Utilizando ImageJ

O Programa ImageJ um aplicativo desenvolvido gratuitamente na linguagem Java.

Por isso, na maioria dos casos no precisa ser instalado no computador (e nem requer
senha de administrador para us-lo).

Ele tem uma interface bem simples e at mesmo pequena. Apenas uma barra de
ferramentas.

Figura 1: Janela do programa ImageJ.

Ele permite a incluso de muitos Plugins (funes desenvolvidas que so acrescidas ao

programa principal). Isso pode alterar um pouco a sua estrutura ou a disposio de
cones. Outro ponto importante que ele permite que voc crie macros e algoritmos,
permitindo que voc crie verdadeiros programas de manipulao de imagens, inclusive
com interao com o usurio.

1. COMO CARREGAR UMA IMAGEM

Para o uso da Radiologia, a vantagem do ImageJ que ele permite a manipulao de

Imagens no Padro DICOM.
Para carregar uma imagem, voc pode fazer de algumas maneiras:
Usar o Comando FILE OPEN; ou
Arrastar a imagem/arquivo at em cima do programa. Aparecer as palavras Drag
and DROP na janela, mostrando que o programa entendeu que voc quer abrir
aquela imagem.

Quando a imagem aberta, a mesma aparece em uma nova janela, independente da

janela do programa. Isso pode parecer um pouco desconfortvel, pois a mesma pode ficar
escondida por outro programa que esteja ativo, mas muito til para se comparar duas
ou mais imagens ao mesmo tempo, pois as janelas podem ser posicionadas lado a lado.
Este uma premissa bsica do ImageJ: toas as respostas/informaes/imagens/sadas
sero apresentadas em novas janelas. Isso deixa a tela um pouco poluda, mas permite
mais facilmente colocar as informaes/imagens lado a lado.

Uma vez aberta a imagem, clique na imagem e aperte simultaneamente CTRL + I. Abrir
uma nova janela com todas as informaes da imagem.

2. HISTOGRAMA

Histograma uma funo que conta o nmero de ocorrncias de uma determinada

categoria. No caso das imagens radiogrficas, o Histograma conta o nmero de pixels
que contem aquele tom de cinza. Ou seja, o histograma uma lista ou tabela (mas
normalmente apresentado na forma de grfico) que informa que existem 100 pixels com o
tom 0, 220 pixels com o tom 10, 35 pixels com o tom 20, e assim por diante.

Figura 2: Exemplo de um histograma com tons de cinza de 0 a 225 e nmeros de ocorrncias (pixels)
daquele tom.

Escolha a janela da imagem, e aperte simultaneamente CTRL + H. Abrir uma nova

janela com o grfico do Histograma.

(a) (b)
Figura 3: (a) Histograma da imagem radiogrfica. (b) Histograma Live ativado: ao se criar uma rea
na imagem, apresentado apenas o histograma daquela rea.

Verifique como o histograma representa a quantidade de preto, branco ou tom de cinza

presente na imagem. Veja que ele apresenta tambm os valores mximos e mnimos do
histograma, a mdia (Mean) e o desvio padro (StdDev). Bins so o nmero de
segmentos que foi divido a escala (256) e Bin width a espessura de cada Bin
(arredondando = 16). Isso significa que o Bin 1 (1 o segmento) acumula a contagem dos
tons de cinza de 0 a 15, Bin 2 (2 o segmento) acumula os pixels de 16 a 31, Bin 3 (3o
segmento) vai de 32 a 47, e assim at o Bin 256 (256o segmento) que acumula os pixels
com tons de cinza de 4080 a 4095, que o valor mximo apresentado.
Depois, clique no boto Live, e faa retngulos sobre a imagem e verifique como cada
regio apresenta seu prprio histograma.
Procure comparar os histogramas locais com o histograma total. Observa a imagem (mais
clara, mais escura, co muito branco ou muito preto) e veja como a sua percepo
representada no histograma.
3. AJUSTE DE BITS

A imagem que voc utilizou estava codificada em 16 bits (65 536 tons de cinza
diferentes). Porm s se utiliza normalmente 12 bits em imagens radiogrficas (4 096
tons). Por isso o valor mximo do histograma 4 095.
Escolha novamente a janela da imagem. Na janela ImageJ escolha a opo IMAGE
Type 8-Bit.
Escolha a janela da imagem e chame a funo Histograma novamente. Compare os
valores entre os dois histogramas. Veja os valores de mdia e mximo como se alteraram.

