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Bioqumica

Monografa
ENZIMAS

Equipo # 1 :
Hernandez Perez Cecilia
Hernandez Vasquez Lidia
Magdaleno Gonzaga Irma Betsabe
Reynoso Gutierrez Sayra Elizabeth
Uehara Uyeda Naomi
Ulloa Hernandez Hilda Berenice

Dr. Javier Romero Iiguez

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301817078
301348264
E04114361
E04117387
E04124715

UNIDAD 5

ENZIMAS
1.- Sinonimia
2.- Concepto / Definicin
a. Naturaleza qumica
b. Composicin qumica
c. Estructura enzimtica
3.- Nomenclatura
3.1.- Nomenclatura Actual
4.- Clasificacin
a. Oxido-Reductasas
b. Transferasas
c. Hidrolasas
d. Liasas
e. Isomerasas
f.

Ligasas

5.- Partes del sistema enzimtico


a. Sustrato
b. Enzima
c. Coenzima
d. Sustancias Activadoras
6.- Propiedades y/o caractersticas de las enzimas
7.- Factores que Modifican la Actividad Enzimtica
a. Temperatura

b. Concentracin del Sustrato


c. Concentracin de la Enzima
d. pH
8.- Actividad Enzimtica o Cintica de las Enzimas

9.- Modelo cintico de Michaelis-Menten


10.- Inhibicin Enzimatica
e. Reversible
f.

Irreversible

g. Competitiva
h. No Competitiva
i.

Alosterica

11.- Efectores de las Enzimas


j.

Covalente

k. No Covalernte
12.- Cofactores de las Enzima
l.

Cofactor

m. Coenzima
13.- Importancia Biomdica

14.- Bibliografa

1.- Sinonimia
Enzima: son tambin llamados catalizadores biolgicos

2.- Concepto / Definicin


Cada clula y cada tejido tienen su actividad propia, lo que comporta
continuos cambios en su estado bioqumico, en la base de la cual estn las
enzimas, que tienen el poder de catalizar, facilitar, y agilizar determinados
procesos sintticos y analticos. Los propios genes son reguladores de la
produccin de las enzimas; por tanto, genes y enzimas pueden considerados
como las unidades fundamentales de la vida.
Este concepto poco difundido casi hasta el siglo XX, se ha desarrollado y
concretado cada vez mas, y constituye un componente esencial de diversas
disciplinas: la microbiologa, la fisiologa, la bioqumica, la inmunologa y la
taxonoma, formando adems parte del campo aplicado, en gran variedad de
industrias. El rasgo particular de las enzimas es que pueden catalizar procesos
qumicos a baja temperatura, compatible con la propia vida, sin el empleo de
sustancias lesivas para los tejidos. La vida es, en sntesis, una cadena de
procesos enzimticos, desde aquellos que tienen por sustratos los materiales
mas simples, como el agua (H2O) y el anhdrido carbnico (CO2), presentes en
los vegetales para la formacin de hidratos de carbono, hasta los mas
complicados que utilizan sustratos muy complejos.
La formacin de los prtidos, los glcidos y los lpidos es un ejemplo
tpico: Son a la vez degradados y reconstruidos por otras reacciones
enzimticas, produciendo energa a una velocidad adecuada para el
organismo, sin el gasto energtico que exigen los mtodos qumicos de
laboratorio.
El nombre de enzima, que fue propuesto en 1867 por el fisilogo alemn
Wilhelm Khne (1837-1900).Deriva de la frase griega en zymc, que significa
en fermento
Compuestos qumicos orgnicos o molculas orgnicas de origen
proteico, de elevado peso molecular que catalizan reacciones qumicas en
sistemas biolgicos. Son biomolculas altamente especficas y altamente
especializadas. Su nica fuente es endgena, o sea que nuestro organismo
debe sintetizarlas para ello se requiere informacin gentica y que existan alfaaminocidos.

Son catalizadores muy potentes y eficaces, qumicamente son protenas.


Como catalizadores, los enzimas actan en pequea cantidad y se recuperan
indefinidamente. No llevan a cabo reacciones que sean energticamente
desfavorables, no modifican el sentido de los equilibrios qumicos, sino que
aceleran su consecucin. Biocatalizadores, que aumentan la velocidad de las
reacciones que tienen lugar en el tejido.
Las reacciones qumicas en sistemas biolgicos raramente ocurren en
ausencia de un catalizador. Estos catalizadores se denominan enzimas y son
en su totalidad molculas de naturaleza proteica (aunque ha habido estudios
acerca de enzimas de naturaleza glucosdica).

a) Naturaleza qumica

Existen numerosas razones para afirmar que las enzimas son protenas. La
ms importantes son las siguientes:
a. El anlisis de las enzimas obtenidas en forma ms pura, cristalizada,
demuestra que son protenas.
b. Las enzimas son inactivadas a altas temperaturas y, en general, la
cintica de la desnaturalizacin trmica de las enzimas da resultados
muy parecidos a los de la desnaturalizacin trmica de las protenas; por
ejemplo el Q10 de la mayora de las reacciones qumicas es de 2 a 3, y,
en el caso de las enzimas, a temperaturas elevadas, alrededor de 60 a
70C, la actividad neta aumenta varios cientos, como sucede con la
velocidad de la desnaturalizacin trmica de las protenas.
c. Las enzimas son activadas en unas zona muy restringida de PH, y
presenta un punto ptimo de PH donde su actividad es mayor. Las
protenas en su punto isoelctrico, muestran propiedades parecidas
desde el punto de vista de viscosidad, solubilidad, difusin, etc., que
resulta del todo similares a las propiedades de este tipo que muestran
las enzimas.
d. Todos los agentes que desnaturalizan a las protenas tambin destruyen
o inactivan a las enzimas, ya sea el calor, los cidos fuertes, o los
metales pesados que pueden combinarse con ellas.
e. Los problemas de solubilidad y de precipitacin son comunes a las
protenas y las enzimas; en general, son solubles en agua o soluciones
salinas, insolubles en alcohol, precipitan con determinadas
concentraciones de sales neutras, etc.

