ANALISA JURNAL

DENGAN DIAGNOSA SEPSIS

DISUSUN OLEH:

TRI HASIDA SARI

(21217086)

SEKOLAH TINGGI ILMU KESEHATAN MUHAMMADIYAH PALEMBANG

PROGRAM PROFESI NERS
2017/2018
 ANALISA JURNAL

Genetic Factors of the Disease Course after Sepsis: A Genome-Wide

Study for 28 Day Mortality

André Scherag: ed.anej-inu.dem@garehcs.erdna

Corresponding author at: Integriertes Forschungs- und Behandlungszentrum (IFB)

Sepsis und Sepsisfolgen, Center for Sepsis Control and Care (CSCC),
Universitätsklinikum Jena, Postfach 07740, Jena, Germany.Integriertes
Forschungs- und Behandlungszentrum (IFB) Sepsis und SepsisfolgenCenter for
Sepsis Control and Care (CSCC)Universitätsklinikum JenaPostfach
07740JenaGermany ed.anej-inu.dem@garehcs.erdna
1
These authors contributed equally to this work.
2
For the ESICM/ECCRN GenOSept Investigators.
3
For the PROGRESS study.
4
on behalf of the Hellenic Sepsis Study Group.

Pnulis ; André Scherag,a,b,⁎,1 Franziska Schöneweck,a,b,1 Miriam

Kesselmeier,a,b Stefan Taudien,a,c Matthias Platzer,c Marius Felder,c Christoph
Sponholz,a,c,d Anna Rautanen,e,2 Adrian V.S. Hill,e,2 Charles J. Hinds,f,2 Hamid
Hossain,g,3 Norbert Suttorp,h,3 Oliver Kurzai,a,i,j Hortense Slevogt,a,j Evangelos J.
Giamarellos-Bourboulis,a,k,4 Apostolos Armaganidis,lEvelyn Trips,m Markus
Scholz,n,o,1 and Frank M. Brunkhorsta,p,q,1

Submited: 10.12.2016, Accepted: 09.15.2016

DOI: 10.1016/j.ebiom.2016.08.043

Abstrak :

Sepsis adalah respon tubuh yang disregulasi terhadap infeksi yang menyebabkan
disfungsi organ yang mengancam jiwa yang bervariasi oleh faktor genom tubuh.
Kami melakukan studi asosiasi genom-wide (GWAS) pada 740 pasien septik
dewasa dan berfokus pada kematian 28 hari sebagai hasil. Varian dengan bukti
sugestif untuk sebuah asosiasi (p ≤ 10-5) telah divalidasi dalam dua studi GWA
tambahan (n = 3470) dan daerah pengkodean gen yang terkait dengan varian
tersebut dinilai dalam studi sekuensing exome independen (n = 74).
Dalam penemuan GWAS, kami mengidentifikasi 243 varian autosomal yang
berkerumun di 14 lokus (p ≤ 10 - 5). Sinyal asosiasi terbaik (rs117983287; p =
8,16 × 10-8) diamati untuk varian missense yang terletak pada kromosom 9q21.2
pada gen VPS13A. VPS13A selanjutnya didukung oleh GWAS tambahan (p =
0,03) dan data sekuensing (p = 0,04). Selanjutnya, CRISPLD2 (p = 5,99 × 10 - 6)
dan sebuah wilayah pada kromosom 13q21.33 (p = 3,34 × 10-7) didukung oleh
data dan bukti biologis eksternal kita.

Kami menemukan 14 lokus dengan bukti sugestif untuk hubungan dengan angka
kematian 28 hari dan menemukan bukti konvergen yang mendukung tiga di
antaranya dalam rangkaian data independen. Menguraikan mekanisme biologis
VPS13A, CRISPLD2, dan lokus kromosom 13 menjadi fokus kegiatan penelitian
di masa depan.

Kata kunci: Sepsis, Respons klien, studi asosiasi genome, Kematian, Exome

ANALISA DATA PICO

Kata Kunci Jumlah Yang Didapat

P sepsis 143763
I Genome study 15037
C -
O .Genetic Factors of the Disease Course
after Sepsis: A Genome-Wide Study for
1
28 Day Mortality
Sumber : Elsevier

KRITERIA SEBUTKAN CRITIKAL THINKING

Sepsis adalah suatu keadaan
di mana tubuh bereaksi
hebat terhadap bakteria atau
mikroorganisme lain. Sepsis
merupakan suatu keadaan
yang mesti ditangani dengan
baik yang berhubungan
P (PROBLEM)
dengan adanya infeksi oleh
bakteri. Bila tidak segera
diatasi, Sepsis dapat
menyebabkan kematian
penderita.
Penyebab utama dari Sepsis
adalah adanya infeksi oleh
bakteri atau jamur. Sepsis
merupakan penyebab
utama terjadinya Shock dan
memberikan angka
kematian sekitar 30%-87%.
Faktor risiko untuk
terjadinya Sepsis antara
lain: umur, penyakit
kencing manis,
obat imunosupresi (yang
dapat menekan sistim
kekebalan tubuh) dan
 adanya riwayat
tindakan invasif (pemasuka
n suatu alat kedokteran ke
dalam tubuh), misalnya
pemasangan kateter air
seni, penyuntikan secara
intravena (melalui
pembuluh darah balik /
vena), dan lain-lain.

