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Licenciada
Orientadora: Ilda Maria Barros dos Santos Gomes Sanches, Professora Doutora,
UNL/ FCT
Jri:
Presidente: Professor Doutor Jos Paulo Nunes de Sousa Sampaio
Arguente: Professora Doutora Rita Maria Rodrigues Teixeira de Castro
Vogais: Professora Doutora Ilda Maria Barros dos Santos Gomes Sanches
Dezembro 2012
A Faculdade de Cincias e Tecnologia e a Universidade Nova de Lisboa tm o direito, perptuo e sem limites
geogrficos, de arquivar e publicar esta dissertao atravs de exemplares impressos reproduzidos em papel ou
de forma digital, ou por qualquer outro meio conhecido ou que venha a ser inventado, e de a divulgar atravs de
repositrios cientficos e de admitir a sua cpia e distribuio com objectivos educacionais ou de investigao,
no comerciais, desde que seja dado crdito ao autor e editor.
ii
Agradecimentos
Concludo este longo percurso existem agradecimentos que no posso deixar de fazer.
Quero agradecer ao Centro Hospitalar que me disponibilizou este estgio e a toda a equipa do
laboratrio de anlises clnicas, em especial seco de microbiologia.
Aos meus pais e ao meu mano, que sempre me apoiaram em tudo e que possibilitaram a minha
evoluo a nvel acadmico.
Ao meu namorado, no s pela maneira como sempre me tratou, mas tambm por todo o apoio que
me deu nos momentos em que me apeteceu desistir de tudo. Por me devolver sempre a vontade de
fazer mais e melhor.
Aos amigos que sempre estiveram do meu lado e que me proporcionaram momentos nicos,
especiais e inequecveis, nomeadamente: Cludia Pinheiro, Tatiana Fera, Dbora Fera, Andreia
Forte, Marta Monteiro, Rui Semio, Carina Silva, Andr Monteiro, Ndia Silvestre, Paulo Palminha,
Carla Correia, Patricia Barreiros, Cecilia Bento, Sandra Piarra, Maria Moniz, Armnio Silva, Edgar
Gramacho e Bruno Gonalves.
A todos os colegas de curso, especialmente Ana Cludia, Ctia e Ndia, pelas horas de estudo que
passamos juntas, e pelos sorrisos que partilhamos tantas vezes.
Aos meus padrinhos, afilhada e respectivas familias, e a todos os familiares que sempre quiseram o
melhor para mim: prima Xana, prima Maria Antnia, primo Manel, Av Adlia, tia Hortence, tio
Ramos, tia Maria, tio Renato, prima Ana, primo Paulo, primo Nuno, primo Guilherme, primo Valter,
primo Mauro, tio Antnio, tia Quina, prima Isabel, primo Antnio, primo Valter, prima Ins, prima
Mavilde, primo Olmpio, primo Tiago, prima Gina, primo Z, primo Nuno, prima Silvia, primo Pedro,
prima Patrcia, primo Diogo, prima Soraia, primo Vitor, prima Anabela, primo Rodrigo, prima Catarina,
primo Manel e prima Maria.
minha cadela Kira, pela companheira que .
E por ltimo, mas no em ltimo, ao meu grande AV, que mesmo ausente, estar sempre presente
no meu corao.
iii
iv
Resumo:
vi
Abstrat
The realization of the internship in microbiology section of the Department of Clinical Pathology of a
hospital center, during a period of six months (from October 2011 to March 2012) was built in two
parts.
One of these parts (part number one) was made during six months of internship (from October 1 to
March 31) it was possible to obtain general knowledge of bacteriology, paying attention to the
methodology used in the processing of different biological samples who came from several services.
The urine was the most analyzed product at 36% (n = 3294) of the total samples..
The second part (part number two) completed during a period of three months (from January 1 to
March 31) focused on the study microbiological of urine. 1408 urine samples from different services
were analyzed with the goal of isolate and correctly identify possible infectious agents. From this study
resulted 500 urocultures (36%) and a total of 604 isolated microorganisms. With the gender evaluation
of the positive urocultures was possible to verify that the prevalence was bigger to the feminine gender
(68%) and to people over than 60 years old (63.2%).
From the 22 types of isolated microorganisms the most frequent was E.coli (46,5%) followed by others
Enterobactereaceas spp. And Gram positive cocci, this order may change significantly with the clinical
condition under study (intern/extern patients and patients with/without catheter).
It was possible to find out that the number of polymicrobial samples was most incident in the
individuals with catheter (41%) than in the individuals without catheter (7%). It was still possible to
observe that the predominance of positives urocultures was in female individuals with catheter
(58,6%) as it was in individuals with ages over 61 years old (86,9%).
vii
viii
ndice Geral
Introduo ...................................................................................................................................1
1.1
1.2
1.3
1.3.1
Urina ............................................................................................................................2
1.3.2
Sangue ........................................................................................................................3
1.3.3
1.3.4
Fezes...........................................................................................................................4
1.3.5
1.3.6
1.3.7
1.3.8
Lquidos Corporais........................................................................................................... 6
1.4
1.5
1.6
1.7.1
Oxidase ..................................................................................................................... 10
1.7.2
Catalase .................................................................................................................... 11
1.7.3
Coagulase ................................................................................................................. 11
1.7.4
Urease ....................................................................................................................... 11
1.7.5
Indol........................................................................................................................... 12
1.7.6
Teste de CAMP.......................................................................................................... 12
1.7.7
1.7.8
1.8
1.9
Microrganismos ................................................................................................................. 16
1.9.1
1.9.1.1
1.9.1.2
1.9.2
1.9.2.1
1.9.2.2
1.9.2.3
1.9.2.4
ix
1.9.3
2.
2.2
2.2.1
2.2.1.1
2.2.1.2
2.2.2
3.
3.2
4.
Concluses: .............................................................................................................................. 45
5.
Bibliografia ................................................................................................................................ 47
6.
Apndices: ................................................................................................................................ 51
ndice de Figuras
Figura 1. 1 Observao microscpica de bacilos Gram negativo ........................................................9
Figura 1. 2 Observao microscpica de cocos Gram positivo ...........................................................9
Figura 1. 3 Morfologia das bactrias ................................................................................................ 10
Figura 2. 1 Fluxograma com procedimento efectuado em urinas ....................................................... 26
Figura 2. 2 Fluxograma de Bacilos Gram negativo ........................................................................... 30
Figura 2. 3 Fluxograma de Cocos Gram positivo .............................................................................. 31
Figura 2. 4 Fluxograma de Bacilos Gram positivo............................................................................. 31
Figura 6. 1 E.coli em MacConkey .................................................................................................... 52
Figura 6. 2 E.coli em gelose Sangue ............................................................................................... 52
Figura 6. 3 Klebsiella pneumoniae em MacConkey ......................................................................... 53
Figura 6. 4 Proteus mirabilis em gelose Sangue .............................................................................. 53
Figura 6. 5 Proteus mirabilis em MacConkey................................................................................... 53
Figura 6. 6 P.aeruginosa em gelose Sangue ................................................................................... 54
Figura 6. 7 P.aeruginosa em MacConkey ........................................................................................ 54
Figura 6. 8 S.aureus em gelose Sangue........................................................................................... 54
Figura 6. 9 Estafilococos coagulase negativa em gelose Sangue .................................................... 54
Figura 6. 10 Enterococcus spp. em gelose Sangue .......................................................................... 55
Figura 6. 11 S.agalactiae em gelose Sangue ................................................................................... 55
Figura 6. 12 S.pneumoniae em gelose Sangue ............................................................................... 55
Figura 6. 13 Corynebacterium spp. em gelose Sangue .................................................................. 556
Figura 6. 14 Leveduras ao microscpico ....................................................................................... 556
Figura 6. 15 Demonstrao da exigncia dos factores de crescimento para H.influenzae ................ 57
Figura 6. 16 H.influenzae em gelose Chocolate............................................................................... 57
Figura 6. 17 Ovo de Ascaris lumbricoides......................................................................................... 57
Figura 6. 18 Ovo de Trichuris trichiura .............................................................................................. 57
Figura 6. 19 Quisto de Entamoeba spp. .......................................................................................... 58
Figura 6. 20 Larva de Strongyloides spp.......................................................................................... 58
Figura 6. 21 Ovo de Ancylostoma spp. ............................................................................................. 58
xi
xii
ncide de Tabelas
Tabela 1. 1 Distribuio dos principais microrganismos da flora comensal........................................2
Tabela 1. 2 Meios de cultura ............................................................................................................6
Tabela 1. 3
Tabela 6. 8
Tabela 6. 9
xiii
xiv
ndice de Grficos
Grfico 3. 1 Percentagens de produtos biolgicos analisados durante o perodo de estgio ............. 33
Grfico 3. 2 Percentagens de produtos biolgicos analisados nos primeiros seis meses de 2011 ..... 33
Grfico 3. 3 Percentagens de resultados positivos e negativos ......................................................... 35
Grfico 3. 4 Percentagens de resultados positivos consoante o sexo ............................................... 35
Grfico 3. 5 Uroculturas positivas no sexo masculino, por grupo etrio............................................. 36
Grfico 3. 6 Uroculturas positivas no sexo feminino, por grupo etrio .............................................. 36
Grfico 3. 7 Distribuio dos microrganismos isolados nas amostras de urina ................................. 37
Grfico 3. 8 Distribuio dos microrganismos isolados por doentes internados e externos............... 39
Grfico 3. 9 Distribuio dos microrganismos por indivduos algaliados e no algaliados ................. 41
Grfico 3. 10 Microrganismos em indivduos algaliados, por sexo feminino e grupo etrio ............... 43
Grfico 3. 11 Microrganismos em indivduos algaliados, por sexo masculino e grupo etrio ............ 43
xv
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Lista de abreviaturas
ITU
LCR
Lquido Cefalorraquidiano
CNA
VCAT
MRSA
Ufc
Ufc/ml
spp.
