Biologia

Grau en Qumica
Curs 2013 2014
Universitat de les Illes Balears

Resumen
La energa de la vida
La clula viva es una fbrica de productos qumicos en miniatura, donde

se producen miles de reacciones

La clula extrae energa y utiliza la energa para realizar el trabajo de
anabolismo y catabolismo
Algunos organismos incluso convierten la energa en energa luminosa, como en la
bioluminiscencia

Concepto 1
El metabolismo de un organismo transforma la materia y
la energa, de acuerdo a las leyes de la termodinmica
El metabolismo es el conjunto de reacciones qumicas de un organismo
Anabolismo: biosntesis, sntesis o bioformacin de molculas orgnicas

(biomolculas) complejas a partir de ms sencillas o de los nutrientes, con

requerimiento de energa siendo reacciones endotrmicas o endergnicas

Catabolismo: transformacin de biomolculas

complejas en molculas
sencillas y almacenamiento de la energa qumica producida en forma de
enlaces fosfato y de molculas de ATP, por destruccin de molculas con gran
cantidad de enlaces covalentes siendo reacciones qumicas exotrmicas o
exergnicas

El metabolismo es una propiedad inherente de la vida que surge de las

interacciones entre las molculas que se producen dentro de la clula

Organizacin de la qumica de la vida en

vas metablicas
Una va metablica comienza con una molcula especfica y termina con un
producto
Cada paso est catalizado por una enzima especfica

Enzima 1
A

B
Reaccin 1

Reactivos

Enzima 2

Enzima 3
D

C
Reaccin 2

Reaccin 3

Productos

 Las vas catablicas liberan energa, rompiendo molculas complejas y obteniendo

molculas ms simples
Las vas anablicas consumen energa, esta es utilizada para construir molculas
complejas a partir de otras ms simples

La bioenergtica es el estudio de la forma como los organismos gestionan sus recursos

energticos

Rutas de degradacin para obtener energa

Rutas de sntesis de nuevos compuestos

Formas de Energa
La energa es la capacidad de producir cambios
La energa existe en diversas formas, algunas de las cuales pueden realizar un trabajo

La energa cintica es la energa

asociada con el movimiento
El calor (energa trmica) es la
energa cintica asociada con el
movimiento al azar de los tomos o
molculas que pasa al ambiente

Sobre la plataforma
el nadador presenta
ms energa potencial
El nadador convierte
la energa potencial
en energa cintica

La energa potencial es la energa que

la materia posee por su ubicacin en el
espacio o bien por su estructura
La energa qumica es la energa
potencial disponible para la
realizacin de una reaccin qumica
La energa puede ser transformada de
una forma a otra

En el agua el nadador
presenta menos
energa potencial.

Al subir se convierte
la energa cintica
(del movimiento muscular)
en energa potencial.

Las Leyes de la transformacin de la Energa

La termodinmica es el estudio de las transformaciones de la energa
Un sistema cerrado, al que se aproxima un lquido en un termo, est aislado de su
entorno
En un sistema abierto, la energa y la materia pueden ser transferidos entre el
sistema y su entorno
Los organismos son sistemas abiertos

La Primera Ley de la Termodinmica

Segn la primera ley de la termodinmica, la energa del universo es constante
La energa puede ser transferida y transformada
La energa ni se crea ni se destruye

La primera ley tambin se llama el principio de conservacin de la energa

La Segunda Ley de la Termodinmica

Durante la transferencia de energa o su transformacin, existe una parte de
energa que no es utilizable y a menudo se pierde en forma de calor
Segn la segunda ley de la termodinmica, cada transferencia de energa o su
transformacin aumenta la entropa (el desorden) del universo. Poner orden
cuesta energa

Leyes de la Termodinmica
Calor

Energia
qumica

Primera ley de la
termodinamica

CO2
H2O

Segunda ley de la termodinamica

Orden y desorden biolgico

Las clulas vivas inevitablemente convierten formas organizadas de energa para calentar
Los procesos espontneos se producen sin ningn aporte de energa, y pueden producirse
rpidamente o lentamente

Para que un proceso se produzca sin una fuente de energa, tiene como consecuencia que
debe aumentar la entropa del universo
Las clulas crean estructuras ordenadas a partir de materiales menos ordenados
Los organismos tambin sustituyen las formas ordenadas de materia y energa con formas
menos ordenadas
La evolucin de organismos ms complejos no viola la segunda ley de la termodinmica
La entropa (desorden) puede disminuir en un organismo (organizacin), pero aumenta la
entropa total del universo