b) Composicin qumica

Los conocimientos sobre la composicin qumica de las enzimas


constituyeron materia de numerosas controversias hasta 1926, cuando J.B
Sumner (1887-1955) consigui cristalizar la ureasa, enzima que transforma la
urea en anhdrido carbnico y amoniaco, y demostrar que era una sustancia
proteica.
A, partir de entonces fueron aisladas otras enzimas en forma pura,
cristalina, y el anlisis demostraba siempre la presencia de una protena,
simple o conjugada. Cuando los anlisis qumicos demuestran que la enzima
es una protena conjugada, pueden distinguirse en el dos partes bien
diferenciadas:

El grupo proteico (Coenzima)


La protena (Apoenzima)

En algunas enzimas oxidantes fue observada la presencia de la


promoporteinas, en las cuales el grupo prosttico esta representado por un
compuesto que contiene Fe y otro elemento, el cual desempea un papel
importante en la combinacin de la protena con el sustrato; otras veces este
grupo prosttico es derivada de vitaminas (como la vitamina B); 4en muchos
casos resulta fcil de separar de la molcula proteica. No obstante una vez
separadas, las dos unidades no muestran actividad enzimtico; por tanto el
grupo proteico (coenzima) y el grupo proteico (apoenzima) han de estar
ntimamente ligados entre si para ser operativos. Por consiguiente, de las
enzimas pueden distinguirse los formados por:

Solo protenas, que difieren entre si por la secuencia con que los
aminocidos estn combinados, como la ureasa y las enzimas
digestivas (la pepsina y la tripsina)

Los conjugados, separados en dos entidades qumicas bien definidas: la


coenzima y la apoenzima.

Despus del descubrimiento de Sumner, el numero de la enzimas y el


estudio de sus actividades qumicas proporcionaron un notable impulso en la
enzimologa, y la gran cantidad de las enzimas que rpidamente se
acumulaban determinaron la necesidad de utilizar una clasificacin o
nomenclatura para evitar errores y facilitar la comprensin de futuros
investigadores.

c) Estructura enzimtica

Por su estructura y composicin qumica puede afirmarse que el origen de


las enzimas esta vinculando al origen de las sustancias proteicas. Al hablar del
origen de la vida se ha citado el xito de los experimentos realizados en el
laboratorio para la produccin de aminocidos; estos aminocidos son los que
precisamente constituyen la base del edificio proteico. Tambin en el
laboratorio se ha intentado la sntesis de protenas a partir de aminocidos.
La sede de las enzimas es el citoplasma. Los cloroplastos vegetales
contienen una amplia gama enzimas encargadas de la funcin cloroflica,
proceso que a travs de reacciones qumicas complejas y encadenadas
transforman compuestos inorgnicos, como el agua, y el anhdrido carbnico,
en sustancias complejas adecuadas para ser entre otras cosas el alimento
fundamental de los animales.
En las mitocondrias existe un sistema de transporte de electrones que
determinan importantes fenmenos de oxidorreduccin, durante los cuales se
forman notables cantidades de ATP, que es un compuesto altamente energtico
del que depende la mayor parte de metabolismo, y coma, por tanto el trabajo
de las clulas; en las mitocondrias se produce el metabolismo enzimtico de
los cidos grasos, los cuales son en parte elaborados tambin en el citoplasma.
En los ribosomas tiene lugar concretamente todas la s sntesis de las
sustancias proteicas, mientras que en los lisosomas se producen enzimas
hidrolticos cuya misin escindir, con la intervencin del agua, molculas
grandes en otras menores, que pueden a su vez ser utilizadas por las clulas;
en cambio, las enzimas glucolticos estn difundidos en el citoplasma.
La localizacin de las sedes de las distintas operaciones enzimticas antes
mencionadas ha sido posible a travs del sistema de ruptura de las clulas y de
la separacin de los distintos componentes mediante centrifugacin diferencial
del homogeneizado de estas la ruptura celular y la subdivisin de los
componentes subcelulares se realizan actualmente utilizando los tejidos, por
ejemplo con saltos bruscos
C hasta temperaturas mas elevadas con
cambiosdesde temperaturas inferiores a 0 de presin osmtica o mediante
ultrasonidos.

3. Nomenclatura de las enzimas

Historia
Cien aos atrs solo se conocan enzimas, muchas de estas, catalizaban la
hidrlisis de enlaces covalentes. Algunas enzimas, de manera especial las que
fueron descubiertas en un principio, recibieron nombres ligados a su sitio de
procedencia anatmica que no siguen ninguna regla ni sistema; tal es el caso
de la
Ptialina de la saliva: ataca al almidn de la pepsina del estmago
Tripsina del pncreas: atacan protenas
Renina: que coagula la leche
Papaina, enzima proteoltica que se encuentra en la papaya.
Proteasas: se encuentran en las clulas.
Las enzimas relacionadas con la cuagulacin de la sangre, como son la
trombina, la plasmina, el plasmingeno, etc. reciben tambin nombres
sistematizados.
Al descrubir nuevas enzimas y proceder a su caracterizacin estricta se
aplicaron reglas de nomenclatura basadas en el nombre del sustrato atacado, o
en el tipo general de sustrato, o en la reaccin catalizada y se ha aadido
convencionalmente, la terminacin -asa.
Por ejemplo:
Las lipasas (hidrolizan lpidos o grasas)
Las amilasas (hidrolizan almidn)
Las proteasas (hidrolizan protenas)
Las esterasas (basado en la unin general de tipo ster presentes en
muchas sustancias) Colesterol estrerasa (si la esterasa es especfica de
los esteres de colesterol) y acetilcolina esterasa (si la esterasa de la
acetilcolina).
Otros ejemplos:

