TEXTO 7

Biologia Molecular
SNTESE DE PROTENAS

A Sntese de Protenas
O RNA e a Sntese de Protenas
O papel do RNAt e das sintetases do aminoacil-RNAt
O emparelhamento cdon-anticdon
O papel do RNAm e dos ribossomos
Etapas da Sntese de Protenas
A iniciao da traduo em procariontes
A iniciao da traduo em eucariontes
O alongamento da cadeia polipeptdica
O trmino da traduo
Quadros de Leitura do RNA Mensageiro
Exerccios
Parte A: Revendo Conceitos Bsicos
Parte B: Ligando Conceitos e Fatos
Parte C: Aplicando Conceitos
Parte D: Resolvendo Problemas
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Apresentao

O dogma central sintetiza o paradigma da biologia molecular: os genes se perpetuam como

cidos nucleicos, mas se expressam na forma de protenas, cuja sequncia de aminocidos
determinada pela sequncia de bases do RNA, o qual transcrito a partir de uma das fitas da
molcula de DNA. Nesta unidade apresentaremos como os polipeptdeos so sintetizados nos
ribossomos das clulas procariticas e eucariticas, etapa fundamental da expresso gnica.
Essa apostila foi organizada pelos docentes do Instituto de Biocincias da USP que
ministraram e ministram as disciplinas Biologia Molecular e de Microrganismos, Biologia
Molecular e Fundamentos de Biologia Molecular para os cursos de Bacharelado e
Licenciatura em Cincias Biolgicas. O texto foi adaptado e compilado de diversos livros
didticos e materiais instrucionais.

A Sntese de Protenas
O RNA e a Sntese de Protenas

As protenas constituem mais da metade da massa seca total de uma clula e sua sntese tem uma importncia
fundamental para a manuteno e o crescimento celulares. A sntese de protenas ocorre nos ribossomos e envolve
vrios tipos de molculas de RNA que atuam nas diversas etapas do processo. Inicialmente, uma molcula de
RNA mensageiro (RNAm) deve ser sintetizada a partir de uma das cadeias do DNA que codifica para a protena.
No citoplasma, molculas de cada um dos 20 aminocidos que entram na composio das protenas devem se unir
a seus respectivos RNA transportadores (RNAt). As subunidades ribossmicas que promovero a sntese devem se
associar com protenas auxiliadoras no processo.
A sntese de protenas tem incio quando todos os componentes mencionados acima, ou seja, um RNAm, um
dos RNAt e as subunidades de um ribossomo se renem para formar um ribossomo funcional. Cada ribossomo
percorre, ento, a molcula de RNAm traduzindo a sequncia de cdons em uma sequncia de aminocidos.
Vejamos agora, em detalhe, cada uma dessas etapas.

O papel do RNAt e das sintetases do aminoacil-RNAt

As molculas de RNAt atuam como adaptadoras no processo de sntese de protenas, uma vez que elas definem
a posio dos aminocidos de acordo com a sequncia de bases do RNAm. Essa caracterstica dos RNAt se deve
ao fato deles terem duas regies de ligao em sua molcula, uma onde se liga covalentemente um aminocido
especfico e outra, o anticdon, o qual se liga ao cdon do RNAm, por meio de pontes de hidrognio.
A ligao de um RNAt com seu aminocido especfico catalisada por uma enzima chamada sintetase do
aminoacil-RNAt. A atuao dessa enzima se d em duas etapas. Primeiramente, os aminocidos reagem com
ATP para formar um aminoacil-adenilato. A energia para essa reao fornecida pela clivagem da ligao alta-
mente energtica do ATP, com liberao de pirofosfato. Essa etapa conhecida como ativao do aminocido.
Em uma segunda etapa, o aminocido ativado reage com o RNAt, liberando uma molcula de AMP. A ligao
do aminocido com o RNAt se d entre o grupo carboxila do aminocido e carbono 3 da ribose do ltimo
ribonucleotdeo da extremidade 3 do RNAt, o qual contm sempre a base adenina (Fig.1).
Existem pelo menos vinte tipos diferentes de aminoacil-sintetases, uma para cada tipo de aminocido. Cada
uma reconhece um nico aminocido e catalisa sua unio a um dos RNAts correspondente a esse aminocido.
Lembre-se que pode existir mais de um tipo de RNAt para um mesmo aminocido.
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Figura 1. Representao esquemtica das reaes de ativao de

um aminocido e de sua ligao ao RNAt, as quais so catalisadas
por enzimas denominadas sintetase do aminoacil-RNAt.

