SEMESTRE : VIII JUNN PER 201 MANUAL !E BIOTECNOLOGA CONCEPTO Y BREVE HISTORIA DE LA BIOTECNOLOGA La biotecnologa, en un sentido amplio se puede definir como la aplicacin de organismos, componentes o sistemas biolgicos para la obtencin de bienes y servicios. Esto significa que desde hace miles de aos, la humanidad ha venido realizando biotecnologa, si bien hasta la poca moderna, de un modo emprico, sin base cientfica La domesticacin de plantas y animales ya comenz en el perodo !eoltico. Las civilizaciones "umeria y #abilnica $%&&& aos a.'.( ya conocan cmo elaborar cerveza. Los egipcios ya saban fabricar pan a partir del trigo hacia el )&&& a.'. *ntes de la escritura del libro del +nesis, se disfrutaba del vino en el 'ercano ,riente recurdese que, seg-n la #iblia, !o .sufri. $o disfrut( accidentalmente los efectos de la fermentacin espont/nea del mosto de la uva $primera borrachera con vino(. ,tros procesos biotecnolgicos conocidos de modo emprico desde la antig0edad fabricacin de queso cultivo de championes alimentos y bebidas fermentadas salsa de so1a, yogur, etc. tratamiento de aguas residuales 2or supuesto, hasta la llegada de la moderna biologa, y en muchos casos hasta el siglo 343, la base de muchos de estos procesos era desconocida. 5e hecho, solamente en el siglo 36444 cobra cuerpo la idea de que la materia viva puede ser estudiada como la materia inanimada, es decir, usando el mtodo e7perimental, con lo que se inicia el lento declive de las ideas vitalistas $creencias errneas de que .la vida depende de un principio vital irreducible a otras ramas de la ciencia.(, que a-n daran sus -ltimos estertores casi al final del siglo 343. *lgunos hitos cientficos que sentaran la base de la biotecnologa contempor/nea Los primeros microscopistas, como van Leeu8enhoe9 y :oo9e $siglo 3644( describen los .anim/lculos. que est/n fuera del alcance del o1o, si bien se tarda a-n un par de siglos en captar la importancia de estas min-sculas criaturas. El descubrimiento de que las fermentaciones se deban a microorganismos se debe a la gigantesca figura de Louis 2asteur, en sus estudios realizados entre ;<=> y ;<>%. En la -ltima parte del siglo 343 e7istan ya instalaciones industriales para obtener etanol, /cido actico, butanol y acetona, aprovechando fermentaciones al aire libre en condiciones no estriles * finales del siglo 343, la .edad de oro de la bacteriologa. permite me1oras importantes en las tcnicas microscpicas el desarrollo de tcnicas aspticas, la esterilizacin y la pasteurizacin la posibilidad de cultivar cada cepa microbiana sin mezclas con otras cultivos puros en medios de cultivo de laboratorio. * comienzos del siglo 33 la bioqumica y la microbiologa convergen, estableciendo las bases enzim/ticas y metablicas de muchos procesos de fermentacin. "e desarrollan procedimientos industriales para producir enzimas $invertasa, proteasas, amilasas, etc.(. 5esde la dcada de ;?)&, las tcnicas de ingeniera qumica, aliadas a la microbiologa y a la bioqumica, permiten la produccin de antibiticos, /cidos org/nicos, esteroides, polisac/ridos y vacunas. La penicilina comenz a fabricarse en plena 44 +uerra @undial, como resultado de avances importantes en tcnicas de esterilizacin a gran escala, me1ora de las instalaciones de fermentacin $incluyendo la cuestin de la aireacin(, cultivo del hongo, etc. * partir de entonces se disearon estrategias para me1orar genticamente las cepas microbianas industriales. Las dcadas siguientes fueron de eclosin de produccin de antibiticos as como de transformaciones de esteroides y de cultivo de clulas animales para la produccin de vacunas antivirales. Las dcadas de los %& y >& vieron la me1ora de procesos de obtencin de pequeos metabolitos como nuclesidos, amino/cidos y vitaminas. Los procesos de fermentacin e7perimentaron me1oras con las tcnicas de inmovilizacin de clulas y enzimas en soportes, y con la fermentacin continua para obtener protena de clulas sencillas $biomasa microbiana(. 2olmeros microbianos como 7antanos y de7tranos se obtuvieron industrialmente, con apliaciones en el campo de la alimentacin $como aditivos(. 2ero incluso bien avanzado el siglo 33, cuando la +entica haba resuelto el misterio de la naturaleza del material de la herencia, las posibilidades que haba para actuar sobre dicho material eran limitadas cruces entre plantas y animales de la misma especie $o de especies similares(, seleccin de los individuos con rasgos deseados, retrocruzamientos $un proceso largo y lento(, mutaciones con agentes fsicos $rayos A6, rayos 3( o qumicos, con ulterior b-squeda $seleccin o rastreo Bscreening( de alguna variante de inters $algo tedioso y frecuentemente infructuoso(, etc. 5ebemos esperar a la dcada de los >& para que sur1a un con1unto de tcnicas de laboratorio revolucionarias que por primera vez permiten .tocar. de modo racional el sancta sanctorum de la vida. "on tcnicas y herramientas con las que se puede modificar el *5! de acuerdo a diseos previos y ob1etivos concretos $de ah el nombre popular de 4ngeniera +entica(. La 4ngeniera +entica $4.+.(, me1or llamada tecnologa del *5! recombinante in vitro, se caracteriza por su capacidad de cortar y empalmar genes o fragmentos de *5! de organismos distintos, creando nuevas combinaciones no e7istentes en la !aturaleza, combinaciones que ponemos a traba1ar en el interior de una variedad de organismos hospederos, para nuestro provecho. 1.1. La biotecnologa e! int"n!eca#ente inte"$i!ci%lina" La actual biotecnologa es una empresa intensamente interdisciplinar, caracterizada por la reunin de conceptos y metodologas procedentes de numerosas ciencias para aplicarlas tanto a la investigacin b/sica como a la resolucin de problemas pr/cticos y la obtencin de bienes y servicios. *lgunas de las ramas de conocimiento implicadas en la biotecnologa @icrobiologa #ioqumica +entica #iologa celular Cumica 4ngeniera $bio(qumica 4ngeniera mec/nica 'iencia y Decnologa de alimentos Electrnica 4nform/tica El avance de la biotecnologa depender/ cada vez m/s de esta colaboracin entre disciplinas, y en el uso de lengua1es y paradigmas comunes, as como en que cada tipo de especialista comprenda los logros y limitaciones de las otras ramas biotecnolgicas. 1.&. La biotecnologa %"e!enta #'c(o! ca#%o! $e a%licaci)n 5e1ando aparte el hecho ya reseado de que las tcnicas biotecnolgicas $principalmente las genticas( encuentran su primera utilidad en el avance de las propias 'iencias de la 6ida, desde el punto de vista de su aplicacin comercial e industrial, podemos decir que el campo de utilidad es inmenso *plicaciones teraputicas productos farmacuticos antibiticos vacunas hormonas terapias gnicas 5iagnsticos diagnsticos para salud humana diagnsticos para agricultura y ganadera ensayos para calidad de alimentos ensayos para calidad ambiental *limentacin me1ora de procesos tradicionales de obtencin de alimentos y bebidas nuevos alimentos y bebidas nutracuticos alimentos con perfiles determinados de nutrientes, y para la me1ora de la salud aditivos alimentarios @edio ambiente tratamiento de residuos urbanos, agrcolas e industriales biorremedio y biorreparacin produccin de energa a partir de biomasa !o podemos olvidar que muchas de las biotecnologas de las que nos beneficiamos son muy antiguas, y que en ellas se est/ logrando una fase de madurez auspiciada por los nuevos adelantos tcnicos $p. e1., la tecnologa de las fermentaciones(. 