MECANISMO GENÉTICOS MOLECULARE S BÁSICOS

Los ácidos nucleicos. Estas macromoléculas:

1) Contienen la información para determinar la secuencia de aminoácidos y por lo

tanto la estructura y función de todas las proteínas de una célula.

2) Son parte de las estructuras celulares que seleccionan y alinean aminoácidos en

el orden correcto a medida que se sintetiza un cadena polipeptídica.

3) Catalizan numerosas reacciones químicas fundamentales, incluida la formación

de enlaces peptídicos entre aminoácidos durante la síntesis de proteínas.

El acido desoxirribonucleico (ADN) , contiene toda la información necesaria para

construir las células y los tejidos de un organismo.

La información acumulada en el DNA está organizada en unidades hereditarias, hoy

conocidas como genes. Que controlan rasgos identificables de un organismo. En el
proceso de transcripción, la información almacenada en el DNA es copiada al acido
ribonucleico (RNA), que lleva a cabo tres funciones distintas en la síntesis proteica.

El RNA mensajero (mRNA) porta las instrucciones del DNA que especifican el orden
correcto de los aminoácidos durante la síntesis de proteínas. El ensamblaje paso a
paso, notablemente preciso, de los aminoácidos para formar las proteínas tiene lugar
mediante la traducción del mRNA. En este proceso, la información en el mRNA es
interpretada por un segundo tipo de RNA denominado RNA de transferencia y el RNA
ribosómico y sus proteínas asociadas.

4.1 ESTRUCTURA DE LOS ACIDOS NUCLEICOS

El DNA y el RNA son químicamente muy similares. La estructura primaria de ambos son
polímeros compuestos por monómeros llamados nucleótidos.

Una hebra de ácidos nucleicos es un polímero lineal con direccionalidad de un

extremo a otro

El DNA y el RNA constan, cada uno, de sólo cuatro nucleótidos distintos.

En el RNA, el azúcar es ribosa; en el DNA, desoxirrobosa. Los nucleótidos que se

utilizan en la síntesis de DNA y RNA contienen cinco bases diferentes. Las bases
Adenina (A) y guanina (G) son purinas, que contienen un par de anillos fusionados. Las
bases citosina(C), Timina (T) y Uracilo (U) son pirimidinas, que contienen un único
anillo. Tanto el DNA como el RNA contienen tres de estas bases : A, G Y C; sin
embargo, T sólo se encuentra en el DNA y U sólo en el RNA.

Una hebra de acido nucleico tiene un orientación química, de extremo a extremo: El

extremo 5´ tiene un grupo fosfato: El extremo 3’ generalmente contiene un grupo
hidroxilo en el carbono 3’ de su azúcar terminal.
La síntesis también procede del 5’ al 3’, esto ha dado origen a la conversión de leer y
escribir las secuencias de polinucleotidos en dirección 5-> 3..

La unión química entre nucleótidos adyacentes, comúnmente denominada enlace

fosfodiester, en realidad consta de dos enlaces fosfoester, uno en el lado 5´ del fosfato
y otro en el lado 3’.

La secuencia lineal de nucleótidos unidos por enlaces fosfodiester constituye la

estructura primaria de los ácidos nucleicos.

EL DNA nativo es una doble hélice de hebras complementarias y

antiparalelas.

El DNA consta de dos hebras de polinucleotidos asociados que se entrelazan entre para
formar una doble hélice. Los dos esqueletos de azúcar-fosfato se ubican en la parte
exterior de la doble hélice y las bases se proyectan hacia el interior.

La orientación de las dos hebras es anti-paralela; es decir sus direcciones 5’ -> 3’ son
opuestas.

Las hebras se mantienen en un registro exacto debido a la formación de pares de

bases entre las dos hebras: A esta apareada con T a través de dos enlaces de
hidrogeno y G está apareada con C a través de tres enlaces de hidrogeno.

En el DNA natural, A siempre se une mediante enlaces de hidrogeno con T y G con C,

formando pares de bases A.T y G.C. Estas asociaciones entre una purina más grande y
una pirimida más pequeña son a menudo denominadas pares de bases de Watson y
Crick. Dos hebras de polinucleotidos o sus regiones, en las cuales todos los nucleótidos
forman estos pares de base, se denominan complementarias.

