UNIVERSIDAD DE MURCIA

Licenciado en Biologa
FACULTAD DE BIOLOGIA
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ASIGNATURA: 01C7 ECOLOGA MICROBIANA

Curso: Quinto / 2 Cuatrimestre.
Tipo: Optativa
Crditos (Teora + Prcticas): 5,5 (4,5+1)
Departamento (Area): Gentica y Microbiologa (Microbiologa)
Profesorado:

D. Francisco Torrella Mateu (torrella@um.es)

Objetivos de la asignatura/ competencias: Impartir las bases de la ecologa de los microorganismos, la

microbiologa ambiental as como las aplicaciones de las mismas.
Conocimientos previos recomendables: Microbiologa (asignaturas troncales), bioqumica, fisiologa y
conceptos bsicos de qumica, fsica y ecologa.
Mtodos docentes: Clases de teora y prctica, y visita guiada.
Tipo de exmenes y evaluaciones (criterios): Examen escrito y, en su caso, trabajos sobre temas
especficos.
Tutorias (horario): Mircoles y jueves 16 a 19 horas.

PROGRAMA TERICO:
Tema 1.-. Concepto de la asignatura e historia: Conceptos de ecologa microbiana y microbiologa
ambiental.- Desarrollo histrico de la ecologa microbiana: Descubrimientos del papel de los
microorganismos en las transformaciones de la materia y en la dinmica de los ecosistemas.- Ecologa
Microbiana en la actualidad: avances metodolgicos y reas de investigacin destacada.
Tema 2.- Mtodos de estudio de la Ecologa Microbiana, I: Caractersticas y objetivos del muestreo en
Ecologa Microbiana.- Aparatos para muestreo en distintos hbitats.- Conservacin de muestras para su
estudio.
Tema 3.- Mtodos de estudio de la Ecologa Microbiana, II: Tcnicas para la cuantificacin de
microorganismos en el medio natural: recuentos directos y recuentos de viables.- Mtodos usados en la
estimacin de la biomasa microbiana: tcnicas de base morfolgica (microscopa directa; captacin y
anlisis de imagen). Tcnicas de base qumica y molecular.- Estudio de la biodiversidad microbiana con
tcnicas gentico-moleculares.
Tema 4.- Mtodos de estudio de la Ecologa Microbiana, III: Deteccin y medida de la actividad
microbiana: actividad heterotrfica; autoradiografas; fijacin de carbono; fijacin de N2; otras medidas
de actividad.
Tema 5.- Factores fsicoqumicos del medio y adaptaciones microbianas, I: Las leyes de Liebig y de
Shelford en Ecologa Microbiana.- Temperatura.- Presin hidrosttica.- Salinidad y actividad del agua.Escasez de nutrientes.
Tema 6.- Factores fsicoqumicos del medio y adaptaciones microbianas, II: pH.- Alcalinidad.Concentracin de oxgeno y potencial re-dox.- Radiacin visible y otras radiaciones electromagnticas.Campo magntico terrestre.
Tema 7.- Las comunidades microbianas en los medios naturales: Descriptiva morfolgico-estructural
de colonizacin microbiana: Medio acutico; medio edfico; las rocas en medio seco y las superficies
higroptricas; los seres vivos animales; los vegetales terrestres y los acuticos. Microorganismos en la
atmsfera.
Tema 8.- Estructura y desarrollo de las comunidades de microorganismos: Adaptaciones y seleccin
microbiana; sucesin en comunidades microbianas.- La diversidad microbiana en comunidades de
microorganismos: realidad de la misma y mtodos para estimarla.
Tema 9.- Interacciones entre microorganismos en el medio ambiente: Simbiosis y comensalismo;
parasitismo intermicrobiano; depredacin intermicrobiana. Transmisin de seales qumicas entre
microorganismos: Quorum sensing.