5e hecho, muchas de las innovaciones que se est/n produciendo no son tanto de nuevos productos cuanto de me1oras en los procesos. 5e cualquier manera, ya estamos viendo la entrada de nuevos productos, en forma de nuevos f/rmacos y de plantas transgnicas con caractersticas novedosas. 5e1ando aparte las tecnologas de fabricacin de vacunas, la mayor parte de las otras /reas biotecnolgicas requieren producir grandes cantidades de sustancias, del orden de 9ilogramos a toneladas, por lo que uno de los principales aspectos es el del .escalado. a esas grandes cantidades. Esto supone un gran reto a los ingenieros, ya que deben disear fermentadores de gran tamao, donde hay que controlar diversos par/metros, como p:, temperatura, o7geno y otros gases, etc. La tecnologa de fermentacin cobr mpetu a partir de los aos )& del siglo 33, cuando se comenzaron a fabricar antibiticos y otras molculas $/cidos org/nicos, hormonas, enzimas, polisac/ridos, etc( por medio de microorganismos. 2or lo tanto, aunque la atencin p-blica se ha centrado en la moderna biotecnologa que usa tcnicas de *5! recombinante, no podemos olvidar que ya antes e7ista otra biotecnologa, que hoy sigue pu1ante, y que se puede beneficiar de los nuevos enfoques. Las biotecnologas, al usar catalizadores biolgicos que funcionan a ba1as temperaturas y materias primas renovables, pueden contribuir a una economa m/s .verde. $ecolgicamente sustentable(. "e espera que puedan sustituir a procesos qumicos contaminantes. En los paises con condiciones clim/ticas apropiadas $p.e1., en los trpicos(, la produccin y uso de biomasa puede presentar muchas venta1as. La obtencin de energa de biomasa $p e1. residuos celulsicos( es una gran promesa para evitar la dependencia de combustibles fsiles en ciertas partes del mundo. Los altos costes $econmicos y ecolgicos( de las energas tradicionales pueden suponer un incentivo para buscar en la biotecnologa procesos de produccin m/s rentables. "i adem/s, se incluyen en los procesos industriales los costes ecolgicos $hasta ahora tenidos como .e7ternalidades. por la teora econmica tradicional(, las alternativas de base biolgica pueden ser m/s favorables que muchas contaminantes que se est/n empleando. Los incentivos son a-n mayores en el caso de la produccin de sustancias de alto valor aadido, como diagnsticos y productos teraputicos, para las que las biotecnologas permiten abrir nuevos mercados muy atractivos, con productos destinados a me1orar la salud y calidad de vida de la poblacin. 1.* Lo! t"e! n+cleo! $e la biotecnologa "eg-n Eohn "mith $;??%(, muchos procesos biotecnolgicos, especialmente los que se realizan en entornos cerrados industriales, tienen un triple n-cleo obtener el me1or catalizador biolgico para una funcin o proceso especfico obtener el me1or ambiente para la funcin de ese catalizador biolgico, mediante una serie de diseos tcnicos en los que es fundamental la ingeniera qumica procesamiento del material, consistente en separar y eventualmente purificar el material biolgico producido 6eamos cada uno de estos tres componentes ;. En la mayora de los casos, el catalizador biolgico son clulas vivas, sobre todo microorganismos. 2or ello, uno de los pilares de la biotecnologa es precisamente la microbiologa $entendiendo esta en sentido amplio de biologa microbiana(. 2arte de lo que hemos aprendido sobre el mane1o de microorganismos se puede aplicar, con modificaciones, al mane1o de clulas de animales y plantas, que cada vez son m/s importantes en la biotecnologa. 6arias son las caractersticas que hacen atractivos a los microorganismos la biodiversidad microbiana es gigantescaF de hecho, solo hemos investigado una pequea parte de ella. 'onforme los bilogos b/sicos aprendan a recuperar m/s biodiversidad y a conocerla, habr/ m/s cepas disponibles con propiedades potencialmente -tiles para los humanos las capacidades metablicas de los microorganismos, como con1unto, son las m/s amplias de todos los seres vivos. Los genomas microbianos esconden tesoros a-n ocultos, pero que se van revelando poco a poco, y ahora de modo m/s r/pido, una vez que se van complentando sus mapas y secuencias $actualmente e7isten varias decenas de genomas secuenciados(. Las actividades biosintticas y degradativas de estos microorganismos presentan oportunidades e7traordinarias para numerosas aplicaciones. los microorganismos crecen r/pidamente, y en muchos casos son f/ciles de manipular desde el punto de vista gentico. Esto hace que sea relativamente f/cil usarlos como factoras microscpicas para obtener productos -tiles en tiempos relativamente cortos. Ana parte esencial del aprovechamiento de los microorganismos reposa en nuestra capacidad para conservarlos viables durantes largos periodos de tiempo, y para que sus caractersticas -tiles sean estables en muchos casos, en lugar del microorganismo, se puede recurrir a aislar alguna o algunas de sus enzimas, y se las pueden poner a traba1ar en condiciones venta1osas y rentables. G. El segundo componente o n-cleo de las biotecnologas estriba en el entorno industrial en que ponemos a funcionar las clulas o las enzimas. Esto nos lleva al concepto de biorreactor, un entorno cerrado y controlado para que nuestros catalizadores biolgicos hagan lo que queremos con la m/7ima eficiencia. En esta parte de la biotecnologa se requiere la colaboracin estrecha entre los bilogos y los ingenieros de bioprocesos, incluyendo los ingenieros qumicos. "e trata de disear biorreactores o fermentadores, especies de cubas cerradas diseadas para controlar diversos par/metros que condicionan la buena produccin temperatura, aireacin, p:, etc. H. Iinalmente, queda el /rea quiz/ m/s desconocida y comple1a, el procesamiento de la biomasa o de la sustancia producidas separacin de las clulas respecto del medio acuoso en que han funcionado, recuperacin eficiente del producto buscado, purificacin, etc. * todo esto tenemos que aadir que un factor importantsimo en el desarrollo de la biotecnologa es la evaluacin de la seguridad del producto, sometida a controles rigurosos seg-n normativas nacionales e internacionales. 5e hecho este factor es tan importante que se puede convertir en limitante, de modo que las regulaciones estrictas desincentivan ciertos desarrollos biotecnolgicos. 2or todo ello, es importante que tales regulaciones sean realistas, y no e7i1an m/s de lo que la evidencia cientfica sugiere, manteniendo en todo momento la preservacin de la salud y el medio ambiente. * su vez, las regulaciones refle1an la percepcin p-blica de los riesgos y promesas de la biotecnologa. 