibringeno que estaba en forma inactiva se active y ese fibringeno haga que el factor 12 una las molculas de fibrina donde haya lesin tisular o dao hemorrgico y se empiece a formar el coagulo de fibrosis. REQUERIMIENTOS: los requerimientos de vitamina K los podemos obtener en vegetales verdes como espinaca, coliflor, el salvado de muchos cereales como de arroz, trigo, en el tomate, pero bsicamente es suficiente con la sntesis intestinal que se hace de vitamina K. se requieren entre 60-80 microgramos por da.
DEFICIENCIA: cmo acta en la cascada de la coagulacin, lgicamente habrn defectos en la coagulacin, los pacientes tendrn hemorragias, tambin se ha visto que la vitamina K estimula la osteocalcina que es una protena que ms o menos comprende entre un 25 y 40% de la protena no colagenasa que tiene el hueso, si est favoreciendo la formacin de esta protena y hay una deficiencia puede producir osteoporosis. Por intoxicacin con vitamina K, no hay manifestaciones muy grandes por toxicidad, hay aumento en la sudoracin de los pacientes, puede haber enrojecimiento de ciertas reas, pero nada grave. Inclusive altas dosis de esta vitamina son utilizadas en intoxicacin con anticoagulantes como la fumarol, la vitamina entrara a realizar el tratamiento porque aumentara la formacin del trombo, gracias a la activacin de la cascada de coagulacin se formara el coagulo de fibrina. A un recin nacido si se le debe administrar vitamina K, porque no podemos dejarle toda la tarea a la flora intestinal, mientras el nio fortalece su flora intestinal debemos administrarla. Todas las vitaminas liposolubles bsicamente no necesitamos requerimiento adicional si tenemos una dieta balanceada como verduras, aceites naturales como el de girasol, no se puede exceder en su administracin porque pueden producir toxicidad en el organismo. Si se requiere de una administracin exgena en pacientes que tengan mal absorcin, es decir problemas intestinales y tambin debemos administrarlas en pacientes con daos hepticos ya que el hgado es el mayor reservorio de vitaminas.
Antes de comenzar a hablar de bioenergtica es importante definir algunos trminos; ustedes saben que el estudio de la energa es una de las grandes proezas del hombre; energa: capacidad de realizar un trabajo, esa necesidad de entender la energa dio cabida a que surgiera una ciencia destinada al estudio de las formas de energa, y de las formas como esa energa se poda intercambiar y transformar en trabajo, esta ciencia se conoce como termodinmica, entonces termodinmica es la parte de la fisicoqumica (en nuestro caso) que se encarga de el estudio de las leyes y los principios que rigen el tratado de la energa, tenemos muchos tipos de energa, cintica elctrica nuclear, y esos diferentes tipos de energa en el caso de los humanos pueden realizar tres tipos de trabajo:
Trabajo Mecnico. Trabajo Qumico. Trabajo Osmtica.
El trabajo mecnico ya lo conocemos bien, es por ejemplo el movimiento muscular, el movimiento de flagelos, el movimiento de las vacuolas dentro de la clula; el trabajo qumico es la sntesis de nuevas molculas, un ejemplo es la sntesis de aminocidos no esenciales, la sntesis de carbohidratos es un trabajo qumico, incluso la conversin de energa, recuerden que la energa es posible intercambiar en energa elctrica en energa qumica, o energa elctrica en energa trmica, entonces es posible hacer el intercambio, entonces, una parte de ese trabajo qumico es convertir la energa que nosotros obtenemos de los alimentos en forma de equivalentes reductores convertirlos en enlaces de alta energa como el ATP que es el objetivo final de la chchara; el trabajo osmtico es el que hacemos nosotros cuando mantenemos concentraciones de electrolitos contra gradiente en un compartimiento celular, por ejemplo el potasio dentro de la clula, o el sodio por fuera de la clula, o cuando facilitamos que la glucosa entre a la clula a travs de transportadores dependientes de sodio (SGLTU) por ejemplo.
Bioenergtica: es la parte de la termodinmica que se dedica al estudio de los postulados de la energa en los seres vivos.
Sistema: un sistema es lo que usted quiera estudiar desde el punto de vista bioenergtico, si usted quiere estudiar una clula, pues su sistema va a ser la clula, si usted quiere estudiar un cultivo celular en una caja de petri, su sistema es el cultivo celular en la caja de petri, si usted quiere estudiar el hombre, su sistema va a ser el hombre. Alrededor del sistema encontramos un entorno.
Entorno: es lo que est en directo contacto con el sistema. La asociacin entre el sistema y el entorno lo conocemos como Universo. Podemos hablar de tres tipos de sistemas:
1-Sistema Aislado: no hace intercambio ni de materia ni de energa con el entorno.
2-Sistema Cerrado: es aquel que intercambia energa pero no materia con el entorno.
3-Sistema Abierto: intercambia tanto energa como materia con el entorno.
Todos los principios que rigen la termodinmica se basan en condiciones ideales, es decir son aplicables a sistemas cerrados y a sistemas aislados, no se aplican a sistemas abiertos de manera estricta, nosotros somos un sistema abierto, los sistemas vivos son sistemas abiertos; luego las reglas de la termodinmica se van a aplicar a los seres vivos con cierta restriccin; adicional a eso, todas aquellas normas que rigen a la bioenergtica van a depender del estado en el que yo tenga mi sistema, no es lo mismo aplicar las reglas de la termodinmica a una materia en estado solid, que aplicrselas a una que est en estado liquido o en estado gaseoso, entonces hay que tener en cuenta el estado en el cual se encuentra nuestro sistema.
Lo otro que hay que tener claro es el Flujo de la energa, esto ya ustedes lo conocen muy bien, existen dos tipos de seres los Auttrofos y los Hetertrofos, los Auttrofos son lo que pueden obtener el carbono directamente del CO2, y obtienen su energa de la luz solar, entre ellos estn muchas de las plantas, estos auttrofos toman el carbono y sintetizan molculas mas grandes como carbohidratos, glucosa, aminocidos, que nosotros utilizamos, o como almidn o como cidos grasos, entonces toda esa energa que captan del sol, ellos las depositan en esas macromolculas; los seres Hetertrofos obtienen sus nutrientes de los auttrofos, sea que le robamos a las plantas los carbohidratos, los aminocidos, los cidos grasos y los utilizamos para nuestro diario vivir; y esa energa que se tomo ac del sol que ahora est en las clulas hetertrofas en macromolculas es una energa que nosotros vamos a utilizar para realizar un trabajo, un trabajo que puede ser celular o puede ser sobre el medio sobre el entorno, entonces podemos encontrar cualquiera de esos dos tipos, trabajo celular o trabajo sobre el entorno.
Para explicar cmo obtienen las clulas hetertrofas la energa de las molculas que le fueron robadas a las auttrofas vamos a hablar de dos tipos de metabolismo:
Metabolismo Aerbico u Oxigenico: es aquel que realizamos en presencia de oxigeno, por va oxidativa vamos a obtener la energa, la mayora de nuestras clulas son de este tipo, hay algunas clulas que son aerbicas estrictas, por ejemplo el encfalo es aerbico estricto, es decir no puede hacer metabolismo si no es por esa va, por la va aerbica. Metabolismo Anaerbico: se realiza en ausencia de oxigeno, entonces hay encontramos muchas bacterias bsicamente, muchas de estas bacterias viven en nuestro intestino.
Existe un algunos tipos de seres que pueden utilizar la va aerbica o la va anaerbica, entonces los llamamos Aerbicos Facultativos, pueden obtener energa usando oxigeno o en ausencia de oxigeno, nosotros tambin tenemos clulas que son aerbicas facultativas, el msculo por ejemplo es una clula aerbica facultativa, si usted tiene suficiente oxigeno la clula muscular puede obtener energa a partir de la glucosa o de los cidos grasos por va aerbica, pero si lo hace en ausencia de oxigeno, un trote fuerte en un periodo corto entonces podemos hacerlo por va anaerbica, y entonces el producto final no va a ser CO2 y agua sino que va a ser acido lctico, y ese producir el acido lctico va a limitar el tiempo en que yo pueda usar esa ruta, porque va a disminuir el pH celular y eso va a reducir la capacidad enzimtica; hay clulas que son anaerbicas estrictas, el eritrocito por ejemplo obtiene la energa por va anaerbica, entonces a pesar de ser la clula quizs la ms rica en oxigeno, no utiliza el oxigeno para obtener energa, entonces lo hace por va anaerbica.
Tipos de vas metablicas: Anabolismo. Catabolismo.
Una va es catablica cuando cogemos una molcula y la degradamos en molculas ms sencillas, por ejemplo cuando cogemos una protena y la degradamos en aminocidos, es una va catablica, o cuando cogemos el glicgeno y lo desarmamos en molculas de glucosa, eso es una va catablica.
En una va anablica, usted coge las molculas pequeas y producen macromolculas, cogemos nucletidos por ejemplo y sintetizamos cidos nuclicos DNA, RNA, cogemos aminocidos y sintetizamos protenas.
Generalmente las vas anablicas consumen energa, son vas que necesitan aporte energtico, mientras que las vas catablicas generalmente producen energa; hay unas rutas que vamos a conocer como Rutas Anfibolicas, que pueden estar en un proceso anablico y al mismo tiempo estar en un proceso catablico, un ejemplo tpico de esto es el ciclo de Krebs, en el ciclo de Krebs usted puede coger acetil CoA y degradarlo completamente para producir CO2 y obtener energa, pero tambin a partir del ciclo de Krebs usted puede coger oxal acetato o alfa ceto glutarato y hacer sntesis de aminocidos, entonces esa ruta que est metida dentro de un proceso catablico y al mismo tiempo pueda hacer parte de un proceso anablico lo conocemos como ruta anfibolica.
Entonces el flujo de energa va en este sentido, los organismos auttrofos obtienen la energa de la luz solar, producen alimentos que los almacenan, y estos alimentos que almacenan nosotros los cogemos y les hacemos catabolismo, para obtener energa de ellos, y esa energa luego nosotros la utilizamos en vas anablicas, vamos a sintetizar biomolculas, hacer trabajo celular que puede ser mecnico, qumico u osmtico o puede ser un trabajo sobre el entorno, entonces la idea es ver cmo hacemos este cuento, ver como las vas catablicas que llamamos exergnicos liberan energa, se acoplan a las vas anablicas que decamos que eran endergnicos y que tomaban energa, y aqu est bsicamente el ciclo de la materia, de las clulas auttrofas hacia las clulas hetertrofas, y una vez las clulas hetertrofas las utilizan simplemente liberan esa materia para devolverla a las clulas auttrofas, entonces vamos a tener flujo de energa y flujo de materia y por eso vamos a ser sistemas abiertos.
Leyes de la Termodinmica
Primera Ley de la Termodinmica La energa no se destruye ni se fabrica, sino que permanece constante, solamente se transforma; la energa no se crea ni se destruye, solo se transforma. Y entonces cuando nosotros queremos aplicar esta regla a los seres vivos vamos a tener que definir lo que es la Energa Interna (U), la energa total de un sistema que nosotros queramos estudiar, es igual a la energa cintica mas la energa potencial mas la energa interna, ya sabemos que es energa cintica, y que es energa potencial, lo que necesitamos es saber que es energa interna, la Energa Interna es la energa propia de una molcula, debido bsicamente a sus electrones, a sus movimientos de rotacin, de traslacin, vibracin que tiene esa molcula, generalmente no incluimos dentro de esa forma de energa interna a la energa nuclear, porque esa energa nuclear la estudia otra parte de la termodinmica, que es la parte de la energa termonuclear, entonces casi nunca la incluimos. Entonces nosotros como seres vivos digamos que estamos como en reposo, pues nuestra clula no tiene un movimiento, entonces para ella no existe la energa cintica ni la energa potencial, entonces toda la energa total va a ser igual al la energa interna que tenga la molcula, toda la energa de un sistema va a ser igual a la energa interna; entonces vamos a investigar la energa interna de una molcula como la glucosa, averiguar cul es la energa interna de una molcula es complicado, pues si yo quiero coger una molcula y fijarme en ella, donde est la energa interna y como la puedo medir me voy a meter en un li, lo ms sencillo que podemos hacer es mirar cmo cambia esa energa en un proceso, entonces la termodinmica lo que hace es fijarse en cual es el estado inicial de un sistema, y cul es el estado final de ese sistema, y mirar cual es la diferencia de energa entre ese estado inicial y ese estado final, entonces la diferencia de energa entre ese estado final y el estado inicial es lo que me interesa a m, si yo cojo glucosa y la oxido, a m lo que me interesa saber es cuanta energa se obtuvo de esa oxidacin de la glucosa, no tiene mucha importancia saber cunta energa puedo obtener de la glucosa o que tan energtica es la glucosa, a m lo que me interesa saber es en un proceso cuanta energa puedo obtener yo de esa glucosa, entonces yo me puedo encontrar con dos tipos de proceso, aquellos que absorben energa y aquellos que aportan energa, independiente de cul sea la ruta que ustedes sigan para llegar a este estado final la energa va a ser la misma en el proceso, si usted sube desde el primer piso hasta el cuarto piso, y sube por una escalera sin descanso hasta el cuarto piso, la cantidad de energa que usted gasto hay es igual a que usted subiera un piso y descansara, subiera otro piso y descansara, subiera otro piso y descansara, subiera otro piso y descansara, la energa es la misma; nos agotamos es porque no tenemos tanta energa para subir de una sola vez, pero la cantidad de energa que gastamos es la misma; entonces el mismo principio se da aqu, independiente de la ruta que escoja para obtener un proceso, la cantidad de energa es la misma, si usted escoge glucosa y la lleva de un solo golpe a CO2 y agua, va a tener la misma energa que si usted tuviera la glucosa, la desarmara primero como lo hacemos nosotros, en gliceraldehido 3 fosfato, luego a acetil CoA y despus a CO2 y agua, gastara la misma energa que si usted cogiera la glucosa y la desarmara de un solo chochazo a CO2 y agua, producira la misma energa, eso es un principio muy importante de la termodinmica.
Como puedo saber la energa interna de una molcula?, entonces me puedo aprovechar de una herramienta que se llama el calormetro adiabtico, este calormetro adiabtico no es ms que un recipiente sellado, es una caja de metal hermticamente sellada con dos orificios, por uno de ellos yo le voy a inyectar oxigeno, aqu tiene una plaquita de metal y por este huequito le voy a colocar dos cables all a este bichito, esto esta hermticamente cerrado. En qu consiste, usted coge un gramo de la molcula que quiera glucosa, cidos grasos, el que usted quiera y lo coloca aqu adentro, y esto est sumergido en un bao de agua, y por aqu le colocamos un termmetro, y por aqu le colocamos un agitador, entonces, colocamos un gramo de glucosa o de lo que ustedes quieran en el calormetro adiabtico y lo sumergimos, y prendemos el agitador, y esperamos que se equilibre la temperatura, que todo tenga la misma temperatura, aqu est el termmetro registrando esa temperatura, y luego por ese cablecito le colocamos la chispa y producimos la combustin del gramo de molcula que tenemos hay, y esta combustin me va a liberar calor y ese calor va a pasar aqu al bao serolgico, y ese cambio de temperatura me lo va a registrar el termmetro, entonces de esa forma puedo yo saber cunta energa interna tiene una molcula, entonces eso es lo que est en el matacho aquel, oxigeno, acido palmitito (que es un acido graso de 16 carbonos), le colocamos la electricidad, hace combustin, se aumenta la temperatura, y registramos ese cambio de temperatura que hay, que podemos decir, si sabemos que la energa interna es igual al calor que produce, menos el trabajo que va a hacer el sistema sobre el entorno, y ese trabajo lo podemos definir nosotros en el caso de hacer una combustin como un cambio de presin y un cambio de volumen; entonces podemos decir que el cambio de energa interna en este proceso, recuerden que estamos hablando de un estado inicial y un estado final, el cambio de energa interna va a ser igual al calor menos la presin por el cambio de volumen, si yo pongo como en este caso el volumen constante, este factor desaparece, entonces yo puedo decir que el cambio de energa interna va a ser igual al calor que se produce, entonces miren que utilizando esa regla matemtica que est muy simple, yo puedo saber cunta energa me produce cualquier molcula, de esa forma hemos averiguado cuanta energa interna tiene la glucosa, el acido palmitito y los diferentes aminocidos; entonces aqu est la misma historia, un estado final, un estado inicial y puede haber un cambio de energa que puede ser que necesite de energa para que ocurra o que libere energa, nuevamente el cambio de energa entre un estado inicial y un estado final es independiente de la ruta que yo coja, me puedo ir por donde yo quiera, siempre voy a obtener la misma energa.
En equilibrio no hay flujo de energa, nosotros lo que buscamos es estar en desequilibrio energtico, la lucha de la vida es por el desequilibrio y no por el equilibrio, en el momento en que nosotros alcancemos un equilibrio energtico con el entorno y con el universo nos morimos, alcanzar el equilibrio es muerte celular, tiene que haber un desequilibrio energtico entre la clula y el entorno y todo lo que hacemos es prcticamente luchar por ese equilibrio. Si el sistema me libera energa aqu en el primer postulado, decimos que es un sistema exotrmico, se est liberando energa en forma de calor; si necesita energa decimos que es endotrmico.
