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UPIBI-IPN
[Gua de Prcticas
[2014]
Departamento de Bioprocesos
Academia de Biotecnologa
Realizado por:
NDICE
I. OBJETIVOS 5
II. INTRODUCCIN 5
IV. METODOLOGA 6
I. OBJETIVOS 10
II. INTRODUCCIN 10
IV. METODOLOGA 11
PRACTICA 3. LECTINAS 14
I. OBJETIVOS 14
II. INTRODUCCIN 14
IV. METODOLOGA 15
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I. OBJETIVOS 20
II. INTRODUCCIN 20
IV. METODOLOGA 21
I. OBJETIVOS 23
II. INTRODUCCIN 23
IV. METODOLOGA 24
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4. DISCUSIN 10%
Consistir en la participacin activa de cada alumno durante la sesin de discusin.
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I. OBJETIVOS
Objetivo General
Extraer ADN genmico de Hongos con importancia Farmacutica.
Objetivos especficos
Comprender los fundamentos del proceso de extraccin de ADN genmico
Analizar la calidad del ADN genmico a travs de la electroforesis en gel de agarosa
Analizar la pureza y concentracin del ADN genmico
Obtener el Peso Molecular del ADN genmico
Discutir la importancia de la Ingeniera Gentica dentro de la Farmacutica
II. INTRODUCCIN
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EQUIPO
- Microcentrfuga
- Espectrofotmetro
- Celdas de cuarzo.
- Cmara de Electroforesis
- Campana de extraccin
REACTIVOS
- Arena de cuarzo blanca
- Buffer de extraccin (100 mM TrisHCl pH 8.0, 20 mM Na2EDTA, 0.5M NaCl, 1% SDS)
- Fenol (25 partes): Cloroformo (24 partes): Isoamilico (1 parte)
- Isopropanol fro
- Acetato de sdio 3.0 M pH 5.2
- EtOH 70 %
- Buffer TE (10 mM Tris-HCl, 1 mM Na2EDTA, pH 8.0)
- Buffer de corrimiento TAE 50X (Trisbase, Ac. actico glacial, Na 2EDTA pH 8.0)
- Buffer de carga (Tris, azul de bromofenol y glicerol)
-Gel red (Rojo Texas)
- Marcador de peso de 1Kb como control.
IV. METODOLOGA
Mtodo modificado de Chow and Kafer (Fungal Genet. Newsl. 40:25-27) utilizando Arena de
cuarzo blanca usada como agente pulverizante.
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17.Decantamos sobrenadante y se deja secar el pellet por 20 min. (si se desea se vuelve a
realizar el lavado)
18.Una vez seco el pellet (ADN) se resuspende en 200 ul de buffer TE agua estril.
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Cuando este se encuentra entre 1.8-2.0 la muestra contiene casi exclusivamente ADN.
a) Lleve a cabo un diagrama de flujo del procedimiento efectuado y coloca del lado derecho la
funcin de cada solucin utilizada en el proceso de obtencin de ADN.
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http://www.fgsc.net/fgn44/weiland.html
http://www.uprm.edu/biology/profs/velez/extraccionADN.htm
Fernndez-Perrino F.J.. Sobreproduccin de antibiticos en hongos filamentosos utilizando
tcnicas de Ing. Gentica Depto de Biotecnologa. UAM-Iztapalapa. Mxico D.F. (PDF)
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I. OBJETIVOS
Objetivo General
Analizar la reaccin antgeno- anticuerpo a travs de la tipificacin ABO y Factor Rh de
acuerdo a su importancia nivel farmacutico
Objetivos especficos
Tipificar el grupo sanguneo de una poblacin determinada (grupo de clase)
Comprender el fundamento de la reaccin Ag-Ac en la tipificacin ABO
Discutir las aplicaciones de la tipificacin ABO y factor Rh
II. INTRODUCCIN
El descubrimiento del grupo sanguneo ABO en el ao 1900 por el cientfico austriaco Karl
Landsteiner, caus gran entusiasmo en la comunidad cientfica de la poca. Hasta entonces,
toda la sangre se consideraba igual en todas las personas y no se entendan las consecuencias
a menudo trgicas de las transfusiones de sangre.(1).
