Gua Docente AS0001-GR0001-PR0001

Asignatura:Ecologa Microbiana
Cdigo: 13794
Grupo:
Titulacin: Licenciatura en Biologa
Profesor/a: Ana Isabel Lpez Archilla
Curso Acadmico: 2011-2012

1. ASIGNATURA / COURSE

1.1. Nombre / Course Title

ECOLOGA MICROBIANA/ MICROBIAL ECOLOGY

1.2. Cdigo / Course Code

13794

1.3. Tipo / Type of course

Formacin optativa /Elective subject

1.4. Nivel / Level of course

Grado / Grade

1.5. Curso / Year of course

4 /4th

1.6. Semestre / Semester

2/ 2nd

1.7. Nmero de crditos / Number of Credits Allocated

9 crditos: 6 Tericos, 3 Prcticos

1.8. Requisitos Previos / Prerequisites

Se recomienda haber cursado previamente las asignaturas de Microbiologa,
Bioqumica y Ecologa
It is highly recommended that Microbiology, Biochemistry and Ecology courses
have been followed in advance

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Asignatura:Ecologa Microbiana
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Profesor/a: Ana Isabel Lpez Archilla
Curso Acadmico: 2011-2012

1.9. Es obligatoria la asistencia ? / Is attendance to

class mandatory?
SI / Yes

1.10. Datos del profesor/a / profesores / Faculty Data

Ana Isabel Lpez Archilla Departamento: Ecologa

Facultad: Ciencias
Telfono: 91 4978013
e-mail: anabel.lopez@uam.es
Pgina Web:
http://www.uam.es/anabel.lopez
Horario de Tutoras Generales: A determinar
consensuadamente con los alumnos

1.11. OBJETIVOS DEL CURSO /OBJETIVE OF THE COURSE

OBJETIVOS

- El objetivo general es que el alumno alcance un cuerpo de

conocimientos bsicos sobre el papel y la importancia del mundo
microbiano y sus actividades en el funcionamiento del ecosistema
terrestre global.
- Los objetivos especficos se enmarcan dentro de los distintos bloques
temticos en los que se divide la asignatura:
- Ser conscientes de la enorme diversidad metablica del mundo
microbiano y su impacto sobre la dinmica de la biosfera, actual y
pasada.
- Reconocer el papel de los microorganismos en el funcionamiento de los
ecosistemas, dentro de sus distintos niveles trficos, y en la dinmica de
los ciclos biogeoqumicos
- Conocer la amplia red de interacciones que establecen los
microorganismos con todo el resto de seres vivos y la influencia que
ejercen, a travs de ellas, sobre su actividad
- Analizar la composicin, diversidad e importancia de la actividad
microbiana en los ambientes naturales.
- Reconocer el papel que juegan los microorganismos como reguladores
del equilibrio global de nuestro planeta y analizar las posibles
consecuencias derivadas de la perturbacin, sobre todo antrpica, de
estos mecanismos de control

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Curso Acadmico: 2011-2012

COMPETENCIAS

En esta asignatura se pretende que el alumno adquiera la capacidad de

relacionar distintos tipos de fenmenos medioambientales con las diversas
actividades desarrolladas por los microorganismos en el medio.

Se pretende tambin que aborden los problemas desde una perspectiva

multidisciplinar que facilite su resolucin de una forma eficaz bajo una
perspectiva holstica.

As mismo, a travs de las tcnicas aprendidas en las clases prcticas, los

alumnos podrn manejar las metodologas bsicas para el estudio de la
comunidad microbiana de medios naturales y aplicar las normativas en vigor
para el control microbiolgico ambiental, requeridas en el mundo laboral.

Mediante la elaboracin de la memoria de prcticas y el desarrollo de trabajos

bibliogrficos y seminarios, los alumnos adquirirn las habilidades de sntesis,
anlisis y exposicin requeridas para su formacin universitaria, con vistas a su
insercin en el mundo laboral

1.12 . Contenidos del Programa / Course Contents

CONTENIDOS TERICOS

PARTE I: INTRODUCCIN. ENERGTICA Y EVOLUCIN MICROBIANA

1.- Desarrollo histrico y perspectivas futuras de la Ecologa Microbiana
2.-Tipos fisiolgicos de microorganismos. Bases de la energtica
microbiana
3.- Diversidad de los mecanismos energticos microbianos
4.- Registro fsil microbiano. Evolucin de los mecanismos energticos
5.- Ecosistemas microbianos en la tierra primitiva. Caractersticas de
nuestro planeta derivadas de la actividad microbiana
6.- Diversidad Filogentica microbiana.

PARTE II: LOS MICROORGANISMOS EN EL FUNCIONAMIENTO DE LOS

ECOSISTEMAS
7.- Estructura y funcionamiento de los ecosistemas: El papel de los
microorganismos. Crecimiento planctnico y en biopelculas (biofilms).
Efecto de las condiciones ambientales sobre el crecimiento de los
microorganismos
8.- Los microorganismos como productores primarios.

