Metabolismo es una actividad celular muy coordinada

de sistemas multienzimáticos para

(1) obtener energía química degradando nutrientes ricos en

energía obtenidos del ambiente;

(2) convertir moléculas nutrientes en las moléculas

características de la propia célula;

(3) polimerizar los precursores monoméricos en

macromoléculas: proteínas, ácidos nucleicos, y polisacáridos,

(4) sintetizar y degradar biomoléculas para funciones

celulares especializadas, tales como los lípidos de membrana,
mensajeros intracelulares y pigmentos.
Bioenergética

• es el estudio cuantitativo de las

transducciones de energía, (cambios de
una forma de energía en otra),
• relaciones energéticas y las
• conversiones de energía en los sistemas
biológicos.

Las transformaciones de energía biológicas

siguen las leyes de la termodinámica.
Los PRINCIPIOS DE LA TERMODINÁMICA están
relacionados con sus aspectos cuantitativos

Primera ley: principio de conservación de la energía:

en cualquier cambio físico o químico, la cantidad

total de energía en el universo permanece constante;
la energía puede cambiar de forma o puede ser
transportada de una región a otra, pero no puede
ser creada, o destruida.

Segunda ley de la termodinámica, el universo

tiende siempre hacia un aumento del desorden:

en todos los procesos naturales, aumenta la entropía

del universo.
Los organismos vivos consisten en:

Un sistema de moléculas mucho más

organizadas que los materiales circundantes

a partir de las cuales están construidas

mantienen y producen orden

aparentemente en contra de la segunda Ley

El sistema de reacción:

es el conjunto de materia que está

experimentando un proceso
químico o físico determinado;

puede ser tanto un organismo

como una célula o dos
compuestos químicos que
reaccionan.
El sistema de reacción y su entorno
conjuntamente constituyen el universo.

Las células (organismos vivos) son

sistemas abiertos que intercambian con
su entorno tanto materiales como energía

los sistemas vivos no se encuentran nunca

en equilibrio con su entorno

las constantes transacciones entre el

sistema y el entorno explican cómo los
organismos pueden crear orden en su
interior al tiempo que operan dentro de la
segunda ley de la termodinámica.
Las células vivas realizan trabajo constantemente.

Necesitan energía para:

• mantener sus estructuras muy organizadas
• sintetizar los componentes celulares y
• generar corrientes eléctricas,

entre otros muchos otros procesos.

La energía libre de Gibbs, G:

expresa la cantidad de energía capaz de

realizar trabajo durante una reacción
(a temperatura y presión constantes)

ΔG, con signo (-): la reacción es exergónica.

ΔG, con signo (-): la reacción es exergónica.

Entalpía, H: contenido calórico del sistema de reacción.

Refleja el número y la clase de enlaces químicos en los reactivos y los

productos.

Reacción química libera calor, es una reacción exotérmica

Reacción química adquiere calor, es endotérmica

contenido calórico de productos < de los reactivos ΔH +

contenido calórico de productos > de los reactivos ΔH –

Por convención

ΔH, (-) tiene signo negativo cuando se libera calor del sistema a su entorno

Las unidades de H son:

joules/mol (J/mol) calorías/mol (cal/mol)
La entropía, S, es una expresión cuantitativa del
desorden de un sistema

Cuando los productos de una reacción son menos complejos

y más desordenados que los reactivos, se afirma que la
reacción transcurre con ganancia de entropía.

ΔS (+) tiene signo positivo cuando aumenta la entropía

Las unidades de entropía (S) son:

joules/mol - Kelvin (J/mol - K)

Las unidades de ΔG y ΔH son:
joules/mol (J/mol)
calorías/mol (cal/mol)

Las unidades de la variación de entropía ΔS son:

joules/mol X ºKelvin (J/mol X ºK)
1 cal = 4,184 Jul 1 Jul = 0,239 cal
En las condiciones existentes en los
sistemas biológicos
(a temperatura y presión constantes),

Las variaciones en energía libre, entalpía y

entropía están relacionadas
cuantitativamente entre sí por la ecuación

ΔG = ΔH - TΔS
Desde un punto de vista termodinámico,

cuando en una reacción en la que una sustancia A se convierte en otra B,

la variación de energía libre ΔG de esta reacción será en función de la

energía libre de ambas moléculas en el equilibrio.