Los antgenos ABO son glcidos unidos a protenas y lpidos de la superficie celular que
sintetizan enzimas glucosiltransferasas polimrficas, cuya actividad vara en funcin del alelo
heredado. Los sujetos que expresan un antgeno ABO particular toleran ese antgeno, pero los
sujetos que no expresan ese antgeno producen anticuerpos naturales que reconocen el
antgeno. (2)
Los reactivos para tipificar los antgenos del sistema ABO, se basan en anticuerpos
monoclonales producidos por lneas celulares de hibridomas murinos y ofrecen todas las
ventajas de los reactivos monoclonales actuales, es decir, un comportamiento parejo y un
abastecimiento seguro. Dado que estos reactivos no provienen de fuentes humanas, el riesgo
de transmisin de enfermedades tales como Hepatitis o Sida es nulo (3).
En la reaccin Ag- Ac, los anticuerpos del sistema ABO son principalmente de clase IgM por lo
que son altamente aglutinantes. Propiedad que se emplea para su identificacin (4).
En 1939 Levine y Stetson, luego de que una mujer diera a luz un feto muerto, hallan en el suero
de la misma un anticuerpo que aglutinaba a los glbulos rojos del marido y a los del 80% de la
poblacin ABO compatible.
En 1940 Landsteiner y Wiener inyectan hemates de Macaco Rhesus a un conejo y observan
que ste desarrolla un anticuerpo que aglutina no solo a los eritrocitos del mono sino que
tambin, a los eritrocitos, del 85% de la poblacin caucsica de Nueva York. Quienes suponen
que se trata del mismo anticuerpo descubierto el ao anterior, por lo tanto, proponen como
nombre "Sistema Rh" por analoga con el antisuero producido por el conejo luego de la
sensibilizacin con el Rhesus. En 1942 utilizan el suero del animal como suero anti-Rh. Se
necesitaron casi 20 aos para demostrar que los anticuerpos humanos y los animales no
reaccionaban con el mismo antgeno (Rho), reasignndole a este nuevo sistema el nombre de
LW en honor a sus descubridores; los antgenos de ste sistema son ms frecuentes en
individuos Rh-positivos que en Rh-negativos, de all la concordancia que origin la confusin.
El anticuerpo humano descubierto por Levine y Stetson est dirigido entonces hacia el antgeno
"D" (Rho) del sistema.(5)
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IV. METODOLOGA
Toma de muestra
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1. Aadir una gota del anticuerpo Anti A, B, AB o Rh al lado de la gota de sangre segn
sea el caso. CUIDADO de no tocar con el gotero la gota de sangre ya que
contaminas el reactivo.
2. Mezclar suavemente con un palillo y observar la aglutinacin.
3. Reportar positivo en donde se encuentre aglutinacin, por ejemplo, si aglutina con el
anticuerpo A ser grupo sanguneo A.
4. Colocar los portaobjetos de cada equipo sobre una hoja blanca y tomar foto para el
reporte.
