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Examen departamental bioquímica 1 diciembre 2013.pdf

Bioquímica 1 (Universidad Autónoma del Estado de Morelos)

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EXAMEN DEPARTAMENTAL
BIOQUÍMICA 1
Departamento de Bioquímica y Biología Molecular
Facultad de Ciencias, UAEM
Semestre: AGOSTO-NOVIEMBRE de 2013

Profesor del curso: Dr. Raúl Arredondo Peter

Sinodal externo: Dra. Vera Petricevich

Nombre del estudiante (apellido paterno, apellido materno, nombre):

Este examen contiene 41 preguntas. El valor de cada pregunta es de un punto.

El examen se califica con base en 41 preguntas. Del total de preguntas 22 (es
decir, el 53 %) provienen del banco de problemas.

1. Los organismos se encuentran en un estado de equilibrio dinámico, sin

embargo, en condiciones de enfermedad la velocidad de síntesis (r1) y
degradación (r2) de sus componentes moleculares es:

a. r1 = r2
b. r1 > r2
c. r1 < r2
d. Todas las anteriores.
e. Ninguna de las anteriores.

2. Las transformaciones químicas en la célula requieren de energía, la cual se

almacena predominantemente en . En el metabolismo esta
energía proviene de reacciones de .

a) El enlace  del ATP.

b) Reducción.
c) El enlace  del ATP.
d) El enlace  del ATP.
e) Oxidación.

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3. ¿Cuál sería el valor de Kw si se disociara una de cada 105 moléculas de agua

líquida?

a. 1 x10-6 M2
b. 1 x10-8 M2
c. 1 x10-10 M2
d. 1 x10-12 M2
e. 1 x10-14 M2

4. Indica cual de las siguientes aseveraciones es falsa (F) o verdadera (V).

( ) En condiciones neutras [H+] = [OH-] = 10-14M.

( ) La escala de pH es aritmética, no logarítmica.
( ) El pKa aumenta inversamente proporcional al Ka, y directamente
proporcional a la debilidad del ácido.

5. Indica cual es la concentración de fosfato de potasio dibásico (K2HPO4) que

se requiere para preparar una solución amortiguadora (a pH 7.0) que contiene
fosfato de potasio monobásico (KH2PO4) 0.1 M. El pKa del fosfato de potasio
(mono y dibásico) es 7.21.

a) 0.5 M
b) 1.3 M
c) 0.9 M
d) 0.062 M
e) 0.02 M

6. Relaciona las columnas al señalar el pI que corresponde a cada aminoácido.

a. Acido aspártico ( ) 5.98

b. Arginina ( ) 2.77
c. Histidina ( ) 10.76
d. Leucina ( ) 7.59

7. Señala cual es el balance de cargas a pH neutro del tetrapéptido AEGK.

a). 2 + 2 -
b). 1 + 1 -
c). 2 + 1 -
d). 1 – 2 +
e). Ninguna de las anteriores.

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8. Enmarca en el siguiente alineamiento del citocromo c de diferentes especies

la posición que corresponde a los aminoácidos invariables.

Humano L M K C S Q C H T I D
Chimpancé I T K C V R C H Y I D
Orangután I M R C S K C H F V E
Gorila I M K C S Q C H T V E

9. Señala cual de las siguientes características estabilizan a una hélice alfa.

a). La repulsión o atracción electrostática entre los aminoácidos cuyos grupos R

tienen carga.
b). El tamaño del grupo R de los aminoácidos.
c). Las interacciones entre los aminoácidos que se encuentran de 3 a 4 residuos
de distancia.
d). La presencia de residuos de Pro.
e). La interacción electrostática intracatenaria entre los grupos carbonilo y amido
de los enlaces peptídicos.
f). Todas las anteriores.
g). Ninguna de las anteriores.

10. Señala cual es el tripéptido repetitivo que forma la estructura helicoidal del
colágeno.

a). Asp-Glu-Val
b). Ile-Val-Arg
c). Gli-X-Pro
d). Lis-X-Arg
e). Glu-X-Glu

11. A partir de una gráfica de Ramachandran relaciona las columnas al señalar

los grados y orientación de las estructuras secundarias de una proteína.

a.  = +120 a +180o y  = -60 a -180o ( ) hélice alfa con

orientación a la izquierda
b.  = -60o y  = -60 a -180o ( ) hélice alfa con
orientación a la derecha
c.  = -40 a -60o y  = +40 a +60o ( ) hoja beta paralela
( ) hoja beta antiparalela

12. Señala cual de las siguientes expresiones matemáticas corresponde a la ley

de Lambert-Beer.

a). I=Ioe-kl
b). I=Ioe-kc
c). I=Ioe-kcl

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13. Con base en el espectro de absorción (abajo) el coeficiente molar del NADH
(=6.3 mM-1cm-1) corresponde a la longitud de onda  = nm.