En nuestro organismo los procesos se llevan a presin constante, y las variaciones de volumen son muy escasas, entonces miren que el cambio del calor es igual al cambio de energa interna mas el trabajo, cambio de presin por el cambio de volumen, cuando yo hablo de un cambio de calor a presin constante lo voy a definir como la Entalpa y lo voy a identificar con una H, entonces cambio calrico a presin constante es entalpa y se representa con H; entonces la entalpa va a ser igual al cambio de energa interna mas la presin por el cambio de volumen, pero como decimos que la presin es constante podemos decir que la entalpa va a ser igual al cambio de energa interna, como decimos que en nuestras clulas la presin es constante, podemos decir que la entalpa es igual al cambio de energa interna; entonces hemos llegado al primer postulado de la termodinmica, de este postulado hay varias cosas que son importantes; aqu est el calor de combustin de algunas molculas, por ejemplo glucosa me produce 669.6 kilocaloras por mol, o 3.72 kilocaloras por gramo, si consideramos una calora como 4.185 julios, energa, yo puedo hacer paso de julios a caloras de caloras a ergos, como yo quiera; triacil gliceroles me estn produciendo 7510 Kcalorias por mol, 9.3 kcal por gramo y la glicina 3.2; miren que de los elementos que tienen mayor calor de combustin son los triacilgliceroles, son una fuente de energa muy grande, lo sabemos y lo entendemos, por eso los almacenamos, lo que pasa es que algunas veces almacenamos muchos triacil gliceroles, pero es una fuente de energa muy grandota, este es el calor de combustin de esas molculas y este es el calor de formacin 304 kilocal por mol, 93.67, 68.8.
Si usted para producir un mol de glucosa necesita 669.6 kilo caloras, cuando hace la combustin de la glucosa debe obtener la misma cantidad de energa, una cosa es que yo obtenga la misma cantidad de energa, y otra cosa es que toda la energa salga de la misma forma, es posible que cuando yo haga medicin de la energa no me d lo mismo porque hay parte de esa energa que se ha disipado, pero si yo las tuviera en condiciones ideales y pudiera medir toda la energa que se libera, tendra que ser igual, la cantidad de calor que se necesita para hacer una sntesis(eso se llama calor de formacin) debe ser igual al calor que se obtiene cuando se hace combustin o se degrada ese elemento (eso se llama calor de combustin). Este seor Hiss llego a tener postulados como este que les acabo de contar, que uno deba tener en cuenta solo el estado inicial y el estado final, las partes intermedias no deban tenerse en cuenta por lo que les contaba, independiente de que usted lo haga en dos o tres o cuatro pasos la combustin de una molcula, la cantidad de energa que obtiene es la misma, que si lo hiciera de un solo chochazo, va a ser la misma; lo otro que l dice es que si yo quiero saber cunto calor de formacin tengo para una molcula, yo puedo fraccionar las reacciones, y mirar, y despus sumar cada una de las fracciones de esa formacin, me explico, si yo quiero saber cunto calor de formacin tiene la glucosa, y s que se forma a partir de CO2 y agua, yo puedo coger y buscar cuanto calor de formacin tiene el CO2, cuanto calor de formacin tiene el agua y al sumar esto me tiene que dar igual al calor de formacin de la glucosa, entonces yo puedo fraccionar la reaccin, mirar el calor de formacin de cada uno de los compuestos que debe sintetizar el elemento grande, en este caso la glucosa y sumando estos calores de formacin de cada uno de estos elementos yo puedo hallar el calor de formacin de la molcula mas grande, eso ha facilitado mucho el estudio de la bioenergtica; a veces es difcil mirar cuanta energa consumo yo para formar una molcula de acido araquidonico, que es un acido de 20 carbonos con tres instauraciones, pero si puedo saber cunto consumo yo para producir molculas ms pequeas, cidos ms cortos y luego asociarlos y con ello obtener la energa total de formacin de una de esas molculas; entonces las tres condiciones importantes de ac son: el cambio de energa es lo mismo sin importar como se d; el calor de combustin debe ser igual al calor de formacin; la suma de los calores de formacin de cada uno de los sustratos debe ser igual al calor de formacin de la macromolcula, en este caso digamos la glucosa, pero el calor no es para nosotros til, hay una frmula que dice que el trabajo que se pueda hacer a punta de calor es igual a q por T2 menos T1 sobre T2, entonces lo que yo necesito para producir trabajo a partir de calor es tener una diferencia de temperatura entre los dos entornos, entre los dos sistemas, entonces hay una parte que debe ser muy caliente y una parte que debe ser muy fra, entonces cuando mas haya diferencia de temperatura, mas calor se puede convertir en trabajo, entonces yo lo que tengo es temperatura de uno de los medios, temperatura del otro, y entre mayor sea la diferencia mucho mejor, si este T1 fuera cero absoluto, todo el calor se convertira en trabajo, pero eso sera una condicin ideal; que sucede en nuestro organismo, somos isotrmicos, la diferencia de temperatura entre un sistema y otro es muy poca, luego no podemos usar el calor como energa para producir trabajo, no es posible usar el calor para producir trabajo.
Segunda ley de la termodinmica:
Todos los procesos espontneos se dan en el sentido que en se incrementa el desorden del universo, como premisa la Entropa que es la forma cmo vamos a hablar del desorden en bioenergtica, siempre debe ir en aumento, en el universo la entropa debe ir en aumento, todos los procesos espontneos ocurren con incremento del desorden; entonces por ejemplo si yo quiero hacer una combustin de glucosa que es el matacho que tengo hay con oxigeno, miren que hay arranco de siete molculas y el desorden se aumenta por que ahora son doce molculas, entonces hay muchas ms molculas dando vueltas, muchas ms posibilidades de choque, de que dos molculas se encuentren, si usted coge una protena y la desarma va a tener mucho aminocidos, con eso aumento la entropa, si usted coge glicgeno y lo desarma va a tener muchsimas molculas de glucosa, aumento la entropa, entonces podemos decir que el catabolismo implica aumento de la entropa, en el catabolismo hacemos aumento de la entropa, mientras que en el anabolismo no, usted coge una molcula de 1200 aminocidos y lo asocia arma una sola protena, una molcula muy organizada, la entropa disminuyo, cogi 600 molculas de glucosa y lo volvi almidn una molcula muy organizada, la entropa disminuyo, recuerden lo que deca al comienzo el catabolismo generalmente significa liberacin de energa y el anabolismo significa aplicar energa, es un proceso endergnicos, necesita energa, entonces si decimos que el catabolismo incrementa la entropa y a la vez estamos diciendo que el catabolismo produce energa, podramos pensar que el aumento de entropa siempre va a ir ligado con la liberacin de energa, el aumento de la entropa siempre ligado con una liberacin de energa y esas reacciones son espontneas, cuando hay liberacin de energa son espontneas, al contrario, el anabolismo disminucin de la entropa, consumo de la energa, ningn proceso se puede realizar de modo que la energa del universo disminuya, pero recuerden que el universo es la asociacin del sistema y el entorno, si usted hace que la entropa en el sistema disminuya, el del entorno tiene que aumentar tanto para compensar esa disminucin en el sistema de tal forma que la suma total signifique un aumento de esa entropa, la entropa la vamos a identificar con una S. PARTE DOS
Recuento:
Ayer nos quedamos viendo las leyes de la termodinmica, de la bioenergtica que aplicbamos a los sistemas biolgicos, hablamos de la primera ley de la termodinmica, que deca que la energa se conservaba, ni se crea ni se destruye, sino que se transforma y revisbamos el concepto de entalpa, como el cambio de energa en forma de calor que observbamos en un proceso, entonces importante que recuerden que lo que estamos evaluando es el proceso en si, es decir, la diferencia del cambio que hay desde el estado inicial hasta el estado final, independiente de por donde lleguemos nosotros a ese estado final, es importante recordar eso; y el hecho de los diferentes estadios intermedios que yo pueda tener, en ese proceso, las diferencias de energa entre esos estadios intermedios pueden ser aditivos, como son aditivos los podemos sumar; la segunda ley de la termodinmica que revisamos ayer hablaba de que todos los procesos espontneos ocurren siempre que la entalpa aumente, siempre que haya un incremento de la entalpa, todos los procesos espontneos ocurren en una direccin en que se incrementa el desorden del universo o la entropa, entonces bajo este concepto lo que nos va a decir la segunda ley de la termodinmica es cul es la direccin del proceso, nos va a hablar cual es la direccin del proceso, hacia a donde esta favorecida una reaccin, la primera ley nos dice cuanta energa puedo obtener yo de un proceso o una reaccin; la segunda ley me determina en qu sentido ocurre la reaccin, cual es el sentido en que se encuentra favorecida esa reaccin, entonces veamos el ejemplo de la glucosa, cuando oxidbamos la glucosa que producamos muchas molculas de CO2 y agua, aqu hay muchas ms molculas luego se incrementa la entropa, y el sentido de la reaccin ser favorecido hacia all (ver diapositiva 10), hacia la oxidacin de la glucosa; ningn proceso se puede realizar mientras la entropa del universo disminuya, miren que todo lo que busca la entropa es alcanzar un estado de equilibrio, un estado menos energtico, cuando alcancemos el equilibrio, cuando ya la entropa no aumente y haya equilibrio termina el flujo energtico, va a terminar el flujo energtico, en ese momento decimos que en los sistemas biolgicos hay muerte, se alcanzo el equilibrio y hay muerte, miren que la premisa habla de la entropa del universo, no de la entropa de un sistema, yo puedo disminuir la entropa del sistema, pero esta disminucin de la entropa del sistema debe ir acompaado de un aumento en la entropa del entorno, de tal forma que la entropa del universo no disminuya, aumente. Generalmente aquellos procesos que significan disminucin de la entropa en un sistema van a necesitar energa, son procesos endergnicos, necesitan energa, necesito aplicarles energa; un proceso exergnicos al contrario ser aquel que me libera energa, los procesos que indican aumento de la entropa son irreversibles, aqu hay dos cosas a las que les tengo que poner cuidado, esto de espontneo se refiere a que ocurre en un sentido, mas no se refiere a la velocidad de la reaccin, nosotros aqu no revisamos velocidad de reaccin, revisamos sentido de la reaccin, entonces lo espontneo se refiere a que se favorece en este sentido, es posible que sea rpida, o es posible que sea muy lenta pero va a ser favorecida en un sentido. Si usted colocara en este recipiente el CO2 y el agua, difcilmente volvera a tener las molculas iniciales, entonces a eso se refiere la entropa, la segunda ley de la termodinmica lo que me va a hablar es del sentido de la reaccin, en qu direccin va el proceso.
Energa Libre de Gibbs:
Necesito una expresin que me relacione entropa y entalpa, y entonces este seor Gibbs se puso en la tareta de hacer unos clculos matemticos y llego a esta frmula, donde dice que el cambio de energa que se observa en una reaccin va a ser igual al cambio de la entalpa menos la temperatura por el cambio de la entropa, entonces lo tenemos all en esta reaccin, ecuacin: G = H - TS; el cambio de la energa libre va a ser igual al cambio de la entalpa menos la temperatura por el cambio de la entropa, hablamos de energa libre como aquella energa de la que disponemos para realizar un trabajo, con la que podemos hacer un trabajo. Cuando nosotros hacemos un proceso en la clula, cuando por ejemplo cogemos la glucosa y la oxidamos, o cuando cogemos un acido graso y lo oxidamos, durante el proceso obtenemos cierta cantidad de energa por ejemplo 9.5 kilocaloras, a partir de un acido graso, pero si usted cogiera y le diera las condiciones al CO2 y al agua quisiera volverse acido graso se dara cuenta que para volver a sintetizar el acido graso usted necesita ms de esas 9.5 kilocaloras, ya que parte de esa energa se pierde durante el proceso, se va a perder en forma de calor, hay una pequea parte de la energa que se va a perder en forma de calor, entonces miren que la premisa de esta historia es que nosotros no podemos tomar el cambio de la entalpa como la energa que yo puedo usar para hacer un trabajo, por lo mismo, porque hay perdida de energa durante el proceso, entonces de ah de esa premisa surge la energa libre de Gibbs, tengo que mirar cmo cambia la entalpa y compararlo con el cambio de la entropa, esas dos relaciones me dan la energa que un proceso me aporta para hacer un trabajo, un trabajo biolgico, ya vimos que poda ser qumico, osmtico o mecnico; para que un proceso sea espontneo, para que se de en el sentido en que se propone necesito que la energa libre de Gibbs sea negativa, voy a necesitar que esa energa libre sea negativa; entonces miren que para yo obtener esta energa libre negativa si tengo esos dos procesos, voy a necesitar, o bien que la entropa aumente mucho, o bien que el cambio de la entalpa sea bajo, de tal forma que el resultado del desarrollo de esta frmula me d un exponente con signo negativo, entonces aqu tenemos varias posibilidades, aqu tenemos un ejemplo: Esto es hielo, agua a diferentes temperaturas, si yo coloco el hielo a menos 10 grados centgrados y lo quiero pasar a agua, miren que la entalpa aumenta, entonces, esto lo que me est diciendo, es que convertir hielo a agua a bajas temperaturas no es un proceso favorable (ver diapositiva 11), no se favorece, miremos que la entropa tambin aumenta, pero ac a menos 10 grados centgrados la entropa es baja, aqu a mas diez grados centgrados la entropa es alta; entonces ac a -10 tenemos una entalpa baja y una entropa baja, la energa libre va a ser positiva, luego el proceso no es espontneo; mientras que si nosotros nos fijamos aqu a +10 C, la entalpa es alta y la entropa tambin, entonces miren que en este caso que la entropa es mucho ms alta que la entalpa el delta de G va a ser negativo, bajo esas circunstancias el proceso es espontneo, entonces lo que me va a decir a m la energa libre de Gibbs es si el proceso ocurre de manera espontnea o necesita energa para que suceda; Si el G es negativo yo puedo afirmar:
Que el proceso es espontneo. Que ocurre en el sentido que se est proponiendo la reaccin. Es un proceso exergnicos, me est liberando energa.
Entonces son esas tres las premisas que yo puedo sacar de un G negativo.
Nosotros tenemos muchos procesos en que la entropa disminuye, por ejemplo cuando hacemos sntesis de protenas, o cuando hacemos sntesis de glicgeno, o cuando hacemos sntesis de cidos nuclicos, la entropa disminuye, pero si yo tengo una disminucin de la entropa, si la entropa es menor, la entalpa tiene que ser mas grande, eso significa que yo necesito aplicarle energa a los procesos en los cuales la entropa disminuye; entonces aqu tenemos un jueguito de cambios de entalpa, cambios de entropa a temperaturas bajas y a temperaturas altas (ver diapositiva 11, cuadro amarillo inferior derecho), Cuando los dos son positivos, el G es positivo a temperaturas bajas, no es favorecido, mientras que a temperaturas altas es negativo y se favorece, deltas ambos positivos, y el mismo jueguito podra hacer con todos, entalpa positivo, entropa negativo, bajas temperaturas, el G es positivo no se favorece, altas temperaturas G positivo, tampoco se favorece, entonces este cuadrito hace referencia bsicamente a este matacho, entonces la energa libre de Gibbs lo que me permite a mi es relacionar, entropa y entalpa, y con base a esas dos expresiones termodinmicas o bioenergticas poder obtener la energa libre de Gibbs, que es la que en ultimas me va a determinar la capacidad que tiene esa reaccin o ese proceso, de aportarme energa para realizar un trabajo, a eso se refiere, entonces miremos aqu varios matachos, varias probabilidades (ver diapositiva 12); entalpa disminuye, entropa disminuye, las dos son negativas, la energa libre tambin va a ser negativa, el proceso se da espontneamente, entalpa negativa, entropa es positiva, pero es tan grande la entalpa que favorece la reaccin, el G es negativo, entalpa aumenta, entropa disminuye, la energa libre sigue siendo negativa, la reaccin se puede dar de manera espontnea, entonces para que una reaccin sea espontnea yo no necesito que los dos tengan signo negativo, necesito que cuando yo aplique la formula de la energa libre siempre vaya a obtener una energa libre negativa, en ese momento puedo saber que la reaccin es espontnea, exergnicos, ocurre en el sentido que la proponga.
Relacin entropa, energa libre y el medio:
Si nosotros observamos el matacho completito de lo que es el universo, el sistema y el entorno(Diapositiva 13) sabemos que la entropa en el universo siempre tiene que aumentar, mientras estemos vivos la energa debe ir aumentando, eso implica que en el entorno la entropa puede aumentar, disminuir o quedar constante, de que depende, de la entropa del sistema, si el sistema aumenta la entropa el entorno puede quedar constante, aumentar o disminuir, pero la disminucin debe ser en menor escala que el aumento de la entropa en el sistema, si la entropa en el sistema disminuye, la nica que le queda al entorno es aumentarla, tiene que aumentar la entropa, para que el universo tenga un aumento neto de la entropa, si la entropa en el sistema es constante, en el entorno deber aumentar tambin, para que el universo tenga un aumento de la entropa, eso no lo dice el segundo principio de la termodinmica, el primer principio de la termodinmica deca que la energa era constante, y como estamos en un sistema abierto la energa debe fluir entre el entorno y el sistema, entonces si la energa en el sistema aumenta, en el entorno tendr que disminuir, en la misma proporcin, si la energa en el sistema disminuye en el entorno aumenta en la misma proporcin siguiendo la primera ley de la termodinmica. Este matachito es para recordarnos que hay un intercambio de calor entre el sistema y el entorno que hace que muchos procesos se vuelvan irreversibles, que nosotros no podamos revertir algunas de las cosas que ocurren en nuestro sistema, en nuestro medio.