2or e1emplo, hoy en Europa la percepcin p-blica ha logrado pr/cticamente una parada en las plantas transgnicas, a pesar de los informes cientficos que dicen que en la mayor parte de los casos, sus riesgos son similares a las plantas convencionales. :abr/ que llegar a un di/logo racional entre los diversos actores $cientficos, empresas, consumidores, ecologistas, etc(, para asegurar el correcto empleo de estas tecnologas, que por un lado no impida aplicaciones benficas sin riesgos, y por otro regule adecuadamente aquellos /mbitos donde las dudas razonables hagan recomendables m/s restricciones. El ideal sera permitir todo aquello que aporte beneficios sin aumentar riesgos, pero no caer en el error de prohibir usos positivos solo ba1o vagas ideas de riesgos no sustanciados, en buena parte imaginaciones y tergiversasiones de grupos de presin que pueden esconder agendas polticas ocultas. 2. ALGUNOS ASPECTOS CLAVE EN LAS BIOTECNOLOGAS &.1 ,ate"ia! %"i#a! Las materias primas para alimentar los procesos biotecnolgicos industriales pueden ser muy variadas, pero el hecho de que en su mayora se trate de materias naturales biodegradables las hace muy atractivas. Lo ideal sera emplear subproductos de otras empresas, con lo que el proceso se abarata y se eliminan problemas ambientales se usan mucho desechos ricos en carbohidratos de ciertas industrias melazas procedentes del procesamiento de caa de az-car y remolacha azucarera. En #rasil usan la caa de azucar para fabricar bioalcohol $+asohol( como biocombustible desechos ricos en almidn de granos como el maz, de tubrculos como la tapioca o la patata. El problema aqu es que el almidn debe primero ser degradado a monosac/ridos u oligosac/ridos antes de la fermentacin industrial, pero ciertos procesos biotecnolgicos son ya competitivos, como la produccin de 1arabes ricos en glucosa o fructosa, usados como endulzantes en alimentos y bebidas. En "uecia eliminan los desechos contaminantes del procesamiento de la patata con un mtodo a base de levaduras, que produce biomasa potencialmente valiosa. E7iste un gran inters en usar como materia prima desechos agrcolas e industriales ricos en celulosa. 5esgraciadamente, la celulosa es comple1a, y su asociacin con la lignina hace que a-n no e7istan procesos industriales operativos. 2ero si en un futuro logramos superar las barreras tcnicas, tendremos una materia prima abundante, y podremos aprovecharla al tiempo que evitamos problemas ambientales. 5e hecho, la lignocelulosa es la materia renovable m/s abundante de la biosfera, y la esperanza es poder aprovecharla en un pr7imo futuro. 5e la misma manera, sera estupendo poder aprovechar otros desechos de las actividades humanas como materias primas para los microorganismos industriales, elimando as problemas de polucin ambiental. La idea sera acoplar una industria que crea efluentes contaminantes con una bioindustria que pueda aprovechar los residuos de la primera, creando productos -tiles y riqueza adicional, y sin que los costes totales sean elevados $aunque ya el hecho de eliminar una fuente de contaminacin de puede considerar como algo positivo( ya se usan desechos procedentes de las industrias papeleras igualmente se aprovechan los lactosueros $residuos ricos en lactosa( procedentes de las queseras El empleo de metanol puede ser -til en ciertos procesos, ya que el metanol es .limpio. y se puede obtener f/cilmente a partir del abundante metano. En un futuro podra ser rentable para fabricar alimentos para animales. &.& ,e-o"a gen.tica/ Ingenie"a gen.tica $2ara una ampliacin sobre ingeniera gentica, especialmente por lo que respecta a la creacin y rastreo de genotecas. Dradicionalmente, la manera de me1orar genticamente los organismos industriales reposaba en la induccin de mutaciones $con mut/genos(, seguida de seleccin o rastreo de los me1ores mutantes. La b-squeda de me1oras en la produccin de protenas $incluyendo enzimas( es m/s f/cil que la de la produccin de otras molculas $polisac/ridos, antibiticos, amino/cidos, etc(, porque cada protena depende normalmente de un solo gen, mientras que los metabolitos se sintetizan por rutas comple1as donde intervienen varias enzimas, cada una sintetizada por un gen diferente, y con regulaciones a menudo complicadas. en los protocolos de seleccin, se suele aplicar una presin selectiva que favorece el crecimiento del tipo de mutantes buscados, en detrimento del resto de microorganismos en los protocolos de rastreo $screening, en ingls( crecen todos los microorganismos, pero se pueden identificar las variantes deseadas sobre la base de que presentan ciertas caractersticas que las diferencian de las dem/s la mezcla de genomas mediante fenmenos de se7ualidad, o parase7ualidad $las bacterias no tienen se7o, pero algunas tienen fenmenos parase7uales como la con1ugacin, que se pueden aprovechar para transferir material gentico de unas cepas a otras(. *lgunos inconvenientes de estas tcnicas tradicionales de me1ora los programas de me1ora suelen ser muy largos y tediosos, y a menudo no dan los resultados deseados el efecto principal de la mutagnesis es originar mutaciones aleatorias en el organismo, la mayor parte de las cuales son negativas para su supervivencia, o empeoran algunas de sus caractersticas originales. Jaramente se dan mutaciones que conducen a la aparicin de propiedades nuevas positivas, y en todo caso, el proceso de su b-squeda es a menudo muy complicado. *dem/s, incluso cuando se selecciona un tipo estimado adecuado, a menudo presenta otras mutaciones que son negativas $p. e1., haciendo que crezca m/s lentamente, o que sea m/s sensible a factores ambientales( lo anterior obliga a trasladar la mutacin .positiva. a un fondo gentico distinto $normalmente una cepa silvestre o que ya haba sido seleccionada como buena en un programa anterior(. Esto complica y alarga la me1ora gentica, e incluso en algunos organismos no se logra la adecuada introgresin de ese rasgo en la cepa deseada. frecuentemente los organismos seleccionados para la produccin acumulan mutaciones desconocidas que no se caracterizan muchos microorganismos industriales carecen de ciclos se7uales, lo que dificulta e incluso impide transferir rasgos -tiles de modo sencillo, de1ando como -nica alternativa la mutagnesis y seleccin en las especies dotadas de se7ualidad, la me1ora por recombinacin gentica est/ limitada al cruce entre razas de la misma especie, o de especies compatibles 2ero la llegada de la 4ngeniera gentica ha supuesto la superacin de muchos problemas que tena la me1ora cl/sica, sobre todo en aquellos microorganismos que carecen de se7ualidad. *dem/s, permite me1oras menos aleatorias y m/s precisas, transfiriendo genes de cualquier origen al organismo donde queremos e7presarlos. &.&.1 Antece$ente! 0 !'"gi#iento $e la Ingenie"a Gen.tica *unque la +entica es la base de toda la #iologa, su desarrollo como ciencia es de los m/s tardos. 