Concepto 2
El cambio de energa libre de una reaccin nos dice
si la reaccin ocurre de manera espontnea
Los bilogos quieren saber qu reacciones se producen de forma espontnea y
necesitan aporte de energa

cuales

Para ello, es necesario determinar los cambios de energa que se producen en las reacciones
qumicas
La energa libre de un sistema vivo es la energa que puede realizar un trabajo cuando la
temperatura y la presin son uniformes (constantes), como ocurre en una clula viva
El cambio de Energa libre (G ) durante un proceso se relaciona con el cambio de
Entalpa, o el cambio en la energa total (H), y el cambio de entropa (TS):
G = H - TS
Slo los procesos con una G negativa son espontneos
Los procesos espontneos pueden aprovecharse para realizar un trabajo

Energa libre, estabilidad y equilibrio

La energa libre es una medida de la inestabilidad de un sistema, su tendencia a cambiar a un
estado ms estable
Durante un cambio espontneo, disminuye la energa libre por lo que aumenta la estabilidad
del sistema
El equilibrio es un estado de mxima estabilidad
Un proceso es espontneo y puede realizar trabajo slo cuando se est dirigiendo hacia el
equilibrio

Movimiento gravitacional Difusin

Reaccin qumica

Energa libre y Metabolismo

Cambios de energa libre <0

Cambios de energa libre >0

Reaccin endergnicas
G > 0

Requieren energa
Reaccin endergnica
G < 0
Liberan energa

Espontneas
Reacciones endergnicas se
pueden acoplar a exergnicas
con lo que la variacin total de
energa libre es negativa

Exergnica
Endergnica

Energa libre y Metabolismo

Energa Libre

Reactivos o Reactantes

Cantidad de
energa
liberada
(G < 0)
Energa
Productos

Progreso de la reaccin
Reaccin exergnica: liberacin de energa

Energa libre y Metabolismo

Energa libre

Productos

Energa
Reactantes

Progreso de la reaccin
Reaccin endergnica: necesidad de energa

Cantidad de
Energa
necesaria
(G > 0)

Equilibrio y Metabolismo
Las reacciones en un sistema cerrado alcanzan finalmente el equilibrio y luego no
hacen ningn trabajo
Las clulas no estn en equilibrio, sino que son sistemas abiertos que
experimentan un flujo constante de materiales

Una va catablica en una clula libera energa libre en una serie de reacciones
Los sistemas hidroelctricos cerrados y abiertos pueden servir como ejemplos o
analogas

G < 0

Sistema hidroelctrico cerrado

G = 0

G < 0

Sistema hidroelctrico abierto

G < 0
G < 0
G < 0

Sistema hidroelctrico multietapas abierto

Concepto 3
El ATP permite el trabajo celular mediante el
acoplamiento de reacciones exergnicas con
reacciones endergnicas
Una clula realiza tres tipos principales
de trabajo:
Mecnico
Transporte
Qumico

Para hacer el trabajo, las clulas deben

administrar sus recursos energticos
mediante el acoplamiento energtico,
utilizando un proceso de exergnico
para realizar uno endergnico

La estructura y la hidrlisis de ATP

ATP (trifosfato de adenosina) es el transportista qumico de energa celular
ATP proporciona energa para las funciones celulares
Adenina

Grupos fosfato
Ribosa

La estructura y la hidrlisis de ATP

Los enlaces entre los grupos fosfato de la cola de ATP pueden romperse por mediante
hidrlisis

La energa se libera desde el ATP cuando se hidroliza y rompe el enlace fosfato terminal
Esta liberacin de energa proviene del cambio qumico de la molcula a un estado de menor
energa libre, no de la energa del enlace de fosfato por si mismo

P
H2O

Adenosina trifosfato (ATP)

Pi

Fosfato inorgnico

Adenosina difosfato (ADP)

Energa

 En la clula, la energa de la reaccin exergnica de la hidrlisis del ATP se puede

utilizar para realizar una reaccin endergnica
En general, las reacciones acopladas a una reaccin endergnica son exergnicas
Reaccin endergnica: G es positiva, la reaccin
es NO espontnea
NH2
Glu

Acido
Glutmico

NH3

Amonaco

Glu

G = +3.4 kcal/mol

Glutamina

Reaccin exergnica: G es negativa, la reaccin

es espontnea

ATP

H2O

ADP +

Pi

Las reacciones acopladas: La suma G es negativa;

as pues, el conjunto de las dos reacciones
es espontneo

G = 7.3 kcal/mol

G = 3.9 kcal/mol

El ATP

El ATP

Proteina motora

Pi

Protein trasladada

Trabajo mecnico: ATP fosforila las proteinas motoras

La energa de la reaccin
exergnica de la hidrlisis del
ATP se puede utilizar para
realizar
una
reaccin
endergnica

Proteina de
membrana
ADP
+
Pi

ATP
Pi

La molcula receptora queda

fosforilada
Los tres tipos de trabajo celular
(mecnico,
transporte
y
qumico) son impulsados por la
hidrlisis de ATP