Energa libre y constante de equilibrio La energa libre de Gibbs tambin est relacionada con la constante de equilibrio de una reaccin, estos dos matachitos que tenemos aqu, esto se llama energa libre estndar de Gibbs, cuando tiene estos dos bichitos aqu, energa libre estndar de Gibbs; estos dos bichitos lo que estn significando es que estamos calculando la energa libre cuando la temperatura es de 25, cuando la concentracin de los reactivos esta uno molar, es decir cuando los productos y los reactivos estn uno molar, y el pH es de 7, en estos momentos hablamos de energa libre estndar de Gibbs, debo cumplir estas tres condiciones. Entonces miren que esta frmula me va a relacionar la energa libre estndar de Gibbs con la constante de equilibrio, y ya sabemos que la constante de equilibrio la calculamos de acuerdo con la concentracin de los sustratos y la concentracin de los productos; vamos a tener dos constantes que es R y T , pero en ultimas lo que me est diciendo esta ecuacin es que si yo vario la constante de equilibrio de una reaccin, la energa libre de Gibbs tambin va a modificarse, si yo cambio la constante de equilibrio de una reaccin la energa de Gibbs se modifica, y yo puedo cambiar la constante de equilibrio modificando o la concentracin de sustratos o la concentracin de productos, eso tiene importancia para cuando hablemos de la capacidad energtica del ATP, resulta que el ATP en la clula no esta en concentraciones constantes, va variando, entonces la capacidad de producir energa en un tipo de clula va a ser diferente a la capacidad de producir energa en otros; entonces con esta formula yo puedo relacionar, constante de equilibrio y energa libre de Gibbs
Go = - RT LnKeq
Entonces miremos un ejemplo, glucosa 1 fosfato para convertirse en glucosa 6- fosfato, si usted coloca 0.2 moles de glucosa 1- fosfato aqu, el equilibrio se alcanza cuando tengamos glucosa 6 fosfato 0.19 y glucosa 1 fosfato 0.1, constante de equilibrio, 19, es decir que la reaccin se desplaza en ese sentido, si yo aplico la ecuacin de la energa libre estndar de Gibbs yo encuentro que la ecuacin de la energa libre estndar es de menos 1745 caloras por mol, esta negativa, entonces me est afirmando que la reaccin est ocurriendo en el sentido que esta propuesta de glucosa 1 fosfato a glucosa 6 fosfato; si yo aumentara la concentracin de glucosa 1 fosfato, la constante de equilibrio disminuira, y entonces esa disminucin en la constante de equilibrio va a tener un efecto sobre el G, seguramente el G sera ms negativo, por que el equilibrio tendera a ser este, entonces esto me permite a mi relacionar, G y constante de equilibrio; miren aqu esta, constante de equilibrio > que uno, G negativo, el proceso ocurre en el sentido que se propone; constante de equilibrio 1, G cero, estamos en equilibrio, aqu no hay produccin de energa neta, puede ocurrir en un sentido o en el otro, en esos momentos en los que yo hablo de una reaccin en equilibrio se refiere a que los cambios energticos son muy pequeos, y entonces si yo aumento la concentracin de algunas de las molculas del sistema, la reaccin se podra desplazar en el sentido contrario, podra yo jugar con la concentracin de los sistemas, por ejemplo supongamos que esta constante de equilibrio fuera muy cercana a uno, el G cercano a cero, si yo le echara glucosa 6 fosfato a la reaccin, y esto fuera cercano a cero, la reaccin facilito se vendra en este sentido, o si yo le echara glucosa 1 fosfato, facilito se ira en aquel sentido; diferente a si usted le coloca una constante de equilibrio mayor que uno, con un G negativo, en ese momento si usted le echa y hay disponibilidad de glucosa 1 fosfato la reaccin se va en ese sentido sin pensarlo, pero si usted le echara glucosa 6 fosfato para que la reaccin se devolviera, usted necesitara aplicarle energa, no se va a dar en el sentido contrario, es irreversible la reaccin, si el Ked es menor que uno la reaccin es positiva, entonces ocurre hacia all, pero necesita energa para ocurrir, y lo ms fcil sera que se viniera en el sentido contrario; entonces miren toda la informacin que se puede sacar del G, todo lo que me puede decir un G; porque es tan fundamental el G, o entender que significa el G, porque es que en la regulacin de los procesos metablicos se da bsicamente en aquellas reacciones que son irreversibles, que tienen un G negativo y bastante grande, que son exergnicos, que liberan energa; son las reacciones ms fciles de regular; por ejemplo en el caso de la gluclisis usted va a encontrar ms o menos unas 20 reacciones, de esas 20 reacciones hay una que es el paso de la fructosa 6 fosfato a fructosa 1-6 difosfato, que es catalizada por una enzima, la fosfofructoquinasa 1, esa reaccin es bastante endergnicos, necesita mucha energa, entonces esos momentos donde hay un cambio de energa bastante grande, positivo o negativo son los que ms fcilmente yo puedo regular, entonces toda la regulacin de la gluclisis se hace sobre esa reaccin, la fosfofructoquinasa 1, el paso de fructosa 6 fosfato a fructosa 1 -6 difosfato, escogemos esa reaccin, no escogemos las que son reversibles por que nos pueden alterar el equilibrio, nos pueden modificar la regulacin, el mecanismo regulatorio, ejemplos de reacciones, piruvato a acetil CoA, la ultima reaccin de la gluclisis, cuando usted va por gluclisis aerbica coge el piruvato y lo convierte en acetil CoA, y hace dos cosas hay fundamentalmente, lo mete a la mitocondria, el piruvato forma acetil CoA, por un lado, y por otro lado lo convierte en un sustrato fcil de oxidar en el ciclo de Krebs, miren el G de la reaccin, menos 33.4 Kilo julios mol, me est diciendo que la reaccin ocurre en este sentido, que es exergnicos, donde va la energa, en estos equivalentes reductores, en los NAD reducidos, hay me estoy llevando la energa del proceso, aqu es donde va la energa y estos NAD, nosotros cogemos esos NAD reducidos y los convertimos en ATP en la mitocondria, pero entonces esto lo que me est diciendo es que la reaccin sea bsicamente en este sentido, y miren la implicacin que tiene el G de esta reaccin, hay un proceso contrario a la gluclisis que es la gluconeognesis, en la gluconeognesis nosotros tenemos que coger sustratos diferentes a los carbohidratos y convertirlo en glucosa, y resulta que unos de los depsitos ms grandes que tenemos nosotros de sustratos energticos son los cidos grasos, los cidos grasos abundan en nuestro organismo, y sera muy fcil coger cidos grasos que se degraden y convertirlos en acetil CoA y devolverme en la gluconeognesis, la gluconeognesis no es otra cosa que la gluclisis en reversa, coge piruvato lo convierte en fosfoenol piruvato, el fosfoenol piruvato lo vuelve gliceraldehido 3 fosfato, el gliceraldehido 3 fosfato en fructosa, la fructosa en glucosa, logramos nuevamente la glucosa, pero este G tan grande y tan negativo hace que sea casi imposible para la clula convertir la acetil coA en piruvato, entonces eso limita el que yo pueda coger los cidos grasos y utilizarlos como sustrato para sintetizar glucosa, los cidos grasos no me aportan glucosa, en cambio la glucosa si me aporta grandes cantidades de cidos grasos. Una reaccin del ciclo de Krebs, el paso de succinato a fumarato, un G de cero, la reaccin se puede dar tanto en este sentido, como en este sentido, de que depende que ocurra en uno o en otro sentido, de las concentraciones de succinato o fumarato, de eso depende, y este intercambio, de hacer posible la interconversin de succinato en fumarato y de fumarato en succinato tiene un papel clave en el metabolismo tambin, nosotros cuando hacemos degradacin del amoniaco en el ciclo de la urea producimos grandes cantidades de fumarato, necesitamos reciclar ese fumarato, necesitamos que ese fumarato se vuelva a convertir en aspartato, la nica forma de convertir el fumarato en aspartato es coger el fumarato convertirlo en succinato, el succinato volverlo alfa ceto glutarato, y el alfa ceto glutarato sacarlo nuevamente como aspartato, entonces miren que usamos Las reacciones que tienen miren un G que estn en equilibrio como reacciones anaplerticas es decir reacciones de relleno que permiten hacer interconversin de metabolitos, anaplerticas, que son las reacciones de relleno, yo saco un sustrato para sintetizar algo y tengo que llenar el huequito que deje de extraer ese sustrato del ciclo, como en este caso el succinato, entonces la reaccin anaplerticas se podra convertir en fumarato en succinato. Otra reaccin del ciclo de Krebs malato oxalacetato G bastante positivo, 29.7 kilojulios mol, significa que la reaccin no ocurre en este sentido sino que tiende a ocurrir en el sentido contrario al que se propone, que es una reaccin endergnicos, que necesita energa para que ocurra, esta reaccin lo que permite en realidad en el ciclo de Krebs es regular las concentraciones de citrato, el citrato se convierte en isocitrato, y el isocitrato se convierte en malato, cuando el citrato se aumenta es un indicador de buena condicin energtica en la clula, entonces cuando uno tiene mucho citrato en la clula muchos procesos que producen energa se inhiben, acurdense de la premisa de que somos zapatoqueos desde el punto de vista energtico, no vamos a producir energa que no necesitemos, aqu tienen ustedes varias reacciones, hay varios ejemplos ah estn los G en kilojulios, en kilocaloras, de muchas reacciones que tienen que ver con el metabolismo, pero no nos vamos a detener mucho a ver esos procesos, miren eso es lo que les deca, a pH 7 a una temperatura de 25 centgrados y a una concentracin de uno molar hablamos de la energa libre estndar de Gibbs; ahora bien, hemos visto reacciones que son exergnicos o que tienen un G una energa libre estndar negativa, muy negativa, y tambin tenemos las otras reacciones que son endergnicos que tienen un G bastante positivo, eso implicara que podra haber en nuestro organismo algunos tipos de reacciones que desde el punto de vista fisiolgico no podran ocurrir, la nica forma que ocurriese una reaccin endergnicos sin aporte de energa, seria modificando la constante de equilibrio, modificando las concentraciones de los sustratos o de los productos, cosa que nosotros no podemos hacer en nuestro organismo a esas magnitudes, modificar un G con base en alterar las concentraciones de sustratos y productos significa aumentar uno de ellos en una magnitud muy grande 100 o 200 veces, eso no lo hacemos nosotros, no lo podemos hacer; entonces a que recurrimos, recurrimos a acoplar reacciones, a hacer reacciones acopladas, eso de reacciones acopladas es, pues que si yo tengo una reaccin que me libera energa, que es exergnicos, la voy a acoplar a una reaccin que necesite energa, que sea endergnicos, de tal forma que la energa que libera una la pueda utilizar otra para llevar a cabo el proceso, y eso es ms o menos lo que nos explica este matacho (diapositiva 24), esta primera reaccin implica realizar un trabajo, un trabajo qumico, por ejemplo la sntesis de una protena, un trabajo mecnico o un trabajo osmtico, eso de realizar ese trabajo me significa gastar energa, necesito energa para hacerlo, para poderlo realizar recurro a un proceso exergnicos, que me libere la energa, entonces necesito que esa energa se libere en ese proceso exergnicos, y de alguna manera yo acoplo esta energa que se libera aqu de este proceso, la acoplo y la llevo a este proceso endergnicos para poder realizarlo de manera adecuada.
Respuesta a una pregunta de un estudiante: no, no, no, es que el sentido de esta reaccin el G bueno si es un error del matacho, el sentido de esta reaccin es hacia ac, est mal escrita hay, el G negativo debera ser hacia all.
Bueno entonces estamos acoplando reacciones, entonces mire que la conversin de glucosa a glucosa 6 fosfato es una reaccin que requiere energa, es una reaccin bastante endergnicos, miren que necesitamos mucha energa, entonces de donde obtenemos esa energa, de la hidrlisis del ATP, hidrolizamos un ATP, el ATP me libera grandes cantidades de energa, y esa energa que yo necesito aqu la acoplo con esta otra reaccin, con la conversin de glucosa en glucosa 6 fosfato y entonces voy a obtener una reaccin acoplada, glucosa + ATP me va a producir glucosa 6 fosfato + ADP, y me va a quedar un poquitico de energa, que me va a decir que el sentido de la reaccin se va a dar hacia ac, un G negativo muy pequeo, ms pequeo que el del ATP, entonces ese es el mecanismo de acople de reacciones; en nuestro organismo hay todos los ejemplos que ustedes quieran de reacciones acopladas; todos los procesos anablicos, se acuerdan que lo veamos en un matacho, estn acoplados a procesos catablicos; la degradacin de glucosa a CO2 y H2O me produce un ATP, y ese ATP lo utilizo yo para sintetizar protenas, un ejemplo fisiolgico muy aplicado en nosotros, cuando usted hace un ayuno prolongado, usted necesita hacer un proceso anablico, es el nico proceso anablico que quizs hacemos nosotros en estado de ayuno, y es sintetizar glucosa, necesitamos sintetizar glucosa, por la ruta esa que les contaba ahorita que era la gluconeognesis, esa gluconeognesis es un proceso bastante endergnicos, necesita energa, pero nosotros en ayuno tambin estamos necesitando grandes cantidades de energa, entonces a que recurrimos, a oxidar metabolitos que sean muy energticos, de tal forma que me puedan aportar energa para la gluconeognesis, y me puedan aportar energa para el organismo, para el trabajo celular, que hacemos, oxidamos cidos grasos, los cidos grasos oxidados, una oxidacin de glucosa aporta 36 ATP, mientras que la oxidacin de un acido graso general, el acido palmtico, que es de 16 carbonos me aporta 129 ATP, entonces el acido graso es muchsimo ms energtico que la glucosa, entonces lo que hacemos es oxidar glucosa, obtener energa, y el hgado esa energa la utiliza para hacer la sntesis de glicgeno; entonces eso es un mecanismo acoplado que nosotros tenemos en condiciones de ayuno.
Respuesta a una pregunta de un estudiante: usted me preguntas es que si yo no le aporto energa a esta reaccin, que hay, pues claro se queda ah, no avanza, necesito el ATP, que es el que me est dando hay trabajo qumico.
Respuesta a otra pregunta: nos estamos adelantando un poco, el intermediario energtico, que nosotros mas usamos es el ATP por varias razones, una de esas razones es que tiene mucha capacidad de energa, tiene tres enlaces fosfato, y ahorita vamos a mirarlo en detalle, la segunda razn es que la mayora de las enzimas, recuerden que las enzimas son estreo especificas, trabajan con ATP.
Entonces en este caso la enzima que hace el paso de glucosa a glucosa 6 fosfato, que es la Hexoquinasa, es especfica para el ATP, no trabaja con ADP; nosotros lo que hacemos es un jueguito mucho ms bonito, si usted tiene mucho ADP y necesita ATP, entonces cogemos el ADP, lo convertimos en AMP, y ese fosfato se lo pega a otro ADP y lo convierte en ATP, pero no trabajamos con ADP. Entonces miren, hay ay una reaccin acoplada, que vamos a hacer, bueno y de paso vamos a echar la historia de los cidos grasos; aqu lo que vamos a hacer nosotros es bsicamente coger un acido graso, y empezar a activarlo, vamos a activar el acido graso; entonces miren que hacemos, tenemos un acido graso aqu, y le vamos a pegar un fosfato, la reaccin que ocurre aqu est en el equilibrio es decir yo podra tener la Acil CoA, y la Acil CoA convertirse fcilmente en acido graso libre, es una reaccin que est en equilibrio, lo que yo necesito, es ponerle sentido a esa reaccin, hacer que la reaccin ocurra en un solo sentido, entonces que hago, cojo al acido graso y lo pongo a reaccionar con un ATP, miren que aqu le pegue un fosfato, de paso lo que estoy haciendo con este acido graso es activarlo, nosotros para poder utilizar las molculas desde el punto de vista metablico necesitamos activarlas, marcarlas como molculas adecuadas para usarse, la glucosa la marcamos pegndole un fosfato, al acido graso lo marcamos pegndole una coenzima A, entonces para poderle pegar la coenzima A necesitamos energa, esa energa me la aporta la hidrlisis de este enlace fosfato, se rompe este enlace Ester y esa energa es la que me permite hacer el acople de la coenzima A al acido graso, peo si yo tuviese esto acil CoA, librecito en altas concentraciones, se podra devolver y producir nuevamente adenilato del acido graso, y este podra liberarse y convertirse nuevamente en acido graso, que me garantiza que la reaccin ocurra en este sentido, este pirofosfato que tengo aqu, la hidrlisis del pirofosfato es una reaccin bastante exergnicos, entonces esa hidrlisis para yo poder devolver el pirofosfato y devolverme en la reaccin, necesitara aplicarle muchsima energa a la reaccin, energa que estoy consumiendo aqu, y energa que estoy aplicando para establecer este enlace, entonces esa necesidad, ese sentido del pirofosfato, me est, primero direccionando la reaccin, y segundo el ATP me est aportando energa para poder hacer la sntesis del acido graso, para poder activar el acido graso, entonces es un ejemplo de una reaccin acoplada que nos dio papaya para hablar de la activacin de los metabolitos.
