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La sntesis de protenas o traduccin

La sntesis de protenas ocurre en los ribosomas que consisten en dos subunidades, una grande y una
pequea, cada una formada por rRNA y protenas especficas. Para la sntesis de protenas, tambin se
requiere de molculas de tRNA, que estn plegadas en una estructura secundaria con forma de hoja de
trbol. Estas molculas pequeas pueden llevar un aminocido en un extremo y tienen un triplete de
bases, el anticodn, en un asa central, en el extremo opuesto de la molcula. La molcula de tRNA es
el adaptador que aparea el aminocido correcto con cada codn de mRNA durante la sntesis de
protenas. Hay al menos un tipo de molcula de tRNA para cada tipo de aminocido presente en las
clulas. Las enzimas conocidas como aminoacil-tRNA sintetasas catalizan la unin de cada
aminocido a su molcula de tRNA especfica.
La iniciacin de la traduccin en procariotas y eucariotas requiere de un tRNA especfico de iniciacin,
tRNAmeti, que es usado para incorporar el residuo de metionina inicial dentro de todas las protenas. En
E. coli una versin especfica de tRNAmeti es requerida para iniciar la traduccin, [tRNA fmeti]. La
metionina unida a este tRNA iniciador es formilada. La formilacin requiere de N 10-formi-THF y se
hace luego que la metionina se une al tRNA. El fmet-tRNA fmeti todava reconoce el mismo codon,
AUG, como un tRNAmet regular.
La iniciacin de la traduccin requiere del reconocimiento de un codon AUG. En el RNAs procaritico
policistrnico este codon AUG est localizado adyacente al elemento Shine-Delgarno en el mRNA. El
elemento Shine-Delgarno es reconocido por las secuencias complementarias en la subunidad menor de
rRNA (16S en E. coli). En los eucariotas los iniciadores AUGs son los primeros en ser encontrados por
el ribosoma.
Las protenas especficas no asociadas a los ribosomas que se requieren para la exacta iniciacin de la
traduccin se llaman factores de iniciacin. En E. coli ellas con IFs y en eucariotas ellas son eIFs. Se
han identificado numerosos eIFs:

Factor de Iniciacin

Actividad

eIF-1

Reposicin de met-tRNA para facilitar la unin del mRNA

eIF-2

Formacin compleja ternaria

eIF-2A

AUG-dependiente de met-tRNAmeti uniendo al ribosoma 40S

eIF-2B (tambin llamado GEF) factor de


intercambio del nucletido guanina

Intercambio de GTP/GDP durante el reciclaje de eIF-2

eIF-3, compuesto de 11 subunidades

Subunidad del ribosoma antiasociacin al unirse a la subunidad


40S, las subunidades eIF-3e y eIF-3i transforman las clulas
normales cuando son sobre expresadas, la sobre expresin de elf3A (tambin llamada elF3 p170) ha sido asociada con varios

cnceres humanos

Factor complejo de iniciacin designado a


menudo como eIF-4F compuesto por 3
subunidades primarias: eIF-4E, eIF-4A, eIF-4G
y por lo menos 2 factores adicionales: PABP,
Mnk1 (o Mnk2)

Unin del mRNA a la subunidad 40S, actividad de helicasa del


RNA dependiente de ATPasa, la interaccin entre la cola poliA y la
estructura cubierta (cap)

PABP: protena de unin poliA

Une la cola poliA de los mRNAs y permite la unin al eIF-4G

Mnk1 y Mnk2
elF-4E cinasas

Fosforila eIF-4E incrementando la asociacin con la estructura de


cubierta (cap)

eIF-4A

Helicasa de RNA dependiente de ATPasa

eIF-4E

Reconocimiento de cubierta 5'; frecuentemente encontrada sobre


expresada en cnceres humanos, la inhibicin de eIF4E es
actualmente un blanco para terapias anticncer

4E-BP (tambin llamado PHAS) 3 formas


conocidas

cuando 4E-BP esta defosforilado se une eIF-4E y reprime su


actividad, la fosforilacin de 4E-BP ocurre en respuesta a muchos
estmulos de crecimiento conduciendo a la liberacin de eIF-4E e
incrementando la iniciacin de la traduccin

eIF-4G

Actua como una base para el ensamblaje de eIF-4E y -4A en el


complejo eIF-4F, interaccin el el PABP permite que el terminal 5
y el terminal 3de los mRNAs actun

eIF-4B

Estimula la helicasa, se une simultneamente con el eIF-4F

eIF-5

Liberacin de eIF-2 y de eIF-3, GTPasa dependiente del ribosoma

eIF-6

Subunidad de antiasociacin del ribosoma

La iniciacin de la traduccin requiere de 4 pasos especficos:


1. Un ribosoma debe disociarse en sus subunidades 40S y 60S.
2. Se forma un complejo ternario llamado complejo de iniciacin, consiste en el iniciador, GTP eIF-2 y
las subunidades 40S.