La mayoría del DNA en las células es una hélice con giro hacia la derecha, hay
alrededor de 10,1 pares por giro. Esto se denomina la forma B del DNA, la forma
normal presente en la mayoría del DNA celular.

En la parte exterior en la forma B del DNA de forma B, los espacios entre las hebras
entrelazadas forman dos hendiduras helicoidales de distinto ancho, descritas como
hendidura mayor y hendidura menor.

Además de la forma B principal, se describieron tres estructuras adicionales de DNA.

Con muy baja humedad, la estructura cristalográfica del DNA B cambia a la forma A,
que es más compacta.

Las moléculas cortas de DNA adoptan una configuración alternativa con giro hacia la
izquierda en lugar de la hélice normal con giro hacia la derecha. Esta estructura se
denomina DNA Z por que las bases parecen zigzaguear cuando se visualizan de
costado.

Aunque los múltiples enlaces hidrófobos y de hidrogeno entre las bases provee
estabilidad al DNA, la doble hélice es flexible sobre su eje longitudinal. No hay enlaces
de hidrogeno paralelos al eje de la hélice de DNA. Esta propiedad le permite al DNA
que se doble cuando forma complejos con una proteína de unión al DNA.

La torsión es crítica para logar el empaquetamiento denso del DNA en la cromatina,

el complejo proteína-DNA, como se presenta el DNA nuclear en las células eucariontes.

Las hebras del DNA pueden separarse de manera reversible

Durante la replicación y transcripción del DNA, las hebras de la doble hélice deben
separase de manera tal para permitir que los bordes internos de las bases puedan
formar pares con las bases de nucleótidos a ser polimerizados en nuevas cadenas de
polinucleótidos.

El proceso de desenrollar y separar las hebras de DNA, denominado desnaturalización,

o fusión, se puede inducir experimentalmente al incrementar la temperatura de una
solución de DNA.

La temperatura de fusión a la cual las hebras de DNA se separan depende de varios

factores. Las moléculas que contienen una gran proporción de pares de G.C requieren
temperaturas más altas para su desnaturalización porque los tres enlaces de hidrogeno
en los pares de A.T, que tienen sólo dos enlaces de hidrogeno. De hecho, es posible
estimar el porcentaje de los pares de bases de G.C en una muestra de DNA a partir de
su temperatura de fusión.

La moléculas de DNA monocatenario, o hebra simple, resultante de la

desnaturalización, forman ordenamientos al azar sin una estructura organizada.
Disminuyendo la temperatura, aumentando la concentración de iones o neutralizando
el pH, se logra que las dos hebras complementarias se reasocien en una doble hélice
perfecta.

La desnaturalización y la renaturalización de DNA son la base de la hibridación de los

ácidos nucleicos, una técnica poderosa utilizada para estudiar la relación de dos
muestras de DNA y para detectar y aislar las moléculas especificas en una mezcla que
contiene numerosas secuencias diferentes de DNA.}

Muchas moléculas de DNA son circulares

Muchos de los DNA genómicos procariontes y muchos DNA virales son moléculas
circulares. Las moléculas circulares de DNA también se hallan en las mitocondrias.

Cada una de las dos hebras de una molécula circular de DNA forma una estructura
cerrada sin extremos libres. Los desenrollamientos localizados de una molecula
circular de DNA, que aparecen durante la replicación, inducen tensiones de torsión en
la porción restante de la molecula debido a que los extremos de las hebras no pueden
rotar libremente.

Como resultado, la molecula de DNA se enrolla sobre si misma, como una banda de
goma enrollada y forma superenrollamientos.

Sin embargo, las células eucariontes y bacterianas contienen Topoisomerasa I, que

puede aliviar cualquier tensión de torsión que se desarrolle en las moléculas de DNA
durante la replicación u otro procesos. Esta enzima se une al DNA en sitios al azar y
rompe un enlace fosfodiéster en una hebra. Tal rotura de una hebra en el DNA se
denomina muesca.

Los diferentes tipos de RNA exhiben diversas conformaciones

relacionadas con sus funciones.

A diferencia del DNA, el cual existe principalmente común doble hélice muy larga, la
mayoría del RNA celular es una hebra simple y exhibe diversas conformaciones. Las
diferencias en los tamaños y las conformaciones de los distintos tipos de RNA les
permiten llevar a cabo funciones especificas en la célula.