Genom wide association Restropektiff studi dengan

(GWA) (n=3470) studi, dan menggunakan artikel
exome squensy study (n=74) penelitian GWA dan
I (INTERVENSI) penelitian terhadap 74
responden. Analisis
menggunkan logistic
regresi
C (COMPARISON) - -
Dalam penemuan GWAS, Kami menemukan 14 lokus
kami mengidentifikasi 243 dengan bukti sugestif untuk
varian autosomal yang hubungan dengan angka
kematian 28 hari dan
berkerumun di 14 lokus (p ≤
menemukan bukti
10 - 5). Data dari assosiasi konvergen yang
(rs117983287; p = 8,16 × mendukung tiga di
10-8) diamati untuk varian antaranya dalam rangkaian
missense yang terletak pada data independen.
kromosom 9q21.2 pada gen Menguraikan mekanisme
VPS13A. VPS13A biologis VPS13A,
O (OUTCOME) CRISPLD2, dan lokus
selanjutnya didukung oleh
kromosom 13 menjadi
GWAS tambahan (p = 0,03) fokus kegiatan penelitian di
dan data sekuensing (p = masa depan.
0,04). Selanjutnya,
CRISPLD2 (p = 5,99 × 10 -
6) dan sebuah wilayah pada
kromosom 13q21.33 (p =
3,34 × 10-7) didukung oleh
data dan bukti biologis
eksternal kita.
 Critical Appraisal Check List

Critical Point Critical Ya Tidak Keterangan

Appraisal Appraisal
Judul - Apakah judul √ - Judul penelitian tersebut
memenuhi kaidah telah memenuhi kaidah
penulisan judul penulisan yakni
menggambarkan variabel
yang akan di teliti,
menggambarkan topik
penelitian

- Apakah penulisan √ - Penulisan judul dalam

judul menggunakan bentuk frasa dan tidak
tanda Tanya (?) menggunakan tanda tanya
(?) ataupun seru (!)
- Apakah penulisan √
judul menggunakan
tanda seru (!)
Penulis - Apakah nama √ - Nama penulisnya adalah
penulis André
dicantumkan? Scherag,a,b,⁎,1 Franziska
Schöneweck,a,b,1 Miriam
Kesselmeier,a,b Stefan
Taudien,a,c Matthias
Platzer,c Marius
Felder,c Christoph
√ Sponholz,a,c,d Anna
- Apakah asal institusi Rautanen,e,2 Adrian V.S.
penulis dicantumkan √ Hill,e,2 Charles J.
? Hinds,f,2 Hamid
- Apakah asal institusi Hossain,g,3 Norbert
penulis sesuai Suttorp,h,3 Oliver
dengan topik Kurzai,a,i,j Hortense
penelitian ? Slevogt,a,j Evangelos J.
Giamarellos-
Bourboulis,a,k,4 Apostolos
Armaganidis,lEvelyn
Trips,m Markus
Scholz,n,o,1 and Frank M.
Brunkhorsta,p,q,1Institusi
penulis adalah

André Scherag: ed.anej-

inu.dem@garehcs.erdna
Corresponding author at:
Integriertes Forschungs- und
Behandlungszentrum (IFB)
Sepsis und Sepsisfolgen,
Center for Sepsis Control
and Care (CSCC),
Universitätsklinikum Jena,
Postfach 07740, Jena,
Germany.Integriertes
Forschungs- und
Behandlungszentrum (IFB)
Sepsis und
SepsisfolgenCenter for
Sepsis Control and Care
(CSCC)Universitätsklinikum
JenaPostfach
07740JenaGermany ed.anej-
inu.dem@garehcs.erdna
1
These authors contributed
equally to this work.
2
For the ESICM/ECCRN
GenOSept Investigators.
3
For the PROGRESS study.
4
on behalf of the Hellenic
Sepsis Study Group.

.
 Bidang - Apakah bidang ilmu √ - Bidang ilmu terkait adalah
Ilmu yang tercantum kehatan
dalam judul
penelitian ?
√ - Latar belakang institusi
- Apakah latar penulis kesehatan medic
belakang penulis
(institusi tempat
bekerja) sesuai
dengan bidang ilmu
topic penulisan?
Metodologi - Apakah tujuan √ - Tujuan penelitian ini untuk
Penelitian penelitian mengetahui deskripsi
disebutkan? hubungan sepsis dengan
genom pada kematian ke
28 hari
√
- Apakah desain
penelitian yang - Desain peneitian study
digunakan? √ restrospektif
- Apakah desain
penelitian sesuai
dengan tujuan - Level of evidence ; level III
penelitian ? √
- Bagaimana level of - Metode pemilihan sampel
evidence dari desain dalam penelitian tersebut
penelitian ? adalah random
- Bagaimana √
pemilihan sampel - Hasil penelitian disajikan
dalam penelitian dalam bentuk tabel dan
tersebut? deskripsi
 √
- Uji statistic yang
- Dalam bentuk apa digunakan adalah logistic
hasil penelitian regresi
disajikan? √

- Apakah uji statistic

yang digunakan ?
Hasil - Apakah hasil √ - Hasil penelitian tersebut
Penelitian penelitian dapat peneliti dapat
diimplementasikan membuktikan hipotesis,
dikeperawatan? terdapat pengaruh genom
pada kromosom ke 13

- Apakah ada √
rekomendasi khusus
terkait hasil
penelitian
Daftar - Apakah daftar √ - Referensi yang digunakan
Pustaka pustaka yang dari tahun 2001 - 2015
digunakan up to
date ? - Daftar pustaka sesuai
- Apakah daftar √ dengan penelitian yang
pustaka yang dilakukan dibidang
digunakan sesuai ? kesehatan

- Refrensi dari buku dan

jurnal lainya yang hasilnya
- Apakah daftar √ dapat dipercaya.
pustaka yang
digunakan dari
sumber yang
terpercaya?