Estructura y Propiedades de las Molculas Orgnicas

Los orgenes de la qumica orgnica

La definicin moderna de qumica orgnica es la qumica de los compuestos del
carbono. Qu tiene de especial el carbono que toda una rama de la qumica se dedica
a estudiar sus compuestos? A diferencia de la mayora de los otros elementos, el
carbono forma enlaces fuertes con otros tomos de carbono y con una amplia
variedad de elementos. Se pueden generar cadenas y anillos de tomos de carbono
para formar una variedad infinita de molculas, y es esta diversidad de compuestos
del carbono la que representa la base de la vida en la Tierra. Los seres vivos estn
formados principalmente de compuestos orgnicos complejos, los cuales se ocupan de
las funciones estructurales, qumicas o genticas.
El trmino orgnico significa literalmente derivado de los organismos vivos. En un
principio, la ciencia de la qumica orgnica se encargaba del estudio de los
compuestos extrados de organismos vivos y de sus productos naturales. Compuestos
como el azcar, urea, almidn, ceras y aceites vegetales se consideraban orgnicos,
y la gente aceptaba el Vitalismo, la creencia de que los productos naturales
necesitaban una fuerza vital para producirlos. La qumica orgnica estudiaba
entonces a los compuestos que tenan una fuerza vital, mientras que la qumica
inorgnica estudiaba los gases, las piedras, los minerales y los compuestos que
podan generarse a partir de ellos.
En el siglo XIX, ciertos experimentos mostraron que los compuestos orgnicos podan
sintetizarse a partir de compuestos inorgnicos. En 1828, el qumico alemn
Friedrich Whler transform al cianato de amonio, formado a partir de amoniaco y
cido cinico, en urea simplemente al calentarlo en ausencia de oxgeno.

La urea siempre haba provenido de organismos vivos y se presuma que contena la

fuerza vital, aunque el cianato de amonio es inorgnico y por lo tanto carece de la
fuerza vital. Varios qumicos argumentaron que algn rastro de la fuerza vital de
las manos de Whler seguramente haba contaminado la reaccin, pero la mayora
admiti la posibilidad de sintetizar compuestos orgnicos a partir de inorgnicos. Se
realizaron muchas otras sntesis, y al final se descart la teora de la fuerza vital.
Como a principios del siglo XIX se refut el Vitalismo, se podra pensar que en la
actualidad la teora ya no existe, pero estara equivocado! El Vitalismo persiste hoy
en da en las mentes de aquellos que creen que las vitaminas, compuestos
saborizantes, etctera, naturales (derivados de las plantas) son de cierta manera
diferentes y ms saludables que los compuestos idnticos artificiales
(sintetizados).

Los compuestos derivados de las plantas y los compuestos sintetizados son idnticos.
Si asumimos que son puros, la nica forma de distinguirlos es mediante datacin
utilizando 14C: los compuestos sintetizados a partir de petroqumicos tienen un
contenido menor de 14C radiactivo y parecen antiguos debido a que su 14C ha
disminuido con el tiempo. Los compuestos derivados de las plantas se han
sintetizado recientemente a partir del CO2 del aire, por lo que stos tienen mayor
contenido de 14C. Algunos proveedores importantes de productos qumicos ofrecen
anlisis de la relacin de istopos para mostrar que sus productos naturales tienen
mayor contenido de 14C y que se derivan de las plantas. Estos anlisis sofisticados
dan un aire de alta tecnologa a esta forma de Vitalismo del siglo XXI.
Aun cuando los compuestos orgnicos no necesitan una fuerza vital, de todas
maneras se diferencian de los compuestos inorgnicos. La caracterstica distintiva
de los compuestos orgnicos es que todos contienen uno o ms tomos de carbono.
Sin embargo, no todos los compuestos de carbono son sustancias orgnicas;
sustancias tales como el diamante, grafito, dixido de carbono, cianato de amonio y
carbonato de sodio se derivan de minerales y tienen propiedades inorgnicas tpicas.
No obstante, la mayora de los millones de compuestos del carbono se clasifican como
orgnicos.