Um RNAt denominado de acordo com o aminocido ao qual ele se liga. Por exemplo, o RNAt que se liga ao
aminocido alanina chamado RNAtAla. Um aminoacil-RNAt carregando um aminocido especfico designado
pela abreviatura do aminocido colocada antes de sua sigla; por exemplo, o RNAtAla ligado a seu aminocido
chamado Ala-RNAt.

O emparelhamento cdon-anticdon

Antes de continuarmos nossa discusso importante tomarmos conhecimento de uma regra nomenclatural que
se no esclarecida devidamente pode dificultar a compreenso do texto. A regra a seguinte: um RNA sempre
escrito no sentido 5 - 3. Assim, temos de ter em mente que os cdons do RNAm e os anticdons dos RNAt
esto escritos no mesmo sentido, contrrio, portanto, a seu emparelhamento, o qual anti-paralelo. Isso quer dizer
que a primeira base na sequncia do anticdon emparelha-se com a terceira base do cdon. Por exemplo, CGU
o anticdon correspondente ao cdon ACG, pois ambos esto escritos no mesmo sentido, de 5 para 3, mas eles
se emparelham em sentidos opostos, como mostrado a seguir:
anticdon 3UGC 5
cdon 5ACG 3
A hiptese de que o anticdon que permite ao aminoacil-RNAt reconhecer seu cdon pde ser testada
experimentalmente, por meio de reaes qumicas controladas, em que foi possvel transformar cistenas, j ligadas
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a seus RNAt especficos (Cys-RNAtCys), em alaninas, gerando, portanto, Ala-RNAtCys. Admitindo-se a veracidade
da hiptese, caso esses aminoacil-RNAt modificados fossem utilizados em um sistema de sntese de protenas in
vitro, alanina seria incorporada nos locais da protena onde normalmente existiria cistena. O experimento foi
realizado e o resultado obtido foi o previsto pela hiptese. Assim, uma vez unido ao RNAt, o aminocido no tem
papel na especificidade da reao de sntese de protena, sendo esta determinada exclusivamente pela interao
cdon-anticdon (Fig. 2).

Figura 2. Representao esquemtica do experimento que comprovou que a incorporao

do RNAt determinada pelo anticdon e no pelo aminocido. A modificao qumica de
cistena unida a seu RNAt, transformando-a em alanina, faz com que esse ltimo aminocido
seja incorporado em lugar da cistena.

Uma pergunta importante a se discutir sobre os RNAt quantos tipos deles existem. Como vimos no texto
sobre cdigo gentico, existem 61 cdons de RNA mensageiro que especificam aminocidos. Assim, teoricamen-
te, esperaramos encontrar na clula 61 tipos diferentes de RNA transportadores, cada um deles com um anticdon
complementar a um dos 61 cdons existentes. No entanto, existe um nmero bem menor de RNAt. O fato que
um mesmo RNAt pode reconhecer, com frequncia, mais do que um cdon, pois a base na primeira posio do
anticdon pode se emparelhar com mais de um tipo de base na terceira posio do cdon. Essa idia foi proposta
em 1966, e ficou conhecida como hiptese do emparelhamento incerto ou oscilao (usa-se o termo
wobble, em ingls). Segundo esta hiptese, o emparelhamento da primeira base do anticdon no seria espacial-
mente to restrito como para as outras duas, de modo que a primeira base de um anticdon poderia fazer pontes
de hidrognio com mais de um tipo de base na terceira posio do cdon. Esse emparelhamento, no entanto, no
irrestrito, ou seja, uma primeira base de um anticdon no pode se emparelhar com qualquer tipo de base na
terceira posio do cdon. Na realidade, observou-se que, por exemplo, uracila na primeira base do anticdon
pode se emparelhar com adenina ou guanina, mas no com citosina ou com outra uracila. Em geral, purinas no
se emparelham com purinas, e pirimidinas no se emparelham com pirimidinas, por questo de distncia entre as
bases. Os tipos de emparelhamento incerto esto representados na Tabela 1.
Tabela 1. Emparelhamento entre bases do cdon e do anticdon