3. El mRNA est unido al complejo de iniciacin.


4. La subunidad 60S se asocia al complejo de iniciacin para formar el complejo de iniciacin 80S.
Los factores de iniciacin de eIF-1 y de eIF-3 se unen a las subunidades ribosomales 40S favoreciendo
la antiasociacin de las subunidades 60S. La prevencin de la reasociacin de la subunidad permite la
formacin del complejo de iniciacin.
La estructura de cubierta (cap) de los mRNAs eucariticos se une con los eIFs especficos antes de la
asociacin con el complejo de iniciacin. La unin de la cubierta (cap) se logra por el factor de
iniciacin eIF-4F. Es necesario el desenrollamiento de la estructura secundaria del mRNA para
permitir el acceso de las subunidades ribosomales. El eIF-4G ayuda en la unin del mRNA al complejo
de preiniciacin 43S.
Una vez que el mRNA es alineado correctamente sobre el complejo de iniciacin y el iniciador mettRNAmet es unido al codon iniciador AUG (un proceso facilitado por eIF-1) la subunidad 60S se asocia
con el complejo. La asociacin de la subunidad 60S requiere de la actividad de eIF-5 que primero se
une al complejo de iniciacin. La energa necesaria para estimular la formacin del complejo de
iniciacin 80S viene de la hidrlisis del GTP unido a eIF-2.
En esta etapa el iniciador met-tRNA met esta unido al mRNA dentro de un sitio especfico del ribosoma
llamado sitio P, por sitio del pptido. El otro sitio dentro del ribosoma en el cual entran los tRNAs
cargados se llama sitio A, por sitio del aminocido.

El proceso de elongacin, como el de iniciacin, requiere de las protenas especficas no ribosomales.


En E. coli estas son EFs y eEFs. La elongacin de los polipptidos ocurre de una manera cclica de tal
manera que en un ciclo completo el extremo de adicin del aminocido, el sitio A estar vaco y listo
para aceptar al aminoacil-tRNA entrante, dictado por el siguiente codon del mRNA. Esto significa que
no slo es necesario que el aminocido entrante se una a la cadena del pptido, sino que el ribosoma
debe moverse bajo el mRNA al siguiente codon. Cada aminoacil-tRNA entrante es trado al ribosoma

por un complejo eEF-1-GTP. Cuando el tRNA correcto es depositado en el sitio A, la GTP es


hidrolizada y el complejo eEF-1-GDP se disocia. Para que los eventos adicionales de desplazamiento
ocurran el GDP debe ser intercambiado por GTP. El pptido unido al tRNA en el sitio P es transferido
al grupo amino en el aminoacil-tRNA en el sitio A. Esta reaccin es catalizada por la
peptidiltransferasa. Este proceso es llamado transpeptidacin. El pptido elongado ahora reside en un
tRNA en el sitio A. El sitio A necesita ser liberado para aceptar al aminoacil-tRNA siguiente. El
proceso de movilizacin del peptidil-tRNA desde el sitio A al sitio P se llama, translocacin. La
translocacin es catalizada por el eEF-2 unido a la hidrlisis de GTP. En el proceso de translocacin el
ribosoma se mueve a lo largo del mRNA de tal manera que el siguiente codon de mRNA reside debajo
del sitio A. Luego de la translocacin el eEF-2 es liberado del ribosoma. El ciclo puede entonces
comenzar otra vez.

Como la iniciacin y la elongacin, la terminacin de la traduccin requiere de protenas de factores


especficos identificados como factores de liberacin, RFs en la E. coli y eRFs en los eucariotas. Hay 2
RFs en las E. coli y uno en los eucariotas. Las seales para la terminacin son las mismas en los
procariotas y en los eucariotas. Estas seales son codones de terminacin presentes en el mRNA. Hay
3 codones de terminacin, UAG, UAA y UGA.
En E. coli los codones de terminacin UAA y UAG son reconocidos por el RF-1, mientras que el RF-2
reconoce los codones de terminacin UAA y UGA. El eRF se une al sitio A del ribosoma
conjuntamente con GTP. La unin de eRF al ribosoma estimula la actividad de la peptidiltransferasa
para transferir el grupo peptidil al citoplasma en vez de a un aminoacil-tRNA. El tRNA no cargado
resultante deja el sitio P y es expelido con la hidrlisis concomitante de GTP. El ribosoma inactivo
entonces libera su mRNA y el complejo 80S se disocia en las subunidades 40S y 60S que estn listas
para otro ciclo de traduccin.

Cdigo gentico
El cdigo gentico consiste en el sistema de tripletes de nucletidos en el RNA -copiado a partir de
DNA- que especifica el orden de los aminocidos en una protena. Las protenas contienen 20
aminocidos diferentes, pero el DNA y el RNA contienen, cada uno, slo cuatro nucletidos diferentes.
Tres nucletidos en secuencia especifican cada aminocido. Esto resulta en 4 x 4 x 4, o sea, 64
combinaciones posibles (codones). El cdigo gentico consiste en 64 combinaciones de tripletes
(codones) y sus aminocidos correspondientes. Los codones que se muestran aqu son los que puede
presentar la molcula de mRNA. De los 64 codones, 6l especifican aminocidos particulares. Los otros
3 codones son seales de detencin, que determinan la finalizacin de la cadena. Dado que los 61
tripletes codifican para 20 aminocidos, hay "sinnimos" como, por ejemplo, los 6 codones diferentes
para la leucina. La mayora de los sinnimos, como se puede ver, difieren solamente en el tercer
nucletido. Sin embargo, la afirmacin inversa no es vlida: cada codn especifica solamente un
aminocido.

El cdigo gentico tiene una serie de caractersticas:


- Es universal, pues lo utilizan casi todos los seres vivos conocidos. Solo existen algunas excepciones
en unos pocos tripletes en bacterias.
- Es inequivoco, pues cada triplete tiene su propio significado, codifica para un solo aminocido.
- Todos los tripletes tienen sentido, bien codifican un aminocido o bien indican terminacin de
lectura.
- Es degenerado, pues hay varios tripletes para un mismo aminocido.

http://themedicalbiochemistrypage.org/spanish/protein-synthesis-sp.html

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