4. AJUSTE DE HISTOGRAMAS

Uma das ferramentas para melhorar a qualidade de uma imagem, ou seja, melhorar seu
contraste e a identificao das anatomias e patologias, a equalizao e a
normalizao do histograma.

Equalizao: Consiste em uma transformao no-linear que considera a distribuio

acumulativa da imagem original, para gerar uma imagem resultante, cujo histograma ser
aproximadamente uniforme (com menos picos). Segue-se o princpio que o contraste de
uma imagem seria otimizado se todos os 256 possveis nveis de intensidade (cinza)
fossem igualmente utilizados, ou seja, todas as barras verticais que compem o
histograma fossem da mesma altura. Na prtica essa uniformizao difcil de ocorrer,
mas a ferramenta cumpre seu papel na maioria dos casos, melhorando o contraste da
imagem e muitas vezes revelando detalhes escondidos.

Normalizao/Expanso: quando um histograma no ocupa toda a faixa possvel de

tons de cinza, p.ex., (0 a 255), ento se pode expandir o histograma de forma que toda a
faixa seja ocupada. Ou seja, se a imagem apresenta s tons escuros, de 10 a 90 por
exemplo, podemos fazer que a escala passe de 0 a 255. Assim, o contraste reduzido,
mas detalhes que estavam escondidos podem aparecer com a distribuio dos pixeis
em mais nveis de cinza.
No programa, estas duas ferramentas se encontram na mesma funo/janela.

Escolha a janela da imagem. Aperte simultaneamente CTRL + SHIFT + D, para duplicar a

imagem. De um novo nome a imagem: p.ex. Equalizada1.
Escolha a janela da imagem Equalizada. Na janela ImageJ escolha a opo PROCESS
Enhance Contrast.

Faa alteraes nos valores percentuais e escolha uma ou as duas opes: Normalize e
Equalize. Faa testes alterando as opes e comparando as novas imagens com a
imagem original. Se precisar, crie vrias cpias (Equalizada2,Equalizada3.) e aplique
em cada uma delas uma opo de ajuste do histograma.
Aps aplicar os ajustes de histograma, aperte simultaneamente CTRL + H em cada
imagem e compare tambm os histogramas.
5. REGIO DE INTERESSE

Regio de Interesse o nome dado a uma regio (retangular ou elptica, ou forma livre)
da qual se retira muitas informaes importantes a cerca da imagem naquele ponto. Essa
regio serve para se saber se um artefato uma patologia, e se a regio homognea ou
heterognea.

Escolha a janela da imagem. Na janela ImageJ escolha a opo ANALYSE Tools

ROI Manager.

Desenhe um retngulo na imagem e clique em ADD. Aparecer na lista um cdigo. Se

quiser trocar o nome, clique em cima do cdigo e escolha RENAME e troque para, p.ex.,
Pulmo
Depois clique em MEASURE e veja a janela com os resultados de mida, mximo,
mnimo, tamanho da rea.

Nesta janela de resultados, escolha RESULTS Set Measurements. E clique em

Standard deviation. Pea novamente para MEASURE e veja o novo resultado. Faa
vrias reas de ROI na imagem e clique em SHOW ALL para ver todas as informaes
dos ROI ao mesmo tempo.

Utilizando o Histograma e o ROI, verifique como muda cada regio da imagem quando
voc Equaliza ou Expande o Histograma.