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9.- Los microorganismos como consumidores/descomponedores. El bucle

microbiano.
10.- Papel de los microorganismos en el funcionamiento y regulacin de
los ciclos biogeoqumicos. Implicaciones microbianas en el cambio
climtico. Ciclo del carbono. Ciclo del nitrgeno
11.-. Ciclo del azufre. Transformaciones microbianas del fsforo. Ciclo
del hierro

PARTE III: INTERACCIONES MICROBIANAS

12.-Tipos de interacciones biolgicas. El papel de las interacciones en el
proceso evolutivo. Interacciones microorganismo-microorganismo
13.- Interacciones microorganismos-plantas
14.- Interacciones microorganismos-animales

PARTE IV: COMUNIDADES MICROBIANAS EN AMBIENTES NATURALES.

MICROBIOLOGA AMBIENTAL
15.- El ambiente terrestre: Caractersticas y origen del suelo.
Comunidades microbianas edficas. Flujo energtico. La biosfera del
subsuelo profundo
16.- El ambiente acutico. Tipos de medios acuticos. Los sedimentos
como hbitat microbiano. Comunidades microbianas en el medio marino.
Flujo energtico. Comunidades microbianas quimiolitotrofas en los oasis
de las profundidades.
17. Comunidades microbianas en medios acuticos continentales. Lagos,
humedales y ros. Flujo energtico
18.- Microbiologa del aire. Caractersticas generales. Dispersin de
microorganismos. Microorganismos en ambientes cerrados y abiertos.

CONTENIDOS PRCTICOS
Prcticas intensivas de laboratorio, que abordarn las tcnicas bsicas de
Ecologa Microbiana aplicadas a diferentes tipos de sistemas naturales, la
aplicacin de normativas de control microbiolgico, cultivos de
enriquecimiento y estudio de comunidades microbianas

Microorganismos del suelo

Anlisis Microbiolgico Ambiental
Control Microbiolgico del Aire
Control Microbiolgico de Superficies
Control Microbiolgico de Personal
Control Microbiolgico de Calidad de Aguas
Efecto de la Radiacin Ultravioleta sobre los Microorganismos

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Columna de Winogradsky
Tapetes Microbianos

1.13 . Referencias de Consulta Bsicas / Recommended

Reading.

ATLAS, R.M. and BARTHA, R (4th ed). Ecologa Microbiana y Microbiologa

Ambiental (2002) Prentice Hall.
ATLAS, R.M. (1990) Microbiologa: Fundamentos y aplicaciones. CECSA, Mxico
BROCK, T.D., BROCK, K. & WARD, D. (1986). Basic Microbiology with
Applications. Prentice Hall
COYNE, M. (2000) Microbiologa del suelo: Un enfoque exploratorio. Paraninfo
DIXON, B. (1994). Power unseen: How Microbes Rule the World. W.H.Freeman
FENCHEL, T., KING, G.M. & BLACKBURN, T.H. (1998). Bacterial
Biogeochemistry: The Ecophysiology of Mineral Cycling. Academic Press
GRANT, W.D. & LONG, P.E. (1981). Environmental Microbiology. Black.
HURST, CH.J. (1997). Manual of Environmental Microbiology. American Society
for Microbiology Press
LYNCH, I.M. & POOLE, M.J. (1988) (2nd ed). Microorganisms in Action:
Concepts and Applications in Microbial Ecology. Blackwell.
LYNCH, I.M. and POOLE, M.J. (1984) Microbial Ecology: A Conceptual Approach.
MADIGAN, M.E., MARTINKO, J.M. & PARKER, J. (2004) (10 ed). Brock Biologa de
los microorganismos. Pearson Educacin, Prentice Hall
McARTHUR, J.V. (2006) Microbial Ecology: An Evolutionary Approach. Academic
Press (Elsevier)
MITCHELL, R. (1992). Environmental Microbiology. Wiley-Liss
MUOZ, E. (1991). Genes para cenar. Ediciones Temas de Hoy.
PARS, R. and JUREZ, A. (1997) Bioqumica de los microorganismos. Ed.
Revert
PETTS,G. and CALOW, P. (1996). River biota. Diversity and Dynamics. Blakcwell
Sci.
POSTGATE, J. (2000) (4th). Microbes and Man. Cambrigde University Press.
POSTGATE, J. Las fronteras de la vida (1995). Ed Crtica (Grijalbo Mondadori)

SCHAECHTER, M; INGRAHAM, J.L. and NEIDHARDT, F.C. (2006) Microbe. ASM

Press, Washington
SCHOPF, J.W. (1992) Major Events in the History of Life. Jones& Bartlett
SECKBACH, J. (2000) Journey to Diverse Microbial Worlds. Adaptation to Exotic
Environments. Kluwer Acad. Publ.
SIGEE, D.C. (2005). Freshwater Microbiology. J. Wiley&Sons

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STOLP, H. (1988). Microbial Ecology: Organisms, Habitat and Activity.

