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Metabolismo

Parte I: La gluclisis o la ruta de Embden-Meyerhoff


George M. Bodner
Universidad de Purdue. West Lafayette, IN 47907
Metabolismo (de los metabolas griegas, cambiable) se ha descrito como la suma total de las reacciones
qumicas llevadas a cabo por los sistemas biolgicos. Incluye procesos por los cuales las clulas:
1) la captacin de energa de su entorno.
2) convertir los nutrientes en los bloques de construccin para la sntesis de macromolculas tales
como polisacridos, protenas y cidos nucleicos,
3) Sintetizar las macromolculas necesarias para el crecimiento celular y la replicacin, y
4) degradar macromolculas para obtener energa o para salvar sus bloques de construccin para la
construccin futura.
Es til dividir el metabolismo en secuencias catablicos y anablicos de reacciones o vas. (desde el
katabole griega, throwine hacia abajo). El catabolismo se refiere a los procesos que se descomponen o
se degradan en compuestos, molculas ms simples ms pequeos, como el in lactato. El etanol, CO2,
NH3, etc.
Vas catablicas son invariablemente acompaados de una liberacin neta de energa libre, y uno de los
objetivos del metabolismo es capturar al menos parte de esta energa en forma de compuestos de "alta
energa" tales como trifosfato de adenosina (ATP).
(del griego anabole, levantndose). anabolismo describe secuencias de reacciones en las que las
molculas cada vez ms complejas se sintetizan a expensas de ATP.
El "intermediario" adjetivo se utiliza a menudo para describir el metabolismo debido a que ambos
procesos catablicos y anablicos se producen en una serie de pasos pequeos, discretos que pasan a
travs de una serie de productos intermedios en su camino hacia el producto final o productos.
Hay muchas razones por las cuales el metabolismo implica largas secuencias de reacciones que
modifican progresivamente la estructura de un compuesto. Es mucho ms fcil para una enzima para
catalizar pequeos cambios en la estructura de un sustrato tal como glucosa de lo que es para hacer la
enzima de obligar a la glucosa y simultneamente oxidar los seis tomos de carbono.
Rompiendo el metabolismo en una serie de pequeos pasos tambin hace que sea ms fcil para
capturar parte de la energa que se desprende en reacciones catablicas. Se permite a la clula para
sintetizar los muchos productos intermedios que sirven como precursores para la biosntesis de los
polisacridos, protenas y cidos nucleicos necesarios para el crecimiento celular. Proporciona una
forma de convertir las grasas y las protenas en hidratos de carbono, o viceversa, ya que las condiciones
lo requieren. Por ltimo, se proporciona una serie de lugares en los que una reaccin puede ser ya sea
estimulado o inhibido y por lo tanto permite a la clula para ejercer el control finamente sintonizado
sobre la velocidad de las reacciones metablicas.
Anaerobio frente a procesos aerbicos
Si tenemos en cuenta el nmero de reacciones cada clula lleva a cabo, el nmero de diferentes clulas
dentro incluso las plantas y los animales ms simples, y las enormes diferencias entre las especies de
plantas y animales, la cantidad de informacin necesaria para describir el metabolismo parece
prcticamente ilimitadas. Afortunadamente, el metabolismo se simplifica por dos factores.
En primer lugar, exposiciones metabolismo slo pequeas variaciones dentro de las clulas de una
especie, o incluso entre las clulas mirada de diferentes especies. En segundo lugar, los procesos
metablicos estn acoplados a travs de una columna vertebral de reacciones esenciales que puede l

