APLICACIONES DE LA ESTRUCTURA DEL ADN EN NANOMATERIALES

I. INTRODUCCIN:
La tecnologa moderna cambia a gran velocidad, pero en particular el ritmo del
progreso en electrnica basada en estado slido es frentico y vertiginoso.
Desde la invencin del transistor y el posterior desarrollo de circuitos
integrados, 1 se ha vuelto necesario, y compulsivo, fabricar objetos de uso
diario ms pequeos, ms porttiles, fciles de manipular y maniobrar. En este
mpetu de elaboracin de nuevos productos, se ha generado una tendencia
hacia la miniaturizacin. Esta tendencia ha tomado una nueva dimensin en
aos recientes con el uso de materiales de tamao entre 1 a 100 nanmetros
(1 nm = 109 m), conocidos como nanomateriales. Un nanmetro es
aproximadamente 80 mil veces ms pequeo que el grosor de un cabello
humano.
Un enfoque moderno en la fabricacin de nanomateriales es una aproximacin
con tendencia hacia la amplificacin, iniciando con bloques de construccin a
escala atmica y ensamblados de manera controlada, contrario a los mtodos
de miniaturizacin convencionales. A esta nueva tcnica para crear productos
compuestos por nanomateriales se le ha llamado nanotecnologa. sta alude a
la fabricacin de materiales funcionales, dispositivos y sistemas, controlando la
materia a escala nanomtrica y explorando fenmenos novedosos que
conduzcan a una diversidad de propiedades fsicas, qumicas y biolgicas a
esa escala. Cuando se manipula o sintetiza la materia a escala atmica y
molecular, surgen fenmenos y propiedades totalmente nuevas, tales como la
cuantizacin de la conductividad, el autoensamble molecular, la corriente de
espn polarizado, entre otras. El control de la sntesis y propiedades deseables
de materiales nanomtricos es primordial para el desarrollo de prototipos con
gran mercado potencial, como la electrnica.
En las ltimas cuatro dcadas, el desarrollo sostenido en tecnologas de
circuitos integrados para procesadores y memorias ha revolucionado la
industria de computadoras y aparatos electrodomsticos con capacidad de
memoria no voltil cada vez mayor; por ejemplo, iPod, celulares, memorias
USB, etctera (ITRS, 2005). Sin lugar a dudas, el corazn y cerebro de los
circuitos integrados y, por tanto, de la electrnica moderna es el transistor.
Precisamente, recin se celebr el 60 aniversario de la invencin del transistor,
el bloque esencial de construccin del mundo digital actual. Esto ocurri entre
el 17 de noviembre y 23 de diciembre de 1947 (Sin autor, 2007). Este primer
transistor meda aproximadamente 1.3 cm, un verdadero gigante comparado
con los dispositivos electrnicos actuales ya que un microprocesador de ese
tamao contiene hoy da cientos de millones de transistores. Fue tal la
importancia de este descubrimiento que en poco tiempo los transistores y
diodos de estado slido reemplazaron los engorrosos, pesados y costosos