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------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------Tema 10.- Interacciones entre microorganismos y plantas: La rizosfera de las plantas terrestres;
epifitismo en vegetales acuticos.- Ndulos fijadores de nitrgeno atmosfrico en simbiosis.- Micorrizas.La filosfera de las plantas terrestres.
Tema 11.- Interacciones entre microorganismos y animales: Los microorganismos como base de
cadena trfica: su consumo por los animales.- La colonizacin microbiana del cuerpo de los animales:
simbiosis de bacterias y microorganismos fotosintticos con protozoos.- Colonizacin microbiana externa
e interna del cuerpo de los animales: aspectos morfolgicos y fisiolgicos de la interaccin.- Los
probiticos.
Tema 12.- Microbiologa de los ciclos biogeoqumicos I: Conceptos bsicos sobre Microbiologa y
reciclado de los elementos.- Ciclos del carbono, hidrgeno y oxgeno: transformaciones de estos
elementos qumicos realizadas por microorganismos. Tipos microbianos implicados.
Tema 13.- Microbiologa de los ciclos biogeoqumicos II: Ciclo del nitrgeno: Actividad de los
diversos grupos microbianos sobre las especies qumicas del nitrgeno. Tipos microbianos implicados.
Tema 14.- Microbiologa de los ciclos biogeoqumicos III: Ciclo del azufre: Actividad de los diversos
grupos microbianos sobre las especies qumicas de azufre. Tipos microbianos implicados.
Tema 15.- Microbiologa de los ciclos biogeoqumicos IV: Ciclos del fsforo, del hierro y del
manganeso: Actividad de los diversos grupos microbianos sobre las especies qumicas de estos
elementos. Tipos microbianos implicados.
Tema 16.- Microbiologa de los ciclos biogeoqumicos V: Papel de los microorganismos en el reciclado
y la inmovilizacin del mercurio, selenio, cadmio, arsnico y otros elementos qumicos. Tipos
microbianos implicados.
Tema 17.- Ecologa microbiana de los tratamientos biolgicos de residuos lquidos y slidos:
Depuracin biolgica de aguas: Diferenciacin de grandes tipos y caractersticas bsicas de los distintos
mtodos.- Diversidad de los microorganismos y funcin de los mismos en los fangos activos, filtros de
goteo, lagunajes, filtros verdes y digestores anaerbicos.- Problemas de depuracin asociados a
determinados microorganismos.- Microbiologa del tratamiento de residuos slidos; compostaje de
residuos orgnicos.
Tema 18.- Accin microbiana sobre compuestos carbonados xenobiticos y recalcitrantes:
Naturaleza de las sustancias orgnicas de difcil degradacin biolgica y accin microbiana sobre las
mismas.- Limitaciones a la biodegradacin. Importancia de los parmetros ambientales.- Bioacumulacin
y efecto sobre la cadena trfica.
Tema 19.- Biorremediacin y recuperacin microbiana de ambientes deteriorados: Recuperacin de
metales: tipos microbianos y ecologa.- Microorganismos bioacumuladores de metales txicos.Recuperacin del petrleo.- Biorremediacin de ambientes contaminados por sustancias orgnicas e
inorgnicas: suelos; aguas subterrneas.
Tema 21.- Modelizacin de ecosistemas en ecologa microbiana: Principios bsicos y ejemplos.

PROGRAMA DE PRCTICAS :
Las prcticas de la asignatura se llevan a cabo de forma
intensiva en el laboratorio y en el aula, a lo largo de cuatro tardes de una semana, complementndose con
una excursin guiada de medio da a varios sistemas biolgicos de depuracin de agua residual en la que
se experimenta sobre el terreno la aplicabilidad de lotratado en las sesiones de laboratorio.
Relacin de prcticas:
(I) Tcnicas de tincin y recuento microscpico de plancton microbiano mediante fluorocromos (DAPI,
AO); estructura y uso del microscopio de epifluorescencia.
(II) Preparacin y funcionamiento de columnas de Winogradsky; observacin y discusin de las
caractersticas de los tipos microbianos desarrollados en las columnas mediante microscopa de contraste
de fase y campo oscuro.