Bueno esto de la catlisis enzimtico bsicamente es recordar lo que ya hemos dicho muchas veces que los procesos enzimticos no afectan el equilibrio de la reaccin, la energa libre estndar de una reaccin no catalizada, es igual a la energa libre estndar de una reaccin catalizada, lo que cambio es la velocidad, pero en bioenergtica no nos interesa la velocidad de la reaccin, eso nos interesaba en enzimologa.
Bueno ahora nosotros necesitamos seguir la historia con el acoplamiento de las reacciones, como una reaccin endergnicos obtiene energa de una reaccin exergnicos, quien se encarga de aportar esa energa, como la aporta; entonces tenemos aqu al actor principal de esa historia que es el ATP, esta es una molcula de ATP, que es un ATP, es un nucletido, inicialmente podemos definirlo como un nucletido trifosfato, un nucletido es la asociacin de una base nitrogenada con un azcar y un fosfato, uno o varios fosfatos; en este caso tenemos los tres, tenemos una base nitrogenada que es la adenina, pero hay que recordar que tenemos varias clases de bases nitrogenadas, estn las purinas y las pirimidinas, entre las purinas encontramos adenina y guanina, y entre las pirimidinas tenemos citosina timina y uracilo; entonces aqu tenemos, adenina, azcar ribosa, siempre vamos a encontrar la ribosa aqu, y miren los fosfatos pegaditos, lo especial que tiene este ATP, observen que al final tenemos tres fosfatos unidos por enlaces tipo Ester, y miren que en este espacio tan pequeito tengo cuatro cargas negativas muy cerca, estas cuatro cargas negativas acurdense que van a tratar de separarse, recuerden que hay repulsin entre ellos, van a tender a separarse, entonces ellas estn unidas hay pero al mismo tiempo estn haciendo fuerza para ver como se desprende el uno del otro, eso le va a dar energa al enlace; cuando usted rompa ese primer enlace, libera mucha tensin, y esa tensin se ve reflejada en energa libre, entonces eso es un comienzo; lo segundo que es muy importante, es que el ATP tiende a formar complejos con el magnesio, y cuando forma complejos con el magnesio la tensin va a disminuir, entonces el ATP va a estar menos tenso; en nuestro organismo nosotros tenemos magnesio, entonces la capacidad del ATP de aportar energa va a depender tambin de la concentracin de magnesio que all en la clula, y ustedes van a observar que generalmente las quinasas (recordemos que las quinasas son transferasas de grupo fosfato), estas quinasas son enzimas que tienen como coenzima al magnesio, ya que siempre va a ir pegadito al lado del ATP ese magnesio; entonces miren que yo puedo tener al magnesio formando complejo con el ATP o con el ADP, con uno o con el otro. De donde viene la energa del ATP, entonces echbamos la historia que de que esta molcula tena cuatro enlaces, cuatro cargas negativas en muy poco espacio en muy poco espacio, entonces eso va a causar una gran tensin en el ATP, todas tratan de desprenderse, y cuando usted rompe el primer enlace se libera muchsima de esa tensin y se va a liberar muchsima de esa energa, entonces ese es el primer paso que tenemos, entonces ese fosfato inorgnico que se desprende en el primer enlace tiene varios estadios, miren que puede estabilizarse por resonancia, y hay cuatro formas diferentes, yo puedo colocar el doble enlace aqu, el doble enlace aqu, o el doble enlace aqu, son diferentes formas del fosfato inorgnico, entonces cuando yo tengo muchsimas formas de una molcula estoy aumentando la entropa, y si aumento la entropa estoy favoreciendo la reaccin, entonces como favorezco la reaccin y hay gran tensin, se libera muchsima energa de ese ATP, me va a liberar gran cantidad de energa, 7,3 kilocaloras por mol me libera la hidrlisis del ATP. Pero no solo el ATP me libera esa energa, cuando yo hago hidrlisis y libero pirofosfatos y dejo una molcula de AMP, la cantidad de energa que se libera es un poco mayor, que cuando hago hidrlisis del primer enlace; bueno echemos la historia completa, miren que ustedes van a encontrar en nomenclatura tres ubicaciones del fosfato, fosfato alfa, fosfato beta y fosfato gama, entonces uno a veces encuentra que los nucletidos se asocian entre si a travs del fosfato alfa, entonces se desprenden estos dos y se pegan por ellos, que la energa la aporto el fosfato gama, entonces la va aportando este, o que la asociacin se dio a travs del fosfato beta entonces me estn hablando de este; entonces como nomenclatura vamos a reconocer alfa, beta y gama; entonces les deca, romper el primer enlace, este enlace Ester me libera gran cantidad de energa, lo que libero yo hay es, un fosfato inorgnico, que se estabiliza por resonancia aumentando la entropa; pero si yo rompo aqu, como lo hicimos en la reaccin anterior del acido graso, lo que voy a liberar es un pirofosfato y un AMP, la ruptura de este pirofosfato, recuerden que despus hacemos hidrlisis y liberamos energa de ese pirofosfato que rompemos, hablbamos de 19 kilojulios mol, entonces yo rompo aqu y puedo liberar la energa que hay entre estos dos y luego liberar la energa que hay entre estos dos; eso hace que la hidrlisis del ADP, la hidrlisis del pirofosfato sea mucho mas energtica que liberar ATP, eso me aporta ms o menos 10.5 kilocaloras por mol, pero en definitiva toda la molcula es bastante energtica; le deca ahorita a su compaera que el ATP se identifica como la moneda energtica de la clula, por dos razones:
1. Tiene gran cantidad de energa depositada. 2. La mayora de las enzimas que necesitan energa utilizan el ATP, tienen estreo especificidad por el ATP, entonces nosotros casi toda la energa la convertimos en ATP.
En los libros ustedes van a encontrar que los enlaces fosfodister, son enlaces de alta energa, pero hablar de eso de enlaces de alta energa no es correcto, porque no es el enlace el que tiene la energa, si yo rompo el enlace se libera energa, pero no es porque el enlace en si tuviera energa, si no por las caractersticas de la molcula, entonces no hablemos de enlaces de alta energa, hablemos mejor de fosfatos de alta energa, entonces hablamos de estos fosfatos del ATP.
Como sabemos que la capacidad de producir energa de un proceso est ligado a la constante de equilibrio, volvemos a la historia de que la energa que yo puedo obtener del ATP va a depender de la concentraciones que yo tengo de ADP y ATP que hayan en la clula, entonces miren que todas las clulas no tienen las mismas concentraciones de ATP y de ADP, van a variar, en el hepatocito, el miocito tiene gran cantidad de ATP, luego va a tener mayor capacidad de obtener energa del ATP, mientras que el eritrocito tiene muy bajas concentraciones de ATP, entonces la capacidad de obtener energa a partir del ATP, entonces va a ser menor, en el hgado de la rata tambin va a ser poco, y esto ni lo miremos que es una bacteria, entonces la diferencia es que la capacidad de obtener energa en las clulas a partir del ATP no es la misma, porque depende, primero de la disponibilidad de ATP y de AMP que hayan en la clula y segundo de la concentracin de magnesio, por que decamos que el magnesio tambin tena efecto sobre la capacidad energtica.
Hay otros compuestos de alta energa adems del ATP que tambin sirven de intermediarios, uno de ellos es este, el fosfoenol piruvato, es la penltima reaccin de la gluclisis, lo hace una enzima que se llama piruvato quinasa, fosfoenol piruvato se debe convertir en piruvato, es una reaccin bastante exergnicos miren 61.9 kilojulios mol, es bastante exergnicos, hay hidrlisis del fosfoenol piruvato, puede estar en dos formas dependiendo de la posicin del hidrogeno que es lo que llamamos Tautomerizacin, en una forma enlica o en una forma ceto; eso que hace, nuevamente como tenemos dos posibilidades la entropa aumenta, entonces ese aumento de la entropa, de fosfoenol piruvato a piruvato, hace que sea bastante exergnicos la reaccin -61.9 kilojulios mol, y vuelve y juega el cuento que les echaba antes, esta reaccin con esa capacidad exergnicos tan alta es una reaccin regulatoria de la gluclisis, la piruvato quinasa es una enzima regulatoria de la gluclisis, es inhibida por los cidos grasos de manera alostrica, por que con ese G tan alto garantizamos que sea irreversible; otra molcula que es bastante energtica, la fosfocreatina, la fosfocreatina es una molcula muy abundante en el msculo, cumple un papel fundamental en el encfalo como aportante energtico, esta reaccin es catalizada por la creatin quinasa, entonces es una fuente de energa rpida del msculo, entonces les echaba la historia de aquellas necesidades energticas que tenamos rapidito, en aquellas circunstancias que de repente tenamos que pegar un trote fuerte de cinco o seis metros, y esa energa que nosotros necesitamos para ese trote fuerte, esa energa necesitamos obtenerla de alguna va metablica, como es una actividad fuerte de corto tiempo la obtenemos de la gluclisis anaerbica, pero para hacer glucolisis anaerbica tengo que movilizar glucosa, para hacer que la glucosa le llegue al msculo, mientras la glucosa llega al msculo y se inicia la gluclisis para obtener energa, hay un lapso de tiempo en el que el msculo debera estar sin energa, entonces nos tocara esperar a que se prendiera el circuito para poder pegar el trote, cosa que no hacemos, si a usted le pegan un susto usted no se queda esperando a que se le active la gluclisis para salir corriendo, usted sale corriendo y mira a ver si la gluclisis se activo o no se activo, eso sucede porque tenemos la fosfocreatina hay, la fosfocreatina arranca dando energa de manera instantnea, y esa energa que da la fosfocreatina entonces me cubre el pedacito en que arranco yo con las vas metablicas, con la gluclisis anaerbica; nuevamente en ese caso cuando yo hago hidrlisis de la fosfocreatina, libero creatina, que se estabiliza por resonancia, voy a tener doce formas de creatina, estabilizadas por resonancia, eso que hace, que se aumente la entropa, y si aumento la entropa, acurdense que la entropa esta en el segundo componente de la energa libre de Gibbs, -T por S, si yo aumento la entropa el signo negativo se dispara, entonces eso hace que la reaccin se vuelva bastante exergnicos, tanto as que para poderla hacer reversible necesito aplicar muchsimo ATP, pero lo hacemos porque necesitamos las reservas energticas; y el otro es este, 1-3 difosfoglicerato, nuevamente hacemos hidrlisis y obtenemos el 3 fosfoglicerato, y el tres fosfoglicerato se estabiliza por resonancia, hay resonancia, puedo tener dos formas del tres fosfoglicerato, de nuevo, el aumento de la entropa dispara la energa libre, hace que la energa libre sea muy negativa, y la reaccin se vuelve bastante exergnicos, esta reaccin del 1-3 difosfoglicerato a 3 fosfoglicerato es una reaccin de la gluclisis, pero extraamente esta reaccin no es regulatoria, esta reaccin no regula la gluclisis a pesar de tener un G bastante grande no es regulatoria, incluso es reversible, siempre y cuando usted tenga suficiente ATP se puede devolver hacia all; entonces eso era lo que les deca, la gluconeognesis que es el paso contrario, que es devolvernos durante este proceso, es un proceso bastante endergnicos, necesito meterle bastante ATP a esta reaccin, y se devuelve, hay ocurre algo especial. A diferencia de esta reaccin que es bastante exergnicos y que no es regulatoria, esta que les contaba ahorita, que es la de la piruvato deshidrogenasa, miren que es menos exergo nica, pero esta si es regulatoria, la ventaja de esta reaccin o el problema de esta reaccin desde ese punto es la carboxilacin, el hecho de que yo tenga que pegar un carbono a la acetil CoA, obliga que cuando yo me quiera regresar a la reaccin, no solo tengo que aplicarle energa, sino que tengo que aplicarle carbonos, entonces tengo que recurrir a dos reacciones, una catalizada por la piruvato carboxilasa y otra catalizada por la piruvato carboxiquinasa, para poder convertir el piruvato en fosfoenol piruvato.
Hay otras sustancias que son bastante energticas como la acetil CoA, es bastante energtica pero es por estos enlaces tiosteres, nuevamente estos enlaces tiosteres, apenas los rompemos, el Ester se estabiliza a travs de resonancia, entonces esa estabilizacin a travs de resonancia de los enlaces tiosteres hace que la entropa aumente, y si aumento la energa nuevamente la capacidad energtica de la clula se dispara, entonces vamos a tener una reaccin con mucha energa.
Tambin tenemos por aqu los enlaces fosfato de alta energa, hay ay bastantes, el 1-3 difosfoglicerato, el ATP convirtindose en ADP me aporta 7.3, el ATP convirtindose a AMP, fosfato inorgnico me aporta 10.9, porque yo hidrolizo este fosfato inorgnico y me produce ms energa, mientras que el ADP convirtindose en AMP y fosfato inorgnico es un poco menos energtico 7.8, lo que pasa es que esta reaccin es muy poco favorecida por que hay muy pocas enzimas que puedan hidrolizar el ADP, entonces lo que les deca en ves de la clula coger el ADP y convertirla en AMP y fosfato inorgnico, lo que hace en una reaccin enzimtico es degradar el ADP en AMP y fosfato, y este fosfato inorgnico agregrselo a otro ADP para convertirlo en ATP, hacer la reaccin contraria; y tenemos otras reacciones que son menos energticas, mire, glucosa 1 fosfato, fructosa 6 fosfato, glucosa 6 fosfato, acetil CoA, lo que yo quiero que miren en este matacho es que yo tengo un espectro grande de fosfatos de alta energa, hay unas que vamos a identificar con poca capacidad de transferencia de fosfatos, y otras que se identifican con una alta capacidad de transferencia de fosfatos, entonces aquellas que tienen poca capacidad de transferencia de fosfatos lo que hace fundamentalmente es recibir energa, no aportan energa, reciben energa, mientras aquellas que tienen un alta capacidad de transferencia de fosfatos son molculas que fcilmente aportan energa, entonces volvemos a la historia que tenamos antes, tengo que tener un acople energtico, reacciones endergnicos tomando energa de reacciones exergnicos, las reacciones exergnicos entonces van a tener molculas con alta capacidad de aportar fosfatos, una capacidad grande de liberar fosfatos, esas las vamos a conocer como molculas altamente energticas, y son bsicamente molculas que se obtienen durante el catabolismo, 1-3 difosfoglicerato, fosfoenolpiruvato son del catabolismo de la glucosa, fosfocreatina son del catabolismo energtico muscular; y hay otras que tienen poca capacidad de aportar fosfatos y que fcilmente reciben fosfatos y son molculas que actan bsicamente en procesos endergnicos en procesos anablicos, glucosa 6 fosfato, glicerol 1 fosfato, son molculas que trabajan bsicamente en procesos anablicos, la glucosa 6 fosfato es el punto de partida para sintetizar glicerol, para sintetizar ribosa 5 fosfato, y el glicerol 3 fosfato es el punto de partida para sintetizar triacil gliceroles, fosfolpidos, glicerofosfolipidos, arranco desde aqu; y el ATP est hay en el medio, entonces el ATP se convierte en un intermediario energtico clave por que tiene una capacidad de recibir fosfatos buena, y tiene una capacidad de aportar fosfatos tambin buena, cosa que no podemos decir por ejemplo del 1-3 difosfoglicerato, por que el 1-3 difosfoglicerato tiene poca capacidad para recibir fosfatos pero si tiene gran capacidad para liberar fosfatos, o en el caso de la glucosa 6 fosfato, tiene gran capacidad para recibir fosfatos, pero tiene muy poca capacidad para donar fosfatos, el ATP es el que est en el medio, el ATP tiene capacidad de recibir y capacidad de aportar, por eso lo usamos como intermediario energtico; por ejemplo ac, conversin de glutamato en glutamina(diapositiva 35), necesitamos eliminar este NH3, ese Ion amonio es una molcula bastante toxica, necesitamos eliminarla, entonces lo ms fcil seria convertir glutamato en glutamina, con ayuda de ATP podramos hacerlo, pero resulta que las condiciones celulares hacen que la reaccin no se de en este sentido, si no en este sentido; me explico, para yo hacer la reaccin en este sentido necesitara que la concentracin de glutamato fuera muy alta y la concentracin de glutamina fuera muy baja, desde el punto de vista fisiolgico no se da esa condicin, las concentraciones de glutamato nunca van a ser tan altas como para hacer que la reaccin se venga en este sentido, y las concentraciones de glutamina nunca van a ser tan bajas como para dejar que se d en este sentido, entonces lo que hacemos bsicamente es acoplarla a una reaccin que me d buena energa, glutamato mas ATP produce glutamil fosfato, primer paso, y ese glutamil fosfato luego recibe el grupo amino y se convierte en glutamil, entonces hago una ruta alterna para llegar al mismo lado, sin tener que pasar por esta reaccin que no est favorecida fisiolgicamente, tambin por que las cantidades de glutamil son muy pocas y entonces ese glutamil fosfato tiende a convertirse en este sentido, es exergnicos, entonces se dirige hacia all, mientras que esta no se va a dar, esa es otra probabilidad, ahora hay una cosa muy importante en bioenergtica, y es el hecho de que la premisa que tenamos de la primera ley de la termodinmica, que la cantidad de energa que yo obtena de un proceso arrancaba de un inicio final, obtena un G era lo mismo si yo lo haca de un solo chochazo que si lo haca por pasos, la idea es que nuestras clulas lo hacen en varios pasos, lo hacen muy despacio, porque si lo hiciera de un solo golpe, si liberara toda la energa en un solo golpe mucha de esa energa se perdera en forma de calor, entonces se volvera un proceso poco eficiente, necesitamos que sea lo ms eficiente posible, porque somos zapatoqueos desde el punto de vista energtico, la mejor forma de hacerlo eficiente es hacerlo paso a paso y garantizar que la perdida de energa sea muy poca, por un lado, y por otro lado si lo hiciramos de un solo golpe la cantidad de energa que liberaramos seria tanta que podra daar la clula, podra causar daos en la clula.