tubos de vaco. Esto, a su vez, transform, la vida cotidiana al suministrar

circuitos integrados cada vez ms pequeos: microcircuitos (1 micra = 106m).
El desarrollo de microcircuitos integrados aceler esta revolucin tanto que a la
fecha hay un frenes en nuestra sociedad contempornea por conseguir
productos domsticos ms pequeos, ms rpidos y con mayor capacidad de
memoria no voltil. Esta reduccin en tamao y el consecuente incremento en
el nmero de transistores en circuitos integrados, fue observado por Gordon
Moore desde 1965. Moore public una prediccin acerca de la tendencia de
que el nmero de transistores en un circuito integrado se duplica
aproximadamente cada 18 meses, a esto se le ha llamado Ley de Moore
(Moore, 1965). La Ley de Moore no slo predice que las computadoras tendrn
microprocesadores ms rpidos y con mayor capacidad, sino que su costo real
disminuir. El costo de un transistor en el procesador Centrino Duo de Intel es
aproximadamente una millonsima parte del precio promedio que tena un
transistor en 1968 (Sin autor, 2007).
Las caractersticas necesarias en los nuevos dispositivos electrnicos han
requerido que el tamao de los componentes sea de escala nanomtrica, es
decir, la de las molculas. Por ejemplo, las fluctuaciones en el tamao de los
dispositivos electrnicos pueden resultar en una gran dispersin en sus
caractersticas elctricas a escala nanomtrica que afecten parmetros tales
como corrientes de encendido y apagado. Los mtodos de escalamiento
convencionales en la industria de dispositivos electrnicos encaran retos
tecnolgicos y de ciencia bsica crecientes (Likharev, 2003). La tcnica
convencional de manufactura en la industria de los semiconductores de estado
slido es la fotolitografa, la cual es el mtodo de miniaturizacin por
antonomasia, utilizando una longitud de onda en la regin uv del espectro.
Debido a limitaciones fsicas, la fotolitografa2 puede producir componentes de
unas cuantas dcimas de micra de tamao. Actualmente se est llevando a
cabo intensa investigacin para reducir an ms el tamao de los
componentes. Mtodos de fotolitografa de la siguiente generacin se basaran
en longitudes de onda de uv extrema y rayos x que potencialmente permitiran
la produccin de componentes de tamao igual o menores a 100 nm. Sin
embargo, los enormes costos econmicos asociados con esta tcnica y graves
problemas inherentes de fabricacin, como la degradacin de la ptica usada,
han hecho que se busquen alternativas en la construccin de componentes
electrnicos.

Para
continuar con la tendencia predicha por la Ley de Moore, como ya se
mencion, hay un inters creciente en nanotecnologa por buscar alternativas a
los mtodos convencionales de miniaturizacin (mtodos top-down) usados en
la actualidad en la fabricacin de dispositivos electrnicos. Una de estas
alternativas para disear dispositivos a escala nanomtrica se basa en
mtodos de amplificacin (bottom-up) usando ya sea mtodos de sntesis
inorgnica que requieren de sistemas de ultra alto vaco (Likharev, 2003;
Lieber, 2001) o molculas bioorgnicas como cido desoxirribonucleico (ADN)
(Seeman, 2004A; Luo, 2003; Braun y Sivan,
2004). Un bloque de construccin esencial en un dispositivo electrnico a
escala nanomtrica son los nano alambres de conductores y semiconductores.
Para que las nanoestructuras sean soportes efectivos en el diseo y
construccin de circuitos integrados, al menos una de las dimensiones del
dispositivo es crtica: el dimetro del nano alambre (Lieber, 2003).
El control en el dimetro de nano alambres representa una de las
caractersticas clave que motivan esfuerzos encaminados a desarrollar
mtodos de amplificacin, ya que est ms all de lo que se consigue en
fotolitografa. El crecimiento de nanoestructuras de manera controlada y
predecible implica que los materiales con distinta composicin qumica,
estructural, morfolgica y de tamao puedan ser ensamblados por diseo a la
medida para construir dispositivos funcionales y circuitos integrados (Braun y
Sivan, 2004; Lieber, 2003). Los mtodos de sntesis inorgnica, tales como
ablacin lser y depsito por capa atmica, resultan ser muy costosos y
requieren de ausencia total de contaminantes, lo que los hace inconvenientes.
Este paradigma de los mtodos de amplificacin, anlogo a la forma en la que
la biologa ha trabajado con los seres vivos tan exitosamente, puede probar ser
una solucin a los retos tecnolgicos que ha encarado la industria electrnica.
De esta manera, encontrar nuevas estrategias para incrementar la densidad de
dispositivos y reducir el tamao de circuitos integrados es un fin deseado por la
tecnologa actual.

Las biomolculas son componentes particularmente e prometedoras en

procesos de autoensamble debido a sus capacidades de enlace
perfeccionadas durante miles de millones de aos de evolucin de la vida en la
Tierra.
Por ejemplo, los oligonucletidos de ADN tienen capacidades de
reconocimiento molecular nicas debido a la especificidad de apareamiento de
sus bases (Seeman, 2004A; Luo, 2003). Esto convierte al ADN en candidato
idneo para la sntesis de nanoestructuras. Adems los cidos nucleicos se
pueden procesar con exactitud nanomtrica por medio de enzimas como
nucleasas y polimerasas.
II