6eamos esquem/ticamente algunos eventos esenciales para entender el surgimiento de la tecnologa del *5! recombinante * partir de ;<%=, @endel establece las bases de la gentica. En sus famosos e7perimentos con el guisante, descubri el modo de transmisin de ciertos caracteres desde una generacin a las siguientes, y su .mezcla. en el aporte materno y paterno. Los hallazgos de @endel permanecieron en el olvido hasta ;?&&, cuando sus leyes son redescubiertas por 'orrens, 5e 6ries y Dschermarc9. En ;?&? se acua el trmino .gen. $o gene( para referirse a la entidad hipottica responsable de los rasgos observables. En ;?;H se obtiene el primer mapa gentico, con % genes. En ;?G& @organ y @uller establecen su Deora cromosmica de la herencia los genes, localizados en los cromosomas, son las autnticas unidades de la herencia, tanto unidades de variacin como unidades de transmisin. Es decir, la herencia presenta un doble aspecto el de la transmisin de los caracteres $estudiado por las leyes de @endel( y el de la e7presin, es decir, el genotipo $con1unto de genes( determina el fenotipo $rasgos observables(. 2ero la naturaleza del material gentico fue ob1eto de polmicas durante mucho tiempo, hasta que entre los aos )& y primeros =& una serie de autores $*very y colaboradores, :ershey y 'hase, etc.( establecen firmemente que el material de la herencia reside en el /cido deso7irribonucleico $*5!F 5!*(. 2or esos mismos aos, #eadle y Datum proponen la teora conocida como .un genB una enzima., que correlaciona cada unidad gentica con el producto de su e7presin, es decir cada gen se e7presa como una determinada protena. 5esde entonces, se produce la definitiva unin de la gentica con la bioqumica. En ;?)=, "chrKdinger escribe su influyente libro Qu es la vida?, una visionaria fusin de la Deora de la 4nformacin con la #iologa, que iba a contribuir poderosamente a la naciente biologa molecular, inspirando a profesionales procedentes del campo de las ciencias qumicoBfsicas. En los )& y =& se produce, en efecto, un .desembarco. de fsicos y cristalgrafos en el aborda1e de cuestiones biolgicas. Es la poca del florecimiento de tcnicas como la difraccin de rayos 3, la ultracentrifugacin y la cromatografa. En ;?=; un 1oven bilogo estadounidense, Eames Latson, llega al laboratorio 'avendish de la Aniversidad de 'ambridge, para pasar una estada postdoctoral. *ll se une al ingls Irancis 'ric9, y ;< meses m/s tarde $primavera de ;?=H( publican en Nature su modelo tridimensional de la doble hlice del *5!. El modelo e7plicaba simult/neamente la herencia y la e7presin del material gentico. Mste consiste en un lengua1e basado en cuatro .letras., las cuatro bases nitrogenadas adenina $*(, guanina $+(, citosina $'( y timina $D(. "e abra en principio una nueva manera de estudiar la base gentica de los seres vivos de dentro $genotipo( a fuera $fenotipo(, al revs de lo que se vena haciendo desde @endel $la observacin de la transmisin del genotipo permita inferencias sobre el genotipo(. * continuacin se abre un decenio llamado a menudo la .Edad de ,ro de la #iologa @olecular., que pone las bases de la comprensin de los procesos b/sicos de la herencia y de la e7presin gentica replicacin del *5! papeles de la *5!Bpolimerasa, los cebadores $primers(, el molde. Dranscripcin una de las cadenas de *5! es copiada por la *J!Bpolimerasa hasta un *J! mensa1ero El *J! mensa1ero es ledo $traducido( por los ribosomas para dar una protena. 5e este modo, el mensa1e lineal del *5! se convierte en el mensa1e tridimensional de la configuracin de la protena El .5ogma 'entral. de la #iologa @olecular la informacin fluye unidireccionalmente en sentido *5! BN *J! BN protena. El desciframiento del cdigo gentico el lengua1e del *5! consta de .palabras. de tres letras $nucletidos(, llamadas codones. 'ada codn tiene un equivalente en el lengua1e de la protena, significando uno de los G& amino/cidos. El cdigo gentico est/ .degenerado., es decir, tiene cierto grado de redundancia algunos de los amino/cidos pueden venir determinados por m/s de un codn. E7isten %) codones, de los cuales tres carecen de sentido no tienen equivalente amino/cido, y en vez, sirven como seales de parada de la traduccin del mensa1ero. Eacob y @onod estudian en profundidad un sistema de e7presin y regulacin gentica en la bacteria Escherichia coli desarrollan su concepto del opern, como unidad de e7presin y regulacin a nivel de transcripcin. Dras la .Edad de ,ro., empiezan a surgir algunas sorpresas que desafiaban ideas fuertemente establecidas Los genes eucariticos son .discontinuos. est/n compuestos por una alternancia de segmentos que entrar/n a formar parte del *J!m maduro $e7ones( y segmentos que se eliminan $intrones(. Este proceso de maduracin del *J! se denomina corteByB empalme $splicing(. *lgunos virus $retrovirus( poseen material gentico de *J!, que es convertido a *5! por una enzima llamada reversotranscriptasa. "e confirman los tempranos $y semiolvidados( estudios de #arbara @c'linctoc9 hay segmentos del material gentico capaces de moverse de un lado a otro de los genomas $elementos genticos transponibles(. El material gentico es m/s din/mico y cambiante de lo que se haba sospechado. 2ero aparte de estos avances b/sicos, a finales de los aos %&, segua pendiente de plasmacin una de las e7pectativas abiertas por el descubrimiento de la estructura del *5! Ocmo llegar a .tocar. el *5!P, Ocmo estudiar cada gen por separado, aisl/ndolo fsicamente de los dem/sP, Ocmo determinar su secuencia de basesP 5urante mucho tiempo, lo -nico que se poda secuenciar era *J! desde ;?%) se secuencian algunos *J! transferentes, que constan de >= a <= bases. Los mtodos se fueron perfeccionando, de modo que en ;?>= se pudo conocer la secuencia de un min-sculo genoma el *J! del virus bacteriano IiB3B;>) $unos )&&& nucletidos(. "in embargo, para estudiar genes haba que ser capaces de aislarlos uno a uno a partir del cromosoma, que es demasiado grande para su manipulacin inmediata. 2ero no se haban descubierto nucleasas especficas capaces de cortar en puntos determinados del *5! para generar fragmentos discretos y homogneos. *nte este estado de cosas, algunos lderes de la Edad de ,ro, consideraron que los problemas b/sicos de la biologa molecular estaban resueltos, y decidieron migrar a otras /reas de conocimiento $biologa del desarrollo, neurobiologa, etc(. 'omo tantas veces ocurre en la ciencia, fue una humilde lnea de investigacin b/sica la que abri definitivamente el camino a la manipulacin del *5! En ;?=H se descubri el fenmeno llamado de restriccin ciertos fagos $virus bacterianos( que parasitan a E. coli podan desarrollarse en ciertas cepas de esta bacteria, pero no podan hacerlo en otras $se dice que est/n .restringidos. en determinadas cepas(. * finales de los %&, Lerner *rber, en #asilea, descubre las enzimas de restriccin responsables de ese fenmeno la cepa de bacteria restrictiva produce unas endonucleasas $.enzimas de restriccin, o restrictasas.( que escinden el *5! del fago crecido en otra cepa diferente. Esas primeras enzimas de restriccin eran inespecficas en cuanto al sitio del *5! donde cortaban, pero en ;?