Bueno aqu est la otra posibilidad que tienen los nucletidos; el ATP no solo sirve como un aportante energtico, tambin sirve como un marcador metablico, marcbamos la glucosa para convertirla en energa, miren que marcamos el acido graso para degradarlo, esto ya lo habamos mirado, hacemos conversin del acido graso para degradarlo; la otra posibilidad es que estos nucletidos que no son solo el ATP, sino el GTP, CTP, UTP, no solo sirven como aportante energtico, sino que van a servir como una condicin, como una molcula, como un monmero para sintetizar polmeros como el DNA o el RNA; entre otras cosas nosotros hacemos reciclaje de esos monmeros porque son energticamente muy costosos su sntesis. Entonces toda la chchara que hemos visto es el acoplamiento, anablico, catablico, a travs del ATP, pero no solo del ATP, sino de NAD reducidos, FAD reducidos y NADP reducidos, (estas son vitaminas, intervienen en reacciones de oxidoreduccin, transportan 2 electrones).
Ahora vamos a ver como obtenemos el ATP.
Convergencia y Divergencia Metablica: Ya habamos visto en alguna parte, (diapositiva 38) los procesos catablicos son en general convergentes, arranco de almidn, glicgeno, sacarosa, y miren que triacilgliceroles fosfolpidos, aminocidos y todos ellos convergen en una sola molcula que es la acetil coenzima A, hay que aprender a tratar muy bien al acetil CoA ya que es clave para ustedes; mientras que los procesos anablicos son divergentes, a partir de acetil CoA sintetizo abeto acetil CoA, a partir de abeto acetil CoA, cidos grasos, a partir de cidos grasos triacilgliceroles, tejido adiposo, eicosanoides, tromboxanos, leucotrienos, prostaglandinas, fosfolpidos, fosfatidilcolina, fosfatidiletanol amina, fosfatildilglicerol, mebalonato, y a partir del mebalonato sintetizo este encarte que es el colesterol, y a partir del colesterol las sales biliares, las hormonas esteroideas, y de aqu puedo sintetizar algunos carotenos, vitamina K aunque nosotros no hacemos mucha sntesis de ellos; entonces miren que las vas anablicas son divergentes y las vas catablicas convergentes, y en general podamos afirmar que todas las vas catablicas convergen en esto que se llama el ciclo de Krebs o ciclo del acido tricarboxilico; entonces vamos a tener convergencias y divergencias.
De dnde obtenemos la energa? Cmo llegamos nosotros a sintetizar el ATP? De dnde se obtiene esa energa para sintetizar ATP?
La energa se obtiene de procesos de oxido reduccin, entonces nosotros cogemos metabolitos bastante reducidos como los cidos grasos y los convertimos, los degradamos y cogemos esos equivalentes reductores, ese potencial de oxidoreduccin que tienen esas molculas.
Vamos a mirar rpidamente los procesos catablicos, porque vamos a hablar de unas lanzaderas y necesito que sepan de donde viene la historia de las lanzaderas.
Sustratos que para nosotros son energticos son tres, glucosa, cidos grasos y aminocidos, son los tres sustratos que para nosotros son energticos, para la glucosa nosotros primero vamos a hacer conversin, glucosa 6 fosfato, vuelvo y les repito esto lo que hace es secuestrar la glucosa y hacemos aqu un proceso que se llama gluclisis, la idea es que despus de esa gluclisis yo obtengo piruvato y ese piruvato pueda tener un destino que es producirme lactato o me produce acetil CoA, uno si hay oxigeno(piruvato) y otro si no hay oxigeno(lactato), esta ruta de la gluclisis anaerbica me va a producir 2 ATP directos, no necesito ir a ningn otro lado, salen de aqu directicos; en cambio la gluclisis aerbica, por aqu obtengo 2 ATP y un NAD reducido, pero hasta aqu todo este cuento ocurre en citoplasma; este acido graso se mete aqu directo, como acido graso se mete a la mitocondria, y en la mitocondria se convierte nuevamente en acetil CoA, entonces tenemos dos fuentes de acetil CoA, y ese acetil CoA, ciclo de Krebs, y del ciclo de Krebs yo obtengo 3 NAD reducidos, un FAD reducido y un GTP, entonces esto es mitocondria; y los aminocidos lo primero que les pasa es transaminacion, se libera el NH3, y ese NH3 lo vamos a convertir en urea, pero estos forman lo que vamos a conocer como esqueleto carboxlico, pues esqueletos carboxlicos, supongan que, erase una vez un aminocido que perdi su grupito amino, y entonces lo que le queda es esto, el hidrogeno, un grupo ceto y los carbonos, esto es lo que se llama esqueleto carboxlico, y ese esqueleto carboxlico, aqu al ciclo de Krebs, entonces en el ciclo de Krebs me pueden producir 3 NAD, 1 FAD, y 2 GTP dependiendo de donde me meta yo al ciclo de Krebs, la historia es la siguiente, el cuento es este, la energa que yo puedo obtener de la gluclisis o de la oxidacin de cidos grasos o la oxidacin de aminocidos, est representada en potencial de oxidoreduccin, y ustedes ya vieron en vitaminas, que ese potencial de oxido reduccin yo lo atrapo en vitaminas, en vitaminas que tienen capacidad de recibir electrones y de transportar protones, que son el NAD y el FAD, pero hay que ver un detalle, a veces ese NAD se da en el citoplasma, a veces yo obtengo los NAD en el citoplasma, pero la nica forma que yo tengo para obtener energa de ese NAD es meterlo a la mitocondria, porque despus de ese ciclo de Krebs aqu viene una cosa que se llama cadena respiratoria y luego viene la fosforilacin oxidativa, y estos son los que cogen el NAD y el FAD y los oxidan, los convierten en NAD oxidado y FAD oxidado que son los que reutilizamos nosotros aqu, y de esto liberamos nosotros ATP. entonces la historia que nos falta echar es como cogemos esos NAD y FAD y los volvemos ATP, entonces les deca, primero es el potencial de oxido reduccin, la historia que les eche con el PH metro, donde tenamos un electrodo que era de hidrogeno y que tena un balance o una posibilidad de liberar electrones de acuerdo a la solucin que le colocaba yo ac, entonces ac lo que hicieron fue colocar la solucin problema, que es cualquiera de las reacciones que ustedes coloquen, por ejemplo, si estamos aqu en este paso de la gluclisis, el paso de gliceraldehido 3 fosfato a 1, 3 difosfoglicerato, me libera un NAD, entonces ustedes cogen la reaccin de gliceraldehido 3 fosfato aqu y el NAD y miran cuantos electrones se producen, como lo pueden obtener, comparndolo con la cantidad de electrones que libera este de ac, si este libera mas electrones que este pues los electrones van a fluir de all hacia ac, pero si este libera menos electrones los electrones van a fluir de aqu para all, entonces lo que yo miro es la capacidad de donar electrones o de aceptar electrones y eso lo reflejo en un potencial que se llama potencial de oxidoreduccin, entonces yo miro el potencial de oxidoreduccin de diferentes reacciones, hay ay muchas reacciones donde hay diferentes potenciales de oxidoreduccin, en general puedo decir, que entre ms negativo sea el potencial de oxidoreduccin, mayor probabilidad tiene de liberar electrones, mientras que si es positivo tendr mayor capacidad de aceptar electrones; entonces cuanto ms negativo, mayor probabilidad de que libere electrones, cuanto ms positivo mayor probabilidad de aceptar electrones, entonces miren que dentro de las reacciones que pueden liberar electrones tenemos la del NAD reducido, el FAD reducido; y las que pueden aceptar electrones, la ultima que tenemos all el OXIGENO, el oxigeno es el principal aceptor de electrones para nosotros, all termina la cadena respiratoria, en la oxidacin, y coger el oxigeno y convertirlo en agua, all termina; y miren que en medio, ms arriba del FAD y el NAD vamos a encontrar los citocromos, citocromo B, citocromo A, citocromo C, y vamos a encontrar aqu la ubiquinona, la ubiquinona que es parte del complejo dos de la cadena respiratoria; entonces vamos a coger estos equivalentes reductores y los vamos a meter en estos potenciales de oxidoreduccin, cual es la idea, empezar a pasar del ms negativo, al ms positivo y cada vez que yo paso de uno negativo a uno positivo, es decir cada vez que tengo una diferencia de electronegatividad, de potencial de oxido reduccin, estoy liberando energa; vamos a ver como cogemos esas diferencias de potencial y somos capaces de convertirlos en ATP, como es que hacemos esa vaina; una cosa muy importante que necesito que les quede muy claro, porque de ah el valor energtico de muchos metabolitos de los que vamos a hablar mas adelante cuando hablemos del metabolismo, es la fuente de equivalentes reductores, yo puedo tener fuentes Citoplasmticas o fuentes Mitocondriales, aqu hay fuentes mitocondriales, el alfa ceto glutarato, el succinil CoA, malato, oxalacetato, piruvato a acetil CoA que es mitocondrial, gliceraldehido 3 fosfato a 1-3 difosfoglicerato es citoplasmtica, lactato a piruvato ocurre en el citoplasma pero el sentido de la reaccin es hacia ac, sea el piruvato se convierte en lactato y reciclamos el NAD, el beta hidroxiacil CoA a ceto acil CoA eso es mitocondrial, esto es sntesis de cidos grasos, glucosa 6 fosfato a fosfogluconato esto es va de las pentosas, este NADP (acta en reacciones de oxido reduccin pero se diferencia del NAD, en que el NADP interviene mas en reacciones anablicas, mientras que el NAD trabaja ms en reacciones catablicas), entonces el objetivo de esta reaccin de la va de las pentosas es precisamente este, producir NADP reducidos como fuente para hacer vas anablicas; y esto glutamato a alfa ceto glutarato, esto es mitocondrial, siocitrato NADP es mitocondrial. Bueno la historia es la siguiente, tenemos bastantes fuentes de equivalentes reductores, pero la gran mayora de ellos se fijaron ac en la mitocondria, y es en la mitocondria donde ocurre cadena respiratoria y fosforilacin oxidativa, no tienen ningn problema, esos NAD y esos FAD que se obtienen en mitocondria directamente se van a cadena respiratoria, se oxidan y puedo obtener energa de ellos, el problema est con estos que se producen en citoplasma, porque estos que vienen de citoplasma tienen que meterse a la mitocondria, entonces una fuente grande es la gluclisis, me produce 2 NAD citoplasmticos, que podran equivaler a obtener 3 o 5 ATP, eso depende de que usemos, pero por ahora me interesa que recuerden que la gluclisis aporta NAD reducidos, es la fuente ms importante de NAD reducidos citoplasmticos; para hacer que esos NAD reducidos se metan a la mitocondria tengo dos sistemas, un sistema que lo vamos a conocer como la lanzadera del malato, que es ese grafico que tenemos ayi, y el otro sistema es la lanzadera del glicerol 3 fosfato.
Esta es la lanzadera del malato (diapositiva 43), tiene muchsimas reacciones pero hoy me interesa bsicamente dos cosas de esta lanzadera, a medida que sigamos avanzando vamos a meterle ms cosas de las que necesitemos, por ahora solo me interesan dos; miren lo que va a pasar, oxalacetato, el oxalacetato puede venir de transaminacin, estas son reacciones de transaminacin en la degradacin de aminocidos, aspartato se convierte en oxalacetato, lo obtengo aqu, oxalacetato, se asocia al NAD reducido que viene del citoplasma, acurdense que la mitocondria tiene dos membrana, una externa y una interna, la externa es permeable, permite el paso de muchsimas molculas, mientras que la interna es la que pone el tatequieto, esa es la que es impermeable, es muy selectiva, entonces este oxalacetato se asocia con el NAD que viene del citoplasma y atraves la membrana externa, se asocio con el NAD y produjo malato, enzima malato deshidrogenasa, esa malato deshidrogenasa atraviesa la membrana interna mitocondrial a travs de un transportador, el transportador es el malato alfa ceto glutarato, transporta cualquiera de las dos molculas, se llama malato alfa ceto glutarato por que miren, permite el paso del malato y de carambolas alfa ceto glutarato; entonces el malato atraves membrana interna mitocondrial y esta aqu en la matriz mitocondrial, y por accin nuevamente de la malato deshidrogenasa y su enzima mitocondrial se convierte en alfa ceto glutarato y se libera como NAD reducido, entonces el NAD reducido por la lanzadera del malato, entra a la mitocondria como NAD reducido, ese oxalacetato por transaminacin se vuelve aspartato, el aspartato sale y el aspartato por transaminacin vuelve a ser oxalacetato y cerramos el bichito, cerramos el ciclo, pero lo clave est aqu arriba; oxalacetato mas NAD reducido, malato, malato oxalacetato mas NAD reducido; es importante que tengan claro que el NAD reducido entra como NAD reducido, porque dependiendo de cmo entre a la mitocondria va a entrar al primer complejo o al segundo complejo, y si entra al primer complejo produce ms energa que si llega al segundo complejo.
La lanzadera del glicerol 3 fosfato (diapositiva 44)es un poco ms complicada, dihidroxiacetona fosfato recibe el NAD reducido y NAD reducido se oxida al NAD, se convierte en glicerol 3 fosfato, y ese glicerol 3 fosfato luego aqu en la mitocondria, membrana interna mitocondrial le dona los equivalentes reductores al FAD no al NAD, aqu entra por el FAD reducido, y resulta que el FAD llega al segundo complejo de la cadena respiratoria, no al primero; entonces el NAD reducido que viene del citoplasma con la lanzadera del malato entra como NAD reducido y sea asocia al primer complejo, mientras que el NAD reducido por la lanzadera del Glicerol 3 fosfato se convierte en FAD reducido y se asocia al segundo complejo, entonces esa diferencia de primero y segundo complejo me va a decir cuanta energa puedo producir a partir de esos equivalentes reductores. PARTE TRES
Recuento:
Ayer habamos visto todo lo que era la energa libre estndar, como se expresaba, cual era la importancia de esos niveles de energa libre estndar, como la iba a interpretar, y habamos dicho que toda esa energa libre estndar la obtenamos nosotros bsicamente de procesos de oxido reduccin, que podamos calcular el potencial de oxidoreduccin o redox que tena un proceso, una reaccin, si lo comparbamos con el potencial redox de un electrodo de hidrogeno que era el que usbamos como estndar o como modelo para poderlo comparar, y que de esa comparacin nosotros obtenamos una serie de potenciales que hacan referencia bsicamente a las reacciones que se asociaban a la cadena respiratoria o la fosforilacin oxidativa, y hacamos la salvedad de que aquellas reacciones o aquellos procesos que tenan un potencial de oxidoreduccin mas negativo tenan mayor facilidad para donar electrones, mientras que aquellas que tenan un potencial redox positivo, tenan ms opcin de recibir electrones, y entonces all arriba en la parte alta de la escala estaba el oxigeno, y el oxigeno entonces era el de potencial ms positivo, mas grande, y por ende entonces iba a ser el aceptor final de esos electrones que iban a fluir. habamos revisado tambin la produccin de los NAD reducidos y decamos entonces que la mayora de ellos se producan a nivel del citoplasma, que solo haba algunas reacciones muy escasas que producan NAD reducidos o NADP reducidos a nivel citoplasmtico y que estaban asociadas bsicamente a una reaccin del ciclo de la gluclisis, era el caso del gliceraldehido 3 fosfato a 1- 3 difosfoglicerato, y una reaccin de la va de las pentosas, que era la conversin de glucosa 6 fosfato en 6 fosfogluconato, y que esos potenciales de oxido reduccin que yo produca a nivel del citoplasma deban permitir o facilitarme el ingreso a la mitocondria y que para eso contbamos con dos lanzaderas, esta que es la lanzadera del malato, en donde el NAD se asociaba al malato y entraba a la mitocondria, y dentro de la mitocondria era liberado como NAD nuevamente, y la otra lanzadera que tenamos era la lanzadera del glicerol 3 fosfato, que cuando los equivalentes reductores que venan en el NAD nosotros los metamos a la mitocondria, pero dentro de la mitocondria los liberbamos como FAD reducidos, y eso produca o tena una implicacin en el balance energtico de las reacciones.
