Como Os Microbio Podem Ajudar A Alimentar o Mundo PDF

UM RELATRIO DA ACADEMIA AMERICANA DE MICROBIOLOGIA
Como os micrbios podem ajudar

a alimentar o mundo
Relatrio de um colquio da Academia
Americana de Microbiologia
Washington, DC // dezembro 2012
Por: Ann Reid e Shannon E. Greene
Translated by: Dr. Clarice Schmidt,
Iowa State University
A Academia Americana de Microbiologia
o ramo honorario da Sociedade Americana
de Microbiologia, uma sociedade cientfica
sem fins lucrativos, com quase 40.000 scios.
Os membros da AAM so eleitos pelos
seus colegas, em reconhecimento suas
contribuies extraordinarias para o campo
da microbiologia. Atravs do seu programa
de colquios, a AAM recorre a experincia
desses membros para abordar questes
crticas em microbiologia.
Este relatrio baseia-se nas deliberaes de
especialistas que se reuniram por dois dias
para discutir uma srie de questes sobre
como as interaes micrbio-planta podem
ser utilizados para aumentar a produtividade
agrcola de forma ambientalmente e economicamente responsvel.
O relatrio foi revisto por todos os participantes, e todos os esforos foram feitos para
garantir que as informaes sejam precisas
e completas. O contedo reflete os pontos
de vista dos participantes e no se destina
a refletir as posies oficiais da Academia
Americana de Microbiologia ou da Sociedade
Americana de Microbiologia.
O contedo do relatrio pode ser distribudo,
desde que a autoria da AAM seja reconhecida
e este aviso seja includo.
A Academia Americana de Microbiologia
grata pela generosidade das seguintes
organizaes pelo seu apoio a este projeto:
n
National Science Foundation
n National Institute for Food and

Agriculture do United States Department
of Agriculture
Academia Americana de Microbiologia

1752 N Street, NW, Washington, DC 20036
academy.asm.org
PARTICIPANTES DO COLQUIO
COMIT DIRETIVO
PRESIDENTE
Ian R. Sanders, Ph.D.
University of Lausanne
Ann Lichens-Park, Ph.D.
National Institute of Food
and Agriculture of the U.S.
Department of Agriculture
Marilyn J. Roossinck, Ph.D.
Pennsylvania State University
Linda S. Thomashow, Ph.D.
Washington State University
Ryland Young, III, Ph.D.
Texas A&M University
PARTICIPANTES
PARTICIPANTES (CONTINUAO)
Matteo Lorito, Ph.D.
University of Naples
Mary E. Maxon, Ph.D.
Lawrence Berkeley National Laboratory
Jos Raaijmakers, Ph.D.
Wageningen University
Rusty Rodriguez, Ph.D.
Symbiogenics and University
of Washington
Alia Rodriguez Villate, Ph.D.
Universidad Nacional de Colombia
Daniel Segr, Ph.D.
Boston University
Gary A. Strobel, Ph.D.
Montana State University
Harsh Bais, Ph.D.

University of Delaware
Eric Triplett, Ph.D.

University of Florida
Gwyn Beattie, Ph.D.

Iowa State University
Prem Warrior, Ph.D.

Bill & Melinda Gates Foundation
Michael P. Doyle, Ph.D.

University of Georgia
Peter Young, Ph.D.

University of York
Ken Giller, Ph.D.

Wageningen University
Christin Zachow, Dr. Dipl.Biol.

Austrian Centre of Industrial
Biotechnology
Bernard R. Glick, Ph.D.

University of Waterloo
Charles Godfray, Ph.D., FRS, CBE
University of Oxford
EQUIPE DA ACADEMIA
AMERICANA DE MICROBIOLOGIA
Gabriel Iturriaga, Ph.D.

Aguirre Innovacin SC.
Ann Reid
Diretora
Linda Kinkel, Ph.D.

University of Minnesota
Leah Gibbons
Assistente do Colquio e do
Programa de Extenso
Steven E. Lindow, Ph.D.

University of California, Berkeley
Joyce Loper, Ph.D.
USDAAgricultural Research Service
and Oregon State University
Shannon E. Greene, Ph.D.

Bolsista do Colquio
Michael Ingerson-Mahar, Ph.D.
Bolsista do Colquio
PREFCIO
De acordo com o Programa Mundial de Alimentos das Naes Unidas,
mais de 870 milhes de pessoas no mundo sofrem de subnutrio.
Muitos dos famintos so crianas. Nos pases em desenvolvimento, a
desnutrio contribui para a morte de 2,6 milhes de crianas a cada
ano e uma em cada seis crianas est abaixo do peso. Ao mesmo
tempo que mais alimentos so desesperadamente necessrios, terra
arvel e importantes recursos como fertilizante e gua so limitados,
e salinizao e mudana climtica limitam a quantidade de terra
adequada para a produo agrcola. Alimentar uma populao global
que dever atingir 9 bilhes em 2050, ira requerer que a produo
agrcola aumente em 70-100%.
Os rendimentos de qualquer cultura variam muito de lugar para lugar, mesmo dentro da
mesma regio. Aqueles que estudam as tendncias agrcolas mundiais falam da lacuna de
rendimento, que a diferena entre o melhor rendimento observado e os resultados encontrados em outros lugares. Teoricamente, se essa lacuna pudesse ser fechada se todos os
agricultores pudessem alcanar o maior rendimento possvel a produo agrcola mundial
aumentaria em 45-70%. As lacunas de rendimento muitas vezes podem ser explicadas por
uso inadequado de gua ou fertilizantes, ou por prejuzos devido a pragas ou doenas, mas
aumentos ostensivos do uso de fertilizantes, gua e pesticidas no so apenas economicamente inviveis, mas teriam muitas consequncias ambientais negativas. Ampliao dos
sistemas de agricultura intensiva atuais simplesmente invivel.
Como Os Micrbios Podem Ajudar A Alimentar O Mundo
PRODUZIR MAIS
ALIMENTOS COM
MENOS RECURSOS
PODE PARECER
BOM DEMAIS PARA
SER VERDADE, MAS
OS AGRICULTORES
DO MUNDO
TM TRILHES
DE PARCEIROS
POTENCIAIS QUE
PODEM AJUDAR A
ALCANAR ESSA
META AMBICIOSA.
ESSES PARCEIROS
SO OS MICRBIOS.
1
Mas e se a lacuna de rendimento pudesse ser fechada de outra forma, se o rendimento

pudesse ser aumentado com muito menos insumos qumicos? Produzir mais alimentos com
menos recursos pode parecer bom demais para ser verdade, mas os agricultores do mundo
tm trilhes de parceiros potenciais que podem ajudar a alcanar essa meta ambiciosa. Esses
parceiros so os micrbios.
Em dezembro de 2012, a Academia Americana de Microbiologia convocou 26 especialistas
em interaes planta-micrbio para discutir como os micrbios poderiam ajudar a alimentar
o mundo. O grupo incluiu especialistas cientficos sobre interaes planta-micrbio de vrias
areas: peritos em desenvolvimento que procuram introduzir novas tecnologias e prticas em
pases em desenvolvimento, representantes de empresas que desenvolvem produtos microbianos, e os legisladores dos setores pblico e sem fins lucrativos. Juntos, ao longo de dois dias,
o grupo explorou as muitas maneiras que os micrbios e plantas interagem e desenvolveu uma
viso de como essas interaes podem ser utilizados para aumentar a produtividade agrcola
de forma ambiental e economicamente responsvel. Sua viso descrita neste relatrio. A
Academia gostaria de agradecer a National Science Foundation e o National Institute for Food
and Agriculture do United States Department of Agriculture por apoiar este colquio.
Um Relatrio Da Academia Americana De Microbiologia
INTRODUO
Micrbios j ajudar a alimentar o mundo. Na verdade, sem os micrbios
no haveriam plantas ou animais, uma vez que toda a vida na Terra
depende de micrbios para prestar muitos servios essenciais. Cada
vez mais, os bilogos esto reconhecendo que todos os organismos
multicelulares das esponjas, aos cupins e os seres humanos so
dependentes de relacionamentos ntimos e evolutivamente ancestrais
com muitos tipos de micrbios.
Para as plantas, como elas so vulnerveis a mudanas no seu ambiente imediato, os servios
prestados por micrbios so crticos. Em seus ambientes naturais, todas as plantas so apoiadas
por um vasto mundo invisvel das bactrias, vrus e fungos que vivem dentro e ao redor de suas
razes, caules, folhas, sementes, plen, frutos e flores. Comunidades complexas adicionais de
micrbios vivem dentro e sobre os insectos, aves, invertebrados, e outros animais, que interagem
com as plantas e entre si. Estas comunidades interdependentes e interligadas tm profundas
razes evolutivas, remontando origem dos organismos multicelulares e emergncia de plantas
e animais terrestres. Suas diversidades e possibilidades so extraordinrias.
MICRBIOS E
PLANTAS SO
PARCEIROS
NTIMOS EM
PRATICAMENTE
TODOS OS
PROCESSO
DA VIDA.
Micrbios suportam a sade das planta, aumentando a disponibilidade de nutrientes,