Espcies
NAD
Mcf
Mcfarland
TSA
Lac+
Fermentador de Lactose
Lac-
No fermentador de Lactose
P.mirabilis
Proteus mirabilis
K.pneumoniae
Klebsiella pneumoniae
K.oxytoca
Klebsiella oxytoca
A.baumanii
Acinetobacter baumanii
E.faecalis
Enterococcus faecalis
E.faecium
Enterococcus faecium
S.epidermidis
Staphylococcus epidermidis
S.saprophyticus
Staphylococcus saprophyticus
S.aureus
Staphylococcus aureus
S.agalactiae
Streptococcus agalactiae
P.aeruginosa
Pseudomonas aeruginosa
P.stuartii
Providencia stuartii
M.morganii
Morganella morganii
E.coli
Escherichia coli
P.vulgaris
Proteus vulgaris
E.aerogenes
Enterobacter aerogenes
C.koseri
Citrobacter koseri
S.marcescens
Serratia marcescens
E.cloacae
Enterobacter cloacae
S.liquefaciens
Serratia liquefaciens
Caldo GN
AM
Antimicrobianos
CMI
CLSI
xvii
xviii
1 Introduo
1.1 Objectivo do Estgio
O objectivo do Estgio no laboratrio de microbiologia foi o de adquirir conhecimentos gerais sobre
microbiologia clinica e tomar contacto com metodologia e tcnicas utilizadas no processamento de
amostras biolgicas provenientes de doentes dos vrios servios hospitalares, como fezes,
expectorao e exsudado vaginal, dando especial ateno s amostras de urina
As amostras so inicialmente semeadas em diferentes meios de cultura, e posteriormente incubadas
em atmosfera adequada ao crescimento e isolamento de microrganismos. Em algumas amostras so
efectuados exames a fresco (ex. urina), e na maioria realizam-se exames ps-colorao.
Depois do crescimento bacteriano procede-se identificao do agente isolado e determinao do
perfil de susceptibilidade a diversos antimicrobianos (antibiograma). Concludo todo o processo e
aps validao introduzido o resultado no sistema informtico, para que possa facilmente ser
consultado pelo clnico.
oportunistas, que causam infeces caso haja alteraes da flora residente, e os patognicos
obrigatrios, cuja presena origina sempre danos no hospedeiro (Forbes & Sahm, 2004).
Tabela 1. 1 Distribuio dos principais microrganismos da flora comensal (Forbes & Sahm, 2004)
(Murray, 2007) (Versalovic, 2011).
Regio
Pele
Olhos (conjuntiva)
Aparelho urinrio
(Uretra)
Aparelho reprodutor
(Vagina)
Flora comensal
- Staphylococcus coagulase negativa
- Propionibacterium spp.
- Corynebacterium spp.
- Streptococcus viridans
- Staphylococcus coagulase negativa
- Difterides spp.
- Streptococcus viridans
- Staphylococcus coagulase negativo
- Corynebacterium spp.
- Lactobacillus spp.
- Enterococcus spp.
- Anaerbios
- Enterobactereaceas spp.
- Staphylococcus epidermidis
- Difterides spp.
- Lactobacillus spp.
- Lactobacillus spp.
- Streptococcus spp.
- Bacterides spp.
- Difteroides spp.
Agentes potencialmente
patognicos
- S.epidermidis
- S.aureus
- S.pneumoniae
- S.aureus
- H.influenzae
- N.meningitidis
- S.pneumoniae
- S.aureus
- H.influenzae
- Salmonella spp.
- Campylobacter spp.
- E.coli
- Shigella spp.
- Yersinia spp.
- Entecococcus spp.
- Enterobactereaceas spp.
- Trichomonas vaginallis
- C.albicans
- C.glabrata
- N. gonorrhoeae
O conhecimento da flora comensal muito importante na anlise dos produtos biolgicos que
chegam ao laboratrio, para que no sejam obtidos falsos resultados positivos.
Urina (Urocultura)
O aparelho urinrio formado pelos rins, ureteres, bexiga e uretra, sendo que esta ltima estrutura
possui uma microflora residente. Acima da uretra, todas as reas do aparelho urinrio so estreis
num ser humano saudvel, o que faz com que a urina seja habitualmente estril (Forbes & Sahm,
2004) (Washington Jr. et al, 2006).
Contudo, as bactrias podem invadir a bexiga e causar infeco por duas vias principais: ascendente
e descendente. Embora a via ascendente seja mais frequente, ela favorecida por introduo de
corpos estranhos ao organismo (ex: cateter urinrio). Ao introduzir um cateter urinrio, as bactrias
podem ser introduzidas directamente na bexiga ou, mover-se atravs deste instrumento da uretra at
bexiga, aumentando desta forma o risco de infeco (Forbes & Sahm, 2004).
A disseminao por via descendente pode ser resultado de uma bacterimia. Qualquer infeco
sistmica pode provocar infeco urinria mas certos microrganismos, como S. aureus ou espcies
de Salmonella, so particularmente invasivos. A via descendente causadora de menos de 5% das
ITU (infeces do trato urinrio) (Forbes & Sahm, 2004).
As infeces urinrias so uma das infeces mais frequentemente encontradas (Forbes & Sahm,
2004).
Para o estudo das amostras de urina deve ser efectuada uma colheita adequada, tendo em conta a
idade e a situao clnica, de forma a minimizar os agentes contaminantes:
Puno supra-pbica: aspirao de urina directamente da bexiga. Este mtodo assegura uma
amostra livre de contaminao (com excepo de microrganismos presentes na pele).
Para a validao da amostra necessrio ter em conta alguns critrios, entre eles encontra-se a
contagem directa de unidades formadoras de colnias por mililitro (ufc/ml).
Para obteno do nmero de ufc/ml deve-se fazer contagem das colnias aps incubao da amostra
de urina semeada com ansa calibrada e correlacionar com os seguintes dados:
Nmero de ufc/ml 104-105 Avaliao deve ser feita segundo critrios clnicos.
1.3.2
Sangue (Hemocultura)
A invaso microbiana da corrente sangunea pode ter consequncias graves, como choque,
insuficincia de mltiplos orgos, coagulao intravascular disseminada e morte (Forbes & Sahm,
2004).
A presena de um cateter venoso central (CVC) aumenta o risco de colonizao por microrganismos
podendo levar a disseminao microbiana (Melo et al, 2007).
Perante a suspeita de infeco da corrente sangunea associada a ponta de cateter deve ser
realizado o seu exame microbiolgico, bem como de hemocultura com sangue colhido de veia
perifrica de outro acesso venoso. A amostra de sangue venoso colhida e inoculada directamente
no meio lquido para hemocultura em aerobiose.
As hemoculturas so analisadas num sistema automatizado, como o Bact/Alert, que faz a deteco
do crescimento de microrganismos (bactrias e fungos) em amostras de sangue (BioMrieux,
Bact/Alert MB, 2004).
Anatomicamente, o aparelho genital feminino constituido por uma sucesso de cavidades (trompas,
tero, endocolo, exocolo e vagina) que se comunicam com o exterior atravs de uma fenda vulvar
(vulva). Esta estrutura permite a entrada de microrganismos patognicos que podem prejudicar o
processo de reproduo (Linhares et al, 2010).
A microflora vaginal constitui um dos mais importantes mecanismos de defesa da funo reprodutora,
impedindo a proliferao de microrganismos potencialmente patognicos, nomeadamente devido ao
seu ambiente cido. Este ambiente mantido por alguns microrganismos presentes, com destaque
para Lactobacillus acidophilus (bacilo Gram positivo), que o principal constituinte desta flora
(Linhares et al, 2010).
A composio da flora vaginal no constante, sofrendo variaes consoante a idade e estado
fisiolgico. Na infncia e aps a menopausa, o pH vaginal neutro e a flora vaginal substituda por
outras espcies microbianas (Linhares et al, 2010) (Faria, 2010).
No caso de grvidas necessrio fazer a pesquisa de Streptococcus agalactiae para prevenir
contaminao materno-fetal (Faria, 2010) (Melo et al, 2007).
Para a deteco de infeces, so efectuadas colheitas de exsudados (ex: exsudado vaginal e do
endocolo). As colheitas so efectuadas com zaragatoa e enviadas para o laboratrio em meio de
transporte adequado.
1.3.4
Fezes (Coproculturas)
Para uma avaliao do possvel agente infeccioso, deve ser colhida uma amostra de fezes em
recipiente adequado.
1.3.5
O Sistema respiratrio pode dividir-se em superior e inferior. A parte superior envolve a epiglote e
tecidos circundantes, laringe, cavidade nasal e faringe (Forbes & Sahm, 2004). A parte inferior
compreende a traqueia, brnquios, bronquolos e pulmes.
O diagnstico de infeces frequentemente dificultado pela contaminao das amostras pela flora
comensal das vias respiratrias superiores durante a sua colheita (Fonseca et al., 2004). Deve-se ter
em conta, os microrganismos presentes nesta flora e observ-los como contaminantes das amostras,
e no como causadores de infeco.