Base na primeira posio Base reconhecida na terceira

do anticdon posio do cdon
G U ou C
C G
A U
U A ou G
I C, U ou A

O emparelhamento incerto ocorre porque a conformao da ala do anticdon do RNAt permite esta flexi-
bilidade na primeira base do anticdon. Modificaes das bases vizinhas do anticdon tambm influenciam no
emparelhamento da primeira base.
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Outros tipos de emparelhamento alternativo, alm do tipo Watson-Crick e dos previstos pela hiptese do
emparelhamento incerto, podem ocorrer quando a primeira base do anticdon de certos RNAt sofrem modificao.
Um exemplo disso a base modificada inosina (I, Tabela 1), que, na primeira posio de um anticdon, pode
emparelhar-se com U, C ou A na terceira posio de um cdon.
A presena de inosina como primeira base do anticdon particularmente importante na distino entre os
cdons AUA, que codifica para isoleucina, e AUG, que codifica para metionina. Com as bases usuais no seria
possvel distinguir entre A e G na terceira posio do cdon; como as duas so bases pricas, qualquer RNAt com
U na primeira base do anticdon reconheceria tanto AUG como AUA. Este problema resolvido pela existncia
da inosina no anticdon; um RNAt com anticdon IAU, que se liga ao aminocido isoleucina, reconhece AUA,
AUC e AUU, mas no AUG; um RNAt com anticdon CAU, que se liga metionina, reconhece apenas AUG.

O papel do RNAm e dos ribossomos

O processo da sntese de protenas comparvel a uma

linha de montagem, na qual o ribossomo vai deslizando sobre o
RNA mensageiro e os aminocidos, trazidos pelos RNAt, vo
sendo encaixados em seus respectivos lugares, de acordo com a
sequncia de bases do RNAm.
O ribossomo um pacote complexo de molculas de protena
e de RNA, as quais formam stios catalticos com funes
especializadas. Vrios fatores acessrios participam, juntamente
com o ribossomo, da sntese de protenas e a energia para a
movimentao do ribossomo fornecida pela hidrlise de GTP.
Um ribossomo procaritico possui um stio para a ligao do
RNAm e trs stios para a ligao de RNAt. Os stios onde se ligam
os RNAt so denominados: stio P, stio A e stio E (Fig. 3). Figura 3. Representao esquemtica dos stios de ligao dos RNA

O stio P, ou stio de ligao do peptidil-RNAt, onde se no ribossomo procaritico. As setas indicam que o RNAt e o RNAm
se movem atravs do ribossomo em um mesmo sentido.
associa a molcula de RNAt ligada extremidade carboxlica
do polipeptdeo em crescimento. O stio A, ou stio de entrada do aminoacil-RNAt, onde se associa o RNAt
recm-chegado ao ribossomo e que traz o aminocido a ser incorporado na cadeia polipeptdica em crescimento.
O stio E (do ingls exit), ou stio de sada, ocupado transitoriamente pelo RNAt livre de aminocido que acabou
de sair do stio P e que est, portanto, deixando o ribossomo. Enquanto o stio E est ocupado, a afinidade do stio
A fica reduzida, impedindo assim que um novo aminoacil-RNAt entre no ribossomo antes que ele esteja pronto
para receb-lo. Assim, o caminho do RNAt no ribossomo se d na seguinte sequncia: ele entra no stio A, passa
para o stio P e finalmente deixa o ribossomo pelo stio E.
Cada ribossomo apresenta um segmento da cadeia polipeptdica em processo de sntese, com comprimento
proporcional ao segmento de RNAm j traduzido por ele. Essa cadeia polipeptdica em formao costuma ser
chamada de protena nascente.
Em geral, sobre uma molcula de RNA mensageiro, so encontrados vrios ribossomos, cada um deles com
um segmento de protena nascente. Se olhssemos da extremidade 5 para a 3 do RNA mensageiro, veramos os
ribossomos a ele associados apresentando protenas nascentes progressivamente maiores, pois os ribossomos mais
prximos da extremidade 3 estariam mais prximos do fim da sntese do polipeptdeo. A esta estrutura formada
por uma molcula de RNA mensageiro associada a vrios ribossomos d-se o nome de polissomo (Fig. 4).

