DCA-740

Biologa molecular
Datos generales
Unidad acadmica: Departamento de Ingeniera Agroindustrial
Programa educativo: Doctorado en Ciencias Agroalimentarias
Nivel educativo: Doctorado en Ciencias
Estructura curricular: Lnea de Generacin y Aplicacin del Conocimiento
Denominacin: Bioprocesos Agroalimentarios
Asignatura: Biologa molecular
Carcter: Optativo
Tipo: Terico y prctico
Prerrequisitos: Microbiologa de reactores
Profesora: Dra. Ernestina Valadez Moctezuma
Ao: Primero
Semestre: Segundo
Sesin: Primavera
Horas totales/semana: 4
Horas totales del curso: 64
Horas totales de estudio independiente/semana: 2
Horas totales de estudio independiente: 32
Crditos: 6
Clave: DCA-740
Introduccin
Este curso se caracteriza por tener un enfoque bsico y aplicado que brinda a los
doctorantes en Ciencias Agroalimentarias la oportunidad de entrar en contacto con
las bases de Biologa Molecular. Es una asignatura relacionada verticalmente con
Tpicos selectos de qumica en alimentos, Anlisis multivariado, Seminario de
investigacin II-IV, Proyecto de investigacin II-VII; de manera horizontal se
relaciona con Diseos experimentales, Seminario de investigacin I y Proyecto de
investigacin I.

Los alumnos orientados hacia la investigacin en bioprocesos, podrn tener una

visin en perspectiva sobre la importancia de tcnicas desarrolladas con Biologa
Molecular para contribuir al entendimiento bsico de otras disciplinas tales como la
Bioprocesos y Microbiologa de Biorreactores.
Presentacin
El deciframiento de la estructura tridimensional del DNA, el Cdigo Gentico y la
Sntesis de Proteinas, se desarrollaron las tcnicas para manipular al DNA
(Tecnologa del DNA Recombinante), elevando a la Biologa Molecular como
ciencia. En la dcada de los 80s los conocimientos bsicos de esta nueva disciplina
fueron la base para que la medicina, la industria y la agronoma dieran un marcado
salto cientfico. En estas dos ltimas reas, que son la de inters en el presente
curso, se han dado avances considerables en el mejoramiento de bacterias y
plantas de importancia agrcola por mtodos no convencionales, que tienen su
origen en la manipulacin in vitro de molculas qumicas biolgicamente activas.
El curso est diseado para alumnos de doctorado que posean conocimientos
bsicos de Gentica, Bioqumica y Fisiologa Vegetal. Ser adems un apoyo para
aquellos estudiantes interesados en la biotecnologa agrcola o en el mejoramiento
gentico, que deseen complementar su formacin conociendo los aportes y
potencialidades de tcnicas basadas en la Biologa Molecular.
Objetivo

Adquirir los conocimientos sobre las macromolculas (cidos nucleicos y

protenas), gentica bacteriana y tcnicas bsicas del DNA recombinante,
para permitir posteriormente, acceder al conocimiento y anlisis, logros y
perspectivas de la Ingeniera Gentica en Procariotes y sus aplicaciones.

Contenido
Unidad I. cidos nucleicos y protenas.
(12 horas)
Objetivo: Adquirir el conocimiento fundamental sobre las propiedades fisicoqumicas y estructurales de los cidos nucleicos que le permitan entender sus