Podem ser efectuadas colheitas das seguintes amostras:
Expectorao
Secreces brnquicas
O exame microbiolgico do exsudado nasal efectuado para despiste de MRSA (S.aureus resistente
meticilina). Cerca de 20 a 30% dos indivduos saudveis so portadores de S.aureus, podendo
existir MRSA. Neste sentido, importante fazer despiste de MRSA nos doentes hospitalizados, para
que seja possvel tomar medidas de preveno e controlo de infeco hospitalar (Versalovic, 2011).
1.3.6
A pele representa uma barreira consideravelmente eficaz contra as infeces bacterianas. Apesar de
viverem sobre a pele muitas bactrias, normalmente so incapazes de provocar uma infeco.
Existem mais microrganismos nas zonas mais hmidas da pele (ex: axilas e virilhas).
Quando existe a suspeita de uma infeco, devem ser colhidos exsudados para anlise
microbiolgica, sendo tambm efectuados exsudados cutneos para controlo de infeco Hospitalar
(Forbes & Sahm, 2004).
1.3.7
Exsudado Ocular:
Devido sua exposio constante para o meio externo, a conjuntiva est sujeita a contaminao
microbiana intensa. A maioria dos microrganismos so removidos por lacrimao (que contm
lisozima), ficando apenas uma microbiota relativamente escassa. Quando ocorre uma interrupo do
equilbrio entre a flora residente e transitria, podem surgir doenas (Trindade, 1999) (Baron, 1996).
Perante a suspeita de infeco procede-se recolha de exsudado ocular.
1.3.8
Lquidos Corporais
Qualquer tecido do organismo ou lquido corporal estril pode ser invadido e infectado por agentes
potencialmente patognicos (Forbes & Sahm, 2004).
Os lquidos devem ser colhidos seguindo as normas de colheita e devem ser enviados de imediato
para o laboratrio. Alm do j referido sangue, existem outros lquidos estreis como: lquido
peritoneal (cavidade abdominal), lquido pleural (trax), lquido articular (articulaes), LCR (lquido
cerebrospinal) e blis (lquido biliar).
Informao clnica adicional um dado importante, na pesquisa do agente etiolgico e deve ser
fornecida ao laboratrio, juntamente com a amostra a analisar (Fonseca et al., 2004).
Selectivos: contm um ou mais agentes que inibem todos os microrganismos excepto os que
se pretendem obter (Forbes & Sahm, 2004).
Apenas alguns meios de cultura so requeridos para uso dirio no diagnstico microbiolgico e cabe
aos responsveis do laboratrio a escolha dos meios a utilizar.
Tabela 1. 2 Meios de cultura utilizados neste estudo
Meio
MacConkey
Gelose Sangue
Chocolate
Objectivo principal
Meio de seleco e diferenciao para bacilos entricos Gram negativo
fermentadores e no fermentadores de lactose (nomeadamente
Enterobactereaceas spp. e Pseudomonas spp.) (Forbes & Sahm, 2004).
Meio no selectivo que permite o crescimento da maioria dos
microrganismos (Faria, 2010).
Meio no selectivo particularmente recomendado para o crescimento de
estirpes exigentes pertencentes ao gnero Neisseria e Haemophilus
(BioMriuex, 2009).
Columbiacolistina-cido
nalidxico
(CNA)
Yersinia CIN
Campylosel
Legionella
GVPC
Sabouraud
D-coccosel
(bile-esculina)
Hektoen
Chocolate com
Vancomicina,
colistina,
anfotericina e
trimetoprim
(V.C.A.T)
MRSA
Mueller-Hinton
MacConkey com
Sorbitol
Granada
Alm dos meios mencionados anteriormente, existem outros tipos, tais como meios de
enriquecimento. So exemplos disso o Caldo para microrganismos Gram negativo (GN), meio
selectivo para patognicos entricos, o Caldo Todd Hewitt, meio selectivo para Streptococos
(ex.:S.agalactiae), e a Hemoline que se destina pesquisa de microrganismos aerbios (BioMrieux,
Caldo Todd Hewitt + Antibiticos, 2003).
A temperatura de incubao que possibilita o crescimento mais rpido num curto perodo de tempo
(geralmente 18-24 horas) chamada de temperatura ptima. Relativamente s temperaturas podemse distiguir os seguintes grupos de microrganismos:
A maioria dos microrganismos isolados neste estudo crescem a 36C 1, sendo por isso classificados
como mesfilos.
A exigncia ou no de determinados gases, nomeadamente o Oxignio e o Dixido de Carbono,
permite classificar as bactrias em:
Aerbios obrigatrios: proliferam no ar ambiente que contem 21% de Oxignio (O2) e uma
pequena quantidade (0,03%) de Dixido de Carbono (CO2);
ainda possvel observar, atravs da colorao de Gram, as diferentes morfologias que as bactrias
podem apresentar. Deste modo, as bactrias podem apresentar forma esfrica (coco), forma de
bastonete (bacilo), forma oval (cocobacilo), forma de vrgula (vibrio), forma ondulada (espirlo), ou
1.6.2
Certos microrganismos possuem na sua parede cidos gordos de cadeia longa (cido miclico), que
conferem impermeabilidade ao violeta de cristal e a outros corantes bsicos. Calor ou detergentes
devem ser usados para permitir a entrada de corantes primrios nestas bactrias. Uma vez dentro
das clulas bacterianas, o corante no eliminado mesmo com solvente lcool-cido.
A colorao Ziehl Neelsen tem como princpio fundamental a colorao lcool-cido-resistente de
microrganismos e diferencia grupos especficos de bactrias como Mycobacterium spp. (Pereira &
Petrechen, 2011).
Oxidase
10
1.7.2
Catalase
Evitar a utilizao de meios que contm sangue, pois os eritrcitos podem produzir uma fraca
reaco de catalase.
1.7.3
Coagulase
Verifica a capacidade de um microrganismo reagir com o plasma e formar um cogulo, por aco da
enzima coagulase. Um teste de coagulase positivo um critrio de diagnstico presuntivo para
identificar S.aureus. Desta forma possvel distinguir Staphylococcus coagulase positiva de
Staphylococcus coagulase negativa. As clulas de uma colnia recente so adicionadas a plasma de
coelho. Se o organismo possuir coagulase, a enzima age sobre o fibrognio no plasma e causa
agregao da bactria (de la Maza, Pezzlo, & Baron, 1999) (Macfaddin, 2000) (Versalovic, 2011).
Para que no sejam obtidos resultados de falsos positivos ou falsos negativos deve-se utilizar um
nmero suficiente de colnias na realizao do teste (uma a duas colnias).
1.7.4
Urease
Detecta a presena da enzima urease. Esta enzima catalisa a hidrlise de ureia em dixido de
carbono e amnia:
(NH2)2CO + H2O CO2 + 2 NH3
11
1.7.5
Indol
bactrias, devido presena de triptofanase (Forbes & Sahm, 2004) (Macfaddin, 2000) (Versalovic,
2011).
Para que se obtenha um resultado vlido, deve-se considerar como positivo alteraes de cor
imediatas.
1.7.6
Teste de CAMP
facilmente observado em placa de gar de sangue, pois a -hemlise apresenta-se sob a forma de
flecha. Este fenmeno observado quer em isolados hemolticos, quer no hemolticos de
estreptococos do grupo B (Washington Jr. et al, 2006) (de la Maza, Pezzlo, & Baron, 1999).
Para que se obtenham resultados vlidos, no devem ser utilizadas colnias velhas de S.aureus (pois
podem no produzir -hemolisina), nem se deve tocar as estrias da sementeira (para que no haja
resultado de falso positivo).
1.7.7
Hidrlise de esculina
Termo geral usado para denominar o sistema completo de enzimas que medeiam a produo de Indol
12
1.7.8
Sistemas automatizados
Pode ainda ser utilizado um sistema automatizado2: Vitek 2 Compact, para a identificao do
microrganismo isolado.
Este sistema realiza em simultneo a identificao de bactrias e os resultados do respectivo teste de
susceptibilidade a antimicrobianos (TSA) num nico relatrio e encontra-se associado a um programa
de computador que auxlia na interpretao dos resultados dos testes de sensibilidade (Fonseca et
al., 2004) (BioMrieux, VITEK 2 Compact , 2005).
tabela 1. 3
Local de aco
Sntese da parede
celular
Membrana plasmtica
Sntese de cidos
nucleicos
Sntese proteica
Anti-metabolitos
Exemplos
Penicilina, Aztreonamo, Imepenemo, Ampicilina, Amoxacilina,
Piperacilina, Ticarcilina, Oxacilina, Meticilina, Cefpime, Cefuroxima,
Cefotaxima, Ceftazidima, Cefalotina, Cefoxitina, Meropenemo,
Vancomicina e Teicoplanina
Polimixina B e E (Colistina)
cido nalidixco
Ciprofloxacina e Ofloxacina
Linezolida, Amicacina, Tobramicina, Gentamicina, Cloranfenicol,
Tetraciclina, Eritromicina, Telitromicina, Lincosamina, Clindamicina,
Novobiocina, Estreptomicina, Estreptogramina A (quinupristina),
Estreptogramina B (dalfopristina) e Nitrofurantona.