Figura 4. Um polissomo consiste de uma molcula de RNAm sendo traduzida simultaneamente por diversos ribossomos que se movem no sentido 5 3.
Ligadas a cada ribossomo existem duas molculas de RNAt; a primeira ( esquerda, no stio P) est ligada ao aminocido recm-incorporado cadeia proteica
nascente; a segunda ( direita, no stio A) carrega o aminocido a ser incorporado em seguida.
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O tamanho de um polissomo depende

tanto do comprimento do RNAm quanto da
eficincia com o que o ribossomo capaz de
se ligar ao mensageiro para iniciar a traduo.
Em bactrias, os polissomos contm, em geral,
dezenas de ribossomos e podem ser encontrados
associados ao DNA. Isso ocorre porque em
bactrias, a traduo e a transcrio so acopladas,
ou seja, os RNAm comeam a ser traduzidos
antes do trmino de sua sntese (Fig. 5).
Nos eucariontes, os polissomos apresentam
em mdia oito ribossomos e so encontrados no
citoplasma, livres no citosol ou presos s paredes
do retculo endoplasmtico. Figura 5. Representao esquemtica do acoplamento entre os processos de transcrio e
Podemos ter uma idia da atividade de sn- traduo em bactrias. As molculas de RNA sendo transcritas crescem no sentido 5 3
e as primeiras sequncias liberadas do molde de DNA comeam a ser traduzidas pelos
tese de protena em uma clula examinando o ribossomos antes do trmino da transcrio.
nmero de alguns elementos envolvidos nesse
processo em uma bactria, por exemplo. A clula de Escherichia coli possui cerca de 20 mil ribossomos, que
constituem um quarto da massa total da clula, cerca de 3 mil cpias de cada tipo de RNAt e por volta de 1500
molculas de RNAm.
O processo de sntese de protenas costuma ser dividido em trs etapas: iniciao, alongamento e trmino.
A iniciao consiste nas reaes que precedem o incio da formao do peptdeo, portanto, a etapa que
ocorre antes da unio dos primeiros aminocidos. Ela consiste na ligao do ribossomo ao RNAm formando um
complexo de iniciao que contm o primeiro aminoacil-RNAt (o da N-formilmetionina em bactrias e o da
metionina em eucariontes). A iniciao uma etapa demorada e pode ser decisiva na determinao da frequncia
com que um mensageiro ser traduzido.
O alongamento compreende todas as reaes que ocorrem desde a formao da primeira ligao peptdica
at a incorporao do ltimo aminocido do peptdeo, sendo a etapa mais rpida da sntese de protenas. Em bac-
trias, aproximadamente 15 aminocidos so adicionados por segundo cadeia polipeptdica nascente, de modo
que a sntese de um polipeptdeo com 300 aminocidos leva cerca de 20 segundos. Em eucariontes, a velocidade
menor, so adicionados cerca de dois aminocidos por segundo.
O trmino compreende os processos necessrios liberao do polipeptdeo pronto. Nesta etapa, o ribossomo
se dissocia do RNAm.

Etapas da Sntese de Protenas

Apesar de muito semelhante nos aspectos gerais, a sntese de protenas difere entre clulas procariticas e clulas
eucariticas. As principais diferenas so observadas na etapa de iniciao do processo.

A iniciao da traduo em procariontes

Em E. coli, o processo de iniciao da traduo requer a presena de uma subunidade menor do ribossomo
(30S), um RNAt especial iniciador da traduo, uma molcula de RNAm e trs fatores proticos de iniciao,
denominados IF-1, IF-2 e IF-3 e GTP (Fig. 6).
Inicialmente uma subunidade ribossomal 30S livre associa-se a um RNAm e aos fatores de iniciao IF-3 e
IF-1. A formao desse complexo depende da interao de bases entre uma sequncia do RNAr 16S e uma regio
especial do RNAm, conhecida como sequncia de Shine-Dalgarno. Essa sequncia corresponde a um consenso
de seis bases (AGGAGG) localizado sete nucleotdeos antes (a 5) do cdon de iniciao AUG. A regio do RNAm
que compreende a sequncia de Shine-Dalgarno e que interage com o ribossomo no processo de iniciao
denominada stio de ligao do ribossomo e compreende cerca de 40 nucleotdeos (Fig. 7).
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Figura 6. Representao esquemtica da

etapa de iniciao da sntese de protena
em bactria. A subunidade menor 30S do
ribossomo se liga ao RNAm, acompanhada
de fatores de iniciao IF-1 e IF-3. O fator
de iniciao IF-2 liga-se ao RNAt fmet e em
seguida subunidade 30S do ribossomo
unida ao RNAm. O complexo de iniciao
formado se une subunidade 50S do ribos-
somo. Quando isso ocorre, so liberados
o IF-2, outros fatores IF e os produtos da
degradao do GTP, ou seja, GDP e fosfato.

