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Monografa
ENZIMAS
Equipo # 1 :
Hernandez Perez Cecilia
Hernandez Vasquez Lidia
Magdaleno Gonzaga Irma Betsabe
Reynoso Gutierrez Sayra Elizabeth
Uehara Uyeda Naomi
Ulloa Hernandez Hilda Berenice
303137562
301817078
301348264
E04114361
E04117387
E04124715
UNIDAD 5
ENZIMAS
1.- Sinonimia
2.- Concepto / Definicin
a. Naturaleza qumica
b. Composicin qumica
c. Estructura enzimtica
3.- Nomenclatura
3.1.- Nomenclatura Actual
4.- Clasificacin
a. Oxido-Reductasas
b. Transferasas
c. Hidrolasas
d. Liasas
e. Isomerasas
f.
Ligasas
Irreversible
g. Competitiva
h. No Competitiva
i.
Alosterica
Covalente
k. No Covalernte
12.- Cofactores de las Enzima
l.
Cofactor
m. Coenzima
13.- Importancia Biomdica
14.- Bibliografa
1.- Sinonimia
Enzima: son tambin llamados catalizadores biolgicos
a) Naturaleza qumica
Existen numerosas razones para afirmar que las enzimas son protenas. La
ms importantes son las siguientes:
a. El anlisis de las enzimas obtenidas en forma ms pura, cristalizada,
demuestra que son protenas.
b. Las enzimas son inactivadas a altas temperaturas y, en general, la
cintica de la desnaturalizacin trmica de las enzimas da resultados
muy parecidos a los de la desnaturalizacin trmica de las protenas; por
ejemplo el Q10 de la mayora de las reacciones qumicas es de 2 a 3, y,
en el caso de las enzimas, a temperaturas elevadas, alrededor de 60 a
70C, la actividad neta aumenta varios cientos, como sucede con la
velocidad de la desnaturalizacin trmica de las protenas.
c. Las enzimas son activadas en unas zona muy restringida de PH, y
presenta un punto ptimo de PH donde su actividad es mayor. Las
protenas en su punto isoelctrico, muestran propiedades parecidas
desde el punto de vista de viscosidad, solubilidad, difusin, etc., que
resulta del todo similares a las propiedades de este tipo que muestran
las enzimas.
d. Todos los agentes que desnaturalizan a las protenas tambin destruyen
o inactivan a las enzimas, ya sea el calor, los cidos fuertes, o los
metales pesados que pueden combinarse con ellas.
e. Los problemas de solubilidad y de precipitacin son comunes a las
protenas y las enzimas; en general, son solubles en agua o soluciones
salinas, insolubles en alcohol, precipitan con determinadas
concentraciones de sales neutras, etc.
b) Composicin qumica
Solo protenas, que difieren entre si por la secuencia con que los
aminocidos estn combinados, como la ureasa y las enzimas
digestivas (la pepsina y la tripsina)
c) Estructura enzimtica
Historia
Cien aos atrs solo se conocan enzimas, muchas de estas, catalizaban la
hidrlisis de enlaces covalentes. Algunas enzimas, de manera especial las que
fueron descubiertas en un principio, recibieron nombres ligados a su sitio de
procedencia anatmica que no siguen ninguna regla ni sistema; tal es el caso
de la
Ptialina de la saliva: ataca al almidn de la pepsina del estmago
Tripsina del pncreas: atacan protenas
Renina: que coagula la leche
Papaina, enzima proteoltica que se encuentra en la papaya.
Proteasas: se encuentran en las clulas.
Las enzimas relacionadas con la cuagulacin de la sangre, como son la
trombina, la plasmina, el plasmingeno, etc. reciben tambin nombres
sistematizados.
Al descrubir nuevas enzimas y proceder a su caracterizacin estricta se
aplicaron reglas de nomenclatura basadas en el nombre del sustrato atacado, o
en el tipo general de sustrato, o en la reaccin catalizada y se ha aadido
convencionalmente, la terminacin -asa.
Por ejemplo:
Las lipasas (hidrolizan lpidos o grasas)
Las amilasas (hidrolizan almidn)
Las proteasas (hidrolizan protenas)
Las esterasas (basado en la unin general de tipo ster presentes en
muchas sustancias) Colesterol estrerasa (si la esterasa es especfica de
los esteres de colesterol) y acetilcolina esterasa (si la esterasa de la
acetilcolina).
Otros ejemplos:
Las fosfatasas son enzimas que atacan las uniones ster, pero en este
caso, toman su nombre del grupo vecino a la unin que van a atacar, de
manera que se denominan fosfatasas (cuando quitan una molcula de
monofosfato), pirofosfatasas (cuando quitan el cido fosfrico como
esteres dobles (pirofosfatos), o triples, etc.)
