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Luca Federico *
Pablo Lorenzano*
1. INTRODUCCIN
Creo que he descubierto el segundo secreto de la vida pronunci una tarde de 1961,
Jacques Monod, 1 al entrar al laboratorio de Agns Ullman en el Instituto Pasteur de Pars.
Cansado, preocupado, con la corbata floja y luego del tercer vaso de whisky, continu:
Crase o no, el rol regulatorio de las protenas alostricas es absolutamente fundamental,
explica todo: la accin hormonal, la funcin del represor, la cintica enzimtica no-
michaelianas; as empez a explicar su descubrimiento que llam alostrico (Ullman,
2004, p. 201).
La bioqumica se establece como matriz disciplinar o programa de investigacin en el
siglo XX, a partir del estudio de los procesos qumicos, en particular de las enzimas, que se
dan en los organismos vivos. Las enzimas son molculas aceleradoras de las velocidades de
reaccin, catalizadores biolgicos, que permiten el mantenimiento de la vida. El llamado
dogma central de la bioqumica (Kohler, 1971, p. 35) es que toda reaccin qumica en
una clula es catalizada por una enzima. El modo en que actan las enzimas ha sido
estudiado en gran medida de acuerdo con sus propiedades cinticas. En 1913, Leonor
Michaelis y Maud Mentel propusieron un modelo que permita, por un lado, explicar su
cintica, diferencindolas de las reacciones qumicas no catalticas, y, por el otro, obtener un
parmetro de la afinidad de las enzimas por las sustancias con las cuales reaccionan. A fines
de los cincuenta, la enzimologa, teora de la bioqumica que se ocupa del anlisis y
caracterizacin de las enzimas, era una teora consolidada. Tanto la cintica de accin
enzimtica como los modelos de inhibicin estaban matematizados (cuando la velocidad de
reaccin disminuye porque p.e. una sustancia que no es con la que reacciona se une y
bloquea la enzima) y se contaba con tcnicas de diagnstico experimental para su estudio.
Sin embargo, aquellas enzimas que eran inhibidas por el producto final de la va metablica
a la que perteneceran no se comportaban segn lo predicho por la teora, p.e. la aspartato-
transcarbamilasa (ATCasa), estudiada por John Gerhart y Arthur Pardee en bacterias, y la
glucgeno fosoforilasa de msculo, analizada por Carl y Gerti Cori y su escuela (ambos
ejemplos ampliamente utilizados en los actuales libros de texto de bioqumica). Sin
embargo, fue Monod, trabajando junto con otros colegas, quien propuso un nuevo modelo
cintico, que no slo explicaba el funcionamiento de stas, sino tambin el de otro tipo de
molcula biolgica: la hemoglobina. En dos artculos publicados en Journal of Molecular
Biology (Monod, Changeux & Jacob, 1963; Monod, Wyman & Changeux, 1965) present su
modelo de interaccin alostrica e introdujo una nueva terminologa para las enzimas.
Las enzimas son macromolculas complejas formadas por una o varias subunidades;
todas tienen un sitio llamado activo que les permite, al unirse con la sustancia reactivo,
catalizar una reaccin qumica. Las enzimas alostricas presentan, adems del sitio activo, el
* Universidad Nacional de Quilmes/CONICET, Roque Senz Pea 352, (B1876BXD) Bernal, Prov. Buenos Aires,
Argentina. Este trabajo, realizado con la ayuda del proyecto de investigacin PICT Redes 2006 N 2007 de la Agencia
Nacional de Promocin Cientfica y Tecnolgica, fue presentado, en el marco del VI Encuentro de Filosofa e Historia de
la Ciencia del Cono Sur, en el Workshop Modelos y representacin en la ciencia, coordinado por Pablo Lorenzano.
1 Premio Nobel de Fisiologa o Medicina en 1965.
denominado sitio alostrico, que une distintas molculas, llamadas moduladores o efectores,
capaces de modificar su velocidad de accin. Estas enzimas estn formadas por ms de una
subunidad y cada subunidad tiene ambos sitios. De manera sucinta, las diferencias cinticas
predichas por este modelo se deben a suponer que cada subunidad de la molcula alostrica
puede estar en dos conformaciones: relajada, R, de alta afinidad por su reactivo, y
tensa, T, de baja afinidad. Las subunidades siempre estn en el mismo estado
conformacional. Al unirse una molcula de reactivo a una subunidad genera un cambio de
conformacin en las restantes aumentando su afinidad por el reactivo, efecto que llam
cooperativo. Dependiendo de la accin que produzca el modulador (aumentar o disminuir la
velocidad de catlisis), generar un cambio de la forma T a R o viceversa. De esta manera
se explica parte del control regulatorio que se ejerce sobre las protenas. En el caso de las
enzimas, sobre aquellas claves para la regulacin de las distintas rutas metablicas.