>& :amilton "mith, en #altimore, descubre un nuevo tipo de enzima de restriccin totalmente especfica capaz de reconocer una determinada secuencia de *5!, de unos pocos pares de bases, y de cortar en ambas cadenas en lugares concretos. *lgunas restrictasas reconocen como secuencia diana un trecho de ) pares de bases $pb(. ,tras restrictasas reconocen secuencias de % pares de bases. "e han descubierto restrictasas que cortan tras reconocer secuencias m/s largas. Las dianas de la mayora de las restrictasas de este tipo son secuencias palindrmicas, es decir, .capic-as. $nota la Q seala el punto de corte(. E1 =RB+Q+**''BHR HRB++DD+Q+B=R @uchas de estas restrictasas cortan en cada cadena en lugares separados del centro geomtrico de la diana $como en el e1emplo anterior(, de modo que generan e7tremos protuberantes. Los e7tremos protuberantes de distintos fragmentos de *5! generados con la misma restrictasa $incluso de fragmentos de especies distintas(, tienen tendencia, al mezclarlos, a empare1arse entre s por puentes de hidrgeno $siguiendo las reglas de empare1amiento *BD y +B'(. "i ahora aadimos la enzima *5!Bligasa a la mezcla de fragmentos de *5! de orgenes diferentes, se reparar/n los enlaces fosfodisteres. Esto es lo que realizaron por primera vez @ertz y 5avis en ;?>G, y enseguida se dan cuenta de que ello poda constituir la base para la produccin de molculas recombinantes in vitro, con material gentico de diferentes especies. 2ero este *5! recombinante, generado en el tubo de ensayo, es inerte, no es m/s que una macromolcula hbrida que por s sola no hace nada. "i queremos que el *5! recombinante haga algo, hay que introducirlo en clulas vivas que sean capaces de e7presar su informacin gentica. Esto nos lleva ya a la idea de lo que es la 4ngeniera +entica la formacin in vitro de nuevas combinaciones de material gentico, por medio de la insercin de un *5! de inters en un vehculo gentico $vector(, de modo que tras su introduccin en un organismo hospedero el *5! hbrido $recombinante( se pueda multiplicar, propagar, y eventualmente e7presarse. &.&.& La "eceta b1!ica $e 'n e2%e"i#ento $e Ingenie"a Gen.tica 6amos a ilustrar el concepto de la ingeniera gentica con el caso bastante f/cil de lograr bacterias que hospeden nuevas combinaciones de *5! 2artimos de *5! que queremos aislar y estudiar vamos a llamarlo *5! pasa1ero 2or otro lado, necesitamos un vehculo gentico para transportar y replicar ese *5! lo llamamos vector. Los vectores son igualmente molculas de *5! con capacidad de replicarse por s mismos o de insertarse una vez que se introducen en el organismo adecuado. :e aqu una lista de lo que debe poseer idealmente un vector gentico capacidad de replicacin autnoma $es decir, se trata de un replicn(, o de integracin en el genoma del hospedero. @arcadores seleccionables se trata de genes que confieren alg-n rasgo que se puede rastrear o seleccionar f/cilmente en laboratorio. Anos de los m/s usados son los genes que confieren resistencia a alg-n antibitico. 5ianas -nicas para al menos una enzima de restriccin. En los modernos vectores se ha introducido un trecho de *5!, denominado polilinker, provisto de varias dianas -nicas para diferentes enzimas de restriccin, de modo que en cada e7perimento se pueda elegir la que m/s convenga. Iinalmente, contamos con el organismo anfitrin o husped. En los primeros tiempos de la 4.+. se manipulaban casi e7clusivamente bacterias, pero hoy es posible modificar animales y plantas. *s, pues, el .retrato robot. de un e7perimento de 4.+. podra ser como sigue ;. "e corta por separado el *5! del organismo a estudiar y el *5! del vector con la misma restrictasa, de modo que se generan e7tremos compatibles entre s $mutuamente cohesivos(. G. "e 1untan ambos *5!s y se les aade *5!Bligasa de esta forma, las uniones entre *5! pasa1ero y *5! del vector se sellan covalentemente, gener/ndose molculas hbridas $quimricas o recombinantes(. H. *hora hay que introducir las molculas generadas en el organismos husped. En el caso de bacterias se recurre a una tcnica sencilla denominada transformacin, que permite la entrada del *5! a travs de las envueltas del microorganismo. ). Iinalmente, hay que localizar las bacterias que han captado y han establecido establemente las molculas hbridas. * menudo este es el paso m/s laborioso, pero el hecho de que el vector posea uno o varios genes de resistencia favorece al menos la eliminacin de las bacterias que no han recibido *5! del vector basta aadir al medio de cultivo el antibitico para el que el vector confiere resistencia. 2ara localizar los transformantes recombinantes, muchos vectores incorporar un gen marcador que produce alguna sustancia coloreada. "i insertamos el gen a aislar dentro de ese marcador, lo rompemos, por lo que las colonias bacterianas no producir/n la sustancia coloreada, sino que permanecen incoloras o blancas. =. El resultado del e7perimento es la obtencin de al menos una colonia $clon( de bacterias que portan la combinacin buscada de vector con el inserto de *5! pasa1ero. "e dice entonces que hemos clonado $Saislado( dicho *5!. El primer e7perimento de este tipo lo realizaron en ;?>H "tanley 'ohen y :erbert #oyer en la Aniversidad de 'alifornia. "e vio que era factible hacer toda clase de e7perimentos en los que se recombina *5! de organismos totalmente diferentes $bacterias, plantas, animales(. &.&.* Ca"acte"i3aci)n $el ADN clona$o Ana vez que se ha clonado un gen o trozo de *5!, hay que caracterizarlo lo m/s detalladamente posible Lo primero que se suele hacer es realizar un .mapa fsico.. 2ara ello, muestras independientes del *5! clonado son sometidas a distintas enzimas o combinaciones de enzimas de restriccin, y los fragmentos resultantes se separan por tamaos usando la electroforesis en gel de agarosa con la sustancia fluorescente bromuro de etidio, revel/ndose en forma de bandas visibles ba1o luz A6. * partir de los tamaos de las bandas generadas por las distintas enzimas y combinaciones de enzimas, es posible ensamblar el rompecabezas del fragmento, determinando un mapa donde se van colocando las localizaciones relativas de las distintas dianas de las restrictasas. * partir de la subclonacin de fragmentos del trozo original, es posible, en algunos casos, ir ad1udicando funciones a cada subfragmento, lo cual va generando en paralelo un .mapa gentico.. El -ltimo nivel $el m/s detallado( de caracterizacin fsica es la misma secuenciacin del *5!. En los primeros tiempos se usaba sobre todo el .mtodo qumico. de @a7am y +ilbert 2ero el m/s usado actualmente es el mtodo de terminacin de cadena mediante dideso7inucletidos $mtodo enzim/tico de "anger(. Ana modificacin del mtodo de "anger permite la secuenciacin autom/tica mediante lectura fluorimtica computerizada. &.&.4 Ot"o! #.to$o! b1!ico! &.&.4.1 Snte!i! 5'#ica $e ADN *ctualmente e7isten m/quinas programables para sintetizar r/pidamente secuencias determinadas de m/s de ;&& nucletidos. "e usan a menudo para generar sondas moleculares en la b-squeda y caracterizacin de determinados segmentos de *5!, y sobre todo para producir los cebadores usados en la reaccin en cadena de la polimerasa. &.