Fosforilacin Oxidativa
Este tema ya lo vieron abajo pero lo vamos a revisar nuevamente; cosas que hay que tener muy claras para poder revisar la fosforilacin oxidativa: La mitocondria posee dos membranas una interna y una externa; la externa es muy permeable, permite el intercambio de muchos iones y muchas molculas, mientras que la interna es bastante selectiva, va impedir el paso de muchos de los componentes, aminocidos, cidos grasos, equivalentes reductores etc. No podrn atravesar esa membrana interna mitocondrial; toda la maquinaria de la fosforilacin oxidativa se ubica en la cara interna de la membrana interna mitocondrial, se mete dentro de esa membrana interna toda esa maquinaria, y entonces pues todos esos equivalentes reductores que se producen dentro de la mitocondria, provienen de la oxidacin de los cidos grasos o de la dexaminacin oxidativa de los cidos grasos, no tienen ningn problema en ingresar o empezar el ciclo de la fosforilacin oxidativa, el li va a ser con los que estn aqu afuera, pero ya tenemos dos lanzaderas que me lo van a permitir. Si yo cogiera esa membrana mitocondrial y la desarmara, la colocara en tratamiento con un detergente, por ejemplo el dextran 100, yo iba a encontrar bsicamente cinco complejos, que hacen parte o que estn inmersos aqu en la membrana mitocondrial, y esos cinco complejos son los que en ultimas constituyen la cadena respiratoria y la fosforilacin oxidativa, entonces lo podra yo separar fcilmente por fraccionamiento de esa membrana.
Vamos a mirar a grosso modo que molculas conforman esos complejos: Lo primero que vamos a encontrar son Citocromos, los citocromos son unas protenas que dentro de su estructura tienen un grupo hemo, (hizo un dibujo), entonces miren que esos grupitos hemo estn formados por cuatro anillos pirrlicos, y esos anillitos se asocian entre s por unos puente metilo, estos puentecitos metilo unen un anillo pirrlico con el otro, y en el centro pueden tener una molcula de hierro como en este caso; uno puede encontrar dos tipos de grupitos hemo o de protoporfirinas o porfirinas, unas que son como estas asimtricas, a lo que se refiere es que los sustituyentes son diferentes y entonces las llamamos de tipo 9, y otras que son simtricas aunque aqu no hay ninguna simtrica que serian del tipo 1, miren que todas las que tenemos ac son de tipo 9 y la presencia de estos grupitos, o mejor hagmoslo de otro lado, la presencia de estos grupos le da solubilidad, cuantos ms grupitos carboxilo tenga la porfirina, mas soluble es, en este caso las porfirinas se convierten en molculas bastante insolubles, van a ser bastante insolubles pues solo tienen dos molculas de este tipo, en el caso del citocromo A nosotros encontramos un sustituyente que son unidades isoprenoides, entonces eso le va a determinar mucho la nomenclatura, la nomenclatura es A1, A7, A10 dependiendo de cuantas unidades isoprenoides tenga a disposicin, entonces esos son unos de los componentes; recuerden ustedes que este hierro puede tener dos estados de oxidacin, ferroso y frrico; uno puede determinar los citocromos bsicamente por espectrofotometra, por espectro de absorcin como ustedes lo estn haciendo en el laboratorio, encuentran diferencias entre el estado reducido y el estado oxidado, aqu tenemos para citocromo C bsicamente, pero se aplica para todos los citocromos, hay una absorbancia determinada en condicin reducida, y una absorbancia que se puede determinar en condicin oxidada, y uno puede determinar que tanto efecto tuvo un flujo de electrones sobre el citocromo.
Lo otro que tiene la fosforilacin oxidativa son estas protenas que en su interior tienen este ncleo hierro azufre o centro hierro azufre o dominio hierro azufre lo van a encontrar de diversas formas en los libros; el objetivo de estos centros hierro azufre, es cuando uno tiene el hierro as metido dentro de una protena, asociado al residuo de cisterna, y a algunas molculas de azufre, en estas condiciones el flujo de los electrones es mucho ms rpido, entonces lo que va a permitir es crear eficiencia a la cadena respiratoria, va a ser ms eficiente la cadena respiratoria; entonces tenemos los citocromos, el hierro azufre y de acuerdo a la constitucin y a como estn formados esos complejos podemos nombrar esos cuatro complejos que hacen parte de la cadena respiratoria:
Complejo uno: NAD deshidrogenada.
Complejo dos: Succinato deshidrogenada, ayer algunos compaeros me decan que haban revisado y que el FAD poda entrar tanto al complejo uno como al complejo dos, y entonces yo le explicaba por qu el FAD no poda entrar al complejo uno, revise y efectivamente el NAD entra al primer complejo y el FAD entra al segundo complejo, la enzimas en este caso la NAD deshidrogenasa, se llama NAD ubiquinona deshidrogenada, es especfica para el NAD en el complejo uno, y en el complejo dos que se llama succinato deshidrogenada tambin la conocen como Succinato coenzima Q deshidrogenada, es especfica para el FAD, entonces ni el NAD puede entrar al segundo complejo, ni el FAD puede entrar al primer complejo, miren que usa varios grupos prostticos, el complejo uno tiene flavin mono nucletido, y tiene ncleos de hierro azufre, el complejo dos tiene succinato coenzima Q deshidrogenada tiene como grupos prostticos el FAD y aparece el FAD y el complejo hierro azufre, Complejo 3 la ubiquinona citocromo C oxidorreductasa, tiene varios grupitos hemo, ncleos de hierro - azufre ahorita los vamos a mirar.
Complejo cuatro que es la citocromo oxidasa tiene diferentes tipos de citocromo, hay vamos a encontrar citocromo B, citocromo A, y algunas protenas que tienen cobre dentro de su estructura, y nuevamente cabe recordarles los dos estados de oxidacin que puede tener el cobre, ion cprico o ion cuproso.
Complejo cinco: en algunos libros ustedes lo encuentran dentro de la cadena respiratoria, pero l no hace parte estricta dentro de la cadena respiratoria si no que es lo que nosotros conocemos como el complejo de la fosforilacin oxidativa, que es la ATP sintasa como tal, entonces el complejo cinco seria la ATP sintasa.
Entonces la idea que traemos es que entre ms negativo el potencial de oxido reduccin, mas fcil se van a donar los electrones, entonces estos complejos, el NAD tiene un potencial de oxidoreduccin mas negativo que la ubiquinona, entonces los electrones saltaran del NAD a la ubiquinona, la Ubiquinona tiene un potencial de oxidoreduccin mas negativo que los citocromos, el citocromo C entonces de la ubiquinona sacara el citocromo C, y el citocromo C tiene un potencial de oxidoreduccin mas negativo que el oxigeno, entonces el aceptor final va a ser el oxigeno; entonces vamos a tener el flujo de electrones, que trae el NAD o que trae el FAD de aqu hacia ac; miremos como sucede ese flujo: Primer complejo, NAD ubiquinona oxidorreductasa, esto trae dos electrones, el NAD trae dos electrones, esos dos electrones son transferidos a una coenzima que es la Flavin mononucletido, entonces esos dos electrones de la Flavin mononucletido pasan de aqu a un complejo hierro azufre, y este complejo hierro azufre lo va a donar a la coenzima Q, que tambin la conocemos como ubiquinona, entonces miren que esa ubiquinona con esos dos electrones toma dos protones de aqu de la matriz de la mitocondria y los asocia a ella, entonces vamos a tener la ubiquinona reducida, que tambin la conocemos como ubiquinol, ahorita vamos a mirar un poco ms del ubiquinol; la reduccin de esta preubiquinona aqu en este complejo uno, cambia la estructura de este complejo, y va a permitir que fluyan a travs del cuatro protones, entonces miren que voy pasando protones desde la matriz mitocondrial al espacio intermembranoso, vamos a fluir protones desde la matriz al espacio intermembranoso, lo que voy a provocar hay es una disminucin en la concentracin de los protones aqu abajo, en la matriz mitocondrial, aqu arriba abra un aumento en la concentracin de los protones pero va a ser pasajera, por que recuerden que la membrana externa es permeable, entonces esos protones fluirn hacia el citoplasma, y entonces habr un aumento pasajero de las cargas positivas, yo puedo inhibir este complejo uno, con esta cosa con el Amital que es un barbitrico, causa inhibicin del complejo uno, la rotenona, que es un producto que se utiliza mucho como insecticida, y con la pieridicina A que es un antibitico y puedo inhibir ac, que pasara si yo inhibo ac, pues bsicamente el flujo de electrones a partir del NAD se va a bloquear, no puedo oxidar NAD, no voy a poder oxidar NAD ac, esta ubiquinona reducida, que tambin la conocemos como ubiquinol es una molcula liposoluble, muy apolar, entonces ella fcilmente se puede desplazar a travs de la membrana, ella se va a poder desplazar a travs de la membrana con los electrones que le regalo este complejo uno, se va a desplazar; lo otro que vamos a tener aqu es el complejo dos, miren que el complejo dos recibe los protones provenientes del FAD, de la lanzadera del glicerol 3 fosfato, recibe los electrones provenientes del FAD, y los traslada rpidamente a la ubiquinona, este complejo dos, cuando hace ese trasteo de electrones no cambia su estructura, no hay modificacin de la estructura, luego no va a haber bombeo de electrones desde ac, de la matriz al espacio intermembranoso. Aqu lo que me estn mostrando es la donacin de los electrones que puede hacer la oxidacin de cidos grasos, nuevamente con el FAD reducido, entonces mire que ese FAD los transfiere al complejo dos, y ese complejo dos a la ubiquinona; aqu est la molcula de ubiquinona, es una molcula bastante apolar, la puedo encontrar en tres estadios, ubiquinona cuando est totalmente oxidada dos grupitos ceto, semiquinona est parcialmente reducida, aqu le hemos colocado un hidrogeno a este grupito ceto y ubiquinol cuando est completamente reducida, entonces le transforme sus dos grupitos cetos en OH, en esos tres estados. En esta condicin como ubiquinol completamente reducida me est transportando dos electrones y dos protones, los mismos dos electrones que venan fluyendo desde all. Complejo 3, Ubiquinona, Citocromo C oxido reductasa; hay un sitio de asociacin para la ubiquinona; bueno este complejo tiene varios componentes, miren tiene, citocromo B, citocromo C1, tiene grupitos hemo, BL y BH se refiere a si es liviano o es pesado, y un grupito hemo pegado a un citocromo C1, adems tiene un centro hierro azufre, a este complejo es que va a llegar la coenzima Q o ubiquinona reducida, entonces recuerden que esta ubiquinona trae dos electrones, aqu hay un ciclo, en ese ciclo, en la primera ubiquinona que llega o ubiquinol completamente reducido, uno de los electrones fluye por el complejo hierro azufre, y de ese complejo hierro azufre pasa al citocromo C1, y del citocromo C1 al citocromo C, lleva uno, el otro electrn que traa el ubiquinol se lo pasa a este citocromo BL, y este citocromo BL se lo pasa al citocromo BH, y el citocromo BH coge una ubiquinona y la vuelve semiquinona, entonces vamos a tener un ciclo aqu que lo que busca es hacer ms eficiente el paso de los electrones, ubiquinol un electrn se va por el lado del complejo hierro azufre citocromo C1 citocromo C, el otro electrn se va por el citocromo BL citocromo BH, se asocia a la ubiquinona y se convierte en semiquinona; la segunda ubiquinona que llega o ubiquinol hace lo mismo, toma un electrn se lo regala al complejo hierro azufre, del hierro azufre al citocromo C1 y del citocromo C1 al citocromo C, el segundo electrn de aqu se va BL BH y se pega a la semiquinona y lo convertimos en ubiquinol, miren que en este paso la ubiquinona o la semiquinona digmoslo toman dos protones y miren que esos dos protones pasan al espacio intermembranoso, el citocromo C se va a ir cargadito de electrones, se lleva cuatro electrones, el citocromo C, entonces lo que voy a bombear es cuatro protones, desde el lado de la matriz al espacio intermembranoso, estoy donando cuatro protones, ese citocromo C ahora pues lleva cuatro electrones tambin es una molcula bastante liposoluble y se trastea a travs de la membrana mitocondrial y llega al complejo cuatro, antes de seguir vamos a devolvernos un poquitico porque aqu hay unos inhibidores Antimicina A y el Mixotiazol que son inhibidores del complejo tres, nuevamente pasa lo mismo que en el complejo uno, si yo bloqueo este complejo tres ya sea por el sitio de unin del citocromo C al citocromo C1 que es el sitio donde fluyen los electrones que trae la ubiquinona, o en este QN que es el sitio donde se une el ubiquinol, si yo bloqueo cualquiera de esos dos sitios los electrones no van a poder fluir y todo lo que hay aqu atrs, complejo dos y complejo uno se va a bloquear, Antimicina A, Mixotiazol, son frmacos que ustedes van a usar en tratamientos de algunos tipos de infecciones; bueno, entonces bamos aqu, citocromo C con cuatro electrones, esos cuatro electrones del citocromo C pasan a esta protena que tiene cobre, se llama protena A que tiene cobre, cambiara el estado de oxidacin del cobre, de esta protena A cobre, pasara al citocromo A, del citocromo A al citocromo A3, del citocromo A3 al cobre B, lo vamos a llamar as, y esos cuatro electrones se van a asociar al oxigeno, tomando cuatro protones de la matriz mitocondrial como sustrato, miren toma cuatro protones como sustrato los asocia al oxigeno y produce agua, entonces el citocromo reducido con cuatro protones y oxigeno me produce agua y citocromo nuevamente oxidado, entonces volvemos al estado inicial de oxidacin, obtenemos la molcula de agua, y adicional a eso ese flujo de protones por ac cambia la estructura del complejo cuatro, y permite que fluyan cuatro protones hacia el espacio intermembranoso, entonces vamos a tener flujo de cuatro protones, en tres complejos, complejo uno, complejo tres y el complejo cuatro, entonces miren que estos cuatro complejos que son bombeados son diferentes a los que se usan como sustrato, los cuatro de sustrato se asocian al oxigeno, producen agua, los cuatro que son para bombear simplemente atraviesan el complejo y llegan arriba al espacio intermembranoso;
Respuesta a una pregunta de un estudiante: no, habamos dicho que hacia ciclos, pero esto se desprende de ac cuando lleva cuatro electrones, hace ciclos, y en cada ciclo va a recibir dos electrones, lo que me quiere decir que l es capaz de aceptar dos ciclos; miren que aqu es donde acta el cianuro (diapositiva 56) y el monxido de carbono, bloqueando este complejo cuatro, bloqueando el paso de los electrones del citocromo B hacia el oxigeno, y entonces bloqueamos toda la cadena respiratoria, vamos a bloquear toda la cadena respiratoria; entonces el aceptor final fue el oxigeno, producimos agua, y durante el proceso hicimos bombeo de protones al espacio intermembranoso, que sacamos con ese bombeo de protones, aqu esta otra ves la misma historia, como fluyen los electrones desde el complejo uno, complejo dos, complejo tres, complejo cuatro, hasta el oxigeno para producir la molcula de agua, entonces el que tiene el potencial de oxidoreduccin mas negativo es este, y el que tiene el potencial de oxidoreduccin mas positivo es el oxigeno, hay esta, es la misma chchara que les estaba echando ahorita, el potencial de oxidoreduccin mas positivo es el del oxigeno; bueno en este pedacito este NADP lo produce la va de las pentosas, la va de las pentosas tambin es citoplasmtica, entonces cuando yo quiero oxidar nuevamente el NADP reducido en la mitocondria tengo que usar tambin las lanzaderas del malato, o del oxalacetato para poder hacer la oxidacin. Lo que obtengo yo con ese flujo de protones, aqu lo que hice fue aumentar la concentracin de protones en el espacio intermembranoso y disminuir ac(?) bsicamente lo que hago es disminuir ac, entonces voy a crear dos gradientes, eso me provoca dos gradientes, un gradiente que es un potencial elctrico, hay mayor densidad de cargas positivas en el espacio intermembranoso, y menor densidad de cargas positivas lo que sera lo mismo de mayor densidad de cargas negativas dentro de la matriz, en la matriz mitocondrial, entonces voy a tener una fuerza que me va a decir que estas cargas positivas deben tratar de alguna forma de meterse a la matriz mitocondrial, y por otro lado el pH tambin es diferente, aqu afuera va a tener un pH mas acido del que hay aqu adentro, aqu el pH va a ser mas alcalino que aqu afuera, luego voy a tener un doble gradiente, un gradiente qumico, y un gradiente elctrico, que es lo que se llama un modelo quimiosmotico de Michel, hay un modelo quimiosmotico, hay dos fuerzas que le dicen a los protones ustedes tienen que volver a la matriz mitocondrial, la fuerza elctrica, la mayor cantidad de cargas positivas en el exterior, lo que sera lo mismo la mayor densidad de cargas negativas en el interior, va a hacer que ellas tiendan a pasar, y la fuerza qumica, el pH aqu afuera es mas acido que aqu adentro, la