Figura 1: Cuatro ejemplos de compuestos orgnicos en organismos vivos. El tabaco contiene

nicotina, un alcaloide adictivo. Los escaramujos contienen vitamina C, esencial para
prevenir el escorbuto. El colorante rojo carmn proviene de las cochinillas, las cuales se
muestran en el nopal. Las amapolas contienen morfina, un alcaloide analgsico y adictivo.

En gran medida los seres humanos estamos formados por molculas orgnicas y nos
nutrimos con los compuestos orgnicos de los alimentos. Las protenas de nuestra
piel, los lpidos de las membranas celulares, el glucgeno del hgado y el ADN que se
encuentra en el ncleo de nuestras clulas son todos compuestos orgnicos. Nuestro
cuerpo tambin es regulado y defendido por compuestos orgnicos complejos.

Los qumicos han aprendido a sintetizar o simular muchas de estas molculas

complejas. Los productos sintticos sirven como frmacos, medicamentos, plsticos,
pesticidas, pinturas y fibras. Muchos de los avances mdicos ms importantes son
en realidad avances en la qumica orgnica. Se desarrollan nuevos frmacos
sintticos para combatir enfermedades, y los nuevos polmeros son moldeados para
reemplazar rganos daados. La qumica orgnica ha cerrado el crculo. Comenz
como el estudio de los compuestos derivados de rganos, y ahora nos proporciona los
frmacos y materiales que necesitamos para salvar o sustituir dichos rganos.

Hibridacin y formas moleculares

Si predecimos los ngulos de enlace de molculas orgnicas utilizando slo los
orbitales sencillos s y p, esperamos ngulos de enlace de aproximadamente 90. Los
orbitales s no son direccionales, y los orbitales p estn orientados a 90 entre s. Sin
embargo, la evidencia experimental muestra que los ngulos de enlace en compuestos
orgnicos se acercan por lo general a los 109, 120 o 180 (figura 2). Una forma
comn de explicar estos ngulos de enlace es mediante la teora de repulsin de los
pares de electrones de la capa de valencia (teora RPECV): los pares de electrones se
repelen entre s, y los enlaces y los pares de electrones no enlazados alrededor de un
tomo central estn separados por los ngulos ms grandes posibles. Un ngulo de
109.5 es la mayor separacin posible para cuatro pares de electrones; 120 es la ms
grande para tres pares; y 180 es la mayor separacin para dos pares. Todas las
estructuras de la figura 2 tienen ngulos de enlace que separan lo ms posible a sus
enlaces.

Figura 2: ngulos de enlace comunes. Los ngulos de enlace de los compuestos orgnicos por
lo general se acercan a los 109, 120 o 180.

Las formas de estas molculas no pueden resultar del enlace entre orbitales atmicos
sencillos s y p. Aunque los orbitales s y p tienen las energas ms bajas para tomos
aislados en el espacio, no son los mejores en la formacin de enlaces. Para explicar las
formas de molculas orgnicas comunes asumimos que los orbitales s y p se
combinan para formar orbitales atmicos hbridos, los cuales separan los pares de
electrones de manera ms amplia en el espacio y colocan una mayor densidad
electrnica en la regin de enlace entre los ncleos.

Orbitales hbridos sp
Los orbitales pueden interactuar para formar nuevos orbitales. Hemos utilizado este
principio para formar orbitales moleculares, mediante la suma y resta de orbitales
atmicos de tomos diferentes. Tambin podemos sumar y restar orbitales del mismo
tomo. Considere el resultado que aparece en la figura 3, el cual surge cuando
combinamos un orbital p y uno s del mismo tomo.
El orbital resultante se conoce como orbital hbrido sp y su densidad electrnica se
concentra en un lado del tomo. Comenzamos con dos orbitales (s y p), por lo que
debemos terminar con dos orbitales hbridos sp. El segundo orbital hbrido sp se
genera si sumamos el orbital p con la fase opuesta (figura 3).