Cambridge University Press.
THURMAN, H.V. (1993) (4th ed) Essentials of Oceanography. Macmillan Pu.Co

Enlaces de Inters

Artculos sobre biofilms

Harrison J.J., Turner, R.J, Marques, L.L. & Ceri, H. (2006) Biopelculas.
Investigacin y Ciencia, Marzo, 2006

Hall-Stoodley, L., Costerton, J.W. & Stoodley, P. (2004) Bacterial biofilms:

From the natural environment to infectious diseases. Nature Reviews
Microbiology, 2:95-108

Nikolaev, Yu.A. & Plakunov, V.K. (2007) Biofilm- "City of Microbes" or an

analogue of multicellular organisms? Microbiology, 76 (2): 125-138

ParseK, M.R. & Greenberg, E.P. (2005) Sociomicrobiology: The connections

between quorum sensing and biofilms Trends in Microbiology,13 (1):27-33

Artculo loop microbiano en suelos

Bonkowski, M. (2004) Protozoa and plant growth: The microbial loop in soil
revisited. New Phytologist, 162:617-631

Artculo sobre transformaciones del hierro

Weber, K.A, Acenbach, L.A. & Coates, J.D.(2006) Microorganisms pumping

iron: anaerobic microbial iron oxidation Nature Reviews/Microbiology, 4:752-
764 (www.nature.com/reviews/micro)

Artculo sobre el papel de los antibiticos en los medios naturales

Davies, J. (2006). Are antibiotics naturally antibiotics?

J.Ind.Microbiol.Biotech., 33:496-499

Blogs de Microbiologa

http://weblogs.madrimasd.org/microbiologia/

http://schaechter.asmblog.org/schaechter/

http://curiosidadesdelamicrobiologia.blogspot.com/

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Monografa de Ecologa Microbiana

Seleccin de artculos monogrficos de Ecologa Microbiana

http://www.revistaecosistemas.net/

Ao 2005, n2

Artculos recientes de revisin sobre microbiologa del medio marino

www.nature.com/reviews/micro

Vol 5 (Octubre 2007)

2 Mtodos Docentes / Teaching methods

Actividades presenciales

- Clases tericas. Cuatro horas por semana

- Clases prcticas. Cinco sesiones de prcticas de laboratorio (4 horas de
duracin cada una), una salida de campo (5 horas), ejercicios prcticos
de gabinete de autoevaluacin de los conocimientos que se van
adquiriendo a lo largo del desarrollo del temario (5 horas).

Actividades dirigidas

- Trabajos individuales: Trabajos bibliogrficos y exposicin de seminarios

en clase, realizados individualmente (5 sesiones de 1 hora). La
orientacin de los trabajos se discute en las horas de tutora
- Docencia en red: Pgina web de docencia, con toda la informacin del
curso (programa, prcticas, actividades, normas de la asignatura),
presentaciones de clase, bibliografa especfica y enlaces recomendados
- Tutoras ( Incluidas virtuales): Presenciales, en el horario indicado, y
virtuales a travs del correo electrnico

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3 Tiempo estimado de Trabajo del

Estudiante / Estimated workload for the
student
168 horas
Factores de ponderacin:
60 horas de teora x 2 = 120
30 horas de prcticas x 1,5 = 45
Un examen = 3 horas
Complemento de trabajo individual = 20 horas (optativo)

4 Mtodos de Evaluacin y Porcentaje en la

Calificacin Final / Assessment Methods
and Percentage in the Final marks
Descripcin detallada del procedimiento para la evaluacin

Para la evaluacin de la asignatura se tienen en cuenta dos aspectos:

- Un examen escrito realizado al finalizar el curso

- Una memoria de prcticas que refleje las actividades realizadas y la
comprensin de las mismas.

Para superar la asignatura ambos aspectos tienen que ser aprobados por
separado. La asistencia a prcticas consume convocatoria (an cuando el
alumno no se presente al examen de teora).

Dado el carcter voluntario de los trabajos bibliogrficos y exposicin de

seminarios, la calificacin obtenida de esta actividad slo ser tenida en
cuenta para mejorar la nota final.
El estudiante que no haya superado el examen escrito pero haya cursado y
superado las prcticas de la asignatura, podr solicitar la convalidacin de las
mismas para el curso siguiente, en cuyo caso conservar la calificacin
obtenida. En este caso, se considerarn consumidas las convocatorias que
medien hasta que apruebe la teora, independientemente de que se presente a
las mismas o no.

Porcentaje en la calificacin final

Examen escrito: 70%
Memoria de actividades prcticas: 30%

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5 Cronograma de Actividades (opcional) /

Activities Chronogram (optional)
Calendario de pruebas peridicas:

Habr una prueba escrita ordinaria y otra extraordinaria cuyas fechas sern
aprobadas por la Junta de Facultad.

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