aumentando o crescimento das razes das plantas, neutralizando compostos txicos no solo,
tornando as plantas mais resistentes doenas, calor, inundaes e secas, e dissuadindo
patognicos e predadores. Os micrbios e plantas so parceiros ntimos em praticamente
todos os processos da vida.
Como as plantas podem crescer no solo escaldante em torno das nascentes de gua quente de
Yellowstone? Como as plantas sobrevivem em desertos? Como sobrevivem em ambientes onde
podem passar semanas debaixo dgua devido inundao sazonal, ou onde o solo salgado,
contaminados com metais pesados, ou pobres em nutrientes? A resposta, em todos os casos,
so as comunidades microbianas que ajudam as plantas a superar esses desafios ambientais.
Algumas das maneiras que os micrbios contribuem para a sade das plantas j so conhecidos h muito tempo, e novas descobertas so feitas regularmente. Recentemente, uma
realizao comeou a se afirmar, de que essas relaes so mais amplas e importantes
do que previamente reconhecido Nos ltimos 20 anos, a nossa capacidade de estudar
essas comunidades complexas e desvendar os mecanismos extensos pelos quais os
membros interagem melhorou imensamente.
A OPTIMIZAO DAS
COMUNIDADES
MICROBIANAS
DE PLANTAS
OFERECE UMA
ABORDAGEM
TOTALMENTE
NOVA PARA
MELHORAR A
PRODUTIVIDADE.
A RELAO NTIMA
ENTRE MICRBIOS
E AGRICULTURA
Expandir nosso conhecimento sobre as interaes planta-micrbio
tem profundas implicaes para a agricultura. Quando os seres
humanos domesticaram plantas e animais h milhares de anos,
fizeram-no sem qualquer conhecimento das comunidades microbianas
locais que foram essenciais para a sade e a produtividade dessas
plantas e animais. Vrias linhagens de trigo, milho, arroz e outras
culturas foram plantadas ao redor do mundo em ambientes em
que as comunidades microbianas locais diferem daquelas aonde as
plantas se originaram, e onde as condies so tais que a planta
pode precisar de novos parceiros microbianos para crescer melhor.
Historicamente, o melhoramento vegetal tradicional e a engenharia
gentica, irrigao e tratamentos qumicos, como fertilizantes e
pesticidas tm sido utilizados para melhorar a produtividade das
culturas quando estas so disseminadas para novas reas. Otimizar
as comunidades microbianas das plantas oferece uma abordagem
totalmente nova para aumentar a produtividade. Na verdade, essa
abordagem o oposto de estratgias de manejo do passado que
tinham como alvo os micrbios, na crena equivocada de que todos
eles causam doena.
Alguns micrbios benficos so conhecidos h muito tempo; os micrbios conhecidos como
rizbios, que habitam as razes de plantas leguminosas e lhes fornecem nitrognio utilizvel,
foram descritos por Martinus Beijerinck em 1888. (Beijerinck, um contemporneo menos
famoso, mas no menos ilustre de Koch e Pasteur, tambm descobriu bactrias redutoras
de sulfato e vrus.) Outras observaes, por exemplo, que certas doenas de plantas parece
ser mais raras em algumas reas do que outras, levou pesquisas que mostraram que a
supresso da doena era devido a organismos vivos. Mesmo antes de os organismos
responsveis serem identificados, os agricultores eram capazes de mover o solo de um campo
para outro para tirar proveito de suas capacidades de proteo.
Nos ltimos 50 anos, muito se aprendeu sobre alguns dos micrbios que vivem dentro, sobre
e perto das plantas. Nos ltimos dez anos, cientistas fizeram um enorme progresso no esclarecimento da incrvel diversidade do mundo microbiano, e comearam a dissecar as elaboradas
redes de comunicao e cooperao entre as plantas, insetos, invertebrados, herbvoros, e
micrbios, e a determinar os mecanismos moleculares to precisos de tais interaes. As
aplicaes comerciais dessas descobertas j esto sendo utilizados para apoiar o crescimento
das plantas, sua sade e produtividade. No entanto, os benefcios ainda no realizados de
compreender como micrbios apoiam a vitalidade das plantas poderiam ser imensos. O simples
reconhecimento que as nossas culturas mais importantes foram criados e cultivados sem dar
ateno aos seus parceiros microbianos ancestrais potencialmente revolucionrio em suas
implicaes. a possibilidade para uma srie de prticas e produtos agrcolas que podem
aumentar a produtividade de qualquer cultura, em qualquer ambiente, de uma forma economicamente vivel e ecologicamente responsvel.
Este relatrio explora alguns dos vrias funes que os micrbios desempenham na sade
das plantas e como as interaes planta-micrbio poderiam ser empregadas para melhorar
a produtividade das culturas. O relatrio termina com grandes desafios, e uma descrio da
pesquisa e desenvolvimento que sero necessrios para superar esses desafios. A onipresena
e diversidade de interaes planta-micrbio podem parecer quase esmagadoras, especialmente
desde que a cincia ainda mal arranhou a superfcie dessas parcerias biolgicas fundamentais.
O potencial de ganho social to grande, no entanto, que este campo de estudo crucial vai
recompensar profusamente qualquer ateno e investimento adicional.
MARTINUS BEIJERINCK
POR QUE AS PLANTAS

PRECISAM DE MICRBIOS?
PRATICAMENTE
TODOS OS
ASPECTOS DA
BIOLOGIA DE
PLANTAS SO
AFETADOS POR
INTERAES COM
MICRBIOS.
Quando pensamos em uma planta de milho ou uma macieira, parece

simples listar os fatores que afetam sua sade e produtividade: luz
solar, gua, temperaturas razoveis e solo frtil. Mas na natureza,
esses fatores so raramente encontrados coletivamente em todos os
momentos. Como, ento, as plantas sobrevivem quando um ou outro
desses fatores est ausente ou limitado por algum perodo de tempo?
A resposta que existe um outro, quase invisvel, mas crucialmente
importante, ingrediente envolvido no bem-estar de cada planta.
Praticamente todos os aspectos da biologia das plantas so afetada
pela interao com micrbios. Dadas as flutuaes no ambiente
natural, plantas, literalmente, no poderia sobreviver sem micrbios
e portanto, todas as plantas formam uma infinidade de relaes
com diferentes micrbios. Algumas dessas relaes so essenciais
e duradouras, outras so transitrias ou necessrias apenas em
determinadas circunstncias. A maioria deles so provavelmente
evolutivamente arcaicas, mas novas parcerias esto evoluindo
constantemente a medida que o ambiente coloca presso seletiva
sobre as comunidades de plantas e micrbios.
As relaes entre plantas e micrbios remontam origem das plantas. A evoluo inicial das
plantas ocorreu em um mundo microbiano extraordinariamente diversificado; bactrias, archaea
e vrus evoluam h bilhes de anos e ocupavam todos os nichos ambientais concebveis. Uma
nova parceria entre as clulas eucariticas e cianobactrias levou aquisio de cloroplastos
e preparou o terreno para a evoluo das plantas. Este evento evolutivo transformador permitiu
que as plantas se infiltrassem no mundo microbiano atravs da incorporao da capacidade
de cianobactrias para transformar luz solar e dixido de carbono (CO2) em acares de fcil
digesto, e usando essa capacidade para conduzir a evoluo de uma mirade de formas
multicelulares que poderiam levar a cabo essa reao em escalas muito maiores e armazenar o
carbono fixo resultante para a prxima gerao. Enquanto cloroplastos podem ser a evidncia
mais antiga do entrelaamento das trajetrias evolutivas de plantas e micrbios, h muitos
exemplos de outras relaes evolutivas de longa data, dos quais a simbiose mutualstica entre
plantas leguminosas e bactrias fixadoras de nitrognio provavelmente a mais familiar, embora
de maneira nenhuma a mais comum.
Interaes planta-micrbio no se limitam a bactrias. As plantas tambm tm um relacionamento ntimo e de longa data com vrus e fungos. Como surgiram todas essas relaes? A
capacidade de realizar fotossntese e armazenar energia em forma de folhas, frutos, tubrculos
e razes torna as plantas uma fonte de alimento altamente atraente. Como as plantas evitam
serem consumidas, especialmente quando no podem fugir? Alm disso, a luz e CO2 no so
as nicas matrias primas necessrias; as plantas tambm exigem um fornecimento regular de
gua, bem como nutrientes como nitrognio e fsforo, e minerais como o ferro. Como podem
adquirir esses insumos, sem ser capaz de viajar para encontr-los? E a maioria das plantas se
reproduzem sexualmente como encontrar um parceiro quando no podem se locomover?
Muitas das respostas a essas perguntas so encontrados nos genomas das prprias plantas;
uma multido de formas de flores, odores e cores que atraem polinizadores, as formas de folhas
e arranjos de ramos que maximizam a rea de superfcie para a fotossntese, os estmatos que
abrem e fecham para regular a troca de gs e gua todas estas funes so codificadas no
genoma da prpria planta. Mas muitas outras respostas a essas perguntas so encontradas
nas parcerias que as plantas fizeram com os vrios tipos de micrbios. Uma multido de relacionamentos mutuamente benficos em que a planta fornece abrigo ou acares e o micrbio
fornece nutrientes ou proteo contra patognicos tm evoludo ao longo do tempo.
INTERAES
PLANTA-MICRBIO
NO SE LIMITAM
A BACTRIAS.
AS PLANTAS
TAMBM TM UM
RELACIONAMENTO
NTIMO E DE
LONGA DATA COM
VRUS E FUNGOS.
O nmero de interaes planta-micrbio reconhecidas vasto e cresce o tempo todo, e podem

ser classificados de diversas maneiras diferentes. Mais importante ainda, enquanto estamos
nos tornando cada vez mais conscientes de relaes mutuamente benficas, as interaes
entre plantas e micrbios podem tambm ser neutras ou nocivas. A mudana conceitual que
precisa fincar raiz que a sade das plantas est intimamente ligada com um ecossistema
complexo e em grande parte invisvel, em que milhares de espcies esto competindo ou
cooperando constantemente em resposta s mudanas das condies ambientais.
UM QUEM QUEM
DOS PARCEIROS
MICROBIOLGICOS
DAS PLANTAS
Existem trs grandes grupos de microrganismos associados com
plantas. Os tipos de servios que eles fornecem s plantas se
sobrepem em muitos aspectos, e pode ser fornecido por um nico
tipo de micrbio ou por mais de um deles trabalhando juntos. As
relaes entre os prprios micrbios tambm podem ser benficas,
neutras ou antagnicas.
BACTRIAS
As bactrias so fantasticamente abundantes; h at 1010 clulas bacterianas por grama de solo
em torno das razes das plantas, uma regio conhecida como rizosfera. As bactrias tambm so
tremendamente diversificadas geneticamente o mesmo grama de solo pode conter at 10.000
espcies diferentes de bactrias. Em adio ao solo, muitas outras espcies bacterianas ocupam
uma variedade de nichos sobre e dentro das partes areas das plantas. Entre os muitos servios
que as bactrias podem fornecer esto: aquisio de nutrientes e minerais; produo de antibiticos para impedir patognicos e toxinas para deter pragas; e a produo de hormonios e outros
compostos para acelerar o crescimento, estimular o sistema imunolgico, e modular as respostas
ao stresse. As bactrias tambm participam de comunidades complexas em que um membro pode
secretar um sinal que atrai organismos benficos, outro pode afastar patognicos, e ainda outro
pode produzir um substrato sobre o qual outros micrbios benficos podem se alimentar. Juntas,
essas comunidades podem formar estruturas densas chamados biofilmes que tm membros e
propriedades distintos, servindo, por exemplo, como redes de comunicao e transporte.
FUNGOS
Recentemente tornou-se claro que o nmero e diversidade de fungos associados a plantas
mais vasto do que anteriormente compreendido. Existem 105 a 107 clulas de fungos por
grama de solo, o que reflete apenas uma parte da histria porque fungos vivem no apenas
sobre ou volta das plantas, mas tambm no seu interior. Cada planta que j foi amostrada
apresentou um ou varios fungos endofticos. Fungos foram encontrados em associao com a
maior parte dos tecidos vegetais, vivendo entre e dentro das clulas das plantas, e formando
redes extensas das quais apenas algumas funes so conhecidas. Micorrizas arbusculares
(AM) so encontrados em associao com as razes de 80% das plantas terrestres (outros 10%
organismos por grama de solo
biomassa por grama de solo
D:
total de genes estimado por grama de solo
nmero total de genes
tamanho medio do genoma dos organismos
nmero de genes
C:
B:
biomassa total (g)
nmero de organismos
A:
Virus
Fungos
Protistas
Bacteria
Algas
Nematodos
Figura 1: A e B: Vrus so os organismos numericamente mais abundantes no solo, mas compem a menor proporo
em termos de biomassa, enquanto que as bactrias so responsveis pela maior proporo de biomassa.
C e D: Os vrus tm a menor media de nmero de genes por genoma e os nematodos a maior. Em termos do nmero de genes
diferentes isto o nmero de capacidades genticas potencialmente diferentes fungos, pela maioria das estimativas,
proporcionam a maior diversidade, seguido por bactrias, embora esta seja realmente um conceito muito difcil de quantificar.
de plantas, principalmente rvores, so associados com um outro tipo de fungo, discutido