Soluto transportado

Soluto

Trabajo de transporte: ATP fosforila las proteinas de transporte

P
NH2
Glu

NH3

Pi

Glu

Reactivos: cido glutamicco Productos (glutamina)

y amoniaco
sintetizada
Trabajo qumico: ATP fosforila los reactivos clave

La regeneracin del ATP

El ATP es un recurso renovable que se regenera por adicin de un grupo fosfato al

ADP
La energa para fosforilar el ADP proviene de las reacciones catablicas en la clula
La energa potencial qumica, almacenada temporalmente en unidades de ATP,
conduce y posibilita la mayora del trabajo celular
ATP

Energa del catabolismo

(exergnica, procesos
productores de energa)

ADP +

Pi

Energa para el trabajo celular

(endergnico, procesos
consumidores de energa)

Concepto 4
Las enzimas aceleran las reacciones metablicas
reduciendo las barreras energticas
Un catalizador es una sustancia qumica que acelera una reaccin sin consumirse
durante la reaccin
Una enzima es una protena catalizadora

La hidrlisis de la sacarosa por la enzima sacarasa es un ejemplo de una reaccin

catalizada por una enzima

Sucrosa
C12H22O11

Glucosa
C6H12O6

Fructosa
C6H12O6

La barrera de la energa libre de

activacin
Cada reaccin qumica entre molculas, implica la rotura de enlaces y la formacin
de nuevos enlaces
La energa inicial necesaria para iniciar una reaccin qumica se llama energa libre
de activacin, o energa de activacin (EA)
La energa de activacin normalmente suele suministrarse en forma de calor del

medio donde se realiza la reaccin

Energia libre

Estado de transicin

EA

Reactantes
A

B
G < O

Productos
Progreso de la reaccion

Cmo los enzimas reducen la barrera

de la EA
Las enzimas catalizan las reacciones mediante la reduccin de la barrera de la EA

Las enzimas no afectan a la variacin de energa libre (G), sino que aceleran las reacciones
que se produciran, s o s, espontneamente al cabo de cierto tiempo

Energa libre

Curso de
la reaccin
sin
enzima

EA
sin
enzima
EA con
enzima
es ms baja

Reactivos Curso de la
reaccin
con enzima

G no es afectada
por el enzima

Productos
Progreso de la reacin

Especificidad de las enzimas por el sustrato

El reactivo sobre el que acta una enzima se llama sustrato enzimtico
La enzima se une a su sustrato, formando un complejo enzima-sustrato
El centro activo es la regin de la enzima donde se une el sustrato ya que es especfica para
ste
El ajuste inducido de un sustrato sita a los grupos qumicos del sitio activo en posiciones
que mejoran su capacidad para catalizar la reaccin

Sustrato
Centro activo

Enzima

Complejo enzima-sustrato

Catlisis en el sitio o centro activo del

enzima

En una reaccin enzimtica, el sustrato se une al sitio o centro activo

El centro activo permite reducir la barrera de la EA mediante

1.
2.

3.
4.

Orientando correctamente el sustrato

Debilitando los enlaces del sustrato
Proporcionar un microambiente favorable
Unindose covalentemente al sustrato

Los sustratos entran al centro activo: el enzima

modifica su forma de forma que permite la posicin
de los dos sustratos (ajuste inducido)

Los sutratos se mantienen en el

centro activo mediante interacciones
ligeras como son por ejemplo
puentes de hidrgeno o
enlaces inicos

Sustratos
Complejo
enzima-sustrato

El centro
activo est
disponible para
dos nuevas
molculas
de sustrato.

Enzima

Los productos
Son liberados.

Sustratos son
convertidos
en productos
Productos

Centro activo (y grupos R de

sus aminocidos) pueden
disminuir la EA e incrementar la
velocidad de reaccin mediante:
actuando como molde para
orientar el sustrato
debilitando los enlaces del sustrato
y estabilizando el estado de transicin
originando un microambiente
favorable
participando directamente en la
reaccin cataltica

Efectos de las condiciones locales en la

actividad enzimtica

La actividad enzimtica pueden afectarse por:

Factores ambientales generales, tales como:

Temperatura
Fuerza inica
pH
Productos o sustancias qumicas que influyen especficamente en el enzima

Efectos de la
temperatura, la
fuerza inica y el pH
Cada enzima tiene una
temperatura ptima en la
que puede funcionar

Temperatura ptima para

un enzima normal humano

Temperatura ptima para

un enzima termoflico
(bacterias tolerantes a la
temperatura)

80
40
60
Temperatura (C)
Temperatura ptima para dos enzimas
0

20

Cada enzima tiene una

fuerza inica ptima en el
que puede funcionar

pH ptimo para pepsina

(enzima del estmago)