Figura 7. Em bactrias, as bases complementares entre a extremidade 3do RNAr 16S da

subunidade ribossmica menor e a sequncia de Shine-Dalgarno do RNAm posicionam o
ribossomo para iniciar a traduo do cdon de iniciao AUG localizado a seguir.

Em seguida, um RNAt especial, o RNAtf-Met (da N-formilmetionina), associado ao fator IF-2, combina-se ao
complexo subunidade ribossomal 30S-RNAm. Essa combinao demanda a participao do fator IF-1 e de GTP,
como fornecedor de energia.
O passo final da iniciao a associao da subunidade maior do ribossomo, para construir um ribossomo
completo. Para que isso acontea, preciso que o IF-3 se dissocie do complexo. Essa a razo do fator IF-3 ser
chamado de fator anti-associao das subunidades ribossomais. O
IF-3 e a subunidade 50S nunca ficam associados simultaneamente
subunidade ribossomal menor. Os demais fatores de iniciao
tambm so liberados aps a chegada da subunidade maior do
ribossomo (Fig. 6). O RNAtf-Met iniciador posiciona-se ento no
stio P do ribossomo completo. Este o nico RNAt bacteriano
capaz de entrar no stio P diretamente, sem ter que passar pelo
stio A, como acontece com os demais RNA transportadores.
Com o RNAt iniciador no stio P, o stio A fica posicionado no
segundo cdon do mensageiro e ir determinar qual aminoacil-
RNAt ser incorporado nessa posio (Fig. 8)
Pelo que vimos acima, um componente fundamental ini-
ciao da sntese de protenas em bactrias o RNAtf-Met. Esse
RNAt especial liga-se a uma metionina que , ento, enzimati-
camente transformada em N-formilmetionina. A transformao
da metionina em N-formilmetionina consiste na adio de um
radical formil extremidade amino do aminocido. Como o
RNAtf-Met incapaz de se associar ao stio A do ribossomo, ele Figura 8. Em bactrias, apenas o RNAt pode ser usado para a
f-Met

s participa na iniciao da traduo. Eventuais cdons AUG iniciao, pois o nico aminoacil-RNAt capaz de se unir subuni-
dade menor de um ribossomo incompleto. No ribossomo completo
internos ao gene so traduzidos por outro RNAt, o RNAtMet, o fMet-RNAt no consegue entrar; qualquer outro aminoacil-RNAt
pode agora se acoplar ao ribossomo e ser usado no processo de
que introduz metionina no formilada no local correspondente alongamento da cadeia polipeptdica.
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do polipeptdeo. Assim, todos os peptdeos bacterianos iniciam com a N-formilmetionina. Em certos casos, o
grupo formil inicial do polipeptdeo eliminado por uma desformilase; em outros casos, a N-formilmetionina
removida por uma aminopeptidase, originando uma nova extremidade para o peptdeo.

A iniciao da traduo em eucariontes

A iniciao da traduo em eucariontes mais complexa que nos procariontes e envolve diversos fatores de iniciao.
Uma das diferenas entre a iniciao da traduo desses dois grupos de organismos refere-se ao estado con-
formacional do RNAm a ser traduzido. Em bactrias, a agregao do ribossomo ao RNAm acontece to logo
a extremidade 5 do RNAm se solta do DNA molde na transcrio. Isso evita que o RNAm adquira estruturas
secundrias que poderiam dificultar a iniciao da traduo. J em eucariontes, o RNAm recm-sintetizado
empacotado com protenas necessrias ao seu transporte do ncleo para o citoplasma.
Uma etapa importante da sntese de protenas nos eucariontes o desempacotamento do RNAm. Nesse pro-
cesso, uma protena reconhece o cap da extremidade 5 dos mensageiros eucariticos, enquanto que outros fatores
proticos desfazem dobramentos no incio do mensageiro (Fig. 9). So muitos os fatores de iniciao proteicos que
se ligam formando um complexo na extremidade 5 do RNAm (Fig. 10).

Figura 9. Representao esquemtica das etapas de iniciao

da traduo em eucariotos.
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Figura 10. Alguns dos fatores

necessrios para a iniciao em
eucariontes e suas respectivas
funes. Em vermelho,
est representado o CAP na
extremidade 5.