abaixo). Esses fungos formam longos filamentos, ou hifas, que atuam como extenses
das razes da planta e so crticos para a aquisio de nutrientes, minerais e gua. Fungos
endofticos tambm podem ser encontradas nos tecidos de planta acima do solo. Por exemplo,
os endfitos Clavicipitaceae formam redes intercelulares dentro das gramneas com que se
associam, onde produzem toxinas que afastam pragas de insetos e animais em pastejo. Um
consenso emergente afirma que muitas plantas em ambientes extremos sobrevivem apenas
por terem formado parcerias com fungos que fornecem ferramentas essenciais para sobreviver
calor, seca, sal, metais pesados e outros estreses.
Nem todos os fungos benficos so endofticos. Muitas rvores tm fungos simbiontes
chamados fungos ectomicorrzicos que formam densos tapetes ao redor das razes das rvores.
Acredita-se que estes fungos realizam muitas das mesmas funes que os fungos micorrzicos
arbusculares: proteo contra patognicos e aquisio de gua e nutrientes.
VRUS
Dos muitos micrbios sobre a qual as plantas so cada vez mais reconhecidos como sendo
dependente, talvez, os vrus so os mais surpreendentes. Os vrus so, de longe, as mais
numerosas entidades biolgicas da Terra. Cada organismo vivo pode ser infectado por pelo
menos um e, normalmente, por muitos vrus, e a maioria dos organismos so infectadas por
um conjunto diverso e inexplorado de vrus. No entanto, os vrus raramente so considerados
fora de seu papel como agentes patognicos. Isso compreensvel; vrus foram descobertas
devido ao seu papel nas doenas. A idia de que os vrus podem estar contribuindo para a
sade vem emergindo muito lentamente. Gradualmente, no entanto, comeam a se acumular
os exemplos de situaes em que os vrus so no somente benficos, mas podem ser
essenciais para algumas plantas.
A ABORDAGEM
ECOLGICA QUE AS
PRPRIAS PLANTAS
UTILIZARAM
PARA SUPERAR
OS DESAFIOS
AMBIENTAIS
FOI QUASE
COMPLETAMENTE
IGNORADO.
A capacidade dos vrus de afetar o fentipo das plantas bem conhecido para os produtores de
plantas, j que um vrus que produz as estrias coloridas nas tulipas. J no sculo 17, quando
a mania pelas tulipas tomou conta da Holanda, os criadores sabiam que podiam introduzir as
estrias atravs do enxerto de bulbos de tulipas rajadas e tulipas lisas. Eles tambm sabiam que
as variedades rajadas declinavam gradualmente em sade e no podiam ser mantidas permanentemente. Mas foi s em 1920 que o TBV (Tulip Breaking Virus) foi identificado como a razo por
trs das estrias. O primeiro vrus identificado (em 1898) foi o vrus do mosaico do tabaco, e agora
existem cerca de 1000 virus patognicos de plantas classificados. Mas os vrus de plantas, em
grande parte, foram identificados por estarem causando danos; a idia de que algumas plantas
podem prosperar por causa do vrus que eles carregam relativamente nova.
Os poucos exemplos que foram identificados at agora sugerem que os vrus so frequentemente parceiros essenciais para o crescimento de plantas em ambientes extremos. Estudos
tm mostrado que muitos vrus de plantas que causam doena em condies benignas atuam
melhorando a tolerncia quando as plantas so estressadas pela seca. Em alguns casos, a
infeco viral pode ser essencial para a sobrevivncia em condies de estrese; a grama do
genero Panicum que cresce no solos quentes do Parque Nacional de Yellowstone s pode
sobreviver se carrega um certo fungo que em si infectado por um vrus. Muitas plantas e
fungos carregar vrus persistentes que so passadas verticalmente por perodos indefinidos.
Estes podem servir como elementos epigenticos no citoplasma, fornecendo nova informao
gentica alm dos genomas de plantas e fungos.
O tema que se repete por todos esses exemplos de interaes benficas entre plantas e micrbios que ao longo de bilhes de anos as plantas vm formando parcerias com uma variedade
de micrbios, que permitem a sobrevivncia quando as condies ambientais no so ideais.
Quando os nveis de nutrientes ou gua so inadequados, quando as temperaturas so muito
altas ou muito baixas, quando os competidores, predadores, ou patognicos ameaam, as
plantas frequentemente so capazes de recorrer aos parceiros microbianos para superar esses
desafios. As implicaes dessa constatao para a agricultura so profundas. Por milnios,
as prticas agrcolas tm procurado proporcionar as condies ideais para o crescimento
das plantas, usando abordagens mecnicas (irrigao), qumicas (fertilizantes) e genticas
(melhoramento) para proporcionar um ambiente que maximiza a produtividade da planta. A
abordagem ecolgica que as prprias plantas utilizaram para superar os desafios ambientais
foi quase completamente ignorado.
10
QUE TIPO DE
SERVIOS OS
MICRBIOS
PODEM
FORNECER?
Os aspectos da biologia da planta que
os micrbios afetam so abrangentes
e de muitas formas. Em qualquer dado
momento, as atividades microbianas podem
ser mais ou menos importantes para cada
aspecto, mas particularmente em condies
de carncia ou estresse, os micrbios so
provavelmente cruciais para a sobrevivncia
das plantas atravs de um ou mais dos
mecanismos abaixo.
AQUISIO DE NUTRIENTES
Alm da gua, as plantas precisam de nitrognio, fsforo,
potssio, enxofre, ferro e outros elementos vestigiais.
Adquiri-los um desafio constante para as plantas e micrbios participam ativamente na maioria desses processos.
Com efeito, as bactrias so os nicos organismos
conhecidos que podem transformar nitrognio gasoso
numa forma orgnica, amnia, que pode ser utilizada pelas
plantas. Antes do desenvolvimento de meios industriais
para fixao de nitrognio, as plantas eram completamente
dependentes dos micrbios para o nitrognio utilizvel.
FUNGOS MICORRZICOS
ARBUSCULARES E MANDIOCA
A mandioca um alimento bsico nos trpicos e
garantir a segurana alimentar nessas regies depende
de aumentar a produo enquanto minimizando a
aplicao de fertilizantes fosfatados, que so caro
para os agricultores locais, prejudicial ao ambiente, e
potencialmente insustentvel dado os limites globais
das fontes de fosfato. Fungos micorrzicos arbusculares
(AMF) estabelecem um relacionamento ntimo com os
tecidos da raiz de seus hspedes vegetais; penetrando
as clulas corticais das razes, as hifas AMF suprem a
planta da mandioca de fsforo, enxofre, nitrognio e
outros micronutrientes. Teoricamente, aplicaes de
AMF nos campos de mandioca poderiam aumentar as
interaes planta- fungo alm daquelas estabelecidas
atravs das unies nativas no solo e reduzir a
dependncia de fertilizantes fosfatados externos para
estimular o crescimento. Entretanto, tem sido muito
difcil de crescer o AMF na ausncia de suas plantas
hospedeiras, e gerar propgulos de AMF suficientes para
aplicao nos campos agrcolas s pode ser alcanado
atravs da produo em larga escala dessas plantas.
Essa abordagem ainda mais complicada pelo fato de
que propgulos de AMF podem ser acompanhado por
outros micrbios que vivem no solo, com consequncias
potencialmente prejudiciais.
Recentemente, um sistema de produo biotecnolgica
em massa foi desenvolvido aonde AMF cultivado
in vitro em meio artificial estril de razes de cenoura
transformadas com Agrobacterium tumefaciens.
Rhizophagus irregularis AMF produzido in vitro foi
testado em larga escala no cultivo de mandioca
comercial na Columbia em locais com vrios solos e
nveis de aplicao de fosfato, e em cada cenrio, os
rendimentos de peso seco de mandioca aumentaram
na presena de inoculo de AMF na verdade, a
inoculao com AMF gerou uma produo de biomassa
seca de mandioca significativamente maior do que em
campos no inoculados em todos os nveis de adubao
fosfatada. Estes resultados promissores sugerem
benefcios econmicos e ecolgicos de AMF em relao
ao tratamento de fosfato no aumento da produo de
mandioca em regies tropicais, e pode ser que tambm se
estenda a outras associaes dos AMF.
As plantas conseguem absorver somente Fsforo inorgnico

(Pi). Ambos os fungos e bactrias podem ajudar as plantas
na obteno de fsforo adequado. As bactrias produzem
cidos orgnicos que se ligam ao Pi e fosfatases extracelulares que liberam Pi de organofosforados e aumentam
11
sua disponibilidade para a planta. As hifas produzidas por fungos micorrzicos alcancam alm
da zona explorada pelas razes das plantas para obter fsforo e transport-lo de volta para a
planta; de fato plantas de mandioca inoculados com fungos micorrzicos arbusculares crescem
10-20 vezes maiores do que plantas crescendo em solo estril sem micorrzicos.
Outros nutrientes, tais como enxofre, potssio e ferro tambm podem ser transformados
em formas utilizveis ou transportado para plantas por bactrias e fungos. A otimizao das
comunidades microbianas do solo poderia permitir que os agricultores aplicassem menos
fertilizantes qumicos, poupando dinheiro e reduzindo a quantidade de excesso de nutrientes
que vaza dos campos nos sistemas aquticos.
PATOGNIOS E RESISTNCIA A PREDADORES