Trimetoprim, Sulfonamidas e Cotrimoxazole (TrimetropimSulfametoxazol)
13
b)
c)
d)
b)
c)
Transduo, onde vrus que infectam bactrias (bacterifagos) transferem genes de virulncia
para as mesmas (Vieira, 2009) (Stansfield, 2005).
Clinical and Laboratory Standards Institute (CLSI, EUA) utilizada neste laboratrio
14
O TSA deve ser realizado para qualquer microrganismo que seja responsvel por um processo
infeccioso e que necessite de teraputica antimicrobiana, sempre que a susceptibilidade no puder
ser previsvel pelo conhecimento da identidade do microrganismo, ou esse microrganismo seja capaz
de exibir resistncia aos antimicrobianos mais frequentemente utilizados. Os antimicrobianos a utilizar
diferem consoante o tipo de microrganismo em estudo (ver listas em apndice 2) (CLSI, 2011)
(Fonseca et al., 2004).
Os mtodos correntes de testes de susceptibilidade a antimicrobianos (TSA), podem ser
classificados em trs grandes grupos:
I.
Foi o primeiro mtodo a ser desenvolvido, sendo considerado o de referncia. Este mtodo consiste
na realizao de diluies sucessivas de agente antimicrobiano em caldo, existindo ainda um tubo
livre de agente antimicrobiano, para controlo de crescimento. Cada tubo inoculado com uma
suspenso do microrganismo a ser testado e incubado a 36C 1, durante 18-24 horas. Aps a
incubao, os tubos so examinados visualmente pela turvao. A existncia desta turvao indica
que o crescimento bacteriano no foi inibido pela concentrao de agente antimicrobiano presente.
A mais baixa concentrao de antimicrobiano em g/ml que impede o crescimento bacteriano (tubo
onde ja no visivel turvao) representa a concentrao minima inibitria, CMI.
Contudo, este mtodo no utilizado devido ao facto de ser muito trabalhoso e dispendioso
(Fonseca et al., 2004).
II.
Difuso
Os testes de difuso utilizam uma suspenso bacteriana padronizada que semeada em meio slido
apropriado ao mtodo utilizado (ex.: gelose Meller-Hinton para o mtodo de Kirby-Baer). Os discos
impregnados em antimicrobianos so colocados na sementeira e aps incubao so medidos os
tamanhos dos halos de inibio de crescimento, obtendo-se um resultado qualitativo que pode ser
lido em Sensvel / Intermdio /Resistente (Fonseca et al., 2004).
15
Mtodo de KIRBY-BAER
O mtodo de difuso em disco utilizado na rotina dos laboratrios clnicos, descrito por Kirby e Baer
em 1966, um dos mtodos de sensibilidade mais simples e confiveis.
O gar de Meller-Hinton considerado o meio mais adequado para testes de rotina de sensibilidade
contra bactrias no fastidiosas pelas seguintes razes:
deste
meio
permite
crescimento
de
bactrias
no
exigentes
IV.
Um dos mtodos quantitativos mais utilizados, o Etest, baseia-se em tcnicas de diluo e difuso. O
sistema compreende um gradiente antimicrobiano pr-definido que usado para quantificar a CMI em
g/ml (BioMrieux, Products: Etest, 2012).
Quando uma tira de Etest inoculada numa placa de gar, h uma imediata difuso do antibitico
pelo meio. Aps incubao, alm de ser visvel um crescimento bacteriano, tambm visvel uma
inibio elptica volta da tira (BioMrieux, Products: Etest, 2012).
1.9 Microrganismos
O mundo dos microrganismos muito vasto, contudo, sero apenas focados aqueles que foram
isolados com mais frequncia nas amostras clnicas estudadas.
16
1.9.1
Dentro destas caractersticas podemos destacar a famlia das Enterobactereaceas e os bacilos Gram
negativo no fermentadores.
1.9.1.1 Famlia de Enterobactereaceas:
Enterobacter cloacae
Serratia marcescens
Serratia liquefaciens
Proteus mirabilis
Proteus vulgaris
Proteus penneri
Providencia retgeri
Providencia stuarti
Morganella morganni
Yersinia enterocolitica
Yersinia pseudotuberculosis
Escherichia coli
Klebsiella pneumoniae
Klebsiella oxytoca
Existem bactrias que, embora se apresentem como bacilos Gram negativo, tal como a famlia das
Enterobactereaceas, diferem desta por no utilizarem ou oxidarem a glucose (ao contrrio da
familia das Enterobactereaceas que a fermentam). So exemplos disso os gneros Acinetobacter
spp. e Stenotrophomonas spp.. Estes microrganismos no fazem parte da flora normal humana, mas
devido alta prevalncia de alguns deles em meio hospitalar, essencialmente Acinetobacter spp.,
podem colonizar a pele e o aparelho respiratrio de doentes hospitalizados (Fonseca et al., 2004).
17
Outros microrganismos que se diferenciam da famlia das Enterobactereaceas por serem Oxidase
positiva, como o caso de Pseudomonas spp., Burvodimonas spp., Rhizobium spp. e Ochrobactrum
spp..
Pseudomonas aeroginosa a espcie no pertencente famlia das Enterobactereaceas encontrada
com mais frequncia em amostras clnicas. Tambm a espcie Acinetobacter baumanii encontrada
algumas vezes, enquanto que as restantes raramente se encontram associadas a infeces no ser
humano (ver morfologia tpica de P.aeruginosa em apndice 4).
1.9.2
Os gneros pertencentes a esta famlia so: Staphylococcus spp., Gemella spp., Jeotgalicoccus spp.,
Macrococcus spp. e Salinicoccus spp.. Contudo, os agentes etiolgicos mais comuns de doenas
humanas so os pertencentes ao gnero Staphylococcus (Forbes & Sahm, 2004) (de la Maza,
Pezzlo, & Baron, 1999) (Washington Jr. et al, 2006).
Os estafilococos so, geralmente, comensais ou patognicos oportunistas. A maioria das espcies
aerbia ou anaerbia facultativa, catalase positiva e apresenta-se frequentemente como cocos
em forma de cacho, quando observados ao microscpio aps colorao de Gram. Contudo, tambm
podem ser observados isoladamente, aos pares, ou em pequenas cadeias (Forbes & Sahm, 2004)
(Washington Jr. et al, 2006) (Poeta & Rodrigues, 2008-2009) (de la Maza, Pezzlo, & Baron, 1999).
A espcie patognica mais encontrada em infeces humanas o S.aureus. A distribuio deste
microrganismo muito ampla podendo ser encontrado em diversos locais, como em alimentos,
superfcies secas e em vrias regies do corpo humano (intestino, pele, mucosas, nasofaringe e
fossas nasais). S.aureus produz uma coagulase, enzima cuja deteco permite distinguir em dois
grupos, estafilococos coagulase positiva (s.aureus) e estafilococos coagulase negativo. O
estafilococo coagulase negativo, mais frequentemente encontrado em amostras clnicas o
S.epidermidis, que na maior parte das vezes corresponde a um agente contaminante (Forbes &
Sahm, 2004) (Washington Jr. et al, 2006) (Poeta & Rodrigues, 2008-2009) (de la Maza, Pezzlo, &
Baron, 1999).
Devido sua virulncia, o Staphylococcus aureus pode comprometer o organismo humano em
infeces sistmicas, ocasionando septicmia, endocardite, choque txico e outras complicaes,
independente da faixa etria e do ambiente em que foi adquirida a infeco (Souza, 2011).
(ver morfologia tpica de Estafilococos em apndice 5)
18
Os
gneros
pertencentes
esta
famlia
so:
Enterococcus
spp.,
Melissococcus
spp.,
Dos microrganismos que se apresentam sob a forma de bacilos Gram positivo, aqueles que mais
frequentemente so isolados em amostras clnicas so os pertencentes aos gneros: Listeria e
Corynebacterium ( Mena & et al, 2004).
Contudo, durante este estgio apenas foi detectada a presena de Corynebacterium spp.
19
1.9.3
Outros microrganismos
Tambm foi possvel a observao de outros microrganismos presentes em amostras clnicas, que
no as urinas, como o caso de Haemophilus influenzae (coco-bacilo Gram negativo), muito
frequente em exsudados oculares.
Para deteco deste microrganismo alm do exame directo (colorao de Gram) e exame cultural
(gelose Sangue e Chocolate) utilizam-se testes de identificao:
o
sistemas automatizados
20
2. Parte Experimental:
2.1 Materiais, Equipamentos e Reagentes:
Equipamentos:
Previ-Color Gram: colorao automtica de Gram, da Biomrieux
Microscpio ptico Olympus BX41: Microscpio com ocular de 10x e quatro objectivas diferentes,
10x, 20x, 40x e 100x.
Bact/Alert 3D 120: sistema automatizado para Hemoculturas e Micobactrias (Biomriuex).
Vitek2 compact (BioMrieux): sistema automatizado para identificao de bactrias e
antibiograma
Camara de segurana biolgica (classe II): para proteco do operador e segurana no
processamento de amostras.
Estufa (ar ambiente ) e estufa de CO2
Materiais:
Meios de cultura da BioMrieux.
Ansas calibradas de 1l e 10l, de Sarstedt
Zaragatoas, de APTACA.
Lminas Normax: Lminas com bordos esmerilados com dimenses 76x26 mm e espessura
0,95x1,05 mm.
Lamelas Normax: dimenses 22x22 mm e espessura 0,13x0,17 mm.
BD BBL DRYSlide: Discos impregnados com reagente oxidase de dimetro 6mm, para a prova da
oxidase.