membrana interna mitocondrial es completamente impermeable, no va a permitir el flujo de esos protones, los complejos que permitan el flujo hacia fuera, hacia el espacio intermembranoso son unidireccionales, no van a permitir el paso en sentido contrario, entonces le queda solo una posibilidad, la ATP sintasa, que es el complejo cinco, la ATP sintasa est formada por dos dominios uno que conocemos como F sub cero y otro que conocemos como F sub uno, el F sub uno est formado por tres unidades, ypsilon, gama y delta (diapositiva 61), hay tenemos la ATP sintasa, si uno observara la estructura de esa ATP sintasa se dara cuenta que F sub cero no es ms que un canal, es un canal asociado a unas protenas contrctiles, entonces este canal se asocia a unas protenas contrctiles, y de paso se pega al complejo F sub uno por el dominio gama, aqu se pega por este dominio gama, entonces van a pegarse a este dominio gama, y cualquier cosa que haga girar o mover a F sub cero va a hacer que se modifique tambin F sub uno, y si uno mira F sub uno se va a encontrar con tres sitios activos, digmoslo as, el primer sitio tiene afinidad por ADP y fosfato, el segundo sitio tiene capacidad de sintetizar le ATP y el tercer sitio libera el ATP y recibe nuevamente el ADP y el fosfato, entonces hay tres probabilidades, en uno recibo ADP y fosfato, en el otro sintetizo el ATP, y en el otro libero el ATP y acepto nuevamente ADP y fosfato. Cada vez que un protn pasa por F sub cero provoca un giro, entonces cuando el primer protn paso, entro ADP y fosfato, cuando fluye el segundo protn se sintetiza el ATP y cuando fluye el tercer protn, se libera el ATP y se acepta nuevamente ADP y fosfato; entonces fluye el primer protn, acepto ADP y fosfato, fluye el segundo protn, se sintetiza el ATP, fluye el tercer protn y libero el ATP y acepto nuevamente ADP y fosfato, en definitiva necesito que tres protones pasen por la ATP sintasa para poder sintetizar una molcula de ATP, son simultneos, entonces vamos a tener tres protones para poder sintetizar una molcula de ATP hasta ahora, hasta ahora vamos a necesitar tres protones; pero resulta que para que este ADP se convierta en ATP necesito un fosfato adicional, una molcula de fosfato adicional, esa molcula de fosfato adicional entra a travs de un transportador por un simporte, miren entra un fosfato pero a la vez entra un protn, entonces voy a hacer intercambio, voy a entrar, dos fosfatos un protn, tres entraban por aqu, uno entra por ac; en definitiva necesito cuatro protones para poder hacer la sntesis de un ATP, tres que hacen tirar a la ATP sintasa y uno que permite la entrada de este fosfato, entonces la ATP sintasa lo que hace es tomar el ADP y convertirlo en ATP, y como la concentracin de ATP es mayor aqu adentro que ac afuera, el ATP sale y el ADP pasa, va a entrar, porque es menos negativo, entonces tiende a entrar con mayor afinidad que el ATP, entonces hacemos un intercambio de ATP por ADP, necesito cuatro protones para sintetizar la molcula de ATP, los cuatro protones me los bombea, complejo uno, complejo tres y complejo cuatro, entonces miren que cuando llega el NAD al complejo uno, a partir del NAD yo podra sintetizar tres ATP, cuando el NAD aterriza en el complejo uno me produce tres ATP, cuando el NAD entra por la lanzadera del glicerol 3 fosfato y se pega al complejo dos, solo me sintetiza dos ATP, solo me puede sintetizar 2 ATP. Cuando uno busca esa relacin de equivalentes reductores y ATP producidos, en relacin a los fosfatos de alta energa que se producen por cada molcula de oxigeno, y si uno se vuelve estricto en esa historia se da cuenta que un NAD no produce 3 ATP, se da cuenta que un NAD produce solo 2.5 ATP y que un FAD no produce 2 ATP sino que produce 1.5 ATP, siendo estrictos en la cuestin de consumo de oxigeno vs. Fosfatos producidos, pero por lo general, y vamos a tomarlo de la manera ms practica vamos a decir que el NAD produce 3 ATP y que el FAD produce 2 ATP. Qu pasa si yo tengo un flujo de protones diferente a la ATP sintasa? Resulta que si yo permito un flujo de protones se d por un sitio diferente a la ATP sintasa ya la energa no se transforma en ATP sino en calor, y aparece en una protena que se llama termogenina que es muy abundante en tejido adiposo pardo, y esta termogenina ante ciertos estmulos por ejemplo el cambio de temperatura, se expresa y entonces abre un canal adicional, que permite el flujo de protones por un lado diferente a la ATP sintasa y lo que vamos a producir es calor. Hay varios tipos de protenas desacoplantes, adems de las termogeninas hay algunas protenas desacoplantes a nivel del msculo, diferentes a las termogeninas que permiten la produccin de calor, incluso de la peroxisoma encontramos alguna protena desacoplante que permite producir cierta cantidad de calor. Sustancias que intervienen con la fosforilacin Oxidativa: aqu tenemos una lista de sustancias que alteran la fosforilacin oxidativa (diapositiva 64), oligomisina, aurovertina son molculas que inhiben la ATP sintasa, y tenemos algunos qumicos que aparecen aqu, dicloro fenil dimetil urea, que tambin me permiten o causan inhibicin o alteran la fosforilacin oxidativa, son desacoplantes; cualquier cosa que desacople la fosforilacin oxidativa, causa inhibicin en la cadena respiratoria, porque impide el flujo de los protones, y si no hay flujo de protones no hay produccin de energa, entonces esto va tambin a verse comprometido en la cadena respiratoria.
Clase #2: Bioenergtica.
Proceso en si, diferencia cambios entre estado final y estado final independiente de la forma para llegar al estado final. Los estadios intermedio en el proceso, la diferencia de energa de los estadios intermedios puede ser.
La segunda ley de la termodinmica hace referencia a que todos los procesos espontaneos se dan cuando la entalpa aumenta. Se producen en una direccin en que incrementa el factor deo la entropa. Nos dice cual es la direccin del proceso, hacia donde.
Entonces la primera ley nos dice cuanta energa podemos obtener de un proceso o reaccin y la segunda ley nos dice hacia donde esta dirida la reaccin, su direccin.
Ej. En la oxidacin de la glucosa se produce mucha molculas de co2 y h20 se incrementa la entropa y la reaccin se ve favorecida hacia la oxidacin de la glucosa. Ningn proceso se puede realizar mientras la entropa disminuya. Ella busca alcanzar un estado de equilibrio, menos energtico. Cuando se alcanza el equilibrio y entropa no aumente termina el flujo energtico. Hay muerte en el sistema biolgico.
Puedo tener una disminucin de la entropa de un sistema pero este hecho debe estar acompaado de un aumento en la energa del entorno. Asi la entropa del universo aumenta. Los procesos que implican disminucin de la entropa en un sistema, van a necesitar energa. Son procesos Endergnicos.
Aquellos que necesitar un aumento de energa son irreversible. Lo de espontaneo se refiere a que fluye en un sentido mas no se refiere a la velocidad de la reaccin. Lo espontaneo es que es favorecida en un sentido.
Si se colocara en un recipiente el co2 y el h2o difcilmente se puede tener una molecula entropa me dice el flujo de la reaccin.
Una expresin que me relaciona la entropa y la entalpia es la frmula:
Cambio de energa (energa libre)es igual al cambio de la entalpia menos la temperatura por el cambio de la entropa:
G=H - S
La energa libre: es aquella que disponemos para realizar un trabajo.
En un proceso, por ejemplo cuando cogemos la glucosa y la oxidamos o cogemos un acido graso y lo oxidamos obtenemos cierta cantidad de energa ej. 9.5 Kcal de un acido graso. Si quisiramos volver a sintetizar un acido graso nos damos cuenta que necesitamos ms energa, ya que parte de la energa se pierde durante el proceso en forma de calor.
El cambio de la entalpa no lo podemos tomar como la energa que puedo usar para hacer un trabajo, Ya que es prdida de energa dada durante el proceso. De aqu surge la energa libre de Gibbs: Tengo que mirar cmo cambia la entalpa y comparar con el cambio de entropa. Estas dos, me dan la energa que un proceso me aporta para hacer un trabajo biolgico que puede ser tipico, osmtico o..m
Para que un proceso sea espontaneo y se de en el sentido que se propone la energa libre de gibbs tiene que ser negativa, que la formula de con un exponente negativo. Hierro agua a diferentes temperaturas.
El hielo esta a -10 C y lo quiero pasar a agua, la entalpa aumenta. Esto dice que convertir hielo en agua a baja temperatura no es un proceso favorable. El cambio de la entropa tambin aumenta pero a -10 C la entropa es baja. En a -10C tanto la entropa como la entalpa van a ser bajas y la energa libre va a ser positiva luego el proceso no es espontaneo. Si estamos a 10C la entropa y la entalpa van a ser altas. Entropa ms alto que entalpia, el G va a ser negativo. Aqu el proceso es Exoftlmico. La energa libre dice si es exoftlmico o si el proceso necesita energa. Nos permite determinar si la reaccin es espontanea o por el contrario necesita ser inducida.
La G es negativo, puedo decir que: 1. Es un proceso espontaneo. 2. Ocurre en el sentido que se est proponiendo. 3. Proceso exergnico (que libera energa).
Tenemos muchos proceso en que la entalpa disminuye, por ejemplo cuando hacemos sntesis de protenas, cidos nuclecos, etc. Si la entropa es menor entalpia tiene que ser ms grande.
H S Low Temperature High Temperature + + G+ no favorecido G- favorecido + - G+ no favorecido G+ No favorecido - + G- favorecido G- favorecido - - G-favorecido G+No favorecido
La energa libre de gibbs permite relacionar entalpia y entropa. (La entalpa) Capacidad que tiene la reaccin o proceso de aportarme energa para hacer un trabajo.
Para tener una reaccin espontaneo no necesito que entalpia y entropa tengan signos negativos, necesito que cuando se aplique la formula siempre vaya obtener una energa negativa, por lo tanto exergnica, espontanea.
Mientras estemos vivos la energa tiene que ir aumentando. Siempre la entropa del universo aumenta lo que implica que desde el entorno la energa puede aumentar, disminuir o quedarse esttica, eso depende de la entropa del sistema: Si el sistema aumenta la entropa en entorno pude quedar constante aumentar o disminuir. Si la entropa ene el sistema disminuye, el entorno tiene que aumentar la entropa para que tenga un aumento neto de la entropa. Si la entropa del sistema es constante, en el entorno deber aumentar.
Segundo principio de la termidinamica
Si la energa es constante, en un sistema abierto ella debe fluir entre el entorno y el sistema. Si la energa del sistema aumenta, la del entorno tendr que disminuir en la misma proporcin. Si la energa del sistema dismunuye, la del entorno tendr que aumentar en la misma proporcin.
Primera ley de la termodinmica
Hay un intercambio constante de calor entre sistema y el entorno y hace que muchos de ellos no se puedar revertir.
La energa libre de Gibbs tambin est relacionada con la constante de equilibrio de una reaccin.
(habla de a energa libre de kandas y) Estamos calculando la energa libre cuando la temperatura es 25C concentracin es 1M pH de 7.
G= -RT Ln Keq
Si yo vario la constante de equilibrio de una reaccin, la energa libre tambin se va a modificar. La constante se puede cambiar alterando la concentracin del sustrato o la concentracin del producto.
Esto es importante cuando se habla de la capacidad energtica del ATP, ya que la concentracin en la clula varia. La capacidad de producir energa de una clula a otra va a variar.
Ej. Glucosa 1-p glucosa 6-p 0.20 mM glucosa 1-p
El equilibrio se alcanza cuando haya 0.19 Mm de glucosa 6-p y glucosa 1-p 0.1 Keq= 19
Si aplico la energa libre de kandas la energa libre es de -1745 cal por mol negativa. Afirmando que la reaccin ocurre en el sentido que esta propuesto.
Si yo aumento la concentracin de glucosa 1-p la constante de equilibrio disminuira. Esa disminucin en la Keq va a tener un efecto sobre el G, sera ms negativo.
Keq= > 1, G negativo. Keq= 1, G 0 en el medio, no hay produccin de energa, ocurre en un sentido o en el otro. En una reaccin en equilibrio, los cambios energticos son muy pequeos. Si aumento la concentracin de uno de las molculas del sistema se puede desplazar en sentido contrario.
Keq cercana uno y aado glucosa 6-p la reaccin se va o si le aado glucosa 1-p (para cualquier lado?)
Si tengo constante mayor que 1 y hay disponibilidad de glucosa 1-p se va hacia la derecha pero si aado glucosa 6-p para que la reaccin se devolviera necesitamos aplicarle energa.
Keq= <1, G es positiva, necesita energa para ocurrir. Lo mas fcil es que se venga en el sentido contrario.
G es fundamental la regulacin de los procesos metabolicos se da en aquellas reacciones que son Irreversibles, un G grande que son exergnicas y liberan energa. Son ms fciles de regular.
En la Glucolisis ms o menos hay 20 reacciones hay una que es el paso de la fructosa 6-p a fructosa 1, 6 difosfato que es catalizada por la fosfofructoquinasa 1 y es bastante endergonica, necesita abundante energa. En estos momentos donde hay un cambio de energa libre bastante grande, positivo o negativo, son los que mas fcil se pueden regular.
Ej. 1. Piruvatoacetil CoA Lo mete a la mitocrondria para formar acetil CoA y por el otro lo convierte en un sustrato para ir a ciclo de krebs G= -33.7 Kj/M
Los NADH los metemos en la mitocrondria para obtener ATP.
2. En la gluconeogenesis, tenemos que coger sustratos diferentes a los CH y convertirlos en glucosa. Uno de los depsitos ms grandes que tenemos de sustratos energticos son los acidos grasos.
Coger acidos grasos, convertirlos en acetil CoA.
La gluconeogenesis coge piruvato, lo convierte en fosfonol piruvato luego lo convierte en gliceraldehido 3 fosfato luego este a fructosa y la fructosa en glucosa.
Pero el G tan grande y tan negativo hace que sea casi imposible para la clula convertir la acetil CoA en piruvato. Esto limita el hecho de coger cidos grasos y utilizarlos como sustrato para obtener glucosa.
cidos grasos no me aportan glucosa en cambio la glucosa si me puede dar cidos grasos.
3. Una reaccin del ciclo de krebs: Succinatofumarato
G=0 Kj/M El sentido depende de las [] de Succinato.
Cuando hacemos degradacin del amoniaco en el ciclo de la urea producimos una gran cantidad de fumarato. Necesitamos reciclar ese fumarato, se convierta en aspartato, para ello necesitamos Succinato luego pasa a alfa ceto glutarato y pasa a aspartato.
Ese tipo de reacciones se conocen como reacciones anafletoricas son de relleno que permiten hacer interconversin del metabolismo.
4. Otra reaccin del ciclo de krebs, Malato oxalacetato
G=99.7 Kj/M La reaccin ocurre en sentido contrario, es endergnica, permite regular las concentraciones de citrato luego este se convierte en isocitrato y este en malato.
Si el citrato se aumenta es un buen indicador de conduccin energtica en la clula. Ante esto, si hay mucha energa en la clula pues los procesos se van a detener.
En resumen, tenemos reacciones que son exergnicas, G muy negativo mientras que las endergonicas tiene un G bastante positivo.
Ante esto, hay algunas reacciones que fisiolgicamente en nuestro organismo no pueden ocurrir. La nica forma de que ocurra una reaccin endergonica seria modificando la constante de equilibrio, de los sustratos o de los productos cosas que en nuestro organismo no podemos hacer en esa magnitud.
Modificar un G significara aumentar un 100 o 200 veces un sustrato eso no lo hacemos nosotros. Se recurre a acoplar reacciones. Reacciones acopladas: tengo una reaccin que me libera energa exergnica la acoplo a una reaccin que necesita energa endergnica. De tal forma que la energa que libera una la pueda utilizar otra para llevar a cabo el proceso.
La conversin de fructosa a glucosa 6-p es una reaccin que requiere energa bastante endergnica, esa energa se obtiene de la hidrlisis del ATP. La hidrlisis del ATP me va a dar una cantidad de energa y la acoplo con la otra reaccin y voy a obtener una reaccin acoplada; me queda un poquito de energa.
Todos los procesos anablicos estn a coplados a procesos catablicos.
La degradacin de glucosa a co2 y h20 produce ATP y este ATP lo utilizo para sintetizar protenas.
Un ej. Fisiolgico: Cuando estamos en ayudo prolongado necesitamos haber un proceso anablico, sintetizar glucosa. (gluconeogenesis que es bastante endergonico) en ayuno necesito grandes cantidades de energa. Recurrimos a oxidar metabolitos que estn en el centro y puedan aportar energa para la gluconeogenesis y para el organismo (trabajo celular) oxidacin de acidos grasos.
Una oxidacin de glucosa laporta 36 ATP mientras que la oxidacin de un Acido graso (ej. Acido palmtico, 16 carbonos) es de129 ATP. El acido graso es mucho mas energtico que la glucosa.
Cogemos la glucosa, obtenemos energa oxidndola luego llevamos esa energa al hgado que la utiliza para sntesis del glucgenomecanismo acoplado.