As plantas esto sujeitas a muitos inimigos biolgicos potenciais, incluindo patognicos
bacterianos, fungais e virais que causam doena, bem como parasitas, insetos, aves e animais
de pasto que se alimentam de plantas. As parcerias com os micrbios podem ajudar as plantas
a resistir a essas ameaas.
A OTIMIZAO DAS
COMUNIDADES
MICROBIANAS DO
SOLO PODERIA
PERMITIR QUE OS
AGRICULTORES
APLICASSEM
MENOS
FERTILIZANTES
QUMICOS,
POUPANDO
DINHEIRO E
REDUZINDO A
QUANTIDADE
DE EXCESSO DE
NUTRIENTES QUE
VAZA DOS CAMPOS
NOS SISTEMAS
AQUTICOS.
12
No caso mais simples, plantas associadas a micrbios podem simplesmente ocupar nichos
que de outra forma poderiam ser vulnerveis a patognicos. Quando as bactrias formam um
biofilme ao redor das razes de uma planta, impedem o acesso de patognicos microbianos e
parasitas que vivem no solo. Os micrbios benficos na rizosfera pode estar fazendo mais do
que simplesmente bloquear a entrada; eles tambm podem estar produzindo um nmero de
produtos qumicos que atuam diretamente contra os agentes patognicos. Muitos antibiticos
utilizados pelos seres humanos para tratar infeces so derivados de bactrias ou fungos
que os produzem para matar ou inibir microrganismos concorrentes. Outros produtos qumicos
produzidos por micrbios podem servir para mascarar a presena da planta de possveis
parasitas ou predadores, atrair organismos benficos, ou estimular o sistema imunolgico das
plantas. Bacterifagos vrus que infectam bactrias podem matar bactrias patognicas
diretamente. H mesmo indcios de que os micrbios podem gerar campos eltricos que
podem atrair ou dissuadir outros micrbios e invertebrados do solo, como nematodes.
Acima ou abaixo do solo, os micrbios podem servir a planta simplesmente por ocupar o espao
que de outra forma poderia ser um ponto de entrada para patognicos. Micrbios endofticos
ou de superfcie tambm podem produzir uma variedade de compostos potencialmente teis,
incluindo as toxinas que afastam herbvoros, compostos volteis alertam as plantas vizinhas para a
presena de uma ameaa, e molculas pequenas que desencadeiam respostas protetoras, como o
fechamento de estmatos.
H interferncia entre as conversas em curso entre as plantas e as comunidades microbianas
acima e abaixo do solo; eventos no solo pode provocar respostas nas folhas e vice-versa. Por
exemplo, quando as plantas de tomate so atacados pelo fungo Alternaria solani, seu sistema
imune produz sinais de estrese que so percebidos por outros fungos que vivem ao redor das
razes. Atravs de suas hifas, os fungos benficos na raiz transmitem o sinal de estrese para
plantas vizinhas alertando-as a regular suas prprias respostas de estrese.
Micrbios produzem uma grande variedade de compostos que inibem ou matam os micrbios
concorrentes. Se uma bactria, vrus ou fungo pode deter outro micrbio que prejudicial
para a planta, provavelmente no interesse da planta fornecer abrigo e alimento ao micrbio
til. provvel que muitas parcerias planta-micrbio evoluram nesta base: a planta fornece
ANLISE DO CUSTO-BENEFCIO DAS INTERAES PLANTA-MICRBIO.

Assim como os casamentos, as relaes planta-micrbio benficas podem variar nas vantagens obtidas por cada
parceiro. Por exemplo, as bactrias do genero Rhizobium fornecem nitrognio s plantas em troca da sntese de um
rgo que fornece o acesso exclusivo aos carboidratos da planta. No entanto, alguns rizbios induzem a planta a
sintetizar um grande nmero de tais rgos, chamados de ndulos, mas fornecem pouco nitrognio em troca. Devido
monogamia da relao rizbio-leguminosa, plantas interagindo com tais rizbios podem pagar um alto custo metablico
com pouca ou nenhuma compensao. A presso evolutiva para este tipo de trapaa por micrbios potencialmente
benficos alta devido economia de energia, o que sugere a necessidade das plantas de reconhecer esses trapaceiros
ou recompensar os parceiros que proporcionam as melhores vantagens.
As plantas so frequentemente colonizadas por vrias espcies de fungos micorrzicos arbusculares (AMF), e cada um
destes fungos podem colonizar diversas plantas, estendendo suas hifas de um sistema de raiz para outro em uma rede
interligada por baixo da superfcie do solo. Enquanto os AMF fornecem nutrientes para as plantas em troca de carboidratos espcie diferentes de FMA variam no nvel de micronutrientes que fornecem sua planta hospedeira. Da mesma
forma, as espcies de plantas diferem na quantidade de carbono que desviam para seus AMF. Usando formas isotpicas
estveis de micronutrientes e de carbono, cientistas foram capazes de acompanhar as trocas que ocorriam entre varios
AMF localizados no mesmo sistema radicular das plantas. Eles descobriram que ambos os parceiros trabalham em
um sistema de recompensas recprocas: a planta fornece mais carbono para os individuos das espcies de AMF que
fornecem mais fsforo, e as espcies de FMA fornecem mais fsforo para plantas hospedeiras que fornecem mais
carbono. Um sistema de recompensas semelhante foi encontrado no intercmbio de carbono e nitrognio. Alm disso,
eles descobriram que este reconhecimento ocorre na interface entre a planta e o AMF, demonstrando que pelo menos
algumas interaes planta-micrbio se aproveitam da comunicao ativa para garantir o benefcio mximo para ambos
os parceiros. Desta forma, estas recompensas recprocas, contribuem para um relacionamento mutuamente benfico e
estvel, ou seja, um casamento longo e produtivo.
carboidratos para certos micrbios no retorno para a dissuaso de patognicos, predadores

ou outros benefcios. Estima-se que at 30% da produo primria de uma planta (isto , a
quantidade de carbono que a planta transforma em matria orgnica atravs da fotossntese)
na verdade deixa a planta como exsudao no solo; os micrbios devem estar fazendo uma
contribuio bastante substancial para ganhar uma poro to alta dos recursos da planta.
RESISTINDO O ESTRESSE AMBIENTAL

Se, como foi dito acima, os micrbios podem ganhar a vida protegendo as
plantas de predadores, lgico que os micrbios podem tambm se
beneficiar por ajudar as plantas a sobreviver momentos de estresse
ambiental. Na verdade, os micrbios tm-se mostrado parceiros
importantes na atenuao dos efeitos de praticamente todos os
estresses ambientais conhecidos que podem afetar as plantas.
Seca As plantas precisam de gua para manter sua estrutura

celular e carregar reaes bioqumicas como a fotossntese. Em
condies de seca, as plantas limitam as perdas de gua, fechando
os estmatos (aberturas na parte inferior das suas folhas), mas isso
impede que a regulao adequada da temperatura e captura de CO2 para
a fotossntese. Fungos endofticos e epfitas ajudam a aliviar esse estresse,
estimulando o crescimento da raiz da planta, aumentando assim a eficincia
13
frio
calor
inundao
seca
estresse osmtico
limitao de nutrientes
patognicos
toxicidade de
metais pesados
Figura 2: Os micrbios proteger as plantas de uma variedade de estresses tanto ambientais quanto biolgicos. Eles ajudam
as plantas a buscar gua quando as condies de calor e seca limitam o abastecimento de gua. Por outro lado, os micrbios
podem proteger as plantas de inundaes ou estresses osmticos quando as concentraes de gua e sal esto desequilibrados.
Com a ajuda de microorganismos, plantas podem capturar nutrientes essenciais do solo e ao mesmo tempo neutralizar os efeitos
txicos de metais pesados e contaminantes orgnicos. Os micrbios tambm pode prevenir doenas causadas por outros
organismos patognicos tanto por dissuadir fisicamente as interaes patognicas ou at mesmo matando os invasores.
14
de absoro de gua do solo. Fitovrus agudos que, em condies normais, causam

doena, tambm demostraram melhorar a tolerncia seca em plantas infectadas.
Inundaes Embora as plantas necessitam de gua para sobreviver, o excesso

pode ser prejudicial. De fato, inundao induz hipxia ou limitao de oxignio nas
razes. Em resposta a vrios estresses, incluindo inundaes, as plantas produzem
etileno, que ativa os mecanismos de defesa e proteo, mas tambm pode bloquear
o crescimento das razes e folhagem. Muitas espcies de bactrias expressam a
enzima ACC desaminase, que degrada o ACC, o precursor do etileno. Ao bloquear
a produo de etileno, estes micrbios permitem a continuao do desenvolvimento
radicular e do crescimento da planta mesmo na presena de inundaes ou secas.
Salinidade Excesso de sais no solo mimetiza as condies de seca para a planta,

uma vez que removem gua dos tecidos vegetais. A salinidade inibe a germinao
das sementes, crescimento das mudas, florao e frutificao entre outros efeitos.
Fungos endfitos isolados das gramineas de dunas na costa oeste americana conferim
tolerncia ao sal, assim como algumas rizobactrias, cujas secrees exopolissacrideas
potencialmente se ligam ao sdio e outros ctions, impedindo a sua absoro pela planta.
Contaminao por metais pesados Contaminao do solo e das guas

subterrneas por metais pesados pode interferir com a homeostase inica nas plantas
e ainda causar dano celular por estresse oxidativo. As bactrias podem tanto diminuir
a toxicidade desses metais e promover o crescimento das plantas pela captao
dos prprios metais, tornando-os biologicamente inativos, ou podem ainda inibir a
reao geral de estresse pelo etileno por meio da atividade da deaminase ACC.
SECA
Contaminao por poluentes orgnicos A gama de rotas de biossntese e

biodegradao encontrada em bactrias enorme. No importa qual o poluente,
h quase certamente em algum lugar bactrias que podem modifica-lo ou
degrada-lo. Quando o solo est contaminado, uma parceria entre as bactrias
que podem degradar ou desintoxicar um composto que inibe o crescimento das
plantas permite que essas bactrias se reproduzam mais rapidamente. Alm
disso, a sua associao com as razes das plantas aumenta o seu acesso aos
poluentes devido ao movimento de poluentes para as razes atravs do fluxo de
transpirao, e tambm ajuda a transportar essas bactrias atravs do solo.
Altas temperaturas Todas as enzimas tm faixas de temperatura nas quais funcionam

melhor. As flutuaes de temperatura acima desses limites pode desativar ou destruir
essas protenas, levando diminuio do crescimento. Mesmo um aumento de 1C
na temperatura noturna pode diminuir a produtividade do arroz em 10%. No entanto,
batatas sob estresse por calor cultivadas na presena de rizobactrias apresentam
aumento de crescimento da raiz e partes areas, bem como o aumento da tuberizao.
Baixas temperaturas Temperaturas frias resultam em um crescimento

mais lento e podem at mesmo danificar as membranas celulares. Embora os
mecanismos por trs da proteo microbiana no sejam claros, videiras inoculadas
com espcies de bactrias Burkholderia mostram um aumento nas taxas de
fotossntese e diminuio de de vazamento de eletrlitos (indicativo de danos na
membrana) em temperaturas frias, em relao as plantas no inoculadas.
INUNDAO
POLUIO
GEADA
15
O POTENCIAL INEXPLORADO DA BIODIVERSIDADE MICROBIANA

Ainda hoje, novos membros do mundo multicelular so descobertos diariamente, incluindo mais de trs mil novas espcies de besouros em 2011! A diversidade notvel de macroorganismos j descritos e espera de serem descobertos
diminuta em relao ao potencial inexplorado do mundo microbiano. Os micrbios que vivem dentro e entre as plantas
desempenham um papel fundamental no estilo de vida do mundo das plantas e pode at contribuir em novas formas
ainda no consideradas. Explorao desse mundo j produziu algumas espcies novas muito interessantes com o
potencial de transformar a produtividade agrcola, biotecnologia e medicina.
O fungo endofitico Muscodor albus foi descoberto vivendo na casca das rvores de canela em Honduras. M. albus
produz uma variedade de gases volteis, com a capacidade de matar diversos fungos patognicos de plantas e
humanos, assim como bactrias Gram positivas e Gram negativas. Alm de visualizar um papel para este fungo endfito
em controle de patognicos durante o crescimento das culturas e processamento ps-colheita, os cientistas esto
explorando a possibilidade dessa mistura nica de lcoois, steres e outros compostos gasosos na inibio da traa da
batata e suas larvas.
CRESCIMENTO E DESENVOLVIMENTO NORMAIS