propiedades biolgicas, para poder entender la funcin y codificacin de la

informacin gentica a nivel celular, as como las propiedades fisico-qumicas y
biolgicas de las protenas.
1.1. Estructura y propiedades qumicas.
1.1.1. Nucletidos.
1.1.2. Estructura del DNA.
1.1.3. Estructura del RNA.
1.1.4. Propiedades fisicoqumicas de los cidos nucleicos.
1.2. Duplicacin del DNA.
1.2.2. Modelos.
1.2.3. Duplicacin en procariotes.
1.2.4. Duplicacin en eucariotes.
1.3. Mtodos fsico-qumicos de anlisis.
1.3.1. Espectrofotometra.
1.3.2. Ultracentrifugacin.
1.3.3. Electroforesis.
1.4 Sntesis y secuenciacin del DNA.
1.4.1. Sntesis qumica de oligonucletidos.
1.4.2. Mtodos de secuenciacin (Sanger y Maxam-Gilbert).
1.5. Biosntesis de protenas.
1.5.1. Transcripcin y traduccin.
1.5.2. Cdigo gentico y sntesis de protenas.
1.5.3. Sntesis de proteinas en procariotes.
1.5.4. Sntesis de proteinas en eucariotes.
1.6. Estructura y propiedades qumicas.
1.6.1. Clasificacin de protenas.
1.7. Enzimas.
1.7.1. Clasificacin de enzimas.
1.7.2. Factores que regulan la actividad enzimtica.
1.8. Mtodos fsico-qumicos de anlisis.
1.8.1. Espectrofotometra.

1.8.2. Electroferesis en una y dos dimensiones.

1.9. Mtodos biolgicos de anlisis.
1.9.1. Secuenciacin de polipptidos.
1.9.2. Traduccin in vitro.
1.9.3. Mtodos inmunoqumicos. Western blot.
Unidad II. Regulacin gentica.
(12 horas)
Objetivo: Comprender la regulacin de la expresin de los genes en clulas
procariotes y eucariotes para visualizar su importancia en el desarrollo de los
organismos.
2.1. Estructura del gen procarionte.
2.1.1. Elementos que controlan la expresin de los genes.
2.2. Estratgias de regulacin de la expresin gentica.
2.2.1. Regulacin transcripcional (modelo del opern).
2.2.2. Atenuacin.
2.3. Estructura del gen eucarionte.
2.3.1. El nucleosoma y la organizacin de la cromatina.
2.3.2. Factores que intervienen en la transcripcin.
2.3.2. Procesamiento del RNA.
2.3.3. Regulacin postraduccional.
Unidad III. Gentica bacteriana.
(12 horas)
Objetivo: Adquirir los conocimientos generales sobre gentica bacteriana para
entender el uso de estos microorganismos en la ingeniera gentica de procariotes
y eucariotes. Atravs de los conocimientos bsicos de la metodologa del ADN
recombinante desarrollada principalmente en procariotes.
3.1. Cromosomas, Plsmidos y Episomas.
3.2. Conjugacin.
3.3. Transformacin.

3.4. Transduccin.
3.5. Caractersiticas de cepas bacterianas utilizadas en laboratorios.
3.6. Enzimas tiles para la manipulacin de los cidos nucleicos.
3.6.1. Polimerasas.
3.6.2. Ligasas.
3.6.3. Endonucleasas de restriccin.
3.6.4. Exonucleasas.
3.6.5. Otras enzimas.
3.7. Vehculos moleculares.
3.7.1. Caractersticas de un plsmido vector.
3.7.2. Vectores de clonacin.
3.7.3. Vectores de expresin.
3.7.4. Vectores ms utilizados.
3.8 Bancos genmicos.
3.8.1. En plsmidos.
3.8.2. En bacterifagos.
3.8.3. En csmidos.
3.9. Aislamiento y clonacion de genes.
3.9.1. Estrategia general de clonacin.
3.9.2. Uso de oligonucletidos sintticos.
3.9.3. Transcripcin inversa de RNA.
3.10. Anlisis los genes clonados.
3.10.1. Reaccin de polimerasa en cadena (PCR).
3.10.2. Seleccin biolgica.
3.10.3. Tcnicas de hibridacin (Southern, northern y western).
3.10.4. Genes reporteros.
3.11. Mtodos de transformacin gentica.
3.11.1. Transformacin.
3.11.2. Microinyeccin de DNA.
3.11.3. Electroporacin.
3.11.4. Biobalstica.