Las fosfatasas son enzimas que atacan las uniones ster, pero en este
caso, toman su nombre del grupo vecino a la unin que van a atacar, de
manera que se denominan fosfatasas (cuando quitan una molcula de
monofosfato), pirofosfatasas (cuando quitan el cido fosfrico como
esteres dobles (pirofosfatos), o triples, etc.)
Las carbohidrasas se denominan as genricamente, pero pueden
comprender enzimas con nombres proveniente del sustrato particular
sobre el que actan como la amilasa que ataca al almidn y la celulasa
que acta sobre la celulosa y, en otras ocasiones, se denominan de
acuerdo con la unin atacada, como la -glucosidasa que acta sobre
las uniones -glucosdicas.
Los ejemplos se pueden extender a todos los terrenos de la actividad
enzimtica, como en las enzimas proteolticas, las fosforilasas, las nucleasas,
etc.
Esta manera de llamarlas, se demostr que era inadecuada porque al
descubrirse varias enzimas, notaron que varias enzimas catalizaban reacciones
diferentes del mismo sustrato, por ejemplo, oxidacin o reduccin de la funcin
alcohol de un azcar.
Aunque el sufijo asa contina en uso; actualmente, al nombrar a las
enzimas, se enfatiza el tipo de reaccin catalizada. Por ejemplo: las
hidrogenasas catalizan la eliminacin de hidrogeno y las transferasas,
reacciones de transferencia de grupo. Con el descubrimiento de mas y mas
enzimas, surgieron ambigedades y con frecuencia no estaba claro cual era la
enzima que un investigador deseaba estudiar.
Para remediar esta deficiencia, la Comisin para el estudio de las enzimas,
que constituye con respecto a los sistemas anteriores un punto de vista ms
uniforme, preciso y descriptivo; esta formada por la Unin Internacional de
Bioqumica (IUB) adopt, en 1964, un sistema complejo pero inequvoco de la
nomeclatura enzimtica basado en el mecanismo de reaccin.
El sistema se basa en la reaccin qumica catalizada que es la propiedad
especfica que caracteriza a cada enzima las cuales se agrupan en clases,
porque catalizan procesos semejantes, y en subclases que especifican con
mayor exactitud la reaccin particular considerada.
En general, las enzimas reciben un nombre de acuerdo con el sustrato o los
sustratos que participan en la reaccin seguido por el tipo de reaccin
catalizada y, por fin, la terminacin -asa. A menudo los nombres as obtenidos
resultan largos y complejos, por lo que es muy difcil que en la prctica se
pueda excluir el uso de los nombres triviales, consagrados por la costumbre.
Sin embargo, con fines de sistematizacin, se reconoce la necesidad de
aceptar el nuevo sistema.

Aunque su claridad y carencia de ambigedad recomiendan al sistema de


nomeclatura IUB para trabajos de investigacin, nombres ms ambiguos, pero
bastante ms cortos persisten en libros de texto y en el laboratorio clnico. Por
esta razn, a continuacin solo se presenta principios generales del sistema
IUB:
1. Las reacciones y las enzimas que las catalizan se dividen en 6 clases
principales, cada una con 4 a 13 subclases.
2. El nombre de la enzima tiene 2 partes: la primera es el nombre del o los
sustratos; la segunda, con terminacin asa, indica el tipo de reaccin
catalizada.
3. Informacin adicional, si es necesario aclarar la reaccin, puede seguir
el parntesis. Por ejemplo: la enzima que cataliza L-malato + NAD = =
piruvato + CO2 NADH + H= , se denomina como 1.1.1.37 L-malato:NAD +
oxidorreductasa (descarboxilante).
4. Cada enzima tiene un numero clave (E.C.) que caracteriza al tipo de
reaccin segn la clase (primer digito), subclase (segundo digito) y
subclase (tercer digito). El cuarto digito es para la enzima especfica.
As, E.C. 2.7.1.1 denota la clase 2 (una transferasa), subclase 7
(transferencia de fosfato), sub-clase 1 (una funcin alcohol como aceptor
de fosfato). El ltimo digito denota a la enzima hexocinasa o ATP: Dhexosa-6-fosforotransferasa, enzima que cataliza la transferencia de
fosfato desde el ATP al grupo hidroxilo de carbono 6 de la glucosa.

Al final de sus y trabajos, clasifico las enzimas en seis grupos principales,


correspondientes por sus trminos a las reacciones que cada enzima ejerce
sobre el sustrato. Estos grupos se subdividen en otro, segn el tipo de sustrato
y los tomos concretos que son sensibles a sus acciones. Estos seis grupos
son los siguientes y se analizarn ms adelante:
1. Oxidoreductasas
2. Transferasas
3. Hidrolasas
4. Isomerasa
5. Liasas
En resumen se puede decir que para nombrar a las enzimas se deben
tomar en cuenta los siguientes parmetros

3.1.- Nomenclatura actual


La nomenclatura enzimtica est basada en 3 parmetros:
Todas las enzimas deben de llevar el nombre del sustrato
Sustrato: parte del sistema enzimtico, sustancia o compuesto
qumico sobre la cual va actuar la enzima es la sustancia o
compuesto qumico que sufre la reaccin qumica.
Las enzimas deben de llevar el nombre de la reaccin qumica
catalizada
Oxidacin ------------------------oxidasa
Reduccin------------------------reductasa
Hidrlisis--------------------------hidrolasa
Isomerizacin--------------------isomeraza
Transferencia--------------------transferasa
Sntesis ---------------------------ligasa
Catlisis---------------------------liasa
Terminacin asa
Ejemplo: Glucosa oxidasa.
Las enzimas se identifican por 4 dgitos:
El primer digito se refiere a la clasificacin general, va del uno
El segundo dgito se refiere a la clase de enzima.
El tercer dgito es la subclase, se refiere a la reaccin qumica
especfica que cataliza la enzima
El cuatro dgito se refiere al nmero progresivo de orden de acuerdo
a su identificacin.