Cientistas ainda esto desvendando as muitas maneiras das quais as plantas podem fazer uso
dos recursos microbianos para tornar os nutrientes mais disponveis ou deter patognicos.
Talvez ainda mais surpreendente, as descobertas esto surgindo a partir da constatao de que
os micrbios desempenham funes crticas no desenvolvimento, fisiologia e metabolismo das
plantas. Essas funes, muitas vezes so realizadas atravs de sntese microbiana
de compostos bioqumicos que imitam, amplificam, inibem ou modificam as
atividades de hormnios vegetais. Por exemplo, as bactrias e os fungos
produzem uma srie de fitohormnios que aumentam a produo de
plos de razes, o que aumenta a capacidade de absoro das razes.
Algumas sementes necessitam de bactrias para germinar. Outros
compostos microbianos melhoram a respirao da raiz ou
afetam a transpirao atravs da regulao da atividade
dos estmatos. As aes destes compostos no so
totalmente dependentes do contato fsico com a
planta; fungos em particular, produzem diversos
compostos volteis que podem atuar a distncia,
tanto em plantas vizinhas como em outros
habitantes dos ecossistemas tais como os
insectos.
16
EXISTEM
VRIAS
CONVERSAS
QUMICAS
ANIMADSSIMAS
ACONTECENDO
SOB NOSSOS
PS...
SABOR
Micrbios podem at mesmo afetar o sabor de plantas alimentcias. Em morangos, a bactria
metilotrfica Methylobacterium extorquens aumenta a produo dos qumicos chamados
furanonas que so responsveis pelo sabor caracterstico dos morangos. Uma dessas
furanonas 4-hidroxi-2,5-dimetil-3 (2H)-furanona (HDMF) tambm estimula as defesas
das plantas, aumentando a produo pelas plantas de vrios compostos antimicrobianos que
detm micrbios nocivos.
Como todos estes exemplos demonstram, h muito mais acontecendo no mundo de uma
planta do que podemos enxergar. Um ecossistema complexo, mas em grande parte invisvel,
envolve cada planta e inclui bactrias, fungos, vrus e invertebrados do solo
com vrias redes entrelaadas de predao, patognese, cooperao
e interdependncia. Existem vrias conversas qumicas animadssimas acontecendo sob nossos ps, conversas que incluem certa
sobreposio de vocabulrio e sinais inequvocos, mas tambm
inmeros esforos para criptografar, enganar ou espionar.
As conversas conectam planta com planta, planta com
micrbio, planta com nematide, micrbio com micrbio,
nematide com nematides e qualquer outra combinao
concebvel, com vrus participando provavelmente de
diversas maneiras. Os habitantes desses ecossistemas
pode ouvir ou interferir com algumas das conversas
dos outros, se passar por um outro, e amplificar ou
atenuar sinais; um nico produto qumico pode
representar coisas diferentes para diferentes
organismos ou em momentos diferentes. Em
suma, h uma grande dose de comunicao
acontecendo e ns estamos apenas comeando
a perceber a sua importncia. Uma das metas
para o futuro ser capaz de escutar ns mesmos.
17
PLANTAS PODEM
PRODUZIR
IMITAES DE
SENSORES DE
QUORUM, BEM
COMO INIBIDORES
DE QUORUM
NUM ESFORO
DE INCLINAR O
COMPORTAMENTO
DAS BACTRIAS
NUMA DIREO
BENFICA PARA
A PLANTA.
18
COMO AS PLANTAS E
MICRBIOS INTERAGEM?
As interaes entre plantas e micrbios no so exclusivamente
qumicas, mas micromolculas so uma linguagem comum
importante. Plantas produzem flavonides que atraem e repelem
vrios micrbios, enquanto os micrbios produzem fatores de
nodulao que induzem a diferenciao raiz. Ambas as plantas e
micrbios produzem compostos orgnicos volteis que podem agir
localmente ou distncia.
Bactrias produzem inmeras micromolculas que servem como sensores de quorum, sinais
que as bactrias utilizam para determinar a densidade da comunidade bacteriana local e
quantos da prpria espcie esto presentes. Bactrias integram estes sinais para dirigir
comportamentos de grupo, como a formao de biofilme ou secreo de toxinas. Plantas
podem produzir imitaes de sensores de quorum, bem como inibidores de quorum num
esforo de inclinar o comportamento das bactrias numa direo benfica para a planta. A
angiosperma Sul-americana chamada Gunera, num processo anlogo ao estabelecimento de
ndulos radiculares em leguminosas, produz uma micromolcula que induz bactrias fixadoras
de nitrognio para se diferenciar em uma forma filamentosa altamente mvel. Esta forma migra
para uma cavidade dentro da haste da planta onde estabelece uma colnia que fornece a
planta com nitrognio fixado em troca de acares.
Outra forma em que os vrios microrganismos que vivem

em torno das plantas podem interagir tanto com as plantas
e entre si, atravs de transferncia direta de material
gentico. Bacterias trocam plasmdeos entre si atravs do
processo de conjugao, e vrus fazem vaivm de genes de
um organismo para outro de forma regular. Transferncia
direta de material gentico de Agrobacterium para plantas
tambm ocorre. Os genomas dos organismos revelam
inmeros exemplos de troca de genes ao longo da histria
evolutiva, mas a frequncia, oportunidade e condies
de desencadeamento que regem essas trocas no so
conhecidos. As bactrias do gnero Agrobacterium podem
participar no processo de conjugao com clulas de
plantas; o plasmdeo que transferem se integra no genoma
da planta onde passa a expressar genes, incluindo os
fitohormnios auxina e citocinina que induzem a formao
de um crescimento tumoral chamado uma vescula. Esta
capacidade tem sido explorado na rea de biotecnologia
para transferir genes desejveis para as plantas. Vrus
tambm podem ser modificados para transferir genes
desejveis em plantas e bactrias.
Outra forma de interao a transferncia de protenas
entre os organismos. Bactrias e fungos produzem protenas
chamadas efetores que so injetadas nas clulas vegetais.
A maioria dos efetores que foram caracterizados at agora
so produzidos por agentes patognicos e parasitas e agem
de forma a suprimir o sistema imunolgico inato da planta.
Seria interessante estabelecer se existem interaes benficas que se utilizem de sistemas semelhantes aos efetores.
Como abordado acima, na discusso da transferncia
qumica e gentica, uma grande quantidade de interao
entre plantas e micrbios usa a linguagem de hormnios
vegetais. Micrbios produzem uma srie de hormnios
vegetais, e eles tambm produzem enzimas que podem
alterar os nveis hormonais das plantas. Em troca, as
plantas produzem compostos que bloqueiam ou modificam
os hormnios vegetais produzidos bactrias.
CENTRAIS DE BIOTECNOLOGIA: OUTRA

RAZO PARA ESTUDAR OS MICRBIOS
QUE SE ASSOCIAM COM PLANTAS...
Este relatrio centra-se nas funes que os micrbios
desempenham em associao com as plantas. Mas
outro benefcio de estudar micrbios associados a
plantas a frequente descoberta de recursos microbianos que podem ser colocados em uso em outros
contextos.
Por exemplo, as bactrias do gnero Agrobacterium
eram conhecidos como patognicos que causam
tumores em planta. Em 1975, mostrou-se que a
bactria utiliza um plasmdeo denominado Ti para
transferir material gentico para as plantas, causando
os tumores caractersticos. Na dcada de 1980, a
indstria de biotecnologia adotou o plasmdeo Ti
como o principal vetor para a produo de plantas
geneticamente modificadas. Na verdade, a primeira
planta geneticamente modificada utilizou dois recursos
microbianos: o plasmdeo Ti de Agrobacterium foi
usado para introduzir uma protena inseticida de outra
bactria Bacillus thuringiensis em plantas de
tabaco, tornando as plantas resistentes a insetos.
A mensagem para levar para casa que qualquer
que seja o papel de um micrbio em particular para
uma planta ou ambiente especfico, ele pode ter
capacidades com implicaes amplas para agricultura
em geral. Mesmo micrbios que foram descobertos
por causa de seus efeitos patognicos podem ter
aplicaes benficas; micrbios que beneficiam
determinados vegetais podem ter capacidades que
beneficiam muitos outros.
Finalmente, algumas das interaes entre e entre plantas

e micrbios so puramente mecnicas ou fsicas; alguns
micrbios benficos simplesmente ocupam o espao
que de outra forma poderia ser vulnervel a patognicos.
A morfologia das folhas, flores e razes da planta podem
desempenhar um papel na determinao de quais
micrbios podem sobreviver. Por exemplo, a fixao de
nitrognio microbiano inibida pela presena de oxignio,
de modo que o fornecimento pela planta de um espao
fsico protegido fundamental para esta parceria plantamicrobiana to especial.
19
BACTRIAS,
FUNGOS E
VRUS TM SIDO
ADAPTADAS E
COMERCIALIZADOS PARA
FINS AGRCOLAS
INCLUINDO
A PROTEO
CONTRA PATOGNICOS E PRAGAS
E PARA SADE
E PRODUTIVIDADE VEGETAL
EM GERAL.
APLICAES ATUAIS
Utilizar micrbios para aumentar a produo de plantas ou proteger
as plantas de pragas no uma ideia nova. De fato, as prticas
agrcolas tradicionais, como a rotao de culturas ou co-cultivo de
leguminosas com plantas no leguminosas tm sido utilizados h
milnios. H at mesmo um mercado pequeno, mas significativo
para tratamentos biolgicos para safras.
Estima-se que os biopesticidas, uma categoria que inclui agentes biolgicos utilizados como
inseticidas, herbicidas, pesticidas e fungicidas, constituem uma indstria de 2.1 bilhes de
dlares por ano cerca de 5% dos 44 bilhes de dlares por ano da indstria de pesticidas
qumicos. Um pouco mais de metade desse mercado composto de micrbios vivos; outros
tipos de biopesticidas incluem agentes no-microbianos tais como os insectos e os compostos
derivados biologicamente, como feromonios. O mercado mundial de fertilizantes qumicos
da ordem de 150 bilhes de dolares por ano; abordagens microbianos poderiam substituir ou
ampliar este mercado.
Bactrias, fungos e vrus tm sido adaptadas e comercializados para fins agrcolas incluindo
a proteo contra patognicos e pragas e para sade e produtividade vegetal em geral. A
categorizao desses agentes pode ser complicada. Se um micrbio est ajudando a planta
por desencorajar o crescimento da raiz em espcies competidoras, isso faz dele um herbicida?
Se um micrbio estimula o crescimento das razes e por consequencia aumenta a produtividade da planta, isso faz dele um fertilizante? Em alguns casos, os mecanismos pelos quais
um micrbio est ajudando a planta podem ser desconhecidos, ou o microorganismo pode
ter mais do que um efeito. s vezes, h razes de regulao e de marketing para enfatizar um
aspecto da atividade microbiana sobre o outro. Por exemplo, os produtos comercializados
como pesticidas podem enfrentam um longo processo de aprovao que pode ser evitado
simplesmente por enfatizar a capacidade de um tratamento microbiano em aumentar a produtividade, em vez de sua capacidade de deter pragas.
H lies a serem aprendidas com alguns sucessos da promoo de produtos base de
micrbios para a agricultura. As seguintes caractersticas foram fundamentais:
20
Micrbios bem caracterizados e clara compreenso do seu mecanismo de ao.
Um alto nvel de especificidade na interao planta-micrbio,