Las estructuras secundarias más simples en los RNA monocatenarios están formadas
por apareamiento de bases complementarias. Las “Horquillas” se forman por
apareamiento de bases complementarias separadas por 5-10 nucleotidos entre una y
otra. Y los “tallos y bucles”, por apareamiento de bases separadas por >10 a varios
cientos de nucleótidos.

Estos plegamientos simples pueden cooperar para formar estructuras terciaras más
complicadas , una de las cuales se denominan “seudonudo”.

Los RNA también tienen capacidad catalítica. Estos RNA catalíticos son llamados
ribozimas. Aunque las ribozimas generalmente suelen estar asociadas con las proteínas
que estabilizan la estructura ribosómica, es el RNA el que actúa como un catalizador.

El rRNA desempeña un papel catalítico en la formación de enlaces peptídicos durante

la síntesis de proteínas.

4. TRANSCRIPCIÓN DE GENES CODIFICADORES DE PROTEINAS Y

FORMACIÓN DE mRNA FUNCIONAL.

La definición más simple de un gen es una “unidad de DNA que contiene la información
para especificar la síntesis de una única cadena polipeptídica o RNA funcional”.

La gran mayoría de los genes contienen información para construir moléculas

proteicas; las copias de RNA de tales genes codificadores de proteínas constituyen las
moléculas de mRNA de las células.

Durante la síntesis de RNA, el lenguaje de cuatro bases del DNA, que contiene A,G, C y
T simplemente es copiado o transcripto, al lenguaje de cuatro bases de RNA, que es
idéntico con la excepción de que U reemplaza a T. Durante la síntesis de proteínas, el
RNA es traducido al lenguaje de 20 aminoácidos.

La RNA Polimerasa transcribe una hebra molde de DNA para formar una
hebra complementaria de RNA.

Durante la transcripción de DNA, una hebra de DNA actúa como un molde o patrón,
determinando el orden en que los monómeros de ribonucleosido trifosfato (rNTP) son
polimerizados para formar una cadena complementaria de RNA.
Se denomina corriente abajo a la dirección en la cual una hebra molde de DNA es
transcripta (o el mRNA es traducido); así, una secuencia corriente abajo se dirige hacia
el extremo 3´. Corriente arriba indica la dirección opuesta.

Etapas de la transcripción Durante la iniciación de la transcripción, la RNA polimerasa

reconoce y se une a un sitio especifico, denominado promotor, en el DNA de hebra
doble. Las RNA polimerasas nucleares requieren diversos factores proteicos,
denominados factores de transcripción generales, para ayudarlas a localizar los
promotores e iniciar la transcripción.

Luego de unirse al promotor, el RNA polimerasa disocia las hebras de DNA para hacer
que las bases en la hebra molde estén disponibles para el apareamiento con las bases
de los ribonucleosidos trifosfatos que se polimerizaran.

LAS 3 ETAPAS EN LA TRANSCRIPCIÓN

INICIACIÓN:

1) La polimerasa se une a la secuencia promotora en el dúplex de DNA “ complejo

cerrado”

2) La polimerasa separa el dúplex de DNA cerca del sitio de inicio de la

transcripción, formando una burbuja de transcripción. “Complejo abierto”

3) La polimerasa cataliza el enlace fosfodiester de dos rNTP iniciales.

ELONGACIÓN

4) La polimerasa avanza 3->5 sobre la hebra molde, separando el DNA bicatenario

y adicionando rNTP al RNA creciente

TERMINACIÓN

5) En el sitio de terminación de la transcripción la polimerasa libera el RNA

completo y se disocia del DNA.

La organización de los genes es diferente en el DNA de procariontes y

eucariontes.
La disposición más frecuente de genes codificadores de proteínas en todas las
procariontes tiene una poderosa y notable lógica: Los genes dedicados a un único
objetivo metabólico, supongamos, la síntesis del aminoácido triptófano, se suelen
encontrar en una disposición contigua en el DNA. Tal disposición de genes en un grupo
funcional se denomina operón. Porque opera como una unidad a partir de un único
promotor. La transcripción de un operón produce una hebra continua de mRNA que
transporta el mensaje para una serie relacionada de proteínas.

El gen eucarionte existía en porciones de secuencias diferentes, los exones, separados

por segmentos no codificadores de proteínas, los intrones.

Los precursores de mRNA de los eucariontes son procesados para

formar las mRNA funcionales.