3.11.5. Agroinfeccin.
Unidad IV. Temas selectos.
(6 horas)
Objetivo: Integrar los conocimientos adquiridos a lo largo del curso mediante la
revisin de artculos cientficos, la utilidad, ventajas y aplicaciones de la Tecnologa
del DNA Recombinante; para lo cual, dependiendo de su inters particular,
elaborar un seminario donde utilice los conocimientos adquiridos en alguno de los
siguientes temas generales:
4.1. Tcnicas novedosas de Biologa Molecular.
4.2. Mutagnesis dirigida para mejoramiento gentico.
4.3. Organismos transgnicos.
4.4. Organismos genticamente modificados.
4.5. Otros de inters.

Actividades prcticas
Se realizan siete prcticas en laboratorios que cuentan con el equipo especializado,
requiriendo un total de 32 horas.
No.

Nombre de la
prctica
El Dogma Central
de la Biologa
Molecular.
Secuenciacin con
el mtodo de
Sanger.

Objetivos

Horas

Unidad

Reproducir los mecanismos de duplicacin,

transcripcin y traduccin mediante la
construccin de modelos didcticos para
entender el flujo de informacin gentica.

II

Comprender el mtodo de secuenciacin de

Sanger con material didctico a fin de describir
su utilidad en el conocimiento de la informacin
gentica.

II

IV

II y IV

Obtener DNA cromosmico a partir de cultivos

bacterianos para conocer su diferenciacin
genmica.
Medir la cantidad de DNA obtenida en la prctica
3 utilizando un espectrofotmetro a fin de
subrayar la importancia de su cuantificacin para
anlisis moleculares.

Purificacin de
DNA bacteriano.

Cuantificacin de
DNA.

Fragmentacin de
DNA con enzimas
de restriccin.

Utilizar diferentes enzimas de restriccin en DNA

cromosmico para interpretar los perfiles de
restriccin.

Electroforsis de
cidos nucleicos.

Separar en geles de agarosa molculas

completas y fragmentadas del DNA
cromosmico a fin de diferenciar su migracin en
la electroforesis.

Transformacion
gentica de
bacterias.

Utilizar clulas bacterianas competentes para

transformar genticamente los plsmidos

Metodologia
Las unidades I-III se desarrollarn con exposicin del profesor apoyado en
diapositivas. Tambin se discutirn algunos artculos de inters.
La unidad IV se desarrollar con exposicin de temas especficos por parte de los
estudiantes apoyados en diapositivas.

Evaluacin (E)

Final

Intermedia

Inicial

Elaborar/presentar/

Indicadores

Valor

Objetivo

Evaluar los conocimientos tericos y

prcticos, mediante la aplicacin de un
examen, para la obtencin de un
panorama grupal.

Examen diagnstico
individual

Examen

Examen parcial

Exmenes
escritos

Participacin
individual

Participacin en
clase y tareas

Prcticas de
laboratorio

Reportes
Participacin

10

Seminario

Exposicin

10

70

10

Aplicar exmenes de los temas

revisados, formulando preguntas
terico-prcticas, para la evaluacin
del aprendizaje.
Fomentar la participacin activa del
estudiante, mediante la discusin de
temas contenidos en el programa, para
el desarrollo de propuestas de
aplicacin.
Aplicar los conocimientos tericos
adquiridos en el curso, mediante el
desarrollo de prcticas, para la
adquisicin de habilidades en el
manejo de materiales, equipo y
mtodos.
Aplicar los conocimientos
proporcionados en el curso, a travs
del desarrollo de un seminario que
integre la Biologa molecular en los
alimentos, para la evaluacin del
aprendizaje.

Bibliografa bsica
Unidad I. Acidos nucleicos y Protenas.
1.

Bohinsky R. C. 1991. Bioqumica. Smith y Wood. Molculas Biolgicas.

Addison Wesley Iberoamericana, S. A. 739 p.

2.

Smith y Wood. 1998. Molculas Biolgicas. Addison Wesley Iberoamericana,

S. A. 1998. 205 p.

3.

Watson, J. D., Hopkins, N. H., Roberts, J. W., Steitz, J. A., and Weiner, A. M.
1897.