.MARCO TEORICO:
Existen diferencias fundamentales entre los materiales construidos por la
naturaleza y aquellos por cientficos en materiales. Para los bilogos, 3 500
millones de aos de evolucin en la Tierra han construido al ms fascinante de
los materiales: los organismos vivos. Sorprendentemente, stos estn
formados slo por unas cuantas macromolculas de un nmero limitado de
bloques de construccin. De ninguna manera esto implica que los seres vivos
sean organismos sencillos, todo lo contrario. Por otro lado, desde hace unos
cuantos cientos de aos, los cientficos tambin han fabricado materiales
admirables, desde plsticos hasta dispositivos electrnicos, los cuales sin
asombrarnos tanto, por ser cotidianos, estn formados de muchas clases
diferentes de bloques de construccin. Tal vez, debido a la falta de un lenguaje
comn, ha habido una separacin entre estos dos campos: Biologa Molecular
y Ciencia de Materiales. El mpetu de nuevas tecnologas con procesos de
sntesis a escalas menores a 100 nm nos indica que ha llegado el momento de
establecer un puente comn entre ellos.
Las afinidades entre Biologa Molecular y Ciencia de Materiales son mucho
mayores de lo que antes nos pudimos haber imaginado. Uno de los objetivos
iniciales en ambas ciencias es la construccin de materiales a nivel molecular.
La convergencia de Biologa Molecular y Ciencia de Materiales suministrar
nuevas ideas, rutas y sinergia. Los cientficos en materiales estn empezando
a tomar la idea de usar molculas biolgicas como bloques de construccin en
el diseo y construccin de nuevos materiales.
De manera semejante, cada vez ms bilogos estn aprendiendo mtodos
tradicionalmente usados en ciencia de materiales para sus fines.
LAS BIOMACROMOLCULAS EN ORGANISMOS VIVOS:
Despus de la determinacin de la estructura del ADN en 1953, la biologa
molecular ha progresado rpidamente (Watson y Crick, 1953). El ritmo de
progreso se increment desde la invencin de la reaccin en cadena de
polimerasa (pcr). sta es una tcnica de amplificacin, la cual hace crecer

exponencialmente la cantidad de molculas de ADN de secuencia especfica a

partir de una gua (Alberts et al., 2002). La tecnologa del ADN recombinante ha
permitido entender los principios bsicos de muchos procesos bioqumicos, y
abri la puerta de la biotecnologa moderna. Actualmente es posible modificar
mediante ingeniera gentica clulas bacterianas relativamente sencillas y se
est en camino de modificar organismos complejos. As se considera que nos
encontramos en la era postgenmica con la decodificacin del genoma
humano. Esencialmente, la biologa molecular trata de entender la vida desde
un punto de vista molecular y as se han derivado disciplinas tales como
gentica molecular, evolucin molecular, medicina molecular, etc. Las
aplicaciones de la biologa molecular tambin se pueden extender a reas no
biolgicas tales como ciencia de materiales. Esta tendencia se ha acrecentado
enormemente con el continuo progreso en nanociencia y nanotecnologa. Es
slo cuestin de tiempo antes de que veamos ADN y protenas en materiales
cotidianos y dispositivos electrnicos.

PROPIEDADES DEL ADN:

La nanoescala es la escala de las molculas. Una distancia de alrededor de

0.15 nm entre dos tomos forma un enlace molecular tpico. La doble hlice de
ADN es una nanoestructuras con un dimetro de 2 nm y gira para formar un
ciclo completo cada 3.5 nm, comprendiendo aproximadamente 10 nucletidos.
El ADN puede estar formado por una cadena sencilla (csADN) o una cadena
doble (cdADN). Cada cadena de ADN est constituida por unidades qumicas o
monmeros denominados nucletidos. Cada nucletido est formado por un
anillo de tomos de carbono y nitrgeno (base nitrogenada), un azcar cclico
(pentosa, en este caso desoxirribosa) y un grupo fosfato. Las bases
nitrogenadas son de dos tipos: pricas y pirimdicas. Las bases pricas son
adenina (a) y guanina (g), y las pirimdicas son citosina (c), timina (t) y uracilo
(u). La repeticin secuencial de molculas de azcar ligadas entre s, va
enlaces fosfodister, se conoce como esqueleto. Estos enlaces dan a todas
las cadenas de ADN una polaridad qumica. Un extremo termina en un grupo
fosfato (llamado 5 debido a que la posicin del grupo fosfato est en el
carbono 5 del anillo de azcar), y el otro extremo en una molcula de azcar
cuyo carbono 3 tiene un grupo hidroxilo (llamado el extremo 3) (Ibid).
Todas las secuencias de ADN, por convencin, se escriben de 5 a 3 a menos
que se especifique de otra manera. Tanto el grupo fosfato 5 como el hidroxilo 3
son tiles para manipular al ADN. El formato comn de ADN en organismos
vivos es una doble hlice que consiste en dos cadenas de ADN unidas por
puentes de hidrgeno entre las bases de cada cadena. Las cadenas de ADN se
aparean en direcciones opuestas, formando cadenas antparalelas, una de 5 a
3 y la otra de 3 a 5, y se les llama cadenas complementarias. El apareamiento
especfico y no-covalente entre las bases es tal que solamente a ser aparea
con t (a-t), y c con g (c g). Esto hace que el ADN sea auto programable, una