1. Qu son los antgenos del grupo sanguneo ABO? Describe cada uno.
2. En qu clulas se encuentran estos antgenos?
3. Realiza un cuadro con el tipo de Ag presente en la clula, que anticuerpo se produce
en el plasma y el tipo sanguneo
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Clula
http://www.medigraphic.com/pdfs/medlab/myl-2009/myl097-8c.pdf
http://med.unne.edu.ar/catedras/bioquimica/pdf/guia-11.pdf
http://ingemeci.com/productos.html
http://microeinmuno.files.wordpress.com/2011/10/grupos-sanguineos-e-
isohemaglutininas.pdf
http://www.aathi.com.ar/pdfs/sis_rh_lo_que_hay_que_saber.pdf
http://www.galactose.org
http://www.joel-sistem-xd.blogspot.mx/2007/10/herencia-gentica-cromosomas.html
http://mesa8labd.blogspot.mx/2009/10/pruebas-pretransfunsionales.html
http://www.cnts.salud.gob.mx/
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PRACTICA 3. LECTINAS
I. OBJETIVOS
Objetivo general
Adquirir los conocimientos terico-prcticos para la obtencin de compuestos proteicos
con actividad hemoaglutinante a partir de extractos vegetales
Objetivos especficos
Determinar la actividad hemoaglutinante de los extractos obtenidos
Investigar el mtodo de conservacin no destructivo para las lectinas obtenidas
Confirmar los pesos moleculares de las lectinas obtenidas mediante el uso de geles de
poliacrilamida (SDS-PAGE)
II. INTRODUCCIN
Las lectinas son protenas naturales de origen no inmune, ampliamente distribuidas en el reino
Plantae y que muestran una serie de actividades biolgicas que las hacen poderosas
herramientas biotecnolgicas. Las semillas leguminosas son una rica fuente de lectinas y varios
gneros de la subtribu Diocleinae y Phaseoleae, han sido la principal fuente de extraccin de
ellas.
Las lectinas estn presentes en casi todos los seres vivos, pues se han encontrado en el reino
vegetal, animal y en microorganismos. En las plantas se han detectado, principalmente en los
cotiledones y endospermos de las semillas y constituyen del 2 al 10 % del total de las protenas
de stas. En el reino animal se han encontrado en invertebrados, tales como cangrejos,
camarones, caracoles, lombrices y moluscos. En el humano estn presentes
fundamentalmente en la hemolinfa y rganos sexuales.
Las lectinas comparten en comn la propiedad de enlazarse de forma especfica y reversible a
carbohidratos, ya sean libres o que formen parte de estructuras ms complejas. Contienen al
menos dos sitios de unin, de ah que puedan enlazarse en primer lugar a un azcar especfico
y en forma secundaria a una molcula glicosilada. Su importancia se debe fundamentalmente a
sus propiedades biolgicas, tales como aglutinacin de eritrocitos y otras clulas como
linfocitos, espermatozoides, plaquetas, bacterias, induccin de mitosis en linfocitos, efectos
citotxicos sobre linfocitos, aglutinacin de virus y otras.
Actualmente se han estudiado en detalle 9 lecitinas con efecto mitognico sobre los linfocitos,
entre las que se destacan las provenientes de Phaseolus vulgaris (PHA), Canavalia ensiformis
(Con A), Pisum sativum (PSA) y Fitolaca americana (PWM).
Estos mitgenos pueden activar de forma diferente los linfocitos T y B, por ejemplo la PHA y
Con A inducen mitogenicidad en clulas T, mientras que el mitgeno de carmn (PWM) estimula
ambos tipos de clulas. No se conoce lectina alguna que estimule slo a los linfocitos B
humanos. Las lectinas se emplean igualmente en la caracterizacin de grupos sanguneos
humanos, as como en la identificacin de nuevos grupos sanguneos. Aunque tambin hay
evidencia de que la mayora de las lectinas juegan un importante papel en la defensa de las
plantas contra diferentes tipos de organismos herbvoros.
Centrifuga
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REACTIVOS
IV. METODOLOGA
(En caso de no encontrar la especie seleccionada proponer una especie productora de lectinas)
2. De cada especie listada adquirir 50 g, lo mas fresco posible, lavarlas y poner a remojar
durante una hora en una solucin isotnica; en caso de que sean semillas secas poner
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a remojar con la menos cantidad posible de solucin isotnica durante unas 4 horas; en
ambos casos, la solucin debe estar contenida en una matriz que proporcione
suficiente humedad pero que no permita que las semillas estn sumergidas
(embebidas) en la solucin, por ejemplo con torundas de algodn.