Si la de A>B la reacción es exergónica.

Si la de A es < B la reacción es endergónica

Es decir

ΔG = GB - GA

Cuando GB > GA , ΔG < 0 es decir negativa ( - )

Cuando GB < GA , ΔG > 0 es decir negativa ( + )

Todas las reacciones químicas están influidas por
dos fuerzas:
• Tendencia a adquirir el estado de enlace
energéticamente más estable (entalpía H) y
• Tendencia a conseguir el mayor grado de
desorden (entropía S).

La fuerza impulsora neta en una reacción es

ΔG, o variación de energía libre,

que representa el efecto neto de estos dos factores:

ΔG = ΔH - TΔS
 Todas las células
precisan fuentes de energía libre
Las células son sistemas isotérmicos

Funcionan a temperatura y presión prácticamente constantes.

El flujo de calor no es una fuente de energía para las células

porque el calor puede realizar trabajo solamente cuando pasa a
una zona u objeto a menor temperatura.

Las células sólo pueden utilizar la energía libre (de Gibbs, G),

que al ser heterotróficas la obtienen de las moléculas de

nutrientes

que transforman en ATP y otros compuestos ricos en energía

capaces de proporcionar energía para trabajo biológico a
temperatura y presión constante.
La ΔG para la oxidación completa de
la Glucosa a CO2 y H20 es de

- 686.000 cal/ mol de glucosa

 La variación de energía libre
estándar está directamente
relacionada con la constante de
equilibrio
Los cambios entre reactivos y productos
en un sistema de reacción continúan hasta
que se llega al equilibrio.

En la concentración de equilibrio

las velocidades de las reacciones directa e

inversa son exactamente iguales y no se
produce ningún cambio neto más en el
sistema.
Las concentraciones de reactivos y productos en el equilibrio definen la
constante de equilibrio, Keq

En la reacción general
aA + bB  cC + dD

a, b, c y d son el número de moléculas de A, B, C y D que participan,

la constante de equilibrio Keq viene dada por

[A], [B], [C] y [D] son las concentraciones molares de los componentes en el
equilibrio.
Cuando un sistema de reacción no está en equilibrio,

la tendencia a desplazarse hacia el equilibrio representa una fuerza motriz,

su magnitud se expresa como el cambio de energía libre de la reacción, ΔG.

Se define como la variación de energía libre estándar, ΔG°

a, la fuerza propulsora del sistema hacia el equilibrio.

Se consideran condiciones estándar de la reacción cuando

La reacción se realiza a una temperatura de(298 K = 25 °C),

Reactivos y productos se encuentran a una concentración inicial 1 M

Presiones parciales de 101,3 kilopascales (kPa) o 1 atm para los gases

Según esta definición, el estado estándar de reacciones en las que intervienen

iones hidrógeno es [H+] = 1 M, o pH = 0.
 ΔG = ΔGº + RT ln [B] / [A]

Para calcular ΔGº,

consideremos que la reacción ha llegado al equilibrio,

es decir A no se transforma ya en B, y por tanto, ya no

hay variación de energía libre

Entonces ΔG = 0

0 = ΔGº + RT ln Keq

por lo que

ΔGº = - RT ln Keq
La mayoría de las reacciones bioquímicas tienen lugar:

en soluciones acuosas bien tamponadas cercanas a pH 7

No se consideran en el cálculo, el pH (y cuando se considera es 7,0)

La concentración del aguareal es (55,5 M) aunque no se considera
(=1M)
El Mg2+ no suele considerarse, tampoco

Las constantes físicas basadas en este estado estándar

bioquímico se denominan constantes estándar transformadas
se escriben con una (‘) prima (por ejemplo, ΔG'° y K’eq )

Son las consideradas en el concepto bioquímico de

variaciones de energía libre estándar ΔG’º

La variación de energía libre estándar
transformada

ΔG'°

es una constante física característica

de una reacción dada que puede
calcularse a partir de la constante de
equilibrio para la reacción:

ΔG'° = -RT ln K’eq.

La variación de energía libre estándar ΔG’° de una reacción
química es simplemente una forma matemática alternativa de
expresar su constante de equilibrio K’eq.