propiedad extremadamente til en el diseo y construccin de nuevos

materiales. Por analoga, es posible imaginar el apareamiento de bases
complementarias como tiras de velcro de diferente color, de tal manera que
slo las de color complementario se pueden pegar (azul a con amarillo t y rojo
c con verde g). Adems, el apareamiento es reversible: la cdADN se puede
separar en dos csADN por calentamiento o aumentando el pH. A este proceso
se le llama desnaturalizacin del ADN.

El ADN se puede ver como un copolmero en el que la distribucin de unidades

repetidas a-t y c-g es aleatoria, aunque la naturaleza aleatoria de estas
unidades convierte al ADN en portador de la informacin gentica en
organismos vivos. Desde el punto de vista tecnolgico, el significado de la
informacin gentica embebida en las secuencias, generalmente, se puede
ignorar por completo, aunque el contenido qumico relativo de las secuencias
influir en las propiedades de las estructuras de ADN.
El descubrimiento hace 55 aos de la estructura de cdADN con helicidad
positiva, o derecha, ha revolucionado a la ciencia y a la sociedad (Watson y
Crick, 1953). La mayor parte del impacto ha estado relacionado con las
propiedades genticas y hereditarias del ADN, que est determinado por las
secuencias a-t y c-g (Alberts et al., 2002). Sin embargo, las molculas de
ADN tambin posee propiedades fsicas y qumicas las cuales los convierten
en una sustancia ideal para disear y construir materiales.
Mecnicamente, el ADN puede ser tanto flexible como rgido dependiendo de si
las molculas son ms cortas que su longitud de persistencia (Luo, 2003). La
longitud de persistencia es alrededor de 50 nm para cdADN y unos cuantos
nanmetros para csADN. Los tamaos de las molculas de cdADN se pueden
controlar de la escala nanomtrica a la milimtrica. El mdulo de Young de
cdADN es aproximadamente de 310 gpa, similar al plexigls. El ADN no slo

puede tener helicidad positiva, tambin llamada ADN-b, sino que tambin
puede tener helicidad negativa, tambin llamada ADN-z. La mayora del ADN
en la naturaleza es b-ADN. De aqu que para utilizar el ADN como
nanoestructuras, lo ms til es fijarlo y estirarlo en lnea recta sobre la
superficie de un sustrato en un ambiente seco para formar fibras paralelas de
ADN (Allemand et al., 1997).
Qumicamente, el ADN es no txico, estable y soluble en agua. Sobre todo, es
fcilmente manipulable. Gran cantidad de mtodos fsicos y qumicos pueden
procesar ADN con exactitud nanomtrica. Por ejemplo, el ADN se puede
segmentar o cortar en sitios especficos utilizando ms de 3 000 enzimas de
restriccin (Roberts y Macellis, 2001) y puede volverse a unir o ligar covalente y
selectivamente por medio de enzimas ligasas. El nmero de estas
herramientas es enorme y sobrepasa aquellas para cualquier polmero sinttico
o natural.