Kit slidex staph plus: teste de identificao presuntiva de S.aureus, para prova da coagulase, da
Bio-Rad.
Aplicador automtico de discos de antibiticos em placas de agar (90 e 150mm), para realizao
de antibiogramas pelo mtodo de Kirby-Bauer
Densimat: Medidor de densidade para antibiogramas realizados pelo mtodo de Kirby-Bauer:
(BioMrieux)
Materiais para Vitek2-Compact:
o
Cartas de identificao
Tubos polisterino
Nos procedimentos experimentais foi ainda utilizado material corrente de laboratrio, Micropipetas
e geradores de microaerofilia e anaerobiose da BioMrieux
21
Reagentes:
Reagente Kovacs, para o teste da Ureia/Indol (BioMrieux)
Perxido de Hidrognio (H2O2) para catalase
Soluo salina da BioMrieux, para Vitek2-Compact
Reagentes para colorao de Ziehl-Neelsen:
o
Aps homogeneizao, a amostra semeada com ansa calibrada de 1l, utilizando a tcnica
de sementeira em estrias4.
Meios de cultura: gelose Sangue e MacConkey (a gelose Sangue substituda por gelose
CNA nos algaliados)
Exame directo
o
Com a ajuda de uma pipeta de pasteur, colocar uma gota de urina previamente
homogeneizada e no centrifugada na lmina, sem a espalhar (tcnica de esfregao de
lquidos).
Proceder colorao
o
Centrifugao a 1800 rpm durante 5 minutos. Decantar e utilizar o sedimento para fazer
exame citolgico.
Depositar a amostra no meio de cultura atravs de uma estria ao meio da placa. Realizar estrias
perpendiculares primeira estria, rodar a placa 90 e fazer novamente estrias.
22
Sangue
Exame cultural
A amostra de sangue venoso colhida e inoculada directamente no meio lquido para hemocultura em
aerobiose introduzida no equipamento automtico (Bact/ALERT 3D), por leitura de cdigo de
barras. Se o aparelho detectar alguma positividade emitido um sinal e o frasco retirado. As
negativas mantm-se em incubao at ao 5 dia, findo os quais so assinaladas como negativo e
retiradas.
Exame cultural (Hemocultura positiva):
Inserir uma agulha para ventilar o frasco e colocar posteriormente uma seringa na agulha
para retirar aproximadamente 1ml.
Colocar uma gota em cada um dos seguintes meios: gelose CNA, gelose Chocolate e
MacConkey.
Exame directo:
observao pode
Podem ainda ser utilizados outros meios, alm destes, em casos especficos:
o
Depositar a amostra no meio de cultura atravs da realizao de vrias estrias num primeiro quadrante (sem
levantar a ansa do meio). Realizar estrias nos quadrantes seguintes, tocando sempre com a ansa nas estrias do
quadrante anterior.
6
Colocar uma gota de sangue na extremidade da lmina, em seguida posicionar uma segunda lmina junto
dessa gota com uma inclinao de sensvelmente 45, e fazer correr esta segunda lmina sobre a primeira.
23
Incubar durante, 18-24 horas a 36C1, a gelose Chocolate, VCAT e Granada em atmosfera
de aerobiose rica em CO2 ,e a gelose sabouraud em atmosfera de aerobiose.
Exame directo
Fezes
Por rotina, so efectuadas pesquisas de Salmonella spp., Shigella spp., Yersinia enterocolitica e
Campylobacter spp.
Exame macroscpico
Devem ser registados todos os aspectos macroscpicos importantes, tais como: fezes
moldadas ou diarreicas, mucosas, sanguinolentas.
Exame cultural
Semear em quadrantes, usando uma ansa descartvel, nos seguintes meios: Hektoen,
MacConkey com sorbitol, Yersinia e Campylosel.
Incubar a 36C 1 em aerobiose, durante 6 horas e fazer a subcultura para gelose Hektoen.
Fazer sementeira utilizando a tcnica em quadrantes, nos seguintes meios: gelose Chocolate,
CNA, e MacConkey.
Incubar os meios gelose Chocolate e CNA em atmosfera de aerobiose rica em CO2 e o meio
de MacConkey em aerobiose, durante 18-24 horas a uma temperatura de 36C 1.
o
Incubar os meios em atmosfera de aerobiose rica em CO2 durante 18-24 horas, a 36C 1.
o
Exsudado farngeo
Utilizar tambm a tcnica de sementeira em quadrantes, para fazer o cultivo deste produto
em CNA .
Semear em meio liquido (caldo de Todd Hewitt), subcultura aps incubao de 24 horas para
gelose CNA
24
Exame directo
o
Corar pela tcnica de Gram e Ziehl-Neelsen (quando solicitado pesquisa de bacilos lcoolcido resistente, por suspeita de Tuberculose.)
Exame directo
Exsudado Ocular
Exame cultural:
Incubar o meio gelose Chocolate em atmosfera de aerobiose rica em CO2 e gelose Sangue
em aerobiose, durante 24-48 horas a 36C 1.
Exame directo:
Lquidos corporais
Exame cultural:
Exame directo:
Depositar amostra sobre a lmina e pressionar com uma segunda lmina. Deslizar suavemente as lminas em
direces opostas.
25
Esfregao corado pelo mtodo de Ziehl-Neelsen: no caso de pesquisa de Bacilos lcoolcido resistentes. (tnica de esfregao de lquidos)
Colocar os esfregaos previamente fixados no aparelho e esperar que este complete o ciclo
de colorao.
Colorao de Ziehl-Neelsen
Cobrir a lmina com soluo de Fucsina e aquecer, passando uma chama no lado oposto da
lmina, at emisso de vapores;
2.2.2
Trabalho 2: Uroculturas
Exame a
fresco e
pscolorao
Sementeira
e incubao
Validao
e emisso
do
resultado
Execuo
do
Antibiograma
Validao
da amostra
Identificao
do agente
isolado
Leitura e
interpretao
do
Antibiograma
26
O exame a fresco, a colorao de Gram, a sementeira e incubao so realizados tal como descrito
na primeira parte do estudo.
Para validao da amostra temos em conta a avaliao a fresco, a colorao de Gram, a presena de
culturas puras e o nmero de ufc/ml.
Prova do Indol
Prova da Oxidase
Prova da Catalase
27
Prova da Coagulase
Hidrlise de Esculina
Utilizar uma ansa de plstico para colocar uma poro de colnias no meio;
semear em quadrantes
Teste de CAMP
Agitar no vortex;
28
Colocar a soluo pipetada em outro tubo que j continha 3ml de soluo tampo;
Mtodo de Kirby-Baer:
Colher colnias puras e isoladas, com o auxilio de uma ansa, e suspender em soluo
fisiolgica estril;
Para o TSA de Staphylococcus spp., o disco da oxacilina e cefoxitina, devem ser incubados a
temperaturas mais baixas, aproximadamente 30C.
Medio dos halos: efectuar a leitura por observao directa do halo de inibio (rea sem
crescimento) e, com o auxlio de uma rgua, fazer a medio do dimetro. Comparar com o
valores consenso de CLSI, para dar o resultado de Resistente/Intermdio ou Sensvel.
29
Antibiograma
30
Antibiograma
Validao e emisso do
resultado
Figura 2. 3 Fluxograma de cocos Gram positivo
Teste da Catalase
Negativo
Antibiograma
31
32
3. Resultados e Discusso
3.1 Trabalho 1: Estudo estatstico das vrias amostras biolgicas
Durante o estgio de seis meses realizado no laboratrio de microbiologia (outubro 2011- maro
2012), foram analisados 9092 produtos biolgicos. Um avaliao estatstica de todos os produtos,
permitiu conclur acerca do produto mais frequentemente analisado neste laboratrio.
total
3294
2288
TOTAL
9092
Exsudado
cutneo
5%
Lquidos Ex.ocular
1%
4%
Fezes
7%
Aparelho
reprodutor
7%
Urina
36%
1405
668
614
425
345
53
Vias
respiratrias
15%
Sangue
25%
Grfico 3. 1 Percentagens de produtos biolgicos
Produto
Urina
Sangue
Amostras das Vias
respiratrias
Amostras do
Aparelho reprodutor
Fezes
Exsudado cutneo
Lquidos corporais
Exsudado ocular
TOTAL
total
3409
2478
Ex.cutneo Lquidos
3%
3%
Fezes
7%
Aparelho
reprodutor
8%
Exsudado
ocular
1%
Urina
34%
1883
756
656
340
270
60
9852
Vias
Respiratrias
19%
Sangue
25%
33
Observando os dados anteriores (grfico 3.1 e tabela 3.1), verifica-se que o produto biolgico mais
analisado durante o perodo de estgio foi a urina com 36% (n=3294). Este resultado est de acordo
com a literatura, pois as infeces urinrias encontram-se entre as que mais levam os pacientes a
consultas mdicas. Estima-se que cerca de 10% dos seres humanos sofrem uma infeco urinria
em alguma altura da sua vida (Forbes & Sahm, 2004) (Camargo & et al, 2001) (Sahm, Forbes, &
Weissfeld, 2007).
De janeiro a junho de 2011 foram analisados 9852 produtos biolgicos, e foi verificado mais um dado
a favor de que as urinas so realmente o produto mais analisado.
Tambm o sangue foi uma amostra analisada com alguma frequncia (25%), sendo o segundo
exame mais frequente neste estudo. A invaso microbiana da corrente sangunea pode ter graves
consequncias, como choque, insuficincia de mltiplos orgos, coagulao intravascular e morte.
