Pontificia Universidad Catlica de Chile

Facultad de Ciencias Biolgicas

Gentica y Evolucin
2016

BIO226E
Gua de ayudanta 7: Ordenamiento de caracteres
Filogenia - Filogeografia
Uno de los problemas centrales de la biologa es la clasificacin de los
organismos basado en sus caractersticas compartidas. Por ejemplo, todos los
organismos con espina dorsal son clasificados como vertebrados. En este caso la
espina dorsal es una caracterstica que define al grupo. Si, adems de la espina dorsal,
un organismo tiene agallas y aletas es un pez, una subcategora de vertebrados. Este pez
posteriormente puede ser asignado a categoras ms pequeas hasta el nivel de especie.
La clasificacin de organismos de esta manera permite a los bilogos poner orden a la
gran diversidad de especies presentes y extintas. El campo de la biologa que se encarga
de la clasificacin de organismos es la Taxonoma (taxis = arreglo + nomos = ley).
El sistema taxonmico moderno est basado en el sistema jerrquico propuesto
por Carolus Linnaeus (1707-1778). A travs de este sistema los organismos se agrupan
en categoras cada vez ms inclusivas desde reino hasta especies. (Reino Filum
Clase Orden Familia Gnero Especie).
La visin de la taxonoma cambio radicalmente despus de que Charles Darwin
(1809-1882) publicara El origen de las especies en 1859. El present evidencia de que
la vida haba evolucionado a travs del proceso de seleccin natural y como
consecuencia de este descubrimiento, hoy en da se reconoce que la clasificacin
taxonmica es un reflejo de la historia evolutiva. Linnaeus junt a humanos y lobos en
la clase Mammalia del Filum Chordata debido a que compartan ciertas caractersticas
(espina dorsal, homeotermos, placenta, etc). Hoy sabemos que esta similitud no es
coincidencia, ambas especies heredaron estos rasgos del mismo ancestro comn.

Una manera de mostrar estas relaciones evolutivas entre organismos es a travs

de un rbol filogentico, como el que se muestra en la siguiente figura:

Pontificia Universidad Catlica de Chile

Facultad de Ciencias Biolgicas
Gentica y Evolucin
2016

Ejercicio 1
Desarrollaran una clasificacin taxonmica y un rbol filogentico para un grupo de
Caminalculos, animales imaginarios inventados por el bilogo evolutivo Joseph Camin
(se encuentran al final de esta gua). En este trabajo ustedes debern clasificar 14
especies vivientes de Caminalculos en gneros, familias, etc. Despus, construirn un
rbol evolutivo de los Caminalculos usando 57 especies fsiles adicionales. Miren los
dibujos y noten la variedad de apndices, formas de concha, etc. Cada especie est
identificada por un nmero (no un nombre). Para los Caminalculos fsiles adems se
incluye un nmero en parntesis que indica su edad geolgica en millones de aos.
a) Examinar cuidadosamente las 14 especies vivas de Caminalculos y notar las
diferencias y similitudes entre ellas. Crear una clasificacin jerrquica de estas especies
basada en la fentica (similitud entre ellas). Proponer gneros, agrupando las especies
que ms se asemejan, y un orden constituido por estos dos gneros. Explicar porque
excluyen las especies que no forman parte de este orden.
b) Construir un rbol filogentico de las 14 especies vivientes basado en los criterios de
la cladstica. Para definir el estado ancestral de los caracteres, utilizar la informacin de
los caminalculos fsiles. Comparar con el rbol fenetico del ejercicio (a).
c) Identificar los caracteres nuevos o derivados (apomorfas) de caracteres ancestrales
(plesiomorfas), los caracteres que son compartidos por uno o ms taxones
(sinapomorfas). Identificar grupos monofileticos, parafileticos, polifileticos.

Pontificia Universidad Catlica de Chile

Facultad de Ciencias Biolgicas
Gentica y Evolucin
2016

d) Responder las siguientes preguntas relacionadas con el rbol construido en (b).

