Es una de las joyas arquitectnicas ms bellas de Tunja, que superviven del
perodo hispnico. Su construccin se inici en el ao 1571, cuando se fund el primer convento de monjas que se estableci en el territorio nacional. Su fundador fue don Francisco Salguero con su esposa Juana Macas de Figueroa. En la capilla de Santa Clara hay altares bien tallados y cuadros antiguos de Santa Clara y de San Bernardino de Sena; igualmente obras de los pintores Vsquez Arce y Ceballos, los artistas Figueroa y otros. Segn el crtico del arte Santiago Sebastin: La Iglesia de Santa Clara tiene una planta muy sencilla, a base de una sola nave, con testero plano y arco toral apuntado, que pudiera derivar de San Francisco de Quito en opinin de Buschiazzo. La nave longitudinal est cubierta en forma de artesa a cuatro aguas, y sobre fondo rojo destaca una combinacin de octgonos y rombos de madera dorada, los cuales enmarcan las tpicas mazorcas y cruces. En el arco toral se repiten los mismos motivos vegetales de la Capilla del Rosario; las hojas dispuestas radialmente no parten de la arquivolta sino de la rosca. Las pilastras del arco toral estn decoradas con unas guirnaldas y el guila bicfala del escudo de Tunja; en lugar de esta ave el artista parece haber estilizado un ave del pas, una garza, en opinin de Marco Dorta, a juzgar por la longitud de las patas. SANTA CLARA LA REAL Planta sencilla de una sola nave, iniciada a fales del Siglo XVI. Cubierta longitudinalmente en forma de artesa, decorada ntegramente con tallas de madera y hojilla de oro en fondo carmes, formando octgonos y rombos que enmarcan cruces, hojas de llantn, mazorcas, pias y querubines. La totalidad de los paramentos murales est cubierta con lienzos al leo, separados por un rico conjunto de pilas-trillas dobles, basamentos y frisos tallados en madera. El coro separado por una bellsima celosa Mudjar contigua a la celda de la Madre Francisca Josefa del Castillo, escritora mstica quien reposa en una cripta all mismo. La celda ubicada en el costado sur del paramento tiene comunicacin visual por intermedio de una celosa, frente al altar del Cristo que la inspir para su obra potica cumbre, "Afectos Espirituales". Aunque la obra escultrica ya no est all, queda el vestigio en el nicho, que coincide exactamente con la cruz donde reposa la talla del Cristo y que actualmente se encuentra en una capilla privada del nuevo convento. Es de anotar que la entrada principal para los fieles, en las iglesias de comunidades religiosas, siempre estaba ubicada a un lado de la nica nave, en la parte central y al lado opuesto del edificio del convento; y como en el caso de las Clarisas, tenemos el ejemplo de la iglesia de los monjes Agustinos, la antigua iglesia de las monjas Concepcionistas, agregando que en todos los casos estaban frente a una pequea plazuela. En el presbiterio sobresale en el harneruelo del arte sonado un sol enmarcado en un octgono tallado en madera que cubre la doble funcin de recordar dos culturas a travs del Dios cristiano y el ser supremo del indianismo, en cuyo fondo aparecen decorativas pinturas murales al temple, arco toral apuntado, al estilo del Gtico Isabelino y en las pilastras guila bicfala coronada, retablo
principal con tres cuerpos y tres calles, como soportes columnas triples, separando los nichos y conjunto rematado por relieves de ngeles.