Regulasi Ekspresi Gen

Novi Silvia Hardiany

Dept. Biokimia & Biologi Molekuler FKUI
Pendahuluan
• Ekspresi gen --> proses multistep yang pada
akhirnya menghasilkan suatu produk gen
fungsional, baik RNA maupun protein
• Tidak semua gen diatur --> gen konstitutif
terus menerus dieskpresikan --> memenuhi
kebutuhan dasar fungsi seluler -->
“housekeeping gene”
• Gen yang diregulasi --> dieskpresikan hanya
pada kondisi tertentu, sel tertentu
Molekul & Sekuen Regulator
• Regulasi transkripsi --> dikontrol oleh
sekuen DNA regulator pada regio non
coding
• Interaksi segmen DNA dengan molekul
regulator (misalnya faktor transkripsi) -->
meningkatkan/menekan transkripsi -->
mempengaruhi jenis dan jumlah produk
• Cis-acting DNA
• Trans-acting factor
Regulasi Ekspresi Gen Prokariot
• Pada prokariot (E.coli) regulasi ekspresi gen terjadi terutama pada
level transkripsi
• regulasi melalui ikatan protein trans acting dengan elemen regulator
cis acting DNA
• Kontrol transkripsi --> inisiasi atau prematur terminasi proses
transkripsi
• Operon --> gen struktural yang mengkode protein
• Operator --> segmen DNA yang mengatur aktivitas gen struktural
• lactose operon --> gen lacZ (mengkode β-galactosidase), gen lacY
(mengkode permease) dan gen lacA (mengkode thioglactoside
transacetylase)
Lactose Operon
 Regulasi Ekspresi Gen Eukariot
Trans-acting molecule
• memiliki 2 domain yaitu DNA binding domain & transcription
activation domain
• Transcription activation domain --> berikatan dengan protein lain,
seperti co activator --> mengaktifkan transkripsi
• Regulasi dicapai melalui pembentukan komplek multiprotein dengan
DNA --> combinatorial control
Regulasi Ekspresi Gen Eukariot
Elemen regulator Cis-acting
• Hormone response elemen (HRE) --> mengatur ekspresi gen sebagai
respon terhadap sinyal dari hormon
• Sinyal regulator yang dimediasi oleh reseptor intraseluler
(glucocorticoid, mineralocorticoid, sex hormon, vitamin D, retinoic
acid, hormon tiroid)
• Sinyal regulator yang dimediasi oleh resptor permukaan sel (insulin,
epinefrin, glukagon,
Regulasi transkripsi melalui reseptor hormon
steroid intraseluler
Regulasi transkripsi melalui
reseptor hormon di
permukaan sel

Contoh gen yang mengalami upregulasi

melalui sistem cAMP/CRE/CREB yaitu gen
yang mengkode phosphoenolpyruvate
carboxykinase dan glucose-6-phosphatase
(enzim kunci glukoneogenesis)
Regulasi melalui co dan posttrasncriptional
processing dari mRNA
1. Alternative splicing menghasilkan isoform protein
Regulasi melalui co dan posttrasncriptional
processing dari mRNA
2. mRNA editing
• mRNA ApoB (komponen kilomikron &
VLDL)) dibuat di hati dan usus
• Pada usus, residu C pada kodon CAA
(glutamin) mengalami deaminasi --> U
(UAA) --> stop kodon --> protein lebih
pendek --> ApoB 48 pada usus yang
bergabung dengan kilomikron
• Pada hati, ApoB full lenght --> ApoB 100
yang bergabung dg VLDL
Regulasi melalui co dan posttrasncriptional
processing dari mRNA
3. mRNA stability
a. Regulasi metabolisme besi --> transferin (protein plasma u.transport
besi)

TfR = transferrin
receptor

IRP = Iron
Regulatory Protein
Regulasi melalui co dan posttrasncriptional
processing dari mRNA
3. mRNA stability
b. RNA interference (RNAi)
• mekanisme gene silencing melalui penurunan
ekspresi mRNA, penekanan translasi atau
peningkatan degradasi
• RNAi
• Uji klinik terapi RNAi pada AMD --> penghambatan
VEGF
Regulasi pada level translasi
• diatur melalui fosforilasi pada faktor
inisiasi translasi pada eukariot (eIF2)
• Fosforilasi eIF2 menghambat fungsinya
sehingga menghambat translasi pada
tahap inisiasi
• Fosforilasi dikatalisis oleh kinase
• diaktifkan sebagai respon terhadap
kondisi spt kekurangan asam amino,
defisiensi heme, akumulasi protein yang
mengalami kesalahan dalam pelipatan
Regulasi melalui Modifikasi DNA
• Ekspresi gen pada eukariot dipengaruhi oleh ketersediaan/akses DNA,
jumlah DNA dan rearrangement DNA
• DNA ditemukan dalam kompleks dengan protein histon dan
nonhiston --> membentuk kromatin
• Transkripsi aktif --> kromatin dekondensasi (eukromatin), hipometilasi
pada regio promoter
• Jumlah DNA meningkat --> amplifikasi gen --> peningkatan produk
• DNA arrangement --> pada pembentukan Ig oleh sel limfosit B
• Elemen DNA yang berpindah (transposon) yang dimediasi oleh enzim
transposase
Daftar Pustaka
• Harvey RA, Ferrier DR. Lippincott's illustrated review: Biochemistry.