En los procariontes la transcripción y la traducción pueden suceder al mismo tiempo.

Los transcriptos primarios de los genes codificadores de proteínas son precursores de

los mRNA (pre-mRNA), que deben atravesar varias modificaciones, denominadas en su
conjunto procesamiento del RNA, para producir un mRNA funcional.

El paso final en el procesamiento de muchas moléculas distintas de mRNA eucariontes

es el corte y empalme (splicing) del RNA: la escisión interna del transcripto para
eliminar los intrones, seguida por la ligación de los exones codificadores. Las regiones
no codificantes (UTR) son retenidas durante el procesamiento.

En los eucariontes superiores, el corte y empalme alternativo de intrones es un

mecanismo importante para la producción de diferentes formas de una proteína,
denominadas isoformas.

4.3 CONTROL DE LA EXPRESIÓN GENICA EN LOS PROCARIONTES

Puesto que la estructura y la función de una celula están determinadas por las
proteínas que contiene, el control de la expresión génica es un aspecto fundamental de
la biología celular molecular.

4.4 LAS TRES FUNCIONES DEL RNA EN LA TRADUCCIÓN

La traducción es el proceso por el cual la secuencia de nucleótidos de un mRNA es

utilizada para ordenar y unir los aminoácidos en una cadena polipeptídica. En las
células eucariontes, la síntesis de proteínas tiene lugar en el citoplasma, donde tres
tipos de moléculas de RNA se reúnen para realizar funciones distintas pero
cooperativas.

1EL RNA mensajero (mRNA) Transporta la información genética transcripta desde el

DNA, bajo la forma de una serie de secuencias de tres nucleótidos, denominados
codones, cada uno de los cuales especifica un aminoácido en particular.

2El RNA de transferencia (tRNA) Es la clave para descifrar los codones en el mRNA.
Cada tipo de aminoácido tiene su propio subgrupo de tRNA, que une al aminoácido y lo
transporta hasta el extremo creciente de una cadena polipeptídica, si el próximo codón
en el mRNA así lo requiere. El tRNA correcto, con su aminoácido adosado, es
seleccionado a cada paso porque cada molécula específica de tRNA contiene una
secuencia de tres nucleótidos, un anticodón, que puede aparear bases con su codón
complementario en el mRNA.

3.-El RNA ribosómico(rRNA) se asocia con un conjunto de proteínas para formar

ribosomas.

La síntesis de todas las cadenas polipeptidicas en las células procariontes y

eucariontes comienzan con el aminoácido metionina. Osea que el codón de inicio es
AUG.

Los tres codones UAA,UAG Y UGA no especifican aminoácidos, pero constituyen

codones de terminación (stop) que marcan el carboxilo terminal de las cadenas
polipeptídica en casi todas las células. La secuencia de codones que transcurre desde
un codón de inicio específico hasta un codón de terminación se denomina marco de
lectura.

La estructura plegada de tRNA promueve sus funciones

decodificadoras.

La traducción, o decodificación, del lenguaje de cuatro nucleótidos del DNA y mRNA al

lenguaje de 20 aminoácidos de las proteínas requiere tRNA t enzimas denominadas
aminoacil-tRNA sintetasa. Para participar en la síntesis de proteínas, una
molécula de tRNA debe estar unida químicamente a un aminoácido en particular a
través de un enlace de alta energía, formando aminoacil-tRNA.

CONCEPTOS CLAVE DE LA SECCIÓN 4.4

- La información genética es transcripta del DNA al mRNA bajo la forma de un

código de tripletes degenerado, superpuesto y sin comas.

- Cada aminoácido está codificado por una o más secuencias de trinucleotido

(codones) en el Mrna. Cada codón especifica un aminoácido, pero la mayoría de
los aminoácidos están codificados por múltiples codones.

- El Codon UAG para la metionina es el codón de inicio más común, y especifica el

aminoácido del extremo NH2- terminal de una cadena de proteína. Tres
codones(UAA,UAG UGA) funcionan como codones de terminación y no
especifican ningún aminoácido.

- El marco de lectura, la secuencia ininterrumpida de codones en el mRNA desde

un codón de inicio especifico hasta un codón de terminación, se traduce en una
secuencia lineal de aminoácidos en una cadena polipeptídica.