por exemplo a simbiose rizbio-leguminosa.
Simplicidade biolgica por exemplo, a toxina Bt codificada por um nico

gene que pode ser facilmente transferido para o genoma da planta.
Uma janela definida de susceptibilidade Agrobacterium pode

transferir genes em clulas de plantas com grande sucesso, se
aplicado nas primeiras 24 horas aps a planta ser infectada.
Estratgias para superar desafios na ampliao para a produo comercial,

obteno de aprovao regulatria e garantia de prazo de validade adequado.
Identificao das condies para a eficcia mxima e consistncia do produto.
Colaboraes funcionais que combinem competncias em

cincia bsica, desenvolvimento, testes e marketing.
Extenso para usurios, incluindo apoio tcnico e educao, em particular no que diz
respeito preveno da doena ao invs de tratamento aps surtos da doena.
Nem todos os tratamentos base de micrbios so implementadas da mesma forma, e a

escolha do modelo de implementao tem implicaes na durao e custo do processo de
desenvolvimento. Por exemplo, no sistema americano, a abordagem mais demorada e cara
o registro completo como um pesticida, seguindo o mesmo caminho para regulamentao
como pesticidas qumicos. Se um organismo est sendo introduzido unicamente para controlar
uma praga ou patognico, esta a via adequada, mas custa at 10 milhes de dlares e
pode levar de quatro a seis anos para se completar. Para tratamentos microbianos visando
fortalecimento da planta ou uso como biofertilizantes, o registo no obrigatrio, os custos
caem quase dez vezes, e o tempo para introduo ao mercado pode ser reduzida a um ou dois
anos. Outro modelo o da produo local, aonde os agentes microbianos ou seus extractos
so produzidos e aplicados localmente em vez de adquirido de um fornecedor externo.
Este modelo pode ser uma situao de ganho mtuo para as comunidades; instalaes de
fermentao ou de cultivo locais fornecem empregos, enquanto os agricultores tm acesso a
tratamentos adaptados s suas culturas e condies especficas. Apoio direto do governo para
tais unidades de produo foi implementada em alguns pases, incluindo Venezuela e Cuba.
21
COLOCANDO MICRBIOS
PARA TRABALHAR
NO ESTAMOS
ACOSTUMADOS
A CONSIDERAR
OS MEMBROS DE
ECOSSISTEMAS
QUE FUNCIONAM
EM ESCALA
MICROSCPICA.
SUAS ATIVIDADES,
EMBORA
INVISVEIS, SO
ESSENCIAIS
PARA O
FUNCIONAMENTO
GERAL DO
ECOSSISTEMA.
22
As aplicaes potenciais de micrbios benficos na agricultura

parecem sem limites, mas o progresso exigir avanos na
compreenso bsica de interaes planta-micrbio acoplados a
ateno prtica para o processo de transferncia de descobertas
do laboratrio para o campo, bem como os problemas tcnicos,
regulamentao, marketing e educao para o usurio. Uma
abordagem integrada para enfrentar estes desafios em outras
palavras, uma abordagem que reconhece a natureza multifacetada
dos desafios provavelmente o melhor caminho para o sucesso.
Os desafios cientficos a serem enfrentados nesse campo exigem uma mudana em relao
ao passado, quando a maioria dos estudos de interaes benficas planta-micrbio mantinha
o foco em uma parceria planta-micrbio de cada vez. Tais abordagens reducionistas so
extremamente importantes e muitas mais sero necessrios para elucidar os mecanismos
de cada interao entre planta e micrbio. No entanto, o progresso tambm vai exigir uma
mentalidade aonde compreende-se cada organismo como um membro de uma srie de
ecossistemas em constante interao. Estamos familiarizados com os ecossistemas em larga
escala, por exemplo, uma pastagem em que os herbvoros, predadores, plantas, polinizadores
e decompositores constituem uma teia alimentar complexa. Estudos ecolgicos nesses
macro-ecossistemas demonstraram como a remoo de uma espcie pode afetar os outros
relacionamentos de formas complexas, o mesmo sendo valido para a introduo de uma
espcie no-nativa. No estamos acostumados a considerar os membros de ecossistemas que
funcionam em escala microscpica. Suas atividades, embora invisveis, so essenciais para o
funcionamento geral do ecossistema.
DESAFIOS CIENTFICOS
IDENTIFICANDO OS PARTICIPANTES
A diversidade impressionante de micrbios encontrados no solo faz com que a identificao
dos participantes parea uma tarefa assustadora. Identificar cada micrbio em cada ambiente
claramente uma meta inatingvel, especialmente porque os sistemas so dinmicos. No
entanto, para qualquer dado sistema de planta, uma pesquisa sistemtica dos membros
da comunidade est se tornando possvel com abordagens metagenmicas. Um catlogo
abrangente da comunidade microbiana associada a espcies individuais de plantas,
mesmo das principais espcies cultivadas, ainda no foi executado; portanto, atividades de
recenseamento so atualmente necessrios para estabelecer padres gerais. Tcnicas de
metagenma so bem desenvolvidos para bactrias; mas tcnicas para avaliar os fungos e
vrus que habitam as comunidades planta-micrbio ainda esto sendo estabelecidas. Uma
outra camada de complexidade adicionada quando os membros invertebrados destas
comunidades os insectos e nematides que interagem com as plantas e micrbios em
numerosas maneiras so tomadas em considerao.
COMPREENDENDO O SIGNIFICADO DA DIVERSIDADE
ESFOROS
PARA SABER
QUEM ESTA
L DEVEM SER
ACOMPANHADOS
DE UM
ESFORO PARA
COMPREENDER
QUE FRAO
DESSA
DIVERSIDADE
REALMENTE
NECESSRIA
PARA OTIMIZAO
DA SADE DA
PLANTA EM
QUALQUER DADO
AMBIENTE.
Os avanos tcnicos esto tornando mais fcil para fazer um censo de uma comunidade do
solo. Mas os esforos para saber quem esta l devem ser acompanhados de um esforo
para compreender que frao dessa diversidade realmente necessria para otimizao da
sade da planta em qualquer dado ambiente. A grande diversidade de micrbios no solo
provavelmente resulta da capacidade de muitos micrbios para sobreviver em nveis de
populao muito baixos, prontos para se multiplicar quando as condies forem favorveis.
A consequncia para as plantas que h uma srie de micrbios disponveis para fornecer
recursos necessrios quando as condies ambientais mudam. Para os pesquisadores que
procuram entender os principais fatores do sistema, a diversidade assustadora. H, sem
dvida, uma grande quantidade de redundncia funcional entre os diversos micrbios do solo.
Se esse no fosse o caso, seria extremamente difcil cultivar plantas fora de seu habitat natural.
23
Por outro lado, pesquisas com fungos micorrzicos arbusculares (AMF) mostraram que,
enquanto a mandioca nunca encontrado sem AMF na natureza, diferentes espcies de
AMF tem efeitos radicalmente diferentes na mandioca cultivada, variando de efeito nenhum
a um aumento de 20% no rendimento. Assim, parece que enquanto uma funo geral pode
ser fornecida por um nmero de espcies diferentes, por exemplo, a aquisio de fosfato
por AMF ou a fixao de nitrognio por bactria, todos os membros de um grupo funcional
no so necessariamente iguais e alguns podem ter um impacto muito maior do que outros.
Determinar especificamente quais gentipos so ideais e por que razes ser um grande
desafio cientfico.
Grande parte da diversidade microbiana no solo provavelmente no est ativa o tempo todo,
assim, o impacto da falta de certas espcies ou grupos funcionais pode ser mnima na maioria
das circunstncias. Micrbios sem qualquer relao podem cumprir as mesmas funes
ecolgicas em momentos diferentes ou em lugares diferentes e, inversamente, um simples
micrbio pode preencher funes diferentes, dependendo das circunstncias. A contribuio
potencial de certos micrbios pode ser mascarada quando as condies so favorveis, ou
insumos como gua e nutrientes esto sendo fornecidos pelo agricultor. Responder questo
se existe um microbioma mnimo comum para as plantas ou seja, um conjunto mnimo
de micrbios que podem fornecer todos os servios essenciais ter implicaes muito
significativas para a otimizao das condies agrcolas.
CARACTERIZANDO A CAPACIDADE FUNCIONAL

Tcnicas utilizadas no estudo dos metagenmas e transcriptomas, que decorrem de informaes a partir das sequncias dos genes, pode fornecer informaes sobre quem est l e,
at certo ponto, o que esto fazendo, mas em qualquer ambiente, h uma enorme lacuna de
conhecimento entre a aquisio das sequncias dos genes e saber o que os produtos desses
genes fazem, a que organismos pertencem, e o que regula sua atividade. Este desafio ainda
maior no ambiente do solo, por ser excepcionalmente diverso. Determinar quais recursos
esto presentes em cada solo e quais aspectos da diversidade da comunidade so essenciais
para o seu funcionamento um grande desafio. Compreender a diversidade funcional ser
muito importante para podermos tirar proveito da capacidade dos micrbios para aumentar a
produtividade das plantas.
COMPREENDENDO A DINMICA DAS INTERAES