Uma diferena importante entre a iniciao da traduo em procariontes e eucariontes, que, nesses ltimos,
apesar de existir um RNAt iniciador que tambm carrega metionina, esta nunca formilada, como em bactrias.
Alm disso, em eucariontes, o complexo de iniciao se forma na extremidade 5 do RNAm, percorrendo em
seguida o RNAm at alcanar um cdon AUG, onde tem incio a traduo. Assim, em eucariontes, a traduo
se inicia no cdon AUG mais prximo extremidade 5 do mensageiro e no em uma sequncia especial de
bases como a de Shine Dalgarno. Apesar disso, a eficincia da iniciao parece depender, pelo menos em parte, de
sequncias de bases vizinhas ao cdon de iniciao.

O alongamento da cadeia polipeptdica

O processo de alongamento da cadeia polipeptdica basicamente o mesmo em procariontes e eucariontes

e ocorre em trs etapas: (1) ligao de um aminoacil-RNAt ao stio A do ribossomo; (2) ligao peptdica com
o aminocido recm-chegado causando a transferncia da cadeia polipeptdica em crescimento do stio P para o
stio A; e (3) translocao do ribossomo ao longo do RNAm, transferindo o novo peptidil-RNAt do stio A para
o stio P, com posicionamento do prximo cdon a ser traduzido no stio A. Durante a terceira etapa, o RNAt
descarregado translocado para o stio E. Esses trs passos so repetidos de maneira cclica e vrios fatores so
importantes nesses processos.
Na primeira etapa, o aminoacil RNAt se liga ao stio A e sua especificidade determinada pelo cdon do
RNAm ali posicionado. Os trs nucleotdeos do anticdon devem parear com os trs nucleotdeos do cdon.
A regio do ribossomo que garante o emparelhamento cdon-anticdon chamada de centro decodifi-
cador. A chegada do aminoacil-RNAt ao stio A do ribossomo s ocorre se ele estiver associado ao fator de
alongamento EF-Tu carregado com uma molcula de GTP (EF-TuGTP). O GTP necessrio para ligao do
aminoacil-RNAt ao stio A e clivado na formao da ligao peptdica, atuando como fornecedor de energia.
Aps a clivagem do GTP em GDP e Pi, o complexo EF-TuGDP liberado do ribossomo e, para tomar parte
em novos ciclos de elongao, deve ser recarregado a EF-TuGTP. Outro fator de alongamento, o EF-T, o
responsvel pela regenerao do EF-TuGTP.
A formao da ligao peptdica entre o grupo amino do aminoacil RNAt e o carboxila do peptdeo em
crescimento catalisada numa regio do ribossomo chamado de centro peptidil-transferase. A formao da
ligao peptdica uma atividade enzimtica desempenhada pela subunidade maior do ribossomo. interessante
destacar que esta funo desempenhada pela molcula de RNAr 23S e no por protenas do ribossomo. A ligao
peptdica requer a hidrlise da molcula de GTP trazida pelo EF-Tu.
Com a formao da ligao peptdica, o peptidil RNAt presente no stio A do ribossomo translocado ao stio
P, o RNAt descarregado transferido para o stio E e o ribossomo sofre mudanas de conformao movendo-se
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trs nucleotdeos em direo extremidade 3 do RNA mensageiro. O passo de translocao requer energia
oriunda da clivagem do GTP e a presena do fator de elongao EF-G, o qual se desliga do ribossomo aps a
hidrlise do GTP. Um fato interessante que o EF-G jamais se liga ao ribossomo se EF-Tu estiver ligado e vice-
versa. Isso garante que o alongamento prossiga em ciclos, em que se alternam a ligao de um novo aminoacil
RNAt e o movimento de translocao do ribossomo (Fig. 11).

Figura 11. Representao esque-

mtica da etapa de alongamento
da cadeia polipeptdica.Complexo
ternrio o termo usado para
descrever um aminoacil-RNAt
ligado ao fator de alongamento
EF-Tu capaz de se ligar ao stio A.

A formao de uma ligao peptdica no ribossomo consome pelo menos trs ligaes fosfato de alta energia:
uma para carrregar o RNAt com seu aminocido especfico (sintetase do aminoacil), outra para ligar o aminoacil-
RNAt ao stio A do ribossomo na primeira etapa e a terceira gasta no movimento de translocao do ribossomo.
O processo de alongamento de um peptdeo muito rpido. Em E. coli, as trs etapas que culminam com a
adio de um nico aminocido levam cerca de 0,05 segundos. Logo, a sntese de um peptdeo contendo 300
aminocidos leva apenas 15 segundos. Considerando a sua complexidade e especificidade, a rapidez do processo
de traduo surpreendente.