Isto d-nos a indicao de que a invaso da corrente sangunea uma das infeces mais graves, e
por conseguinte, a rpida deteco e identificao dos patognios transportados pelo sangue uma
das funes do laboratrio de microbiologia (Forbes & Sahm, 2004).
As amostras provenientes das vias respiratrias tambm foram analisadas com alguma regularidade
(15%), o que corrobora outros trabalhos descritos. Segundo os mesmos, estes produtos so
analisados com bastante frequncia, mas ainda assim, menos que as urinas e o sangue (Jorgetto &
et al, 2005).
As doenas diarreicas so, por todo o mundo, uma importante causa de morte, especialmente em
crianas com idade inferior a 5 anos (Forbes & Sahm, 2004).
As fezes constituem 7% das amostras analisadas, semelhana do que se verificou para as
amostras provenientes do aparelho reprodutor. Desta forma, este tipo de amostra surge como o
quinto produto mais analisado.
Outros Produtos biolgicos relacionados como exsudado cutneo, exsudado ocular e lquidos
corporais, so menos frequentes, apresentando por isso uma menor afluncia de anlise neste
laboratrio.
Finalmente, analisando o tabela 3.1 em simultneo com o tabela 3.2, observa-se que a ordem dos
produtos analisados se mantem inaltervel, independentemente da altura do ano em estudo.
34
Resultados
Negativos
908
Positivos
500
total
1408
Positivos
36%
Negativos
64%
Resultados
Feminino
Masculino
341
159
total
500
Masculino
32%
Feminino
68%
35
Percentagens
2,4
1,2
0,0
0,0
0,4
2,2
14,2
11,4
32
Quantidade de Uroculturas
positivas
Tabela 3. 5 Percentagens de
Masculino
71
57
12
1
11
Atravs da observao dos valores anteriores (Grfico 3.5 e Tabela 3.5), verifica-se que para
crianas com idade inferior a 1 ano, o resultado de uroculturas positivas no sexo masculino foi 2,4%
(n=12), e que h medida que a idade da criana aumentou (2-10anos), ocorreu uma diminuio para
1,2% (n=6). Entre os 11 e os 30 anos no se obtiveram uroculturas positivas, voltando estas a surgir
a partir dos 31 anos.
Tabela 3. 6 Percentagens de uroculturas
Feminino
etrio
Grupo etrio
1
2-10
11-20
21-30
31-40
41-60
61-80
81
Total
Percentagens
2,0
6,4
3,8
4,0
5,6
8,8
21,0
16,6
68
Quantidade de uroculturas
positivas
105
83
44
32
10
1
19
20
28
Nos valores apresentados no grfico 3.6 e tabela 3.6, observa-se que, para o sexo feminino, o
nmero de uroculturas positivas em idades inferiores a 1 ano , foi de 2,0% (n=10), menos 0,4% do
que o verificado para o sexo masculino. Este resultado pode estar relacionado com a presena de
mal formaes congnitas no sexo masculino, que so mais frequentes neste sexo (Kazmirczak & et
al., 2005).
Verificou-se tambm que foram encontrados resultados positivos em todas as faixas etrias, ao
contrrio do que aconteceu no sexo masculino, e que a incidncia tem tendncia a aumentar
significativamente com a idade. Todos os grupos etrios, com excepo do j referido grupo de
36
idades inferiores a 1 ano, apresentaram percentagens superiores s obtidas para o sexo masculino,
isto , as uroculturas positivas foram predominantes no sexo feminino.
Estudos prvios mostraram que a incidncia de bacteriria (presena de bactrias na urina) no sexo
feminino aumenta gradualmente com a idade (Sahm, Forbes, & Weissfeld, 2007). O que est de
acordo com os resultados obtidos neste estudo.
A predominncia de uroculturas positivas no sexo feminino est relacionada, tal como j referido, com
a estrutura anatmica do aparelho urinrio da mulher, agravando-se ainda com a juno de outros
factores, tais como:
o
A associao das ITU com relaes sexuais tambm est relacionada com o aumento da
incidncia, devido possvel introduo de bactrias na uretra feminina;
Observa-se ainda que em ambos os sexos, as uroculturas positivas foram mais frequentes para
indivduos com idade acima dos 60 anos (63,2% : ver clculo em apndice 13), tal como se verificou
em outros estudos (Muller & et al, 2008) (Kazmirczak & et al., 2005) (Menin & et al., 2010) (Sahm,
Forbes, & Weissfeld, 2007).
Estes resultados podem estar relacionados com a presena de clculos urinrios e doena prosttica,
que obstruem o fluxo urinrio causando esvaziamento vesical incompleto e consequentemente a
infeco urinria (Kazmirczak & et al., 2005) (Muller & et al, 2008).
Das 500 amostras de urina com resultado positivo, foi possvel isolar 22 tipos diferentes de
microrganismos, incluindo leveduras. Estes microrganismos, bem como o respectivo nmero de
isolamentos, so evidenciados no grfico 3.7.
Quantidades isoladas
281
64 55
39 39 37
25 18
Microrganismos isolados
37
Streptococcus agalactiae com 3,9% (n=18). (ver tabela de percentagens em apndice 14)
Deste modo, possvel constatar que os microrganismos maioritariamente isolados das amostras de
urina foram bacilos Gram negativo pertencentes famlia das Enterobactereaceas, com evidncia a
E.coli, semelhana do que est descrito por outros autores (Muller & et al, 2008) (Kazmirczak & et
al., 2005) (Jorgetto & et al, 2005) (Camargo & et al, 2001) (Orestein & et al., 1999) (Guidoni &
Toporovski, 2001) (Grossman & Caroni, 2009) (Sahm, Forbes, & Weissfeld, 2007).
A Escherichia coli um microrganismo pertencente flora normal do intestino humano que pode
contaminar e consequentemente causar infeces extra-intestinais.
Na literatura consta que o segundo microrganismo mais isolado em urinas Klebsiella spp., contudo,
neste estudo P.mirabilis foi mais frequente (Kazmirczak & et al., 2005) (Grossman & Caroni, 2009)
(Duarte & et al., 2008). A capacidade de P.mirabilis provocar infeces do trato urinrio facilitada
pela sua capacidade em degradar a ureia.
Klebsiella pneumoniae, Pseudomonas aeruginosa, Enterococcus faecalis, S.aureus e S.agalactiae
tambm surgiram com alguma frequncia, semelhana do que est descrito na literatura, onde
estes microrganismos so identificados como sendo dos mais comumente isolados de amostras de
urina (Kazmirczak & et al., 2005) (Jorgetto & et al, 2005) (Camargo & et al, 2001) (Sahm, Forbes, &
Weissfeld, 2007) (Caldern & et al., 2009).
Para alm destas espcies foram tambm isolados, embora em pequenas quantidades (inferior a 15
isolamentos), os seguintes microrganismos: Staphylococcus saprophyticus, Enterococcus faecium,
Staphylococcus epidermidis, Klebsiella oxytoca, Acinetobacter baumanii, Morganella morganii,
Citrobacter koseri, Corynebacterium sp, Providencia stuartii, Proteus vulgaris, Enterobacter
aerogenes, Serratia marcencens, Serratia liquefaciens e Enterobacter cloacae.
Foi tambm possvel a deteco de 37 leveduras, sendo na sua maioria C.albicans. Se compararmos
o total de bactrias obtido (n=567 : ver clculo deste valor em apndice 15), com o total obtido para
as leveduras (n=37), constatamos que o valor para estes segundos microrganismos muito inferior.
Assim sendo, conclu-se que leveduras surgem com menor frequencia em amostras de urina,
relativamente a bactrias (Grossman & Caroni, 2009).
38
Por este motivo, foi feita a distino entre doentes internados e doentes externos, para todos os
microrganismos acima mencionados. A distino deste tipo de doentes permitiu obter os resultados
representados no grfico 3.8.
externos
Microrganismos isolados
internos
163
43 25
15 18 35 12
13
118 21 30 24 21
13
7
0
0
6
3
3
1
3
2
1
2
1
1
2
2
1
0
2
0
2
2
0
0
2
0
2
0
1
Grfico 3. 8 Distribuio dos microrganismos isolados por doentes internados e doentes externos.
(legenda: valores acima do eixo horizontal correspondem a doentes externos (rosa claro); valores
abaixo do eixo horizontal correspondem a doentes internos/internados (rosa escuro)).
Observando este ltimo grfico, possvel verificar que os microrganismos isolados com maior
regularidade neste laboratrio, diferiram de doentes externos para doentes internos (internados).
As espcies bacterianas com maior frequncia de isolamento em doentes externos tiveram a seguinte
ordem:
o
Para os doentes internos, embora se mantenha constante o tipo de microrganismos isolados mais
frequentemente, a ordem foi ligeiramente diferente:
o
39
S.agalactiae com 1,9% (n=5). (ver tabela com percentagens em apndice 16)
E.coli foi a espcie mais isolada em ambos os tipos de doentes (internados e externos), sendo a
maioria dos casos adquiridos em doentes externos (na comunidade). Estes resultados encontram-se
de acordo a literatura (Maldaner & et al., 2011) (Sahm, Forbes, & Weissfeld, 2007).
Tambm P.mirabilis foi encontrado com maior regularidade em doentes externos, relativamente a
doentes internados. Este resultado pode estar relacionado com a constante associao desta espcie
a clculos urinrios e doena prosttica (Faria, 2010).