Las carbohidrasas se denominan as genricamente, pero pueden
comprender enzimas con nombres proveniente del sustrato particular
sobre el que actan como la amilasa que ataca al almidn y la celulasa
que acta sobre la celulosa y, en otras ocasiones, se denominan de
acuerdo con la unin atacada, como la -glucosidasa que acta sobre
las uniones -glucosdicas.
Los ejemplos se pueden extender a todos los terrenos de la actividad
enzimtica, como en las enzimas proteolticas, las fosforilasas, las nucleasas,
etc.
Esta manera de llamarlas, se demostr que era inadecuada porque al
descubrirse varias enzimas, notaron que varias enzimas catalizaban reacciones
diferentes del mismo sustrato, por ejemplo, oxidacin o reduccin de la funcin
alcohol de un azcar.
Aunque el sufijo asa contina en uso; actualmente, al nombrar a las
enzimas, se enfatiza el tipo de reaccin catalizada. Por ejemplo: las
hidrogenasas catalizan la eliminacin de hidrogeno y las transferasas,
reacciones de transferencia de grupo. Con el descubrimiento de mas y mas
enzimas, surgieron ambigedades y con frecuencia no estaba claro cual era la
enzima que un investigador deseaba estudiar.
Para remediar esta deficiencia, la Comisin para el estudio de las enzimas,
que constituye con respecto a los sistemas anteriores un punto de vista ms
uniforme, preciso y descriptivo; esta formada por la Unin Internacional de
Bioqumica (IUB) adopt, en 1964, un sistema complejo pero inequvoco de la
nomeclatura enzimtica basado en el mecanismo de reaccin.
El sistema se basa en la reaccin qumica catalizada que es la propiedad
especfica que caracteriza a cada enzima las cuales se agrupan en clases,
porque catalizan procesos semejantes, y en subclases que especifican con
mayor exactitud la reaccin particular considerada.
En general, las enzimas reciben un nombre de acuerdo con el sustrato o los
sustratos que participan en la reaccin seguido por el tipo de reaccin
catalizada y, por fin, la terminacin -asa. A menudo los nombres as obtenidos
resultan largos y complejos, por lo que es muy difcil que en la prctica se
pueda excluir el uso de los nombres triviales, consagrados por la costumbre.
Sin embargo, con fines de sistematizacin, se reconoce la necesidad de
aceptar el nuevo sistema.
4.- Clasificacin
xido reductasas
Son las enzimas relacionadas con las oxidaciones y las reducciones
biolgicas que intervienen de modo fundamental en los procesos de
respiracin y fermentacin.
son importantes a nivel de algunas cadenas metablicas, como la
escisin enzimtica de la glucosa, fabricando tambin el ATP, verdadero
almacn de energa. Extrayendo dos tomos de hidrgeno, catalizan las
oxidaciones de muchas molculas orgnicas presentes en el
protoplasma; los tomos de hidrgeno tomados del sustrato son cedidos
a algn captor.
Transferasas
Hidrolasas
Liasas
Estas enzimas escinden (raramente construyen) enlaces entre tomos
de carbono, o bien entre carbono y oxigeno, carbono y nitrgeno, y
carbono y azufre dejando enlaces dobles, pero tambin agregan grupos
a los enlaces dobles. Las liasas catalizan reacciones en las que se
elimina grupos (por ejemplo H2O, CO2 y NH3) para formar un doble
enlace o se aaden a un doble enlace. Los ejemplos son liasas,
descarbolasas, hidratasas, deshidratasas, desaminasas y sintasas.
Algunas liasas actan sobre compuestos orgnicos fosforados muy
txicos, escindindolos; otros separan el carbono de numerosos
sustratos.
Ejemplo:
Isomerasas
Ligasas
Realizan la degradacin o sntesis de los enlaces fuertes mediante el
acoplamiento a sustancias ricas en energa como los nucleosidos del
ATP. Algunos ejemplos de estas son las Carboxilasas y las
Peptidosintetasas.
Son enzimas que catalizan la unin de dos molculas acoplada a la
hidrlisis de un grupo pirofosforilo en el ATP o un trifosfato nucleosilo
similar.
Son enzimas que catalizan la formacin de un enlace entre dos
molculas de sustrato. La energa para estas reacciones la aporta
siempre la hidrlisis de ATP. Los nombres de muchas ligasas incluyen el
trmino sintetasa. Otras ligasas se denominan carboxilasas.
Ejemplo:
Enzima Piruvato caboxilasa
3.
PH
Temperatura
Cofactores
Caractersticas:
Efecto de la temperatura :
Un aumento en la temperatura provoca un aumento de la velocidad de
reaccin hasta cierta temperatura ptima, ya que despus de
aproximadamente 450 C se comienza a producir la desnaturalizacin trmica.