1. Algunos linajes se ramifican muchas veces y estn representados por muchas
especies vivientes. Discutir alguna condicin ecolgica que haya llevado a esta rpida
diversificacin de linajes. (Un ejemplo del mundo real sera la diversificacin de los
mamferos en el Cenozoico, justo despus de la extincin de los dinosaurios)
2. Algunos linajes cambian poco a travs del tiempo. Un ejemplo de esto serian
fsiles vivientes como la Cacerola de las Molucas. Discuta las condiciones ecolgicas
que permiten esta estasis (largo tiempo sin cambio evolutivo).
3. Encuentre dos ejemplos de evolucin convergente entre los Caminalculos.
Esto significa encontrar casos donde dos o ms especies tienen caractersticas similares
que han evolucionado independientemente en cada linaje. Las alas de murcilagos, aves
y abejas son un ejemplo de convergencia porque los tres grupos no adquirieron la
caracterstica de un ancestro comn.
4. Describir dos ejemplos de estructuras vestigiales que pueda encontrar entre
los Caminalculos. Estas son estructuras que han sido reducidas hasta el punto de ser
virtualmente intiles. Apndice, muelas del juicio son ejemplos de estructuras
vestigiales en nuestra especie.

Pontificia Universidad Catlica de Chile

Facultad de Ciencias Biolgicas
Gentica y Evolucin
2016

Ejercicio 2
La ardilla Tamias striatus es una especie que habita los bosques templado de
Norteamrica. Como depende fuertemente de un habitat boscoso, podemos suponer que
no sobrevivi en las regiones que fueron cubiertas por los hielos durante el ultimo
mximo glaciar, y que su presencia actual en estas regiones es el resultado de un
proceso de re-colonizacin post-glacial. Para poner a prueba esta hiptesis, Rowe et al.
(2004) analizaron la diversidad gentica de esta especie en base a la secuencia de la
Regin Control del DNA mitocondrial. Los dos principales resultados aparecen en las
figuras siguientes.

En la parte superior: Distribucin de frecuencia del nmero de diferencias entre pares de

secuencias (distribucin de mismatch). En la parte Inferior: red de haplotipos. El largo
de rama es proporcional al nmero de mutaciones que separan dos haplotipos, excepto
entre los haplotipos IL-NW y WI-NW que estn separados por solo un paso mutacional.

Pontificia Universidad Catlica de Chile

Facultad de Ciencias Biolgicas
Gentica y Evolucin
2016

Interpretar estos resultados respondiendo a las preguntas siguientes:

A. Qu tipo de historia demogrfica sugieren estos resultados: crecimiento,
persistencia o reduccin poblacional?
B. Cules son los argumentos que justifican su respuesta a la pregunta anterior?
C. Considerando que los nucletidos analizados son 850, que la tasa de mutacin es de
3.10-7 y = 6, calcular la fecha del evento demogrfico.
D. Segn estos resultados, usted acepta o rechaza la hiptesis planteada por los
autores? Explicar brevemente porqu.
E. A qu corresponde la pequea ola ubicada cerca de 33 diferencias en el grfico de
distribucin mismatch?
Podra ser una evidencia de que hay dos especies en esta serie de datos? Justificar.
Qu concepto de especies estn utilizando para definir su respuesta?
Ejercicio 3
Construir una red de alelos (o haplotipos) a partir de las siguientes secuencias. En cada
rama uniendo 2 alelos, poner marcas correspondientes al nmero de cambios
nucleotdicos que separan estos alelos (1 marca para un cambio, 2 marcas para 2
cambios, etc). Identificar los individuos pertenecientes a cada haplotipo. Luego,
construir una distribucin de mismatch.
Qu tipo de cambio demogrfico sugiere? Argumentar.
1 > A T T C G T G A A T G T C C A T A T G G C T G A T T A
2 > A T T C G T G A A T G T C C A T A T G G C T G A T T A
3 > A T T C G T G A A T G T C C A T A T G G C T G A T T A
4 > A T T C G T G A A T G T C C A T A T G G C T G A T T A
5 > A T T C G T G A A T G T C C A T A T G G C T G A T T A
6 > A T T C G T G A A A G T C C A T A T G G C T G A T T A
7 > A T T C G T G A A T G T C C A T A T G C C T G A T T A
8 > A T T G G T G A A T G T C C A T A T G G C T G A T T A
9 > A T T C G T G A A T G T C C A T A T G G C T G A T T A
10> A T T C G T G A A T G T C C A T T T G G C T G A T T A
11> A T T C G T G A A T G T C C A T A T G G C T G C T T A

Caminalculos vivientes:

Caminalculos fsiles (nmero en parntesis indican edad en millones de aos)

Nota: Los dibujos de Caminalculos son propiedad de la revista Systematic Zoology y

Robert R. Sokal. (Sokal, R.R. 1983. Systematic Zoology 323:159-184) Fueron copiados
de la pgina del Dr. Robert P. Gendron.