Cada enzima tiene un pH

ptimo en el que puede
funcionar
0

4
pH

pH ptimo para dos enzimas

100

pH ptimo
para
tripsina
(enzima
intestinal)

10

Cofactores
Los cofactores son ayudantes enzimticos no proteicos

Los cofactores pueden estar:

Estrechamente unidos a la molcula de enzima
(enlaces covalentes)
Grupos prostticos
Unidos dbilmente al enzima (fuerzas dbiles)
Cosustratos
Tipos de cofactores:
Iones metlicos
Cu2+, Fe3+, Zn2+
Molculas orgnicas
Coenzimas

Inhibidores
enzimticos
Sustancias que se unen al enzima y
disminuyen su actividad

Inhibidores
competitivos:
el
inhibidor se une al sitio activo de una
enzima, compitiendo con el sustrato
Inhibidores no competitivos: el
inhibidor se une a otra parte de una
enzima, provocando que la enzima
cambie
de
conformacin
tridimensional y haciendo que el sitio o
centro activo sea menos eficaz o
totalmente ineficaz

Un substrato puede
unirse normalmente
al centro activo
de un enzima

Sustrato
Centro activo

Enzima

Unin normal
Un inhibidor competitivo
mimetiza el sustrato,
compitiendo por
el sitio activo

Inhibidor
competitivo

Inhibicin competitiva

Un inhibidor no competitivo,
se une al enzima
en un centro o zona alejada
del centro activo,
modificando la conformacin
del enzima, de modo que
el centro activo queda con
una conformacin no funcional

Inhibidor no competitivo
Inhibicin no competitiva

Concepto 5
La regulacin de la actividad enzimtica
ayuda a controlar el metabolismo
El caos qumico se producira en una clula si las vas metablicas no estuvieran
reguladas de forma estricta
Para regular las rutas o vas metablicas, la clula enciende o apaga los genes
que codifican las enzimas especficas de la va

Regulacin alostrica de las enzimas

Regulacin alostrica es el trmino utilizado para describir los casos en que la
funcin de una protena en un lugar (centro activo) se ve afectada por la unin de
una molcula reguladora en otro lugar (centro alostrico)

La regulacin alostrica puede inhibir o estimular la actividad enzimtica

Activacin e
inhibicin alostrica
La mayora de las enzimas
reguladas alostricamente estn
hechas
por
subunidades
polipeptdicas
Cada enzima presenta
activas e inactivas

Activador alostrico
estabiliza la forma activa

Enzima alostrico Centro activo

con 4 subunidades (uno de cuatro)

Centro
regulador
(uno de cuatro) Forma
activa

Oscilacin

formas

Activador
Forma activa
estabilizada
Inhibidor alostrico
estabiliza la forma inactiva

La unin de un activador estabiliza

la forma activa de la enzima

La unin de un inhibidor estabiliza

la forma inactiva de la enzima

Centro activo
no funcional

Inhibidor
Forma inactiva
Forma
estabilizada
inactiva
Activadores e inhibidores alostricos

Cooperatividad
La cooperatividad es una forma de regulacin alostrica que puede amplificar la

actividad enzimtica
En la cooperatividad, la unin de un sustrato a un sitio activo produce y estabiliza
cambios conformacionales favorables en todas las otras subunidades
La unin de una molcula de sustrato
al centro activo sita todas las
subunidades en una conformacin activa
Sustrato

Forma inactiva

Forma activa estabilizada

Cooperatividad, otro tipo de activacin alostrica

La inhibicin por
retroaccin o
retroalimentacin
(Feedback Inhibition)

Sustrato inicial
(treonina)
Centro activo
disponible

La inhibicin por retroalimentacin

impide a una clula el derroche de
recursos mediante la sntesis

qumica de ms producto que el

necesario

Enzima 1
(treonina
deaminasa)

Isoleucina
utilizada por
la clula
Inhibicin
por
retroaccin

En la inhibicin por retroalimentacin, el producto final de

una va metablica cierra la
actividad de la va cuando se alcanza
una determinada concentracin

Sitio o centro
activo de treonina

Isoleucina
unida al
sitio
alosterico

Intermedio A
Enzima 2

Centro activo de
enzima 1
que no
Intermedio B
puede
unirse a
Enzima 3
la treonina
VIA CERRADA
Intermedio C
Enzima 4

Intermedio D
Enzima 5

Producto final
(isoleucina)

Localizacin especfica de las enzimas

dentro de la clula
Las estructuras del interior de la clula ayudan a poner en orden a las vas
metablicas
Algunas enzimas actan como componentes estructurales de las membranas
Algunas enzimas residen en orgnulos especficos, como las enzimas para la
respiracin celular que se encuentran en las mitocondrias
Mitocondria,
Lugar de la respiracin celular

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