Sabemos de alguns efeitos individuais que as plantas e micrbios tm uns sobre os outros,
mas estamos muito longe de ter um mapa de todas as interaes ou ser capaz de prever
como as vrias interaes se combinam para produzir um fentipo em particular. Como
foi observado anteriormente, essas interaes so de vrios tipos qumicas, genticas,
fsicas e todas so altamente dinmicas. Abordagens manejveis para escutar todas
essas conversas podem envolver novas tcnicas de visualizao e novas ferramentas para
conectar quimiotipo (o conjunto de compostos qumicos que fluem entre os membros da
comunidade) com fentipo.
24
COMPREENDENDO A RESILINCIA
Se o objetivo final o desenvolvimento de intervenes que melhorem a produtividade
da planta e resistncia a doenas e pragas, ser necessrio descobrir em que pontos
esses sistemas complexos so suscetveis manipulao. Tratamentos que funcionam
nas condies simplificadas de laboratrio frequentemente falham quando so testados
nas condies mais complexas encontradas no campo. Isso pode ser em parte devido
concorrncia das comunidades microbianas j estabelecidas, a ausncia dos parceiros
necessrios, ou condies ambientais desfavorveis ou momento da aplicao. Ser capaz de
manipular comunidades planta-micrbio de maneira previsvel vai exigir avanos em nossa
compreenso de como as comunidades evolvem ao longo do tempo e quais caractersticas
so mais passveis para manipulao consistente.
Compreender a resilincia das comunidades microbianas tambm ser necessrio para
avaliar os riscos e benefcios da introduo de novos micrbios em ambientes agrcolas.
A aceitao pblica de suplementos microbianos ira requerer uma avaliao minuciosa do
impacto ambiental da adio de micrbios e que os mecanismos de implementao das
mudanas benficas da comunidade sejam bem compreendidos. Por exemplo, os micrbios
introduzidos alteram a diversidade das comunidades microbianas locais? Ser que eles
causam mudanas na estrutura da comunidade microbiana nativa? Essas alteraes so
benficas ou prejudiciais sade das plantas e a produtividade sustentvel? Os micrbios
introduzidos podem se espalhar para alm da cultura alvo, e seria isso um motivo de preocupao? So ainda necessrios muitos avanos na compreenso fundamental da dinmica de
comunidades para responder a estas perguntas importantes.
A ACEITAO
PBLICA DE
SUPLEMENTOS
MICROBIANOS
IRA REQUERER
UMA AVALIAO
MINUCIOSA
DO IMPACTO
AMBIENTAL
DA ADIO DE
MICRBIOS.
25
DESCOBRINDO OS PARCEIROS
EVOLUTIVOS DAS PLANTAS DE CULTIVO
O contexto microbiano em que os ancestrais das plantas de
cultivo atuais evoluram certamente diferente do contexto
atual aonde os descendentes so cultivados. Compreender
os parceiros com os quais cada planta evoluiu um alvo
altamente promissor para intervenes que visam o melhoramento da produtividade das culturas. Parece claro que as
plantas so capazes de recrutar os micrbios locais para
muitas funes, mas possvel que fornecendo as plantas
com parceiros microbianos mais estreitamente relacionadas
com aqueles com os quais a planta evoluiu, poderia permitir
uma reduo dramtica nos insumos artificiais incluindo
fertilizantes qumicos, pesticidas e herbicidas que os
seres humanos tm empregado para ajudar as plantas a
crescer em novos ambientes. Comunidades microbianas
otimizadas evolutivamente tambm podem permitir que
plantas cultivadas cresam em solos pobres ou sob
as condies menos previsveis que acompanharo as
continuas mudanas climticas.
PRODUO VISANDO
INTERAES BEM SUCEDIDAS
COMUNIDADES MICROBIANAS
OTIMIZADAS EVOLUTIVAMENTE TAMBM
PODEM PERMITIR QUE PLANTAS
CULTIVADAS CRESAM EM SOLOS
POBRES OU SOB AS CONDIES MENOS
PREVISVEIS QUE ACOMPANHARO AS
CONTINUAS MUDANAS CLIMTICAS.
26
H milnios, os melhoradores de plantas tm usado

variaes genticas naturais em vegetais para a criao de
novas variedades, e as tcnicas utilizadas vem se tornando
cada vez mais sofisticadas. No entanto, o melhoramento
de plantas com o objetivo de otimizar as interaes com
micrbios benficos conhecidos ainda no foi tentado,
mas o sucesso to provvel quanto o melhoramento
visando qualquer outra caracterstica desejvel. Da mesma
forma, ou talvez ainda melhor, deveria ser possvel produzir
micrbios benficos que interagem com mais sucesso
com uma determinada planta de cultivo. At data, os
micrbios que foram descobertos por serem benficos
num determinado contexto so, em seguida, introduzidos
no mercado como reforadores gerais de cultura. Muitas
vezes, eles no fornecem benefcios consistentes em outros
solos. No entanto, no h nenhuma razo para no tirar
proveito das variaes genticas nas populaes desses
micrbios e criar micrbios aperfeioados para aplicaes
especficas. Esta abordagem pode ser ainda mais rpida do
que o melhoramento de plantas, dada a rapidez com que os
micrbios se reproduzem. Em suma, a criao de plantas
pode explorar uma nova caracterstica para otimizao e
programas de melhoramento gentico poderiam visar o
aprimoramento das culturas microbianas.
NECESSIDADE VITAL PARA

NOVOS INSTRUMENTOS
E ABORDAGENS
MAIS, MAIS RPIDAS, E MAIS BARATAS
Tecnologias de alta capacidade para sequenciamento de cidos nucleicos como metagenmica e metatranscriptmica esto revolucionando a nossa capacidade de determinar
quais os organismos esto presentes e quais genes esto sendo expressos. Quanto mais
rpidas, mais baratas e mais acessveis essas tcnicas se tornam, mais fcil ser para discernir
padres nos microbiomas de vrias plantas em vrios ambientes.
Mas estas tcnicas com base de cidos nucleicos so apenas o incio. um longo caminho
de sequncia at a compreenso da dinmica da comunidade, metabolismo, e as respostas
perturbaes. As protenas e micromolculas pode fornecer uma interpretao muito mais
direta da atividade da comunidade do que sequncias de genes, mas as tecnologias para a
gerao de proteomas e metabolomas esto muito aqum daqueles para o sequenciamento de
cidos nucleicos. A habilidade de investigar outras molculas com a mesma alta capacidade
seria transformadora.
MELHORES ANOTAES
Com a acumulao de conjuntos de dados genmicos e transcriptmicos, identificar as
funes dos genes ainda no caracterizados est se tornando cada vez mais importante.
A combinao de esforos para caracterizar as funes dos genes com modelos que
preveem genes-chave para cada processo ecolgico ser particularmente
poderosa. Mtodos de alto rendimento para anotao de genes, descoberta e
previso funcional so urgentemente necessrios.
Como fungos e vrus presentes nas comunidades planta-microbianas
so cada vez mais includos nas anlises baseadas na sequncia
de genes das comunidades microbianas, o problema de genes
no anotados e genes de funo desconhecida esta se tornando
vertiginoso. Entretanto, h boas chances de que o estudo destes
organismos relativamente negligenciados revelar novas
vias metablicas e sintticas, e novas estratgias para
lidar com os imperativos biolgicos universais como
resistncia a patognicos e estreses. Aprender
mais sobre as funo dos genes nestes
organismos ser gratificante por si s, e sem
dvida crucial para entender a dinmica
global dos ecossistemas planta-micrbio.
27
AS RAZES
ESTO FAZENDO
MUITO MAIS
DO QUE
SIMPLESMENTE
SEGURAR
AS PLANTAS
NO LUGAR.
MODELOS EM TODAS AS ESCALAS

Modelos esto disponveis para muitos micrbios individuais, bem como para algumas
plantas (como Arabidopsis e milho). Pesquisa bsica ainda necessria sobre como
caracterizar e quantificar os diferentes tipos de interaes, inferir o comportamento do
sistema a partir dessas interaes, e prever como os organismos individuais e todo o
sistema vo reagir a perturbaes. Modelos pode avanar os estudos de qualquer relaes,
por exemplo, o papel de cada micrbio no fornecimento de nutrientes dadas as condies
ambientais, as interaes micrbio-micrbio, interaes micrbio-planta (tanto simbioses
como endosimbioses), e sistemas de mltiplas espcies. Compreender interaes plantamicrbio complexas ao nvel de sistemas vai exigir uma coleo de modelos vinculados
abrangendo escalas desde organismos individuais at interaes de pares e anlises de
cadeias entrelaadas. O objetivo final a integrao dos modelos nos diversos nveis para
fornecer uma imagem realista do comportamento do sistema.
Os modelos so mais poderosos quando so desenvolvidos em conjunto com abordagens
experimentais. Iterao entre os resultados observados na pratica e a teoria, leva a
compreenso com mais rapidez. Para alcanar uma verdadeira biologia de sistemas de
interaes planta-micrbio preciso uma base computacional robusta.
TCNICAS PARA O ESTUDO DA RIZOSFERA

As razes esto fazendo muito mais do que simplesmente segurar as plantas no lugar. As
inumerveis interaes que ocorrem entre as razes das plantas, seus exsudatos, e as milhares
de espcies de micrbios no solo so fundamentais para a sade e produtividade das plantas.
Entretanto, permanecem na sua maioria, uma caixa preta. Os mtodos para estudar estas
interaes a um nvel molecular e em tempo e espao real, so essenciais, para poder-se
determinar a comunidade ideal para a produtividade da planta e com optimizar com sucesso o
microbioma do solo no campo.
ESTABELESCENDO MTRICAS DE PRODUTIVIDADE E RENDIMENTO

Uma questo bastante complicada a necessidade de desenvolver um consenso para
medidas de produtividade e rendimentos ideais. S com boas mtricas quantitativas, ser
possvel demonstrar o valor das intervenes baseadas em micrbios.
28
TRANSFERINDO
DESCOBERTAS PARA AS
MOS DOS AGRICULTORES
Em todas as reas da cincia, existem desafios em traduzir os
avanos no conhecimento bsico em novos produtos e aplicaes
prticas. A rea de interaes planta-micrbio no diferente, e de
fato, as experincias passadas deixaram um legado de ceticismo
sobre se as descobertas nesta rea pode ser aplicados no mundo
real dos agricultores.
Uma exploso de interesse e pesquisa h vrias dcadas no tema do controle biolgico
usando micrbios para proteger as plantas contra doenas levou a alguns produtos de
sucesso, mas muitos tratamentos base de micrbios que mostraram resultados promissores
29
O IMPULSO
DA CINCIA,
COMBINADO
COM A URGNCIA
INEGVEL DO
PROBLEMA,
SUGEREM QUE
O MOMENTO
PROPCIO PARA
O INVESTIMENTO
EM INTERAES
PLANTAMICRBIO COM
O OBJETIVO DE
MELHORAR A
PRODUTIVIDADE
AGRCOLA.
nas condies controladas de laboratrio ou em estufas, foram infrutferos quando aplicados

no campo. luz da evidncia emergente de que as interaes planta-micrbio so complexas
e altamente interdependentes, provvel que as falhas anteriores resultaram da incapacidade
de prever as condies que permitiriam que um micrbio introduzido pudesse se estabelecer e
fornecer o servio desejado. Agora est claro que a introduo de um nico micrbio pode ser
ineficaz se um parceiro fundamental no est presente, ou se um concorrente est ocupando o
nicho alvo. A superao desse obstculo no ser trivial, mas a conscincia da complexidade
e dinamismo destes ecossistemas um importante primeiro passo. Como muitos avanos
foram feitos nos ltimos 20 anos e com tantas tecnologias novas a disposio, hora de lanar
um novo olhar sobre essa rea.
Ecologia microbiana est passando por um renascimento trazendo muitas inovaes que
possibilitam o estudo em diversos ambientes. Do oceano ao intestino humano, pesquisadores
esto aprendendo mais e mais sobre como as comunidades microbianas complexas se
formam e mudam ao longo do tempo. O ambiente do solo muitas vezes caracterizado como
o mais complicado de todos, e talvez o mais difcil de estudar. Mas provvel que muitos
princpios subjacentes so compartilhados entre essas assembleias microbianas e a ecologia
microbiana do solo deve se beneficiar dos avanos conquistados em outros ambientes.
O impulso da cincia, combinado com a urgncia inegvel do problema, sugerem que o
momento propcio para o investimento em interaes planta-micrbio com o objetivo de
melhorar a produtividade agrcola. Se este o caso, qual e a melhor forma para estruturar
esse investimento? Os participantes deste colquio concordaram que uma abordagem em trs
fases, modeladas vagamente nos ensaios clnicos utilizado para tratamentos biomdicos, seria
a mais propensa a dar bons frutos em tempo hbil.
RECOMENDAO 1:
INVESTIR EM PESQUISA BSICA IMPULSIONADA PELA CURIOSIDADE
H um dilema central e inevitvel no mago de todas os apelos para aumentar o investimento
em uma rea determinada de pesquisa bsica. A experincia nos diz que, apesar
de praticamente todos os produtos inovadores dependerem de avanos em
pesquisa bsica, impossvel prever quais projetos de pesquisa fundamental
traro resultados mais rapidamente. Uma frmula que tem sido extremamente bem sucedida nas ltimas seis dcadas o apoio pblico
de investimento em projetos iniciados pelos pesquisadores por
curiosidade, com os projetos sendo escolhidos com base
em reviso paritria.
30
RECOMENDAO 2:
ASSUMIR UM OU MAIS GRANDES DESAFIOS
Embora reconhecendo que as descobertas importantes provavelmente viro da simples
abordagem cientfica, o campo de interaes beneficiais planta-micrbio excepcionalmente
amplo, e apoio financeiro a pesquisa no ilimitado. Definir um grande desafio como alvo para
todos os projetos pode ser inspirador, tanto para os cientistas como para o pblico em geral,
e pode ser organizado de forma a incluir o investimento em necessidades de infraestrutura e
tecnologia que beneficiam a comunidade cientfica em geral, bem como aqueles que trabalham
no grande desafio em si. Uma gama de oportunidades de financiamento podem ser usadas
para atender a um desafio, desde projetos desenvolvidos por um simples investigador por
curiosidade, ao desenvolvimento de ferramentas especficas, at o estabelecimento de
equipes ou centros de pesquisa. Grandes desafios so mais bem sucedidos quando so mais
ambiciosos, indo alm das abordagens de financiamento convencionais, mas mantendo-se
realistas. Um ponto final mensurvel que represente a concluso do desafio altamente desejvel. Na rea das interaes planta-micrbio, muitos desses objetivos so possveis, dentro
dos quais as possibilidades de pesquisa bsica seriam timas. Alguns desafios significativos e
viveis identificados durante o colquio foram:
20:20 em 20 aumentar a produtividade 20%, reduzindo o uso de pesticidas