4.- Clasificacin

xido reductasas
Son las enzimas relacionadas con las oxidaciones y las reducciones
biolgicas que intervienen de modo fundamental en los procesos de
respiracin y fermentacin.
son importantes a nivel de algunas cadenas metablicas, como la
escisin enzimtica de la glucosa, fabricando tambin el ATP, verdadero
almacn de energa. Extrayendo dos tomos de hidrgeno, catalizan las
oxidaciones de muchas molculas orgnicas presentes en el
protoplasma; los tomos de hidrgeno tomados del sustrato son cedidos
a algn captor.

Transferasas

Estas enzimas catalizan la transferencia de una parte de la molcula


(donadora) a otra (aceptora).
Su clasificacin se basa en la naturaleza qumica del sustrato atacado y
en la del aceptor. Este grupo de enzimas actan sobre los sustratos mas
diversos, transfiriendo grupos metilo, aldehdo, glucosilo, amina, sulfat,
sulfrico, carboxilo, carbonilo, fosforilo y cido (RC = o).

Los nombres comunes triviales suelen incluir el prefijo trans. Como


ejemplo podemos nombrar las transcarboxilasas, transmetilasas y
transaminasas.
Ejemplo:
Enzima Hexoquinasa
Glucosa + ATP

Glucosa Fosfato + ADP

Hidrolasas

Esta clase de enzimas actan normalmente sobre las grandes


molculas del protoplasma, como son la de glicgeno, las grasas y las
protenas.
La accin cataltica se expresa en la escisin de los enlaces entre
tomos de carbono y nitrgeno (C-N) o carbono oxigeno (C-O);
Simultneamente se obtiene la hidrlisis (reaccin de un compuesto con
el agua) de una molcula de agua. El hidrgeno y el oxidrilo resultantes
de la hidrlisis se unen respectivamente a las dos molculas obtenidas
por la ruptura de los mencionados enlaces.
A este grupo pertenecen protenas muy conocidas: la pepsina, presente
en el jugo gstrico, y la tripsina y la quimiotripsina, segregada por el
pncreas. Desempean un papel esencial en los procesos digestivos,
puesto que hidrolizan enlaces ppticos, estricos y glucosdicos.

Liasas
Estas enzimas escinden (raramente construyen) enlaces entre tomos
de carbono, o bien entre carbono y oxigeno, carbono y nitrgeno, y
carbono y azufre dejando enlaces dobles, pero tambin agregan grupos
a los enlaces dobles. Las liasas catalizan reacciones en las que se
elimina grupos (por ejemplo H2O, CO2 y NH3) para formar un doble
enlace o se aaden a un doble enlace. Los ejemplos son liasas,
descarbolasas, hidratasas, deshidratasas, desaminasas y sintasas.
Algunas liasas actan sobre compuestos orgnicos fosforados muy
txicos, escindindolos; otros separan el carbono de numerosos
sustratos.

Ejemplo:

Enzima Piruvato descarboxilasa

Isomerasas

Transforman ciertas sustancias en otras ismeras, es decir, de idntica


formula emprica pero con distinto desarrollo.
Son las enzimas que catalizan diversos tipos de isomerizacin, sea
ptica, geomtrica, funcional, de posicin, etc.
Se dividen en varias subclases.
Las racemasas y las epimerasas:
Actan en la racemizacin de los aminocidos y en la epimerizacin de
los azcares. Las primeras son en realidad pares de enzimas
especficas para los dos ismeros y que producen un solo producto
comn.
Las isomerasas cis trans:
Modifican la configuracin geomtrica a nivel de un doble ligadura. Las
xido reductasas intramoleculares catalizan la interconversin de
aldosas y cetosas, oxidando un grupo CHO y reduciendo al mismo
tiempo al C = O vecino, como en el caso de la triosa fosfato isomerasa,
presente en el proceso de la gluclisis ; en otros casos cambian de lugar
dobles ligaduras, como en la (tabla) isopentenil fosfato isomerasa,
indispensable en el cambio biosintico del escualeno y el colesterol. Por
fin las transferasas intramoleculares (o mutasas) pueden facilitar el
traspaso de grupos acilo, o fosforilo de una parte a otra de la molcula,
como la lisolecitina acil mutasa que transforma la 2 lisolecitina en 3
lisolecitina, etc.
Algunas isomerasas actan realizando inversiones muy complejas,
como transformar compuestos aldehdos en compuestos cetona, o
viceversa. Estas ultimas desarrollan una oxidorreduccin dentro de la
propia molcula (oxido reductasa intramoleculares) sobre la que actan,
quitando hidrgeno, a algunos grupos y reduciendo otros; actan
ampliamente sobre los aminocidos, los hidroxcidos, hidratos de
carbono y sus derivados.

