TAXONOMA BACTERIANA

Dra. Silvana DAgosto

rea Bacteriologa - Curso de Microbiologa
Ao 2015

Taxonoma:
Taxos ( griego ), estructuracin u orden
- Nomos ( griego ), ley
Es la ciencia que estudia la clasificacin biolgica:
genotpica y fenotpica
-

---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------

Breve historia de la taxonoma:

Siglo XVIII, Carlos Linneo. Introduce el concepto de REINO
Asign a cada organismo a una categora grande: reino vegetal o reino animal.
Subdividi cada categora en categoras progresivamente ms pequeas.

Tres dominios segn diferencias de ARNr y lpidos de membrana

Taxn: grupo de organismos emparentados

DOMINIOS:

Bacteria: procariotas unicelulares con peptidoglicano.

Grupos o taxones-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------Archaea: procariotas unicelulares sin peptidoglicano.
Grupos o taxones---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------Eukarya: ( todos los eucariotas )---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------

Por qu es importante la taxonoma?

Permite organizar el conocimiento----------------------------------------------------------------------------------- Agrupar microorganismos por caractersticas compartidas y diferenciables------------------------------- Inferencias e hiptesis sobre nuevos organismos-----------------------------------------------------------------

Estudios evolutivos--------------------------------------------------------------------------------------------------------

Caracterizar aislamientos (ej. m.o patgenos)------------------------------------------------------------------- Microbiologa clnica: tratamiento----------------------------------------------------------------------------------- Comunicar en forma eficiente con nombres precisos-------------------------------------------------------------

Comprende tres partes independientes pero relacionadas:

A- Clasificacin: estructuracin de organismos en grupos o taxones en base a similitudes o parentesco

evolutivo---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------B- Nomenclatura: asignacin de nombres a los taxones-------------------------------------------------------------------------C- Identificacin: determina a que taxones pertenece un organismo que se aisl.
Permite encuadrar un M.O en un grupo taxonmico pre establecido.
----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------

A- Clasificacin
Fenotpica: a partir de propiedades observables fenotpicas compartidas. Ej. Gram negativas, enorme
grupo de cientos de m.o. que pueden no estar relacionados pero comparten esta caracterstica.
---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------Filogentica: Agrupa a los m.o. de acuerdo a su relacin gentica.
------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------

BACTERIA+ ARCHAEA= PROCARIOTAS

EUCARIOTAS

BACTERIA : incluyen bacterias patgenas

ARCHAEA : bacterias presentes en el ambiente, diferencia en lpidos y aspectos genticos
PROCARIOTAS: son unidades no compartimentadas, no presentan : membranas nucleares,
mitocondrias, SRE, aparato de Golgi, ni lisosomas, con respecto a los EUCARIOTES.
Ribosoma procariotas (70S) (eucariotas 80S)
La 30S tiene un ARN de 16S (importante para estudios filogenticos) y la 50S contiene ARN 23S y 5S.

Dentro de los PROCARIOTAS, estudiamos cuatro categoras.

1. Bacterias Gram negativas: pared celular compleja con peptidoglicano 10 % y cido murmico , membrana
externa de LPS como principal componente.
Morfolgicamente : encontramos bacterias redondeadas o cocceas, bacilos
rectos o curvos, helicoidales o filamentosos (Escherichia, Salmonella, Leptospira,).
Se reproducen por fisin binaria o biparticin y algunas por brotes o gemacin.
-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------

2. Bacterias Gram positivas: pared celular con peptidoglicano 90 %, cidos teicoicos y lipoteicoicos.
Morfologa y reproduccin similar al grupo anterior. ( Cocos : Staphylococcus y Streptococcus ).
Algunas presentan esporas ( Bacilos: Bacillus y Clostridium).
-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------

3. Bacterias que carecen de pared celular. En este grupo, encontramos bsicamente a los Mycoplasmas que
carecen de pared celular y no sintetizan peptidoglicanos. Sintetizan esteroles.
Son pleomrficas. Son inmviles. Colonias bacterianas semejan un huevo frito.

4. Archaea. Son m.o. terrestres y acuticos con determinadas caractersticas similares a los 3 grupos anteriores,
que no los tenemos en cuenta por no ser m.o. patgenos. Carecen de peptidoglicano.
-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------

Rangos taxonmicos que se utilizan para su clasificacin:

Taxones
Dominio
Phylum
Clase
Orden
Familia
Gnero
Especie

Sub-especie
importancia en estudios
clnicos y ecolgicos

Los MICROORGANISMOS se sitan en un pequeo grupo

homogneo que pertenece a grupos mas amplios siguiendo una

estructura jerrquica sin superposiciones.
Especie: Categora taxonmica bsica.
Gnero: Grupo bien definido de una o ms especies que
esta claramente separado de otros gneros.
------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------Cepa: Poblacin de organismos que descienden de un nico
organismo o de un aislamiento en cultivo puro.

Definicin de especie procariota:

1. Coleccin de cepas que comparten numerosas propiedades estables y que difieren significativamente
de otras grupos de cepas.