3. Transcurrido este tiempo y de ser posible, separar con mucho cuidado el epitelio de la
semilla, y ponerlos a remojar -junto con los cotiledones- durante toda la noche previa a
la sesin de laboratorio en un volumen 1:1 v/m en una solucin buffer (PBS 0.015 M,
pH 7.2, 0.15 M NaCl) o cuando menos en una solucin isotnica (ATENCIN:
conservar la solucin de remojo de toda la noche que ser la solucin de extraccin A),
en el caso de la Triticum vulgaris dejar en remojo el mayor tiempo posible hasta que
germine de ser posible.
4. En la sesin de laboratorio retirar de la solucin de remojo a los epitelios y los
cotiledones y molerlos en un mortero por separado. En caso de que el cotiledn sea
muy pequeo el material crudo se moler finamente junto con su epitelio. Despus del
molido se colocan en 50-100 mL de solucin de remojo por una hora (extraccin B),
transcurrido ese lapso se filtra e igual que la solucin de remojo (solucin extraccin A)
de toda la noche se les hace una extraccin con acetona fra para remover lpidos (2:1,
lquido:lquido). Si se requiere se puede hacer una remocin de slidos con papel filtro
del No. 1.
5. Se remueven las partculas que aparezcan usando una combinacin de centrifugacin
a 200 g 20 minutos y filtrado al vaco con papel Whatman No.1. Se puede optar por
remover los restos de la acetona dejando la muestra dentro de una camapana de
extraccin de humos.
6. El sobrenadante claro (y probablemente amarillezco), se toma una alcuota de 1 mL
para la prueba de hemaglutinacin y otros 5 mL para determinacin de protenas por el
mtodo de Lowry (Hartree, 1972) el de Bradford
7. Determinar el peso molecular aproximado de los compuestos proteicos mediante
electroforesis (SDS-PAGE).
Tratamiento de la muestra.
1. Se limpia con etanol al 70% las placas de vidrio para remover contaminantes.
2. Colocar las placas de vidrio y los separadores en la base para preparar el gel.
3. Preparar el gel separador de acuerdo a lo indicado en la tabla 1 del anexo, adicionando
el persulfato de amonio y el temed al final.
4. Vaciar el gel separador en los vidrios evitando la formacin de burbujas, y alcanzando
un nivel 3 cm por debajo del borde superior. Dejar polimerizar de 20 a 30 minutos.
5. Preparar el gel concentrador de acuerdo a la tabla 2 del anexo.
6. Vaciar en la parte superior y colocar el peine, evitando la formacin de burbujas. Dejar
polimerizar de 15 a 20 minutos.
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ANEXO I
Sol. Acrilamida bisacrilamida 2.5 3.0 3.5 4.0 4.5 5.0 6.0 6.5 7.5
Amortiguador pH 8.8 3.75 3.75 3.75 3.75 3.75 3.75 3.75 3.75 3.75
Agua desionizada 8.75 8.25 7.75 7.25 6.75 6.25 5.25 4.75 3.75
Persulfato de amonio 0.05 0.05 0.05 0.05 0.05 0.05 0.05 0.05 0.05
TEMED 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01
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PREPARACIN DE SOLUCIONES
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Agrawal BBL, Goldstein IJ. 1972. Concanavalin A, the jack bean (Canacalia ensiformis)
phytohemagglutinin, In V Purification of carbohidrate-beinding protein. Ginsberg (ed.), Methods
in enzymology, XXVIII . Academic Press Inc., New York. 313-318.
Dahanukar SA, Kulkarni RA, Rege NN. 2000. Pharmacology of medicinal plants and natural
products. Indian Journal of Pharmacology. 32: S81-S118
Goldstein IJ. Hollerman CE. Merrick JM. 1965. Protein-carbohydrate interaction. I. The
interaction of polysaccharides with concanavalin A. Biochim. Biophys. Acta 97:68-76.