Quanto espcie E.faecalis, foi isolada um maior nmero de vezes a partir de amostras provenientes
de doentes internados. A sobrevivncia dos microrganismos pertencentes ao gnero Enterococcus
em ambiente hospitalar deve-se sua resistncia intrnseca a vrios antibiticos utilizados
comumente, e, talvez mais importante ainda, a sua capacidade de adquirir resistncia aos
antibiticos, seja por mutao ou recepo de material gentico atravs de plasmdeos (Horner & et
al, 2005).
Os resultados positivos para P.aeruginosa foram maioritariamente de doentes internados. A ampla
resistncia deste microrganismo aos antibiticos favorece a sua seleco em doentes internados
(Faria, 2010).
ainda de salientar que ao contrrio do que aconteceu com S.aureus e K.pneumoniae, S.agalactiae
foi isolado maioritariamente de doentes externos. Esta predominncia em doentes externos, pode
estar ligada com a sua pesquisa especfica em gestantes no terceiro trimestre de gravidez, no
havendo para tal a necessidade de internamento da utente. Este microrganismo tem grande
relevncia mdica deste na contaminao de neonatos, sendo importante o despiste da portadora,
para eventual profilaxia (Borger & et al., 2005).
Se observarmos a tabela que se segue, verificamos que o isolamento deste microrganismo ocorre
quase exclusivamente no sexo feminino, e que grande parte da sua incidncia ocorre na mulher em
idade frtil (n=9).
Tabela 3. 7 Isolamentos de S.agalactiae por sexo e grupo etrio
Grupo etrio
(anos)
1
2-10
11-20
21-30
31-40
41-60
61-80
81
Total
Masculino
Feminino
0
0
0
0
0
0
1
1
2
0
1
3
3
3
2
3
1
16
Total em
idade
frtil =9
Tambm as leveduras foram isoladas com alguma frequncia, o que corrobora a literatura (Sahm,
Forbes, & Weissfeld, 2007).
Para os restantes microrganismos, no foi retirada qualquer concluso, quer em doentes externos e
internos, devido sua baixa incidncia (n15).
40
Tambm a distino entre doentes algaliados e no algaliados importante para a avaliao dos
microrganismos isolados na urina, pois a presena de cateter temporrio ou permanente pode
influenciar na seleco dos microrganismos.
Dos 500 produtos com resultado positivo, foi possvel o isolamento de um total de 604
microrganismos. Esta diferena de valores entre produtos e microrganismos, est relacionada com a
deteco de 71 amostras polimicrobianas (14,2%), nomeadamente em indivduos algaliados.
Tabela 3. 8 Amostras polimicrobianas (2 e 3 tipos diferentes de microrganismos na mesma amostra)
em doentes algaliados e no algaliados.
Doentes no
algaliados
n
%
319
93
24
7
0
0
343
367
Doentes algaliados
tipos microrganismos
1
2
3
total amostras
total microrganismos
n
93
48
16
157
237
%
59
31
10
total amostras
412
72
16
500
604
no algaliados
algaliados
213
38 20
21 12
0
68 26 35 18 27 0
10 12
15
41
Lengenda do Grfico: valores acima do eixo horizontal correspondem a doentes no algaliados (rosa
claro); e valores abaixo do eixo horizontal correspondem a doentes algaliados (rosa escuro).
Pode-se constatar, atravs do grfico 3.9, que para os indivduos no algaliados houve um maior
isolamento com a seguinte ordem:
o
S.agalactiae com 2,8% (n=6). (ver tabela com percentagens em apndice 18)
Mais uma vez, semelhana do que aconteceu quando foi feita a distino entre doentes internos e
externos, a espcie E.coli foi o microrganismo isolado com maior afluncia quer em doentes
algaliados, quer no algaliados. No entanto, pde constatar-se que esta espcie foi mais frequente
em individuos no algaliados. Os microrganismos encontrados apresentaram percentagens de
isolamento que diferem significativamente das obtidas para doentes internados/externos. O que
corrobora a teoria de que estes dois determinantes esto relacionados com a seleco dos
microrganismos.
Tambm foi possvel verificar que houve maior nmero de isolamentos em indivduos algaliados,
relativamente a indivduos no algaliados, para os seguintes microrganismos: E.faecalis, S.aureus, e
P.aeruginosa.
Alguns destes resultados podem estar relacionados com a capacidade dos microrganismos em aderir
a superfcies plsticas de corpos estranhos, como cateteres (Forbes & Sahm, 2004)
(Washington
42
Grupo etrio
1
2-10
11-20
21-30
31-40
41-60
61-80
81
Total
Quantidade de
microrganismos isoslados
etrio
Percentagens
0
0
0
0
3,0
5,1
23,2
27,4
58,6
Feminino
55
65
12
1 2-10 11-2021-3031-4041-6061-80 81
Grupo etrio (anos)
Os valores apresentados anteriormente (grfico 3.10 e tabela 3.9), para o sexo feminino, demonstram
que a incidncia de uroculturas positivas em indivduos algaliados foi de 58,6% (n = 139 : ver clculo
deste valor em apndice 19).
S se obtiveram isolamentos acima dos 31 anos, e foi notvel um aumento da sua incidncia com a
idade.
Idades superiores a 60 anos foram as que apresentaram uma percentagem de uroculturas positivas
mais significativa, com 50,6% (n=120 : ver clculo destes valores em apndice 19), do total de
microrganismos isolados em ambos os sexos. Isto , mais de metade dos microrganismos isolados
resultaram de indivduos do sexo feminino, nomeadamente em idades superiores a 60 anos.
3.
10
Percentagens
Masculino
Quantidade de microrganismos
isolados
Tabela
51
35
Grupo etrio
1
2-10
11-20
21-30
31-40
41-60
61-80
Percentagens
0,4
0,0
0,0
0,0
0,0
4,6
21,5
81
14,8
Total
41,4
11
1
1
Para o sexo masculino (grfico 3.11 e tabela 3.10), observou-se que a incidncia de uroculturas
positivas foi de 41,4% (n=98 : ver clculo deste valor em apndice 20).
43
S foram isolados microrganismos em indivduos com idade superior a 40 anos, com excepo de um
nico isolamento numa criana com menos de 1 ano.
Tambm para este sexo se registou uma percentagem de uroculturas positivas mais significativa
acima dos 60 anos, com 36,3% (n=86 : ver clculo destes valores em apndice 20), do total de
microrganismos isolados em ambos os sexos.
Ao contrrio do que aconteceu para o sexo feminino, nota-se que para idades acima de 81 anos,
existiu um ligeiro decrscimo da incidncida de uroculturas positivas, isto , no ocorreu um aumento
sucessivo.
Este resultado pode estar relacionado com a esperana mdia de vida associada a
ambos os sexos:
o
Como a esperana mdia de vida para os homens se situa abaixo dos 80 anos, normal que a
percentagem de isolamentos de microrganismos em uroculturas diminua do grupo etrio dos 61-80
anos para o grupo etrio acima 81 anos .
Posto isto, podemos constatar que a frequncia de uroculturas positivas em indivduos algaliados foi
maior em :
o
em idades superiores a 61 anos, com 86,9% (n=206 :ver clculo destes valores em apndice
20).
A incidncia de uroculturas positivas em idades mais avanadas pode estar relacionada com o facto
destes indivduos estarem mais susceptveis a adquirir infeco hospitalar devido diminuio da
resposta imunolgica, o que causa vulnerabilidade a condies adversas, tal como estes
procedimentos invasivos.
Estes resultados corroboram os obtidos para o estudo feito inicialmente para o total de
microrganismos isolados, onde as uroculturas positivas tambm foram mais frequentes em indivduos
do sexo feminino, e em idades superiores a 60 anos.
44
4. Concluses:
Com o primeiro estudo (trabalho1) foi possvel conclur que a urina o produto biolgico mais
analisado neste laboratrio, independentemente do semestre. Sendo a infeco urinria uma das
mais frequentes.
Com o segundo estudo (trabalho 2), analisaram-se 1408 amostras de urina, tendo-se verificado que a
grande maioria eram negativas (64%). Notou-se um predomnio de uroculturas positivas no sexo
feminino (68%), verificando-se isolamentos de microrganismos em todos os grupos etrios,
contrariamente ao que se verificou para o sexo masculino, onde entre os 11 e os 30 anos no se
obtiveram uroculturas positivas.
Verificou-se tambm um predomnio destas uroculturas positivas em idades superiores a 60 anos
(63,2%) para ambos os sexos.
Destas uroculturas positivas foi possvel isolar 22 tipos de microrganismos. Os microrganismos com
percentagens de isolamento baixas (n<15), no foram includos no estudo.
E.coli foi o microrganismos mais isolado neste estudo, com 46,5%, seguido de outros bacilos Gram
negativo, nomeadamente Enterobactereaceas spp., e alguns cocos Gram positivo.
Os microrganismos mais frequentemente isolados variaram a sua ordem de acordo com a situao
clnica em estudo (doentes internados/externos e doentes algaliados/no algaliados).
Para os indivduos algaliados, foi ainda possvel constatar que apresentaram com maior frequncia
amostras polimicrobianas.
Com este estudo foi possvel tomar conhecimento da prevalncia dos patognicos locais, mediante
diversos determinantes. Este conhecimento de extrema importncia a nvel clnico, pois juntamente
com o conhecimento do perfil de susceptibilidade, vai permitir a elaborao de protocolos de
actuao teraputica importantes para um tratamento mais rpido e adequado.