- La decodificación de la secuencia de nucleótidos en mRNA en una secuencia de

aminoácidos de una proteína depende de los tRNA y de las aminoacil-tRNA
sintetasas
 - Todos los tRNA tienen una estructura tridimensional similar, que incluye un
brazo aceptor para la fijación de un aminoácido específico y un tallo con bucle
con una secuencia anticodón de tres bases en el extremo. El anticodón puede
aparearse con su correspondiente codón del mRNA.

- Debido a las interacciones no estándares, un tRNA puede aparearse con mas de

un codón del mRNA ; a la inversa, un codón particular puede tener un
apareamiento de bases con multiples tRNA. Sin embargo, en cada caso, solo el
aminoácido adecuado es insertado en una cadena polipeptídica creciente.

- Cada una de las 20 aminoacil-tRNA sintetasas reconoce un único aminoácido y

lo une, mediante enlaces covalentes, a un tRNA análogo, para formar un
aminoacil-tRNA. Esta reacción activa el aminoácido para que pueda participar
en la formación de un enlace peptídico.

- Tanto los ribosomas de los procariontes como los de los eucariontes – los
grandes complejos de ribonucleoproteinas sobre los cuales ocurre la traducción-
constan de una subunidad mayor y una menor. Cada subunidad contiene
numerosas proteinas diferentes y una molecula principal de rRNA (grande o
pequeña). La subunidad grande también contiene un rRNA 5s accesorio en los
procariontes y dos rRNA accesorios en los eucariontes.

- Los rRNA análogos de muchas especies diferentes se pliegan para formar

estructuras tridimensionales que contienen numerosos tallos con bucles y sitios
de unión para proteínas, mRNA Y tRNA. Muchas proteínas ribosómicas pequeñas
se asocian con la periferia de los rRNA.

CONCEPTOS CLAVE DE LA SECCIÓN 4.5

PASOS DE LA SINTESIS DE PROTEINAS SOBRE LOS RIBOSOMAS.

De las dos metioninas-tRNA que se encuentran en todas las células, solo una actua en
la iniciación de la traducción.

Cada paso de la traducción – la iniciación, la elongación de la cadena y la terminación-

requiere factores proteicos específicos incluidos las proteínas de unión a GTP que
hidrolizan el GTP unido a GDP cuando un paso ha sido completado con éxito

Durante la iniciación, las subunidades ribosómicas se ensamblan ceca del sitio de inicio
de la traducción de una molécula de mRNA y el tRNA que porta la metionina
aminoterminal apareada con el codón de inicio.

La elongación de una cadena incluye un ciclo repetitivo de cuatro pasos

En cada ciclo de elongación de la cadena, el ribosoma sufre dos cambios

conformacionales monitorizados por las proteínas de unión a GTP. El primero permite
una unión fuerte del aminoacil-tRNA entrante al sitio A y la expulsión de un tRNA desde
el sitio E y el segundo conduce a la translocación.
La terminación de la traducción es llevada a cabo por dos tipos de factores de
terminación: los que reconocen codones de terminación y los que promueven la
hidrólisis de peptidil-tRNA.

La eficiencia de la síntesis de proteína se incremente con la traducción simultánea de

un único mRNA mediante múltiples ribosomas.

CONCEPTOS CLAVE DE LA SECCIÓN 4.6

REPLICACIÓN DEL DNA

- En un DNA Bicateniario parental, cada hebra, actúa como un molde para la

síntesis de una hebra hija que permanece apareado por sus bases a la nueva
hebra, formando un DNA bicatenario hijo (mecanismo semiconservativo). Las
nuevas hebras se forman en la dirección 5-> 3.

- La replicación comienza en una secuencia denominada origen. Cada molécula

de DNA cromosómico en eucariontes contiene múltiples orígenes de replicación.

- Las DNA polimerasas, a diferencia de las RNA polimerasas, no pueden

desenrollar las hebras del DNA bicatenario y no pueden iniciar la síntesis de
nuevas hebras complementarias a la hebra molde.

- En una horquilla de replicación, una hebra hija (la hebra conductora) es

elongada continuamente. La otra hebra hija (la hebra rezagada) es formada
como una seria de fragmentos de OKAZAKI discontinuos a partir de cebadores
sintetizados cada algunos cientos de nucleótidos.

- Los ribonucleotidos utilizan energía proveniente de la hidrólisis del ATP para

separar las hebras de DNA parentales (moldes).