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774 Rural, Santa Maria, v.45, n.5, p.774-781, mai, 2015 Storck et al. http://dx.doi.org/10.1590/0103-8478cr20131470
ISSN 0103-8478 FITOTECNIA
DelPapa - Software tools for analyzing data for experiments in randomized block design using the
Papadakis method
- REVISO BIBLIOGRFICA -
RESUMO (mean of errors of the neighboring plots), the Scott and Knott
grouping test (P=0.05) is also carried out.
O aplicativo computacional para a anlise de dados
de experimentos executados no delineamento blocos ao acaso, por Key words: experimental precision, spatial variation, accuracy
meio do mtodo usual e de Papadakis, foi desenvolvido em sua measurements, analysis of variance.
primeira verso (no publicada), na linguagem de programao
Pascal. Considerando que o mtodo de Papadakis foi eficiente
para as principais culturas agrcolas (milho, soja, feijo e trigo) INTRODUO
e, para tornar o aplicativo mais amigvel, a verso em Pascal foi
reprogramada em Java, cuja denominao DelPapa. Este aplicativo
<https://sourceforge.net/projects/delpapa/files/?source=navbar> A confiabilidade dos resultados de
realiza a anlise de varincia segundo o delineamento blocos ao uma pesquisa atribuda ao correto planejamento
acaso pelo mtodo usual (estima parmetros genticos, medidas experimental, execuo e anlise estatstica dos
de qualidade experimental e testes dos pressupostos da anlise
de varincia) e pelo mtodo de Papadakis. Usando as mdias
dados coletados. No planejamento, definido o
ajustadas pela covarivel (mdia dos erros das parcelas vizinhas), tamanho e o nmero de unidades experimentais por
tambm realiza o teste Scott e Knott (P=0,05) para agrupar os tratamento, bem como a forma de casualizao dos
tratamentos. tratamentos ou delineamento experimental. Para a
Palavras-chave: preciso experimental, variao espacial,
anlise estatstica dos dados, devem ser testados os
medidas de preciso, anlise de varincia. pressupostos do modelo matemtico e, caso alguma
pressuposio no seja atendida, os dados devem ser
ABSTRACT submetidos a uma transformao adequada ou usar
The software tool for data analysis from experiments
testes no paramtricos. Maior confiabilidade dos
performed in a randomized block design, by the usual manner resultados dos experimentos tambm pode ser obtida
and by the Papadakis method, was developed in its first version por meio da realizao da anlise de covarincia, em
(unpublished), in the Pascal programming language. Whereas que alguma varivel secundria, no relacionada aos
the Papadakis method was efficient for the major crops (corn,
soybeans, beans and wheat) and because of its friendly software tratamentos, usada para reduzir o erro experimental
tools, the Pascal version was reprogrammed in Java, whose name e para ajustar as mdias dos tratamentos (STEEL et
is DelPapa. This software tools <https://sourceforge.net/projects/ al., 1997).
delpapa/files/?source=navbar> makes the analysis of variance
according to a randomized block design by usual manner (estimate
Novos mtodos de anlise estatstica
the genetic parameters, the accuracy measurements and the so ou foram, muitas vezes, de difcil adoo,
verification of assumptions for analysis of variance) and by the principalmente, devido ao volume de clculos
method of Papadakis. Using the adjusted means for the covariate necessrios, aliado inexistncia de aplicativos
I
Universidade Tecnolgica Federal do Paran (UTFPR), Rodovia PR 469, Km 01, 85501-970, Pato Branco, PR, Brasil. E-mail:
lindolfostorck@gmail.com. *Autor para correspondncia.
II
Departamento de Fitotecnia, Universidade Federal de Santa Maria (UFSM), Santa Maria, RS, Brasil.
Recebido 02.11.13 Aprovado 03.11.14 Devolvido pelo autor 30.12.14
CR-2013-1470.R2 Cincia Rural, v.45, n.5, mai, 2015.
DelPapa - Aplicativo computacional para a anlise de dados de experimentos no delineamento blocos... 775
computacionais apropriados, na poca de sua acaso. O aplicativo foi denominado DelPapa, sendo
divulgao. O mtodo de Papadakis (PAPADAKIS, desenvolvido na linguagem de programao Java, o
1937; CARGNELUTTI FILHO et al., 2003) se que o torna independente de sistema operacional, isto
enquadra nesta situao. Trata-se de um mtodo , basta que se tenha a mquina virtual Java instalada
de ajuste espacial, que utiliza as mdias dos erros e o aplicativo pode ser executado em qualquer sistema
experimentais calculadas entre as parcelas vizinhas operacional.
como covarivel, a fim de diminuir a varincia do
erro experimental. No h restrio quanto ao nmero DESENVOLVIMENTO
de parcelas e ao formato dos blocos.