Hartree EF. 1972. Determination of protein: a modification of the Lowry method that gives a
linear photometric response. Analyt. Biochem. 48: 422-427
Hernndez-Daz P, Martn-Gonzlez O, Rodrguez-de-Pablos-Vlez Y, Ganem-Bez FA. 1999.
Aplicaciones de las lectinas. Rev Cubana Hematol Inmunol Hemoter. 15(2):91-5
Mccabe MM, Smith EE. 1975. Relationship between cell-bound dextransucrase and the
agglutination of streptococcus mutans. Infection and Immunity. 12 (3): 512-520.
Monteiro ACO, Walbert E. Muniz-Filho WE, Horta ACG, Beltramini LM, Moreira RA. 1998.
Isolation and partial characterization of a lectin from Canavalia dictyota seeds. Revista
Brasileira de Fisiologia Vegetal, 10(3):167-172.
Wu C, Lovrien R, Matulis D. 1998. Lectin Coprecipitative Isolation from Crudes by Little Rock
Orange Ligand. Analyt. Biochem. 257: 33-39.
Peumans WJ, Van Damme EJM. 1995. Lectins as PIant Defense Proteins. Plant Physiol. 109:
347-352
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I. OBJETIVOS
Objetivo General
Obtener penicilina por varios sistemas de fermentacin.
Objetivos especficos
Comparar el rendimiento de la fermentacin slida y la fermentacin lquida.
Determinar ventajas y desventajas de la produccin y de la extraccin del antibitico.
II. INTRODUCCIN
Existen diferentes clases de antibiticos los cuales tienen un valor econmico importante
debido a su aplicacin clnica, sobre todo en los pases como Mxico en el cual actualmente las
enfermedades de etiologa infecciosa representan el tercer lugar de causa de mortalidad (1),
siendo los de mayor demanda la cefalosporina, penicilinas y tetraciclinas, estas ltimas
representan el 17.5% en ventas del mercado mundial de antibiticos (2) y estn considerados
dentro del Cuadro Bsico de Medicamentos del Sector Salud.
La produccin de tetraciclina se realiza por fermentacin lquida con altos costos de operacin
lo que se refleja en el valor agregado de los productos, por lo que resulta interesante generar
procesos de produccin de antibiticos con aplicacin de biotecnologas alternativas que
resulten ms rentables como en el caso de la fermentacin en estado slido o con el uso de
soportes semislidos, las cuales son ampliamente utilizadas en los pases orientales y presenta
ventajas sobre la fermentacin sumergida (4).
La fermentacin slida se realiza sobre soportes que generalmente son seleccionados de
acuerdo a sus caractersticas, utilizacin y abundancia regional, siendo Mxico un pas con
generacin de una gran cantidad de residuos agroindustriales con poco o ningn
aprovechamiento de los mismos, la utilizacin de estos residuos como soportes en
fermentaciones slidas para la produccin de metabolitos microbianos representa una
alternativa para su aprovechamiento y una mejora ambiental, as como econmica, de las
regiones en las que se producen.
El salvado de trigo por su consistencia y bajo costo, ha sido utilizado como soporte para la
produccin de metabolitos en estado slido de enzimas, cidos orgnicos, entre otros.
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IV. METODOLOGA
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3. Aadir 10 ml del medio inoculado sobre la placa gelificada de agar No. 2 y dejar
solidificar nuevamente.
4. Colocar 2 cilindros sobre las placas gelificadas y aadir 50 l de cada una de las
diluciones, incubar a 37oC por 24 h, medir el halo de inhibicin.
3. Anlisis de todos las variables en funcin del las caractersticas del soporte utilizado.
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I. OBJETIVOS
Objetivo General
Determinar cualitativa y cuantitativamente la presencia de una protena dada en la
muestra problema
Objetivos especficos
Detectar agentes patgenos y su transmisin en muestras.
Detectar antgenos de manera especfica.
Evaluar la presencia de anticuerpos dependientes de procesos fisiolgicos.
II. INTRODUCCIN
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Materiales
Reactivos
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