O trmino da traduo

Como j vimos, existem trs cdons do cdigo gentico que no codificam aminocidos (UAG, UAA e UGA),
sendo usados como sinais de trmino da sntese da cadeia polipeptdica. Em bactrias, o cdon UAA o cdon
de terminao mais utilizado, e UGA mais usado que UAG.
Nenhum dos cdons de terminao tem um RNAt correspondente, eles so reconhecidos diretamente por
fatores proticos. Em E. coli, os fatores que catalisam a terminao so denominados RFs (do ingls release factors).
RF-1 reconhece o cdon UAA e UAG, e RF-2 reconhece os cdons UGA e UAA. Esses fatores entram no stio
A do ribossomo, quando este stio se posiciona sobre um cdon de terminao. Eles tambm requerem a presena
de um peptdil-RNAt no stio P para agir. Nos eucariontes, existe apenas um fator de terminao, o chamado eRF.
Para o eRF se ligar ao ribossomo necessrio GTP, que provavelmente clivado aps a concluso da etapa de
terminao. A reao de terminao consiste na liberao do polipeptdeo pronto do RNAt, expulso do ltimo
RNAt do ribossomo e dissociao do ribossomo do RNAm.
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Quadros de Leitura do RNA Mensageiro

Dada uma sequncia de bases do DNA ela pode ser lida teoricamente em trs quadros de leitura, um come-
ando na primeira base, outro na segunda base e outro na terceira base; uma leitura a partir da quarta base repete
o primeiro quadro e assim por diante.
Um quadro de leitura formado exclusivamente por trincas que significam aminocidos chamado de quadro
de leitura aberto ou ORF (do ingls open reading frame). Um quadro de leitura que no pode ser traduzido, porque
interrompido por um cdon de terminao, dito interrompido. Se certa sequncia est bloqueada nos seus trs
quadros de leitura possveis, ela no dever codificar protena.
Uma sequncia que traduzida em protena tem um quadro de leitura que comea sempre com um cdon
de iniciao e se estende por uma srie de cdons sucessivos que significam aminocidos, at atingir um cdon
de terminao.
A identificao de um quadro de leitura aberto em uma sequncia de DNA no significa obrigatoriamente
que tal sequncia seja traduzida em protena at que tal fato seja efetivamente demonstrado pela identificao do
seu produto proteico.
A transcrio da informao gentica em RNA e a traduo em protenas so reguladas por sequncias espe-
ciais de bases presentes no DNA e no RNA. No DNA, essas sequncias formam os stios de ligao da polimerase
do RNA ou de fatores de transcrio nas regies promotoras. Esses stios de ligao localizam-se antes (5) do stio
de incio de traduo presente no RNAm. No DNA, localiza-se tambm o stio de trmino da transcrio, o qual
fica alm (3) do stio de trmino da traduo localizado no RNAm. (Fig. 12).

Figura 12. Resumo da organizao da informao na molcula de DNA de uma bactria. Uma molcula de DNA uma dupla hlice formada por duas cadeias
polinucleotdicas. A informao gentica encontra-se codificada na sequncia de bases ao longo de uma das cadeias (cadeia de cdigo). A expresso de um gene se
d pela transcrio de uma fita do DNA em uma molcula de RNAm.

EXERCCIOS

Parte A: Revendo Conceitos Bsicos

Preencha os espaos em branco nas frases de 1 a 14 usando o termo abaixo mais apropriado:

(a) aminoacil-sintetase (h) polissomo

(b) anticdon (i) Shine-Dalgarno
(c) ativao do aminocido (j) stio A
(d) alongamento (k) stio P
(e) emparelhamento incerto (l) stio E
(f) iniciao (m) translocao
(g) peptidil-transferase (n) terminao

1. A etapa da sntese de protena que termina com a dissociao das subunidades do ribossomo e com a
liberao do polipeptdeo pronto e do RNAt chamada ( ).
 Biologia Molecular Texto 7 Sntese de Protenas 12

2. A propriedade da primeira base de um anticdon reconhecer mais de uma base na posio terceira
base do cdon chamada ( ).

3. ( ) uma trinca de bases do RNAt que se emparelha com o cdon do RNA mensageiro.