O mtodo de Papadakis possui preciso Anlises executadas no aplicativo DelPapa
das estimativas das mdias e/ou de parmetros Considere o modelo matemtico para os
genticos, no mnimo iguais ao de outros mtodos dados de um experimento no delineamento blocos
de anlise espacial (VIVALDI, 1990; COSTA et al., ao acaso: Yij=m+ti+bj+eij, em que Yij o valor
2005; CANDIDO et al., 2009). Estudos de simulao observado, referente varivel Y, na parcela que
(PEARCE, 1998) mostraram que o uso do mtodo recebeu o tratamento i (i=1, 2, ..., I), localizada no
de Papadakis implica estimativas dos contrastes no bloco j (j=1, 2, ..., J); m uma constante; ti o efeito
tendenciosas e uma importante reduo na estimativa do tratamento i; bj o efeito aleatrio do bloco j; e
do erro experimental, principalmente em ensaios com eij o efeito aleatrio do erro experimental (variao
formato retangular. Vrias aplicaes do mtodo de no controlada) referente observao ij. Com os
Papadakis, em culturas de milho (CARGNELUTTI valores observados de um experimento, segundo
FILHO et al., 2003; STORCK et al., 2010), de este modelo, realizada anlise de varincia pelo
soja (STORCK et al., 2008; STORCK et al., 2009; mtodo usual (STEEL et al., 1997). Desta anlise, o
STORCK & RIBEIRO, 2011), de feijo (STORCK et aplicativo disponibiliza: quadrado mdio de bloco
al., 2011) e de trigo (BENIN et al., 2013; STORCK & (QMb) e os respectivos valores do teste F e valor-P
SILVA, 2014), tm mostrado importantes vantagens de significncia; o quadrado mdio de tratamento
desse mtodo. Nestes estudos, foram observadas (QMg) e os respectivos valores do teste F e valor-P
redues do coeficiente de variao, da diferena de significncia; o quadrado mdio do erro (QMe); a
mnima significativa entre mdias de tratamentos e mdia geral ( ).
aumentos da acurcia seletiva, da herdabilidade, do A eficincia relativa do uso de blocos em
ndice de diferenciao de Fasoulas e do coeficiente relao ao delineamento inteiramente casualizado
de determinao do modelo. Tambm foi observado (ERb=100[((J-1)QMb+(I-1)(J-1)QMe)/(I(J-1)]/
aumento no coeficiente de repetibilidade e, por QMe), em percentagem, importante quando o
consequncia, reduo no nmero de repeties efeito de blocos significativo e informa sobre a
necessrios para um coeficiente de determinao necessidade do uso de blocos em ensaios futuros na
de valor pr-estabelecido. Foram mantidas as mesma rea experimental. A acurcia seletiva (AS)
condies dos pressupostos para a anlise de estimada como sendo: AS = (1-1/F)1/2, para F>1; e
varincia (aditividade, normalidade, aleatoriedade e AS=0, para F<1, em que F o valor do teste F para
homogeneidade de varincias). tratamento. Ensaios com AS>0,90 tm preciso
Um aplicativo computacional para a muito alta; para 0,70<AS<0,90 preciso alta; para
anlise de experimentos executados no delineamento 0,50<AS<0,70 preciso moderada; e AS<0,50
blocos ao acaso, por meio do mtodo usual e de preciso baixa (RESENDE & DUARTE, 2007). O
Papadakis, foi desenvolvido em sua primeira verso coeficiente de variao do erro experimental (CVe),
(no publicada), na linguagem de programao em percentagem, , uma estimativa
Pascal. No entanto, a utilizao do aplicativo no da preciso experimental a ser usada para comparar
era to amigvel. Assim, considerando a eficincia ensaios semelhantes.