OBTENIENDO Y MANIPULANDO ADN:

El ADN genmico se puede obtener y purificar a partir de organismos
cultivados, incluyendo bacterias, levadura, y clulas de mamferos o plantas.
Esto se logra escindiendo fsicamente las clulas va disrupcin mecnica y/o
digestin enzimtica. Posteriormente, el ADN se puede precipitar con
isopropanol en la presencia de alto contenido salino. En la actualidad, la
forma ms sencilla de aislar ADN es a travs de cromatografa y estuches
(kits) de purificacin de diversas marcas comerciales. El ADN del bacterifago
l, fago de la bacteria E. coli, se ha estudiado ampliamente en
Biologa Molecular, por lo que se ha convertido en fuente comercial comn de
ADN. En particular, nuestro grupo de investigacin ha utilizado a ste para la
sntesis de nano alambres de plata mediados por ADN (Oviedo, 2007) tal y
como comentaremos posteriormente. Una de las tcnicas ms comunes para
amplificar ADN es mediante pcr.

sta es una reaccin qumica en cadena que amplifica un cdADN en forma

exponencial (Alberts et al., 2002). Es una herramienta de laboratorio tan
poderosa que es posible tener un gran nmero de copias de un fragmento
particular de ADN, a partir de una copia nica. Adems, pcr en tiempo real (rtpcr) usa espectroscopia de fluorescencia para monitorear el proceso,
haciendo posible la cuantificacin y la comparacin. Adems de pcr, tambin
hay gran cantidad de herramientas para manipular ADN, entre las ms
comunes estn las enzimas, mismas que llevan a cabo una amplia variedad
de tareas. Por ejemplo, hay cierta clase de enzimas, como las endonucleasas,
las cuales funcionan como tijeras que cortan o escinden cadenas de ADN
en sitios internos. Por el contrario, hay otras como las exonucleasas que
cortan cadenas de ADN en extremos terminales, como
lijado del ADN. Las enzimas de restriccin pueden reconocer y cortar, de
manera precisa, diferentes secuencias de ADN. Por otro lado, nucleasas no
especficas, tal como la nucleasa, digieren tanto csADN como cdADN a
mononucletidos, semejante a un molido fino del ADN. Adems, el ADN se
puede extender por medio de diversas polimerasas, algunas de ellas como la
Taq polimerasa realizan este proceso a altas temperaturas (Ibid). Las cadenas
de ADN tambin se pueden enlazar de forma covalente a travs de ligasas,
cuya funcin es similar a la de un pegamento permanente. Las ligasas son
tiles para unir dos fragmentos de ADN que poseen extremos
complementarios o rasurados.
Por ltimo, los extremos 5 y 3 de cadenas de ADN se pueden modificar
durante la sntesis usando grupos amino o tiol, biotina, o un compuesto
fluorescente. En particular, esto hace al ADN an ms verstil en el diseo y
construccin de nanomateriales.
En efecto, otra forma de obtener ADN para la sntesis de nanomateriales es a
partir de oligonucletidos u oligos (pequeas secuencias de csADN que
contienen de unas cuantas a varias decenas de bases). El precio de la
sntesis de oligonucletidos con una alta eficiencia contina disminuyendo,
por lo que es ms conveniente conseguirlos comercialmente que sintetizarlos
en el laboratorio. Pares de oligos con bases complementarias (a-t, c-g) de
ADN se pegan para formar una nanoestructura previamente diseada. El
auto ensamblado de oligos para formar una nanoestructura de ADN es
semejante a cmo se unen dos tiras complementarias de velcro. Ahora bien,
si en los extremos de una nanoestructura unidimensional quedan pequeas
secciones de oligos sin unir, tiras pegajosas, stas a su vez se pueden usar
para crear una nanoestructura peridica bidimensional, como una rejilla o
celosa. El control en el diseo de las secuencias provee a los oligos de gran
flexibilidad en la construccin de nanomateriales mediados por ADN. Seeman
y colaboradores son pioneros en el uso de oligos para ensamblar
nanoestructuras usando ADN (Seeman, 2004A y 2004B). Gran variedad de
objetos geomtricos y estructuras peridicas han sido construidos
exitosamente usando entrecruzamiento doble de ADN, dos dominios

helicoidales conectados por dos entrecruzamientos .A su vez, esto se puede

usar como mediador para crecer andamios y arreglos a escala nanomtrica.
Uno de estos arreglos consiste en la posibilidad de metalizar nanoestructuras
de ADN que, a su vez, sean la base en la integracin de un circuito elctrico.
La literatura reciente ya reporta la posibilidad de colocar nanopartculas de oro
en estructuras cristalinas mediados por el autoensamble de ADN
. Nuestro grupo de investigacin ha iniciado el diseo y construccin de un
ensamble peridico de oligos para su metalizacin en una rejilla formada por
nano alambres.