&.4.& Reacci)n en ca$ena $e la %oli#e"a!a 6PCR7 !o cabe ninguna duda de que la tcnica m/s revolucionaria de los -ltimos ;= aos ha sido la reaccin en cadena de la polimerasa $2'J(, que ha dado nuevas alas a la propia 4ngeniera gentica y a toda la biologa molecular. Iue inventada por Tary @ullis a mediados de los aos <&. 'omo ya sabemos, muchas de las tcnicas cl/sicas de la 4ngeniera gentica estaban encaminadas a resolver el comple1o problema de cmo clonar o localizar un gen o un segmento de *5! concreto .perdido. en la inmensidad del genoma. "in embargo, esas tcnicas son a menudo largas y tediosas, y no es raro que no den resultados. La 2'J ha venido a cambiar el panorama, ya que permite en principio producir in vitro grandes cantidades de una secuencia de *5! concreta sin recurrir a la clonacin en un organismo husped. Esencialmente la tcnica permite la amplificacin selectiva de cualquier trecho de *5!, supuesto que se conocen las secuencias que lo flanquean. 'omo alguien ha dicho, .es una tcnica que consigue encontrar la agu1a en el pa1ar, al tiempo que produce un pa1ar de agu1as por amplificacin selectiva.. El %"inci%io 5'e !'!tenta la PCR El *5! de cadena doble que se quiere amplificar se calienta casi hasta ebullicin, de modo que se separan las dos cadenas, las cuales van a servir de moldes m/s adelante. "e aaden dos cebadores $normalmente fabricados por sntesis qumicaF ver apartado G.G.).;(. 'ada cebador es un corto oligonucletido, correspondiente a una de las secuencias que flanquean el trozo a amplificar. *l ba1ar la temperatura, cada cebador se empare1a por puentes de hidrgeno con la secuencia complementaria de una de las cadenas del molde, y obligar/ a la *5!Bpolimerasa a comenzar la copia de esa cadena molde complementaria $por supuesto, en sentido =RBNHR( *l aadir la *5!Bpolimerasa y los ) tipos de deso7inuclesidoBtrifosfato $d!D2s(, se produce la sntesis de las respectivas cadenas complementarias de cada molde, a partir de los respectivos cebadores. *l final de esta fase, tenemos el doble de cadenas de *5! de doble cadena respecto a las de partida. Luego la mezcla se vuelve a calentar hasta casi ebullicin, con lo que se vuelven a separar la cadenas, que en su forma de cadenas sencillas sirven para iniciar otro ciclo idntico al anterior, al final del cual tendremos el cu/druple de *5!. "i repetimos el protocolo n ciclos, el resultado ser/ G n copias a partir de las originales. La t.cnica b1!ica $e la PCR El *5! a usar no precisa ser purificado. La cantidad de partida puede ser min-scula $U; microgramo de *5! genmico(. 5e hecho se puede amplificar a partir de una sola molcula de molde. El empleo de *5!Bpolimerasas termorresistentes, como la Taq $procedente de la bacteria Thermus aquaticus descubierta 1unto a los giseres de Vello8stone(, evita tener que aadir polimerasa nueva en cada ciclo de amplificacin. En resumidas cuentas, el e7perimento suele realizarse seg-n este orden ;. En un tubito se mezcla el *5! molde, los dos cebadores $oligonucletidos(, los cuatro d!D2s y la *5!Bpolimerasa termorresistente. G. "e calienta a ?)W' durante = min, con lo que se separan las cadenas del *5! molde a amplificar, gener/ndose las correspondientes cadenas sencillas. H. "e ba1a la temperatura en torno a los %&W', de modo que cada cebador se empare1a con el e7tremo correspondiente de una de las cadenas del molde. "e dice que ahora tenemos los moldes cebados. ). "e sube la temperatura hasta >GW' $la ptima de funcionamiento de la Taq(, y se de1a durante = min, tiempo durante el que se est/ produciendo la sntesis in vitro de las cadenas complementarias de cada hebra molde. =. "e sube la temperatura a ?)W' durante G& segundos, suficientes para separar la cadena recin sintetizada respecto del molde original. %. Las cadenas sencillas generadas entran ahora en un nuevo ciclo $pasos ; al =(, y as sucesivamente, de modo que tras H&B%& ciclos obtenemos una amplificacin del *5! original de millones o miles de millones de veces. Dodo este proceso se realiza en unos aparatos autom/ticos llamados termocicladores, en los que se pueden fi1ar los par/metros de tiempos y temperaturas de cada paso del ciclo. El mtodo de 2'J fue patentado en ;?<>, y en principio fue comercializado por la empresa 'etus, si bien desde ;??; los derechos fueron adquiridos por :offmanBLa Joche y 2er9in Elmer. Las ganancias de este mtodo tan universalmente empleado son astronmicas. Las aplicaciones de la 2'J y de sus numerosas variantes son pr/cticamente ilimitadas simplifica sobremanera muchos e7perimentos de 4.+. permite muchos estudios de e7presin gentica secuenciacin directa de secuencias amplificadas deteccin de mutaciones seguimiento de la efectividad de tratamiento de enfermedades diagnsticos de enfermedades genticas e infecciosas en ciencia forense identificacin de restos biolgicos, determinacin de paternidad, pruebas periciales en criminalstica en arqueologa y paleontologa TECNOLOGIA MICROBIANA EN LA BIOTECNOLOGIA A"#i$a$i%& !e L'( P)i&$i"i'( !e Mi$)'*i'#'+ia I&,-(.)ia#, P)'$e('( /e)me&.a.i0'(, Mi$)'')+a&i(m'( I&,-(.)ia#e(, Ce"a( I&,-(.)ia#e(1 2)ea( !e La Bi'.e$&'#'+3a La utilizacin de los seres vivos, sus partes o los productos de su actividad para su uso industrial constituye la base de la biotecnologa. Existen ejemplos del uso biotecnolgico de microorganismos desde tiempos antiguos, como son la fermentacin de bebidas alcohlicas y la fabricacin de pan. Desde este prisma, incluso la seleccin y obtencin de diferentes variedades productivas de plantas y animales de inters agrcola y ganadero a lo largo de la historia podran considerarse aproximaciones biotecnolgicas. El descubrimiento y caracterizacin de los procesos de mantenimiento y flujo de la informacin biolgica ha provocado la expansin del n!mero de aplicaciones de la biotecnologa. Entornos cientficos e industriales cada vez m"s especializados y diversos, hacen uso en mayor o menor medida de la biotecnologa como herramienta para sus procesos. Esta diversidad ha determinado a su vez la necesidad de un sistema de clasificacin de los usos de la biotecnologa #ue los agrupe en funcin de sus caractersticas comunes o de su utilidad final. $omo resultado, actualmente se consideran cinco agrupaciones fundamentales de los usos biotecnolgicos, #ue han sido identificadas mediante un sistema de colores%
&iotecnologa 'oja
La biotecnologa roja agrupa todos a#uellos usos de la biotecnologa relacionados con la medicina. La biotecnologa roja incluye la obtencin de vacunas y antibiticos, el desarrollo de nuevos f"rmacos, tcnicas moleculares de diagnstico, las terapias regenerativas y el desarrollo de la ingeniera gentica para curar enfermedades a travs de la manipulacin gentica. (lgunos de los ejemplos m"s relevantes de biotecnologa roja son, la terapia celular y la medicina regenerativa, la terapia gnica y los medicamentos basados en molculas biolgicas, como los anticuerpos teraputicos
&iotecnologa &lanca