El objetivo de este trabajo es presentar las lneas de especializacin que capturan los
ejemplos de enzimas alostricas que aparecen en los libros de texto universitarios de
bioqumica y seguir dichas lneas para los ejemplos mencionados ms arriba, a los efectos
de mostrar que, aunque existe una cierta heterogeneidad en la presentacin de los temas,
stos se logran integrar de modo natural en una y la misma teora: la teora de las enzimas o
enzimologa, mediante las herramientas proporcionadas por la concepcin estructuralista de las
teoras cientficas.
2 Para una presentacin ms completa, ver Donolo, Federico & Lorenzano (2007).
As, los distintos ejemplares coinciden en que todos ellos tratan de biotransformaciones,
donde una cierta cantidad de algunas sustancias qumicas, orgnicas o inorgnicas, llamadas reactivos, se
transforman en otra u otras, llamadas productos, en un tiempo dado y con una velocidad dada, mediadas
por una unin qumica especfica. Pero, para capturar completamente los ejemplares
presentados, sta caracterizacin es insuficiente, pues en stos suelen aparecer otros
trminos cuyas extensiones no pueden ser determinadas mediante teoras distintas, tales
como la qumica.
Para ello, entonces, es necesario agregar los trminos o conceptos TE-tericos a los
TE-no-tericos. Estos son las sustancias qumicas llamadas enzimas, que permiten que las
reacciones de biotransformacin ocurran en las condiciones intracelulares; las coenzimas, que
estabilizan las enzimas y las asisten en el transcurso de la biotransformacin; los reguladores,
moduladores o inhibidores, que aceleran o inhiben la reaccin; la constante k, que caracteriza la
afinidad de una enzima por su reactivo; y el conjunto de transformaciones enzimticas, las
transformaciones catalizadas por enzimas.
Las razones por las cuales los conceptos anteriores deberan ser considerados tericos
para la teora TE o TE-tericos son, en breve, las siguientes. Se asume que una sustancia
qumica es una enzima si slo en su presencia se produce una reaccin metablica, ya que
si, p.e., entran en contacto una molcula de ARN o una protena sin accin cataltica con
algn reactivo no generarn un cambio metablico. A su vez, si una sustancia qumica acta
como regulador, modulador o inhibidor, slo lo har en presencia de una enzima. Si no hay
una enzima, es difcil saber a priori si una sustancia es un modulador, un regulador o un
inhibidor. Por ltimo, si bien la constante k est ntimamente relacionada con la relacin de
unin qumica (trmino TE-no-terico), pues el valor que toma k en los nmeros reales
expresa la tendencia que tiene una enzima para unirse con un reactivo o sustrato, lo que en
terminologa de la enzimologa se conoce como afinidad de una enzima por un particular
sustrato, k, tampoco puede detectarse independientemente de la presencia de una enzima;
lo mismo ocurre con las transformaciones enzimticas.
Lo que hasta ahora tenemos son los modelos potenciales M p de TE, o sea, el marco
conceptual de dicha teora sus dominios, relaciones y funciones.
Sin embargo, para capturar en toda su complejidad la nocin de ejemplar, y a su vez la
totalidad de ejemplares aqu descriptos, hace falta expresar la ley fundamental o
generalizacin simblica, en la terminologa de Kuhn de TE, que aparecer adaptada en
distintas formas simblicas especficas en cada uno de stos. La manera de hacerlo es por
medio de la nocin estructuralista de modelo actual M, pues slo sern modelos para esta
teora aquellos que satisfacen la totalidad de las condiciones introducidas, es decir, que,
adems de venir formulados en el marco conceptual de TE, satisfacen su ley fundamental,
implcita en los libros de texto, y que establece lo siguiente:
Todos los cambios metablicos que se dan en cualquier organismo vivo a travs de la
biotransformacin de cierta cantidad de uno o ms reactivos en cierta cantidad de uno o ms productos,
en un tiempo dado y con una velocidad dada, ocurren siempre en presencia de una enzima y en ocasiones
de una coenzima y/o un regulador, mediada por una unin o interaccin qumica especfica.
