Table 1. Hybridization methods.

Method Target
Southern blot DNA fragments separated by gel electrophoresis
Northern blot RNA fragments separated by gel electrophoresis
Slot/dot blot Total DNA or RNA
Colony blot DNA or RNA in microbial colonies
Fluorescent in situ hybridization (FISH) DNA or RNA in microbial cells
Microarray DNA which is hybridized to probes on an array
Quantitative PCR DNA fragments during PCR amplification

INTERPRETASI MASING-MASING METODE

METODE ELEKTROFORESIS

Makin besar ukuran molekulnya, makin rendah laju migrasinya.

Fragmen DNA yang divisualisasikan di bawah sinar ultraviolet

setelah terlebih dulu direndam di dalam larutan etidium bromid akan
nampak sebagai pita berwarna merah dengan posisi migrasi yang
sesuai dengan berat molekulnya.
METODE DOT BLOT

Dot blot dimulai dengan membut titik sampel ke membrane yang memiliki
perbedan konsentrasi dari sampel dititikkan pada stiap dotnya
Membran diinkubasikan dengan radioaktif prob untuk dicetak di X-ray. Sampel
yang terlacak dengan prob akan memendarkan warna hitam

COLONY BLOD

DETEKSI DNA DENGAN FLUORESCENT