Ligasas
Realizan la degradacin o sntesis de los enlaces fuertes mediante el
acoplamiento a sustancias ricas en energa como los nucleosidos del
ATP. Algunos ejemplos de estas son las Carboxilasas y las
Peptidosintetasas.
Son enzimas que catalizan la unin de dos molculas acoplada a la
hidrlisis de un grupo pirofosforilo en el ATP o un trifosfato nucleosilo
similar.
Son enzimas que catalizan la formacin de un enlace entre dos
molculas de sustrato. La energa para estas reacciones la aporta
siempre la hidrlisis de ATP. Los nombres de muchas ligasas incluyen el
trmino sintetasa. Otras ligasas se denominan carboxilasas.
Ejemplo:
Enzima Piruvato caboxilasa

5.- Partes del Sistema Enzimtico

1. Sustrato; cualquier compuesto qumico.

Sustancia, compuesto qumico que sufre la reaccin


qumica.
Aquellas sustancias en las que acta la enzima.
Cualquier origen qumico.
2.

La enzima; siempre acta sobre un sustrato para producir una


catlisis y su resultado es un producto.

3.

Coenzimas; provienen de las vitaminas (forma activa de las


vitaminas), tienen peso molecular bajo. Biomoleculas no proteicas
que favorece y/o potencial izan la accin de una enzima.

4.- Sustancias activadoras: temperatura, electrolitos y pH.

6.- Propiedades y/o caractersticas de las enzimas


Propiedades:
Las propiedades de las enzimas derivan del hecho de ser protenas y de
actuar como catalizadores. Como protenas, poseen una conformacin natural
ms estable que las dems conformaciones posibles. As, cambios en la
conformacin suelen ir asociados en cambios en la actividad cataltica. Los
factores que influyen de manera ms directa sobre la actividad de un enzima
son: poseen una conformacin natural ms estable que las dems
conformaciones posibles. As, cambios en la conformacin suelen ir asociados
en cambios en la actividad cataltica. Los factores que influyen de manera ms
directa sobre la actividad de un enzima son:

PH

Temperatura

Cofactores

Caractersticas:

Las enzimas son protenas sin excepcin.


Son protenas complejas.
Son protenas altamente especificas.
Tienen el nivel cuaternario de estructura proteica.
Son de muy elevado peso molecular.
Presentan todas las caractersticas de la estructura cuaternaria de las
protenas.
Son protenas que poseen un efecto catalizador al reducir la barrera
energtica de ciertas reacciones qumicas.
Influyen solo en la velocidad de reaccin sin alterar el estado de equilibrio
Actan en pequeas cantidades
Forman un complejo reversible con el sustrato
No se consumen en la reaccin, pudiendo actuar una y otra vez
Muestran especificidad por el sustrato
Su produccin est directamente controlada por los genes

7.- Factores que modifican la actividad enzimtica

Efecto de la temperatura :
Un aumento en la temperatura provoca un aumento de la velocidad de
reaccin hasta cierta temperatura ptima, ya que despus de
aproximadamente 450 C se comienza a producir la desnaturalizacin trmica.
Cuando mayor es la temperatura, mayor es la velocidad de reaccin. La
velocidad de reaccin aumenta debido a que hay ms molculas con la energa
suficiente para entrar en el estado de transicin. Las velocidades de las
reacciones catalizadas por enzimas aumentan tambin al incrementarse la
temperatura. Sin embargo, las enzimas son protenas que se desnaturalizas a
temperaturas elevadas. Cada enzima tiene una temperatura ptima a la que
acta con su mxima eficacia. Debido a que las enzimas son protenas, los
valores de la temperatura ptima dependen del pH y de la fuerza inica. Si la
temperatura se incrementa ms all de la temperatura ptima, la actividad
enzimtica desciende bruscamente. La temperatura ptima de una enzima
normalmente est cerca de la temperatura normal del organismo del que se
procede

Concentracin de sustrato:
Al principio un aumento de la concentracin de substrato produce un
aumento rpido de la velocidad de reaccin, pero si se sigue aumentando la
concentracin de substrato, la velocidad de reaccin comienza a disminuir;
vemos que a muy altas concentraciones de substrato se observa que no
cambia la velocidad de reaccin, se dice que los centros activos de la enzima
se encuentran saturados. La velocidad de reaccin que se obtiene a esa alta
concentracin de substrato se define como la velocidad mxima (vm) de la
reaccin enzimtica bajo las condiciones especificadas. La concentracin de
substrato [S], a la semivelocidad mxima de reaccin ( v ) se puede
determinar de la figura y representa la constante de Michaelis o km, la cual es
una caracterstica para cada enzima. La inversa de km, o 1/ km, mide
aproximadamente la afinidad de la enzima por el substrato. Mientras ms
pequeo sea el valor de km, mayor ser la afinidad de la enzima por el
substrato. Si varias enzimas compiten en el metabolismo por el mismo
substrato, ste ser transformado preferentemente por la enzima con mayor
afinidad.

CONCENTRACIN DE ENZIMAS: Las enzimas poseen un PH caracterstico donde su


actividad es mxima: por encima o debajo de ese PH la actividad disminuye.