do mtodo, a disponibilizao de um aplicativo mais Resultados importantes para o
amigvel, isto , de uso mais intuitivo, importante melhoramento de plantas (STORCK & RIBEIRO,
para a qualificao da anlise de dados. 2011), quando os tratamentos so aleatrios, como:
Assim, este trabalho tem por objetivo varincia gentica mdia [Vgm=QMg - QMe/J];
apresentar o aplicativo computacional referente coeficiente de variao gentico, em percentagem
ao mtodo de Papadakis, que pode ser utilizado ; proporo de variao
para a anlise de dados obtidos de experimentos gentico/ambiental (CVg/CVe); varincia fenotpica
conduzidos, em campo, no delineamento blocos ao mdia (Vfm= QMg/J); varincia ambiental mdia
Figura 1 - Mapa de um experimento de 14 tratamentos (T1, T2, ..., T14) no delineamento blocos ao acaso com trs
repeties (B1, B2 e B3) e parcelas dispostas em trs filas (F1, F2 e F3) e 14 colunas (C1, C2, ..., C14) na
parte (A, tratamentos) e respectivos valores da varivel observada (produtividade de gros de feijo, kg ha-1)
na parte (B, dados de STORCK et al., 2011), estimativas dos erros sobre as parcelas (C) e as estimativas da
covarivel (D, mdia dos erros nas parcelas vizinhas).
aleatoriedade e homogeneidade das varincias) de Cij. A partir das informaes da Figura 1(A e B),
A anlise de varincia dos valores de Cij, segundo o o usurio do aplicativo DelPapa deve preparar o arquivo
modelo blocos ao acaso, estima o quadrado mdio de com os dados para a anlise. Neste arquivo (de preferncia,
bloco, valor do teste F e respectivo valor-P do teste, em planilha de dados), deve escrever os valores nas
mostrando que o efeito de bloco, em geral, permanece respectivas colunas. Na coluna Bloco, deve escrever o
presente. Tambm estimado o QMg e respectivo nmero do bloco, variando de 1 at J = 3 (no exemplo); na
valor do teste F e valor-P, mostrando a ausncia do coluna Tratamento, deve escrever o nmero da cultivar,
efeito de tratamento. variando de 1 at I=14 (no exemplo); na coluna Fila,
Na sequncia, o aplicativo DelPapa, deve escrever o nmero da fila, variando de 1 at nmero
realiza a anlise de covarincia, segundo o modelo de filas (no exemplo = 3), na coluna Coluna, deve
escrever o nmero da coluna, variando de 1 at nmero
, com testes de hipteses de colunas (no exemplo = 14); e, na coluna varivel,
do efeito linear () da covarivel (Cij) e do efeito de deve escrever os respectivos valores das parcelas (Figura
tratamentos ajustados, conforme STEEL et al. (1997). 1B). Neste arquivo, os dados podem estar ordenados por
So obtidas as estimativas de amplitude (H) entre qualquer um dos indexadores (bloco, tratamento, fila e
mdias ajustadas dos tratamentos, CV, D, DMS, HD, coluna) ou at pela magnitude da varivel resposta. Usar
IDF, R2 e AS. Tambm estimada a eficincia relativa o ponto para separar os decimais. Gravar o arquivo
do uso da anlise de covarincia em relao ao uso com os dados com o nome.CSV (a partir da planilha
da anlise de varincia, segundo o delineamento dos dados, Salvar como outros formatos => tipo =
blocos ao acaso. As hipteses dos pressupostos CSV (separado por vrgulas)) num endereo conhecido.
(normalidade, aleatoriedade e homogeneidade das O arquivo tambm pode ser copiado e colado em editor
varincias), referentes ao erro no modelo de anlise de texto e gravado como nome.txt e, posteriormente,
de covarincia, so testadas. realizado o teste do renomeado como nome.CSV.
paralelismo entre os tratamentos para o efeito linear As diversas variveis respostas de um
da covarivel (SEBER, 1976). A hiptese testada experimento so analisadas individualmente, ou seja,
H0: 1= 2=...= I, com P=0,05. A falta de paralelismo deve haver uma submisso para cada varivel. O
entre os tratamentos implica diferenas nos graus da usurio pode obter um tutorial completo referente ao
sensibilidade dos tratamentos em relao variao uso do aplicativo no endereo <https://sourceforge.
do erro mdio, fato que pode causar tendenciosidade net/projects/delpapa/files/?source=navbar>, junto com
no ajuste das mdias de tratamentos. o aplicativo DelPapa.
testada a hiptese de que o mtodo de
Papadakis reduz a varincia do erro experimental, CONCLUSO
em relao ao delineamento blocos ao acaso, por
meio da estatstica F = QMe/QMEA, em que: QMe o O nome do aplicativo DelPapa composto
quadrado mdio do erro da anlise de varincia com por Del+Papa, Del de delineamento e Papa de mtodo
delineamento blocos ao acaso; e QMEA o quadrado de Papadakis. A implementao do DelPapa em Java
mdio do erro ajustado pelo mtodo de Papadakis, ou permite que o aplicativo seja executado em qualquer
da anlise de covarincia. sistema operacional, desde que a mquina virtual Java
As mdias ajustados ( ) dos tratamentos (Java Runtime Environment - JRE) esteja instalada,
so calculadas por abrangendo um grande nmero de potenciais usurios.