La biotecnologa blanca engloba a todos a#uellos usos de la biotecnologa relacionados con los procesos industriales. )or esta razn, la biotecnologa blanca es tambin conocida como biotecnologa industrial. La biotecnologa blanca presta especial atencin al dise*o de procesos y productos #ue consuman menos recursos #ue los tradicionales, hacindolos energticamente m"s eficientes o menos contaminantes. Existen numerosos ejemplos de biotecnologa blanca, como son la utilizacin de microorganismos para la produccin de productos #umicos, el dise*o y produccin de nuevos materiales de uso cotidiano +pl"sticos, textiles,- y el desarrollo de nuevas fuentes de energa sostenibles, como los biocombustibles. &iotecnologa (zul
La biotecnologa azul se basa en la explotacin de los recursos del mar para la generacin de productos y aplicaciones de inters industrial. .i tenemos en cuenta #ue el mar ofrece la mayor biodiversidad, potencialmente existe una enorme variedad de sectores #ue se pueden beneficiar de los usos de la biotecnologa azul. /uchos de los productos y aplicaciones de la biotecnologa azul se encuentran en fase de b!s#ueda o investigacin, si bien ya hay ejemplos de utilizacin de algunos de ellos de forma cotidiana. &iotecnologa 0erde
La biotecnologa verde se centra en la agricultura como campo de explotacin. Las aproximaciones y usos biotecnolgicos verdes incluyen la creacin de nuevas variedades de plantas de inters agropecuario, la produccin de biofertilizantes y biopesticidas, el cultivo in vitro y la clonacin de vegetales. La primera de estas aproximaciones es la #ue ha experimentado un mayor desarrollo y tambin la #ue ha suscitado mayor inters y controversia en la sociedad. La creacin de variedades modificadas de plantas se basa casi exclusivamente en la transgnesis, o introduccin en la planta de inters de genes procedentes de otra variedad u organismo. /ediante la utilizacin de esta tecnologa se persiguen tres objetivos fundamentales. En primer lugar, se busca la obtencin de variedades resistentes a plagas y enfermedades. ( modo de ejemplo, en la actualidad se utilizan y comercializan variedades de maz resistentes a plagas como el taladro. 1na segunda utilizacin de las plantas transgnicas est" orientada al desarrollo de variedades con mejores propiedades nutricionales +por ejemplo, mayores contenidos en vitaminas-. )or !ltimo, la transgnesis en plantas tambin se estudia como medio para obtener variedades de plantas #ue act!en como biofactoras productoras de sustancias de inters mdico, biosanitario o industrial en cantidades f"cilmente aislables y purificables. &iotecnologa 2ris
La biotecnologa gris est" constituida por todas a#uellas aplicaciones directas de la biotecnologa al medio ambiente. )odemos subdividir dichas aplicaciones en dos grandes ramas de actividad% el mantenimiento de la biodiversidad y la eliminacin de contaminantes. 'especto a la primera, cabe destacar la aplicacin de la biologa molecular al an"lisis gentico de poblaciones y especies integrantes de ecosistemas, su comparacin y catalogacin. 3ambin pueden incluirse las tcnicas de clonacin con el fin de preservar especies y la utilizacin de tecnologas de almacenamiento de genomas. En cuanto a la eliminacin de contaminantes o biorremediacin, la biotecnologa gris hace uso de microorganismos y especies vegetales para el aislamiento y la eliminacin de diferentes sustancias, como metales pesados e hidrocarburos, con la interesante posibilidad de aprovechar posteriormente dichas sustancias o utilizar subproductos derivados de esta actividad. P)'$e(' !e /e)me&.a$i%&: Es el proceso de catabolismo +ruptura- incompleto #ue es totalmente anablico +se da en un ambiente sin oxgeno-. La sustancia #ue se va a romper +catabolismo- es el nutrimento. El nutrimento es roto por la actividad enzim"tica +complejo enzima sustrato-. El fin de la fermentacin es proporcionar energa al organismo #ue la est" realizando. La fermentacin la realizan m"s #ue todas las bacterias, hongos. Es el proceso energtico m"s primitivo de los seres vivos. El primer ser vivo, #ue era unicelular, microscpico y procarionte, utilizo ese mecanismo para obtener energa de los nutrientes #ue haban en los mares primitivos. A4 /e)me&.a$i%& L5$.i$a: En este tipo de fermentacin el microorganismo oxida el nutrimento hasta convertirlo en un compuesto llamado 4cido l"ctico y (3). Este proceso lo realizan muchas bacterias +llamadas bacterias l"cticas-, hongos, algunos protozoos y muchos tejidos animales5 en efecto, la fermentacin l"ctica B4 /e)me&.a$i%& A#$'6%#i$a: Es un proceso biolgico de fermentacin en plena ausencia de aire +oxgeno 6 78-, originado por la actividad de algunos microorganismos #ue procesan los hidratos de carbono +por regla general az!cares% como pueden ser por ejemplo la glucosa, la fructosa, la sacarosa, el almidn, etc.- para obtener como productos finales% un alcohol en forma de etanol +cuya frmula #umica es% $9:6$98679-, dixido de carbono +$78- en forma de gas y unas molculas de (3) #ue consumen los propios microorganismos en su metabolismo celular energtico anaerbico. C4 /e)me&.a$i%& a$7.i$a(: Es un tipo de fermentacin (erbica usada por las bacterias del genero (cetobacter. Estas bacterias usan compuestos de alcohol para romper sus enlaces y obtener energa +(3)- el producto de desecho es el "cido acetico. U('( ,e #a 8e)me&.a$i%&: Los usos de la fermentacin se deben a #ue los productos de desechos son de inters industrial. (#u nadie sale perjudicado. Los microorganismos usan los nutrientes, especialmente los carbohidratos, y los descomponen o a "cido l"ctico, o a "cido actico, o a (lcohol. ;osotros los seres humanos usamos esos productos de la descomposicin de los nutrientes y los empleamos para usos industriales. por ejemplo el m"s conocido es la produccin de cerveza. Mi$)'')+a&i(m'( I&,-(.)ia#e(: Los microorganismos #ue sintetizan productos !tiles para el hombre representan, como m"ximo, unos pocos centenares de especies de entre las m"s de <===== descritas en la ;aturaleza. Le0a,-)a( Las levaduras se vienen utilizando desde hace miles de a*os para la fabricacin de pan y bebidas alcohlicas. La levadura #ue sin duda fu la primera y a!n hoy en da sigue siendo la m"s utilizada por el hombre es Saccharomyces cerevisiae de la #ue se emplean diferentes cepas para la fabricacin de cerveza, vino, sa>e, pan y alcoholes industriales. Kluyveromyces fragilis es una especie fermentadora de la lactosa #ue se explota en pe#ue*a escala para la produccin de alcohol a partir del suero de la leche. Yarrowia lipolytica es una fuente industrial de "cido ctrico. Trichosporum cutaneum desempe*a un importante papel en los sistemas de digestin aerbica de aguas residuales debido a su enorme capacidad de oxidacin de compuestos org"nicos, incluidos algunos #ue son txicos para otras levaduras y hongos, como los derivados fenlicos. 9'&+'( 8i#ame&.'