Efecto del pH:

El pH no afecta la actividad enzimtica directamente sino que modifica la


concentracin de protones. Los protones adems de alterar la estructura de la
enzima y el substrato, pueden participar tambin en la reaccin como substrato
o producto. En esos casos, la concentracin de protones afecta directamente la
velocidad de la reaccin.
Cualquier cambio brusco de pH, sabiendo que las enzimas son
protenas, puede alterar el carcter inico de los grupos amino y carboxilo en la
superficie proteica, afectando as las propiedades catalticas de una enzima. A
pH alto o bajo se puede producir la desnaturalizacin de la enzima y en
consecuencia su inactivacin .
La concentracin de ion hidrgeno afecta a las enzimas de diversas
formas. En primer lugar la actividad cataltica est relacionada con el estado
inico del lugar activo. Las variaciones de la concentracin de ion hidrgeno
pueden afectar a la ionizacin de los grupos de lugar activo. En segundo lugar,
los cambios de los grupos ionizables pueden alterar la estructura terciaria de la
enzima. Los cambios drsticos del pH frecuentemente conducen a la
desnaturalizacin. La mayora de las enzimas son activas dentro de un
intervalo estrecho de Ph. Por esta razn. Los seres vivos emplean
amortiguadores para regular estrechamente el pH. El valor de pH al que la
actividad de una enzima es mxima se denomina pH ptimo, y vara
considerablemente segn la enzima.
Enzimas:
Pepsina 1,5 (pH ptimo)
Tripsina 7,7
Catalasa 7,6
Arginasa 9,7
Fumarasa 7,8
Ribonucleasa 7,8

8. Actividad enzimtica o cintica de las enzimas

El estudio cuantitativo de la catlisis enzimtica, que se denomina


cintica enzimtica, proporciona informacin sobre las velocidades de reaccin.
Los estudios cinticos miden tambin la afinidad de las enzimas por los
sustratos y los inhibidores, y proporcionan conocimientos sobre los
mecanismos de reaccin. La cintica enzimtica tiene varias aplicaciones
prcticas, que incluyen una mejor comprensin de las fuerzas que regulan las
rutas metablicas y el diseo de tratamientos ms adecuados.
La velocidad de la reaccin anterior es proporcional a la frecuencia con
la que las molculas reaccionantes forman el producto.
Otro trmino que es til para describir una reaccin es el orden de la
reaccin. El orden se determina de forma emprica, es decir, mediante
experimentacin. Se define como la s8uma de los exponentes de los de
concentracin en la expresin de velocidad. La determinacin del orden de una
reaccin permite a un experimentador obtener determinadas conclusiones con
relacin al mecanismo de la reaccin. Se dice que una reaccin sigue una
cintica de primer orden cuando la velocidad depende de la primera potencia
de la concentracin de un nico reactante y sugiere que el paso limitante de la
velocidad es una reaccin unimolecular
La actividad especfica de una enzima, una magnitud que alcanza para
controlar la purificacin de la enzima, se define como el nmero de unidades
internacionales por miligramo de protena.
La medida se realiza siempre en las condiciones ptimas de pH,
temperatura, presencia de cofactores, etc, y se utilizan concentraciones
saturantes de sustrato. En estas condiciones, la velocidad de reaccin
observada es la velocidad mxima (Vmax). La velocidad puede determinarse
bien midiendo la aparicin de los productos o la desaparicin de los reactivos.

9. Modelo cintico de Michaelis-Menten

Los estudios sistemticos del efecto de la concentracin inical del


sustrato sobre la actividad enzimtica comenzaron a realizarse a finales del
siglo XIX. Ya en 1882 se introdujo el concepto del complejo enzima-sustrato
como intermediario del proceso de catlisis enzimtica. En 1913, Leonor
Michaelis (foto de la izquierda) y Maud Menten (foto de la derecha)
desarrollaron esta teora y propusieron una ecuacin de velocidad que
explica el comportamiento cintico de los enzimas.
Para explicar la relacin oservada entre la velocidad inicial (v 0) y la
concentracin inicial de sustrato ([S] 0) Michaelis y Menten propusieron que las
reacciones catalizadas enzimticamente ocurren en dos etapas: En la primera
etapa se forma el complejo enzima-sustrato y en la segunda, el complejo
enzima-sustrato da lugar a la formacin del producto, liberando el enzima
libre:

En este esquema, k1, k2 y k3 son las constantes cinticas individuales de


cada proceso y tambin reciben el nombre de constantes microscpicas de
velocidad. Segn esto, podemos afirmar que:

v1 = k1 [E] [S]

v2 = k2 [ES]

v3 = k3 [ES]

Se puede distinguir entre enzima libre (E) y enzima unido al sustrato


(ES), de forma que la concentracin total de enzima, [ET], (que es constante
a lo largo de la reaccin) es:
[ET] = [E] + [ES]
Como [E] = [ET] - [ES], resulta que: v1= k1[S] [ET] - k1 [S] [ES]

Este modelo cintico adopta la hiptesis del estado estacionario,


segn la cual la concentracin del complejo enzima-sustrato es pequea y
constante a lo largo de la reaccin (Figura de la derecha). Por tanto, la
velocidad de formacin del complejo enzima-sustrato (v 1) es igual a la de su
disociacin (v2+ v3):
v1 = v 2 + v 3
Adems, como [ES] es constante, la velocidad de formacin de los
productos es constante:
v = v3 = k3 [ES] = constante.
Como v1=v2+v3, podemos decir que:
k1[S] [ET] - k1 [S] [ES] = k2 [ES] + k3 [ES]
Despejando [ES], queda que:
siendo kM = (K2 + K3) / K1, en donde la expresin (k2+k3)/k1 se ha
sustitudo por KM, o constante de Michaelis-Menten. Este enlace nos aporta
una explicacin sobre las razones que hacen de la KM un parmetro cintico
importante.
Por lo tanto, en el estado estacionario, la velocidad de formacin del
producto es:
Para cualquier reaccin enzimtica, [E T], k3 y KM son constantes. Vamos a
considerar dos casos extremos:

A concentraciones de sustrato pequeas ([S] << KM) v = (k3 [ET]/KM)


[S]. Como los trminos entre parntesis son constantes, pueden
englobarse en una nueva constante, k obs, de forma que la expresin
queda reducida a: v = kobs [S], con lo cual la reaccin es un proceso
cintico de primer orden.

