UNIVERSIDAD NACIONAL MAYOR DE SAN

MARCOS
FACULTAD DE QUMICA E INGENIERA
QUMICA
BIOQUMICA
FRED GARCA ALAYO, Ph. D.
Mg. JUAN CARLOS WOOLCOTT HURTADO

MECANISMOS DE CATLISIS
ENZIMTICA.

1a. LISOZIMA: mecanismo qumico de catlisis

El sustrato consisten en un polmero alternado de Nacetil

glucosamina (NAG) y n acetil-murmico (NAM)
Como se muestra arriba, la hidrlisis se inicia con la ruptura del
enlace O-C por catlisis cida, a partir de lo cual se forma un in
carbnio.
Luego de la salida del producto (alcohol), el in carbonio
reacciona con un hidroxilo que realiza un ataque nucleoflico
regenerando el hemiacetal correspondiente

 La formacin del hidroxilo ocurre en el sitio activo a partir

de una molcula de agua que pierde su protn por accin
de la base conjugada del mismo aminocido que realiz la
catlisis cida inicial, con esto el aminocido recupera su
protn y el oxgeno del agua se convierte en un nuclefilo
muy activo.

El aminocido encargado de realizar catlisis cida sobre el acetal y catlisis bsica

sobre el agua es el glutmico 35.
Por otra parte, el aspartico 52 (53 en la lizosima humana), que posee un pKa ms bajo
se encuentra ionizado al pH ptimo y su carga negativa permite estabilizar el in
carbonio intermediario.
Cuando el ASP 52 fue "mutado a GLU", la enzima se volvi 1000 veces ms lenta,
posiblemente debido a que su mayor cercana al in carbonio permite la formacin de
un aducto covalente que se libera muy lentamente del sitio activo.

3b. L-ASPARTATO AMINOTRANSFERASA:

mecanismo qumico de catlisis

La L-aspartato cataliza la deaminacin oxidativa del L-aspartato

produciendo empleando fosfato de piridoxal (PLP) como cofactor, el cual
es reducido a fosfato de pirodoxamina (PMP).
Se trata de una reaccin redox interna en la que el la el cofactor resulta
reducido.
En este tipo de enzimas, a semejanza de las deshidrogenasas que
emplean FAN o FMN fuertemente unidos como grupos prostticos, el
problema consiste en que el cofactor reducido debe regenerarse para
que la enzima pueda volver a catalizar la reaccin.
Al igual que en las deshidrogenasas, este problema es resulto empleando
piruvato como aceptor y catalizando la reaccin en reversa

2b. CARBOXIPEPTIDASA A: mecanismo qumico de

catlisis

El sustrato es otra protena que posea el extremo carboxilo libre. La enzima tiene
preferencia por aminocidos aromticos, aunque puede cortar con casi todos,
excepto si el ltimo aminocido es la prolina (por qu?)
La reaccin qumica consiste en la hidrlisis del ltimo enlace peptdico en la que
el protn del agua se aade al lado amino y el oxhidrilo al carbonilo del enlace.
Aunque la reaccin es exergnica, el enlace peptdico es el derivado carbonlico
ms estable en la serie aldehdo < cetona < anhdrido < tioester < ester < amida <
amida N-substituida, por lo que es difcil de hidrolizar. De hecho, la hidrlisis
qumica requiere HCl 6 N a 90oC por varios das para completarse.

 El sitio activo de esta enzima posee un tomo de zinc, adems de los

residuos del GLU270 y la ARG127, que tambin participan.
Aunque se han propuesto varios mecanismos, el ms aceptado es el que
se muestra abajo y est basado en una combinacin de datos cinticos
qumicos y cristalogrficos.
Estos ltimos revelan que en el sito activo, una molcula de agua se
encuentra coordinada al zinc.
El protn del agua coordinada al zinc es hasta 6
unidades de pH ms cido que las molculas de agua
en la solucin (cunto vale el pKa del agua?). De este
modo, el GLU270 (en su forma bsica) puede
fcilmente abstraer dicho protn, lo que facilita el
ataque nucleoflico del oxhidrilo resultante sobre el
carbono carbonlico. Este ltimo adems se encuentra
activado por un enlace inico entre el oxgeno y la
ARG127. Como resultado del ataque se forma un
intermediario tetrahdrico con el carbonilo hidratado,
el cual es estabilizado porque el par de electrones
sobre el oxgeno puede acomodarse en la posicin 5
de coordinacin del Zinc. Ahora el GLU270 hace la
funcin de cido protonando a la amina, casi
inmediatamente hace funciones de base al
desprotonar al hidrato y vuelve a perder este protn
con la amina. Los productos son liberados y es
razonable asumir que la salida del carboxilato recin
formado es acompaada de la entrada de otra
molcula de agua que restituye la esfera de
coordinacin del zinc.

GRACIAS