Para completar el tratamiento de los componentes del ncleo terico K de TE, y tener
reconstruido el elemento terico bsico T de TE, nos faltan explicitar las condiciones de
ligadura C y los vnculos intertericos L. Aqu, sin embargo, debido a cuestiones de
espacio, no nos extenderemos al respecto.
3 Debido a que en los ejemplares presentados las enzimas poseen cintica alostrica, no se mencionan en el cuerpo del
texto las restricciones susceptibles de ser introducidas para las enzimas Michaelis-Menten, dando lugar a una lnea de
especializacin distinta, a partir del segundo tipo de restriccin. Para una presentacin de cmo se capturan estos ltimos,
ver Donolo, Federico & Lorenzano (2007).
actan con coenzima en los sistemas biolgicos pueden actuar como hidrolasas, liasas,
isomerasas, transferasas, oxidorreductasas y sintetasas. Mientras que aquellas que lo hacen
sin coenzima slo actan como hidrolasas o como liasas (Blanco, 2006, p. 127). 4
El quinto tipo de restriccin caracteriza a las enzimas proteicas alostricas que actan
con y sin coenzima y que tienen distinta actividad cataltica (hidrolasa, isomerasa,
transferasa, etc.), segn el modo de regulacin a la cual estn sometidas. Las enzimas
alostricas que pueden estar sometidas slo a un modo de regulacin, por un tipo de
regulador, o a ms de un modo de regulacin, es decir, por distintos tipos de reguladores,
que puede ser de distinto grado de complejidad segn los reguladores que intervengan. En
el caso de estar sometidas a un nico modo de regulacin slo se encontr el tipo
alostrico.
El sexto tipo de restriccin caracteriza, por un lado, las enzimas alostricas sometidas a
un solo modo de regulacin, el alostrico, segn los cambios que ejerce en la cintica de
reaccin los moduladores o efectores. Existen casos de enzimas que estn sometidos a un
solo tipo de modulacin (la positiva o la negativa) y casos de enzimas que estn sometidas a
ambos tipos de modulacin, sufriendo en algn momento modulacin positiva y en otro
negativa, siendo esos moduladores sustancias qumicamente diferentes. Este tipo de
restriccin caracteriza, por otro lado, a las enzimas con ms de un modo de regulacin,
segn estn reguladas por interconversin o regulacin alternativa. Aunque la actividad
de estas enzimas se regule de ms de una forma, hay algunas que, cuando estn bajo control
de un tipo de regulacin, no sufren efecto o accin de otro tipo (regulacin alternativa).
Pero hay otras que pueden padecer, en algn momento, una doble regulacin simultnea,
cuyos efectos se obtienen de la combinacin de ambas (regulacin por interconversin),
adems de la alostrica. En el caso de las enzimas con regulacin alternativa la regulacin
puede ser de dos tipos: modificacin covalente y la alostrica (ya explicada). Las
propiedades catalticas se modifican profundamente por la unin covalente de un pequeo
grupo de sustancias como fsforo. Este cambio en la propiedad cataltica se invierte por
hidrlisis o ruptura del enlace covalente. Como cabra esperar, las enzimas que catalizan la
modificacin covalente tambin estn rigurosamente controladas (Stryer, 1988, pp. 240-
241). Si bien las enzimas en este caso cambian su formula qumica, pues se le agrega una
cierta cantidad de tomos al generarse una unin covalente con el modificador, esto ocurre
antes de la reaccin y persiste despus de la reaccin hasta que se escinda dicha unin por
regulacin hormonal. Por lo tanto, durante la reaccin la enzima permanece inalterada. En
el caso de las enzimas con regulacin por interconversin, en los ejemplos encontrados en
los libros de texto, siempre aparece primero la regulacin covalente y luego la regulacin
alostrica, donde sus efectos se superponen temporalmente. A su vez, cuando la enzima no
se encuentra bajo el efecto covalente es tambin sometida a regulacin alostrica, pero por
otros moduladores. El termino interconversin (Voet & Voet, 2006, p. 659) designa a las
enzimas que pueden interconvertirse entre dos formas con propiedades cinticas y
alostricas distintas, por medio de una serie de reacciones complejas llamadas en conjunto
cascadas cclicas que responden a regulacin hormonal. Para nuestros objetivos es
suficiente con mencionar que estas enzimas responden a un mayor nmero de estmulos
alostricos, exhiben una mayor flexibilidad en sus patrones de control y poseen un
potencial de amplificacin enorme en sus respuestas a las variaciones en las
concentraciones del modulador (Voet & Voet, 2006, p. 659).
