CAPITULO 5 NUTRICION, CULTIVO Y METABOLISMO MICROBIANO

MINIREVISIN
5.1 nutricin microbiana
Qu dos clases de molculas contienen la mayor parte del nitrgeno de una
clula?
-

NH3 y NO3-

Por qu un elemento como el Co2+ se considera un micronutriente y un

elemento como el C un macronutriente?
-porque se requiere en pequeas cantidades mientras que el C est presente
en todo el organismo.
Qu papeles desarrolla el hierro en el metabolismo celular? Qu mecanismos
son los responsables del secuestro del hierro?
-Juega un papel importante en la respiracin celular y representa un elemento
clave de los citocromos y las protenas presentes en el transporte de electrones
que contienen hierro y azufre.
-los agentes quelantes de hierro llamados sideroforos que solubilizan el hierro y
lo transportan dentro de la clula.
5.2 Medios de cultivo
Por qu es ms fcil el crecimiento rutinario de Leuconostoc mesenteroides en
un medio complejo que en un medio definido?
-Porque requiere mltiples factores de crecimiento y el medio complejo
contiene un alto contenido de nutrientes.
De los medios mostrados en la tabla 5.4 seale en que medio, definido o
complejo, crecera ms rpido E. Coli y comente la razn. Por qu E. coli no
crecera en el medio descrito para Thiobacillus thioparus?
-En el medio definido solo para E. coli ya que solamente permitira el
crecimiento de esta bacteria y no crecera en el de T.thioparus porque igual es
solo definido para esa bacteria y no permite el crecimiento de otra.
5.3 cultivo de microorganismos en el laboratorio
Qu significa la palabra estril? Qu ocurrira si los medios de cultivo no se
esterilizan tras su preparacin y se dejaran a temperatura ambiente?
-Estril significa ausencia de microorganismos.
-Si no se esterilizara se llenara de otros contaminantes no deseados y eso
afectara en el resultado que quisiramos obtener.
Por qu es necesaria la tcnica asptica en la obtencin de cultivos puros en
el laboratorio?
-Para evitar la contaminacin durante la manipulacin de los cultivos y de los
medios de cultivos estriles.

5.4 bioenergtica
Qu es la energa libre?
-Es la energa liberada que es utilizable para realizar un trabajo.
En general, las reacciones catablicas son exergonicas o endergonicas?
-Son de las dos maneras ya que existen reacciones que liberan y obtienen
energa.
Usando los datos de la tabla 5.5, calcule el valor de deltaG 0 para la siguiente
reaccin: CH4 + O2 CH3- OH. Enqu se diferencian G0 y Gf?
= -175.4 (-50.8+0) = -124.6 por lo tanto es exergnica.
-El primero indica el cambio de energa libre durante una reaccin y el segundo
indica que los compuestos tienen a formarse espontneamente a partir de sus
elementos.
La formacin de glucosa a partir de sus elementos libera o requiere energa?
-libera energa ya que forma 2 ATP.
5.5 catlisis y enzimas
Cul es la funcin de un catalizador? Qu tipo de macromolculas son las
enzimas?
-Un catalizador regula la velocidad de reaccin.
-Las enzimas son protenas.
Pordnde se une una enzima a su sustrato?
-Se unen por el sitio activo.
Qu es la energa de activacin?
-Es la energa mnima para que empiece a darse la reaccin qumica.
5.6 oxidacin y reduccin: donadores y aceptores de electrones
En la reaccin entre H2 y 1/2 O2 H2O Cul es el donador y cual el aceptor
de electrones?
-El H2 dona los electrones y el O2 es el aceptor de electrones.
Cul es el valor E0 del par 2H+ / H2? Son los protones buenos aceptores de
electrones? Por qu?
-E0 es -0.421 V
-Los protones son buenos aceptores ya que tiene el signo contrario de los
electrones y se atraen.
Por qu el nitrato (NO3-) es un aceptor de electrones mejor que el fumarato?
-Porque el NO3- es un reductor ms fuerte.