ΔG’º = - RT ln K’eq
Como puede observarse, su relación es logarítmica y con
signo cambiado

K’eq > 1  (-)ΔG’º K’eq < 1  (+)ΔG’º K’eq = 1  ΔG’º=0

ΔG = ΔΗ − ΤΔS
Cuando ambos reactantes y productos se
presentan en concentraciones = 1 M

La reacción

ΔG = ΔGo + RT ln 1 / 1 = ΔGo

al ser el ln de 1 = 0

el término RT ln 1/1 será = 0

Por lo que podemos definir la Variación de Energía

Libre Estándar de una reacción, aquella en la que
reactantes y productos se encuentran a una
concentración 1 M
Cálculo de ΔG'° Calcular el cambio de energía libre estándar de
la reacción catalizada por el enzima fosfoglucomutasa:

Glucosa 1-fosfato  Glucosa 6-fosfato

Si la concentración inicial de la glucosa 1-fosfato es 20 mm

(al inicio, en ausencia de glucosa-6-fosfato)

la mezcla final en el equilibrio alcanza las concentraciones:

glucosa 1- fosfato 1,0 mm y

glucosa 6-fosfato 19 mm

en una reacción a 25 °C y pH 7,0.

La reacción en la dirección de formación de glucosa 6-fosfato

¿transcurre con una pérdida o una ganancia de energía libre?
Calculemos:

valor de la constante de equilibrio:

K’eq = [glucosa 6 - P] / [glucosa 1 - P] =

= 19 mM /1,0 mm = 19

La variación de energía libre estándar será:

ΔG'° = -RT ln K’eq

= -(8,315 J/mol X K)(298K)(ln19)

= - 7,3 kJ/mol
Dado que la variación de energía libre
estándar es negativa,

la conversión de la glucosa 1-fosfato a

glucosa 6-fosfato transcurre con una
pérdida (liberación) de energía libre.

(En la reacción inversa, AG'° tiene la

misma magnitud pero signo opuesto.)
EL CAMBIO DE ENERGÍA LIBRE REAL
DEPENDE DE LAS CONCENTRACIONES
DE REACTIVOS Y PRODUCTOS
Importante distinguir entre:

Variación de energía libre estándar ΔG’º,

- constante y característica para cada reacción
- Indica dirección y hasta que punto debe
transcurrir esa reacción hasta el equilibrio

Variación de energía libre real ΔG es

- función de las concentraciones de reactivos y
productos y de la temperatura real de la reacción
- su valor absoluto es negativo y varía a lo largo de la
reacción para llegar a 0 en el equilibrio
La variación de energía libre real

ΔG
depende de:
- ΔG'° (que es constante para esa reacción) y
- de las concentraciones de reactivos y productos:

ΔG = ΔG'° + RT ln ([productos]/[reactivos])
Para una reacción aA + bB  cC + dD

DG = DG’º + RT ln _[C]c [D]d__

[A]a [B]b

Siendo los términos RT ln _[C]c [D]d_

[A]a [B]b
los que se dan realmente en la reacción

El criterio para espontaneidad de una reacción es el de ΔG

La desaparición inmediata de los productos en otra
reacción modifica el término
RT ln [productos] /[reactivos]
 La variación de energía libre (real) de una reacción es
independiente de la ruta por la que discurra la
reacción;

sólo depende de la naturaleza y la concentración de los

reactivos iniciales y de los productos finales
Cuando:
ΔG es grande y negativa,
la reacción tiende a discurrir en el sentido directo
(hacia la formación de productos)
ΔG es grande y positiva,
la reacción tiende a ir en la dirección inversa
(hacia la formación de sustratos)
ΔG = 0,
el sistema se encuentra en equilibrio.
Este principio de la bioenergética explica el
motivo por el cual una reacción
termodinámicamente desfavorable
(endergónica) puede ser impulsada en el
sentido directo acoplándola a una reacción
muy exergónica a través de un intermedio
común.
Ejemplo de la fosforilación de la Glucosa
con ATP por la Hexokinasa

Glucosa + Pi --> glucosa 6-fosfato + H2O

AG'° = 13,8 kJ/mol

El valor positivo de ΔG'° predice que en

condiciones estándar la reacción no tenderá a
producirse espontáneamente en la dirección
escrita.
Esta reacción se realiza acoplada a otra
reacción celular catalizada en el mismo
enzima, la hidrólisis de ATP a ADP y Pi,
que es muy exergónica:

ATP + H20 --> ADP + Pi

AG'° = -30,5 kJ/mol

En este caso, la energía almacenada en el ATP se
utiliza para impulsar la síntesis de glucosa 6-
fosfato, aunque su formación a partir de glucosa y
fosfato inorgánico (P;) es endergónica.

