RESUME

EKSPRESI MATERI GENETIK

PADA EUKARIOT DAN PROKARIOT

Untuk Memenuhi Tugas Matakuliah

Genetika I
yang dibina Oleh Prof. Dr. Siti Zubaidah, M. Pd

Disusun oleh :

Kelompok 8

Ayu Maulidya (150342600319)

Dinda Aprilia (150342602371)
Offering G

JURUSAN BIOLOGI
FAKULTAS MATEMATIKA DAN ILMU PENGETAHUAN ALAM
UNIVERSITAS NEGERI MALANG
Maret 2017
Coupled Transcription and Translation in Prokaryotes
 Pada Prokariot, molekul mRNA telah ditranskripsi dan ditranslasi pada arah 5' ke 3' arah, dan
tidak memiiliki membran nucleus yang memisahkan transkripsi dari translasiseperti pada
eukatiot, sehingga translasi dari molekul mRNA sering dimulai sebelum transkripsi berakhir.
 Pasangan antara transkripsi dan translasi memfasilitasi sangat cepat dan efisien "turn-on dan"
turn-off dari ekspresi gen yang diamati pada prokariota.
 O. L Miller, B. A Hamkalo, dan rekannya mengembangkan teknik yang mana transkripsi dan
translasi dapat divisualisasikan secara langsung menggunakan mikroskop elektron.

Transcription, RNA Processing and Transport, and Translation in Eukaryotes

 Bagaimana transkrip gen ditransportasikan dari nucleus menuju sitoplasma dan determinasi
dari waktu dan tempat dari translasi mRNA? Pertanyaan ini timbul sebab, pada eukariota,
transkripsi dan translasi tidak dapat berpasangan, karena transkripsi terjadi di inti dan translasi
terjadi dalam sitoplasma.
 mRNA pada eukariot yang berasal dari transkrip gen primer terjadi beberapa tipe pengolahan :
(1) Pembelahan pre-mRNAs molekul besar menjadi mRNA molekul kecil
(2) Pertambahan dari kelompok 7-methyl guanosine menuju ujung 5’ dari molekul
(3) Pertambahan kira-kira 200-nukleotida sekuen panjang menuju ujung 3’ dari molekul
(4) Pembentukan lebih komplek dengan protein spesifik
 Laju proses RNAs nonribosomal atau heterogeneous RNA (hRNA) dalam nucleus dihasilkan
dalam :
(1) Sebagian besar RNA nonribosomal disintesis di dalam inti
(2) Pembentukan molekul kecil ditansportasikan ke sitoplasma
(3) mRNA yang lebih kecil molekul yang areuransported sitoplasma tertalu
 Translasi pada eukariot tampaknya analog dengan translasi pada prokariot, kecuali, (1) amino
kelompok methionyl-tRNA (RNA inisiasi) formylated (2) studi mRNA eukariot yang paling
eukariotik nampak monogenik, sehingga hanya satu spesies non polipeptida ditranslasi dari
setiap mRNA.
 Dalam prokariota, banyak mRNA poligenik yaitu, dua lebih polipeptida berbeda yang
diseintesis dari segmen nonoverlapping dari mRNA tunggal.
 Sintesis dari satu protein eukariot, sutra protein fibroin, dapat divisualisasikan oleh mikroskop
elektron menggunakan teknik yang dikembangkan oleh O. L Miller, B. A Hamkalo dan
rekannya.