Figura 3: Formacin de un par de orbitales atmicos hbridos sp. La suma de un orbital s y

un orbital p da como resultado un orbital atmico hbrido sp, con la mayor parte de su
densidad electrnica de un lado del ncleo. Sumar el orbital p con la fase opuesta da como
resultado el otro orbital hbrido sp, con la mayor parte de su densidad electrnica en el lado
opuesto al del primer orbital hbrido.

El resultado de esta hibridacin es un par de orbitales direccionales hbridos sp que

apuntan en direcciones opuestas. Estos orbitales hbridos proporcionan una mayor
densidad electrnica en la regin de enlace de un enlace sigma a la izquierda del
tomo y de otro enlace sigma a la derecha; dan un ngulo de enlace de 180, y
separan a los electrones de enlace lo ms posible. En general, la hibridacin sp da
como resultado este arreglo de enlace lineal.
Orbitales hbridos sp2
Para orientar tres enlaces de tal manera que estn lo ms alejado posible, se requieren
ngulos de enlace de 120. Cuando un orbital s se combina con dos orbitales p, los
tres orbitales hbridos resultantes se orientan en ngulos de 120 entre s (figura 4).
Estos orbitales se conocen como orbitales hbridos sp2, ya que estn formados por un
orbital s y dos orbitales p. El arreglo de 120 se conoce como geometra trigonal al
contrario de la geometra lineal asociada con los orbitales hbridos sp. Ah permanece
un orbital p no hibridado (pz) perpendicular al plano de los tres orbitales hbridos sp2.

Figura 4: Geometra trigonal con orbitales hbridos sp2. La hibridacin de un orbital s con
dos orbitales p da un conjunto de tres orbitales hbridos sp2. Esta estructura trigonal tiene
ngulos de enlace de aproximadamente 120. El orbital p restante es perpendicular al plano de
los tres orbitales hbridos.

Orbitales hbridos sp3

Muchos compuestos orgnicos contienen tomos de carbono que estn enlazados a
otros cuatro tomos. Cuando cuatro enlaces estn orientados de tal manera que estn
lo ms alejado posible, forman un tetraedro regular (ngulos de enlace de 109.5),
como ilustra la figura 5. Este arreglo tetradrico puede explicarse mediante la
combinacin del orbital s con los tres orbitales p. Los cuatro orbitales resultantes se
conocen como orbitales hbridos sp3 ya que estn formados por un orbital s y tres
orbitales p.

Figura 5: Geometra tetradrica con orbitales hbridos sp3. La hibridacin de un orbital s con
los tres orbitales p da como resultado cuatro orbitales hbridos sp3 con una geometra
tetradrica que corresponde a ngulos de enlace de 109.5.

Metano (CH4) es el ejemplo ms sencillo de la hibridacin sp3 (figura 6). La

estructura de Lewis para el metano tiene ocho electrones de valencia (cuatro del
carbono y uno de cada hidrgeno) que corresponden a cuatro enlaces sencillos CH.

La geometra tetradrica separa a estos enlaces mediante el ngulo ms grande

posible, 109.5.

Figura 6: Diversas vistas del metano. El metano tiene una geometra tetradrica; utiliza
cuatro orbitales hbridos sp3 para formar enlaces sigma con los cuatro tomos de hidrgeno.