A concentraciones de sustrato elevadas ([S] >> KM), v = k 3 [ET]. La


velocidad de reaccin es independiente de la concentracin del sustrato,
y por tanto, la reaccin es un proceso cintico de orden cero. Adems,
tanto k3 como [ET] son constantes, y nos permite definir un nuevo
parmetro, la velocidad mxima de la reaccin (Vmax): Vmax = k3 [ET],
que es la velocidad que se alcanzara cuando todo el enzima disponible
se encuantra unido al sustrato.

Si introducimos el parmetro Vmax en la ecuacin general de la velocidad,


(la frmula recuadrada anteriormente), obtenemos la expresin ms conocida
de la ecuacin de Michaelis-Menten:

Hay enzimas que no obedecen la ecuacin de Michaelis-Menten. Se


dice que su cintica no es Michaeliana. Esto ocurre con los enzimas
alostricos, cuya grfica v frente a [S] no es una hiprbola, sino una sigmoide
(Figura de la derecha). En la cintica sigmoidea, pequeas variaciones en la
[S] en una zona crtica (cercana a la K M) se traduce en grandes variaciones en
la velocidad de reaccin.

10. Inhibicin enzimtica

La actividad de las enzimas puede inhibirse. Las molculas que reducen


la actividad de una enzima, denominadas inhibidores, incluyen muchos
frmacos, antibiticos, conservantes alimentarios y venenos. Las
investigaciones de la inhibicin enzimtica y de los inhibidores llevada a cabo
por los qumicos son importantes por varas razones:
1. la razn ms importante, en los seres vivos la inhibicin enzimtica es
un medio importante para regular las rutas metablicas.
2. numerosos tratamientos clnicos se fundamentan en la inhibicin
enzimtica.
3. El proceso de inhibicin enzimtica es til para comprender los
mecanismos de accin txica y farmacolgica de algunos compuestos.
La inhibicin enzimtica puede producirse cuando un compuesto
compite con el sustrato por el activo de la enzima libre, se une al complejo ES
en un lugar separado del lugar activo, o se une a la enzima libre en un lugar
separado del lugar activo. Se describen tres clases de inhibidores enzimticos:
a. Competitiva:
Los inhibidores competitivos se unen de forma reversible a la enzima
libre, y no al complejo ES, para formar un complejo enzima inhibidor (EI).
Con frecuencia, el sustrato y el inhibidor compiten por el mismo lugar en
la enzima. La concentracin del complejo EI depende de la concentracin del
inhibidor libre y de la constante de disociacin K I.
Debido a que el complejo EI se disocia fcilmente, la enzima est
disponible de nuevo para unir al estrato. La actividad de la enzima disminuye
debido a que no se produce una reaccin productiva durante el tiempo limitado
que existe el complejo EI. El efecto de un inhibidor competitivo sobre la
actividad puede invertirse aumentando la concentracin de sustrato. A (S)
elevadas, todos los lugares activados estn llenos de sustrato y la velocidad de
reaccin alcanza el valor que se observa sin un inhibidor.
Las sustancias que se comportan como inhibidores competitivos, es
decir, que reducen la afinidad aparente de una enzima por el sustrato, suelen
tener una estructura semejante a la del sustrato. Entre estas molculas hay
productos de reaccin o anlogos que no se metabolizan, o derivados del

sustrato. La succinato deshidogenasa, una enzima del ciclo del cido ctrico de
Krebs, catalizan una reaccin redox que convierten el succinato en fumarato.
b. No Competitiva:
En algunos reacciones catalizadas por enzimas el inhibidor puede unirse
tanto a la enzima como al complejo enzima sustrato:
En estas circunstancias, que se denominan inhibicin no competitiva, el
inhibidor se une a un lugar diferente del lugar activo. La unin del inhibidor
ocasiona la modificacin de la conformacin de la enzima que impide la
formacin del producto. Normalmente, los inhibidores no competitivos no
afectan a la unin del sustrato y se parecen poco o nada a ste. Como con los
inhibidores acompetitivos, la inhibicin no competitiva slo se invierte
parcialmente aumentando la concentracin de sustrato. La inhibicin no
competitiva normalmente implica dos o ms sustratos. Las caractersticas de la
inhibicin que se observan pueden depender en parte de factores como el
orden en el que se unen los diferentes sustratos. Adems, para la unin de los
inhibidores no competitivos existen dos determinaciones de K I.
Dependiendo del inhibidor que se considere, los valores de estas
constantes de disociacin pueden ser o no equivalentes. Existen dos formas de
inhibicin no competitiva: pura y mixta. En la inhibicin no competitiva pura, que
es un fenmeno poco frecuente, ambos valores de K I son equivalentes. La
inhibicin no competitiva mixta es de forma caracterstica ms complicada
debido a que los valores de KI son diferentes.
c. Acompetitivos:
En la inhibicin acompetitiva, el inhibidor slo se une al complejo enzima
sustrato, y no a la enzima libre.
La adiccin de ms sustrato a la reaccin da lugar a un aumento de la
velocidad de reaccin, pero no hasta el grado que se observa en las reacciones
sin inhibir. La inhibicin acompetitiva suele observarse en las reacciones en las
que las enzimas unen ms de un sustrato.
d. Anlisis Cintico de la Inhibicin Enzimtica:
La inhibicin competitiva, acompetitiva y no competitiva pueden
diferenciarse fcilmente con representaciones dobles inversas.
En dos conjuntos de determinaciones de loa velocidad, la concentracin
de la enzima se mantiene constante. La inhibicin competitiva aumenta la K m
de la enzima y mantiene la Vmx inalterada. En la inhibicin acompetitiva se
modifican ambas Km y Vmx, aunque su cociente permanece igual. En la
inhibicin no competitiva, disminuye Vmx y aumenta Km.

e. Reversible:
En la inhibicin reversible (es decir, inhibicin competitiva, acompetitiva y
no competitiva), el inhibidor puede disociarse de la enzima debido a que se une
mediante enlaces no covalentes.
f.