Molecular

Biology

of

the

Gene.

Volumen

and

II.

The

Benjamn/Cummings Publishing Company, Inc. 1163 p.

4.

Darnell, J., H. Lodish and D. Baltimore. 1990. Molecular Cell Biology. 2da. ed.
American Books. New York. 1005 pp.

5.

Smith y Wood. 1998. Molculas Biolgicas. Addison Wesley Iberoamericana,

S. A. 1998. 205 p.

6.

Walker, J. M. 1984. Proteins: Methods in Molecular Biology. Vol 1. Ed. Human

Press. Clifton, N. J. 365 pp.

Unidad II. Regulacin gentica y Gentica bacteriana.

7.

Freinfelder, D. 1983. Molecular Biology. A comprehensive introduction to

prokariotes and eukariotes. Jones and Bartlett Publishers Inc. Boston, USA.
979 pp.

8.

Kahl, G. 1988. Architecture of Eukariotic Genes. VCH. FDR. 517 pp.

9.
10.

Birge, E. A. 1981. Bacterial and Bacteriophage Genetics. Springer-Verlag.

New York. 359 p.

11.

Jimnez-Snchez, A. and R. Guerrero. 1982. Gentica Molecular Bacteriana.

Ed. Revert, S. A. Espaa. 445pp.

12.

Shapiro, J. A. 1983. Mobile Genetic Elements. Academic Press. New York.

687 pp.

Unidad III. Ingeniera gentica de procariontes.

13.

Old, R. W. and S. B. Primrose. 1985. Principles of gene manipulation. An

introduction to genetic engineering. Blackwell Scientific Publications. Oxford.
409 p.

14.

Smith y Wood. 1998. Biologa Molecular y Biotecnologa. Addison Wesley

Iberoamericana, S. A. 1998. 247 p.

15.

Watson, J. D., J. Tooze and D. T. Kurtz. 1896. ADN recombinante. Introduccin

a la Ingeniera Gentica. Ed. Labor, S. A. Espaa. 200 pp.

16.

Watson, J. D., Gilman, M., Witkowski, J. And Zoller, M. 1992. Recombinant

DNA. Scientific American Books. New York. 626 p.

Unidad IV. Temas selectos.

Publicaciones en revistas

Annual Review of Biophysics and Biomolecular Structure

Annual Review of Genetics

Biochemical Genetics

10

Cloning

Community Genetics

Conservation Genetics

Current Advances in Genetics and Molecular Biology

Current Genetics

Developmental Genetics

Development, Genes and Evolution

DNA and Cell Biology

DNA Sequence

Gene

Genes to Cells

Genetica

Genetical Research

Genetic Engineering News

Genetics

Genetics and Molecular Biology

Genome

Genome Biology

Genome Research

Genomics

Journal of Computer-Aided Molecular Design

Molecular Engineering

Molecular and General Genetics

Molecular Genetics and Metabolism

Molecular Phylogenetics and Evolution

Mutagenesis

Nature Genetics

Nature Reviews Genetics

New Genetics and Society

Nucleic Acids Research

Protein Engineering

Proteins: Structure, Function, and Genetics

Psychiatric Genetics

RNA

Russian Journal of Genetics

Theoretical and Applied Genetics

Transgenics

Trends in Genetics

Perfil del profesor

Se requiere de un profesor entendido como un trabajador del conocimiento,
ms centrado en el aprendizaje que en la enseanza, diseador de ambientes de
aprendizaje, con capacidad para optimizar los diferentes espacios en donde ste
se produce, atendiendo particularmente la organizacin y disposicin de los
contenidos del aprendizaje, con un seguimiento permanente de los estudiantes.
Sin embargo, en su perfil profesional, el profesor debe tener formacin en
ciencias genmicas, biotecnologa, o programa similar, preferentemente con
estudios de doctorado en las mismas reas del conocimiento, con dominio de las
reas de las ciencias genmicas, adems de experiencia profesional mnima
de 5 aos en el mbito docente.

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