('( Los hongos tienen una gran importancia econmica, no tan slo por su utilidad, sino tambin por el da*o #ue pueden causar. Los hongos son responsables de la degradacin de gran parte de la materia org"nica de la 3ierra, una actividad enormemente beneficiosa ya #ue permite el reciclaje de la materia viva. )or otro lado, los hongos causan gran cantidad de enfermedades en plantas y animales y pueden destruir alimentos y materiales de los #ue depende el hombre. Ba$.e)ia( Entre las especies bacterianas de inters industrial est"n las bacterias del "cido actico, Gluconobacter y Acetobacter #ue pueden convertir el etanol en "cido actico. El gnero Bacilluses productor de antibiticos +gramicidina, bacitracina, polimixina-, proteasas e insecticidas. Del gnero Clostridium cabe destacar Clostridium acetobutylicum #ue puede fermentar los az!cares originando acetona y butanol. Las bacterias del "cido l"ctico incluyen, entre otras, las especies de los gneros Streptococcus y Lactobacillus #ue producen yogur.Corynebacterium glutamicum es una importante fuente industrial de lisina. El olor caracterstico a tierra mojada se debe a compuestos vol"tiles +geosmina- producidos por Streptomycesaun#ue su principal importancia radica en la produccin de antibiticos como anfotericina &, >anamicina, neomicina, estreptomicina, tetraciclina, etc. Ce"a(: Es, en microbiologa, una variante fenotpica de una especie o, incluso, de un taxn inferior, usualmente propagada clonalmente, debido al inters en la conservacin de sus cualidades definitorias. De una manera m"s b"sica puede definirse como un conjunto de especies bacterianas #ue comparten, al menos, una caracterstica. Existen sociedades cientficas, las colecciones de cultivos tipo, #ue almacenan una gran diversidad de microorganismos y #ue los difunden a peticin de los investigadores5 en dichas colecciones, la atribucin taxonmica de cada clon est" perfectamente asegurada hasta el nivel de cepa. Las cepas se pueden agrupar seg!n sus caractersticas comunes% biovar o biotipo, #ue son a#uellas cepas #ue tienen caractersticas bio#umicas y fisiolgicas especiales. morfovar o morfotipo, con morfologa especfica. serovar o serotipo, con caractersticas antignicas especficas. patovar o patotipo, con propiedades patgenas para ciertos hospedadores. fagovar o fagotipo, con especificidad para lisar ciertos bacterifagos METABOLISMO /ERMENTATIVO : M;TO!OS !E /ERMENTACI<N =CONTINUA : !ESCONTINUA4 Me.a*'#i(m' !e La /e)me&.a$i%&: La fermentacin es un tipo especfico de metabolismo hetertrofo #ue utiliza carbono org"nico en vez de oxgeno como receptor terminal de electrones. Esto significa #ue estos organismos no utilizan una cadena de transporte de electrones para oxidar ;(D9 a ;(D? y por lo tanto deben tener un mtodo alternativo para usar esta energa reductora y mantener una fuente de ;(D? para el funcionamiento apropiado de las rutas metablicas normales +por ejemplo, la glicolisis-. )uesto #ue no re#uieren oxgeno, los organismos fermentantes son anaerobios. /uchos organismos pueden utilizar fermentacin bajo ciertas condiciones anaerobias y respiracin cuando el oxgeno est" presente. Estos organismos son anaerobios facultativos. )ara evitar la superproduccin de ;(D9, los organismos fermentantes obligados generalmente no tienen un ciclo completo del "cido ctrico. El (3) en organismos fermentantes es producido por la fosforilacin a nivel de sustrato donde un grupo fosfato se transfiere de un compuesto org"nico de gran energa al (D) para formar el (3). /e)me&.a$i%& L5$.i$a piruvato ? ;(D9 ? 9?6666666@ "cido l"ctico ? ;(D? .e produce en muchas bacterias +bacterias l"cticas-, tambin en algunos protozoos y en el m!sculo es#ueltico humano. Es responsable de la produccin de productos l"cteos acidificados 666@ yoghurt, #uesos, cuajada, crema "cida, etc. El "cido l"ctico tiene excelentes propiedades conservantes de los alimentos. /e)me&.a$i%& A#$'6%#i$a: Dos reacciones sucesivas% piruvato 66666666@ acetaldehido ? $78 acetaldehido ? ;(D9 ?9? 6666666@ etanol ? ;(D? .e lo encuentra en levaduras, otros hongos y algunas bacterias. La fermentacin alcohlica es la base de las siguientes aplicaciones en la alimentacin humana% pan, cerveza, vino y otras. /e)me&.a$i%& C'&.i&-a : !e($'&.i&-a: /e)me&.a$i%& C'&.i&-a: En la fermentacin continua establece un sistema abierto. La solucin nutritiva estril se a*ade continuamente al biorreactor y una cantidad e#uivalente de solucin utilizada de los nutrientes, con los microorganismos, se saca simult"neamente del sistema. El objetivo fundamental de la industria de las fermentaciones es incrementar los rendimientos. Este objetivo puede alcanzarse si se desarrolla el tipo de fermentacin m"s adecuado para cada paso en particular. .i bien los procesos de fermentacin continua no se utilizan de forma general en la industria, debido fundamentalmente al mayor nivel de experiencia #ue se tiene en el crecimiento de clulas en fermentacin discontinua, el coste de produccin de biomasa mediante cultivo continuo es potencialmente inferior al de cultivo discontinuo. De este modo se han instalado plantas de produccin para la produccin continua de protena de origen unicelular a partir de n6alcanos, compuestos $< y almidones. (un#ue muchas fermentaciones para la produccin de metabolitos funcionan bien como procesos continuos, slo unos pocos procesos han resultado !tiles para la aplicacin pr"ctica por varias razones% a1> /uchos mtodos de laboratorio operan continuamente durante solamente 8= a 8== horas5 para #ue sea de utilidad industrial el sistema debe ser estable durante al menos A== a <.=== horas. *1> /antener las condiciones estriles a escala industrial a lo largo de un largo perodo de tiempo es difcil. $1> La composicin de los sustratos debe ser constante a fin de obtener una produccin m"xima. La composicin de las soluciones de nutrientes industriales son variables. Lo #ue puede originar cambios en la fisiologa de la clula y disminuir la productividad. ,1> $uando se utilizan cepas de alto rendimiento se producen mutacin, los cuales pueden crecer en cultivo continuo m"s deprisa #ue las cepas de produccin por lo #ue el rendimiento disminuye con el tiempo ya #ue cada vez son menos clulas las #ue sintetizan el producto de inters. /e)me&.a$i%& !e($'&.i&-a: 1na fermentacin discontinua +en batch- puede ser considerada como un Bsistema cerradoB. (l inicio de la operacin se a*ade la solucin esterilizada de nutrientes y se inocula con el microorganismo, permitiendo #ue se lleve a cabo la incubacin en condiciones ptimas de fermentacin. ( lo largo de toda la fermentacin no se a*ade nada, excepto oxgeno +en forma de aire-, un agente antiespumante y "cidos o bases para controlar el ph. La composicin del medio de cultivo, la concentracin de la biomasa y la concentracin de metabolitos cambia generalmente como resultado del metabolismo de las clulas observ"ndose las cuatro fases tpicas de crecimiento% fase de latencia, fase logartmica, fase estacionaria y fase de muerte. En los procesos comerciales la fermentacin frecuentemente se interrumpe al final de la fase logartmica +metabolitos primarios- o antes de #ue comience la fase de muerte +metabolitos secundarios-.