5.7 El NAD como un transportador redox de electrones

Repase la figura 5.10 Es el NADH un donador de electrones mejor que el H2?
Es el NAD+ un aceptor de electrones mejor que el H2? Cmo se determina
esto?
-Pues hay una pequea diferencia en el potencial de reduccin de ambos casos
y se tiene que el H2 tiene un potencial 0.10 mayor que el NADH.
5.8 compuestos de alta energa y almacenamiento de energa
Cunta energa se libera por mol de ATP convertido a ADP+ Pi? Y por mol de
AMP convertido a adenosina + Pi?
-El primer caso el ATP libera 32KJ/mol de energa mientras que el AMP es
16KJ/mol de energa.
Seale como puede la clula prepararse para periodos de ayuno nutricional
tras periodos de abundancia de nutrientes.
-Se guardan reservas energticas en polmeros como el almidn y los lpidos
los cuales ante la ausencia del suministro de energa entran en anabolismo
para ser utilizados como energa.
5.9 conservacin de la energa
Qu forma de sntesis de ATP requiere la participacin de la membrana
citoplasmtica? Por qu?
-Por fosforilacin oxidativa ya que la membrana esta energticamente activada
por la fuerza motriz de protones y pierde parte de esa energa en la formacin
de ATP.
Enqu se diferencia la fosforilacion a nivel de sustrato de la fosforilacion
oxidativa?
-A nivel sustrato el ATP se forma directamente de un intermediario rico en
energa durante los pasos del catabolismo de un compuesto orgnico mientras
que de la fosforilacion oxidativa produce ATP a expensas de la fuerza motriz de
protones.
5.10 la glucolisis como ejemplo de fermentacin
Qu reacciones de la glucolisis implican oxidaciones y reducciones?
-Desde el Gliceraldehdo-3P hasta llegar al piruvato y ya ah la ruta que va a
agarrar ya sea para lactato, etanol o acetato
Cul es el papel del NAD+/NADH en la glucolisis?
-Es un transportador de electrones ya que anqu se reduzca se tiene que
volver a oxidar.
Por qu se forman los productos de fermentacin durante la glucolisis?

-Porque es una ruta que puede tomar la glucolisis segn sea el caso para
formar energa y estos productos se pueden usar para obtener productos
naturales que son de utilidad para los humanos.
5.11 la respiracin y los sistemas de membranas transportadoras de
electrones
Dequ modo importante se diferencia una quinona de otros transportadores
de electrones en la membrana?
-Porque la quinona son transportadores no proteicos altamente hidrofbicas.
Qu transportadores de electrones descritos en esta seccin aceptan 2e- +
2H+? Cules aceptan solo electrones?
-Los que aceptan 2e- son los NAD+ el FAD+ y los que solo aceptan electrones
son los citocromos.
5.12 respiracin y fuerza motriz de protones
Cmo generan la fuerza motriz de protones las reacciones de transporte de
electrones?
-Durante el proceso del transporte tiene una separacin de protones y
electrones a travs de la membrana, dos electrones y dos protones
procedentes del NADH entran en la cadena para iniciar el proceso, durante este
proceso algunos protones liberan se liberan al medio causando una pequea
acidificacin de la cara externa de la membrana el resultado final es la
generacin de un gradiente de PH y de un potencial electroqumico a travs de
la membrana. La superficie interna citoplasmtica ser elctricamente
negativa y alcalina y la superficie externa de la membrana estar cargada
positivamente y ser acida, llamado en conjunto fuerza motriz de electrones.
Cul es la relacin de protones bombeados por cada NADH oxidado en la
cadena de transporte de electrones de Paracoccus mostrada en la figura 5,20?
Enqu puntos de la cadena se establece la fuerza motriz de protones?
-Por cada NADH oxidado salen 8protones y estn en el complejo I en el
complejo IV y en un intermedio de I y II.
Qu estructura celular convierte la fuerza motriz de protones en ATP? Cmo
funciona?
-La ATP sintasa logra la conversin de la fuerza motriz de protones en ATP
(membrana citoplasmtica se da). La ATPasa contiene 2 partes funcionales un
complejo multiproteico F1 y un canal conductor de electrones F0 donde se
llevan a cabo la conversin de ATP.
5.13 flujo de carbono en la respiracin: el ciclo del cido ctrico
Cuntas molculas de CO2 y cuantos pares de tomos de hidrogeno se liberan
por cada piruvato consumido en el ciclo del cido ctrico?