organizados en vas tales como "gluclisis", y una comprensin de un nmero limitado de estas vas
pueden producir una gran cantidad de informacin acerca de todo el proceso de metabolismo.
A menudo es til distinguir entre anaerbico, aerbico y organismos facultativos cuando se habla de
metabolismo.
Anaerbico (literalmente: sin aire) organismos florecer en ausencia de oxgeno. Ellos no pueden
utilizar O2 en su metabolismo y son a menudo envenenado por su presencia. Los organismos
aerbicos, por otro lado, necesitan O2 para sobrevivir. Los organismos que tienen la capacidad de vivir
bajo condiciones aerbicas o anaerbicas se llaman facultativa.
Este documento se centra en una secuencia de reacciones conocidas como gliclisis o la va de
Embden-Meyerhoff. La gluclisis es la principal fuente de energa para los organismos anaerbicos y el
primer paso en la degradacin de la glucosa en los organismos aerobios.
Esta va se rompe la glucosa a piruvato o bien, lactato o etanol y captura parte de la energa liberada
para sintetizar ATP a partir de ADP y fosfato.
Energetlcs bioqumicos
Trifosfato de adenosina (ATP) es la principal fuente de energa qumica para una interminable variedad
de procesos biolgicos. Se alimenta procesos tan diversos como la bioluminiscencia; el transporte de
iones y molculas a travs de las membranas celulares; la contraccin de los msculos; la sntesis de
hidratos de carbono, grasas, protenas y cidos nucleicos; y ambos N2 y fijacin de CO2.
Aunque llamamos ATP una "trifosfato", en realidad es un anhdrido de cido como el anhdrido actico.

ATP es un anhdrido mixto hecho por condensacin de monofosfato de adenosina (AMP) con un ion
fosfato (HP04 2- o
H2PO4-, dependiendo del pH) para formar el difosfato de adenosina (ADP). Si dejamos que el smbolo
"Ad" reposar por adenosina, esta reaccin "fosforilacin" puede l por escrito de la siguiente manera,
La fosforilacin de la difosfato luego da la trifosfato (ATP), cuya estructura completa se muestra en la
Figura 1.

La clave para entender el papel de la ATP en el metabolismo est apreciando lo que se quiere decir
cuando el ATP se refiere como una "alta energa '' fosfato. steres de fosfato, como la glucosa 6-fosfato

y anhdridos como el ATP son inestables frente a la hidrlisis. Antes de que podamos comparar sus
energas libres de la hidrlisis, sin embargo, es importante reconocer que una estricta adherencia a la
definicin de estado estndar causa problemas cuando se trata de sistemas biolgicos. El estado
estndar para las reacciones que implican el ion H + tendra una concentracin de iones H + de
exactamente 1.000 M. Esto es claramente poco realista para las reacciones biolgicas que son mucho
ms probable que ocurra cerca de pH 7. El "estado normal" para las reacciones bioqumicas, por tanto,
se define como pH 7, y esta convencin se indica mediante el smbolo DELTA G 'en vez de DELTA
G . La diferencia entre DELTA G y DELTA G 'para una reaccin que libera o consume un solo ion
H + es 40,0 kJ / mol. La energa libre estndar de hidrlisis de un ster de fosfato tpica tal como la
glucosa 6-fosfato o fructosa 6-fosfato es ms o menos 15 kJ / mol. La energa libre de hidrlisis de ATP
a ADP (o ADP a AMP) es el doble de grande.

Por lo tanto, ATP y ADP se refieren a menudo como "fosfatos de alta energa", porque la energa
almacenada en uno de estos fosfatos de alta energa "" es lo suficientemente grande para conducir la
fosforilacin de un azcar tal como glucosa o fructosa.

Hay varias razones por las que la energa libre estndar de hidrlisis de ATP o ADP es inusualmente
grande. A un pH fisiolgico tpica, la columna vertebral polifosfato lleva un nmero de tomos de
oxgeno cargados negativamente, que repelen fuertemente entre s. La hidrlisis de ATP a ADP y de
iones fosfato, o ADP a AMP y fosfato, alivia algo de esa repulsin. La hidrlisis tambin aumenta la
carga inica total, y por lo tanto la contribucin de la solvatacin a la energa libre de los productos.

La energa libre asociada a la reaccin entre el ion H + desprendido durante la hidrlisis y el medio de
almacenamiento en bfer que rodea tambin impulsa estas reacciones a la terminacin. Por ltimo, ms
estructuras de resonancia pueden ser escritas para los productos de estas reacciones que para los
reactivos, y por lo tanto la hidrlisis aumenta la estabilizacin por resonancia.
La nica manera para organismos anaerobios para sintetizar ATP es hacer fosfatos "sper alta energa",
que son an menos estable a la hidrlisis que ATP o ADP. La mayora de los pasos de la gluclisis son,
por tanto, diseados para construir sper intermedios fosfato de alta energa como fosfoenolpiruvato y
1,3-diophosphoglycerate que contiene suficiente energa para convertir ADP en ATP.