14. Indica cual es la fuerza centrífuga relativa (RCF, expresada en xg) a la que
se somete una partícula cuando se centrifuga a una velocidad de 1,500 rpm en
un rotor de 20 cm de radio.

a. 500 xg
b. 300 xg
c. 200 xg
d. 1,500 xg
e. Ninguna de las anteriores.

15. A pH 7.0 y baja fuerza iónica, ¿cuál es el método cromatográfico más

adecuado para separar a estos dos péptidos? Péptido I: RAMKKMGTIWMSRK,
y Péptido II: AREGKMGSLPMTHK.

a. Cromatografía de afinidad.
b. Cromatogafía de intercambio aniónico.
c. Cromatografía de intercambio catiónico.
d. Filtración en gel.
e. Interacción hidrofóbica.

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16. El peso molecular (Mr) de la proteína que se observa en el carril 2 del gel
SDS-PAGE de abajo es (utiliza la hoja de papel semilog o milimétrica para
realizar el cálculo):

a). 15,000 Da d). 34,000 Da

b). 19,000 Da e). 76,000 Da
c). 30,000 Da f). 148,000 Da

17. ¿Que sucederá con el valor de P50 de la hemoglobina si se incrementa el pH

de la solución en la que se encuentra de 7.2 a 7.4?

a) No hay cambio en el valor de P50

b) El valor de P50 aumenta
c) El valor de P50 disminuye

18. Relaciona las columnas al señalar el punto de fusión de los siguientes ácidos
grasos.

a) Acido lignocérico 24:0 ( ) -49.5oC

b) Acido araquidónico 20:4 (5,8,11,4) ( ) 63.1oC
c) Acido laurico 12:0 ( ) 44.2oC
d) Acido -linoleico 18:2 (9,12) ( ) 86oC
e) Acido palmítico 16:0 ( ) -5oC

19. En este fosfolípido el alcohol que se esterifica al residuo de fosfato es el

glicerol: .

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20. Relaciona las columnas al indicar el tipo de enlace (en negritas) que rompe
cada clase de fosfolipasa. El superíndice señala el átomo de carbono en la
molécula de glicerol. R representa la cadena acilo del ácido graso.

a. Fosfolipasa A1 ( ) 2CH-O-CO-R
b. Fosfolipasa A2 ( ) P-O-CH2-CH2-N+(CH3)3
c. Fosfolipasa C ( ) 3CH2-O-P-
d. Fosfolipasa D ( ) 1CH2-O-CO-R

21. La es una técnica que

permite separar con alta resolución a los compuestos lipídicos. Los lípidos que
se separan por medio de esta técnica se pueden identificar mediante la técnica
de debido a que el cociente masa/carga es
característico de cada lípido.

22. Señala cual (es) de las proteínas en el esquema se liberará de la membrana

al agregar EDTA (ácido etilendiaminotetraacético).

Ca++

23. Numera consecutivamente (del 1 al 5) la secuencia de eventos que suceden

cuando la bomba de Na+ y K+ transporta iones a través de la membrana.

( ) La bomba se desfosforila y asume la conformación I.

( ) La bomba se fosforila y asume la conformación II.
( ) La bomba libera 3 Na+ al exterior de la célula y une 2 K+.
( ) Se unen 3 Na+ a la bomba en la parte interna de la célula.
( ) La bomba libera 2 K+ al interior de la célula.

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24. Señala cual estructura corresponde a la -D-manosamina.

25. ¿Cual es el anómero de las unidades de D-glucosa en el glucógeno?

a. 
b. 
c. 
d. 
e. 

26. La ceruloplasmina es una sialoglicoproteína que une Cu2+. Esta proteína es

reconocida como una "proteína vieja" por los receptores de asialoglicoproteínas
del hígado para ser degradada cuando pierde las unidades de ácido siálico del
oligosacárido que está unido a la proteína. Indica en la siguiente estructura el
enlace que se rompe cuando se libera el ácido siálico para dar lugar a la
asialoceruloplasmina.

NeuNAc(23)Gal(14)GlcNAc(12)Man(16)Man(14)GlcNAc(14)GlcNAc()Asn

27. Su nombre químico es -D-glucopiranosil 1,4 D-glucopiranosa y es el

producto de la condensación de dos moléculas de glucosa con la pérdida de una
molécula de agua: .