Cogemos un acido graso y comenzamos a activarlo. Le vamos a pegar un fosfato, la reaccin que ocurre puede estar en equilibrio, puedo tener la acil CoA y este convertirse en acido graso. Para ponerle sentido a la reaccin, cojo el acido grado y lo pongo a reaccionar con el ATP. Le pegu un fosfato, para activarlo (para poder utilizar la molculas desde el punto de vista metabolico necesitamos activarlas). Marcarlas como moleculas adecuada.
La glucosa es activada con el fosfato El acido graso se activa pegndole una coenzima A pero necesitamos energa; esta es aportada por la hidrlisis del enlace fosfato (ya que se rompe).
Pero si hay acil CoA en mucha proporcin, se puede devover y podra producir adenilato de acido graso.
El pirofostato hace que la reaccin tambin se de en cierto sentido,la hidrlisis del pirofosfato es una reaccin bastante excergonica, para poder volver a formar pirofostato (devolver la reaccin) necesitara quitaele mucha energa a la reaccin.
La hidrlisis del pirofosfato: 1. Direcciona la reaccin. 2. ATP aporta energa para hacer sntesis, activar el acido graso.
Catlisis Enzimatica: no afectan el equilibrio de la reaccin. La energa libre estndar de una reaccin no catalizada es igual a la energa libre estar de una reaccin catalizada. Lo que cambia es la Velocidad.
En bioenergtica no interesa la velocidad de la reaccin (es de inters en enzimologa).
ATP
Acoplamientos de reacciones: como una reaccin endergnica obtiene energa de una reaccin exergnica. Como es el aporte de energa.
Es un nucletido trifosfato.
Un nucletido es la asociacin de una base nitrogenada con un azcar y uno o varios fosfatos.
Al final estn 3 fosfatos unidos por enlaces tipo L y alrededor hay 4 cargas negativas muy cerca y van a tratar de repeler y separar da energa.
Al romperse el primer enlace se libera energa.
El ATP tiende a formar complejos con el magnesio y al formarlos la tensin va a disminuir, el ATP estar menos tenso. La capacidad del ATP de aportar energa va a depender tambin de la concentracin de magnesio que haya en la clula.
Las quinasas, que son transferasas de grupo fosfato, son enzimas que tienen como coenzima al magnesio.
Puedo tener al magnesio formando complejo con el ATP o con el ADP. Las 4 cargas negativa que se encuentran alrededor van a causar una gran tensin en el ATP. Trata de desprenderse y cuando se rompe el primer enlace se va a liberar mucha tensin y se libera energa.
El fosfato inorgnico que se desprende en el primer enlace tiene varios estadios, puede estabilizarse por resonancia y hay 4 formas. Al tener diferentes formas de una molecula, estoy aumentando la entropa y si la aumento estoy favoreciendo la reaccin y liberando gran cantidad de energa: 7. 3 Kcal/mol
Pero no solo el ATP me libera esa energa. Cuando se hace hidrlisis libero molcula de pirofosfato y dejo una molcula de AMP, la cantidad de energa es mayor: 10.5 kcal/mol
Existen 3 ubicaciones del fosfato: alfa beta y gamma nomenclatura.
La ruptura del primer enlace es la de un enlace ester que libera gran cantidad de energa liberando un fosfato inorgnico que se estabiliza por resonancia aumentando la entropa.
Tambin en otra reaccin rompo un pirofosfato y un AMP. 19 kj/M rompo y puedo liberar la energa entre los dos y entre los dos del otro lado. La hidrlisis del pirofosfato es bastante energetico ?
El ATP es la moneda energtica de la celula: 1. Tiene alta cantidad de energa depositada. 2. La mayora de las enzimas que necesitan energa utilizan el ATP, tiene estereoespecificidad por el ATP.
Casi toda la energa la vamos a convertir en ATP.
Los enlaces fosfodiester son de bastante energa. Realmente, no es el enlace el que tiene energa, sino por la caractersticas de la molcula. El fosfato es quien tiene alta energa.
Como sabemos que la cantidad de produccin de energa de un proceso est ligado a la contante de equilibrio.
La energa que se obtiene del ATP, depende de la concentracin de ADP Y ATP que haya en la clula. Estas concentraciones varan: Miocito: gran cantidad de ATP. Mayor capacidad de obtener energa del ATP. Eritrocito: bajas concentraciones de ATP.
Depende de la disponibilidad de: ATP AMP Mg
Estos tienen efectos sobre la capacidad energtica.
Otros compuestos de alta energa: Fosfonol piruvato, que es la penltima reaccin del ciclo de la glucolisis. Es una reaccin bastante exergnica a la hidrlisis del fosfonol piruvato para producir piruvato, se puede dar en dos formas dependiendo de la posicin del hidrogeno, que es lo que se denomina autogenisacion de una forma no ..a una forma.
Como tenemos 2 posibilidades la entropa aumenta. Este aumento hace que sea bastante exergnica la reaccin, 61,9 Kj/mol. Esta reaccin con esta capacidad exergnica tan alta es regulatoria de la glucolisis, siendo la piruvato quinaza una enzima regulatoria de la glicolisis.
Otra molecula bastante energtica es la fosfocreatina, es muy abundante en el musculo, tambin fundamental en el encfalo. Esta reaccin es catalizada por la creatin quinasa. Es una fuente de energa rpida.
Para poder hacer glucolisis anaerbica tengo que hacer que glucosa llegue hasta el musculo, mientras ella llega, hay un lapso de tiempo en que el musculo estuviera sin energa. La presencia de la fosfocreatina permite que la actividad inicie y el musculo no se quede esperando a la glucosa y el inicio de la glucolisis anaerbica. La fosfocreatina arranca dando energa de manera instantnea y esa energa cubre el pedazo en que se inician las vas metabolicas.
Cuando se hace hidrlisis de la fosfocreatina, libero creatina. Se estabiliza por resonancia teniendo 12 formas de creatina. Aumento la entropa que se encuentra en el segundo componente de la energa libre de Gibbs. Si aumento la entropa el signo negativo se dispara por lo que la reaccin se vuelve bastante exergnica. Para hacerla reversible solo tengo que aplicar un minimo de ATP.
El 1,3- difosfoglicerato, hacemos otra vez hidrlisis y obtenemos el 3 fosfoglicerato que se estabiliza por resonancia y obtengo 2 formas. El aumento de la entropa hace que la energa libre sea muy negativa y que sea una reaccin exergnica. Esta reaccin ocurre durante la glucolisis pero extraamente no es regulatoria, es incluso reversible siempre y cuando se tenga el ATP.
A diferencia de esta reaccion que es tan exergnicas, que no es regulatoria, esta la de la piruvato deshidrogenasa, se bastante exergnica pero es regulatoria. El problema de esta reaccin es que el hecho que tenga que darle un carbono al acetil CoA, obliga a que cuando me quiera regresar a la reaccin no solo tengo que aplicar energa sino tambin carbono. Tengo que recurrir a dos acciones: Una catalizada por la piruvato carboxilasa. otra catalizada por la piruvatocarboxilquinasa. Para poder convertir piruvato en
Hay otras sustancias que son bastante energticas como el Acetil CoA debido a enlaces tioester, estos enlaces apenas se rompen se estabiliza a travs de resonancia y hacen que la entropa aumente, la capacidad energtica de la celula se dispara.
Enlaces fosfato de alta energa. El 1, 3 difosfoglicerato, el ATP convirtindose en ADP (7.3), el ATP conviertiendose en AMP fosfato inorganico, mas energa (10.9) ya que hidrolizo el fosfato inorgnico y me produce ms energa mientras que el ADP convirtindose en AMP fosfato inorgnico es un poco menos energtico. Esta reaccin es poco favorecida porque hay un poco de enzimas que pueden utilizar el ATP. En una reaccin enzimtica degrada el ADP en AMP y el fosfato inorgnico pergarselo a otra para convertir ADP paraconvertirlo en ATP (Reaccion contraria).
Tenemos otras reacciones que son un poco menos energticas: Glucosa 1-p Fructosa 6-p Glucosa 6- p Glicerol1-p Acetil CoA.
Tengo un espectro grande de molculas con fosfato de alta energa. Hay unas que se van a identificar con poco capacidad de transferencia de fosfato y otra que se identifican un una alta capacidad de transferencia de fosfato. Aquellas con poca capacidad, lo que hacen fundamentalmente es recibir energa no aportan energa- Aquellas con alta capacidad de transferencia de fosfatos son molculas que fcilmente aportan energa.
Tengo que tener un acople energtico poder cubris las reacciones endergonicas con aquellas excergonicas. Las excergonicas van a tener molculas con alta capacidad de aportar fosfatos molculas altamente energticas y son basicamente molculas que se obtienen en el catabolismo. 1,3 difosfoglicerato Fosfonolpiruvato. (del catt. Glucosa) Fosfocreatinina (del catabilismo energtico muscular).
Hay otras con poca capacidad de aportar fosfatos y que fcilmente reciben: Son molculas que actan en procesos endergonicos, anablicos. Glucosa 6-p punto de partida para sintetizar glicerol glicerol 3 fosfato punto de partida para sintetizar triacilgliceroles, fosfolipidos.
El ATP esta en el medio y se convierte en un intermediario energtico clave porque tiene una capacidad de recibir fosfato y tambin capacidad de aportar fosfato. Lo que no sucede con el 1, 3- difosfoglicerato que tiene poca capacidad para recibir fosfato pero gran capacidad para liberar. Glucosa 6-p que tiene gran capacidad para recibir fosfato pero poca para donar.
ATP es un intermediario energtico.
Conversin del glutamato en glutamina ncesitamos eliminar el NH3 ya que el ion amonio es bastante Lo mas fcil seria convertir glutamato en glutamina. Pero las condiciones celulares hacen que la reaccin no se lleve en ese sentido que se desea. Necesitara que la concentracin de glutamato fuera muy alta y la de glutamina muy baja. Desde el punto de vista fisiolgico no se da esta condicin. Lo que se hace es acoplar a una reaccin que me de buena energa.
Glutamato + ATP Glutamil fosfato que recibe el grupo amino y se convierte en.(1:12) dejamos una ruta alterna para llegar al otro lado sin tener que pasar por esta reaccin que no est favorecida fisiolgicamente. Como la cantidad de glutamil fosfato que tengo es muy poca entonces ese glutamil fosfato se empieza a convertirse en el otro sentido ya que es una reaccin exergnica.
Estos procesos se dan despacio, ya que si fuera de un solo golpe alta cantidad de energa se perdera en forma de calor y se volveria un proceso poco eficiente y necesitamos que sea eficiente y por eso se hace paso a paso para que perdida de energa sea poca.
La otra posibilidad que tienen los nucletidos El ATP no solo sirve como aporte energtico sino tambin como marcador metabolico, marcamos la glucosa para convertirla en energa. Tambin marcamos el acido graso para degradarlo.
La otra posibilidad es que los nucletidos: ATP, GTP, QTP,etc. van a servir como molecula, un monmero para sintetizar polmeros de ADN, ARN.
El acoplamiento tambin se puede hacer a travs del NADH, FADH, NADPH. Estas son tambin vitaminas que estn implicadas con procesos de oxidoreduccion donde se transportan 2 electrones.
Para la obtencin del ATP, OXIDOREDUCCION
Los proceso catabolicos son en general convergentes: almidon glucgeno catalosa triacilgliceroles ,fosfolipidos,aminocidos, todos ellos convergen en una molecula que es el acetil CoA.
Por su parte, los procesos anbolicos son divergentes: A partir de acetil CoA sintetia acetoacetil CoA
A partir de acetoacetil CoA acidosgrasos.
A partir de acidos grasos, triacilgliceroles, tejido adiposo, tromboxano, prostaglandinas, fosfolipidos (fosfatidilcolina, fosfatidiletanolamina, fosfatidolglicerol), melanolato que sintetizo para colesterol y apartir del colesterol las sale biliares, las hormonas esteroideas, y de ah algunos carotenos, vitamina k.
En general todas las vas catablicas convergen en el Ciclo de Krebs.
La energa se obtiene de procesos de oxidoreduccion entonces nosotros cogemos metabolitos bastante repetidos como los acidos grasos y los convertimos, degradamos y cogemos esos equivalentes reductores. Que tiene potencial de reduccin.
Sustratos que para nosotros son energticos: Glucosa Acidos grasos. Aminoacidos.
Glucosa 6-p se hacela glucolisis y obtengo piruvato que puede tener destino ya sea lactato o acetil CoA. Si no hay oxigeno o si hay oxigeno respectivamente.
La ruta de la glucolisis anaerbica me va a producir 2 ATP directamente. La glucolisis aerobica obtengo 2 ATP y un NADH. Todo esto ocurre en citoplasma.
El acido graso se mete directamente a la mitocondria donde se convierte en acetil CoA, que va a ciclo de krebs de donde obtengo 3 NADH, un FADH y un GTP.
Lo primero que les pasa a los aminoacidos es transaminacion se libera el NH3, y este se se convierte en urea. Lo que queda se conoce como esqueleto carboxlico. En el ciclo de krebs me produce 3 NADH, un FAD y 2 GTP.
La energa que se puede obtener de la glucolisis, por oxidacin de los cidos grasos o de aminocidos esta representada en el potencial de oxido reduccin. El cual se atrapa en vitaminas que tiene capacidad de recibir electrones y de transportar protones NAD Y FAD. A veces obtengo los NAD en el citoplasma pero necesito llevarlos a la mitocondria para obtener energa, luego introducirlos a la cadena respiratoria y luego la fosforilacin oxidativa. Los convierten en NAD Y FAD oxidados y as liberar ATP.
Primero, potencial de oxido reduccin. (la historia con el peachmetro, donde se tiene un electrodo de hidrogeno, tiene una motilidad de liberar electrones dependiendo de la solucin. Aca, se toma la solucin problema en cualquiera de las dos reacciones por lo menos si estamos en la glucolisis, el paso de gliceraldehido 3 fosfato a 1, 3 di fosfoglicerato se libera un NAD, se mira cuantos electrones se producen, se compara con los electrones que libera el potencial. Esto permite el flujo.
Miramos la capacidad de aceptar o donar electrones. Lo reflejo en un potencial que se denomina potencial de oxido reduccin. En general puedo decir: Entre mas negativo sea el potencial, mayor probabilidad de liberar electrones. Entre mas positivo, mayor probabilidad de aceptar electrones.
Las reacciones que pueden liberar Electrones son el NADH, FADH.
Las que aceptan, el Oxigeno es el principal aceptor de electrones all termina la cadena respiratoria en la oxidacin.
Mas arriba del NAD y el FAD vamos a encontrar los citocromos A, B , C y tambin encontramos la ubiquinona que es parte del complejo respiratorio.
Vamos a escoger, los equivalentes reductores y se van a meter en potenciales de oxido reduccin para pasar del mas negativo al mas positivo y cada vez que los paso (cuando tengo una diferencia de electronegatividad) estoy liberando energa.
Algo muy importante, el valor energtico de muchos metabolitos, es la fuente de equivalente reductor: Fuentes citoplasmticas: Lactato piruvato Via de las pentosas Glucosa 6-p Fuentes mitocondriales: Alfa cetoglutarato Acetil CoA Malato oxal Piruvato acetil CoA Gliceraldehido 3-p 1,3 difosfoglicerato
NADP interviene mas en reacciones anablicas mientras que el NAD trabaja ms en reacciones catablicas.
El objetivo de la via de las pentosas es producir NAD reducido como fuente para via anablica.
Glutamato, alfa ceto glutarato.
Tenemos bastantes fuentes de equivalentes reductores pero la gran mayora terminan en la mitocondria y es all donde ocurre cadena respiratoria y fosforilacin. (se oxidan y me producen energa).
Los que se producen en el citoplasma tiene que se introducidos en la mitocondria. Una fuente grande la glucolisis que produce 2 NAD citoplasmaticos que pueden equivaler a 3- 5 ATP dependiendo de quien interviene.
Hay dos sistemas para que se puedan introducir a la mitocondria: Lanzadera del malato lanzadera del glicerol 3 -p
Lanzadera del malato
El oxalacetato puede venir de transaminacion en la degradacin de aminocido aspartato se convierte en oxal acetato.
Se asocia al NADH que viene del citoplasma. (la mitocondria tiene 2 membranas una interna otra externa que es permeable mientras la interna es impermeable y selectiva).
El oxalacetato se asocia con el NADH que viene del citoplasma y atraviesa la membrana externa y produce malato, enzima malato deshidrogenasa.
El matalo atraviesa la membrana interna a travs de un transportador que es el malato alfa cetoglutarato y se encuentra ahora en la matriz mitocondrial y por accin de malato deshidrogenasa se convierte el alfa cetoglutarato y se libera como NADH y este por la lanzadera del malato entra a la mitocondria como NADH.
El oxal acetato por aminacin se vuelve aspartato sale y luego por transminacion se vuelve oxal acetato.
Dependiendo de cmo llega a la mitocondria va a entrar al primer complejo o al segundo complejo. Si llega al primero produce ms energa.
La lanzadera de glicerol 3-p
Hdroxiacetona fosfato recibe al NADH el NADH se convierte en glicerol 3-p luego en la mitocondria le dona los electrones al FADH, y llega al segundo complejo de la cadena respiratorio.