e fertilizantes em 20% em 20 anos: O desafio com foco mais pratico necessita
de pesquisa que contribua para o aumento da produtividade das culturas, e
simultaneamente a reduo da demanda de insumos externos. Os participantes do
colquio concordaram que o objetivo de aumentar a produtividade em 20% enquanto
reduzindo de forma semelhante insumos qumicos, ambicioso, mas atingvel, com
benefcios dramticos para os consumidores, agricultores e meio ambiente.
Caracterizar completamente o microbioma de uma simples cultura importante:

Tal projeto examinaria os parceiros microbianos de uma planta em particular atravs
de vrios parmetros como os parceiros microbianos variam em diferentes reas
geogrficas, em diferentes estgios de desenvolvimento, a partir de linhagem para
linhagem, sob regimes diferentes de tratamento e cultivo? Quais foram os parceiros
microbianos dos ancestrais selvagens das plantas cultivadas? Como as comunidades
microbianas associadas com a planta reagem s mudanas de temperatura, humidade
e nveis atmosfricos de CO2 e como influenciam as respostas das plantas para essas
mudanas? Quais so as propriedades biolgicas dos parceiros microbianos e h
um microbioma mnimo ou central? Pode a introduo de micrbios especficos ter
uma influncia previsvel sobre a biologia ou o desempenho da planta hospedeira?
Caracterizar a resposta de uma variedade de comunidades planta-micrbio

a uma estrese em especial: Incluindo sistemas planta-micrbio cultivados e
selvagens, tal projeto se concentraria em respostas mltiplas para um nico
fator estressante como seca, salinidade ou limitao de nutrientes.
31
O PROCESSO DE
DESENVOLVIMENTO
DESTES
PROTOCOLOS
J SERIA UMA
OPORTUNIDADE
PARA QUE
OS VRIOS
INTERESSADOS
CIENTISTAS,
AGNCIAS DE
FINANCIAMENTO,
AGNCIAS
REGULADORAS,
EMPRESAS
PRIVADAS,
PROGRAMAS
DE EXTENSO
E GRUPOS DE
CONSUMIDORES
PARA COMEAR
A TRABALHAR
UNS COM OS
OUTROS DE FORMA
PRODUTIVA.
RECOMENDAO 3:
ESTABELECER UM PROCESSO FORMAL PARA TRANSFERIR
DESCOBERTAS DO LABORATRIO PARA O CAMPO
Incentivar os investigadores a identificar possveis aplicaes para as descobertas

bsicas: O investimento em pesquisa orientada por curiosidade certamente vai
resultar em descobertas com aplicaes prticas. Auxilio deve estar disponvel
para os pesquisadores que desejam explorar a possibilidade de mover as suas
descobertas para linha de aplicao. O objetivo seria suscitar uma ampla diversidade
de abordagens, com o avano para a prxima fase com base na reviso paritria.
Suportar um grande nmero de projetos-piloto que visem avaliar tratamentos

baseados em descobertas fundamentais: Projetos nesta fase seriam avaliados
em termos de eficcia e segurana, com normas e protocolos estabelecidos para
medir os resultados e avaliao de riscos. Nem todos os tratamentos envolveriam a
introduo de novos organismos viveis; em alguns casos, pode ser possvel alterar
as condies externas de maneira que favorea o estabelecimento ou a resilincia
de uma comunidade micrbio-planta optimizada. Estabelecer normas para avaliar o
risco de organismos introduzidos ser essencial para a se ganhar a aprovao dos
rgos reguladores e do pblico. Envolver uma ampla base de interessados nesta
fase, incluindo potenciais usurios, agentes de extenso, agncias reguladoras,
grupos de consumidores e outros, provavelmente til. Criar uma conscincia
de como micrbios e plantas interagem e discutir os riscos e benefcios das
estratgias para promover interaes beneficiais ir contribuir para uma adoo
mais bem sucedida quando as novas aplicaes atingirem o estgio comercial.
Ensaios de campo abrangentes dos projetos-piloto de maior sucesso: Como

descrito acima, os esforos bem sucedidos de uso de micrbios na agricultura
resultou do conhecimento especifico de micrbios, funes microbianas ou interaes
planta-micrbio. No entanto, fatores adicionais no processo de comercializao
desempenham um grande papel na traduo bem sucedida de uma determinada
descoberta. Esses fatores incluem questes tcnicas como aumentar a escala de
produo e manter a viabilidade atravs da cadeia de abastecimento, as preocupaes
empresariais, como alocao de propriedade intelectual e aprovao de regulaes,
e as preocupaes da sociedade como receptividade pelos agricultores e aceitao
do consumidor. Mesmo um avano cientfico impressionante apenas o primeiro
passo para a transferncia de conhecimento para aumentar a produtividade
agrcola e a sustentabilidade. As histrias de sucesso indicam que a incluso de
todas as partes interessadas durante todo o processo extremamente valioso.
Porque esses fatores no-cientficos pesam tanto no sucesso final da transio de descobertas
em aplicao, seria til desenvolver protocolos padronizados, sistmicos e escalonados para
a transio do laboratrio para o campo. O processo de desenvolvimento destes protocolos
j seria uma oportunidade para que os vrios interessados cientistas, agncias de
financiamento, agncias reguladoras, empresas privadas, programas de extenso e grupos de
consumidores para comear a trabalhar uns com os outros de forma produtiva.
32
CONCLUSO
Alcanar a segurana alimentar para uma populao global ainda em
expanso um desafio grande e complexo. O aumento da produtividade
agrcola sem aumentar a presso sobre os ambientes naturais ou
consumir mais combustveis fsseis uma meta que vai exigir progresso
em muitas frentes. Algumas vezes, no entanto, uma grande necessidade
e uma nova oportunidade coincidem e as discusses do colquio
resumidas neste relatrio demonstram que essa hora chegada. Todas
as plantas, em todos os ambientes, dependem de micrbios e portanto,
potencialmente todas as culturas, no importa onde so cultivados,
poderiam se beneficiar da otimizao de seus parceiros microbianos.
o momento certo para se alistar as capacidades do mundo microbiano
para ajudar a resolver este problema humano urgente.
P EN S AR D ES IGN GROUP
WWW.P EN S ARED ES IGN .COM

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UM RELATRIO DA ACADEMIA AMERICANA DE MICROBIOLOGIA

Como os micrbios podem ajudar

National Science Foundation

n National Institute for Food and

Academia Americana de Microbiologia

Harsh Bais, Ph.D.

Eric Triplett, Ph.D.

Gwyn Beattie, Ph.D.

Prem Warrior, Ph.D.

Michael P. Doyle, Ph.D.

Peter Young, Ph.D.

Ken Giller, Ph.D.

Christin Zachow, Dr. Dipl.Biol.

Bernard R. Glick, Ph.D.

Gabriel Iturriaga, Ph.D.

Linda Kinkel, Ph.D.

Steven E. Lindow, Ph.D.

Shannon E. Greene, Ph.D.

Como Os Micrbios Podem Ajudar A Alimentar O Mundo

Mas e se a lacuna de rendimento pudesse ser fechada de outra forma, se o rendimento

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Micrbios suportam a sade das planta, aumentando a disponibilidade de nutrientes,

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POR QUE AS PLANTAS

Quando pensamos em uma planta de milho ou uma macieira, parece

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O nmero de interaes planta-micrbio reconhecidas vasto e cresce o tempo todo, e podem

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organismos por grama de solo

biomassa por grama de solo

total de genes estimado por grama de solo

nmero total de genes

tamanho medio do genoma dos organismos

biomassa total (g)

de plantas, principalmente rvores, so associados com um outro tipo de fungo, discutido

Como Os Micrbios Podem Ajudar A Alimentar O Mundo

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As plantas conseguem absorver somente Fsforo inorgnico

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PATOGNIOS E RESISTNCIA A PREDADORES

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ANLISE DO CUSTO-BENEFCIO DAS INTERAES PLANTA-MICRBIO.

carboidratos para certos micrbios no retorno para a dissuaso de patognicos, predadores

RESISTINDO O ESTRESSE AMBIENTAL

Seca As plantas precisam de gua para manter sua estrutura

Como Os Micrbios Podem Ajudar A Alimentar O Mundo

Um Relatrio Da Academia Americana De Microbiologia

de absoro de gua do solo. Fitovrus agudos que, em condies normais, causam

Inundaes Embora as plantas necessitam de gua para sobreviver, o excesso

Salinidade Excesso de sais no solo mimetiza as condies de seca para a planta,

Contaminao por metais pesados Contaminao do solo e das guas

Contaminao por poluentes orgnicos A gama de rotas de biossntese e

Altas temperaturas Todas as enzimas tm faixas de temperatura nas quais funcionam

Baixas temperaturas Temperaturas frias resultam em um crescimento

Como Os Micrbios Podem Ajudar A Alimentar O Mundo

O POTENCIAL INEXPLORADO DA BIODIVERSIDADE MICROBIANA

CRESCIMENTO E DESENVOLVIMENTO NORMAIS

Um Relatrio Da Academia Americana De Microbiologia

Como Os Micrbios Podem Ajudar A Alimentar O Mundo

Um Relatrio Da Academia Americana De Microbiologia

n National Institute for Food and