La ruta de formación de glucosa 6-fosfato por

transferencia de fosforilo desde el ATP es diferente
de las dos reacciones previas (1) y (2), aunque el
resultado neto es el mismo que la suma de las
dos reacciones.

En los cálculos termodinámicos, lo único que

importa es el estado del sistema en el inicio del
proceso y su estado al final; la ruta entre los
estados inicial y final es, por tanto, irrelevante.
Estas dos reacciones comparten los intermedios comunes
Pi y H20, motivo por el cual se pueden expresar como
reacciones secuenciales:

(1) Glucosa + Pi --> Glucosa 6-fosfato + H20

(2) ATP + H20 --> ADP + Pi .
Σ: ATP + Glucosa --> ADP + Glucosa 6-fosfato
La variación de energía libre estándar global se obtiene
sumando los valores de ΔG'° de las reacciones individuales:

AG'° = 13,8 kJ/mol + (-30,5 kJ/mol) = -16,7 kJ/mol

La reacción global resulta exergónica
La variación de energía libre de una
reacción ΔG es independiente de la
ruta por la que transcurre la reacción.

Las variaciones de energía libre son

aditivas; la reacción química neta que
resulta de dos reacciones sucesivas
que comparten un intermedio común
tiene una variación de energía libre
global que es la suma de los valores
de ΔG de las reacciones individuales
Calcule la energía libre real de hidrólisis de ATP, ΔGP,
en los eritrocitos humanos.
La energía libre estándar de hidrólisis del ATP es de -
30,5 kJ/mol, y las concentraciones de ATP, ADP y P;
en los eritrocitos son las que se muestran en la Tabla.

Supongamos que el pH es 7,0 y la temperatura 37 °C

(temperatura corporal).
¿Qué nos dice todo ello sobre la cantidad de energía
requerida para sintetizar ATP en las mismas
condiciones celulares?
Solución: Las concentraciones de ATP, ADP y P; en los eritrocitos
humanos son 2,25, 0,25 y 1,65 mm, respectivamente. La energía
libre real de hidrólisis del ATP en estas condiciones viene dada por la
relación

ΔGP = ΔG'° + RT ln [ADP][Pi] / [ATP]

Sustituyendo por los valores adecuados obtenemos
ΔGP = -30,5 kJ/mol + [ (8,315 J/mol x K)(310 K) ln (0'25 x 10-3)(1,653x 10-3)]
(2,25 x 10-3)
= -30,5 kJ/mol + (2,58 kJ/mol) ln 1,8 x 10-4
= -30,5 kJ/mol + (2,58 kJ/mol)(-8,6)
= -30,5 kJ/mol - 22 kJ/mol = -52 kJ/mol
Así, ΔGP, la variación de energía libre real para
la hidrólisis del ATP en el eritrocito intacto (-52
kJ/mol) es mucho mayor que la variación de
energía libre estándar (-30,5 kJ/mol).

Por el mismo motivo, la energía libre requerida

para sintetizar ATP a partir del ADP y Pi en las
condiciones existentes en el eritrocito sería 52
kJ/mol.
 Lógica química y
reacciones bioquímicas
comunes
• Los sistemas de los organismos vivos utilizan un gran
número de reacciones químicas que se pueden clasificar en
cinco tipos generales.
Una reacción pertinente es la que utiliza un sustrato
disponible y lo convierte en un producto útil.