El sptimo tipo de restricciones caracteriza a las enzimas con ms de un modo de
regulacin, del tipo alternativa, segn el efecto o la combinacin de efectos catalticos de
los distintos reguladores enzimticos. El efecto de la modificacin covalente puede activar
la catlisis enzimtica, efecto positivo, o inactivarla (inhibirla), efecto negativo. A
continuacin presentamos una tabla donde se postulan todos los posibles casos para las
4 Para una presentacin ms completa ver Donolo, Federico & Lorenzano (2007).
enzimas con regulacin alternativa segn el efecto provocado por la regulacin covalente,
por un lado, y por la regulacin alostrica, por el otro:
Fuente: Blanco, 2006; Stryer, 1988; Nelsons & Cox, 2000; Voet & Voet,
2006.
Fuente: Blanco, 2006; Stryer, 1988; Nelsons & Cox, 2000; en especial, Voet &
Voet, 2006.
5. CONCLUSIN
En el transcurso de este artculo se mostr cmo es posible capturar los ejemplos
paradigmticos o ejemplares pertenecientes a la bioqumica, mediante las nociones
estructuralistas de especializacin, especializacin terminal y de aplicacin exitosa. Aunque, por
cuestiones de espacio, no se capturaron todas las especializaciones terminales y aplicaciones
exitosas presentes en los libros de texto de bioqumica y artculos especializados,
mostramos cul es el procedimiento general de obtencin de ejemplares, tomando en
cuenta los que figuran en la publicacin de Monod y colaboradores donde se expone por
primera vez el modelo alostrico, infaltables en los libros de texto universitarios.
Los ejemplares de las enzimas alostricas se pueden interpretar como aplicaciones
exitosas de las especializaciones terminales (de una rama de especializacin) de TE
aplicaciones del ncleo que han tenido xito en la explicacin de un fenmeno bioqumico
particular dado. De este modo, los distintos ejemplares o aplicaciones exitosas de la teora
de las enzimas o enzimologa, que aparecen en los libros de texto y publicaciones
especializadas de forma desarticulada, pueden ser integrados mediante la nocin
estructuralista de red terica.
BIBLIOGRAFA
BALZER, Wolfgang; MOULINES, C. Ulises; SNEED, Joseph D. An Architecture for Science.
The Structuralist Program. Dordrecht: Reidel, 1987.
BLANCO, Antonio. Qumica biolgica. Buenos Aires: El Ateneo, 2006.
BRENDA ENZYME DATABASE. Disponible en: http://www.brenda-enzymes.info.
DEZ, Jos Antonio; LORENZANO, Pablo. La concepcin estructuralista en el contexto
de la filosofa de la ciencia del siglo XX. Pp. 13-78, en: DEZ, Jos Antonio;
LORENZANO, Pablo (eds.). Desarrollos actuales de la metateora estructuralista: problemas y
discusiones. Quilmes: Universidad Nacional de Quilmes/Universidad Autnoma de
Zacatecas/Universidad Rovira i Virgili, 2002.
DONOLO, Ana; FEDERICO, Luca; LORENZANO, Pablo. La teora de la bioqumica
metablica y sus ejemplos paradigmticos. Pp. 39-59, en Filosofia e histria da biologia 2/
So Paulo: Fundo Mackenzie de Pesquisa (MackPesquisa), 2007.
_______. La estructura de la bioqumica metablica, en LORENZANO, Pablo (ed.). Modelos
y teora en biologa. Buenos Aires: Editorial Prometeo (en prensa).
KOHLER, Robert. The background to Eduar Buchners discovery of cell-free
fermentation. Journal of the History of Biology. 4: 35-61, 1971.
MONOD, Jacques; CHANGEUX, Jean-Pierre; JACOB, Franois. Allosteric proteins and
cellular control systems. Journal of Molecular Biology. 6: 306-320, 1963.
MONOD, Jacques; WYMAN, Jeffries; CHANGEUX, Jean-Pierre. On the nature of
allosteric transitions: a plausible model. Journal of Molecular Biology. 12: 88-118, 1965.
STRYER, Lubert. Bioqumica. Madrid: Revert, 1988.
ULLMANN, Agns. Being around. Pp. 199-207, in ULLMANN, Agns (ed.). Origins of
molecular biology: a tribute to Jacques Monod. Washington, DC: America Society for
Microbiology Press, 2004.
VOET, Donald; VOET, Judith. Bioqumica. Buenos Aires: Panamericana, 2006.