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------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------(III) Fundamentos y uso de aparatos de medida de parmetros fsico-qumicos de utilidad en
microbiologa de las aguas: medidores de oxgeno disuelto; conductividad; temperatura; pH; potencial
redox; turbidez. Medicin de cloro en aguas potables.
(IV) Estimacin de la carga microbiana del aire: aparatos de medida, siembras, observacin de tipos
microbianos viables.
(V) La microbiologa de la depuracin biolgica de las aguas a travs de macrofotografas y micrografas
de microorganismos presentes en los diferentes sistemas: sesin demostrativa y de discusin.
(VI) Visita guiada a estaciones de depuracin biolgica de aguas residuales urbanas. recogida de muestras
y estudio en el laboratorio.

BIBLIOGRAFA:

Textos de microbiologa general de lectura recomendada para partes de la materia:

Schaechter,M, J.L. Ingraham and F.C Neidhart. Microbe. ASM Press. Washington. 2005.
Prescott, L.M. et al. Microbiologa, 4 ed. (o posteriores) McGraw Hill Interamericana. Madrid. 1999.
Madigan, L.T. et al. Brock, Biologa de los microorganismos. 10 ed. y anteriores. Prentice Hall Iberia.
Madrid. 2004.

Textos especficos de ecologa microbiana y microbiologa ambiental:

Atlas,R.M. and R. Bartha. 2002. "Ecologa microbiana y Microbiologa ambiental. Pearson
Educacin SA (Addison Wesley), Madrid.
(Traduccin al castellano de 4 Ed.en ingls de "Microbial Ecology. Fundamentals and aplications" de
R.M. Atlas and R. Bartha. 1998. Benjamin /Cummings Pub. Co.)
Maier, R.M., I.L.Pepper and Ch.P.Gerba. 2000. Environmental Microbiology. Academic Press.
London.
Lynch, J.M. and J.E.Hobbie. 1988. "Microorganisms in action: concepts and applications in
microbial ecology". Blackwell Sci. Pub. Oxford.
Stolp, H. 1988. "Microbial ecology: organisms, habitats and activities". (Cambridge University
Studies in Ecology Series), Cambridge University Press, Cambridge.

Otros libros de ecologa microbiana bsica o aplicada:

B.E. Rittmann and P.L. McCarty. 2001.
Environmental Biotechnology: Principles and
Applications. McGraw-Hill Book Co., New York.
van Elsas,J.D., Trevors, J.T. and E.M.H. Wellington. 19... (4th printing). "Modern soil
microbiology". Marcel Dekker AG. Basilea (Suiza).
Hurst Ch.J., et al. 1997. "Manual of environmental microbiology". American Society for
Microbiology Press (ASMPress), Washington D.C.
Burlage, R.S. et al. 1998. "Techniques in microbial ecology". Oxford University Press, N.Y.
Ehrlich, H.L. 1996. "Geomicrobiology" (3rd Ed). Marcel Dekker,Inc., New York.

Libros complementarios de posible uso espordico para partes de la asignatura:

Lovley, Derek R. (ed.).2000. Environmental Microbe-Metal Interactions. ASM Press. Washington,
DC.
Horikoshi, K. And W.D. Grant (Eds.). 1998. "Extremophiles. Microbial life in extreme
environments". (Wiley-Liss), John Wiley & Sons, Inc., N.Y.
Insam,H. And A. Rangger (Eds.). 1997. "Microbial communities. Functional versus structural
approaches". (Springer for Science). Springer-Verlag, Berlin-Heidelberg.
Hastings,A. 1997. "Population biology. Concepts and models". Springer-Verlag Inc., New York.
Gurney, W.S.C. and R.M. Nisbet. 1998. "Ecological dynamics". Oxford University Press Inc., New
York.

Artculos cientficos y escritos sobre Ecologa Microbiana; pginas web sobre la

materia:
Sern suministrados por el profesor a lo largo del curso.