Las reacciones que tienen lugar en la célula representan un

sistema de éxitos que ha utilizado la evolución para
construir las rutas metabólicas. De ahí que bacterias y
células animales compartamos la mayoría de nuestros
mecanismos bioquímicos, con enzimas semejantes.
Mecanismos semejantes para reacciones específicas,
consecuencia del éxito evolutivo, como:

•la transformación de un nutriente sencillo tal como la

glucosa en aminoácidos, nucleótidos o lípidos;
•la extracción de energía a partir de combustibles mediante
su oxidación, o
•la polimerización de subunidades monoméricas en
macromoléculas
 Los sistemas de los organismos vivos
utilizan un gran número de reacciones
químicas que se pueden clasificar en cinco
tipos generales.
La mayoría de reacciones de las células vivas se
encuadra en cinco categorías generales:
(1) reacciones que forman o rompen enlaces
carbono-carbono;
(2)reordenamientos internos, isomerizaciones y
eliminaciones;
(3) reacciones de radicales libres;
(4) transferencias de grupo

(5) oxidorreducciones
PRINCIPIOS QUÍMICOS BÁSICOS.

Primer principio básico, un enlace covalente consiste

en un par de electrones compartido y, en general, el
enlace se puede partir de dos formas

Rotura homolítica, cada átomo abandona el

enlace en forma de radical, llevando un electrón
desaparejado.

Rotura heterolitica, la más frecuente, un átomo

retiene los dos electrones de enlace.

Los carbaniones, carbocationes e iones hidruro,

formados son muy inestables; esta inestabilidad
conforma la química de estos iones.
El segundo principio básico es que en muchas reacciones
bioquímicas intervienen interacciones entre nucleófilos (grupos
funcionales ricos en electrones con capacidad para cederlos) y
electrófilos (grupos funcionales con una carencia de electrones y ávidos
de los mismos).

Los nucleófilos se combinan con los electrófilos a los que ceden sus
electrones.

Un átomo de carbono puede actuar como nucleófilo o como electrófilo

según sean los enlaces y grupos funcionales que lo rodean.

Reacciones que forman o rompen enlaces carbono-carbono

En la rotura homolítica, cada átomo abandona el enlace en forma de

radical, llevando un electrón desaparejado

La rotura heterolitica de un enlace G--C forma un carbanión y un

carbocatión

La formación de un enlace C--C implica la combinación de un

carbanión nucleofílico con un carbocatión electrofílico.
FIGURA 13-1 Dos mecanismos
para la rotura de un enlace C-C o
C-H. En una rotura homolítica,
cada átomo de carbono mantiene
uno de los electrones de enlace,
formándose radicales carbono
(carbonos con electrones
desapareados) o átomos de
hidrógeno sin carga. En las roturas
heterolíticas, uno de los átomos
mantiene los dos electrones
enlazantes. Esto puede dar lugar a
la forma
Diferentes grupos de una molécula pueden
experimentar oxidación-reducción sin cambio neto en
el estado de oxidación de la molécula; grupos en un
doble enlace pueden experimentar un reordenamiento
cis-trans o se pueden trasponer las posiciones de los
dobles enlaces.
Un ejemplo de reacción de eliminación que no afecta
el estado de oxidación global es la pérdida de agua de
un alcohol que introduce un enlace C=C:
− Los grupos carbonilo juegan un papel especial en reacciones que
forman o rompen enlaces C-C. Intermedios carbanión son comunes
y se estabilizan mediante grupos carbonilo adyacentes o, menos
frecuentemente, por iminas o ciertos cofactores.

FIGURA 13-3 Propiedades químicas de los grupos carbonilo.

(a) El átomo de carbono de un grupo carbonilo es un electrófilo debido a la
capacidad de retirar electrones del átomo de oxígeno electronegativo, lo que da
lugar a una estructura híbrida resonante en la que el carbono tiene una carga
positiva parcial.
(b) Dentro de una molécula, la deslocalización de electrones a un grupo carbonilo
estabiliza un carbanión en un carbono adyacente, facilitando su formación.
− Una redistribución de electrones puede producir reordenamientos,
isomerizaciones y eliminaciones. Tales reacciones incluyen oxidorreducciones
intramoleculares, cambios cis-trans en el ordenamiento de un doble enlace y
transposiciones de dobles enlaces.
La eliminación de H2O, (p.e. por las enolasas) forma de un enlace saturado
C—C, otro doble C—C. De forma semejante se eliminan alcoholes y aminas-

