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Estructura de un gen
Tiene tres cosas bsicas que son independientes del gen. Por convencin por
nomenclatura un gen se debe escribir en direccin 53 estando 5 a la izquierda. Al
escribir protena amino a la izquierda y carboxilo a la derecha.
Partes de un gen para aprenderse para toda la vida
Hacia el lado 5 (regin promotora) que pareciera corta con respecto al gen,
pero no es cierto, puede ser 10 a 15 veces ms grande en tamao que el
mismo gen para el que est regulando. Se posa la RNA polimerasa para
hacer el RNA por medio de transcripcin. Tiene dos cajas obligatorias
o Caja TATA o su equivalente (porcentaje bajo 23%), slo ese porcentaje
lo tiene. Esta caja tiene que tener nucletidos fijos. Est determinado
segn la especie y segn el gen. Cualquier alteracin en esa distancia
altera el gen.
o En direccin 5 (hacia arriba de la TATA, ms a la izquierda), CAJA
CAAD o su equivalente.
Un mismo gen puede tener diferentes cajas: al ver la secuencia del DNA, nos
podemos encontrar con que estas cajas pueden estar en un exn o un intrn. Una
secuencia puede tener varias cajas distribuidas a lo largo de ese gen. Un gen en la
regin promotora por obligacin en la regin promotora tiene que tener las
dos cajas para transcripcin y RNAm. Las otras dependen del rgano pues las
otras estn en todas las clulas, en cambio las otras se expresan dependiendo del
rgano. La misma secuencia estn en todos los genes pero en donde inicia y como
se compone vara de rgano a rgano (linfocito, hgado, etc)
TODO GEN TIENE QUE TENER REGIN PROMOTORA Y STA TIENE
QUE TENER DOS CAJAS.
DESPUS de las dos cajas esenciales comienza la zona del gen que se
transcribe a RNA y generalmente comienza en una zona que no se traduce y se
llama UTR (regin no traducida) es una zona que puede ser corta o muy larga
dependiendo del gen. Tambin est en la regin 3. All es el inicio de la
transcripcin y la terminacin. En el RNA hay una zona donde se inicia la
traduccin que comienza corriente debajo de la zona del UTR, all est el auge, la
tripleta para el inicio de la traduccin o si hablamos del DNA ser el ATG. All est
en codn de inicio de la traduccin y al final el codn de pare, vuelve un UTR
despus de ste que puede ser muy largo tambin. Y esa zona UTR tiene un lmite
para cada gen y determina donde la RNA polimerasa deja de transcribir al RNA.
Dentro del gen (la zona que codifica para una protena) con exones e intrones.
Exones secuencia de nucletidos que se traduce a protena e Intrn que no se
traduce a protena, pero hay que recordar que lo que es exn en un rgano puede
ser intrn en otro rgano de ese mismo gen.
Hay RNA chiquiticos de interferencia han sido descubiertos y tienen que ver con
replicacin, trascripcin y traduccin.
RNA heterogneos, o de interferencia o microRNAs. Pero entonces no se ha
definido si son genes o no.
Se parte en tres molculas que componen el ribosoma
5,8
Se unen con muchas protenas: ribonucleoprotenas por ser conjunto de protenas
ms RNA. El que los aisl los puso en un gradiente de sacarosa y vio que unos
quedaban en un lado y otros en otro.
La fraccin 28S ES DE LA fraccin 60S y esa es la que hace el enlace peptdico.
As que esa unin lo hace el RNA en mamferos y en bacterias 23S. Es una
ribosina
After break
Control de mecanismos de regulacin, ms estudiados en virus, virus RNA de
doble cadena. Casi todas las clulas tienen mecanismos que censan
A partir de elementos inorgnicos se forman bases, azcares. Quin hizo el primer
polmero de RNA y de aa.
El RNA acta como una enzima, ribosinas. El RNA su porcin 28S, en todos hace
la sntesis del enlace peptdico. Entonces los primeros genes fueron RNA y por lo
tanto dio origen a DNA (hizo protenas) retrotranscripcin tan ancestral como la vida
misma. Los virus se formaron como genomas individuales a partir de RNAs.
Los virus RNAs, la entrada de otro RNA lo censa y lo inactiva. As se inhiben los
factores de inicio de la traduccin. Casi todos los virus tienen mecanismos o utilizan
de la propia clula o el virus mecanismos de la clula
Dos factores de inicio
2 (forma sin fosforilarse puede unir al otro factor) y al unirse vienen una
enzima y la fosforila y se suelta de 2B y all se une a RNAt con el metianina
de inicio
2B
Al liberarse ya est fosforilado y por lo tanto habr cambiado de forma. Slo
entonces puede reconocer la metianina de inicio. Si llega virus o hay desnutricin,
hay protenas que impiden que se fosforile o se unen, y al no fosforilarse, no se
producen los cambios, no comienza, y para la sntesis.
Factor 2, son varias protenas, deprivacin de factores de crecimiento (vejez) en
menopausia o andropausia (proclive). Esto tiene que ver con enfermedades como
tumores, enfermedades virales y uso de los virus en la lucha contra el cncer.
Virus de doble cadena llega y el organismo lo detecta fcilmente por ser doble
cadena. Tiene una protena que llega e impide que la clula pare la sntesis de
protena (la clula debe ganar para que el individuo sobreviva).
La MEC y su unin con la clula est dada por azcares. La clula una vez se
forma genera protenas transmembranales y se ancla a la MEC (matriz extracelular)
y es gracias a los azcares siendo mayor la proporcin en los nios que en los
ancianos. Esta es la razn por la que los nios almacenan ms agua y azcares
cargados negativamente y retienen Na, Hormonas de Crecimiento en la MEC y
electrolitos y eso determina la rpida sanacin. Al perder agua como en la vejez se
dan arrugas y dems.
La naturaleza utiliza los azcares como sistema de informacin. Los nucletidos
que son 4 al calcularse dan 64 posibilidades de combinarse. En la naturaleza
existen 20 a la 20 posibilidades de secuencias de aa. Un azcar como la glucosa
(usualmente hexosas o pentosas). Dos glucosas que se unen tienen 6 posibilidades
de enlaces diferente y cada uno de ellos puede ser alfa o beta. La celulosa es igual
a la glucosa pero su polimerizacin es diferente y eso hace la diferencia en la que el
almidn sea digerible y la celulosa no.
Hay 200 monmeros de los cuales los que ms se investigan son 8: ribosa,
glucosa, manos, n acetil, amilasa, etc
3 tipos de glicosilacin
Los libros hablan de 3 tipos de glicosilacin pero en realidad son 2.
RER inicia all y termina en el AG (Aparato de Golgi). Se construye rama de
azcar independientemente de la sntesis de protenas. En todos los RER
constantemente se hace la polimerizacin de azcares y la clula decidir
donde colocarlo pero el mecanismo an se desconoce. Los sitios donde se
coloca la cadena de polmero de azcares son:
o en la N de Asparaginas: N-Glicosilacin
o en el Aparato de Golgi donde se une al Oxgeno de la Serina y se
denomina: O-Glicosilacin
o se unen a un azcar y a un cido graso y se GPI***. Azcar, fosfato,
cido graso
todo esto ocurre posttraduccionalmente
Slo ocurre en AG
LECTINAS
Son protenas glicosiladas que unen dos azcares. Son glicoprotenas. Los
anticuerpos que unen dos azcares no se consideran lectinas. Muchas lectinas
funcionan como superantgenos
SUPERANTGENO
Aquellos que pueden estimular el anticuerpo sin necesidad de ser presentado por el
complejo de histocompatibilidad como por ejemplo los alrgenos