Removal of Intron Sequences by RNA Splicing

 Gen langka dari beberapa virus prokariot, misalnya, E coli bakteriofag T4 dan dua B subtilis
bakteriofag SP01, dan dari archebacterium juga telah ditemukan mengandung intron.
 Mekanisme splicing harus sangat tepat, urutan ekson harus bergabung dengan tepat pada
nukleotida tunggal untuk memastikan bahwa kodon di ekson distal menuju intron dibaca dalam
pembacaan yang benar.
 Persimpangan ekson-intron berbeda dalam kasus gen RNA dan gen suructural dalam
mitokondria dan kloroplas, yang menggunakan mekanisme RNA splicing berbeda.
 Sisa sekuen intron dari gen nuclear berbeda jauh dan sepenuhnya sekuen tampak acak.
Three Distinct Types of RNA Splicing
 3 Kelas intron yang paling umum dan paling penting pada ekspresi gen ekariot :
(1) Intron prekursor tRNA dihilangkan dengan pembelahan endonukleolitik yang tepat dan
mengkatalisasi reaksi ligasi dengan splicing endonukleoase dan aktivitas ligase.
(2) Intro precursor Tetrahymena rRNA dipindahkan secara autokatalisasi dalam reaksi unik
yang dimediasi oleh molekul RNA.
(3) Introns dari transkrip hnRNA nuklear disambung keluar dalam dua tahap reaksi yang
dilakukan oleh partikel ribonucleoprotein kompleks yang disebut “spliseosom”.
 Penyambungan yang mengarah ke mRNA menghasilkan protein yang berbeda. Salah satu
intron pada sitokrom gen b dari ragi mitokondria termasuk bagian kode sekuen untuk protein,
sebuah "RNA matang”, bertanggung jawab dalam pemotongan intron kedua dari transkrip dari
gennya.

Splicing tRNA Precursors Unique Nuclease and Ligase

 Pembelahan RNA prekursor menghasilkan terminal 5'-OH dan ler NISM adalah mini dan
kelompok phosphat siklik 2’-3’ kelompok siklik fosfat pada terminal 3’. Fase II dari proses
ligasi melibatkan 4 reaksi terpisah.
(1) Penambahan kelompok phsophate ke terminal 5'-OH, reaksi ini membutuhkan aktivitas
kinase dan fosfat donor (ATP ).
(2) Kelompok fosfat 5’ diaktifkan dengan transfer kelompok AMP-ligase intermediet.
(3) Kelompok phosphat siklik 2’-3’ dibuka oleh aktivitas siklus phosphodisterase yang
menghasilkan 2' fosfat dan 3' hidroksil bebas.
(4) Nukleofilik menyerang 3’-OH bebas pada interior fosfat 5' dengan pembebasan AMP.
Semua lour cofacto reaksi ini dikatalisis oleh ion splicing ligase. Akhirnya, kelompok fosfat
2' dihapus oleh aktivitas phosphatase untuk menghasilkan molekul tRNA matang.

Autocatalytic Splicing of Tetrahymena tRNA Precursor

 Kegiatan autocatalyuc eksisi intron pada Tetrahymena rRNA precursor tidak memerlukan
sumber energi eksternal dan protein. Sebaliknya, melibatkan serangkaian transfer obligasi
phosphoester, tanpa ikatan hilang atau dan diperoleh dalam proses. Reaksi membutuhkan gia
sembilan nucleoside atau nucleotide dengan 3’-OH bebas.
 Titik kuncinya, bahwa reaksi splicing autokatalitik merupakan intramolekul di alam dan,
dengan demikian, tidak tergantung pada konsentrasi. Selain itu, RNA precursor mampu
membentuk pusat aktif dalam kofaktor ikatan guanosin-3'-OH. Dengan demikian situs katalitik
tidak terbatas untuk protein, tetapi juga diperhatikan bahwa tidak ada aktivitas trans katalitik
seperti enzim, hanya aktivitas katalitik cis.
Pre-mRNA Splicing snRNAs, snRNPs, and the Spliceosome

Intron ribosom adalah 413-416 ntds panjang. Urutan tertentu pada ujung 5' melengkapi 3'
daerah ekson tersebut. Selain membentuk pasangan basa dengan 3'end dari ekson (sebagai panduan
urut), itu juga mengasumsikan struktur sekunder sehingga menghasilkan sebuah situs untuk
mengikat molekul G. Ini adalah molekul G yang inisiat memotong melalui kelompok 2'-OH yang
bermuatan negatif.