Cmo dibujar molculas tridimensionales

Las figuras 5 y 6 son ms difciles de dibujar que las figuras anteriores, ya que
representan objetos tridimensionales en una pieza de papel bidimensional. El orbital
pz debe lucir como si apuntara hacia dentro y hacia fuera de la hoja, y el tetraedro
debe parecer tridimensional. Estos dibujos utilizan la perspectiva y la imaginacin
de quien las observa para aadir la tercera dimensin.
Emplear la perspectiva es difcil cuando una molcula es grande y complicada. En
qumica orgnica se ha desarrollado una notacin abreviada para simplificar los
dibujos tridimensionales. Las lneas punteadas indican enlaces que van hacia atrs,
alejndose del lector. Las lneas en forma de cua representan enlaces que van hacia
fuera, en direccin del lector. Las lneas rectas son enlaces en el plano de la pgina.
Las lneas punteadas y las cuas muestran la perspectiva en el segundo dibujo del
metano correspondiente a la figura 6.

La estructura tridimensional del etano, C2H6, tiene la forma de dos tetraedros

unidos. Cada tomo de carbono tiene una hibridacin sp3 con cuatro enlaces sigma,

formados por los cuatro orbitales hbridos sp3. Las lneas punteadas representan
enlaces que se alejan del observador, las cuas representan enlaces que salen hacia el
observador, y otras lneas de enlace estn en el plano de la pgina. Todos los ngulos
de enlace se aproximan a 109.5.

Rotacin de enlaces
Algunos enlaces rotan fcilmente, pero otros no. Cuando vemos una estructura,
debemos reconocer cules enlaces rotan y cules no. Si un enlace rota con facilidad,
cada molcula puede rotar a travs de diferentes arreglos angulares de tomos. Sin
embargo, si un enlace no puede hacerlo, distintos arreglos angulares pueden implicar
compuestos diferentes (ismeros) con propiedades diferentes.
Rotacin de enlaces sencillos
En el caso del etano (CH3CH3) ambos tomos de carbono tienen una hibridacin sp3
y son tetradricos. El etano luce como dos molculas de metano a las que les han
arrancado un hidrgeno (para formar un grupo metilo) y que estn unidas por el
traslape de sus orbitales sp3 (figura 7).
Podemos dibujar muchas estructuras para el etano, las cuales difieren nicamente en
cmo ha girado un grupo metilo con respecto al otro. Tales estructuras, que slo
difieren en las rotaciones alrededor de un enlace sencillo, se conocen como
conformaciones. Dos del nmero infinito de conformaciones del etano aparecen en la
figura 7.

Figura 7: Rotacin de enlaces sencillos. El etano est formado por dos grupos metilo,
enlazados por el traslape de sus orbitales hbridos sp3. Estos grupos metilo pueden rotar uno
con respecto al otro.

Cul de estas estructuras del etano es la correcta? Slo hay dos grupos metilo
alineados de tal forma que sus enlaces CH sean paralelos (eclipsados), o alternados,
como en el dibujo de la derecha? La respuesta es que ambas estructuras, y todas las
estructuras intermedias posibles, son estructuras correctas del etano, y una molcula
real de etano rota a travs de todas estas conformaciones. Los dos tomos de carbono

se enlazan mediante el traslape de sus orbitales sp3 y forman un enlace sigma a lo

largo de la lnea entre los carbonos. La magnitud de este traslape sp3sp3 permanece
casi igual durante la rotacin, ya que el enlace sigma es cilndricamente simtrico
alrededor de la lnea que une a los ncleos de carbono. Sin importar cmo gire uno de
los grupos metilo, su orbital sp3 se traslapa con el orbital sp3 del otro tomo de
carbono.
Rigidez de los enlaces dobles
No todos los enlaces permiten una rotacin libre; por ejemplo, el etileno es muy rgido.
En este caso, el enlace doble entre los dos grupos CH2 consiste en un enlace sigma y
un enlace pi. Cuando giramos uno de los dos grupos CH2, el enlace sigma no se ve
afectado, pero el enlace pi pierde su traslape. Los dos orbitales p no pueden traslaparse
cuando los dos extremos de la molcula forman ngulos rectos, y el enlace pi en
efecto se rompe en esta geometra.