Enzyme Nomenclature

Antes de discutir los pasos individuales en la gliclisis podra ser til examinar la nomenclatura de las
enzimas.
La mayora de las enzimas se nombran listando el sustrato y luego el tipo de reaccin que
catalizan. Una enzima que oxida alcoholes a aldehdos mediante la eliminacin de hidrgeno, por
ejemplo, se llama una alcohol deshidrogenasa.
Una clase importante de enzimas para las discusiones del metabolismo intermediario son las enzimas
quinasa, que catalizan la transferencia de un fosfato del ATP a un alcohol para formar un ster de
fosfato o fosfomonoster.

La fosforilacin de uno de los grupos -OH sobre la glucosa para formar glucosa 6-fosfato, por ejemplo,
es catalizada por enzimas conocidas como hexoquinasa y glucoquinasa. Enzimas mutasa, por otro lado,
catalizan la transferencia interna de un fosfato dentro de un sustrato, tal como phosphoglyceromutase
que convierte 3-fosfoglicerato a 2-phosphoglycerare.
Una isomerasa cataliza la conversin de un ismero a otro. Enzimas isomerasa puede catalizar
reacciones que implican oxidacin-reduccin, tales como la conversin de un aldehdo (glucosa 6fosfato) en una cetona (fructosa 6-fosfato), pero no hay cambio neto en el estado de oxidacin del
sustrato. Enzimas deshidrogenasas catalizan reacciones en las que existe un cambio neto en el estado de
oxidacin del sustrato. Aunque las reacciones catalizadas por una deshidrogenasa son generalmente
reversibles, que siempre se nombran en la direccin de la oxidacin. Reduccin de acetaldehdo a
etanol, por ejemplo, est catalizada por la enzima alcohol deshidrogenasa.
La gluclisis
La gluclisis (literalmente: glucosa disolucin) es una secuencia de 10 o 11 reacciones catalizadas por
enzimas que se muestran en las figuras 2 y 3 que degradan una molcula de glucosa en dos molculas
de ya sea piruvato, lactato o etanol, con la sntesis neta de dos molculas de ATP .
Paso 1: fosforilacin de la glucosa
El primer paso es una fosforilacin catalizada por la enzima de la glucosa en C6 para formar un ster
fosfato.

Aunque este paso consume una molcula de ATP, que tiene la ventaja de etiquetado de la molcula de
glucosa con un grupo fosfato altamente cargado que ayuda a las enzimas posteriores reconocen y se
unen los sustratos apropiados.
Paso 2: lsomerization de glucosa 6-fosfato
Glucosa 6-fosfato se convierte a continuacin a partir de un aldehdo (aldosa) en una cetona (cetosa).

La constante de equilibrio para esta reaccin favorece ligeramente el material de


partida (Kc = 0,4), pero la reaccin procede fcilmente hacia la derecha debido a las cantidades
relativamente grandes de glucosa 6-fosfato que se acumulan en la clula.
Paso 3: La fosforilacin de fructosa 6-fosfato
Una segunda molcula de ATP ahora se consume para fosforilar la fructosa y fosfato a CI para formar
fructosa 1,6-difosfato.

Una vez ms, la energa libre almacenada en una molcula de ATP se utiliza para conducir lo que de
otra que una reaccin desfavorable.
GLUCOLISIS PRIMERA ETAPA
Figura 2. Secuencia de Reaccin fa la primera etapa de la gluclisis.
Paso 4: La escisin de fructosa 1,6-difosfato
En presencia de una base, aldehdos o cetonas con un alfa-hidrgeno pueden someterse a una reaccin
reversible conocido como una condensacin aldlica.
La fructosa 1,6-difosfato las puede considerar como el producto de una condensacin aldlica de la
dihidroxiacetona fosfato y gliceraldehdo 3-fosfato.
GLUCOLISIS SEGUNDA ETAPA
Figura 3. secuencia de reaccin para la segunda etapa de glycalysis.
La enzima que escinde la fructosa 1,6-difosfato para formar una mezcla de fosfato de dihidroxiacetona
y gliceraldehdo
Por lo tanto, 3-fosfato se conoce comnmente como "aldolasa".
El equilibrio para esta reaccin favorece fuertemente el material de partida (Kc = 6,25 X 10 -5). La
reaccin se sac constantemente a la derecha, sin embargo, como los productos de esta reaccin son
consumidos en los pasos subsiguientes.
Paso 5: La interconversin de triosa fosfatos