Irreversible:

Los inhibidores irreversibles normalmente se unen covalentemente a la


enzima, con frecuencia a una cadena lateral del lugar activo.
g. Alostrica:
La mayora de las enzimas alostricas son protenas con varias
subunidades. La unin del sustrato a un protmero en una enzima alostrica
afecta a las propiedades de unin de los protmeros adyacentes. La actividad
de las enzimas alostricas se ve afectada por molculas efectoras que se unen
a otros lugares denominados lugares alostricos o reguladores. Las enzimas
alostricas generalmente catalizan pasos reguladores clave de las rutas
bioqumicas.

11. Efectores de las enzimas

a. Covalente

Algunas enzimas se regulan por la interconversin reversible entre sus formas


activa e inactiva. Estos cambios de la funcin estn producidos por diversas
modificaciones covalentes. Muchas de estas enzimas poseen residuos
especficos que pueden estar fosforilados y desfosforilados. Por ejemplo, en un
proceso controlado por hormonas, la forma inactiva de la enzima (glucgeno
fosforilasa b) se convierte en la forma activa (glucgeno fosforilasa a) por la
adiccin de un grupo fosfato a residuo especfico de serina.
Otros tipos de modificaciones covalentes reversibles son la mutilacin, la
acetilcin y la nucleotidilacin (la adiccin covalente de un nucletido).

b. No Covalernte

Trifosfato de adenosina (ATP): la energa para la biosntesis del ATP las


proporcionan los protones al moverse hacia abajo en su gradiente
electroqumico en una direccin bioenergticamente favorable. El
creador de este concepto, Meter Mitchell, se refera a esta fuente de
energa como proticidad (en analoga con electricidad). La teora
quimiosmtica para la formacin del ATP por fosforilacin oxidativa
implica dos operaciones diferentes. Primero, el transporte de electrones
genera un gradiente de protones a travs de una membrana
impermeable. Segundo, los protones se mueven hacia debajo de sus
gradiente electroqumico, del exterior al interior de la mitocondria para
energizar la f0ormacin del ATP por la ATP sintasa. La ATP sintasa usa
la corriente de protones para soportar la biosntesis del ATP a partir de
ADP y Pi.

Dinucletido de nicotinamida y adenina (NAD), es un oxidante comn en


las reacciones catablicas. NAD, que sirve de portadoras de hidrgeno
en copiosas reacciones catalizadas por deshidrogenasas especficas del

substrato. NAD+ se requiere en las principales vas metablicas que


culminan en la descomposicin oxidativas de hexosas, aminocidos y
cidos grasos. Participa adems en la oxidacin de otras substancias
biolgicas como etanol y retinol.

12. Cofactores de las enzimas


Cofactor:
Algunas enzimas dependen para su actividad cataltica adems de la
estructura proteica, de otras molculas de naturaleza no proteica. Estas
estructuras reciben el nombre de cofactores. Estos son resistentes al calor
mientras que las protenas generalmente no lo son.
El complejo enzima cofactor recibe el nombre de holoenzima. A la
fraccin proteica aislada del cofactor que es inactiva se la denomina
apoenzima. Los cofactores pueden ser simplemente iones metlicos o en
algunos casos molculas orgnicas complejas. Estas ltimas el nombre de
coenzimas.
Las cadenas laterales de los aminocidos de lugar activo son las
responsables principales de catalizar las transferencias de patrones en las
sustituciones nuclefidas. Para catalizar otras reacciones, las enzimas
requieren cofactores no proteicos, es decir cationes metlicos y coenzimas.
Activadores Metlicos
Los metales importantes en los seres vivos son de dos clases: metales
de transicin y metales alcalinos y alcalinotrreos. Debido a sus estructuras
electrnicas, los metales de transicin suelen participar en la catlisis. Los
metales alcalinos y alcalinotrreos con poca frecuencia forman complejos
fuertes con las protenas.
Varias propiedades de los metales de transicin los hacen tiles en la
catlisis. Los iones metlicos proporcionan una concentracin elevada de
cargas positivas que es especialmente til para la unin de molculas
pequeas. Debido a que los metales de transicin actan como cidos Lewis
(aceptadores de pares electrnicos), son eficaces electrfilos. Debido a que
sus valencias dirigidas les permiten interaccionar con dos o ms ligandos, los
iones metlicos ayudan al sustrato a orientarse dentro del lugar activo. Como
consecuencia, el complejo sustrato-ion metlico polariza al sustrato y estimula
la catlisis. Finalmente, debido a que los metales de transicin tienen dos o
ms estados de valencia, pueden actuar como mediadores en las reacciones
de oxidacin-reduccin.
Activadores Metlicos.
Coenzimas:

Las coenzimas son molculas orgnicas que tienen diversas


funciones en la catlisis enzimtica. La mayora de las coenzimas derivan de
las vitaminas, muchas de las cuales deben ser incorporadas con la dieta. Las
vitaminas (nutrientes orgnicos que se requieren en cantidades pequeas en la
alimentacin del ser humano) se dividen en dos clases: hidrosolubles y
liposolubles. Adems existen determinados nutrientes semejantes a las
vitaminas (cido lipoico, carnitina y cido p- aminobenzoico) que pueden
sintetizarse en pequeas cantidades y que facilitan los procesos catalizados
por las enzimas.

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