Las enzimas son protenas, que intervienen en reacciones exergonicas
(catabolismo). Tienen una estructura terciaria. Un catalizador incrementa la velocidad de una reaccin disminuyendo el requerimiento de la energa de activacin Un catalizador funciona formando complejos transitorios con las molculas de sustrato, ligndolas de manera que se facilite su interaccin. Un catalizador cambia slo la velocidad a la que se consigue el equilibrio. Aceleran una reaccin qumica pero NO son una fuente de energa. Las enzimas son molculas orgnicas, son mucho ms especficas que los catalizadores inorgnicos El sitio activo es lo que permite identificar o clasificar a las enzimas como una protena. Contiene dentro de alguna parte de su estructura terciaria un grupo caracterstico de aminocidos que forman el sitio activo La lisozima es una enzima que rompe las uniones glicosdicas en los peptidoglicanos de las paredes bacterianas, conduciendo a la lisis (ruptura) y muerte de las bacterias. La carboxipeptidasa A es una enzima que modifica los polipptidos eliminando un aminocido cada vez desde el extremo C-terminal del polipptido. El sitio activo de una enzima tpica comprende un nmero determinado de aminocidos Pueden portar tambin grupos prostticos Una consecuencia de la estructura del sitio activo es que las enzimas manifiestan un alto grado de especificidad por el sustrato, esto se refiere a la habilidad de las enzimas de discriminar o diferenciar molculas muy similares. Succinato deshidrogenasa es una enzima que convierte el fumarato en succinato La especificidad por grupos, se refiere a las enzimas que reconocen una categora amplia de sustancias, es ms frecuente en enzimas implicadas en la sntesis y degradacin de polmeros. La Unin Internacional de Bioqumica designara una Comisin Enzimtica (EC), encargada de idear un sistema racional para nombrar las enzimas. Las seis clases principales de enzimas son oxidoreductasas, transferasas, hidrolasas, liasas, isomerasas y ligasas.
El sistema CE designa todas las enzimas conocidas con un nmero
separado en cuatro partes. Por ejemplo, EC 3.4.17.1, es el cdigo de la carboxipeptidasa A. Los primeros tres nmeros definen la clase, subclase y sub-subclase, y el nmero final es el nmero de serie asignado a la enzima cuando fue aadida a la lista. Las enzimas de pueden desnaturalizar por cambios de la temperatura La mayora de las enzimas de los seres homeotermos se inactivan por la temperatura, por encima de los 50-55 C. Para tales enzimas, la inactivacin por calor es slo un fenmeno de laboratorio. Sin embargo, algunas enzimas son extraordinariamente sensibles al calor y se desnaturalizan e inactivan a temperaturas ms bajas, en algunos casos, incluso a temperaturas corporales en personas con fiebre alta. Los cambios en el pH tambin desnaturalizan a las protenas. Las enzimas funcionan en distintos pH. La actividad tambin se puede ver afectada por la presencia de sustratos alternativos. El medio ambiente inico puede afectar tambin a las uniones del sustrato porque las interacciones inicas estn a menudo involucradas en las uniones entre el sustrato y el sitio activo. El contacto inicial entre el sitio activo de una enzima y una molcula de sustrato potencial, depende de colisiones aleatorias.
Una vez en la hendidura o bolsillo del sitio activo, las molculas de
sustrato se unen temporalmente a la superficie de la enzima, con la orientacin apropiada para interaccionar entre s y con grupos catalticos especficos de la enzima, lo cual facilita la reaccin. La unin del sustrato suele realizarse a travs de aminocidos cargados, por medio de puentes de hidrgeno o enlaces inicos (o ambos). La fuerza de unin entre una enzima y una molcula de sustrato, suele encontrarse en el rango de 3-12 kcal/mol El modelo de ajuste inducido supone que la unin inicial de la(s) molcula(s) de sustrato al sitio activo deforma la enzima y el sustrato, estabilizando a las molculas de sustrato en su estado de transicin y permitiendo que los enlaces crticos sean ms susceptibles a ataques catalticos. La distorsin de la enzima implica un cambio conformacional en la misma y, por tanto, en la configuracin del sitio activo. Este cambio posiciona de forma ptima a los grupos reactivos apropiados de la enzima, para la reaccin cataltica en la cual intervienen, aumentando as la probabilidad de que la reaccin se produzca. El papel del sitio activo no es slo reconocer y unir el sustrato apropiado sino tambin activarlo, sumergindolo en el medio qumico necesario para la catlisis. Una determinada reaccin catalizada enzimticamente, puede involucrar a uno o ms recursos de activacin del sustrato. Los tres mecanismos ms comunes son los siguientes:
Hasta el momento, hemos visto que la colisin inicial aleatoria de una
molcula de sustrato sacarosa, en este caso con el sitio activo, tiene como resultado su unin a residuos aminoaclicos que estn posicionados estratgicamente all (Paso 1). La unin del sustrato induce un cambio en la conformacin enzimtica que intensifica el ajuste entre la molcula sustrato y el sitio activo, facilitando de ese modo la conversin del sustrato en los productos, en este caso glucosa y fructosa (Paso 2). Despus, estos productos se liberan desde el sitio activo (Paso 3), permitiendo que la molcula enzimtica regrese a su conformacin original, quedando el sitio activo ahora disponible para admitir otra molcula de sustrato (Paso 4).