Dihidroxiacetona fosfato y gliceraldehdo 3-fosfato son ambos triosa (azcar CQ) fosfatos. Aunque
DHAP no puede entrar en la segunda mitad de la va glucoltica, puede que convertido en una segunda
molcula de gliceraldehdo 3-fosfato por una enzima isomerasa.
El efecto neto de los cinco primeros pasos de la gluclisis es dividir una molcula de glucosa en dos
molculas de gliceraldehdo 3-fosfato con ningn cambio neto en la frmula emprica, (CH20) n, y por
lo tanto ninguna oxidacin o reduccin neta.
Paso 6: La oxidacin del gliceraldehdo 3-fosfato
Aunque el objetivo principal de la gluclisis es la produccin de ATP, los primeros cinco pasos
consumen dos molculas de ATP.
El sexto paso prepara el escenario para una reaccin que produce dos molculas de ATP, y por lo tanto
nos lleva al punto de equilibrio. En este paso, gliceraldehdo se oxida y luego fosforilado para dar un
fosfato de acilo, ya sea conocido como 1,3-difosfoglicerato o 3-phosphoglyceroyl fosfato.
Las enzimas no se oxidan o reducen un sustrato directamente, slo catalizan reacciones de oxidacin o
reduccin. El agente oxidante en esta reaccin es una coenzima conocido como nicotinamida adenina
dinucletido (NAD +) que se une a la enzima triosa fosfato deshidrogenasa y recoge un hidruro (ion :-)
H para formar la coenzima reducida NADH. El segundo tomo de hidrgeno eliminado del sustrato en
esta oxidacin se libera en la solucin como un ion H +.
Paso 7: Sntesis de ATP
1,3-difosfoglicerato es un fosfato "super alta energa" que transfiere un fosfato al ADP para formar
ATP.
No debera sorprender que el 1,3-difosfoglicerato tiene una inusual gran energa libre de hidrlisis. La
repulsin entre los electrones en el grupo de fosfato de acilo en C1 es muy similar a la repulsin entre
electrones en el hackbone polifosfato de ATP que mejora la energa libre de la hidrlisis de ese
compuesto. Adems, el in 1,3-difosfoglicerato contiene dos grupos fosfato altamente cargados en las
proximidades.
El efecto neto de los pasos 6 y 7 es capturar en forma de ATP parte de la energa liberada cuando se
oxida un aldehdo.
Debido a que dos iones de 1,3-difosfoglicerato se forman por cada molcula de glucosa consumida,
este paso genera dos molculas de ATP que compensan el ATP consumido en los pasos 1 y 3.
Paso 8: lsomerization de 3-fosfoglicerato
Mediante la transferencia de un grupo fosfato de C3 a C2, este paso prepara el escenario para la sntesis
de otra sper fosfato de alta energa.
Paso 9: La deshidratacin de 2-fosfoglicerato
La deshidratacin de los rendimientos de 2-fosfoglicerato fosfoenolpiruvato (PEP).