2. Especie (genomoespecie) es una coleccin de cepas que tienen una composicin de G + C similares y
una similitud de un 70% o superior en base a experimentos de hibridacin de ADN.
-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------

Categoras de clasificacin a nivel de subespecie (tipificacin):

( importancia en estudios clnicos )
Biovariedad: variantes de cepas procariotas caracterizadas por diferencias bioqumicas y fisiolgicas
--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Fagovariedad: tipificacin por fagos ------------------------------------------------------------------------------------------------ Patovariedad: patogenicidad ---------------------------------------------------------------------------------------------------------- Morfovariedad: diferencias morfolgicas------------------------------------------------------------------------------------------- Genomovariedad: grupos con ADN similares o diferentes--------------------------------------------------------------------- Serovariedades: diferencias antignicas --------------------------------------------------------------------------------------------

Sistemas de clasificacin
1- Taxonoma clsica:
Caractersticas fenotpicas
Caractersticas genticas
2 Taxonoma polifsica

1.

Caractersticas genticas:

Contenido CG 20 a 80 % ( poco fiable ):

> 10 % de diferencia en su genoma son
m.os diferentes

Hibridacin ADN - ADN

www.uct.ac.za / microbiology / manualim.html

Hibridacin ADN - ADN

Secuencia completa del genoma

Microorganismos estrechamente relacionados

Determinar el grado de hibridacin:
1- Hibridacin completa: A y B son idnticas
2- Hibridacin parcial: 70 % A y B estn relacionados ( misma especie )
3- No hibridacin: A y B no estn relacionados
-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------

2- Taxonoma polifsica
Combinacin de caractersticas fenotpicas, genticas y filogenticas.
Enfoque gentico o molecular de la taxonoma:

- Composicin de bases del ADN o del ARN r ------------------------------------------------------------------------------------

Hibridizacin y homologa de cidos nuclecos ------------------------------------------------------------------------------ Homologa entre protenas ------------------------------------------------------------------------------------------------------- Recombinacin gentica ----------------------------------------------------------------------------------------------------------- Secuenciacin -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------

Filogentica:
Secuenciacin de ARNr 16 S
rbol filogentico

1500 nucletidos
Secuencias conservadas
Secuencias variables

-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------

rbol filogentico

Definicin de especie bacteriana y anlisis de ARNr 16 S:

Porcentaje de

hibridacin de microorganismos A y B > o igual a 70 %

Secuenciacin ARNr 16 S > 97 % identidad

Diferencia > 3 % de nucletidos son especies diferentes
Se confirma con pruebas fenotpicas, morfolgicas, tintoriales, bioqumicas, etc..

------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------

Existen bacterias cultivables y no cultivables:

Las no cultivables no pueden definirse como especie.

El 99 % de las bacterias no son cultivables.
Secuenciacin de ARNr 16 S identifica microorganismo cercano.

Definiciones:
Gnero:
Similitud ARNr 16 S de 95 a 100 %
Hibridacin ADN ADN > 20 %

Familia:
Similitud de ARNr 16 S < 95 %

B- Nomenclatura
Botnico Sueco Carl von Linn o Linneo
Sistema binomial: gnero y especie.
Nombre latinizado
Gnero: Primera letra en mayscula. Ej: Escherichia
Especie: minscula. Ej: coli
Escrito en bastardilla o cursiva (subrayado si es manuscrito)
Ej: Escherichia coli o Escherichia coli
Abreviado: E. coli o E. coli ( primera letra mayscula ).
Castellanizacin: Estafilococo dorado

El epiteto de especie es estable , el gnero puede cambiar

Lactococcus
Gnero Streptococcus
Enterococcus
Ej: Streptococcus faecalis: Enterococcus faecalis

Domnio Bactria
Phylum- proteobacteria
Clase- gammaproteobacteria
Orden- Enterobacteriales
Famlia- Enterobacteriaceae
Gnero- Salmonella
Espcie- Salmonella enteritidis

Manual Bergeys: Manual de sistemtica bacteriolgica

Primeras ediciones : clasificacin fenotpica , en funcin de forma, tincin de
Gram, relacin con el oxigeno , motilidad etc.

2 Edicin con 5 volmenes ( ao 2012 ).

Clasificacin filogentica basada en secuenciacin de ARNr, ADN y protenas.
2 dominios, 30 phylum,, > 400 gneros.
Proteobacteria > 270 gneros
Gram positivas > 170 gneros

Bibliografa:
MICROBIOLOGIA. Prescott, Ed. Interamericana, 7 edicin, captulo 19:
Evolucin microbiana, taxonoma y diversidad (pgs.471- 472).
Filogenia ( pgs.. 474 475 ).
Clasificacin filogentica ( pgs. 478 479 ).
Rangos taxonmicos ( pgs. 480 481 ).
Caractersticas clsicas y moleculares ( pgs. 481 485 ).
BIOLOGA DE LOS MICROORGANISMOS. Brock, Ed. Addison Weisley, 12 edicin, captulo 14:
Caractersticas diferenciables de los dominios ( pg. 415 )
Caractersticas de ARNr 16 S ( pg. 418 ).
Filogenia microbiana ( pgs. 421 423 ).
Hibridacin ADN ADN ( pg. 428 429 ).
Manual Bergeys www.bergeys.org/pubinfo.html