4. Chama-se ( ) unio entre um aminocido e uma molcula de ATP, que ocorre antes do aminocido
ser ligado ao seu RNAt especfico.

5. ( ) a etapa da sntese de protena em que ocorre a ligao do ribossomo ao RNAm, formando um

complexo que contm o primeiro aminoacil-RNAt.

6. ( ) a etapa da sntese de protenas em que os aminocidos so unidos em sequncia na cadeia

polipeptdica.

7. ( ) o local do ribossomo onde se alojam os aminoacil-RNAt recm-chegados.

8. A enzima que catalisa a unio de um RNAt a seu aminocido especfico chamada ( ).

9. ( ) o local do ribossomo onde se aloja o aminoacil-RNAt ligado ao polipeptdeo em crescimento.

10. () o nome do conjunto formado por diversos ribossomos unidos a uma molcula de RNA
mensageiro.

11. ( ) o local do ribossomo de procariontes onde fica alojado um RNAt que j se dissociou do
peptdeo em crescimento mas ainda no deixou o ribossomo.

12. A atividade cataltica que promove a ligao peptdica entre o aminocido recm-chegado ao ribossomo
e o peptdeo em crescimento chamada ( ).

13. O deslocamento do ribossomo de trs em trs bases do RNAm, que termina com a exposio no stio
A de um novo cdon a ser traduzido chamado ( ).

14. ( ) o nome da sequncia de nucleotdeos localizada no incio de um RNA mensageiro procaritico,

que permite a reunio das duas subunidades dos ribossomo e o incio da traduo no local correto.

Parte B: Ligando Conceitos e Fatos

Para cada uma das frases listadas nas questes de 15 a 25, escreva no parnteses a letra V caso a afirmao seja
verdadeira, e a letra F, no caso de ser falsa.

15. A modificao qumica de um aminocido ligado a um RNAt no afeta o peptdeo, pois os ribossomos
tm mecanismo de correo de erros na traduo ( ).

16. A iniciao da traduo em procariontes depende de uma sequncia de nucleotdeos no incio dos
RNA mensageiros ( ).

17. Na iniciao da traduo em procariontes, os ribossomos deslizam at encontrar o cdon de

iniciao ( ).

18. Na iniciao da traduo em eucariontes, os ribossomos deslizam at encontrar o cdon de

iniciao ( ).

19. Na iniciao da traduo em eucariontes, as protenas que reconhecem o encapamento e desdobram

o RNA mensageiro tm papel importante ( ).
 Biologia Molecular Texto 7 Sntese de Protenas 13

20. Drogas que afetam a produo de energia na clula, em princpio, no interferem na traduo, pois o
movimento dos ribossomos independe de energia ( ).

21. A incorporao dos aminocidos corretos no ribossomo depende da ao das aminoacil-sintetases, que
ligam cada RNAt ao seu aminocido correto ( ).

22. obrigatria a existncia, em cada clula, de 61 tipos diferentes de RNAts, um para cada cdon
codificador de aminocidos ( ).

23. Experimentos com ribossomos desprovidos de protenas indicam que a formao das ligaes peptdicas
catalisada apenas por protenas ribossomais ( ).

24. Tanto em procariontes como em eucariontes possvel encontrar polissomos associados ao DNA que
est transcrevendo o RNAm ( ).

25. Quando um cdon de terminao surge no stio A, um RNAt especial de terminao entra nesse stio
e promove a dissociao do RNAm e das subunidades ribossomais ( ).

Parte C: Aplicando Conceitos

26. Faa um esquema de um ribossomo procarionte na fase de elongao, indicando os stios de ligao
do RNAt e do RNAm, os aminoacil-RNAts presentes e o peptdeo em crescimento.

27. Faa um esquema comparativo entre as clulas procariticas e eucariticas abordando os seguintes
aspectos: local da transcrio, local da traduo, tipos de polimerase do RNA e processamento do RNA.

28. Faa um esquema de um gene genrico de procarionte indicando as fitas de molde e de cdigo, os
promotores, o stio de iniciao da transcrio, o stio de ligao do ribossomo, o cdon de iniciao,
um quadro de leitura com alguns aminocidos, o cdon de parada e a regio de trmino da transcrio.
Represente tambm o RNA mensageiro e o peptdeo produzidos.

Parte D: Resolvendo Problemas

29. Liste quatro diferenas entre a sntese de protenas em eucariontes e procariontes.