Podemos hacer la siguiente generalizacin: La rotacin alrededor de los enlaces

sencillos est permitida, pero los enlaces dobles son rgidos y no pueden girar.
Como los enlaces dobles son rgidos, podemos separar y aislar compuestos que slo
difieren en cmo estn acomodados sus sustituyentes en un enlace doble. Por
ejemplo, el enlace doble del but-2-eno (CH3CHCHCH3) evita que roten los dos
extremos de la molcula. Hay dos compuestos diferentes posibles, y tienen
propiedades fsicas distintas:

Isomera
Los ismeros son compuestos distintos con la misma frmula molecular. Existen
diversos tipos de isomera en los compuestos orgnicos. Por el momento debemos
reconocer las dos grandes clases de ismeros: ismeros constitucionales y
estereoismeros.

Isomera constitucional
Los ismeros constitucionales (o ismeros estructurales) son ismeros que difieren en
su secuencia de enlace; es decir, sus tomos estn conectados de manera distinta.
Utilicemos el butano como ejemplo. Si se le pidiera dibujar una frmula estructural
para el C4H10, cualquiera de las siguientes estructuras sera correcta:

Estos dos compuestos son ismeros porque tienen la misma frmula molecular. Son
ismeros constitucionales debido a que sus tomos estn conectados de forma
distinta. El primer compuesto (n-butano por butano normal) tiene sus tomos de
carbono en una cadena recta de cuatro carbonos de largo. El segundo compuesto
(isobutano por ismero del butano) tiene una estructura ramificada con una
cadena ms larga de tres tomos de carbono y una cadena lateral metilo.
Hay tres ismeros constitucionales del pentano (C5H12), cuyos nombres comunes son
n-pentano, isopentano y neopentano. El nmero de ismeros aumenta rpidamente
conforme aumenta el nmero de tomos de carbono.

Los ismeros constitucionales pueden diferir de maneras distintas a la ramificacin

de sus cadenas de carbono. Pueden diferir en la posicin de un enlace doble o de otro
grupo, o por tener un anillo o alguna otra caracterstica. Observe cmo los siguientes
ismeros constitucionales difieren en la forma en que los tomos estn enlazados
con otros tomos. (Verifique el nmero de hidrgenos enlazados a cada carbono). Sin
embargo, estos compuestos no son ismeros de los pentanos que acabamos de mostrar,
ya que stos tienen una frmula molecular distinta (C5H10).

Estereoismeros
Los estereoismeros son ismeros que slo difieren en cmo se orientan sus tomos en
el espacio. Sin embargo, sus tomos estn enlazados en el mismo orden. Por ejemplo,
el, cis- y el trans-but-2-eno tienen las mismas conexiones de enlace, por lo que no
son ismeros constitucionales. Son estereoismeros porque slo difieren en la

orientacin espacial de los grupos unidos al enlace doble. El ismero cis tiene los dos
grupos metilo del mismo lado del enlace doble, y el ismero trans los tiene en lados
opuestos. Por el contrario, el but-1-eno es un ismero constitucional del cis- y transbut-2-eno.

Los ismeros cis y trans slo son un tipo de isomera. El estudio de la estructura y
qumica de los estereoismeros se conoce como estereoqumica.
Los ismeros cis-trans tambin se conocen como ismeros geomtricos, ya que
difieren en la geometra de los grupos de un enlace doble. El ismero cis siempre es el
que tiene los grupos iguales del mismo lado del enlace doble, y el ismero trans tiene
los grupos iguales en lados opuestos del enlace doble.
Para tener isomera cis-trans, debe haber dos grupos distintos en cada extremo del
enlace doble. Por ejemplo, el 1-buteno tiene dos hidrgenos idnticos en un extremo del
enlace doble. Si invertimos sus posiciones, no obtenemos compuestos diferentes. De
igual manera, el 2-metil-2-buteno tiene dos grupos metilo idnticos en uno de los
extremos del enlace doble. Si invertimos los grupos metilo, no obtenemos compuestos
distintos. Estos compuestos no pueden presentar isomera cis-trans.