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28. La estructura del siguiente disacárido corresponde a:

a. O--D-galactopiranosil (1  4) -D-glucopiranosa (lactosa)

b O--D-glucopiranosil (1  2) -D-fructofuranosa (sacarosa)
c. O--D-glucopiranosil (1  1) -D-glucopiranosa (trehalosa)
d. O--D-glucopiranosil (1  4) -D-glucopiranosa (maltosa)
e. Ninguno de los anteriores

29. Señala cual de las siguientes secuencias corresponde a un palíndrome.

TTAGCACCACGATT GACCTGGACTGCAT TTAGCACGTGCTAA

|||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||
AATCGTGGTGCTAA CTGGACCTGACGTA AATCGTGCACGATT

30. Una secuencia corta de DNA se secuenció usando el método dideoxi. Los
fragmentos se corrieron en un gel, se tiñeron y se muestran abajo:

¿Cuál es la secuencia del DNA?

a. 3’-TGACTAGGGCT-5’
b. 5’-ATCGGCATATG-3’
c. 5’-TCAGGATCAGT-3’
d. 5’-TGACTAGGACT-3’
e. 5’-ACTGATCCTGA-3’

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31. Señala en las curvas de desnaturalización del DNA de dos especies

diferentes, que se muestran abajo, en cual de ellas la cantidad de G+C es
mayor.

32. Señala cuantos electrones y protones se unen al NAD+ para dar lugar a
NADH.

a) 1 electrón y 1 protón
b) 2 electrones y 1 protón
c) 2 electrones y 2 protones
d) 3 electrones y 2 protones
e) 3 electrones y 3 protones

33. ¿Cuál de los siguientes aminoácidos puede participar en la catálisis ácido-

base generalizada en el sitio activo de una enzima?

a. D
b. E
c. K
d. R
e. Ninguno de los anteriores
f. Todos los anteriores

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34. La siguiente figura ilustra la interacción del sitio activo de una enzima con el
substrato:

Señala cuál de los diagramas de abajo corresponde a los cambios de energía

libre que suceden durante la transformación S  P cuando el sitio activo de una
enzima interactúa con el substrato de la manera que se ilustra en la figura de
arriba.

35. La siguiente gráfica muestra la actividad de una enzima hacia un substrato.

Señala en la gráfica la región de la curva en donde Et] = ES].

36. Señala cual de las siguientes proporciones entre las constantes de equilibrio
de una reacción enzimática corresponde a la definición de Km.

a. (k2 + k1)/k1
b. (k2 + k-1)/k1
c. (k1 + k-1)/k2
d. (k2 + k-2)/k1
e. (k2 + k-2)/k2

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37. Señala cual es el valor de Km y Vmax de la peroxidasa de rábano cuando se

obtienen los siguientes valores experimentales. La reacción que lleva a cabo la
peroxidasa es H2O2 + RH2  R + 2H2O.

[H2O2] (mM) Producto formado (mol/min)

2.3 0.277
4.6 0.398
9.2 0.530
13.8 0.568
18.4 0.563
27.6 0.546 Km =
36.8 0.663
46 0.751 Vmax =

38. La siguiente gráfica muestra el mecanismo de acción de un inhibidor

.

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39. En las plantas llamadas C4 la reacción en la asimilación del CO2 atmosférico

es la carboxilación del fosfoenolpiruvato (PEP) que cataliza la enzima
fosfoenolpiruvato carboxilasa (PEPC), la cual se localiza en las hojas. El
producto de esta reacción es el oxaloacetato y Pi. Esta enzima se inhibe por
ácidos dicarboxílicos, como el malato. Para determinar la naturaleza de la
inhibición de la PEPC la velocidad inicial de la enzima se determina a diferentes
concentraciones de malato. La gráfica de los datos experimentales se muestra
en la figura 1.

Con base en esta gráfica, la Km de la PEPC hacia el PEP es

, y el malato actúa como un inhibidor .

40. La modificación covalente es un mecanismo que regula la actividad de las

enzimas. Por ejemplo, la dirección del movimiento de las bacterias (hacia un
atrayente o lejos de un repelente) depende de la orientación del giro del flagelo,
el cual responde al proceso metilación  desmetilación de las enzimas que se
localizan en la base y el “tallo” del flagelo. Estas enzimas son metiladas a partir
del:

a. ATP
b. Adenilato
c. Uridilato
d. S-adenosilmetionina
e. S-adenosilhomocisteina

41. Numera el orden de los eventos que suceden durante la traducción.

( ) Unión del aminoacil-RNAt al sitio A del ribosoma.

( ) Translocación de los RNAt y el RNAm al sitio E del ribosoma.
( ) Hidrólisis de GTP por el factor de elongación G.
( ) Unión del peptidil-RNAt al sitio P del ribosoma.
( ) Formación de un enlace peptídico.

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