45
46
5. Bibliografia
48
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50
6. Apndices:
Apndice 1
Microrganismo
Ampicilina
Amoxacilina + c.
Clavulnico
Ticarcilina
Piperacilina
Cefoxitina
Cefuraxima
Trimetoprim
+
sulfametoxazol
Nitrofurantona
Klebsiella spp.
--
--
--
--
--
--
E.coli
--
--
--
--
--
--
--
--
P.mirabilis
--
--
--
--
--
--
P.vulgaris
--
--
--
--
--
Pseudomonas spp.
--
--
--
--
--
--
--
Microrganismo
Polimixina B
Eritromicina
Clindamicina
Novobiocina
Ampicilina
S.saprophyticus
--
--
--
--
S.aureus
--
--
--
--
S.coagulase negativo
--
--
--
--
--
Streptococcus sp.
--
--
--
--
--
E.faecalis
--
--
--
E.faecium
--
--
--
51
Apndice 2
Tabela 6. 3 Antibiticos utilizados no mtodo de Kirby-Bauer
Gram negativos
Enterococcus sp.
Staphylococcus sp.
Estreptomicina altamente
concentrada
Ampicilina
Linezolide
Ciprofloxacina
Gentamicina altamente
concentrada
Cefoxitina
Colistina
Ciprofloxacina
Cloranfenicol
Penicilina
Amicacina
Tobramicina
Gentamicina
Oxacilina
Ceftazidima
Tobramicina
Vancomicina
Teicoplanina
Gentamicina
Nitrofurantona
Eritromicina
Amicacina
Meropenem
Cefotaxima
Amoxacilina+
c.clavulnico
Nitrofurantona
Piperacilina +
Tazobactam
Trimetoprim +
Sulfametoxazol :
Cotrimoxazole
Ceftazidima
Ciprofloxacina
Teicoplanina
Novobiocina
Tetraciclina
Vancomicina
Gentamicina
Trimetoprim +
Sulfametoxazol
Piperacilina +
Tazobactam
Aztreonamo
Ticarcilina
Piperacilina
Clindamicina
Cefpime
Nitrofurantona
Trimetoprim+
Sulfametoxazol
Meropenemo
Polimixina B
Ciprofloxacina
Cefuraxima
Cefoxitina
Cefalotina
Ampicilina
Ticarcilina
Imipenemo
Linezolida
Novobiocina
Apndice 3
52
Proteus spp. em gelose Sangue apresenta na grande maioria das vezes um vu resultante da sua
mobilidade. Em MacConkey estas colnias so tipicamente transparentes, isto , no fermentadoras
de lactose (Lac-)
deste trabalho).
trabalho).
Apndice 4
Morfologia tpica de P.aeruginosa
Em gelose Sangue as colnias normalmente apresentam um bordo irregular e uma pigmentao que
as distingue das outras Pseudomonas spp.: azul-esverdeado (pigmento piocianina) ou vermelho
acastanhado (pigmento piorubina). Frequentemente apresentam um brilho metlico e -hemoltica.
(de la Maza, Pezzlo, & Baron, 1999)
Em agar de MacConkey as colnias so tpicamente no fermentadoras de lactose (Lac-), podendo
apresentar pigmentao esverdeada, ou acastanhada. (de la Maza, Pezzlo, & Baron, 1999)
53
Apndice 5
Morfologia tpica de estafilococos.
As colnias, em gelose sangue, apresentam tpicamente cor branca ou acizentada, geralmente sem
hemlise. (de la Maza, Pezzlo, & Baron, 1999)
54
Apndice 7
Morfologia tpica de Estreptococcus spp.
S.agalactiae em gelose Sangue apresenta normalmente colnias grandes, mas com uma -hemlise
pequena. (de la Maza, Pezzlo, & Baron, 1999)
S.pneumoniae em gelose Sangue apresenta regularmente colnias translcidas, mucides ou no, e
circundadas por -hemlise. (de la Maza, Pezzlo, & Baron, 1999)
.
Apndice 8
Observao microscpica de Corynebacterium spp.
55
Apndice 9
Leveduras
Ao microscpio apresentam colorao azul (Gram positivo) e so fceis de identificar devido s suas
dimenses celulares.
Apndice 10
Morfologia tpica de Haemophilus influenzae
56
Apndice 11
Parasitologia
57
Apndice 12
Resultados normalmente obtidos com testes de identificao presuntiva
Oxidase
Urease
Negativo Negativa
Negativo Positiva
Negativo Positiva
Positivo
Indol
Positivo
negativo: K.pneumoniae
Negativo: P.mirabilis
Indol
Positivo: K.oxytoca
Positivo: P.vulgaris
58
catalase
Coagulase
S.aureus
Positiva
Positiva
Positiva
Negativa
Tabela 6. 7
catalase
Hidrlise de esculina
CAMP Test
Negativa
Negativa
Negativa
Negativa
Negativa
Positivo
catalase
Hidrlise de esculina
Positiva
Apndice 13
Clculo da percentagem de uroculturas acima dos 60 anos
Resultado: 14,2+11,4+21,0+16,6=63,2 %
59
Apndice 14
Tabela 6. 8 Resultados para os microrganismos obtidos nas uroculturas positivas
microrganismos
P.mirabilis
K.pneumoniae
K.oxytoca
A.baumanii
E.faecalis
E.faecium
S.epidermidis
S.saprophyticus
S.aureus
S.agalactiae
P.aeruginosa
P.stuartii
M.morganii
E.coli
P.vulgaris
E.aerogenes
Leveduras
C.koseri
S.marcescens
E.cloacae
S.liquefaciens
Corynebacterum sp.
total
Total Percentagens
64
10,6
39
6,5
4
0,7
3
0,5
55
9,1
6
1,0
6
1,0
7
1,2
25
4,1
18
3,0
39
6,5
2
0,3
3
0,5
281
46,5
2
0,3
2
0,3
37
6,1
3
0,5
2
0,3
1
0,2
2
0,3
3
0,5
604
100
Apndice 15
Clculo do total de bactrias:
60
Apndice 16
Tabela 6. 9 Uroculturas positivas para doentes internos e doentes externos
Microrganismos
P.mirabilis
K.pneumoniae
K.oxytoca
A.baumanii
E.faecalis
E.faecium
S.epidermidis
S.saprophyticus
S.aureus
S.agalactiae
P.aeruginosa
P.stuartii
M.morganii
E.coli
P.vulgaris
E.aerogenes
Leveduras
C.koseri
S.marcescens
E.cloacae
S.liquefaciens
Corynebacterium spp.
total
n (internos)
21
21
3
1
30
6
3
0
13
5
24
2
1
118
2
0
2
2
2
1
2
1
260
% (internos)
8,1
8,1
1,2
0,4
11,5
2,3
1,2
0,0
5,0
1,9
9,2
0,8
0,4
45,4
0,8
0,0
0,8
0,8
0,8
0,4
0,8
0,4
100
n (externos)
43
18
1
2
25
0
3
7
12
13
15
0
2
163
0
2
35
1
0
0
0
2
344
% (externos)
12,5
5,2
0,3
0,6
7,3
0,0
0,9
2,0
3,5
3,8
4,4
0,0
0,6
47,4
0,0
0,6
10,2
0,3
0,0
0,0
0,0
0,6
100
Apndice 17
Clculo de amostras polimicrobianas em doentes algaliados
61
Apndice 18
Tabela 6. 10 Uroculturas positivas para doentes algaliados e no algaliados
Microrganismos
(n)Algaliados (%)Algaliados
P.mirabilis
K.pneumoniae
K.oxytoca
A.baumanii
E.faecalis
E.faecium
S.epidermidis
S.saprophyticus
S.aureus
S.agalactiae
P.aeruginosa
P.stuartii
M.morganii
E.coli
P.vulgaris
E.aerogenes
Leveduras
C.koseri
S.marcescens
E.cloacae
S. liquefaciens
Corynebacterium sp.
total
26
18
2
1
35
4
4
0
15
6
27
2
1
68
0
0
0
1
1
0
2
0
213
12,2
8,5
0,9
0,5
16,4
1,9
1,9
0,0
7,0
2,8
12,7
0,9
0,5
31,9
0,0
0,0
0,0
0,5
0,5
0,0
0,9
0,0
100
(n) no
Algaliados
38
21
2
2
20
2
2
7
10
12
12
0
2
213
2
2
0
2
1
1
0
0
351
(%) no
algaliados
10,8
6,0
0,6
0,6
5,7
0,6
0,6
2,0
2,8
3,4
3,4
0,0
0,6
60,7
0,6
0,6
0,0
0,6
0,3
0,3
0,0
0,0
100
(n) Total
64
39
4
3
55
6
6
7
25
18
39
2
3
281
2
2
0
3
2
1
2
0
564
(%)
total
11,3
6,9
0,7
0,5
9,8
1,1
1,1
1,2
4,4
3,2
6,9
0,4
0,5
49,8
0,4
0,4
0,0
0,5
0,4
0,2
0,4
0,0
100
Apndice 19
Clculos para doentes algaliados do sexo feminino:
Resultado=7+12+55+65= 139
62
Apndice 20
Clculos para doentes algaliados do sexo feminino:
Resultado= 11+51+35+1=98
Nmero total para indivduos com idade superior a 60 anos:
Resultado= 51+35=86
Percentagem de indviduos com idades superiores a 60 anos:
63