-Se liberan 3CO2 y 5atomos de hidrogeno en forma de NADH y FADH.

Qu dos papeles fundamentales tienen en comn el ciclo del cido ctrico y la
glucolisis?
-Formacin de energa (ATP) y como funcin bioenergtica y biosinteticas.
5.14 diversidad catablica
Diferencie entre los quimioorgantrofos y los quimiolittrofos en cuanto a sus
donadores de electrones.
-Los quimiolittrofos los compuestos inorgnicos son sus donadores de
electrones como H2S, H2, FE2+ y NH3; mientras que los quimioorganotrofos
usan compuestos orgnicos como la glucosa, acetato.
Cul es la fuente de carbono de un microorganismo auttrofo? El CO2
Diferencie entre fotoauttrofo y fotohetertrofo
-Los primeros usan la energa conservada en ATP para la asimilacin de CO2
como fuente de carbono mientras que los segundos necesitan de la luz como
fuente de energa y compuestos orgnicos.
5.15 biosntesis de azucares y polisacridos
Qu forma de glucosa se usa en la biosntesis de glucgeno?
-Glucosa-6P
5.16 biosntesis de aminocidos y nucletidos
Qu forma de nitrgeno se usa normalmente para formar el grupo amino de
los aminocidos?
-El amonio (NH3)
Cules son las bases nitrogenadas puricas y cules son las pririmidnicas?
-Las pricas son la adenina y la guanina y las pririmidnicas son la citosina,
timina y uracilo.
5.17 biosntesis de cidos grasos y lpidos
Explique porque los cidos grasos se forman mediante adicin de bloques de
dos tomos de carbono mientras el donador de estos contiene tres tomos de
carbono.
-Por que por cada dos tomos de carbono que se incorporan el otro se libera en
forma de CO2.
5.18 regulacin de la actividad de enzimas biosinteticas
Qu es una inhibicin por retroalimentacin?

-Cuando un exceso del producto final de la va inhibe la actividad de la primera

enzima de esta va.
Qu es una enzima alosterica?
-Son las enzimas que tienen dos sitios de unin, el sitio activo que une al
sustrato y el sitio alosterica que une reversiblemente el producto de la va.
Qu hace que la adenilacion a la actividad de enzimtica de la glutamina
sintetasa?
-Cuando la enzima est completamente adenilada (con 12 grupos AMP) es
inactiva y cuando est parcialmente adenilada es parcialmente activa.

PREGUNTAS DE REPASO
1.- Por qu el carbono y el nitrgeno son macronutrientes y el
cobalto es un micronutriente? R= Porque el C y el N estn presentes en la
mayora de la clula en una mayor proporcin y el Co se necesita en el
organismo en una menor proporcin.
2.- Qu son los sideroforos y para que se usan? R= Son agentes quelantes que
solubilizan el hierro y lo transportan dentro de la clula.
3.- Por qu el siguiente medio no puede ser considerado un medio definido:
glucosa, 5g; NH4Cl, 1g; KH2PO4, 1g; MgSO4, 0.3g; extracto de levadura, 5g;
agua destilada, 1L? R= Porque no se sabe con exactitud la proporcin de cada
componente, ya que la glucosa y el extracto de levadura pueden tener
monmeros que no sabemos su composicin y adems son sustancias muy
nutritivas.
4.- Qu es una tcnica asptica y para que resulta necesaria? R= Es una serie
de procedimientos para para evitar la contaminacin del medio de cultivo y su
realizacin es necesaria para tener xito en el laboratorio.
5.- Describa como calculara el valor de G 0 en la reaccin: glucosa + 6O2
6CO2 + 6H2O. Si se le dijera que esta reaccin es muy exergonica, Cul sera
el signo de G0 (negativo o positivo)? R= Primero colocar con la frmula la
ecuacin para calcular su valor la cual quedara de la siguiente manera: [6(394.4) + 6(-237.29)] [-917.3 + 6(0)] = -2872.84 KJ/mol, exergonica con signo
negativo.