Diagram dari dua-langkah jalur eksisi intron dari pre-mRNA nuclear. Proses ini terjadi pada
splisiosom. Langkah pertama, pembelahan terjadi tepat pada ujung 5’ dari intron dan 2’-5’
fosfodiester linkage terbentuk antara posisi 5’ dari G pada situs pembelahan dan terpelihara. sebuah
residu terletak dekat ujung 3’ akhir intron. Ekson 1 diadakan ditempat dengan komponen pada
spliceosom. Langkah kedua, dua ekson bergabung ikatan fosfodiester 3’-5’ normal dan intron
dilepaskan.
 Interaksi spesifik dari U2, U5, dan U4/U6 snRNP kompleks. Perakitan dan daur ulang
komponen spliceosome sehubungan dengan Prp8. Dilestarikan 5 Ј dan 3 Ј situs sambatan mewakili
U2 cis -spliceosomal GU dan AG residu masing-masing. Prp8 telah ditemukan di dua kompleks U5
yang berbeda: U5 snRNP (kecil, kuning) dan lebih besar U5 / Prp19 snRNP (besar, biru).

Kode Genetik
Properti penting :
(1) Kode genetik terdiri dari tiga nukleotida kembar. Tiga nukleotida di mRNA menentukan satu
asam amino dalam produk polipeptida; dengan demikian, masing-masing kodon berisi tiga
nukleotida.
(2) Kode genetik adalah nonoverlapping. Setiap nukleotida dalam mRNA hanya memiliki satu
kodon kecuali dalam kasus yang jarang terjadi di mana gen tumpang tindih dan urutan
nukleotida dibaca di dua frame baca yang berbeda.
(3) Kode genetik adalah koma bebas. Tidak ada koma atau bentuk lain dari tanda baca dalam
daerah coding molekul mRNA. Selama penerjemahan, kodon dibaca berturut-turut.
(4) Kode genetik merosot. Semua kecuali dua dari asam amino yang spesifik oleh lebih dari satu
kodon.
(5) Kode genetik memerintahkan. Beberapa kodon untuk asam amino tertentu dan kodon untuk
asam amino dengan sifat kimia yang mirip berkaitan erat, biasanya berbeda oleh nukleotida
tunggal.
(6) Kode genetik memulai dan menghentikan kodon. Kodon spesifik digunakan untuk memulai
dan untuk mengakhiri rantai polipeptida.
(7) Kode genetik hampir universal. Dengan pengecualian kecil, kodon memiliki arti yang sama
pada semua organisme hidup, dari virus ke manusia.

QUESTIONS and ANSWERS

1. Ayu Maulidya (150342600319)
 …
2. Ayu Maulidya (150342600319)
 …
3. Dinda Aprilia (150342602371)
Setiap prokariot dan eukariot memiliki ekspresi gen masing-masing. jelaskan dan jabarkan
perbedaan ekspresi gen pada eukariot dan prokariot!
 Perbedaan :
(1) Eukariota multiseluler. Ekspresi gen dapat berkembang dan jaringan spesifik.
(2) Ada beberapa salinan untuk banyak gen eukariotik, dan sebagian besar DNA yang
tidak penting.
(3) Gen eukariotik primer dalam inti. mRNA harus melintasi membran inti sebelum
mereka ditranslasi dalam sitoplasma.
(4) Banyak gen eukariotik terganggu oleh DNA noncoding, yang ditranskrip dan kemudian
dihapus oleh proses yang dikenal sebagai splicing.
(5) Eukariotik prekursor mRNA dimodifikasi secara luas dalam inti sebelum translasi.
(6) Transkripsi dan translasi tidak ditambah seperti di prokariota.
(7) Polisistronik mRNA langka di eukariota.
4. Dinda Aprilia (150342602371)
Genom eukariotik biasanya jauh lebih besar daripada genom prokariotik. Apa yang
menyebabkan peningkatan jumlah DNA terlihat dalam genom eukariotik?
 Jumlah tersebut meningkat dari DNA dalam genom eukariotik karena sebagian besar untuk
peningkatan jumlah DNA non-coding, kadang-kadang disebut sebagai DNA "sampah", di
intron dan daerah intergenic dan transposabel elemen. Sumbangan relatif kecil untuk
meningkatkan ukuran genom adalah seukariota, terutama spesies multisel yang kompleks,
umumnya mengkodekan gen lebih, dan ukuran rata-rata protein eukariotik mungkin lebih
besar dari ukuran rata-rata protein prokariotik.