Cuando mayor es la temperatura, mayor es la velocidad de reaccin. La
velocidad de reaccin aumenta debido a que hay ms molculas con la energa
suficiente para entrar en el estado de transicin. Las velocidades de las
reacciones catalizadas por enzimas aumentan tambin al incrementarse la
temperatura. Sin embargo, las enzimas son protenas que se desnaturalizas a
temperaturas elevadas. Cada enzima tiene una temperatura ptima a la que
acta con su mxima eficacia. Debido a que las enzimas son protenas, los
valores de la temperatura ptima dependen del pH y de la fuerza inica. Si la
temperatura se incrementa ms all de la temperatura ptima, la actividad
enzimtica desciende bruscamente. La temperatura ptima de una enzima
normalmente est cerca de la temperatura normal del organismo del que se
procede
Concentracin de sustrato:
Al principio un aumento de la concentracin de substrato produce un
aumento rpido de la velocidad de reaccin, pero si se sigue aumentando la
concentracin de substrato, la velocidad de reaccin comienza a disminuir;
vemos que a muy altas concentraciones de substrato se observa que no
cambia la velocidad de reaccin, se dice que los centros activos de la enzima
se encuentran saturados. La velocidad de reaccin que se obtiene a esa alta
concentracin de substrato se define como la velocidad mxima (vm) de la
reaccin enzimtica bajo las condiciones especificadas. La concentracin de
substrato [S], a la semivelocidad mxima de reaccin ( v ) se puede
determinar de la figura y representa la constante de Michaelis o km, la cual es
una caracterstica para cada enzima. La inversa de km, o 1/ km, mide
aproximadamente la afinidad de la enzima por el substrato. Mientras ms
pequeo sea el valor de km, mayor ser la afinidad de la enzima por el
substrato. Si varias enzimas compiten en el metabolismo por el mismo
substrato, ste ser transformado preferentemente por la enzima con mayor
afinidad.
v1 = k1 [E] [S]
v2 = k2 [ES]
v3 = k3 [ES]
sustrato. La succinato deshidogenasa, una enzima del ciclo del cido ctrico de
Krebs, catalizan una reaccin redox que convierten el succinato en fumarato.
b. No Competitiva:
En algunos reacciones catalizadas por enzimas el inhibidor puede unirse
tanto a la enzima como al complejo enzima sustrato:
En estas circunstancias, que se denominan inhibicin no competitiva, el
inhibidor se une a un lugar diferente del lugar activo. La unin del inhibidor
ocasiona la modificacin de la conformacin de la enzima que impide la
formacin del producto. Normalmente, los inhibidores no competitivos no
afectan a la unin del sustrato y se parecen poco o nada a ste. Como con los
inhibidores acompetitivos, la inhibicin no competitiva slo se invierte
parcialmente aumentando la concentracin de sustrato. La inhibicin no
competitiva normalmente implica dos o ms sustratos. Las caractersticas de la
inhibicin que se observan pueden depender en parte de factores como el
orden en el que se unen los diferentes sustratos. Adems, para la unin de los
inhibidores no competitivos existen dos determinaciones de K I.
Dependiendo del inhibidor que se considere, los valores de estas
constantes de disociacin pueden ser o no equivalentes. Existen dos formas de
inhibicin no competitiva: pura y mixta. En la inhibicin no competitiva pura, que
es un fenmeno poco frecuente, ambos valores de K I son equivalentes. La
inhibicin no competitiva mixta es de forma caracterstica ms complicada
debido a que los valores de KI son diferentes.
c. Acompetitivos:
En la inhibicin acompetitiva, el inhibidor slo se une al complejo enzima
sustrato, y no a la enzima libre.
La adiccin de ms sustrato a la reaccin da lugar a un aumento de la
velocidad de reaccin, pero no hasta el grado que se observa en las reacciones
sin inhibir. La inhibicin acompetitiva suele observarse en las reacciones en las
que las enzimas unen ms de un sustrato.
d. Anlisis Cintico de la Inhibicin Enzimtica:
La inhibicin competitiva, acompetitiva y no competitiva pueden
diferenciarse fcilmente con representaciones dobles inversas.
En dos conjuntos de determinaciones de loa velocidad, la concentracin
de la enzima se mantiene constante. La inhibicin competitiva aumenta la K m
de la enzima y mantiene la Vmx inalterada. En la inhibicin acompetitiva se
modifican ambas Km y Vmx, aunque su cociente permanece igual. En la
inhibicin no competitiva, disminuye Vmx y aumenta Km.
e. Reversible:
En la inhibicin reversible (es decir, inhibicin competitiva, acompetitiva y
no competitiva), el inhibidor puede disociarse de la enzima debido a que se une
mediante enlaces no covalentes.
f.
Irreversible:
a. Covalente
b. No Covalernte