6.- diferencie entre deltaG0, deltaG y deltaG0f. R= El primero indica el cambio

de energa libre durante una reaccin y el segundo indica que los compuestos
tienen a formarse espontneamente a partir de sus elementos.
7.- para qu necesita la clula enzimas?
-Para poder regular su velocidad de reaccin, en este caso para hacer ms
rpida sus reacciones qumicas.
8.- Describa diferencias entre coenzima y grupo prosttico.
-La coenzima se unen dbilmente a las enzimas y una misma molcula puede
unirse a varias, mientras que los grupos prostticos se unen muy fuertemente
a sus enzimas (covalentemente)
9.- la siguiente lista es una serie de donadores y aceptores de electrones
acoplados. Usando los datos de la figura 5.10, ordene esta serie en funcin de
la energa producida de mayor a menor: H2/Fe3+, H2S/O2, metanol/NO3(produciendo NO2-), H2/O2, Fe2+/O2, NO2-/Fe3+, H2S/NO3
Fe2+/O2=1.84; H2S/O2 = 1.36; H2/O2 = 1.22; NO2-/Fe3+ = 1.18;
0.48; H2S/NO3= 0.46; metanol/NO3- (produciendo NO2-) = 0.04;

H2/Fe3+ =

10.- Cul es el potencial de reduccin del par NAD+/NADH?

- 0.32, 6e11.- Por qu el acetil fosfato es un compuesto rico en energa y la glucosa-6fosfato no lo es?
-No todos los grupos fosfato son ricos en energa y el acetil-P tiene -44.8 es
ms energa que el otro.
12.- Cmo se produce ATP en la fermentacin y en la respiracin?
-En la fermentacin sucede por la fosforilacion a nivel de sustrato y en la
respiracin por fosforilacion oxidativa.
13.- Dnde se produce NADH en la glucolisis y donde se consume?
-Se produce en la reaccin del gliceraldehido-3P y se consume al pasar de
piruvato a lactato.
14.- Qu es necesario para reducir la NAD+ a NADH? Y para reducir el
citrocromobc1-oxidado a bc1-reducido?
-Un donador y aceptor de electrones.
15.- Comente el significado del trmino fuerza motriz de protones y por qu
este concepto es tan importante en biologa.
-origina que la membrana posea un cierto estado energtico, como si fuera una
batera y es importante porque puede generar trabajo, transportar iones,

rotacin de flagelos, y muchas otras reacciones que requieran energa de la

clula.
16.- Cmo se utiliza la energa rotacional de la ATPasa para producir ATP?
-Contienen 2 partes funcionales la F1 y F0, el movimiento de protones a travs
de la subunidad F0 induce la rotacin de protenas c generando una torsin que
se transmite en F1 y causa cambios conformacionales y esto constituye una
energa potencial que puede ser aprovechada para hacer ATP.
17.- El dinitrofenol y el cianuro actan como venenos celulares de modo muy
diferente. Compare y diferencia los modos de accin de estos dos compuestos.
-El cianuro es un inhibidor ya que bloquea el flujo de electrones y por tanto la
fuerza motriz de protones, se une a citrocromaA; por el contrario el dinitrofenol
es un desacoplador ya que permite el flujo de electrones pero no permite la
formacin de ATP ya que inducen poros en la membrana.
18.- repase el balance energtico de la fermentacin y de la respiracin
definiendo todos los pasos que permitan la sntesis de ATP. Los organismos
pueden obtener aproximadamente 20 veces ms ATP cuando crecen
aerbicamente sobre glucosa que por la fermentacin. Escriba una frase que
explique esta diferencia.
-ETAPA 1: FASE PREPARATORIA
* En esta no se genera ATP.
* Se consume 2 ATP
* La glucosa entra en las clulas por medio de protenas transportadoras
especficas.
1) Fosforilacin de la glucosa a glucosa-6-fosfato.
Glucosa + ATP+ Mg2+ Glucosa-6-fosfato (G-6p) + ADP + H+ Enzima:
Hexoquinasa.
Primer punto de control, es decir son reacciones irreversibles.
Activador: fosfato
Inhibidor: G-6p
2) Isomerizacin de la G-6p a fructosa-6-fosfato.
(Conversin de una aldosa en cetosa)
Glucosa-6-fosfato Fructosa-6-fostato Enzima: fosfoglucosa isomerasa.

