TALLER MICROBIOLOGIA AMBIENTAL

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Para el monitoreo de los microorganismos asociados con el proceso de
biorremediacin tanto de la matriz de suelo como la de agua en este caso se
puede hacer uso de diferentes tipos de herramientas microbiolgicas, unas de
ellas convencionales, que aprovechan las caractersticas propias de la
bacteria, bien sean bioqumicas o nutricionales. As tiene cabida el uso de
tcnicas como:

Recuento en placa: a travs del cual se permite el crecimiento del

microorganismo en medios de cultivo selectivos a partir de muestras
diluidas de suelo para despus cuantificar el nmero de unidades
formadoras de colonia por gramos o kilogramos de suelo,
Nmero ms probable (NMP): Si se conocen las caractersticas
bioqumicas del microorganismos y ha sido estandarizada la tabla de
NMP para el mismo, es posible utilizar esta tcnica para estimar la
concentracin celular por unidad de masa de suelo.
Turbidimetra: Aun cuando se trata de una matriz heterognea, es
posible utilizar las tcnicas turbidimetricas para estimar la concentracin
de clulas, mediante la medicin de la absorbancia de la biomasa en
suspensin.
Observacin directa: A partir de diluciones de suelo se realiza una
tincin simple y posterior recuento en cmara de neubauer, este mtodo
permite dar un dato aproximado de la concentracin de bacterias por
unidad de masa de suelo.

El aumento en la poblacin microbiana implica entonces actividad celular, si se

conoce que el microorganismo est utilizando el contaminante como fuente de
energa, seguramente en este proceso metablico lo est degradando.
Tambin existen tcnicas ms sofisticadas, a nivel molecular, nos dan la
posibilidad de reconocer la presencia del microorganismo en la matriz de suelo.
Entre ellas:

RT-PCR: la deteccin de la expresin de los genes implicados en la

produccin de enzimas del metabolismo de los hidrocarburos permite
detectar la presencia de que aquellos microorganismos capaces de
degradar los contaminantes a la vez que nos da una aproximacin de la
tasa metablica que presenta e indirectamente permite calcular su
concentracin celular.
ANALISIS DE IMPEDANCIA: al reconocer que el metabolismo de la
bacteria implica reacciones de transformacin de las molculas de
contaminantes, podra medirse la actividad metablica del mismo en
relacin con los cambios en la conductividad del medio.

HIBRIDACIN FLURESCENTE IN SITU (FISH): La deteccin de los

microorganismos se detectan de manera especfica mediante la
utilizacin de zonas de hibridacin de DNA marcadas con un fluorocromo
y su cuantificacin, mediante un equipo de medicin de la cantidad de
luz emitida por la muestra