SNTESIS DE NANOALAMBRES USANDO ADN:

El ADN ya ha sido utilizado como soporte para fabricar nanoestructuras.
Braun y colaboradores desarrollaron una metodologa, llamada litografa
molecular, usando ADN como soporte para el crecimiento de partes
electrnicas bsicas (Braun y Sivan, 2004). El mtodo de litografa molecular
es una tcnica de amplificacin basada en el uso de protenas, Reca, ligadas
a csADN para bloquear determinadas regiones en cdADN lineal con la
finalidad de sintetizar nano alambres de longitud especfica. Este mtodo se
asemeja al uso de masks, ADN, y resists, Reca, en fotolitografa
convencional. Nuestro grupo de investigacin us litografa molecular para
fijar y estirar el ADN del bacterifago l sobre una superficie de Si, para
posteriormente metalizarlo por un periodo de 48 horas para sintetizar nano
alambres de plata (Oviedo, 2007).
Como continuacin a este estudio y usando una ruta alternativa, hemos
iniciado el diseo y la construccin de un ensamble peridico de nano
alambres utilizando oligos como mediador. Puesto que es necesario mejorar
la eficiencia de interaccin entre nano alambres y la superficie usada como
sustrato, esta investigacin propone la utilizacin de oligos para la obtencin
de nano alambres con longitud especfica y puntos de ramificacin en
fragmentos de ADN lineales que formen ensambles peridicos.
stos servirn como molde o patrn para la posterior metalizacin y
fabricacin de nano alambres con precisin cuasiatmica que sirvan como
modelo en el diseo de un circuito integrado. Estas son caractersticas nicas
que slo ofrecen las tecnologas de amplificacin implementadas en
nanoelectrnica que podran competir comercialmente con las actuales
tecnologas de miniaturizacin.

FUTURO DE ADN COMO NANOMATERIAL:

Existe gran potencial en usar ADN como material genrico y no slo como
material gentico. De acuerdo con la literatura reciente, se ha logrado un

importante avance en investigacin bsica aunque no se ha demostrado

fehacientemente qu materiales de ADN se puedan usar en la construccin de
dispositivos electrnicos. Una de las razones principales es que las cadenas de
ADN son lineales o en forma de ovillo, lo que restringe su utilidad en la
construccin de materiales a escala nanomtrica. Para concretar este potencial,
se deben desarrollar diferentes formas de ADN con alta pureza que muestren la
posibilidad de fijarse, estirarse y ensamblarse de manera controlada como
bloques de construccin sobre un sustrato que den lugar a estructuras con
arreglos peridicos ms grandes, como circuitos integrados. Tambin deber ser
posible explorar la viabilidad de incorporar componentes heterogneos en
nanomateriales o nanodispositivos.
La combinacin del descubrimiento de nuevos fenmenos a escala nanomtrica
con su aplicacin en la tecnologa moderna es la fuerza que empuja a la
nanotecnologa. Los materiales basados en ADN se usarn en las tcnicas
nanotecnolgicas y expandirn ampliamente el repertorio de los materiales que
actualmente disponemos. Tenemos que convencer a nuestra sociedad de que el
catastrofismo y fatalismo que pudieran generar en el futuro el desarrollo de
productos nanotecnolgicos basados en ADN est slo en la imaginacin febril
de futurlogos y escritores de ciencia ficcin.
III

.CONCLUSION:
El desarrollo de la Ciencia y Tecnologa actuales implican la generacin y
aplicacin del conocimiento en muchas reas y consecuentemente el
estudiante de Ingeniera debe estar al tanto de los mismos,
en este trabajo se present una introduccin a los nanomateriales que
consideran aquellos materiales ,la aplicaciones de la estructura del ADN en
nanomateriales .La comprensin del ADN y de las formas de utilizacin de la
informacin ha servido para poder aclarar muchas de las incgnitas planteadas
sobre la estructura y la funcin celular y como as aplicarlas en la actualidad.

IIII

.REFERENCIAS:

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