3) fosforilacin de la F-6p en fructosa 1,6-bifosfato

Fructosa-6-fostato + ATP+ Mg2+ Fructosa 1,6-Bifosfato + ADP + H+
Enzima: fosfofructoquinasa
Segundo punto de control
Activador: P, AMP, F2,6-BP
Inhibidor: ATP, Citrato
4) Rotura de la Fructosa 1,6-bifosfato
Fructosa 1,6-bifosfato Dihidroxiacetona fosfato+Gliceraldehido-3P Enzima:
Aldolasa
5) Interconversion de las triosas fosfato
Dihidroxiacetona fosfato Gliceraldehido-3P Enzima: Triosa fosfato isomerasa
Termina la primera etapa de la gluclisis, a partir de aqu las reacciones se
llevaran a cabo dos veces, ya que se formaron dos triosas (G-3P).
SEGUNDA ETAPA: FASE DE BENEFICIOS
6) oxidacin del gliceraldehido 3-fosfato a 1,3 bifosglicerato
Gliceraldehido-3P + Pi + NAD+ 1,3 bifosglicerato + NADH + H+
Enzima: Gliceraldehido-3-fosfato deshidrogenasa.
7) Transferencia de fosforilo desde 1,3bifosglicerato al ADP
1,3 bifosglicerato + ADP 3-fosfoglicerato + ATP
Enzima: fosfoglicerato quinasa
8) conversin del 3-fosfoglicerato en 2-fosfoglicerato
3-fosfoglicerato 2-fosfoglicerato
Enzima: fosfogliceratomutasa
9) Deshidratacion del 2-fosfoglicerato a fosfoenolpiruvato

2-fosfoglicerato Fosfoenolpiruvato + H2O

Enzima: Enolasa
10) Transferencia del grupo fosforilo desde el fosfoenolpiruvato al ADP
Fosfoenolpiruvato + ADP + H+ piruvato + ATP
Enzima: piruvato quinasa
Tercer punto de control, controla el flujo de esta va.
Activador: piruvato quinasa
Inhibidor: ATP, alanina
Balance global de la va glucolitica
Glucosa + 2pi + 2ADP + 2NAD+ 2piruvato+ 2ATP + 2NADH + 2H+ + 2H2O

19.- Por qu se dice que el ciclo del cido ctrico desempea 2 funciones
importantes en la clula?
-Porque tiene funciones bioenergtica y biosinteticas.
20.- Seale diferencias en lo que respecta al donador de electrones y a la
fuente de carbono que utilizan E. Coli y el quimiolittrofo T. thioparus.
-La T. thioparus su donador de electrones es un compuesto inorgnico y la
fuente de carbono es el CO2, mientras que el E. coli puede usar compuestos
orgnicos como glucosa y acetato como su donador de electrones y fuente de
carbono.
21.- Qu dos vas catablicas proporcionan el esqueleto carbonado para la
biosntesis de azucares y de aminocidos?
-La glucolisis y el ciclo del cido ctrico.
22.- Describa el proceso por el que se sintetiza en la clula un cido graso
saturado lineal como palmitato (C16).
Acetil-ACP + Malonil-ACP Acetoacetil-Coa (+ CO2+ ACP) + 2NADPH 4C (+
H2O +2NADp+) + 3C, sale CO2 6C se repite el paso anterior hasta llegar a
palmitato (16C)
23.- Compare la regulacin de la DAPH sintasa y de la glutamina sintetasa
El primero cataliza la primera reaccin de la va de los aminocidos aromticos
y cada una es regulada independientemente por uno de los aminocidos que

son terminales su inhibicin es cuando los tres productos estn en exceso.

Mientras que la glutamina sintetasa se regula la enzima est completamente
adenilada (12AMP) es inactiva y cuando est parcialmente adenilada est
parcialmente activa.