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PESQUISA
PROTEOMAS
O despertar da era ps-genmica
rotenas so polmeros de aminocidos resultantes da traduo das
informaes genticas contida no
DNA das clulas. O termo protena
vem do grego proteios e significa a
mais importante. De fato, as protenas compem um conjunto de molculas indispensveis para todos os seres
vivos do planeta. Elas so as biomolculas
mais abundantes e ocorrem em grande
diversidade, podendo agir como enzimas,
anticorpos, hormnios, componentes estruturais, receptores celulares, etc. Devido
a essa diversidade de funes, as protenas
exercem papel fundamental em quase todos os fenmenos biolgicos, como produo de energia, defesa imunolgica, contrao muscular, atividade neuroqumica e
reproduo. Do ponto de vista comercial,
bilhes de dlares so gerados anualmente
por indstrias que trabalham com protenas, como as farmacuticas e alimentcias.
J se discute at o uso de protenas em
eletrnica e computao de maneira rotineira no futuro.
Wagner Fontes
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Genomas e Proteomas
Nos ltimos vinte anos, a Bioqumica
sofreu uma verdadeira revoluo, principalmente devido aos espetaculares avanos na rea de Biologia Molecular, que vem
disponibilizando uma incrvel gama de
informaes moleculares sobre os sistemas
biolgicos. Destaca-se a enorme quantidade de sequncias de DNA fornecida pelos
projetos de sequenciamento total de genomas. Hoje j so conhecidas as sequncias
completas dos genomas de microorganismos como Haemophilus influenza, Mycoplasma genitalium, Escherichia coli e Sacharomyces cerevisiae. Espera-se, para o
comeo do prximo sculo, a sequncia
total do genoma humano.
A partir das sequncias de DNA dos
genes, pode-se deduzir a sequncia de
aminocidos das protenas por eles codifi-
Figura 2-Equipamento de
eletroforese bidimensional.
nas. Do mesmo modo, o estudo do genoma no permite saber que protenas esto
expressas realmente em uma determinada
clula em um dado momento. Dentro desse
contexto, torna-se importante o estudo em
larga escala das protenas por meio de
projetos de anlise de proteomas.
PROTEOMA um termo relativamente
novo, que significa o conjunto de PROTEnas expressas por um genOMA. O genoma
de um organismo, como por exemplo o de
um ser humano, praticamente constante,
independente de qual das diferentes clulas (excetuando-se vulos e espermatozides) est sendo analisada ou de variaes
no meio ambiente. Por outro lado, o proteoma de um neurnio ser bastante diferente do proteoma de um linfcito do mesmo
indivduo, j que as diferenas morfolgicas e funcionais entre as duas clulas so
reflexo do conjunto de protenas produzidas por cada uma. O mesmo tipo de clula
pode apresentar diferentes proteomas em
resposta a estmulos externos como a ao
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Figura 4-Identificao de
protenas por espectrometria de
massa. Uma mancha protica de
um gel bidimensional (1)
cortada e transferida para um
tubo onde sofre digesto
proteoltica (2). Os peptdios
resultantes so separados de sais
e outras micromolculas (3) e
aplicados no espectrmetro de
massa (4). As massas dos
peptdios so usadas para fazer
buscas em bancos de dados por
mtodos computacionais,
resultando na identificao da
protena (5).
Aplicaes Biotecnolgicas
A existncia de Mapas de Proteomas
disponveis na Internet permite que pesquisadores de todo o mundo, trabalhando
em diversos assuntos envolvendo expresso de protenas, tais como efeito de frmacos, condies patolgicas, diferenciao
celular, comparao de variedades da mesma espcie e respostas celulares a estmulos externos diversos, possam identificar
mais facilmente as protenas expressas ou
reprimidas, precisando para isso apenas
obter o perfil bidimensional das protenas
de seu sistema nas mesmas condies dos
Mapas de Referncia disponveis.
Hoje, j se vislumbra uma enorme gama
de aplicaes a partir do conhecimento
detalhado dos proteomas, principalmente
em medicina, agropecuria e biotecnologia. Por exemplo, a comparao de expresso de cepas patognicas e no patognicas de microorganismos pode ajudar no
desenvolvimento de mtodos diagnsticos
e de agentes teraputicos. A anlise de
proteomas acoplada tcnicas de knockout de genes pode demonstrar os efeitos metablicos da protena nocauteada e
verificar se outros genes so co-regulados.
De fato, mais de 1000 protenas j foram
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