13.4 En la reacción de descarboxilación, se forma un carbanión sobre el carbono sombreado en azul al

tiempo que sale el CO2. La reacción no transcurriría a velocidad apreciable sin el efecto
estabilizador del carbonilo adyacente al carbono del carbanión. Donde quiera que se muestra un
carbanión, se supone una resonancia estabilizadora con el carbonilo adyacente, tal como se muestra en
la Figura 13-3b. Una imina (Fig. 13-3c) u otro grupo captador de electrones (incluidos ciertos cofactores
enzimáticos tales como el piridoxal puede reemplazar el grupo carbonilo en la estabilización de
carbaniones.
FIGURA 13-6 Reacciones de isomerización y eliminación.
(a) Conversión de glucosa 6-fosfato en fructosa 6-fosfato, una reacción del metabolismo de los
azúcares catalizada por la fosfohexosa isomerasa.
(b) Esta reacción tiene lugar a través de un intermedio enediol. Las flechas azules curvadas
representan el movimiento de los eletrones de enlace.
Los recuadros rosa, siguen la ruta de oxidación de izquierda a derecha. B, y Bz son grupos
ionizables del enzima; pueden dar y aceptar protones (actuando como ácidos generales o bases
generales) mientras transcurre la reacción. Los recuadros rosa indican grupos nucleofílicos; los
azules, electrofílicos.
La rotura homolitica de enlaces
covalentes que genera radicales
libres tiene lugar en algunas
rutas, tales como ciertas
reacciones de isomerización,
descarboxilación, de
reductasas y reordenamientos.
Las reacciones de transferencia de
fosforilo son un tipo muy
importante en las transferencia de
grupo dentro de las células y se
requieren para la activación de
moléculas que han de intervenir en
reacciones que, de otro modo,
serían muy desfavorables.
Reacciones de transferencia de grupo La transferencia de grupos
acilo, glucosilo y fosforilo desde un nucleófilo a otro es frecuente en
las células vivas. En la transferencia de grupos acilo interviene
generalmente la adición de un nucleófilo al carbono carbontlico de un
grupo acilo para formar un intermedio tetraédrico:
FIGURA 13-8 Maneras alternativas
de mostrar la estructura del
ortofosfato inorgánico.
(a) En una representación
(inadecuada) hay tres oxígenos
unidos por enlace sencillo al fósforo
y un cuarto mediante un doble
enlace, permitiendo las cuatro
estructuras de resonancia diferentes
que se muestran.
(b) Las estructuras de resonancia
pueden ser representadas de una
manera más precisa mostrando los
cuatro enlaces fósforo-oxígeno con
cierto carácter de doble enlace; los
orbitales híbridos así representados
se estructuran en un tetraedro con el
P en su centro.
Cuando un nucleófilo Z (en este caso, el -OH del C-6 de la glucosa) ataca
al ATP, desplaza al ADP (W).

En esta reacción SN2 se forma un intermedio pentacovalente transitorio (d)

FIGURA 13-9 Estados de oxidación del carbono en las biomoléculas.
Cada compuesto se forma por oxidación del carbono marcado en
rojo del compuesto inmediatamente superior. El dióxido de carbono
es la forma más oxidada de carbono presente en los seres vivos
FIGURA 13-10 Una reacción de oxidación-reducción. Aquí se muestra la
oxidación del lactato a piruvato. En esta deshidrogenación, dos
electrones y dos iones hidrógeno (el equivalente a dos átomos de
hidrógeno) se eliminan del C-2 del lactato, un alcohol, para formar
piruvato, una cetona. En las células esta reacción está catalizada por la
lactato deshidrogenasa y los electrones se transfieren al cofactor
nicotinamida adenina dinucleótido (NAD). Esta reacción es
completamente reversible; el piruvato puede ser reducido por los
electrones del cofactor.
Las reacciones de oxidación-reducción
implican siempre la pérdida o la
ganancia de electrones:
un reactivo gana electrones
reduciéndose, mientras que el otro los
pierde y se oxida.

Las reacciones de oxidación

generalmente liberan energía, siendo por
ello importantes en el catabolismo.
RESUMEN 13.2Lógica química y reacciones bioquímicas
comunes
Los sistemas de los organismos vivos
utilizan un gran número de reacciones
químicas que se pueden clasificar en cinco
tipos generales.
Los grupos carbonilo juegan un papel especial
en reacciones que forman o rompen enlaces C-
C. Intermedios carbanión son comunes y se
estabilizan mediante grupos carbonilo
adyacentes o, menos frecuentemente, por
iminas o ciertos cofactores.