, com Alm disso, o aplicativo est disponibilizado sob a
as quais realizado o teste de comparao de mdias licena GPL v3, no endereo <https://sourceforge.net/
ajustadas pelo mtodo de Scott e Knott (P=0,05) projects/delpapa/files/?source=navbar>. Como est
(RAMALHO et al. 2005). disponvel sob a licena GPL v3, permite que qualquer
usurio possa usar o aplicativo livremente, assim
Preparo dos dados e anlise no aplicativo DelPapa como possa distribu-lo e mesmo possa aperfeioar
O usurio deve organizar os dados sobre um o aplicativo, visto que o cdigo fonte tambm est
mapa do experimento (Figura 1A), ou seja, a identificao disponvel na pgina.
da posio relativa de cada parcela no espao fsico Em princpio, possvel aplicar o mtodo
(nmero da fila = F; nmero da coluna = C, tal que F<C) de Papadakis, usando o aplicativo DelPapa, para
e o respectivo nmero do tratamento e do bloco (B). Com qualquer varivel avaliada em experimentos de
a identificao espacial (F x C) de cada parcela, os dados campo, cujos tratamentos so qualitativos e que se
do experimento so registrados (Figura 1B). quer comparar as mdias ajustadas pela covarivel
de natureza espacial. No entanto, dependendo do tipo colunas (Tabela 1): primeira coluna, para os resultados
de tratamento, algumas estatsticas podem no ter da varivel original; segunda coluna, para os resultados
significado, como, por exemplo, a varincia gentica, o da covarivel; e terceira coluna, para os resultados pelo
coeficiente de variao gentico e de herdabilidade e a mtodo de Papadakis. A comparao dos resultados
acurcia seletiva, para tratamentos de manejo cultural (estatsticas que estimam a preciso experimental)
ou tratamentos fitossanitrios entre outros. Diferentes obtidos nas diferentes colunas permite inferir sobre
variveis do mesmo experimento podem resultar em a eficincia do uso do mtodo de Papadakis. Esta
diferentes graus de eficincia do mtodo. A sada dos comparao pode ser importante quando forem
resultados da anlise apresentada numa tabela de trs analisados vrios experimentos.
Tabela 1 - Modelo de sada dos resultados para os dados da parte inferior da figura 1.
O leitor pode observar que o nmero de deste mtodo e consolidar as vantagens e a eficincia
estatsticas descritas grande e diversificado (Tabela 1), nas mais diferentes situaes (culturas, variveis
podendo ser agrupadas pela sua importncia. No primeiro respostas e tratamentos). Assim, este aplicativo
grupo de estatsticas, so consideradas aquelas de interesse pode auxiliar no convencimento para o uso rotineiro
na comparao de tratamentos: significncia do efeito da prtica desta e/ou de outras prticas de anlises
de tratamento (sem e com Papadakis) e teste de Scott e espaciais com maior preciso. Por fim, os autores
Knott com mdias ajustadas (Tabela 2). Num segundo esperam contar com a avaliao e a crtica referente
grupo, esto as medidas de preciso experimental: a este aplicativo.
acurcia seletiva, valor do teste F para tratamento,
herdabilidade, diferena mnima significativa, AGRADECIMENTOS
coeficiente de variao do erro experimental, ndice
de diferenciao de Fasoulas e coeficiente de Ao Conselho Nacional de Desenvolvimento
determinao do modelo. Num terceiro grupo, esto as Cientfico e Tecnolgico (CNPq) (bolsas de produtividade em
pesquisa) e a Coordenao de Aperfeioamento de Pessoal de
informaes quanto ao atendimento aos pressupostos: Nvel Superio (CAPES) (Edital 6/2012, PVNS).
normalidade dos erros, aditividade do modelo,
homogeneidade de varincias e aleatoriedade dos REFERNCIAS
erros. Num quarto grupo, esto algumas estatsticas de
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