Esta es una de las ms bellas reacciones metablicas. La energa libre total de reaccin es despreciable,
y sin embargo, la reaccin convierte un fosfato de baja energa ('hyd delta G = -18 kJ / mol en un
sper fosfato de alta energa (hace)' hyd = -61,9 kJ / mol ) capaz de transformar ADP en ATP.
Paso 10: Sntesis de ATP
Equilibrios Keto-enol se encuentran en gran medida en el lado de la cetona.
Reordenamiento de fosfoenolpiruvato al ismero ceto, por tanto, proporciona suficiente fuerza
impulsora para transferir el grupo fosfato a partir de PEP al ADP para formar ATP y el ion piruvato.
Debido a que dos iones fosfoenolpiruvato se producen por cada molcula de glucosa que entra en la va
glicoltica, el efecto neto de esta etapa es la sntesis de dos molculas de ATP.
Una molcula de ATP se consume en cada uno de los pasos 1 y 3 de la gliclisis, y dos molculas se
producen en cada uno de los pasos 7 y 10. Por consiguiente, el balance global de energa para la
gluclisis es 2 ATP por glucosa.
Paso 11: Reduccin de la piruvato
Se necesita un paso ms para completar la va glucoltica.
La oxidacin del gliceraldehdo 3-fosfato en el paso 6 fue acompaado por la reduccin de NAD + a
NADH. NAD +, como otros cofactores enzimticos, est presente en solamente bajas concentraciones
en la clula. Por lo tanto, la gluclisis debe contener una etapa en la que NADH se oxida a NAD +
truco.
Los organismos aerbicos pueden reciclar NADH a NAD +, reduciendo el oxgeno al
agua. Organismos anaerobios lograr el mismo objetivo mediante la reduccin del ion de piruvato a
lactato ya sea el ion o etanol. Reduccin de piruvato a lactato se produce en los organismos anaerobios
tales como las bacterias responsables de lactato para convertir la leche agria. Tambin puede ocurrir en
los tejidos aerbicos tales como los msculos esquelticos, cuando la demanda de oxgeno es superior a
la velocidad a la que se puede suministrar.
Reduccin de piruvato a etanol se produce en la fermentacin alcohlica.
El primer paso en este proceso implica una descarboxilacin catalizada por la enzima irreversible de
piruvato para formar acetaldehdo, que se reduce luego por NADH a etanol.
El Elflclency de Glycolysls
La energa libre estndar de reaccin para la degradacin de glicosa al in lactato (-197 kJ / mol de
glucosa) es slo una pequea fraccin de la energa disponible cuando la glucosa se oxida a CO2 y
H2O (-2870 kJ / mol). La belleza de la gluclisis, sin embargo, es que se libera esta energa en ausencia
de cualquier oxidacin o reduccin neta. Un extremo del in lactato (-CO2-) se oxida con relacin a la
glucosa, mientras que el otro extremo (-CH3) se reduce.
Tal vez una mejor estimacin de la eficiencia de la gluclisis puede obtenerse mediante el clculo de la
fraccin de la energa liberada durante la gluclisis que es capturado en la forma de ATP. Muchos
bioqumicos hacer este clculo dividiendo la energa libre estndar de hidrlisis del ATP sintetizado en
la va (2 mol ATP X -31 kJ / mol) por la energa libre global de la reaccin (-197 kJ / mol), lo que da
una eficiencia de aproximadamente el 30%.
Este clculo es engaoso, sin embargo, porque las concentraciones fisiolgicas de glucosa, lactato,
ATP, ADP, etc., estn tan lejos de el estado estndar. Si corrkct la energa libre de reaccin para la

degradacin de la glucosa para reflejar las concentraciones de glucosa (5 mM) y lactato (2,9 mM) en
una clula tpica, como un glbulo rojo (n, obtenemos un valor de delta G ' para esta reaccin de
aproximadamente -210 kJ / mol. Si hacemos la misma correccin para la energa libre de hidrlisis de
ATP, usando concentraciones de glbulos rojos tpicos de ATP (1,85 mM), ADP (0,138 mM) y fosfato
(1 mM) , obtenemos estimaciones de delta G 'del orden de -55 kJ / mol. Esto corresponde a la captura
en forma de ATP en concentraciones fisiolgicas de ms de 50% de la energa emitida durante la
gluclisis.
Otros hidratos de carbono como fuente de productos intermedios para la gluclisis
Otros hidratos de carbono, adems de la glucosa pueden entrar en la va glucoltica. La fructosa, por
ejemplo, puede que fosforilado en fructosa I-fosfato por una quinasa y luego dividir por aldolasa en
dihidroxiacetona fosfato y gliceraldehdo.
DHAP puede entonces ser convertido en gliceraldehdo 3-fosfato por la enzima triosa fosfato
isomerasa, mientras que gliceraldehdo puede ser fosforilada a gliceraldehdo 3-fosfato por una
quinasa. El primer paso en la degradacin de galactosa implica la fosforilacin por una quinasa para
dar galactosa 1-fosfato, que se epimeriza a la glucosa l-fosfato y luego se convierte a la glucosa 6fosfato por una enzima mutasa.
En tiempos de abundancia, el exceso de carbohidratos en plantas y animales se convierten en glucosa
que se almacena como almidn o glucgeno. Cuando sea necesario como fuente de energa, estos
polisacridos entran en la gluclisis a travs de la accin de dos enzimas, el glucgeno (o almidn)
fosforilasa, que escinde las molculas individuales de glucosa de la cadena de polisacrido para formar
glucosa 1-fosfato, y fosfoglucomutasa, que transforma este producto intermedio en glucosa 6-fosfato.
Literatura Clted

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